Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039719

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039719
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039719
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGGAGAACAATCATTGCTCCAGTAGGGCCGTCCGATCGTCACTCCAGGAT TCGGCCGTGAATACCACGCAGAGACGTATAGCCACTCCCCGCTTGGCCCA CTCGATCGCCTCCACATCCTCCTCGCATCCCCACCGGCCACCGGCCTCCG TCCGCCGCGGCCCCTCCTGCCCGGCTGCCCCTCTCCCGCCGGCCGCGGCG CCTTACCCGATCCAGCGTCGCTGCCACGCAGAGCTCCGATCACGTCCACG TGTGCGGGGCGGCGGCTGCAAGCCTGCCATTTGCTCTGCTGGCTGCGTAC CGTCGTCTCGCACCTCGGCAGCTGTGGCCGCTGGTCGCCTGATCTGCTCC GCGCGGCGGTGAGCAGTACAGTTCAAAATTCATCACCATTGATTTCACTA CCTCTGTGATTCCTCTGACAGTCTAACCGAACAATTGTAAGGAATCCTCG AGCCGAATGGAGAGGTCCTCGTTCGCGTCGGCGAGCTCCGGCGAGCTCGC CGCCGCCGCCGTTTCAGGACTTGGAAGGCCGGTGAGAGTGATACCGCTGC GCCACCCTCTGGACGCGGCTGCGCGGGGCCCAGCCTCTTCCTCCTCCTCC GCCCGGTCGTTGTTGTCGGCGGCGATGGAGAGGGTGCGGAGTATGGGGCC GTGGGAATGGGCGGAAGCGGCTCTCCCGTGCTTGGCGTGGATGCGGAGCT ACAGGTGGAAGGAGGACCTCCAGGCCGACCTCGCCGCTGGAATCACTGTA GGGGTCATGCTTGTGCCTCAGGTACGCTGTTACTCTGATAATTTCTTGTA GATCTTATATTGCTTTGACATGATCGACTGTCAATCTAAAATGTTTTAGT GACCAAGTTCGTTGAGATGTTTACTCGAAATAAATGTCTCTGAGGATTAG CTGAATCTTTTCGCTCCTGCTCGAGCTTATTGACTTATTGGTCGCTCGAG TTAAGAAAACAAACTATTTGTTGCTCTACTGCGTGTCTTAAAGTATTATT GCTGTCCGTCTATGAGAAAAATTCTGAAATGCTATTCTATTGGAGCCGGT TAAACATGAATTCTGAGTTCTTAAGTCGTGAATACAGCTTAATTGAGTAG TTAAGTGAGCAAAGGAGTGTTATTATGAGCAACCCATGGACGGTGGATCC CATACATGGTTTGTTTGCAAACATTACTACTAGTGGAACCGTGATTTTGT GCATGTTGCATTGAGATATATTTTCATGCAAGATTTTGAAGTGCTACTGT TATTTTGAATACGGAGTTGATCTCTGTAATTCATTCAAGTTTGATGGGAC GGTTGATTATTCATAGAGCTTACTTAAAATGTCTAGTCACCTAAAATCAC TGTGTGAGCACATTACAAAATTACAATTTGAGTATCTAGGTTGGTATGGC TAGTCTCCTACACCACTGTTAGCACATTGCAGAATTTCATGTCTTATTTT CCATGTGATGAGCTTGTGGTTATTTATAGTTGCAAACGGCACATCCTTCA TGTAAGTTTAACTGGTTAAATTGGAATGAGATTGCCTCAACCTTTGTAGG CGAAAGTTTAGGAAGTCATAGGTGGTAATTGGGTTCCTTGGCAACCATTG ATCACCAAGTGTACCAGGGAAAAGGCACTATAATTAATTGATTGTGCTTA ATACAATTTTCTCTTGAATTTGGTATGTTTCTGTATTCATGTATTTGAAG TTTGGCGCTCATTTGCTGAGATTCCTGGATTAACTGAACTTTTTGGGCGT TCCTGCTAAATTGTATTGAAAAGTTGTTCGCAATATCTGAACTGGGTTAC ATAACTTGTTCCTTGTCCTAATTTTCTTAAAACTTAGTACTACCTCTGAT CCAAATTAGTTGTCGCAGGTTCACTGAACCTAGACAGATTTAGGCAACAT TTTGCCTAATCTGCGACAATTAATTTGGATCGGAGGGAGTAACAAAAAGT CCTGTTCACATGTGTGCTGGCTTGGTGTTAGTTTTTTTTACCCTCCATTT GCTCTACTTTTTTTGGTCAGAAATTCATTTATGTATTGTGTTGTAGGCAA TGTCATATGCAAAGCTGGCTGGGCTTCACCCAATTTATGGGCTGTGTAAG TGCTTACATCTGGCTCTCCTTACTTTTTTTCTTTTATGTCATCAAATGAG TGTTTTAGTTGACGCAAATTATCCTTTTCATTTCCATTGTGCTGAACAGA CACAGGCTTTGTCCCACTGATTGTCTACGCACTTTTTGGGTCCTCACGAC AATTAGCAGTAGGTCCAGTGGCACTTGTTTCTCTGCTAGTGTCCAATGTC CTTGGGGGTATAGTTAATTCATCTAGTGAGCTGTATACAGAATTAGCCAT ATTATTGGCGTTCATGGTTGGGATATTGGAATGCTTGATGGGATTGCTAA GGTAATTCTGTATTTACCAAAGAAAGTTGATGTTCCTGTCTTTACCCAAT TTGGAGAAATTGAAATTTGAAGCATTGACTTTGCTGTTGTAAAGAAGAAA ACCTATATGCAGATTCATTGTTATTCTATGCTTACTGCATTATAAATATA ACAATGTGTATAGCTCAGATGCTTAACCCGCTAGCTGCATGTCTTCATCT TCTGATGCTTTATCTTTCGGTAGAGTTTTTACACAAGGACTAGCCGCTTT CTATTGTATTTTGCCTTGTTGGCAAAAGTGTCCTGAAATCATTTGACTCT GGGAAAGGGGTATATTACGAAAGCAGCACCTCAGTACCCCCCAATGAACT ATTCACACGTATTGCTTCTCTTTATGGCTTGTATGGAAAACAGATGATTG GACCTTCATATGTTGTATTGAACATGCACTATATCCATGAACTTGCTGGT ATCTTTTTTGAATAGTGCATGGGAGCATCAGATTCTCGCTTGTGTTGTTA CAACTTACAAGTGTATCCTACTAGAGATCCAAGTATGTTTTCTTTCAGTT TTGTACAGAGGCACAAGAAAAAAATGCTCACGTCTTGCTTTTGGTAGTAG AAGAAACCTAAATTGCTATCTGTACTATGTCCATTGAAGTCCTTTTATAA GTAGGTTTACTGTAATGCTCCTTGTCTCAATTAGATGGACTTTAGGTGCA TGTTGCCTATTTCTTTAGACTTAACCATCTTCATGATCCGTGGAAGATAT CATCTGCATACGTCTGATTTTCATTAAGGTTGTGTAACTCTTCATGTTTT TTTCATTTTCACAGACTTGGTTGGCTTATTCGTTTCATCAGCCATTCGGT AATATCTGGATTCACTACAGCTTCAGCCATTGTAATTGGTTTGTCCCAAA TCAAGTATTTCTTAGGTTACAGTGTTACAAGAAGCAGCAAAATTATACCG CTTATTGAGAGTATAATTGCAGGAATAGATCAGGTGGGTTTTCTTCTACC CCTGTATCTTCCCTGTTTTCTTTTAGATCCACACTGCTTAGGCAAGTGTA TGGCTAGATGATATTTGATAGGCACTATTGCCACCACCATTGCAAGCTTA GCGTACATGTGTGAGCATCACTTAGATACCGTTGATCCCAGATAAGCATA CACTTCTATTTCCTTGTGATTTATACTGGAATATTTTTACATGATATATA TTTTTGCTTTATTCTGTAAAGTGTTTTAATCTGCAACTACTAACCAAAAC AAAAATTTGGATCTGCTTCTGTGTGGGTGTCTGCTGCTATGTTGACAGTA AACTGGGTCACTGGGACGAAACCATGTATAGCTAGAGTTAAGAATTCCCT GCAAGCACACCTTCATTCAGTGACTCTTTACTCACGCCTCATTTTCTTGT CTTTTAGTATTCTTGCTTGACGTATCTAACTTTGAAACTTCTGATATACC AACTTAACAACTGAACCCAGTACTTCTTTGTAATAATAAAAAATGCGAGT GCAGTGAACGGTTACTAAGTTTTAAGCTCTGCCATTTATACAGATTACAC ATCATTAATCAACCTTCCTTAGGCACATTCATTCATGAAAACTGCTTATA TTATTCTTTCAGATCATGAACATGGTCATTAACCTAATATGACATCACCG TTTTGCAGTTCTCCTGGCCTCCATTTTTGATGGGATCAGTGTTTCTTGCT ATTCTTCTAATAATGAAAAAACTAGTAAGTTAGCATTGCTCTATCTGTCT CAGTTACATTTCCGTTAACCGTTCCATTTGAAATACTACACTTTGGTATA TCATTTTTAAGACCCCTAAAATTCTTGCAGGGCAAAACAAATAAAAAGTT ACGTTTTATGAGAGCCTCTGGTCCACTAACAGCTGTCGTTCTTGGAACAC TGTTTGTGAAAGTTTTCCGTCCACCTTCCATCTCAGTGGTGAGTGAGCTC CTTATATTCTTTTGTCCCAAACTGTGCAATTTTATGCAATATGTAGTATA ATAATTTTAAAACCTGTACCTTGGCTCGCTCTTTTGTTGTTCATTTGACA TCTATTCTGTTTGATAATGCATATGCGTTCTTTGAGTTTTTGGTGCTTTT TTGTTTTTTCACGTGTATCATCAAATCTTACGACTATAGATGGCTATTTC TTTTGATAAGATGTTCTGTGGAAGTCAGAGAAATATTGCATGTGTGATGC ATAAGGTGTGGCCTTACGGTAGTTTTCCAATTTTTAACTCAAATATGTGC CTATGGTAAATGCTCATTTTTCATCCGTTAAACCTTACATGGATTTCCAC TATGGCTAACCACACATTTGGTGCTATTTTATTTTTATCAAGTTAAATTT ACCTTGTGTCATACATTATGATTGACAACGACATCACAAGTTACCCTCAA TTTCTCGAGTGCCTAGGTAGGTGAAATACCGCAAGGCCTTCCCAAGTTCT CCGTTCCCCGAGGATTTGAGCATCTGACGTCCCTAATGCCAACTGCAGTA CTTATCACTGGTGTTGCCATTTTGGTAAAAACATTTTGCTATCTTTCTAT TTGTTTTGTGTCTTGTACTTTCTTCAGTGGAGATTAAACATTTGTGTTAT ATAATTTTAGGAATCTGTTGGGATAGCTAAAGCTTTAGCTGCTAAGAATG GCTATGAATTGGACTCCAACAAAGAGGTATGATGCCATAAACATTGTGCA ATTAGTTTTTTTGGTATAAGCTGCTCACATTTTCTCTGCAAACTCAATTC TACTAATTTTTCACCATGTTATGTAATAATACAGTAATATGTCCCATGCA CAACATCTTAGAGGACGTGCTAATATTCACTTCTACAAGGAAACTAGTTG GTCATGATGGTCCTTTCACTCGGGGGTCGTACCAACTATCTATCTGTTCT CTTAGACTGACAGGATGGCTCACACCAAACAACCTACTTAAGTCTGCTTT GCAAAAATACCCAACTCTGACATGATTTTTTCAGATATACAGAGCAACAC CTCAATTCCGTCAAGTAAACAGCCTTGTCCTTACTAGTAGCAGACTGAAG TTCTTTTACATGCTTAATAACTTGCTGACAAAGGAAAGAGCTAATAATCT TTATTCGCTGCCTTGCATTGTTTCCGGACTCCTTGGGGATGGGTCTCTCC ATGCCCATAATATGTTAACTAAGTGATGAAGGGGAATAACTTCTACAGAC TTAGTCAACTTAGTTATCATAAGATTTTGAGTAATGATGTCATTTGTGAT GAAATGAACACGATAAATTTTGCTCCCATTTCTTTTTCTTTTTGTTTCCT TTCTCTATTTTCTGCATCACTTTGCACTTTAGTTTTGGGAATGATAATGC TGCATCAAAGCATGTTTTCTTAAACCTAGGTTATCGGCCTGTCCTAGGTG ATAAATATTAGGAAGTTCTACTTAGTGGCTGCTGTTTCCAGAGGTATGAA TGTCCCAGACTCCCAGTCAACTTAAGCAATACTGAAGTGATGTGTGAACG GTCCTGAATTAGATGTAGCAGTTTATCAATATTAGAAAACAAAATTTATT GTTTACACGAATATTTAATACTATGCATGCATTTGCATATATCAGTGTTT ATTGTTTCTAGCCAATATTCTCTTTATTCCAAATCAACCCTTCTGATCAA GTTCTCCTTGTTACAGTTATTTGGTCTTGGCATAGCAAATATATGTGGTT CATTCTTCTCTTCATACCCTGCTACAGGTAAATATTAACCATATTAGTGA GTAATATATGCGCCGCTTCATTCATCTGTATTCTTTTCTGTTCTTTAGCT GAAAATTGCAATGTTTTAGTTATTCGCGAGTGTCCAGGTTTTGAAAAGCT GATTATTGATGGATGTCCATACAGGCTCCTTTTCTAGGTCTGCTGTGAAT CATGAAAGTGGGGCAAGAACTGGATTATCAGGAATCATAATGGGCATAAT AATTTGTGGTGCTCTCTTGTTTATGACACCATTATTTACTGATATACCTC AGGTAAGTAATCATTGGGTTGCTCAACGAAGTTTTCCAACTGGAACCTTG TGTTCACCTTTTTCTTTGTTTATTAATGCTACCAACAGTGTGGATTAAAT ATGGACAATAGTATCATTATATTTAGGACCTAATTTGGAATTAACGGATG GAATCAAACTGTTATATTATTTTGGCAATATTAGTGTACCCATTAAGCCT TGTAGTAGTGCTACTTATTATTTCGTAGTTTTAAGTTTGAAATTTAAGTT TCCTCACAAAAGTAGGTCACGTTTGAGTGTTGACAGATTTATTATGACAA ATTTATTTACTCGTGTATAAAAGGTAACAAAAAACATGTAAACTTATCAC ATAAGTTAGTTTTACTCTTAATAGTCAAATGAATTGTACAATCTTGTTTC TTAAAAGGCAGAACTGTACTGTGCTCTATGCGGAACTGAATTCTCCTAAG ATTTAACCTTTTAAGATCATGAACTGTTTGACCAAATGTAGACCCTACAA AATTTCGAATCAATTTTTATTTGCAGCATTATACATGCGCTTAATAGGAT CTTTAAGTGTTCCATGTTTACTTACCATTTTATATCCATTTTTCCTTCAG TGTGCATTGGCTGCCATTGTGATTTCTGCTGTCACTGGCCTGGTAAGGGC ATCTGAACTCATTTGTACTTACTATGATTGAGAGTTTGTAACAAATACTC AAGATAACCATGATGCCTGATGGCAATGTAGTACCTTCTCCGCAAGGAAT AAAGCTATATCTATTTACTTCTGTTGTACTCCCTCTGTTTCAAAATATAA GATGTTTTAGCTTTGTGAAACAAATGTATCTAGACTTCTTTTAGTATGTA GGTTCATTCAAGTTTGGTGTGAATCTACATACTAAAACAAGTCTAGATAC ATTTTCTTCACAAATCTAAAACATCTTATATTTTAAAACGGAGGGAGTAG CTTGCAATTTTTGCTCTAACATGTTATATCAGTAATTTATGAGCTGTTCA TTCTTCTAACAGTTTTTTTTTTCATAATTGAAATTATTCAACACCTGATT TCTCATGGATATTGGGAATGTATTTAGGTAGATTATGATGAGGCCATGTT CCTGTGGGGTATTGATAAGAAGGATTTCTTTTTGTGGGCAATGACGTTTA TTACAACATTAATTTTTGGCATTGAGATTGGGGTCCTTGTTGGGGTAAGT ATGAATTTGTATCGGGTCATTTTAGTTAAATATTATATCGATCTTTAGCT GAAGTGTAGATAAGCTGGCATACAAAATTTCAGATTTTGTATGAAGATGA ATCATTCATTTGACGGTACCATTTTCCTTTGTAGGTTGGATTCTCGCTGG CATTTGTAATCCATGAGTCAGCAAATCCACATATAGGTGAGTAAATGTAC TACGGAGTACTTTTTCGCGAAAACGCAAAACTTGCGTCTCGATGCATTGA TAGAAAGAGTAAATGTACTACTCTAGAGTCTAGACATGACAACCACTTGC AATCTGCTTGATACCACACCATCATTATTCTTGGAATCAGCAACCAAAGT TGTATCTCAGGGTGCTCTTTTATTGGACCTTTTGTGTCATTCATATGTTC AAGGTTTTTAACTGCTTGGTGCCTTGTCCCAAGGGCCTGATCTAGAGCTG TTTTAATATGTTTTTATGGCCTGTCTGCAGCTGTTTTGGGCCGTTTGCCT GGAACCACCGTGTACAGGAATACATTGCAGTACCCTGAGGCTTATACATA CAATGGAATTGTGGTTGTCCGAATTGATTCACCAATCTACTTTGCTAACA TTAGTTACATAAAGGACAGGTGAATCTCTTCATCTGTTTCAGTAATTTGT CTTATTATTAGTAAGGTTCCTTGTTATCCTGATGGAAGTTCTTTATAAGG TTGCGCGAATATGAGCTCAAACTCCCAGTTTCAAACCGGGGACCTGATGT TGGAAGGGTGTACTTTGTGATCCTCGAGATGTCCCGTAAGACCTTTTCAT CTGTGTTATGTCTATTAAAGCACATGCTAAACACTGTTATGTGCACATAA TTGTTTCTCTTTCATTTGAAAACCGTATCTTATGAGCATTAATTGGACTA CCTAGATGAATAGTTTAGATGATAGTAAAATTTGGCGTGCAGCTGTTACA TATATTGACTCGAGTGCTGTTCAAGCTCTCAAGGACCTGAACCAAGAATA CAAAGCACGCGACATCCAGGTTCTTATCCTGAGCACTTCTTCTATTCTAG AGTATGGAAACTAGTAACATATCTGCGTGGAAGCAGCGTTTCAAACCCTG GGAGGCCTTTTATATTATTGCAGATTGCTATAGCGAACCCTAACCGGCAG GTGCACCTACTGCTGTCAACAGCGGGCATCATAGACATGATTGGTCCAGG GTGGTGTTTCGTGCGAGTGCATGATGCCGTCCAAGTATGCCTCCAGCATG TGCAGAGTTCGTCATCAAATTCCATTAAGCTTTCACCACAGGCATCTGGG AACTCGACGGACTCTCCCAAGGCACAGCAGCGGCATGGCTTCCTCAAGAA CCTGTGGAGAGCACAAGATGGGAATGGAAGCGCCGGTGACGAGACCCAGT CTTTGCTGCGCCAAAACCTTGTGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.