Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039954

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039954
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039954
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTCTGATTTCAAAACGCAGCTCTGCTTCGTCGAGGCAATGCTTCGAGT
TTGACACCAGGACCGGCGTTGCAGGGCTTCTTGAAGGAGCATCTCGGATA
TTTCTTGACGATTAGATCACGCTTCAAGGGTAAAATCCATTCACGTCTTT
TGTAATTAATGTGAGTAGGTTTATTTCTGGTCTAGATAACCAATTAAGTC
ATGTTACCTAGGCGTCTCCCGTTCGGAAGGGTTATGCAATATTTATAGCC
GTAACTCTTTCGGATTGTCCACGTTTTTGGTCAACCCGAGGATGTGTAGA
TTGGGTATGTTTTCCATGCTTTGCTCTGCTCCGAGACCGGATTTTGGTGG
CGCCTCCTCGTCGTTCTCCGGATGCACATCCTCTCGGCTTTTTTGCCGAA
ACGTGTATCGGGAGAACAGCGGGGAGGTGCTGCCAAAATTCTGTCTCGGT
TCAGGGTATAGCATGGAGAACATATCCAATCTACACATCTTCAGGTGGGA
TTAGGTCCTTTACCTATTAGAGAGATATATAGGTGGATGCATGCCGTAAA
ACATGATTTTGCTCGAATTAAATGGACTAAAAATTTGTAAATTAAATGCA
TTATATGCTTGTTTTTTGGTACTTCTTAGAGGATGGAGAATCATCGTGCC
TGGATGTACAATGGCCAACTCAGTCAGGCGAAAATGACCACAGAATGGAA
GGAAAAGACCGACAAGTTGTTGGAACCACCTCAAGGCTAATCCCCGAGAT
ACACTACGACGCGCGCGTGAACTGCGTGACCAATTGGTATGGGCACGAGA
AGAAGATTGCAATGCCGAAGAAGCGCGCCCGAAAAAGGCTTCTGACGCGT
GAGCAATACATGAAGGTAGGCATATTTGCTTCTTTTTACTTCACACATGA
CTATAGTTTACTTTCATTCCTCTATTAATTTATATCATGTGTATGTAGGT
GCCTCCTCAGTATGCCGCCTTCAAGGGCCAATGCTTTCAGTTGATGGTTG
CCAGGTGGGTATCCAAGGACTATGTGGAAGCTCACATGGATGCGATGTGT
CGGCGTGAGATGTTGGGTGAAGGAACACACCGTCAAGGCAACCTCACCAT
CACTGGCGTCATCCAGAAAAGGGTGAGCAAATCCGTAATTTATTTATTTA
TTCCTACCACTTTATTCTATATGTGTGATTGTCTATTTTATTTATCTTAA
TTATTTCTCTTGCAGAAACTTGACATAGACGAGGACATCACTCACTTTTA
GGCTTTCTACCCGGGAGGTGAAGAAACCCGAGGAGGGGAAGTCAAAGTGG
ATGACCCTAGGATCTGAGCTGAGGGTTGGAAAATACGAGACGAAGTACAA
GAGTCGCATGGCGAGAACTCAAACCCGCTCACGGAGCCCTTCGACCCTGA
GGTTGCTATGCTAGCAGGAGATGGCAAGAAGAATGGTCGATTATATGTTG
CCAACGGTTGCATCCCTGAGATCTCCATTCCATCTAAGAGGCAACTCTAT
GGTAGTGGGAAGGGCTCGTGTATAGAGACGCGCCCACAACCTTCACAGGT
CATGTATAGTAGGATGCAGGTATGGTACTCTTCATTGATCATACAATAAT
TGAATATATGTTTGCATTGTAACGATGATGATGAAATTGTGATAACACGA
TGTAGGCTCAACTAGAGGAGGATCGGCGAAAGAGAGAGGAGGCTGAGCAA
AAGGTTCTCCAAATGCATGAGATGTGGGTTGAGCAACAACGAGCAGTGCA
TGCTAGGTTCGCAGCCTATGATGCGCAATTTCATGTGAGTTCTTTCCCAT
AAGACTGGATGGCTAACTCCATTCAACTTGTAAAACTTACCTTCTCAAAT
TGGATTTATAGCTCTTAGCTTCTGCGAATGGCACAGCTCCTCCTATTCTT
CCTCCTTTGCCTTCGATGAACTTCCAATTCGTAAGTTGTGTTGCATCTAT
TCAATACTACATCTTATTGTGACATGTTTACCGTCTCATAACCGTTTACC
ATGTTTTGTAGGGAATGCTTTCGGCCGGATCCAACAACAAACCAACCCCT
CCGGAGGATGAAAGCCCTGTGACGCCTGCCACTACGAGCGTGCCCATGCC
GAATCTGGACAACCCGAACATTAGGAGGAAACTTTGTGAGTTCCCACACT
CTTTGTCAATTTCTTGTTTGTATACATCTTGTGTCAAATTGTACCAAGTC
CTTACCATATAGCTACATAGATACCAAGTTTTATGGTTGTTCCAAATATA
CCCTTGTTAGAATCAAATGTCGATATTCTTCGGAGAATCATCTTACCATA
TACATACCAAGTCCACATAGCTACATAGATAAAAAAATTGAATTTGCTTG
TGCAAAACTATACCTTGTTAGAATCATGTAATATTTTTACCATATAGCTA
CATAGATGATAAATTAAAATTATGCTAGTGCTAAATTTACCTTATTAGTA
TCATGTAAATATGTTTGTTAGAATCATCTTACCATATAGCTATATATATA
CCTAGTTTGAACTTTTTAAGATTGCATCATTTTTACTCATGCTTGTGTGT
TTTGCACTTTGTAGGATTACATCAAGGAAGCCTATGTTGTGGTGGAACAT
GGTCGCCGTTGATGGAGCTATGTACCACATGCTAGAGGACTGTGTGCCAC
TTGGTTGTGTTGATGGATATGTGAACTTGAATTCAAGTGTTTGTTGAACT
TGTAAACTTTATATGCATGTTTGATGTACTACTGCACTTGTGAACCTATT
ATGTGAGTTCTTGCTGTGATATATGTGTGTTGTGAGCCTACATATGATTA
TGTATGTCCAGATTTGTTTTGAAATGCAGGGTTTAATGAAAAACAGCATG
AACCTGCCAATTTTTCGTGGACTTTGTCGTGTATCCTAGGAAAAACACTC
GGCAAAAAAGAACATCTTTCCGTGTATCCCAGGTAAAACACTTGGTAAAC
AGAACATCTTTGCCGTGTATTACCCTAAGAGACACTCGGCAAAAATTACT
TCTTTACCGTGTATTACATCAGAAATACTCGGCAAATATTATAAGTCGAC
GTGTCTCCATCCAGTGAATGGGGCGATGTGAAGAAATCCCAGCCGTTAAT
CTTTGCTGTGTGTTTGTTGGAAACACTCGGCAAACATTTGACGCCGTCTT
CAGCTGCCGCACCGTGAACGCATTATTTTTACCGAGTGCGCGGCTGGTAG
ACACTCGGCAAAATTTTGCTAAGTATCCGGGAGTTAAACACTCGGCAAAG
TCGAGTTTGCCGGCGGGGTGTACGTTGTGAACTCTTTGCCGAGTGTAAAT
ACACGGCAAACGTTTGCCGAGTGTATTTCGGCCTTTGCTGTGTATTTTAA
ATACCCAGTAAAAAATCGTTTCCTGTAGTGTTTACTTTCCTCCATTCTTT
TTTGAAATATAGTTCTTTTCAAGCAATGCTTGAGTGCTTTGTATTACTTA
GGTATGGTACCTTTCATATCAGCGATGATCTTTTATATGAGTCGGGACAA
TCAACATTACACTTGTTGATAATTGAGTTTGCATGCTAATTCTGATGTCC
TCAATTTGTTTTGAGAGGTAGGTCAAGTCTTACTTTGATGAAAAATAGCA
GAGGTTAAATTTTTAGCTTAATGATTTTTCTCTAGCAATCTTGCCACACG
CCACTTGCTTATATAGTTGTTTGAATTGTATGCCACTGGACAATGCATAG
TAGTAACTCATGTTCTTAACACATGTTCAGTGGCATCATATGAAATTTAT
TTCTTTCCAGTGGCACATTACTGTCCATTGGAATCATATAAAGTTTCTGT
CTTTCCAGTTTAACCTCAAATGGTAGGTTTGACACATGTGTTTGCGCACA
TGTATATATGAATTAAATAAGGATACAGTACGTGTTAAGTTTGTGCTCTA
AATTTTCATGAAGTTGTGTACATAATTTGCTAGGCAGACAATGCTTAATG
AGATGTTCATGTATTTTATAAAAAACACAGCGTACCATTTAACAATATTT
AATGAAGATGTTCATGGACATTTTACATAGTGTGCTCTGAATTAAGTTTG
TGCTCTATATTATAAATGCACTATCCGAGAGATAGACCGGTCTGCAATGC
GATATTAGCTCGGTCCTTACTGAAGTTGACAAGGCTTGCAAAGTAATAAT
TGATTGAGATTATTTCGTTATCCTATGTTCTATTTATCAGTGGTTTTGTT
TGTCTTTATTACTTAATAGTATAACTTTCTTGATATAATTTCCTAGGAAT
ATTTCTTCTTGTGCTACATGTTATTTTGGAAACACTTTGCTATGGTTGGG
TGTTCCTTATCTGAAAATGGTTTTAGGGCAAGGTCACTTCTGCATTTACA
TAAACTTTCTGGTTCCAATTATGTCTTTGATGAGTGCACCCAACAGTTCC
AATCAGATATGAAGTAATACAGTTTGCAATTAGGTCTCTCGAGTACAATG
CTCAAATTTAAGTTAATGTAGTTGATGAGTTACTTTACCTGATATTTTCA
AATATAAGAGGTTAGGATGCATCCACGAGCCATCATTTTGACTTTGTGAC
ATGCAGTTGCAGTTTCCTTTCTTTGGCACCTAGATTTTAGCATGTTTAGA
TTACATTAATTGTGTCTGAGCTTAGCTCAACGCAATGGCTGCTCTCTATG
TTTTATAGTAATAAAGATCATGGAGATATACCCTCCACTGATATTTGGTT
TGCATTCATTTCACCCCTGTTCAAGGAAATTGTCTTTGGCAGGCATGCAT
CCAGTTTAAGTTACAACTAAATAATGTCGTATTTGTTAATTATTGTAGAT
ACTGACCACAAATTGTTGCATTTTCTATGTATAGCATGGAAGGCCTGCCA
AAGCATACGCGAGAACCAAAATTATGCTTGTCGTAGATGGTGCGAACCTG
ATGGAGTGCCACTGAGAAACAACATCCTAGACAACCGATCAGTCTGCATT
TTCCCTTATCTTTTACCTTTTGTATATTGATGGATTCTAATATAGCATCA
GTTTGCATTTTCCCTTATCTTGCTATTACCGTTTGTATATTCCTCTAAGC
ACTCATCCATGCTCACTGAGTTATTATGCAAATAGGTTGGTTTTATCTTA
TGCATTGGAAAAACAGTGATCTATTTTCCTCTCTTACGCATGAATTTCTT
TGTAGCAGATACTGTTTTTTTTGTTATCCATAGATGTAGGCATTTTTGGG
GCATCACACCTGAGCATTGGGCAAGTACCAAACAAGAAAGCCATGACTTT
TTACATTGGGAACTTGCTGACTCCAACACACCGACTTTTTGTTGTGAAAC
TGAATGGAATCCCTCAATGTATTTAGCTACTACTATCTCAATACCATCTA
TTTGTAGCTAATTGTGATGCATTTCATATTTTCACTACTTGATGCATCAT
TTTTTGCTTTTAACACACTATGTATCTACCCGGTCCATTGTGATGTCTAA
TAGCTTAAATTGTTATGTGTGTAATTTTGTGTTGCCTCAGTGTGAATTCA
ATAGAATTGTAAATCAGTGTAAATTACATGGGATCGTGTACCAAGACACA
CTAATAAATCTTCCTTTTGATGTTAATATTACTCACTGATATATGTGTTA
TTTCTTTTGTTGTCTGGCATAGATTAGGCTCAAGATATATATCTTCCTTG
TGTGACTTCCAATTATCCTTCACATGAAATGTTCAACCCTGTCGAAGTAG
TCTCATTTCAAATCTTTTATCAAATTTGAATCTAGACGCTTTCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.