Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034741

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034741
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034741
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCCCCTCTCGGTCTGTCCACCAGAGTCCCACTCTCGCCCCCGCGCGCG ACACGAGTCAACGAAGCACGAACGCGCCCAGTCCCCGGTCTCCGCCGGCG GCGCGCGATCGGCTGCCGGTATGGGCAGGACCGGGAGCATGCGGCGCTCC TCGATGCCGTCCTCGCCCGCGGCGGCGCCGGCCCCGGTGCCCGACTTCAC CGCCTCGCCGGACGACTACACGCTCATGGAGGAGATAGGCTTCGGCGCCA ACGCCGTAGTCTACCGCGCCCTCTTCCTCCCCACAAACACCACCATAGCC GTCAAGTGCCTCGATCTCGACCGGGTCAACAGCAACCTCGTGAGCTCCCT TCCCTCTCTATTGTCCCGGCTCTGCTCTCCGACGATTCTCTGTTCCAACG ATTCTCTGCTCTCCACGTCCTAGGGTTGGGTTTGCCGGGGATGGTTCGAT CGGGGAGGCGTGGTCATTTATGGACGCATTGTGGATGCAGTCGACCTGAC ACGATCGATCTAGTTATATTTGTTTCTATGTTGCTGAGATCATATTAGCT CTAGGATCAGACTTTGGATTTTGCTTAGTCCAAGTAGTTGGCTCTAGTCC ACGAGTTGGTCTACTCGATCCTGCGATTTCCGTTCGCATTTTTTTTAACT TTGATGATCGTCTATTTTCGTCATTTTGTCAGTGACCTGCATTATCCTAC TGTCCCTCGTGAGTCCCCTCTCTCTCCCTCTCTACTGTCCCGGCTCTGCT CTCCACGTCCTAGGGTTGGGTTTGGTGGGGATGCCCCCACCGGGGACACA TGTTCATTTTAGCGACGCATTGTGGATGCAGTCGAGCTGACACAATCGTT CTAGTTATGGGCTGTTTATATGATGCTGACATGATATTAGCTCTAAGATC AGACTCCCTCAAAAATAAAAATAAAAAGCTCTAAGATCAGACTTTGGTTT TCTTTTAGTCCAATTTGGCTCTACTCTGAGGAGTTGGTGTACTCGATCCT GCGATTTCCGTTCGCATTTTTTTTATTACTTTGATCGTCTAATTTCGTCA TTTTGTCAGCGACTTGCATTGCCCTTGCCGCTGGCTTGGAGATACCTAGG ACTCTTTTCATGTACTGTTAGGCACAACTCCGATTATTTTCACAAATCAA CGTAGACCACTTCCAGTTTGGCCAGAGTTGGCCCTGGTTGAGGAGTTGAT ATACTGGATTCTGCAATTTCTCTTCACAATTTTTACTTTGATTGTGTAAT TTCCTCATTTTACTAGTGGCTTGCATTACTCTTGACGCTGGTTTGGACAT ACTGTAGGACTCTTATCTGTATTTTTAGGCACCAGCAAGCTTTGATTGCT TTTTATAAATTTCACAAATCAACATAGGCCACTTCCAATTCTCCGCCACA GTGCGGTTGTGTCCCCTACTCCCTCCGTTTCATAATATAAGATGTTTTAG CTTTGTGAAAGGAGTGTATCTAGACCTCTTTTTTGAGCGAATCTACACAC TAAAAGAGGTCTAGATACACTCCTTTCACAAAGCCAAAACATCTTATATT TTGAAACAGAGGGAGTAGATGGCATGTAGATGCGGCGAATTTAATGTAGG ATGCAGTATTTTTCTAAATTGCGTCTTTGTTACAAAAGAAACCGTAACTG CACATTCTTTAGCTGGCATGATCACCAGGAGTAGTACTGCTTGCTCGCTT CTGAAGCGCCAAACTGTATGCCTACCACTGAAAGTTACATCTCATAATGA ACGGATTTCCATGTTTTCTGCTTGCCTCTTGGTGTTCCCTTTCTCAAAGT TTGTAGTATGTAGTGTATTTAGCATCTCACAATGCTATCTGATATTTGTA TATCCTCTGCAGGATGATGTGCGGAAGGAGGCTCAGATAATGAGCTTGAT AGATCACCCCAATGTCATCAAGGCGTATTGCTCATTTGTCGTCGATCATA ACCTTTGGGTCATAATGCCATTCATGGCAGAGGGTTCATGTTTACACCTA ATGAAGGTCGGATACCCCGATGGCCTTGAGGAGCCTGTTATCTGCTCCAT TCTAAAAGAAACACTAAAGGCTCTAGATTACCTCCATAGGCAAGGACATA TCCACAGAGATGTCAAGGTTAGCTTATTCTATTACTCCATAGGATTAATT TGCACTAATGTCATCAGAACTTTTGCTCAACATAACATTTTACAGGCGGG CAATATCCTTGTCGATAGCCCTGGTGTAGTGAAACTTGGGGACTTTGGTG TATCTGCTTGCTTGTTTGACAGAGGTGATAGACAAAGATCTAGGAATACA TTTGTGGGAACACCGTGCTGGTAGCTATATTTTTCTAAATTTCTCTTCTA GATGCTCGATTAGTATTTAACAATTTGAAAATGTTTGACGTGCTATCTTA TTTTGTTTGGTGTTTAGGATGGCTCCAGAAGTTCTCCAGCCTGGAACAGG TTATAATTTCAAGTATGTTTTGAATCTCATAGTCATGTCATGTTTGCTAC TATAGTCTAGAATACATTGATGCATTAGTTGCATCATCCTTAGTTTGGTT GTCCATGAGATGACTTATCATTTTTTCACTTCAGAAAAAGCTATGTACAT TAGCACCATAAGACATTAGTACGTCTGAGATCACTCAAGTATTGTCTTTC AATTTTATGTTTATATGAATAATGTTGAAATGCTATCTGTAGTTTGAAGA AATCATGCTAACAATCTTTCCTACAGATATCCTTCTCATCTATCCACTCT ATAATTGTGATACTCTTTATGTCTTATTTCTATATACTTTTACATGTCAT TGTGTTTGGCTGCTTTCTATAGTTGAGGTGTGCTCATGAGTATTTTTTCC CCTACACAGAGCTGATATTTGGTCATTTGGAATAACTGCATTGGAACTTG CACATGGCCATGCTCCCTTCTCTAAGTATCCTCCTATGAAGGTAACAAGT TACTTTTGTGAATTAAAATACTTCTATATTTTGCAGGCAAGTATTAGCAA ACAAGTGTCTGAGCTGCTTCAGAATTCCTTTTCTTCTCTAGCTTTTCTTA TATTCAAAATTTCGCTGAGCTGTTCTGTTGGCAGTTTGCAGACATGATGT TTTCACCATTTGCTGATATTACTGTTGTACCAAAAGCCACCAATAATACC ATTTTGCTACATGTGCATACCTTCTTTGCCTGACAACAGTATTGTAAAAG TTAACCATAAGCTTGGTGGTCTTGTCCATGAAGTTAGAAACTTTTCTGGG CAGTCAAGGGTACTGTCAAAGGTGACAACCCTCACATATACAATTTTTGT TTAACTGCAGTTTATCATTTTTGATTCAGGTTCTTCTCATGACCCTTCAA AATGCACCACCAGGTCTTGACTATGACCGTGATAGAAAATTTTCGAAGGT AGTATACTGGTGCTTTCAGCCAATTCTTGGCTAGTGAGTGTCTTTTGGTT ATATTTTTACAGAAATATCTATTTGTCTTAGGAAGCCATGTCAGTTATTT GGAGAGTACAGACATATTAGATTACAATGTTTACCCTTCTAATGAAGGCT TTTCATCTTAAATCAGTCTTTCAAGGAAATGGTTGCCATGTGCTTGGTAA AGGATCAAACTAAGAGGCCAACAGCTGAAAAGTTACTAAAGCATTCGTTT TTCAAGAACACAAAGGCCCCACAGCTGACTGTTAAGAGTATTATTACTGA TTTGCCCCCTCTATGGGAGCGTGTGAAGACACTCCAGGTTTCACTCTTGT CATATCTCATTTTCTTACTTGGCATTGTTATCATTATATCACACTAAATT ACTGTTCTTTTCCAGCAAAAAGACGCAGCACACTTGGCTTCTTCTGAACA GGAAGCACTTTCTATGGTTTGTGATATCAAAACTTATATGTTATTGTAGG CTTTCGATGAAGTTTTTTTCGATTTGAGCCATTAAAGTACACTTGTTTAT TTACTCCACAAACTTGAATGGCAAGATATTATGGTCGATTGGTCATTTTA TTAGGATCTATAAAAACAAAGTAAGACTCGTGGGCACCTAATTTTAGAAG TTGATCACTTGTGCAGTATATAATTTGACTCCTTTTCATATAACAAAGAT GATAACCAAAATGTGTTTGAGCTAAGACATTCGTTTGTATGACCAATTAA TTTGACTGGAACTCACTGAAAGATTCCAACATGACTACGACCTATCTTGT TTCACATGCAAACAATTAAGTAGTAACATTTTATTCAGTTACACCGACAT ATCGTGGCTACTTGCAAATTAAGGTGATTTTGCTCGCAGTAGAGTTTTTG CTGCAATCTGATCTTGTACAGCACCGTGCTGTAAACTTTTGGGGTGAATT CAGCATGATAGTGTCATAATTTTTTAAAACATTATATATGCAGTTTGCTA TTTAAGAAATGCATATATGCAGTTCTGTCTTTCAATCCACTTAGCTGATT TTCTTATGGTTTGATTCCTGCCCAACAGAGTGAGTACCAACGAGGTGTCA GTGCATGGTACTTTGATATTGAGGATCTAAAGGCTCAGGCTTTACTGGTA AAGCAATAACTAAGATTTTCCTCGTTGCTACATGACTTTACGTTCTTGAG ATGAAAGTGATTATGATATAATCTTACAAGTAAGTCCCAAACTTATGCAG ATTCATGATGATGATCCACCTGAAATAAAGGAGAATGATGATAATGTTCG AACAATTGAAGTTGATAAGGTTTGATTGATTTGATTCCATTTCAAATTAA TGACCTTCAACCTGTCCTGTAGTGATGATAGAAACGGTCTATATATTTGC TTGTTTAAAAAAAATTGTAGTGCATCAAGGACAGGGGATATGATATGCTC CTATCTTCATAGTAAAAACTAAAAAGCTATACTGTTTGTCTACTTTGAAG AGCATGGACATGTTTAGCTGGCAGTAAAATGCCACAGGTGTTTCTGCTAC TCTGCCTGAATCTGAAAATATATTTATCCCTTGTCATGCTAGAACTACTT TTGTACAGGACAAAGATCTGCAACTTATTTTCTCACTGTCATGTAGTTTT TCACTAACTATTACAGTAATTCCTTAATTTTTTTTTGCATTCCCTGTTGG GTTATAACCGAATGTGTTCTTACATGCAAGAGAGAATTGTACCAATATCT CTTCAAATGCTCTATTGGCAGGATGCATCTTCTGAGAGTCATTTTGGAAA ATCGACACTTCTGAACGGAAATAACCGCTGGCCGAATCAGTATGTAACAT TCAAGCGTTCATTCAACTCTATAGGTTCAATGTTTGATTTATAACAAGAG AATCAGTAAACCTTGATTCATATTGCTGTTTTACTTTCCTGCTTTAGTGT TAATACTTAATAGTATATTCATAGTATTTTTTTATATTTCAGTGAACGAA CTTGTGCCACTACAGTAAATCCAGGTGCAAATGACCGTGAAACAAGTGAG GAATTGACTTCTGGCCTTGGCAATGCTGATTCTGGAAGGAAGGTTGATGG ATCAGATTATGACTCATTATCCTCTACACCAAAGCATGGTTCTGAGGCGG GAAATTGTAAAAGTGAAGTTAGACAAAAACAAAAACAAAGAACTTTCTCC GGCTCGATTCTGTATTCTCCTACCGCTGATAGTTCCGTCAATGGAAGAGG TCCTATTATTGATAGGTACGCTTAACAATTTTCATGAACTTGTTCCATTC TTTTTGATCTATTTCATGCGCTCCAAATAGAAAACAAAGTGCACTAATCT ATTTATATTCTAGTAGACTGTTGTTTAGTTCGTCAGTTTCAGCTTTGGAG TTTTGGTAGATCTTATTTATAGATCTTGACCAAATATTTTTCCGAAAGAA TTGGGTTATCAGATGATGAAATTTGCATATCCGTGTATTCATGCACTCAA CACCTTTTGGAGTTTCCTTACATGTTGATGGAGTATGAGCGTGATCTGAC TGTATATCATTAAAAGTCATTATGGACTGATTAGCTTGAAGTTCCATCCC CCAGCATACTAGATATTATGTGGAGCCACCATAAGTGTTTATATAGTTAT ACCCCCTAAGTAAATGCCACTTCCAATACTTGATGGAAATATTATGTGGA GCTCTTCCTTAATGCTTAAGTTCTTTTATATTATTAGTTTGTGTTAGCAT ACCGGTTTTAATTGCATTTGATTGGTCTTCCTCATCTCAGGGATGCAGGA GGTCAATCAGTATCAAATAAACAAAAGAATGATGCGGGAAGAATCGATGA TCTCAGTGGTCCGCTGTCACTTTCAACTCGTGCTTCTGCAAATAGCCTGT CTGCCCCTATTCGCTCTTCTGGAGGTACGGTAAAGCGGCCTTTGTTCTAA CACAATTATGCACCATATCTGTCAATGTACAGGCAAAACTATAGCCATGC TTTAAAATTAGCTTATGTTTTTGAAAATGCTCTCTGCTCATATTCAGTGT TCTAGAAGTAGGATAAACCCCCATGGTTCTTGCATAAATTTTCAACACTT TTGTCAATGTAGTTGAAAAGACTTGGAGTCGCGTCTTAACATTTAGTGTT ACAGTATGCATTGTGAACTACACCCTTAGAGAATAGTCCTGTCAACTGTA GTCCCTAGTGATTGCATTGAAAGGCATGCAATTTTCTGCCTTTTATATGC AGGATATGTGGGCTCCTTGGGAGATAAGCCTAGGGTGGAAATAAAAGGCA GATTTTCAGTGACATCCGAAAATGTTGATCTGCCAAAGGTGGGTTACCTG TTAAGCAATGCATATATATCAGTAGATAGTGCTCCATAGCAGAACAAGAC CACTTCAAGGAAAAACTAAATAAAATCTGCTTGACAGGTTCAGGAAATTC CAGTGGTCAAAATTTCACCTAGACCACAGGAGGTAAGAATATGGTTCAGA AAAGCTCTACTGCACTCTTGCACTACTTAAATATGCACCTCAAGATGAGT TACCACTGATACTGGGAGTTCTCAGGGATCTGCACTGAGAAAATCAGCCA GTGTTGGTGCTTGGCCAGTGAAGGCTAAGTCAATGGTACGCTTTCTTGTT GTCTAAACTCTACTAAACCTATCATTTGTAGAAACAATTTTTTTACTTAT TAGAATTACGTGTTATTGCACTAAATTGTTTGTTTTCCCTTGATGTAACA CTATTGAATTTTCTTTCTGAGTTTTCAATTAAACCACACAAGTTTAGATT TAATGAGATGGTTTAAAGTCTGTGCGATTACATTTCTGAAAGAGTTAATT GGCATCATCTCTTTTCTTTGATCATATTTACTGTCAAGTTGTGTATCTCT CATTAGAGAATGACCTGTATAAGATGATATCCAGTCTACAGTACTGAATT TCTGGATTAGTCGCATGCAAGAACTGAACTCTAAAGCCTGTAGAAATTAT GTTGAAAATGGACAAATTTTCCATGTTTGAATTATGTATATCAAAGCTAG TTCATATGCTGGTGGTGCATATCATTTTTGTTGATTGTGTAGAGCTTATC TGGATCTTGATTTTCTGCATTTAATATGTTTTTAGACCATTATTATGTAC TCCCTCATGCTGTTAACATGTCCGCTTATTAAGAATTTAGTCTCTTTAAA TGATTGATGAGGCACAGAAGGGTAGAAGGTCCCAGTTTTGGACCAGTACA TTTGTAATTATTTTGGATTTTGGTAACTCACTACATCAATGGCTATAGAA CACAGAATATTTACCACCTTCGTATGTCTTTTCTCTCAATTCTATTTTTT ATGCCTTAATGCATTGGTTTTGCAGTCTAATAATCATCAACGGAAGGAAT TATGCGACAGCTCAGTATCTGCATCAGTTTTGATTCCCCATCTCCAAAAC CTTGTACAGCAGACCACATTTCAGCAAGTATGGAAGTAACCCAATATGAT ACCCTTAATGCATGTGTGTTACAAATATTTGTCTTACGGTAAACCATATC CCATTTTCTTTTCCCAGGATCTCATCACGAACCTAATGAGTAACTTGCAA CAGAATGAGAATGCTGATGGTAATAATTTTCCACTGTATCTACTGAAAGT TTCAATTTTCTCCTTCTATAGTTAAAATATTTTATTTTCTCCAGGGCTGC AGTCTAGATTTCAGACTGTGGAGGGTGATACAAGGGTAAGCAGCTTCATT GGTTAATATATGGAGTATATATATAATCAACATGCAAAGTTCATCACACA TGTATCTTCTGCACACAATAGCTTTATAAGATGGGTGTGTTTATATTCAT TGCAGTGAAATTTCTACTGTAAGAACATATTAACTCATAAATTTGTGGAC CTTTTTTGGCAGGTTGAAACAAGTAGTGCTGAGGGAGAACGGACACTACT CAATAAAATATTCGAATTACAATCTAGGTAGGTCAATTACTTGGCAATTG ATATTGGAAGGGGTAATCACATCCTCTCAAACTTGAAATTTGTATTTGAA AATTTTTCCACTTCCAATTGCAAACAACAAAACACTAAAATTCCTGCATA AAACCTCTCTTTTATACAGCTCAATCCTATTTGCTTGTCATCGCCGATAT CAGGTTGCTATCTTGCGATACTAGTGCCTATAATGCTGCCTGATTCTGTG AGCTGCTTTTCCTGCTTAGACTGCCTGTGCCGTGTCAAGAGTTACAGCCC AACCCAACTGCAACATTTATCACCTTGCTTAATGTTACTGTGTTGCCACA TGACAATCTTATGCACGTCTAGCTGTTGGAGTTTGGATACTGCCTGGTTC GTATCTACTTGTTTCACATTGCCCACGTACCTCTACCGCTTGCTTCCACC TACACCTCACTGCCTTCTCCACTCCATGCTCCCCCAACTGTTATGTTTTT TTTCCAGCTACTTGCACAGTGTGTGTAGCTATCTTTTGTTGCATAGAGTC TTTTCCACAATGCTTGACTGCTTTGAGATGAGTGAGGAGGCTGTCTTGGT TATAAGTGCTGTGGTTCAAATTGTCAGCCTCACAACTTGGTAGTGAGACG GGTTAATGTTTTATAATTACAATGTGACGCCTCATGTACCTCACTCATGA CATTTTGACTAGTTGCTGCTAGCTAAAAAATAGACAACTTTCGTCTTTCT ACATTTTTCATCTGAAATTCATAGCTGTGATGTTGTGTTGATCGTTTTCT AAGGCTTAATGCATACTCCAATCGAGATTTTAACATGACTAGGATGCTTT CCTTTGTCGGTAATTAAGATTTTGCAATTTTTATTATTTAATTTACAATT TCCTCTTGCAGAATGATTTCTTTAACTGACGAGTTGATTGCATCAAAGCT CAAGCATGTTCAGGTCAGTATCAAGCTATTTCTCATGAGCTTTCTCCACT GTTTGCACCGAGTCATCTGCAACAAAGTACCCGATTGTTTAGTCTCTAAC AAAGGGTAGGGGAGGGTGGTAAACGGACTCCTACTCAACATACACATTAT GCCAAATGTACCTTAAGTACATCGAATTAGAGAATCGAACAACAAATAAG TGTGAAAATTAATACCATATGTAAGATGATTATTGTGTATGATTTGTCTT CTGCATTACTTGCAGCTGCAAGGTGAACTAAATGCACTGTACTTTCAAGA AGAAATAGTCGACAGGAGAGAGGAGGACAACGAAGAAGCCTGACATGGCA AGGCACCCTTTAGTGCTGCAAGGAGTATTCCGGTGACCACCTCTCGAAAA GAGAGAGTATTCTTGTCACTATAAATTGCCTGCCCTGGATCACGCATTGA CGCTTGGAATTGGTGTGCGGGCATGTCTTGGAACCCCACAAAGAAGTCGA GGAGAGAATGCTATTCGAGGCTTAGTAAGAGAATGTGCTCGTGGATGTCC GTTTGTACATAGCTATTTAGTCGGTAGGGTTTGCGTTTAGTTTATTGTCC TGCGGTATCCATTCATTTTGGCTGACCTTATCATTGAGATGGCTATTGAT GCCAGCCATAGTGCCCATTTGGTCGCAGAAGAATAATTGAACTCTGGTAA TGTATTATATAACATATGCCAATGAATTTGGAATAAATGAGAAAATAATT GAGTATATAGTGTCTGAGTCCCATTGAACAATATTTGTGTCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.