Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA037668

[Submit comment/correction]

Sequence	AA037668
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA037668
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTAATCCGCCCTGTCCCCTCACCGGAAAAACAGAAAAAAAAAAGGTTTCG GGTACACGGCAGGAGCAGCAAACTCTGTGTATCCTGTTGTGCCGCGCAGC CTCGATCGTCTGCTCGCTCCTCGCCTAAAGGCAGAGAGGAGGGGGAAGGA GCGCACTCCGTCGCCGTCCTCTGCGACTCCGCTCCCCTCCCCTCTTCCTC GTATCCCCCCTTCCTCCGCCGTCGCTGTCGCGCTCTTCCTCCTGCTCGCC TCTGCCGTCGCTGTCAGTCGCGCTCTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCA CCTCCACCTGGACCGTCCTGCTCTTCACCGCAGAGAGAGGAAGAGACGGC CAGAGGGGCGTAGCTTCTTGCATCAGCAATGGTGGTACGTTCTCCACTTC CCCTCTTCCCAGTTTTAGGCCCCCCTGATTCAAAAGGTTTCTCTTAGGAC AGACCGACAGAGAGTCGCAATGCTTCCTATACTAGCTTTTCTATGCGAGG ACTGTATTCAATAGGATTTTTTTTCCAATAGTTCTTTCGCACCGCATTCA GTTTCCATCGACTGGAAACACTCGGGAAGATTCGTTTTTCTTTTGGTTTC TCACAGCGCAACCAGGTTTTGGTGGTCTGTTTGATCGAATCCAGTTTCCC ACGGCATTCAGTTTCCCCTCTCTTCTCTTCCTCGATGTGTCCTGGACCAG TGGCTGTATGCGACACCAGATGTGGGTCGAGAAACCGCATGGCCATTAGA AATCAAAGAGCTTATGTTGCGTAAGTACAGGGTAATGTACCTGCTAGATT TTTTCGAAAAGGGGATAAGACCCCGGCCTCTGCATCAACCTTTTATTAAG CAGTCTGTCAAATATAGTTTTTACATCTCAAGGATCGCTCAAAGTTGAAA AAAATCAATCAGCGAAAAATAAATAGCATATGGCGACTAAACGTCCTGTA GTCGACTAATATGTACCTGTTAGATACCACTGGATCGTACCATTACCGGA GTTAGCTGAAAAATGAACTGAAACTAGCTGAACCAATTGGTTACATGGAA TTTGTGTGCTGATTTCGCCGCAGAGAGGTCACTGGACGTCATGTTGCATT GGCTGGTTAGCTCTTTGATCTGTTCGTCATGCTATATGTTCAGTTTACTG ACCCTTGTCCGCATTTTCAAACACCTCGGGATTACACTGAATATGTTGAT GCAAATAGTTTGTCGAAACATCAACCTCTCTCAGGTGTATCTTTCTTGAT GGTCCATTCAGTCTAGTATATGTTTTCAGAATCTTATTTGATACACTCTG GTTCCTAGAGTTGAACGAGGTTGTGCTGATTTCGCCTTTGGGATTTTGGT CGTCACATGATATCCTTGTTTCGTATGTTGTTCCTGACCGACACATTGAT CTAAACATTGTAATCAGACATAAGCATTTAACAGGCCAGGTCAGGACACT TTGAGAAGGATTTTTATAGTTTAGGTTTATGGTAGAGTGGCCTACCTACT TCTCTAGCACTTCATCTATCATGCATTAGAGCAGTTAATTTGTGTTGAAG TGTATAAGTGGATTGCCTAGCCCTTTCCATCAGTTCAGGACTTTTGGTTG TGTTCACTAGTGCATGAAGCTTGACATGGTATCAGAGCCCAGGGTCTCGA GTTCGAGTTCTTGGCTTTCGCAATTTATCCTAAAATTGTTGTTGCCCCCT CGGTGTCCACATATAGGCCTGTTGAGCCATACCTCTAAGTCACCGGTCCA TACACAAGGCCTCTTGAGCCTACCTCTAAGTGTACATTTGTTGAATTGTC TTCCCGTCATACGTGAGGGGGGTGTAGAAGTATATAAGTGGATTCCCTAG CCCTTTCCATCAGTTTCAGACTTTTGGTTGAGTTGGCTAGTGCATGAAGC TTGACAATTTGGACCGCGAAGTACCATTGTTTATTCATTTCATACACGCA TCATCAAGCTGTACCGCAGTAGTGTCTTTTTGTTTAATCTTATTCCAGGT GATACAATGTGGCAAACCTGATTAATCTGACCACCTTCTTAGATTTACGA ACCTGACAACTTTCCTCTCATAAAAAGCTCTGTTATGCATAATGTGTTCT ACTATTCCAGAGAACTATTCTTCCCGACCTTGGAAAACTATTCTTCCTGA CCTCTAAGAACTATCTCTTACTGACCTCTGAGTGAAATCTAGCACTTCAG TTAGTTAGGCATACCCAATGCCAACCGAAACTTAAGCTGCTTCTAATTGT ACCGATGTAATGTCTTGTTGCTTATTACGTTTGATGCGTCATAGACTCTA GAATTGAATCTGGCTGTGCTGATTCTGCGCTAGAGATTTCAGTTGTGATA TCTTGTGGTTCTTTAGGTCTGATGGCGTAATAAGTTCTTCTGTTGCGTAA TTTTCTTCTCTACAATTGCTTTGCTGGTGGTTTTCTTTCAATATTGATCA AATCATGCCTATCTTTTGTCACAGGATTTGAGTAGCGACAGCGACGATAG TGATAAGTTTGAGTGGGAAAGTGATGGTGAGGCTGAACCCTCATCGGCTG TGACTTTGAGGAACTTGGATGCTGCTGGCCCATCAACATTTGTACGTCAG GTAGTAAACAATTGAAATTATGTCTTTCAGCACAAGAGCTAGGCATGACT TGTTATTGCCTTGTTAATGTTATTGTTATGATCTTAGTGCGATATTTACT CATCTGACTGCCTAAAGGATTCTAATGGGTGGGCCAATGGGGAAGCGCCA TCGGATTCTCTAGTCGAGGAATATGTGGGAATGGGGTTTTCAAAAGATAT GGTCATCAAAGGGATCAAGGAAATAGGTAATACTAAAATTAATATATTTC ATTCTAGTTGTCATACGTGTTTGCACCTTCTGTTTCAACCGGGCATTTTT CTTTCAGGGCACAGTGATGCAAATGCACTGCTCGAGCTACTTCTCACATA CAAGGTGTTTGTTCATGTGCTTCTGCTACTTAATTTATCCTACAATCTTT TGCTGCATGGCGGCACTGATTGAATGTTACAATTGGTTATGTTGCAGACA CTAGGTGATGAGGCTGCGGGTAATTGCTCTACTTCTGGCCTCATCCCCCA GAGCGTTGAAGATGACGACGATCTTGATTTTGAAAACTGGGATGGAGATG ATAGTGCTGATGGGAGAGAACCCAACTCCGATGGTTCTGGTGAGGTAGAT GATTCCTTATCATTCTTTTGGTATTATGATTTTTTTTATCATGTATATGT ATGCTGATACGTGTGACATCTTTGCCATGCATACCTTTCTGTTGAGAACA TGAAGCTTAAATTGAATTATCAGCAAAGTTACAGTCATGTTGAATACACA TTGCTAGAAATTCCAGAACCTGGTTAAGCCAGACACACACCGGATTATTT AGGGATGCAGATTTTGCAATTATATGGGCTGCCATATTTGCATCTCTCTT TATATAATTAATTGTGAAAGCAAGAAAACTCCTACTAAGCTCAGCAATCT GTTTTCTTCTTTGGATCTCCACAGCGACACAAAACATGGGAATCAGATTC AATGATGACTTCTGGACAGCCACATATCTCTTCGCCTGAACCCGTCTCAC AAGCCTGGGTCATCCAGATCATCACACCCATCACCCCATGTCCTTCCAAC ATAGAAAAAGAAGCAGTATCAACATTAAGCTTCCTCATACAGGAGATCTC CATCTGGCCTTTATAGATATTATATTTCCTCCCTTGCTCTCCAGAGACAT CTAAATAAGATTAAAGGCAGTGTCCCACGCTCACTTACACACTTTGTCCA GGTTCAGGGGCACTTCCCATGTCAACACCCATTGCGAGCTGTCCAGATAG ACCACTTACCACACAAAATACCACTTCCTCATCAGGTTTGCAAAAAGCAG CATCTAACAGATCATTAGATTCTGTCATGTGGGTGAAGCCTTGGCAGTTT AACATTGTAAAGCTCATTAAAGAGGGTGAAGCCTTGGCAGTTTAACATTG TAAAGCTCATTAAAGGAACCCAGAAGTCATGCAAACGTAGATTCCGTCAA AGCATGGAATGCAGTATCTTCGTTGGCACCACAACCAGTGCAAATATTCT GTGGTTCCCTGTGTCTCTTGTGTAGAACATCACGCACATGCACATATCCT GTCCATGAACGACTCCACAAAAATGTTTGGATTTTAGGTGGGATTTTTAG TTTCCATAAAATTCTCTAGACCAGAATTTCCTCCCCCAAAGAGCTGTAGG ACCCGTTTTCAGCACCCCCGGTGCCTCTGAAAGAAGCCACCAGTAAAGCC GTCCAGCCCCCGCGACTTAGTTGGCTTCATCATAAAGAGAGTTTCGGTCA CCTCTTCCTCAATAAAGGGCCGGCAAAGATCTTCGTTTATGAGTGCAGTA ACCTTGGGGATCTCCCAAATATTAATATTCTCATGGGAAGTAAAAAAGCG ATAGGTGGAAACATGCACCTTCCTCCTCAAAATCCTTTTGCTGACGTGAT TTTGTTTTGCCTCGCTCTTTCATGGTATTTTGCATGGAAAAAGAGTTGTT GCGATCCCCAGCTTTGAGCCATTGGACTCTTGAATGTTTCCACATCATCA CCTCTTCTCTAGCGACCAGGTCGGATATCCCCAGCTTTGAGCGCAGGGAT CAAGATCTCACCACCTTCAGCCGCTTCCTAAGGTTTTTAAGCTGACCTTA ACAGCCCGCAAAACCGTCAAACTTCAGTTTTTCAGTTTGCATTACAGAGA TAGCAGTGCTGAGCTAACTCCAGCAAGACTAAGCTCAGGGCAGGCCCAAA AGTCTTTTATCAAGTTCTCATGATGGGATCACTGGTCCACAATTCCTCAA ACTGAAACCTTCCATCTCCCCTCTTTTTCCAGATCGACTGTTTAATCACC TCAATCAGTAAGGCGCAATGATCAGATTCAGTTGTCTGAGAATATGTCAA CATTAGAGGAGGCAAAGCAGTGAAGAAAGTTTTCATCCGCTAGAGGTCTG TCTAATCTCACCTTGGCATTGTTCTTTCCCTCTTGAATATGGGTAAGGGA GTCCAGAATAGCCCAGACCAGTGACCTACAACTGTCCACAACCTCTGTGA AACCGTCCATCTGCCACTCCTCCCTTTCATTTCTGTCAAAATTCCACCCT TTCATTTCTGAAAAACAGAGCATCTCCAGAAGATGTTGCTCCACAAGCAT GTGGAGCTCTTGAACTGCCACGGGTTGCCCACAACACCAGCAGTTCAACA TTAAGATTTTCATTGTTTTCGGCGGGGATGCTCTGCAGCCTCTAAAGTTC CTGCACCAAAGAAAAAGACTCATCTTATGTAACAAGTGCTTTCTAATCTC TGTTTTGTTTTGTTCTGAATCTGTGCAGGATTTTCTACGAGAGATGTCAG AGAAGGACAATAAGATCAAGTCCTTAGTAAACATGGGCTTTCCTGAAGAG GAAGCCAATATGGCTATTTCCAGATGTGGTATGCCTATTTATTGTTACCT GATGATCATGCTTTAATGGAAAAGACACCTTATGTGTATATTCTTGCTGA AAAATTCCTAGGTGTGGATGCCGATCTCTGTGTATTAGTTGATTCGGTCC ATGCAGCACAAGCTGCAGGAGATTGTAACAATAGGAATTTATCTGAATAT GAGGTATTTTTTCTTGACTGTACATTTGAGTAACAAAACTATTTCCTCTT TTGATTTGATGTAAAGATGCTGGAAACTTGTTTATAATTTGGCAGGTTAC TGGTAGGTGCTTTGATTCCTTCGAAGGGAGAAAGAAAACAAGATTGATGG AAGAGAGCAAGAAGAAGAGGAAGCGTTATGGCGGTGGGGCACAAGGAAGT CGACCCTCCTTTGATGGTAACCAGGAGGAACCAATGCCTCTCCCAAATCA AATGGTTGGATTCAGCCTACCCGGTGACAGGCTGCGGTCCGTGGTCAGGA GACTTCCTAAAGCAGCCATTGGCCCACCTTACTTCTACTATGAAAATGTG GCTGAAGCTCCAAAAAGAGTATGGATGGAAATGTCCAGATCCTTGTATGA CATAGAGCCAGAGTTTGTGGATTCTAAGTACTTCTGTGCAGCTGCTCGGG AAAGAGGCTACATCCATAATTTGCCAATTGAGAATAGGTTACCTATCCGT CCTCTCCCTCCAAAGACCATCTCAGAGGCCTTCCCACATTATAAGAAGTG GTGGCCTTCATGGGACCACAGGGAGCAGCTCAATTGTTTGGAGACACGTG TAGCAAGTACAACTCTGATAAAACAGATAGAACGTACTCTTGCAAGCTCA AGTAATCCACCACCTCTAACCGTTCAGAGGTATGTAATGGATGAGTGCCG AAAATGGAACCTTGTTTGGGTCGGAAAGAACAAAGTTGCCAATCTAGAGC AAGATGAGATGGAATATTTACACGGTTTCCCAAGAAACCACACGAGAGGA GTCACCAACACAGGGAGGTACAGATGTCTTGGTGATTCTTTCCAAGTTGA TACTGTGGGTTACCACTTGTCGGTGTTGAAGGACATGTTTCCCAATGGTG TTAATGTGATATCCTTATTCAGCGGTATTGGAGGAGGAGAGGTAGCATTG CACAGGCTTGGAATCCACATGAAGACTGTGATTTCAGTTGAGATTGATGA AGTTAATAGGAGAATTCTGAGGGGTTGGTGGGATCAAACACAAACTGGCA CGCTAATTGAGATTGCCGATGTAAGGTTTCTCACTAATGATAGAATTGCA TCATTTGTTGGTAGATATGGTCACTTTGACTTGGTGATTGGGGGCCTAGA AGGCGAGCAACAATCTTTGTTCTGTCACTATTCGAGGATCTTGAACGCTG TCAAGTCAGCTACGGCAAGGAGGTAGCCAAAGCTATTCATGTGGTCAATT GGAAGGATCTTGGTTCCTGGATAAGTTGCCATAATTATGTGAGGTTTCTT CTGCTTGCTGTGTATAGTTTGTTTTGATCCTATTGATAGTAGATATCTGT TGATACTTGATAGGTGCTCTATCCTCTGTATATGGTTTGTTTTGATCCTA GTTATAGTGGATGTCCATTGATACTTCTAGGTTTGAGTTATTCAGGTTTT ATGATCTTAGTGATGCAATGTGAATGTATGCAATATTCCTAACAATGGTT CAGGTTCCTTTTCATATTCAAATTGCATGGTAATTGGTTCGTTTTATGAA AAGTAATGTCTTCTGAGTTACTGATTCTGATATCTCTGATCAGATGAAGC ATTTAACTATATACTAGAAACATAAGCATCAGGGCAGTGAGGTTTCTGGA TGTATAGTCCATTTCTTATTCTAGTTGTAGTAGTATTTGCAGTGTTATTT CAGGATGCTTTCCATCTAGTTCCTTAGTGTCTCATGGTTATGGTAGCACA TGCACTCTTGACATTTTTTTTCCATTTTTCATCCTAATAGTTGATCCTGT TTGTTTCCTTGGAGCTCCTCTGATTGTAATACATGCATACACAGAACAAT TCTCTGATCTAATCACCAGTTAGTTTGGTCCTGTTTGGTTCCATTCACTG TGTCCTTTTTTTGTATATAGTGTTCAATTGTGGTATCCTCTCTCTGGTAG CGAGTGTTAACTGAAAGTGCATGTCTGGGATGCCTGTTGCATCTGTCAAT ACCCATGTCTAGCATTTATATGATACTTCCAAAGTAGAAATTATGTGCAT AGAGAAAAAGGAACAGCAGATCCAACATTTTTTATAGTTCAAGGGTTCGG CACTGCTTTTATTTATTTGGTTGATTTGTTCATTCAATATAAGGAAACCA AAGGTGCCTGCTGTCTACTTTGTGTGTACTGTGGCCAATCTTGCCTGGTT GTTAAATGAAGAGCCTAACCAAGATGGTACCTGGTTGTTAGAACAGGCTA GCTATGTAGCCTGCCTGTGCAGTATTTAAGTATTTATGTCTTCCTTGGTG ATTAGACTATGCAGTTTGTGAATGTTCCTTTGATCTAATTCAGTAGCAAA ATGTATTTTTCATGTCAATTCCCGCTACCATTGTTTACCTTGGCTAATTG TGCATAACATGCCTTTCCAGCCTCAGAGTACATCAGTTTGCAAAGAAGTT TCTTCCTATTTCATGTCCCTTTTTGGATATCTGGATGCGAAGCCAACTAC TGTTTGGACCAACAATTACCACTGCAAATGGAAAGCTTCAAGTTCTGGAC GCATGGTATTCATGTACGCAGCATAAATGATGGTGTAATAAAACGGTAGA TGCATTTTATGTAGTATTTCTTTTGACATTGACATCAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.