Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA039181

[Submit comment/correction]

Sequence	AA039181
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA039181
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCTGACGAAACTGCACTCATTAAAACCCATCGCGATCTGGTGCGGTGGC CGCCCCCGTCGCCAATCTTCCGGCCACGCAAAACCGCCGGGCCACGCACC AACTTCCACTCCCCACTACCGACGATGCGGCACCTCCTCCTCTCCCGCCT CCTCCGCCGCGCCTCGCCCCCCTCCCAACCCCACCACCACCACCTCCAAC TCATCCGCGCCCTCTCCTCCTCCTCCCCGCTCCCGTCCTCCGACGCCGAC CTCCGCAAGTACGCCGGCTACGCGCTCCTCGTCCTCGGCTGCGGCGCCGC CACCTACTACTCCTTCCCCTTCCCGGCCGACGCGCTCCACAAGAAGGCCG TCCCCTTCAAGTACGCGCCCCTCCCCGACGACCTCCACACCGTCTCCAAC TGGAGCGGCACACACGAGGTCCACACCCGCGTCCTCCTCCAGCCAGACTC CATCCCCGCGCTCGAGGATGCCCTTGCCACCGCCCACAGGGAGCGACGCA GGCTCAGGCCCGTCGGCTCTGGGCTGTCCCCCAACGGCCTCGGCCTCTCC CGGGCCGGCATGGTCAACCTTGCGCTCATGGACAAGGTGCTCGACGTAGA CGTCAAGAAGAAGACTGTCACGGTGCAGGCAGGGATACGTGTTTCTCAGC TCGTCGATGCGCTCCGAGAGCATGGTCTCACGCTGCAGAACTTTGCGTCC GTTCGGGAGCAGCAGGTCGGTGGCATCATTCAGGTATGACCTACTGGGGG GAAATCAATTTCTTGTACAGGCAAGGAGCTGCATCTATGAATTTTGGATA TTAGAATGAAAATTGGCATAATCACTTGGCACAAATTTGGTTGAAAATGT TGGATGAAATGCTTCACATTGGCAACAGTGCAATAGTTACTGCTATGTTG CAGGGATTGAAACATGCTTGATCTAGCAAACAACCGATTTTTCCATAGAT CAGCAAAACTTTCACATAGAAAAAAAATACTGGAATTCTCAATTTTTTCA AAAATTTATTTCATTGAGATAATCTTAAATTCAAAATGGGTTTAATTGGT TAAATTCAAAAAGTTAATCAAATAACTTCGCTACCTAAATAAGGGTATTG TATGAGTATATTCAGGTCATGTCCTTGCACCTTATAACAAAAGGGTTAGA ACCTAGAGGGCAGGGGCCTTTGTAATTCACAGGCAGATCAATCAGCAGAA AATGGTACTACCTCCGTTCCATAATGTAAGCCTTTTTAGCGAACTAAAAC AGCTTGCTAAAAAGGCTTATATTGTGAACGGAGGGAGTAGATAGAAAGAC TCAAGGTTATCTTTGGTCGAGTCTTATCGTCCAATCAGGACTTCCATACA TTTTCTTTTCTTCAGAAGGGGAATTTTCTTAGCTTGGTCTTTATTCTATA TTTAATCGCTCGTTGTTACTAAGTTGTTACCAGCTACAAATGTTTTTGAC ATATTTTATCTTAGAATTCCAATTGTATCTACTAAAAATTGAAACTGTTT ACATAAGTATTGCCCTTTTTCTTGAGAGAGACAAGTATTGCTCAAGGGAT GAATAGTATGGACAGTTCTTATGGCATCAAAGGAACAGATCCATAAACCA ACATCCATAATCCAACATATTGGCCTCTGGGATCTCAAGTATCCAGTCAC TGCCCTGTGGGCATAGCAACTATGTAATGACGCTTGAATATAGAATATGT ATGCCCTACTCTTCCCGCCCTACTCCTTGAGGGATCTAATTGTTTCTTAG CTTGCTCTACAACTTGTGGGAATCTTGACCTCCATTAACATCATTTAAGA CCAAATACATTTAGGTATAACTAATTTCAAATGTATTCTTGATTGCACAC AGGTTGGTGCCCATGGCACTGGTGCATTATTGCCTCCAATTGACGAGCAG GTTATTAGCATGAAACTGGTTACTCCTGCCAAAGGGACATTAGAGTTATC GAGTGAGAAAGATCCTGACTTATTTTATCTTGCCCGCTGTGGACTTGGTG GCCTAGGAGTCGTTGCAGAAGTTACTCTTCAGTGTGTAGAAAGACACCAA CTTGTTGAGCATAGCTTTGTTTCTAATGCAGATGAGATCAAGAAAAACCA CAAGTAATATTACACACTGTCTCAGTTGATTAGTCTGTACAGTTTTACTA TCCTTTACTGGAAGAATTTCTAACTTCCGTGCTTCCCCACCCTTTTCAGG AAATGGCTGTCTGAAAACAAACATATCAAGTACCTGTGGATTCCATATAC TGATACAGTTGTTGTTGTCCAATGTAATCCTCCTTCAAAATGGAAAACGC CAAAGTTGACATCAAAATACGGAAAGGATGAAGCCCTGCAGCATGTTCGC GACCTTTATCGGGAGTCACTGAAGAAATATAGGTGCGAACACATGGCTAA TGGTTTGCTACTAGGACTTGCAATATTCTGTAGTTTTCTCCATGCAAATT GCATGATAATCCTTTATAGGTTAACAGGAGAGCACATTACAAGTACACTT GCACTTTTTCTCTGTCACCCTTGACTACTAACAAACTTCATTTGGATACT CTGCTCTTATGCTGATATTATTTTGTACTCAAATGAATCAGCTAAATATT TCCTTTGTTAGAAACTGAACTGTAGGAGAAAGCGATTTTACTCTGGTGAC CATTGTGTCTTTAGCTTTGCTCCTACACGTTTATTTGAGTTTGGCCTCTC CACCTTGAGTTCCTTGTCACTCTCGAGGCTCGTACAGAAAGGCATGGGGG GTGCCGTCATATTTGTAGGAAGAGTTGCCTAAGTCATAATTTTGAGACCT CTCCACCTTGATACCGTTGTCACTCTTGAGGCTTGTACAGAAAGGCATGG GGGTGCCGTTGTAGGAAGATTTGGGTAACTTATAATTTTGACAAGTGTCA GATGGGATTTTTTTTGTGCCCGCTAGTTAAGCATTGTGTTGTTACCTTGA AATGATTGACATACATGCTCAAATTGGAGGTGTGTGTAGCCAAGTAAAAT ACTTAAAAAGATGTTGGAATCACTTGTAGATCTACTCGAATGAACTAATT TGAATATGTTCTGCACTAAATTTTCTAGCTTTACTATGCAATAGTGATTT TTTTAATTTGGTTTCTAGCTCATGCCACTTTATAGATGCTTTTCAGAAAT GAAGCAGAAAGTAAAGACTCAGCGATCGATGAACTATCATTTCCTGAATT GAGAGATCAATTGCTTGCTCTTGATCCTCTCGATAAAGATCATGTGATCA GGATTAATAAAGCAGAAGCTGAGTACTGGAAGAAATCTGAGGGATATCGC ATGGGCTGGAGTGATGAAATACTAGGTTTTGAATGTGGTGGGCAGCAGTG GGTTAATGAAACCTGCTTCCCTACTGGAACTCTAGCGAAACCAAGTATGA AGGATTTAGATTATATGGAGGAGTTGCTACAGTTGATTGAGAAGGAAGAT GTACCTGCGCCTGCACCTATTGAGCAGCGTTGGACTGCCCGCAGCAGGAG TCCCATGAGCCCAGCATCAAGCTCCGAAGAAGATGATATATTTTCATGGG TAACTTGTTCTTTGTAACTTTGTGTGTTGTTGTGTCAATCAATGTTATTA TTGCCTGTCATCCACCTACAGTTTTCTTACTTGTCCTATATATGGGTGTT CTTTTTGTTTGGGGGGGGGGGGGGGGATATCTGGGGAAATGGGTTAAATG ATGCAGATTGCTTGAAAATCAGACGTGTGAGTTACAAAAGTGTAGTTATG CCAGACTCATGGGAGGGCATGTTCCATGGCCATGCGAAATTTTAAAATTA AACTCATTCAGATTTGCACGATACCAAAAAGACAAGTAGTACTGAGTTAC CGAATAATGTGTCATACTATTCCCCATGTTTCCTCTTGGTTCAAATGTTT ATCTTAAAATTTGTAAAGATATAGAAATTTCCTATTCTATATTTGGTATA TCTCTCGGGATTTTAAAACTTCTTACATGATTTTTAACGCATTTGCAGTA TTTATCCCAATTTTAGAGGACATGCTCATGTATAACTCAGTTCAAAATGA CGTTGATATATAGCTTACAAGCTGATGAAATACATTCTACTCTTAATGCT TTCATGTCATGTGTACTTAGCAAATAGCAGCCGTACCTACATAAATCAGT ATTTCTTGTAATCTATTGGTGTCAGTTTCAGTAATAACAGCAGTCATGGA AAGAGCTTTGTTTCATGCTATCTTGTTTGTAATAAAATCAGACCGTTGTT TAAAATTCTTTTCAGTGTAGATGATGTGGAAAGTTTCAAAACGTTTATCA TATTCTGGAATATAAATTATAAATCAGCCTGAAAGGAGTGATAGAACACT AACAGTACATATAACCTAATTAACTGCTCTGGAGATTCTCAAAATTATGT GAATTATTTTTCAGAGGTTTTAACATGTTCTTGCAACACTTGGTGCACTT CTGTAGGCACTGTAGCTCCATCAGTTTATTCATTTTTTAGCAATGTAATA AGGTTTTGTGCAGTTTTTACCATGTTGTAACTAGTTAACAGCTTTCTTTG TTGATCCTCTTAAAAAACTTAGTGTGTGTGTATGCAATACAGGTCGGTAT AATAATGTATTTACCAACATCGGACCCTCGCCAAAGGAAGGACATTACCG AGGAGTTCTTCAACTACAGAAGTCTGATACAAACTAGTCTCTGGGATGAT TATTCTGCCTATGAGCACTGGGCCAAAATTGAGGTACCAACTTTTACTAG CACCTGCAAGATTTATGCACCTACTGTTGGGTGTTTGTTACAGTAAGCTT TGCTGCTGACATGGTGGAAGATTAGCATCATACTTGTTCATTACAAGAGA ATGATCTTTTCTCTTGCAGGCATAGCAGTGGCTTGCTGAACTATCTTGCA TTATTTATTTACAAAATAGTGCACCTCTGAATTAATACTTTCTTATTCCT CTCCTTAGGTTCCAAAGGACAAGGATGAACTTGCTGAATTGCAGGTTAGG TTGCGGAAGCGTTTCCCTGTTGACGCGTATAACAAGGCGCGCATGGAGCT GGACCCTAACAAGGTTCTCTCTAGTGTGAAGTTAGACAAGATGTTCCCAG GGACGCAGACTGTCCAACATGCAAAGTAAAGGTGTTCTGATTGATGACAT GCTGAAGGCATAGCACTTTAGTGTAATATGTAGCCTTTTTTTGCCCACTG GAGAAATGTGCTCTTCCAAGTTGGATTGTGTTGTTGATACTTGGATCAAA ACTAAAAACTACCATCCTGCTCTGTCGGTGGTTTACATGATTATGCACGC TTGCTGAAGTGTTAATTTATTTGAAGAACTTGCTCTGTTGTAACTAGAGA TAGGTTTTTCATGCTCTCACCTGTGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.