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GrainGenes Sequence Report: AA015766

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Sequence
AA015766
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015766
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTCGCTCTCGCCGCCGCAGCTGTGCTCTATCCCCCGGACGCCGCCCGCCG
TCGCTGTCCCCGGACGCCCGCCGCCGCAGCTGCCGCCCGTTGTCGCTCTC
GCCGCCGCAGCTGTCCTCTATCCCCCGGATGTCGCCCTCCGCCTGCCGCC
CGCCGCCGCAGCTGTTTCCCGCCGCCACAGATGTCCTCTATCCCGACGCC
GCCCGTTGTCGCTGTTCCGGGACCCCCGCCGCCCCAGCTGTCCTCGGTCG
AGAGCCGCCGCTCTCCCTCAGACGAGCGCCGCCTCTCTCCCCCAGACGTG
CTCCGCAGCTCGATCCCCGGGTTTGCACCGCTGCCCCCTATCTACTCTCT
GATGCAGCTCGGTTCCCGTTTAGGAATTTGGACTGAATCAAATTTTAGCT
GTTCCTATACATTGTCATGTACCATCATCATATGCTGCATATGCAGATTT
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GGAGCTGCAGGAGCTTGACGAGTATCAGCGCGTGGTTAGTAAGACCTTCA
GAAGCAAGGACGAAGGATTTCTGTTTTATAGAGGTCCTTTATGTTAGAAA
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ACACGTGCTTTAAAGAAGGACACCGTACATTGGCGAACTTCGGACCTAAC
CCCAAAAGAACTCCAAAGGCTCTTACTCGTTGTGGATGCTCGGCTTGTTT
AGAGATCGAGCTGAGTGCAGCTACTGGAGAATGGTTTGTTAAGAAGTTTG
AGGACAAGCATAACCATACACTCGCTAAGGAAGGCGAGTCTGCTTACTTA
TACTCTCACCGCAAGATGACAGATGGTCAGAAGGCTGATATAGTTAGGTA
TGGGATTGGTGGCCTACGCACACACAAGATAATGGACGTAATGGAATATC
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CATGTTGAACTACATGGCCACAGAAAGACAAGGATGCAGATTTCTTTCAT
AGATACAACTCTGACAAAGATGGCCATCTAAGGAACCTATTCTGGGCAGA
TGGGCAGTCTTGGCTGGACTACGATGCATTTGGCGGTGTCCTAATCTTTG
ACAGCACGTACCGTGTGAACCGCTATAACCTGCCATTTGTTCCTTTCGTT
GGGGTGAACCACCATCGTAGCACCACTGTGTTTGGGTTTGCGGTCCTATC
CGATGAGACCACTAAAACTTATATCTGGTTGCTTGAGACATTTCTCATGG
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CTCACGGTTTTCGAGTATGTATGAGCTCAAAGAGAAATGGTCCGTGGCGT
ACACAAAAGGTGGATATTTCCTGGGAATGAGGAGAAACCAGAGGAGTGAA
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AGGCGGAGCTGGATGCCAAAGCTTCGCAGCCGGTGCCTTTCACTAAAATA
TCCGATCACCCTCTTTTGAAAAGCGCTGCGCGTATTTATACTCCTGCCAT
GTTCAAGATGGTGAAAGCCCGGTTCACAAAATCAGCCGGATGGGATATAG
GTGAGATGACCTAGGAAGAAGGCAGTTTGGTCAGGTTTATTGTATCCAGT
GATTATGGCGAGCATGATGTGACTTGTGTCAATTCTGGGACGACTCTAGA
GAGTGTGAACTGCCATTGTCGAAAGATGCAGCGTGAGGATATCCCATGCG
CACAGGTGTTTCGTGTTCTAACACAATTGGGCATTTCTAACATGCCTCAT
TGTTGTGTTGCCGTTAGATGGACCATGCAAGGTAAAGATATATTTGAACC
TGAACGTCAGTAGACATATTTGGACTGAGCATATGGATCGGTACCGCGAC
ATGCGCAACAAGGCTAATTCAGTTTTGTTTAAAGCTTCAATGAGCATGGA
GAAATCACATAGAGTGCTTGAGTTTTTTAAGAGTCTTTCAGACGACAACG
TGGCTGAGGATGATGAGGATGCTGATTCTAGCGAGAGTGACGACGGAAGG
GAGACGGGAACATTTGGTCCTTTGCCTGTATATTTTTCGGGGTCGAAACA
AGCTTTCAAGGGAAAAGTCAAGGATCCAATACCGATAAAACCGAGAGGTG
CTCCATCTAAGAAAAGGCCAAAGGCATTTTACGAGAAATTCAGTTCCAGG
AACAAAGGTAACTGCATAAAAATATTTATTAGTTTGCCTCGAAAAATATT
AATATGTACACTGTTCTCAATGCCATTATTTACTGTCTTTGTTTTTTTAA
TAGCATGCGATATTTGATTCGAGGAAATAAGTTACTCCCTCCGTCCCATA
ATAGATGTCTTAGATTTGTCAAAATTTAGATGAATCTAGACACTATTTAG
TATATAGGTTCATCCAAATTTTGAAAAATCTAAGACATCTATTTTGGGAC
GGAGGGAGTATTAAGTCTGCAATACTTCATTTTTGGGTGAGTTAAAAAGC
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TTAAATTTTGATGGGGTGTGGATGATCGAGAGTGGTGTCGATGGGTATGG
ATGATTGAGAGTGGTGTGTCGATGGGTGTGGATTTTCGAGAGTGGTGTCG
ATGGTTTTGGATGTTTGAGAGTGGTGTCGATGGTTCTGGATGATCGAGAG
TGGTGTCGATGGGTGTGGATGTTCAAGAGTGGTGTCGATGGTTCTAGATG
ATCGAGAGTGATGTCGATGGGTCTGGATGATCGAGAGTGGTGTCGATGGG
TGTGGATGTTCGAGAGTTGTGTCGATGGGTCTGGATGATCGAGAGTGGTG
TCGATGGTTCTGGGTGTTCGAGAGTGATGTCGATGGTTCCGGATGGTCGA
GAATGGCGTCGATGGTTCTGGATGTTTGAGAGTGATTTCAATGAGTTTTG
TATATTCAAAATTATAAAATTTGACATTCATGATCGTGTCCTAGTCCAAG
TCTTGTTGTACAATCGTTATTATTTAGAAAACCATTATTACTTGAGAAAA
AAAGAAAGACCTAGGTCAACTGGGACGTCCGCACAGCCCTATAAATACAC
GTCACATGTAGCAAGATCGTATACTTTTCACGCCGTCCCGACCGCCACTT
TTTTGACGCGCCTTGTCTCCATATTTTTCTCCCCTTTCTAGCCGCCATCG
CCATCTCTAAGCCTTTCCAGCCGCTGCTACCGATGGATTCCCCGATAAGA
TCTGAATCGCATTGCGCCTCGAGCTCTAAGAAATCATGACACCGGGTCAA
AAAGGTTTGAATGTGTCCATATATTCTTGATCATATATTTGTTTATTGCT
TATACTCACAAAATCTCCACGCTAATTGACGCAGGGGATATCTACGATGA
AGGCAATTCACGAGGAGTACGAGCCTGCTAAAAAATCTGCAAGTGCATGA
AAACCACCCGTCCATCAGGTATTTTTTTTTCAAACCAGATATGTTAATTC
CAGCGAGTGTATATAGTTAATTCTGGCCAGATTAGATTGTTTAAATCTAG
CGAAATTAGACCGTTACTTATAGCGAGATTAGAATGTTTAATTCATATGA
GGTTAGACACTTTTTGTTAGGACTAGATTAGACTATTTTTATTACGGGAG
ATTAGACTCTTTTTATCAGGCCAAGATTATGATGTATAAATCAGAGGAGA
TTATGATGTATAAATCCGGAGAGATAAGGTTGTATAATTACGGTGATATT
TCATTGTTACATGGCAATATTAGATTGTTTAATTCTACCGGTATTTGACT
ATGTAAATCTAACGATAATAGACTATTATCGCAAAAAAAAAGACTATTAA
TTGTAGCTCGGTTAGATACTTTTTATTATGGTGAGATTAGACTCATTATA
TTAGGACGATATTAGTCTCTTTTTAGTTAAGTGCGATTAAACTGCTTTAA
TTACGATGAAGTTTCTCTTTTTTAATTAAGACGATAGGGTTTCTCTTTTT
AATTAAGACGATAGTAGAAGAGATTAGACTACTACTTTAATTGTCCCATA
GGGTAATGTCTTTCTTCTACAACCTATAGGGTACTCAAGCGTGCTCACAG
AAAGCGTATTGCAATGCATTAGCTAAGGTGCTGACGCCTGATAGGCATGC
CTTCATTGCCGCTAGTCTGGGGCACTTGCTACACTAACAGCCTATGAACA
TCTGGCGGCACATGTGCTGCTGGTTGGCCAAAAAATGATGTGAAAGCTAA
AGCTTTTATTGTGAAAAGTAAACCGGTAAGGATAACAATTACCGACGTTG
CAAAATCTTATGGGATTGCACGCAAAAGGCCAAGATTTTCATCTCATCTT
CTTGGGAGAACTTCTGCCTTGTACGCTGAACTGGAAAATAAACTGAACAG
AGGCATTAGTTTTTCTTTGTTGATTGAGAGGATGAGCCTAATTTGCCTCT
TGAAGATTTTTTGCAATGTTTTGTGTTATACACGATTGGGAGAGTATTGT
GCCCTACAACGTCCTTTTCAGTAAATTCCAAGTATTTGGGCATGGTTGAC
ACGATCTAAAAAGTTAAGTCCATTAATTAGGCAAAACTGACACTGGATCA
CTTATTAGCTAGTATACAAAACTATAGGCTTGGAAAAGCTAATTTAGAAG
GAAATATCTCACTTCTTCGGGTTATTCCACTTATTTTCTTTCTTGACATC
TTATAACAAATCACTATTTTACATTTTAAATCATTCAAATTTATACAACT
TTGCTCCTGGGAGAAGTTCAAGGCTTCAGATCTAGATGACACCGTTGATT
ACACTCATAGGCGGATACCTTTGATGCAACATTGGAACGAAGAAAAATCT
AGAAAGATTGATAGAATTGACGAACTACATGGCTTCGTAGCCGAAGAGGT
ACAATATGGGATTAGCCGGCTAAAGGTAGTCTTCCACATATTGAAAATAG
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ATCCCATATTGCACCTCTCCGGCTGCGAAGCCATGTAGTTCGTCAATTCT
ATCAATCTTTCTAGCTTTTTCTTCGTTTCAGTGTTGCATCAAACGTATCT
ACCTCTGAGTGTAATCAACGGTGTCATCTAGATCCGAAACCCTGAACTTC
TCCCAGTACCAAAGCTGTATAAATTTGAATTGAGTTAAAATGTAAAATAG
CGATTTGTTATAAGATGTTAAGAAAGAAAAGAAGTGGAATAACCTGAAGA
AGTGGGAGATTTCCTTACAAATTAGCTTTTCCAAGCGTATAGTTTCTATA
CTAGCTAATAAGTGATCTAGCGTTAGTTTTGCCCAATTAATGAACTTAAC
TTTTTGGACCGTGTCGATCATGCCCAAATACTTGGAATTTACTAAAAATG
ATGTTGTAGGGCGCAATACTCTCCCAATCGTGTATAACACAAAACATTGC
AAAAATCTTCAAGCGGAAAATTAGGACCGCTCATCCTCTCAATCAACGAA
GAAAAATTGATGTTGCTCTTCAGTTTATTTTTCAGTTCAGCGTACAAGGC
AGAAATTCCTTCAGAGAAGATGAGATGAAAATCTTAGCCTTTTGCGTGCA
ATCCCATAAGATTTTCAACGTCGGTAATTGTCATTCTTACCGGTTTACCT
TTCACAATGAAAGCTTTAGCTTTTACATCATATTTTTTGGTCAACCAGCG
ACACATGTGCCGCCGGATGTTCATAGCTTGTAACTGGAGAAAGTGCCCCA
GATCGGCGGCAACGATGAAGCCACGCCTATCAGCCATCAGCACCTTAGCT
AATGCATTGCAATACGCTTTCTCTGCACGCCTGAGTACGCTACAGGTTGT
AGAAGAAAGACATTAGCCTAAAAGACAATTAAAGTAGTAGTCTAATCTCT
CCAGATTTAAACAGTTTACTATTGTATTAATTAAAAAAGAGAAACTTCAT
CGTAATTAAAGCAGTCTAATCATGCCTAACTAAAAAGAGACTAATCTTGT
CCTAATAAATGAGTCTAATCTCACCATAATAAAGTGTCTAACCAAGCTAG
AATTAGCAGTCTATTATCGCTAGAATTAAACTGTCAAATACTGATAGAAT
TAAACAATCTAATATCACCATAATTACACAACCTAATCTCTCCCCGGATA
TATACATCGTAATCTCCCCCGATTTATACGTCATAATCTCTACATGATAA
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AAGCGTCTAACCTTCTTTGAATTAAACATTCTAATCACGAGTCTAATCTT
GTTAGAGTTAAGCAATCTAATCTGGCCAGAATTAACTGTATACACTCGCC
GGAATTAACATATCAGATTTGGAAAAAAAAGAAGAGAATACCTCATTAAC
TATGGTTTTCGTGCACTCGCAGATTTTTTAGGAGGCTCGTACTCCTCGCG
AATTGTCTTCATAGTGGGGTACGTCAATTAGCATGGAGATTTCGTGAGTA
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AGGTTGACAAATTAACCAACTTAGTATGAGATACATAAGATAAAAACTAT
ATTATTAAAAACTTCAAATGTTATATTTTCTAATGATATAATTTTTATAT
TATATAATTTATTTTATATAGCTCATGCGGGACGATCTAGGTATACGCGG
AAGTCTTATAAACTGGAATAGAGGGAGTATATAATATATGGACGCATTTA
AACCTTTTGACCCGGTGTCGTGATTTCTTAGAGCTCGAGGTCCATCTAAC
GGCAACACAACAATGGGGCATGTCAGAAATGCCCAATTACTACCTATAAC
CGGCCCTAGCCAACCCGCCTCCTCAGAGCTCCCCCGCGCGCACAGCCTCG
TTAACCGTCCGATCAGCTGAGAATAGTTCCTGACAGCCTTCATTTTCGCT
TGTGTCCGTTCGATCTTGTCATTTCTTGTGTTACTTGTTGCGTTCCTCGT
TAGGTCGCTTTGAACTGGGTCCGCCAAACTCGTGGGGTAGGCGTCTGGAG
ACAGCGGGGTCAACTTCTCTATGTCGCTCGTTTATCTGGAGGCCTCGAGT
GATGGGCATGGCATGGCCATGGGCGTGGTGAACAGCGCCTGATCATGGTC
AAGGACACGGTGTACAGCGCATGGTTTATTTTCCCTGACATCTGCACCTT
TCTTTACCCTCGCTGCCGCTGGCCCCTGCCGCTAGCAGGCCCCCCATGTA
ACTCACCGCATGGGTGGAGGGTGTTTCTGGGCGATGGACGGGGAGGTCCA
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AAGAGGTCCTGTACCGATGGACGTGAGGGCCTTGACTGGAGACTTCTGCG
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TCTTTTGCTACTTCATGCTCTTCTTGTTCTATGGCTGACACCAGGGTCGA
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GCGGGTAAAAGGAAGCAGAGCATCCTGGACCTGGAGATGGCCTCTCTTTT
GGCACTGTGAGCGCGTCAGGATGGTACGTGATGGGCGGCGCGGTGGACTT
TGGTCGACGGCCTCTTGCTTTTCTTTTCTCACATTGCCGCGTTTCCTTTT
CTCTGCCTTTGGCTGGCCTCCCTTTTACCCGGTCCCACCTATCCGTGAGC
CTGTGTGCCGGAAATCCTGTCTGCCCTCCTTCTGATTTTACTCCTCTCTT
CAAGAGGGATGAAAATTCCCCCCAGTCGTCGCTCCTCTCCTTCCCCCAAT
CGTCGCCGCCTCTCCTCTCTCTCTCCCGTCCTATGGGTCTCCTCCGCACT
CCGCAGCGCCCCTCCTATAGCTCCCATGCCCTGGGAGTTCTTCCATTTTG
TTGCTGCATGAGCGCGTGCCAAAGGAGGGCGGCGGCGCAAAGGGTGAGCG
GCAGGCGGACGGAGCTGCATGGGATGGTCACGGTGGCGGGCCAGAGGAGG
CGCTGTAGGAGTGCGAGCGGAGGAGGATGGTGGCGCGCCAGTGGAGTCGC
CGTCGCTGGCGTGGCATGCCGCCTCAACATGGTCATTCATAACTGCTGCT
CCTCTCCTCCTCCCCAATAGGCCGGCACCTCTTCTCCTCCCCCCCGCTCC
AGTGCCACAAGAGGCGGTACATAGGAAGTGGGTGGAGGCATCACGACTCC
GGGGTCGAAGCTATGCAGAGGATGTTGGGGACGGAGGAGGAGAACCCGGC
GGCAAGGTTGGCGAGGGAGACGCCTGTACCCGTCCCATGGTTCTTCTTGG
GAGGGCTCGCCTTGGTCTGCTCGGGGACAGAAGACAACATCGGACTACTA
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ATCTGGTTAAGCTCGGTTGGTGTGTCATGTGCTTGATGTTTCACTATAGG
TTGTTATTTGGTAGGTGACACAAATGCTAAATGAGAGGTAGATCTCGGGA
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TCCATGACTTGGTTATGCTCGTTAGTGTGTCATGTGCTTTGATGTTACAC
TTTATATTGTGGTTTGGTGGCTTATACAAACGCTAAATGAGATCTGGAGC
TTAGGAGATTTTTATTTATAGTTGTTTAATTGGTATTCTTGGTATTAGCT
CTTGCACTCTGGCGCCTAGCTTCGGCACGACTTGGTAGTGACACAACTAA
CCTCGACATGGCCACAATGGCGACACAAGAGCTCGACCGTGTCATGTCGC
TGCGAGGGGCACCAAGCTACTTATATGCATTCAGGCAGTATTCTGGTTAC
GACTAACGAGCACCAGGGAAAGGCACTGTTCTATTGGTTCTTTGAGGCTA
TGGACAAACCTGACGAGAAGCCATTGGTCTTATGGTTAAATGGAGGTTGC
TAGATAACTGTATTATGTCGTGGAACTTCAGAAACTTCGAGGTTGAAAGA
CGTCTGTGATCTGACAATATATCATGTGCTTTTGTTTTGCAAATGTTGCA
GGACCTGGTTGTTCTTCAGTTCGGTTTGTGCAGGTATAAGAGCTTGGACC
ATTTCGTGTGAAGAAGATGTTCCTAAGCTTCGGTTCAATCATTACGGCTG
GAAGCAAGGCAAGTGCAAACCAGCAATAACATGCCATGTATAATCAGATA
GCCGGATTTGTACCATAATAATGGAGCATGTAATTAACTCCCTTCGATGA
CCTTTGAGCTGCCAACTTGCTGTTCCTTGACTGATACGCACGCCGGTAAT
TCCACTGGTATGTGTATCTTACTGTATTTTAGTTTCAGACAGTGGCTACC
CGAGTTTCTTAACAAGATAGCATGGCATTCCTCCTTTGTAGTACATGGTT
CATATGCTTTCCTTGCCAGAGGTTCCCTCAGAACAAAAATGAAAGAGTTC
AACATAACCAGAGAGAGCTATGCAGGTCTGACATCTTATTCATAGTTCAT
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TCCTTAATTTTTTTGCGACGCGCTAGGACACTACATTCCCCGGCTAGCTA
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TGATTTCCTATGGAATTCATGATTTATGCTGATCAGTTGGTGGGTTCTTA
ATGTTATTTGTTCAGGTTGTTATGCAGCTTCTCGATCTTCCGGGAATCAC
TGAAGGTGCTAAACATGGAAAGGGTAGAGGGAGGCATGTAATATGTCCAC
CTTTTGCTCTATTTTTTGCAGTGCAGCAGCATGGTCGGAAATGTGTCATG
CCATATCAGACATGGATATTTAATTATATCCTCTACAAGATCTCATGGCA
CTGTTAGTTTAATAGTTCTGCCAACATTGGGTATCCTTCTCTTGCTGGAC
TTAGTTGAGCACCAGCAGTATGTGTTTACAAAGGGGCATTGTCACTTCCA
CCTAATTATATCTATGTAGGGAATCAAATATGGTATAGTGCACTGTATAA
TTCTAATTGTCATTATTGTATCAGCCATTGTCTTTTAACTTTCTTGCTCA
TAATGCATATTTTTACTAAATATGTAATGGAAGTTAACCAGATATGTTCT
TGAAAGCACTGAAGCCTGGATGAGACATTCACCTTCAACATCTTATGTCA
GATTGTTAGAATGAATTTTGTTTCTGAGACCTTTTCAAAGAAAACTAATT
TGTGGATCATTAAGGTCGCTGCATGTTCTACTTACATCCTATCCTTAGGA
ATAGTTTTATCTCATATATATACGCTTTTTGATATAGTAAAATCCATAAT
ATCATGCTGATTGTCACTTTAGGTGATGTAGAGGCACCTTGCCGCAGAGG
TGGTTCGTGCTATGGGTGATAAAGTGTCGGTTATTGCTATCTTTGTGCAG
AGCACCGGTAAAGCCCATTGCGCTGTGCAGCAGCTTGAACATGCGGTGGG
AGCGGCGTTCAGACCATATGCATGGCTCGGGAAGTGGCTCTGTGTCTAGA
GGCCGCTAGCACGGCTGATGGTAGGACGCCAAGGTGAGTTTCTCTCTCCA
AACTTGTGTGATTTGGTGTGCTTCCTTTTTTGTTAACTGGATCTACTACT
CATGAGAGCATGTCCTTTCTTATCAGTTCCATCCACTATCTGTTGTGTTC
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CCGTACCACGAGGAAGTAGCTATAGCAACTATAGCATATTGACTTGTGGT
TATGTTTATATCTGCAACCAAGATTTATACGGTGTAGATTTTCATTCCTT
CAATTTCGGAAATAAGAGAGCAATTTCTTAAGGGCACCAATATTTATCTA
ATCGACAGGTGAATATTATCAAGTTTGGCTGTAGTTTCAGTTTTTAAGAG
TTCCAATTTGTGAGCATGCTTATGGATTTTTTTAGTTTCTTACTCAGGTC
CACACTAATGCATTGCGAGGGAGTTCCCATTTAGCTAACTTGCTTTTAGT
ATGTAGCTTATAGACAGGTCTGCTCAGTAATTCTGACAGTTAAATTCTAT
TAACCAGCTAATTGGTAAACTGGGTGTTACTGCCATAATAGTTTACTTGG
TACTCAGATAGAAAGGTTTGGAGAGATTTCTATTATACTGAATTCCTTCA
GCAACCAATTATATAGTTCCTTTCGATTGCTGCACTATCCTTGCTTAATA
GGCAGATTTTACAAAAAAAAAGTAGGAGTGGGCAAGGATATCCTCCACTG
TTCGTGAATATATGAGTGTTGTTTGGACTGACAAGAAATGACAAGAAAGG
GAGTGTTGCTTCAGTTATTATTGTATATATGAAGCGCCAATGTTTGGTGA
AACAGTGCTTGATCCAGATGAAGGAGAAGAAACAATGCTTAATCCGGATA
AGGAGAAGTTGTTCCGCTGACAGTCATGACGGCCTATAACATGGGCATGC
TGGAGTAGCAAAAGAACATAAAACCATGCTAGAGCTGGATGGATTCACAC
AGAACGCATATGAAAAGCTTCCTGTGAAACCTAGCTTAGCTATGTTTTCT
AATGTATGAAACATAAGGCCTTAGTTCTAATTAGCAAACACTTATCTTTG
CTACTGTTTCTACTTTTGGTGTTTTCGACAGTAGGTAATCTGCACTATTT
AGCTGTAGGCATTTATTAGAGATTCAGTCTCATGTAATAGTAGGTATATA
TGTGTTGCCACGAAGATTGGTCTATGGTCCTCTGTTGTGTAAGAATGATG
ATTTGGTGAGCTTGAGTAATGACCCTGTTTAGCTATGGTAGCCTATCTTA
TGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.