Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016776

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016776
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016776
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACTCCATTTTAGAGAGAGGGGGTTCATCTCATCTGCGTGTGCGTGTCTTA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATCAAAAGCAGAGAGAGAGGAGTAG
TTGGGTAATGCAAATCGAGACTTAGCTAGGGTTTCCCTCCCCATCTACCA
TCCTTCTCCTCCCCACGCCGCCGCAGTCCCACGATCGCCATGATCGGCGG
TGCCGACGAGAACGAGCCGGAGGACCAGCCGTCCTCCACCACCACAACCC
CTCCTTCCTCTCCCTCGCCGCCGCCGCCACCACCACCGATCGCGTCCCCT
TCCTCGCCTCTCGTCCAGCAGACCGCTGGCGTCGGCCTCGGGAGGAGGCT
GCTCGGTTCCATCCGCTCCCTCCTCCCCGCGTCTCCGCCCGCCGCCGCCC
CCGCCCCCAAGCTCGGCCTCGGCCTCCTGCTCCATCTCAGGCCCGACCAC
CCTCGCCTCCACCCAACCCCAACCCCGCCTGCTTCCGCTTCTCCGTCCGC
GTCCGAGGACGACCCTCTGGAGGAAGATGCCGCTGCGGCACGCCCTCACG
CCACCGCGGGTAGGGGTGATGGAGGCCTGGACGCCGCTGCGGGGCTGCAC
TTGCCGGCGCACACGGGAGGCGACGTTGCCCTCGAAGGAGATCAGGATGC
CGGTCTCGTGGATGTGCAGCAGGGTGCGGCCCCCGCAGCCAACGAACTCC
GTGCGGGCGACGAGTCAAGGCCCACCGGCGTCGCGTCTCCGTACGTTTTC
GAGGAGGACGAGTCAAGGGCAACCGGCGTCTCGTCTGTGTCCGAGGACGA
CGAGCCGGAGGAGGGCGGTCCTCTGGATGCTGCCGAGTGGCTTCGCGCCG
CCGAGCGTGACGCCGAAGCAGGGCTGTGCTTGCCACCGGTGAACATCCGA
CGCGGGCTCAGCGAGGACGGTGCTGCTACGGCGACGGTTCAGCCTAACAT
CATGGTCAAGCAGTGTTCCGCCAAGCAGGCGCTCCACCACCTTCAATACC
TCAGTCCAGCGGCGGAAACGGGAGGTGAGCTTGCCCTGGAAGAAGATCAG
GAGGGTGGCCTGGCCCTGGTGGATGAGCATGGACACGAAGGCACCATCGA
CACACAGGCCGCAGCGCCAACCAAGGGGGGCGACCATTTCTGTGCAAGTG
ACGAGTCAGGGGCATCCAAGGTAGACGACCTTGTGGGGGAGAAGGACAAG
GTGGTGGAGCAACAAGGTGCAGCCGACTGGCAAGGTTCATTGTTCAAGGA
TGTTGATGCTGCTGGGGATGATCAAGAACAGGTGCTGCAGCAGTGCACAG
GAGATCAGTTGAGAGTTGCCAGGGATGATCAGGAGGTGGGGAAGCAAGAT
GCCATCCACCCAAGGGATGAAATCACATGTGACATTGCTGCTGCTGAGGA
TCAAGAGAAGGTGGGATCAGCCGAGAATGTTGATGTTATGGAAGGCCAGG
AGTTGGTGGAGCAAGACGGCATCCACCCAAGGTATGCAACTACATATTAC
ATTGCTGTTGAGGAACAAGAGAAGGTGGAGGGACACAGCACTAATCAGTG
TGGATCAACTGGGAATAATGGTGATGCTGTTGAAGATCAGGAGGTGCTCT
TGCCAGATGTCATTGATAGGAAGGATGAAGGCACAGATGGCAATGCCGTT
GATGATCAAGACAAGGCAGTGCAGCAATGTGACATTTATGAATTGGGAAC
AACTGAGAACGACGATGATGATGCCGAGGGTGATCAGGAGGCGGTGGAGC
AAGGTGTCTGCGATAAAGGGGGTATGGATGATGATAGTGCTGTCAAAGAT
CATGAGGTGGCTGGGCAAAGTGTCATTGATAGAATGCACAATACAATAGA
TGCCATTGCTGTCAAAGATCAAGATAAGGGAGTGGGCGCCACTTATGACT
TGGGAACCGTCGTTATGGATGATCAGGAGGTGGTGGAGCAAGATACCACC
GACCCGGTGGATTATATTGCTGTTGAGGAAGAAGAGAAGTTGGAACGACA
TGCCACTCATGGGCTGGGATCAACTGAGAGTGTTGATGATTCTGTGGAAG
GTCAGGAGGTGGTGGAGCAATGTGTCATTGACAGAACTGTCGAGAATGAT
GATGTTATGGATGATCAGGAGGTGGTGGAGCAAGATACCACCCATCCAAT
GGATGATATTGCTGTTGAGGAAGAAGCGAAGTTGGAACGCCAGGCCACTC
ATGGGCTGGGATCAGCTGAGAATGTTGATGATGCTGTGGAAGATCAGGAG
GTGATGGAGCAATGTGTCATTGACAGAACCTTCGAGAATGATGATGTTAT
GGATGATCAGGAGGTGGTGGAGCAAGATACCACCCACCCAATGGATGATA
TTGCTGTTGAGGAAGAAGCGAAGTTGGAACGCCACGCCACTCATGGGCTG
GGATCAGCTGAGAATGTTGATGATGCTGTGGAAGATCAGGAGGTGGTGGA
GCAATGTGTCATTCACAGAACCTTCGAGAATGATGATGTTATGGATGATC
AGGAGGTGGTGGAGCAAGATACCACCCACCCAATGGATGATATTGCTGTT
GAGGAAGAAGAGAAGTTGGAACGACACGCCACTCATGGGCTGGGATCAAG
TGAGAATGTCGATGATGCTGTGGAAGATCAGGTGGTGGAGCAATGCGTCA
TTGACAAAACCGTCGAGAATGATGATGCTATAGATGATCAGGAGGTGTTG
GAGCAAGATACCTCCTACCCAATGGATGATATTGCTGTTGAGGAAGAAGA
CAAGTTGGAACGCCACACCATTCATGGGCTGGGATCAACTGAGAATGCTG
ATGATGCTGTGGAAGATCAGGAGGTGGTGGAGCAATGTGTCATTGACAGA
ACCGTCGGGAATGACGATGTTATAGATGATCATAAGGTGGTGGAGCAAGA
TACCACCCATCCAATGGATGATATTTCTGTTGAGGAAGAAGAGAAGTTGG
AACAACACGCCACTCATGGGCTGGGATCAACTCAGAATGTTGATGATGCT
GTGGAAGATCAGGAGCTGGTGGAGCAATGTGTCATTGACAGAACAGTCAA
GAATGATGATGTTATGGATGATCATGAAGTGGTGGAGCAAGATACAACCC
ACCCAATGGATGATATTGCTGTTGAGGAAGAAGCGAAGTTGGAATGCCAC
GCCACTCATGGGCTGGGATCAGCTGAGAATGTTGACGATGCTGTGGAAGA
TCAGGAGGTGGCGGAGCAATGTGTCATTGACAAAAAGGATGAAAGCACAG
ATGGCACTGCTGTCGATGATCAAGAGAAGGCGGTAGAGCAATGTGCTTCT
TATGGATGGGGAACCACTGAAAATGACGATGCTAAGGATTATCAGGAGGT
GGTTTCTGCCACAGATGGCACTGCTGTCGATGATAAAGAGAAGGCGGTAG
AGCAATGTTCTTCTTATGGATGGGGAACCACTGAAAATGACGATGCTAAG
GATTATCAGGTGGTTTCTGCCACAGATGGCACAGCTGTCGATGATCAAGA
GAAGGCGGTAGAGCAATGTGCTGCTTATGGATGGGGAACAACTGAAAATG
ATGATGCTAAGGATTATCAGGAGGTGGTTTCAGCCACGGCGAATGGCAGG
GATGGGGGTATATGGAAGAAGGAGAAGGTTAAGCTGCCATATCCATATCC
ACAAAGGCCCGGGAAACTCAACTGCCCCTTTTACATGTCAACAGGGAGCT
GCTCATATGGGTTCTCCTGCAACTTCCACCACCCACCGGTAAAATCAGCT
ATCATTTGATATACTATTCTTTTATTTTCGACAGGAAAACATTGTTTGTT
TCTTTACTTAGTATAATAGAATGCTGCAATTTTGCTTAGCACAACAGGTT
CTGTAAATTATATCTGTCATACCAGTGCCATCCGTCTTTCCGCTCGATAA
TTAGTGCTGTGATCTATATTTTAATACATGAAGCAAACGCCTGCAGCCCC
TGTATGCTTGTTCCACATAGATGATATATGTGCATAGACATGCTATACAA
CATGCTCTTTTCTATATATGAATGTAGTCTATCACACCTTTTCTGATCCC
CAAATAAACATGAGATGATTTAAGAATATTAATGTTTTATCTGCTGATAA
ATGTAGTGGACATTTGAAAGCCAAATTACAATTATGTACCTTGTTCGCTA
GTTTGTTCATGAGCTATTTAGTAATTTATTTTCCTTGTTTTTGTTGATGT
TGTCATTGCTACAGCTTAAAGCCAAGCCAGGTGGTTCGTGGTGTTCCTCT
GAACAAGGAAATCAGGGCGTTGCAGAAATTCTGGAACTGAACCGCATTGG
CCTCCCCATACGAAAAGTATGGCTATGATGTCTTTTCATCTATTGAAGTT
GATTTATACTGGAAAATGCTGAAACTGACCTTTGTCTAAATTTACTTTTC
AGGGATCAAGAAATTGCACCTACTATATGAGGAATGGTGCTTGCAGATAT
GGCAAACACTGTCATTTTAACCATCCAGAGCATGTCATTGATGCTCAGTT
CTATGCACCAACAGGGTGGGAGGATAGTGCTTTGCAATTGGAGAAATCTC
TTGATCACCATACAACAGTAGATGACACATCACACTTGAAGAAATCTTCT
GATGATGCAACCTTGGATGATACATCCTACTCAAAGAAGTTTTCTGACCA
TGCAACCTTAAATGACATATCACACCTGAAGAAATCTTCTGATGATGCAA
CCTTGGATGATACATCCTACTCAAAGAAGTTTTTTGACCATGCAACCTTA
AATGACACATCATCTAGTACAGGGGTCCTGCCACCAAACATTTTAAGAAT
GCTTTTACCTCCCCAAAAAGTACCGGTCACTACAGAAGCAAAGATGGTAC
CGGTGAAAAAGGTACACGTTGTATCTTCTCTATATTATATGATTCTTAGA
TCTCTATTTGCACATATTGCTTGCACATTGCTACTTTTGTGACACCATAC
TGTACTATTCCTAGACTATGACTGGTCTACGCCTTTCTGAAATTTTTCTT
ACCCTATCTGCTTCATGTAGGGCTCAAACTGGTCATCTACTTCAGATGAT
TCTGACGGTTGTTGTTCAGCAGATAGTTCAGATGGGCCTTTGTGCAAGCA
GGAGCATGTGGATAGTTCAGATGGTTCTTTGTGCAAGCAGGAGCATGTGG
ATTACCCTGAGAGGCCTGGCAGACCAGAATGTCCCTTCTATATGAGGTTC
GGTGATTGTAAATTTGCATCAAGGTGCAAATATCACCACTCAATAGACAA
ATACCCAACTAGATCCCATCCGGAAATTTCATCACTGGGAGTGAAAAAGA
CAGAATATCCTGAGAGACCTGGGGAACCAGAATGCCCCTTCTATATGAAA
GACCAGTTCTGTAAATTTGGGGCACAGTGTAGGTTTAATCACCCAAAGAA
TTCAAATTCTACCTTGCAGATCCCAATGAATGTAAAAAAATCTGTTGCCG
CTAATGAACATCACCAACCTACCAGAATCACACTAGAAGACCATATGCAT
CAGCAACAGCAATATCCTGAGAGACCTGGTCAGCCAAACTGCCGGTACTA
CTTGCAATTTGGGCAATGCAAATTTCTGTCTGCATGTATATTTCACCATC
CAAGAGATGTACTTCCCTCTGGTCCAGTTCACTCTGATCAGATTGGACCT
GAAATACATGACATGCCAGAATGCCCATTCTATATGAAATCTGGGAAATG
TCAATTTGGGTCAGCATGTGAATTTCGTCATCCCAAAGATATATGTTCAA
CTACAGAGGTATGCCTTAAAAATTATTGATGGCCAAGTAGACCCTAGATC
AATCATAACTAGCTTTCAATTGTTCCTTTTTTGCCTGGCTGATCCCTGTT
GCATTTTTAGCTGTTAGAGATGTTTACTAGTGTTGACTTATATGCAAATA
GAAACTGAATGTCTTGAGTGTGTTCATAATTCTTGTTCGATATGCTGTGA
GTATTTTACTATTGCTCTGCTTGTGTGTACACGAGACACTTCTGATGTGC
AATATACTATTACCTCCGATCCATAATAAGTGTTGCTGATTTAGTGCAAA
GTTGTTCTAAATCAATGACACTTATTATGGATTGGAGGGAGTACCTTCTT
GTATTAATGAAGTCTATTTTGAACATTTTTTATTCCTACTGCACAACTGG
ACTGCAAATGTTAGAAACATTTTTTTATCTACAACCTCCACTGCAATGCT
TCAACCTTTTGTTTCTACAATAGTGATCGCTAACTGGTTGAATTTTGTTA
TTTTTTTCAGAAGTGGAACCATGTCATGTCATCCAACTGAAACAAAATAC
ATGCTTGATTGTTACCTTTATGTAATATTTTACCTGTGGTGATCATGGAT
CCTTATGCTTTTTCAGGGATCATTTGGTGACAGAACTGGCTCGGCATATG
ATAATTTCACAAGGCCAGAGAATGTCATGCAGCAACGAGAACAGACCCAG
TATCCTGAAAGGCCTGGTGAACCTGAGTGTTTCCAGTACATGAAGCATGG
CTCCTGTAGGCTTCAGATGAACTGCAGATACCACCATCCAGCAGACCAGC
TTTCTAGGAAACAGGTGTGTAGTAATCATAAAGTCCAGAAGCTTAATTAT
GATGCGTTCCACTGCCTTTTAGATGACATTTGTAACTGTTACTTGTGAAT
GCAGTACGACTCGACATACCACTGAACTCATCACTCTACTGCTTGAGCAA
AGCAAGAACGAACTGGTTACAGTGTGAACGCTATCAACTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.