Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA045275

[Submit comment/correction]

Sequence	AA045275
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA045275
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGACTCCGGCGACGAGGCTAACCTGGCTGCCTGGATTGAAGAAGAGGA GGCCGCTGAGGTAGCAGAAGAAGAAGCATGCAAGAGGGCACGTATAGAGG TTTAATTTCCTTCATTTGTCATGAGTTTTGGTACTAATTTGTCTAGTAAT TAATTACAACTTACAAGTGTGAAATCTTTCCTCATAGTTTGTTTTCTTTT CATTGCTGTAGGCAAATGTTCCGGAAATCTTTGATCTAGCAAATGTGGTT GCCGATCCCGGAATTCGGAGACCAATTGAGTCATATGGTACCCCTGAAAT TAGAGATAAAATGCGATGGGCATATTTGTCGAGAGGTCGTAATCGTTTAG TTGGTCATAATTATCCCAAAAATCCGGATAGGCGGTCATTTCTAGATGCA TGGTATAGCAAGTATGATTGGTTAGAGTATAGTGTGGAGAAGGATGCTGC ATTTTGTTTCCATTGTTTTCTTTTCAAGTCTTCAAGCACTGGTAACTACT TTGGATCAGATGTTTTCACAAAGTCGGGGTTTACAAATTGGAAGAAAGCA TCAGAAAATTTCAAGGGTCATGTAGGTGGACCAACGAGCTTTCACAACAA TGCAAGAAATAGTTGTGAAGATTTCAGAAATAAAAAGCAAAGTGTTGCAT ATGCTCTTGTTCGTCATGAAGAAAAATCACATATTGAATATGAGATTCGT TTAAGGGCTGTTGTGGGTGTTGTCAGATTTCTACTTGACCAAGGTTTAGC TTTTCGTGGGCATGACGAGTCTAGCACTTCCTTGAACAAGTGCAATTTCC GTGAGATGTTGGATTGGTATGGTGCAAGATGCAAGGATGTAGCTGATGTG ATCAATGAGAATGCTCCTGGCAATTGTCAATTAACATCTCCTAAGATCCA AAAAGATATAGTGCAAGCATGTGCAGAAGAGATTACACAAGTCATTATGA GTGAGCTTGGAAATGGTTGTTTCTCTCTACTTGTTGACGAGTCTCGTGAT GTATCGGTTAAAGAACAAATGGTTGTGATGGTGAGGTTAGTCATGTTGGA GATATGCCCTAGAGGCAATAATAAATGTAGTTATTATTATATCTTTGTGT TTATGATAAATGTTTACATTCATGCTATAATAGTATAAACAAGGAAACAT TAATACTTGTGTGATTTGTAAACTTAAATTGAAGTCCCTAGTATAAGCCT CTATACAACACTAGCTTGTTGGTTGATAAATGATTGTGGTTTCCCTATCA TGGACATTGAGATGTTATCGACAACAAGATCATATCGTTAGGAGAATGAT ATGGTGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAAGTCATTT TAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATAAATAGTAATCTAATTCTTT CGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTACCGGATGGATGCTTTGATGAC ATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATTGAGTATT CGGAAAGTATTGGTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTGTCCATCC ATATGACGGATAGATATACTCAGGGCCCTCTCGGTGAAATGTCATCCAAT TAGCTTGCAAGCATGTGACTGGCTCACAAGGGATCACATATCACGGGAAC GAGAAAAGAGTACTTATCGGTAATGAGGTTGAACTAGGTATGCAGAGATA CCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAAACTATTGTGAGACAAAGGGAAAT TGATATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGTAGAAATA TGTGGGAGCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTGTTGGTTATTGTTCGGAG AAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAGACACACT TAAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGAATGATGAGAAAGAGACCG AATGTTGTTCAGAGTCTCGAATGGGATTCGGGATATCACGAGGAGATCCG GAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCATGTTTCGGAGAT GGAGAATGGTTCCGGTGTTTTTATCAGGAATGTTCTAGAAGGTTCCGGAA TGTCCGGCACTCCGGGGGGGAAGGGTACATGAATGTGTTATCAAGTTGAT ATGATTGCATCATGTACTCGGTGTCATCGCTGTTCAAACTAGAGGGATTA TTCAAATCCTAGTTTGAAAAGTCAAACGGCTAGTTTGAAAGTCAAACGGC AAGTTTTGGAAAGAGGAGGAGGAGTGGGAAACCGAGTTGGGGAGGGTTTC CCTCCTCCAACCGGCGGCGCACCACCCAAGCCGAGTTGGGGAGGGACTCC CCTCCCTCCCCTTGGCCGGCCGGCCCCTCCACCTATATAAGGAGGGGCAG GGCTCCCTCCTAGAGACACACAAGTCCCTTGCCTCGAAAACCCTAACCCT AGCCGCCGCCTAGGGATCTCCTTGCCGCCGACTTGGGCACCACCAAGCCC TAGTCGCCGGCTCTAGAACCTCTTCCTCGGCGTGTCTAAACCCTAGATCG TCGAGGGATTTCTTATAGCCCACCATACTCGCTCTGGCTTAAGGCGAAGC CCTGCGAGATCTCCCCTCTACTTCCGGTACCACGCCATTGTGCTACCGGA ATTGCGAGGAGAGTGCTACAACCTCCGCTGCCTGCTGGAACAAGGGAGAG GAAGGTCTTCGTCGAGTACCGAACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCC GGAACGCAGCTTCGGAAGGATCGTCTACGCGATCTTGAAATCGGGAAGAG TACGACTACATCACCCACGAGAATCCGCTCTCGTTAAACACTTTGGAATC TTCGAGGGTGAGTTATTCTATCGACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATAGA TCTTGGCTTGTTTGTTTGTATGCGGTAGAAAAATTTAGTTTTCCATGCTA CGAATCCCTACAGTGGTATCAGAGCCGTGTCTATATGTAGATCTGTTGCA CGAGTAGAACACAATGGTCATTGTGGGCGTTGATGCCTTTGTTGTCGATT GCTTCTTGTGTACTTTGCATCTTGCGGTATGTTGGGATGAAGCGGCCCGG GCTAACCTTACATGACATCGTTCATGAGACTTGCTCCACGCTTGACATGC AACTTGTATTGCATAAGTGGCTTTGCGGGTGCCTGTTTCTCCTAGCATAG TTAAGATCCAATTTACAACGGGTGATTAACAATACTAGTATCAATGTTGT GGTTCTTGTTCGTAAGTTAGAACGACACTTATTGAAAGCCCCAAACCACG TAAAACATGCAAAGAAAGTAGAGGCGTCTAACTTTGTTTTGCAGGGGTGT GCTGTGATGTGATATGGCCATGATTGTGATTATATTTGATGTATGCAATG TTCCTTATTGTAAGTTGGCAACCGGCAGGAGCCATATGGTTGTCTTTAAT TTATGTTAAGACTCGCGTGTCTATTCAAAGTAGTTGTAATAGTTGAAGCT GGTGGACGACAACCATGGAGAAGCGTCATTGACCTTGATGCAATGCCGGT GATGATGGAGATCATGTTCGTGCTAGAAGATGGAGATCGGAAGCACAATG AAGAAAGGCCATATCATATCACATATTATGAATTGCATGTGATGTTAATC CTTTATGCATCTTGTATTGCTTAGTAGACGACGGTAGCATTATAAGATGA TCCCTCATGCACATGAATTTCAAGTCATAAAGTGTTCACCCTCAGTTAGC ACCGTTGCTAAAGCTTGTTGTTTCGAAGCACCACGTGATGATCGGGTGTG TTAGATTCCGCAAGTGTATACAACATGAGCAAGCCAGATTTGCTCATGCG GAAACTAAGGTTTGATCTTGACGGGCCTAGCATGTACAGACATGGTCTCG GAACACGGATCACCGAAAGGTAAAGCATGAATCATATAGTAGATATGATG AACATGTCGATTATTCGCCATTGAAACTATATCAATTCTCGTGATGATCG GTGTTGATGTGGTGGATTTGGTTAGTGTGATCACTAAAACAATGTGAGGG ATATTGTTTTGAGTGGGAGTTCACCTAGATTAATTTTATTATTAATTTGA ACTCAATTTGTCATAAACTTAGTCTAAACTATTGCAAATATGTTGTAGAT CAATGGCAGCCCCTACCATCAATTTTAATGCGTCCCTAGAGAAAGAAAAG TTGAAAAACAATGGAAGCAACTTCGCAGATTGGTTCCGCAATTTGAGGAT TGTCCTCACAGCTGGTAATTTGACCTATGTGCTGGATGCACCGCTGGGTG ACCCACCTGCAGCTGATGTTTCCGATGAAGTAAAGAACGTTTACCTCATT TGGAAGATTCAATACTCCACAGTTCAGTGTGCTATCTTGTATGGTTTAGA ATCGGAGCTTCAGAAAAGGTTTGAGAATTCAGACCCATATGATATTGTTG AGGATCTCAAATTGATCTTTGAGAATCATGCGGCAATTGAAAGCTATGAG GCTTCTGAAAAGTTCTTTAACTGCAAGTTGGAAGAGGGCAGCTCCGTCAG TGAGCATGTGCTTAAGATGTCTGGGCACGCAAACAAACTTCAAAGCTTGG GTATTGTGATTCCTAATGCTTTGGGGATTTACCGTGTCCTCCAATCACTA CCACCAAGTTACAAGAACTTTGTGATGAACTACAACATGCAAAACATGAA CAAGACGTTGCCAGAACTCTTTGCCATGTTGAAATCTGCAGAAGTGGAGA TCAAGAAAGAGCACCAAGTGTTGTTGGTCAATAAGACCACCAAATTCAAG AAAGGCAAGTCTAAGCAGAAGGGACACTTCAAGAAGGGTGGTAAGAAAGT TACCACGCCAACGAAGAAGACCAAGGCTGGACCTAAGCCTGATACTGAGT GCTTTTACTGCAAGGGAGAAGGTCACTGGAAGCGGAATTGCCCAAAGTAC TTGGCGGATTTGAAGAACGACAACATCAAGAAGAAAGGTATATCTGATAT ACATGTTATTGATGTGTATCTCACTAGTACTCGTAGTAGTGCCTGGGTAT TTGATACTGGTTCGGTTGCTCATATTTGTAACTCGAAACAGGTGCTGCAG AATAAACGGAAGCTAGCGAAGAACGAGGTGACGATGCGCGTGGGAAACGG ATCAAAGGTTGATGTGATCGCGGTCGGCACGCTACCCCTTCATCTACCAT CGGGATTAGTTTTATACTTAAATAATTGTTATTTGGTGCGTGCGTTGAGC ATGAACATTATATCGGGATCTTGTTTATTGCGAGACGGTTACTTGTTTAA GTCCGAGAATAATGGTTGTTCGATTTATATGAGTAATATGTTTTATGCAC ATGCACCTTTGATAGATGGTCTATTCTTATTGAATCTCGATAGTGGAAAT ACACATATTAATAACATTGAGGCAAAACGTTTGAAATCGAGCGATAACTC GACCTATATGTGGCACTGTCGTCTTGGTCACATTGGAGTGAAGCGTATGA AGAAACTCCATTCCGATGGACTTCCTGAATCACTTGATAGATGCGAAGCA TGTGTGATGGGTAAAATGACTAAGACTCCTTTTTCTGGTATGATGGAGTG AGCTGCGGACTTATTGGAAATCATACATACCGATGTGTGTGGTCCAATGA GTGTAGCATCGCGCGGTGGTTATCGTTATGTTCTTACCTTCACGGATGAC TTGAGTAGATATGGGTATATCTATTTTCATGAAACATAAGTCCGAAACTT TCGAGAAGTTTAAGGAATTTCAAAGTGAGGTAGAGAATCAACGTAACAAG AAGATTAAATTTCTACGTTCTGATCGTGGAGGTGAATATCTAAGTTACGA GTTTGGCGAGCATTTGAAGAAATGCGGAATACTTTCACAGATGACACCGC CGGGAACACCACAGCGTAATGGTGTGTCCGAACGTCGTAATCAAACTCTC TTAGATATGGTTCGTTCTATGATGTCACTTACATATTTGCCGCTATCATT TTGGGGTTATGCATTAGAAACAACCGCATTCACTTTAGATAGGGCACCGT CTAAATCCGTTGAAAGGACACCGTATGAATTATGGTTTGGGAAGAAACCT AGATTGTCGTTCCTTAAAGTTTGGGGATGCGAAGCCTATGTAAAGAAGTT ACAGCCGGACAAGCTTGAACCCAAAGCGGAAAAATGCGTCTTCATAGGAT ACCCGAAGGAAACTATTGGGTATACCTTCTATCATAGATCCGAAGGAAAA ATCTTCGTTGCCAAGAATGGATCCTTTCTAGAGAAGGAATTTCTCTCGAA AGAAGTGACTGGAAGGAAAGTAGAACTCGACGAGGTTGTCGAACCTTCTC TCGAAATTGTGAGTAGCGCAGCACCGGGAGAAGTTCCTGTGGTGCCTGCA CCAATAAGAGAGGAAGCTAATAATGATGATCATAAAACTTCGGTTGAAGT TGCTACAGAGCCTCGCAGGTCAACGAGAACTCGTACCACTCCAGATTGGT ATGATCCCGTTATGAGTGTCATGTTGGTGGATAACACCGATGACCCTGAG ACATATGAGGAAGCAATGATGAGCCTAGATTCCAATAAATGGCAAGAAGC CATGAAATCCGAGATTGGATCCATGTACGAAAACCAAGTATGGACTTTGG TGGACTTACCAGATGGCCGGAAGGCTGTCGAGAACAAATGGATTTTCAAG AAGAAAACAGATGCTGATGGTAATGTTACTGTCTATAAAGCTCGACTTGT CACAAAAGGGTTTCGACAAATTCAAGGAGTTGACTACCATGAGACTTTCT CACCAGTAGCGAAGCTAAAGTCTGTGAGGATTATGTTAGCAATCGCTGCA TATTATGATTATGAGATATGGCAGATGGATGTCAAAACAACATTCCTCAA TGGAGACATTGATGAAGAGTTGTATATGATGCAACCCAAAGGTTTTGTCG ATCCTAAAGATGCTAACAAGGTATGCAAACTTCAACGGTCCATCTATGGA TTGAAGCAAGCATCCAGAAGTTGGAATCAACGTTTTGATAAGGTGATCAA AAGTTTTGGTTTTATACAAACTTATGGAGAAGCTTGTATTTACAAGAAAG TGAGTGGGAGCTCTGTAGCATTCTTAATACTATATGTAGATGACATATTG TTGATTGGGAATGATGTAGACCTTCTTAATAGTGTCAAGGAATATTTGAA TAATAGTTTTTCAATGAAGGATCTTGGCGAGGCAGCTTATATATTAGGCA TAAAGACTTATAGAGATAGATCGAAACGCCAAATATCATTGTCACAAAGT ACATATTTGGACAAAGTTCTAAAGAGGTTTGGAATGGAAGATAGCAAGAA AGGATTCTTGCCCATGTTGCCCAATACGACCTTGAGTAAAACTCAAAGTC CGACATCGGCAGAAGATAGAGAAAGGATGAGTAAGACTCCCTATGCCTGA GCCATAGGATCTCTAATGTATGCCATGCTATGTACTAGACCCGACATTGC ATATGCTGTTAGTTTAACTAGCAGATATCAAAGTGATCCAGGAGTGGATC ATTGGACAGCGGTCAAAAACATCCTTAAGTACTTGAGAAGAACTAAGGAT ATGGTTCTTTCTTATGGAAGTGATGAACAGCTCGTTGTTAATGGTTACAC CGATGCTAGTTGGAACACCGATCCGGATGATTCTAAATCACAATCTGGAT ATGTATTTATTTTGAATGGTGCATCAGTTAGCTGGAGGAGTGCAAAGCAA AGCGTTGTGGCGAGATCTTCAACTGAATCGGAATACATGGCTGCTTTGGA GGCTTCACAAGAAGCGATATGGATGAAAGAGTTCATTACAGAGCTGGGTG TGGTTCCTAGTGCGCTGGACCCAATGTCTATCTACTGTGATAACATGGGC GCCATAGCCAATGCGCAAGAACCAAGGTCACACAAGAAGCTGAAGCACAT CAAGCTACGTTTTCACGCAATTCGAGAACATATCCAAGATGGGGATATAA AGATTTGCAAAGTACACACATATCTGAATGTGGCGGATCCGTTGACTAAA CTTCTCCCGAGGGCAAAACATGACCAGCACCAAACTGCCATGGGTGTTCG GTATATTACCATGTAATCTAGATTAGATGACTCTAGTGCAAGTGGGAGAC TGTTGGAGATATGCCCTAGAGGCAATAATAAATGTAGTTATTATTATATA TTTGTGTTTATTATAAATGTTTACATTCATGCTATAATAGTATTAACAAG GAAACATTAATACTTGTGTGATTTGTAAACTTAAATTGAAGTCCCTAGTA TAAGCCTCTATACAACACTAGCTTGTTGGTTGATAAATGATTGTGGTTTC CCTATCATGGACATTGAGATGTTATCGACAACAAGATCATATCGTTAGGA GAATGATATGGTGGACATACTCCTATAGATAAGCGTAGCATAAAGATCAA GTCATTTTAATAGTTCAATTGCTATATGCTTTCTGATACATAGTAATCTA ATTCCTTCGACCATGAGATCATGCATATCACCTTTACCGGATGGATGCTT TGATGACATCAAACACCACACCGTAACTGGGTGGCTATAAAGGTGGCATT GAGTATTCGGAAAGTATTGGTTGAAACACATGGATCAAGAGTGGGATTTG TCCATCCATATGACGGATAGATATACTCAGGGCCCTCTCGGTGAAATGTC ATCCAATTAGCTTGCAAGCATGTGACTGGCTCACAAGGGATCACATATCA CGGGAACGAAAAAAGAGTACTTATCGGTAACGAGGTTGAACTAGGTATGC AGAGATACCGACGATCATAACCTCGGATAAGTAAACTATCGTGAGACAAA GGGAAATTGATATCGTATGTAAGTGGTTCATTCGATCGCAAAGTAATCGT AGAAATATGTGGGAGCCATATGAATTTCCAGATTCCTCTGTTGGTTATTG TTCGGAGAAGTGTCTCGATCATGTCCGCATAATTCACGAACCGTAGGGAG ACACACTTAAGGATTCGACGTTGTTTGAGTAGTTATGGAATGATGAGAAA GAGACCGAATGTTGTTCAGAGTCTCGAATGGGATTCGGGATATCACGAGG AGATCCGGAATGGTCCGGAGAATAAGATTCATATAAGGAAAGTCCTGTTT CGGAGATGGAGAATGGTTCTGGTGTTTTCATCAGGAATGTTCTAGAAGGT TCCGGAATGTCCGGCACTCCGGGGGGGAAGGGTACATGAATGTGTTATCA AGTTGATATGATTGCATCATGTACTCGGTGTCATCGCTGTTCAAAATAGA GGGATTATTCAAATCCTAGTTTGAAAAGTCAAACGACTAGTTTGAAAGTC AAACGGCAAGTTTTGGAAAGAGGAGGAGGAGTGGGAAACCGAGTTGGGGA GGGTTTCCCTCCTCCAACCGGCGGCGCACCACCCAAGCCGAGTTGGGGAG GGACTCCCCTCCCTCCCCTTGGCCGGCCGGCCCCTCCACCTATATAAGGA GGGGCAGGGCTCCCTCCTAGAGACACACAAGTCCCTTGCCCCGAAAACCC TAACCCTAGCCGCCGCCGCCCTCCAAGCCGCCGCCGCCTAGGGATCTCCT TGCCGTCGACTTGGGCACCACCAAGCCCTAGTCGCTGGCTCTAGCACCTC TTCCTCGGCGTGTCTAAACCCTAGATCGTCGAGGGATTTCTCATGGCCCA CCATACTCGCTCCGGCTTAAGGCGAAGCCCTGCGAGATCTCCCCTCTACT TCCGGTACCACACCGTTGTGTTGCCGGAATTGCGAGGAGAGTGCTACAAC CTCCGCTGCCTACTGGAACAAGGGAGAGGAAGGTCTTCGTCGAGTACCGA ACGTGTGACCGACTGCGGGAGCGCTGCCAGAACGCAGCGCCGGAAGGATC GTCTACGCGATCTTGAAATCGGGAAGAGTACGACTACATCACCCACGAGA ATCCGCTCTCGTTAAACACTTTGGAATCTTCGAGGGTGAGTTATTCTATC GACTCGTTGCTACAATCTAGTAGATATATCTTGGCTTGTTTGTTTGTATG CGGTAGAATTTTTTTGTTTTCCATGCTACGAATCCCTACAAGTCATACTC TCACGGTTCTTTCTCATACTCCCACAACTCAATTATCATACTCTCACAAT TCTTATATGTTATTGCTTGTAGGTTTGTGAACCAAAAAGGAGAGATCATG GAAAGATTGCTTGGTGTTGAGCATGTTCTTGATACTACATCGGCTTCTTT GAAAAGATATCTAGATGCAATGTTTGCGAAACATAATTTGTCCATGTCTA GCTTAAGAGGTCAAGGATATGATGGTGCCTCTAATATGCGTGGGGAGCTA CATGGTTTAAAAACATTGGTATTGGTCGACAACCCTTTTGCTTTTTATGT GCATTGTTTTGCCCACCAACTACAATTGGTGGTTGTGGCGGTTGTGAAAG GGGTTCTTTCAGTTGGTCAGTTCTTTGGTCACTTAAACAAGATTGTCAGT ATGGTGAGTGCCTCTTGTAGGAAATCTTTACCTGCAAATCTTTGTTTATG TATAAATTCTAATTTCTACATGCACAAATTTTGTAGGTGAGTGCCTCTTG TAGGAAAAAGGATGCATTGTTGCAATTGCATCATGATCGTTTGGTAGCAC AACTAGAGAGTGGGGAGATCTCGTCGGGAAGAGGCCAAAATCCAGAGGCA AGTTTAGCAAGACCGGGTGATACTCGTTGGGGGTCGCACCATAAAACTCT AGTTCGGATTCAAGTAATGTGGGATTCAGTGGTTAAAGCACTATGTAGTG TTTCTCATGATGGGACAGATGCCGAAGAGAAAGGCGTGGCTTCAGGTTAT ATCATATACATGGAAACCTTTGAATTTGTTATTATCTTGCATTTGATGAT TCGATTACTTGGTATAACAAATGTTTTGTCAAATGCATTGCAAGCCAAGG ATCAGAACATAGTGAGTGCTATGAATATGATTGTCTCAGTGAAAAGTGCA TTGCACAAATTGAGAAATGATGGATGTGAGCCTCTATTGCTTGCCGCTAC TAAGTTTTGTGGTGCACGCAACATTATGGTACCGAATATGGATGCTAACA TTGCAGCTGGCGGTTACTCAAGGAGCTCACGCAAAATGGTTACTTGCTTG CATCATTACAAGGTAGAAATCTTTAATGAGGTGCTTGATAGAAACATAGT TGAGATGAATCATAGATTTTCTGAAACTTCTACACGCCTATTATTGTGCA CTTCATGCCTTGATCCTAGAGACTCATTCAAAAGCTTTGACAATGATATG CTAGTTGAGCTTGCAACCATATACTCTGCTGATTTCTCTTCACATGATTG TTTTATTGGTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.