Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043727

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043727
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043727
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGACATGGAGCGTGACCTCAATATGGCCACTCGGGAAGCAACCACTAG
CTATGCCAACAACTCCAGGGTTCAGGTTTGTGAACGACCTTATGCATGTC
GATACAATTGAAATGGCCTCTTTGGATTGCGGAATTTCCATATACTTTTG
TAGCTTTTCAGTTTTTTTACAAAAAATCGTGTAAATGGCCTTCGGATTGT
AGGATCCGGATTGTCTAAATTACGAATGGTATGCAATCCTTTTATCTTTT
CTGAAAAGGAGAATTACATCAACATATGTGTATGTTTAATGCACACACAC
CACATATGCATTATGTTAAATAACTATGATTTCAAAAGACAAACAATTTT
AATTAAAAGTCCCATACGCCCTCTATCTATCTTTGTGTTCCTCCAAATTT
TGTGTTTATTTTCTACTAACCATCCAAAAACATCACCGAGAAAAACCATG
TAGGATAGCACATGACATCTCATTCCTGTATTTATTCTGATTCTACGTTT
TCTTTTTTGTTTCTGCTTTCCATATAGACTCTAACTGTCCTGGATATATA
GATAAGCATATTGGTCCCGAAGCTGATGAATTTTTTCCTTGCATTTGTAA
TAGCAAAAGGCTTTGCTCGAGGCCAGGCCAATGCTTCAGATAGCTGTGAG
ACAAGTGTACATGGATCTCCCACTTCCGACGATCACAGTCGGTGACTTAG
GATGCTCATCAGGTGAAAACACACTCCTGTTTGTCTCCAAGGTGATCGAT
GTGATAGTCGACAAGCTCATTGGTGACACCGTGGAGCTCCAGTTCTTCCT
CAATGATCTGCCAGCCAACGACTTTAACCATCTATTTCGTACACTTGGAC
GCTTCAAGGAATCAATTGTTGTGGATCACAGTGGAGGGTGGGGGAAGGGA
GGGGAGATGCGAGAGCGAGGAGCGTTTTTTATTCACCTACCGATATATAA
TGGAAAGGGTCACTCACATGGAAAATAATAGCATTGCTATTTCGCGTTAT
TTAGCTCGTTATAGTGTATTCGGAGAGTCAACGCTATTTTTTCATGATTT
TACTCGCGATGGCACTATTTTCCAAATAGCTCGCTATATCGTGCTCAAAC
ATTATAGCGTTAGCGTTATTTCAAATATAGCATGTTATTTTTTTTTGTTG
GTGGGTGTGGAGTAAGCGAGCATATGATGAGTGTGTGGATCGGAGTTAGC
AAACATATGATAAAGTTTTTGATTGTTAAACTTAGGTGTGTTTGGTAGGT
TCCATATTCGTTTCTTCGTATGGGTCGAGAAGAAATAAGGATGTTTGATG
TATTGGATGGCATCCTTTTTTGCACCGCACGGGTTTTTTTGCGCAGCACG
GGCACCATCGTCTTCCGCATCGGCGCACGAGGCGATCAGACTCAACATCG
CGCGATGGGAGGCGCAGTTCGAGCGGCAGCTATGTGTTGCAGGCATGACG
GAACCACGGGGCACCATGAGCCTGGCAAGACCTGCTACAACGGCAACTCA
TCGGCATGCGGCAGGCACGGCCTTTTCCCCTTGTGCTTGATTTGATCTTT
CTTTTCTTTGTTGTTCGTCGGGAGAGATCAATCCACAGCAACTCATGGGT
GCCATCTCTCTGAAGTAAATTTCCTCACTTGTTTCTGAATGATTTCAGGC
CACACGCCAATCCAATCTCGGTGATTATCTTAGTTTGTCTGAACTCTGAA
CCCCCTTCATCTTCTTCTGAAAATTCAGTCTAGGGTATGTTTGTCTGATA
CTTACTTGTGCAAGCGGAAACAAGCTAGCGCAGCCACGTTGTTAGGTACC
AAGCGTTGCCGGTGACTTTAGTCCCACCTCGCTAGCGGGAGGAGGCCACG
ACCAGCTTATAAGGGAGAGTTTCTCTCCTCCTTTCAGTCCGGGCTTTTGG
GATGGAGTGGGCTCTCCGCTGAATGTTGGGCCGTGTGCGCGGCCATGGGC
CAGGAAACGTCCAAACGCAACACGAGTGTGTGGAGATGGGCCCGGGATGC
TGACAATTGGTATCAGAGCCAGCACCGCCATGCCCACCTGGGGGGCTTCC
TAGGGGGATGGGGTGTTAGGTACCAAGCGTTGCCGGTGACTTTAGTCCCA
CCTCGCTAGAGGGAGGAGGCCACGACCAGCTTATAAGGGAGAGTTTTCCT
CCTCCTTTCAGTCCGGGCTTTTGGGATGAAGTGGGCTCTCCGCTGAATGT
TGGGCCGTGTGCGCGGCCGTGGGCCAAAACGTCCAAACGCAACATGAGTG
TGTGGAGCTGGGCCCGGGATGCTGACAATTGGTATCAGAGCCAGCACCGC
CATGCCCGCTTGGGGGGCTTCCTAGGGGGATGGGGTGTTAGGTACCAAGC
GTTGCCGGTGACTTTAGTCCCACCTTGCTAGCGGGAGGAGGCCACGACCA
GCTTATAAGAGAGAGTTTCCCTCCTCCTTTCAGTCCGGGCTTTTGGGATG
GAGTGGGCTCTCCGCTGAATGTTGGGCCGTGCGCGCGGCCGTGGGCCAGA
AAACGTCCAAACGCAACACGAGTGTGTGGAGCTGGTCCGGGGATGCTGAC
ACACGTCACCTGTAGATCCTGGCTTGCGGGAGGTTACGTTCAGGGTGTTC
ACCGTGCCCTTCACCTGGGATTCCAACTCCAAATCCATTGCAAGTAGGGC
TGACCTGGGCGCGGCTCTGCTCTCCCGTCTCGGCGGAGCAGTGCAGCCAC
AACACATACCCCGTGCTCCGCCAGCCTTCGCAGGACCTCTGCTTCGTGTT
GCCGGAGACGGCGTCGCCGTTCTGTGGTGCGCCTGCCATCGCTGACGCTC
CACCTGGACGACGCCGAGTCGCCGACCGGGAGCTGCCACGCGCCAACTAC
ATGTTTGAGGACCATGGCGTGCGCGTCGTGTGCCTGGTGCTCGCCGCGGT
GCCCGGGGACCAGACCGTCATCGGCAACTACCAGCAGCAGAACACGCATG
TCGTCTACGACCTCGACAATGACCTGCCGTGGACGCCAGGACGAGGACGA
GACGTCGTCCGGGTTAAGCGCATCGAGTCCTGCCTCGGTCCACTCCTCGT
TGCGCATGCCGACCGGCGCCTCCATCTCCGAGGTGATGCCGACATCATCG
TCATTGTTGGCTCTGACTAGGGGGTCCTAATCTTCGTCGGCATGTTATTG
CTCCTCCTGATAGTTAGATGTTACTAATATGAGATTAGAGGTGAGAAATT
ATCCTTGCATACCGCAACCAAACATCCTAAATTCTTCTCATAAGACTAAA
AGCAGACAACCAAACAAAGTGGCTAAAATTGCTCAACTGCTCGGGAAACA
AAAATACAAGGAACCAAACAAAACGCTCATCCAGGCCCGAGATCAAATCT
CTCCACATGCAGCATCCAGCCGTCCAAGTAGCAAAAACGAGAAATTTGAG
ACCGATCAATCAAACATGCCCTTATGTGATCGCATCAAGCCGTCGCCTCA
TGTTGCAACACCCGACGCTGTGCATAGCTTTAGCCCTATCGGTTCTCCTC
CAACTTGGATAGCACCGAAATTGGTGATGCATATACAAGCGTTACTATGG
CTAATTCATTAGATGCTGAAATCCTTAATATTCATGATATACCTGTTATA
ATCTTAATTTTTACAAACCACTATTTTGTAAAATAGCGCGCTATTATCAT
GCTATAATTTTTATAGCGTCCGTGCCATTTTTTTCTCCTTTGTCACTCAC
TCAGCTACCTCAACTTCAGCTATCATCACTATTGAAGGGAGGGAGAGGGG
CCGACATGCCCACATCTAGTGGGGAACAAGAGTAGGTGGGAAAGGAGCGG
TGGGAGCATTCAACTTACTGCCCTATCCACATATACCCCACTTAAAAAAA
AATGAACAAAAAATGAACGTGGATTGTCCCAGCCCAGAACTCATGGCATG
TGCCGTGTCATTGAGGCTGTCTGCATCACTTTAGTGAAGAGGCAGGGATG
TTTATCCCCTTTTCTAAAAAATAAATATAATTTAATTTCAACTACCGACA
CAAAACATGTGCTGAGCAATTAGAGACTCGACAAGTAGTACTCCTTCCGT
CTTAAAAAGGATGTCGCAAGTTTATCAAAATTTAAATGAATAGTATCTAG
ATACATGTAAATTTATACAAATCACATCCTTTTTAAAACGGAGGAAGTAG
TACAAATCAAATTCAAAGCCATCGGTATCTCAAAGCAGCTATTTTGTTGT
GGCAAAGCTGTGTGACACGCACGCGGGCATTTGCTACAAGATCCTTCGGC
GAAAATAACACTTCATCCGTGGATATTGATCTTATGTTTCTATAAATAGT
ACCTAACGAGAGTGAGTACTTATTGTCTTATTCCCTACTATTGCTTATCA
CGAGATAGAGATTTGTAGCAATGGACATGGAGCGTGACCTCCATATGGCC
ACTGGGGAAGCAACGACTAGCTATGCCAACAACTCCAGGGTTCAGGTTTG
TGAACGACCTTATGCATCTCGATACAATTGAAATGGCCTCTTTAGATTGC
GGAATTTTCATATACTTTTGTAGCTTTTCAGTTTTTTACAAAAAATCATG
TAAACGGCCTTCGGATTGTAGGATCCAGATTGTCTCAATTCCAAATGGTA
TACAATCCTTTTATCTTTTCTGAAAAGGAGAATTACATCAACATCTGCGT
CTGTTTAATGCACAAACCACATATGCATTATGGTTAACGGATTTGCTAGT
TCTCAGGCGCCTGAGAACTTCTTAAGTCTCAGTCGTCTCTTTCACCGTTT
GATTTATCTCGTGATTCGTGCAAAATAGAAGTTACACATGAGTTGCAACT
TGGGTGTAACTGAGAATTTAATGAGTTGAGTTGCAACTAAGTTGCAACTG
AGAATTAGTATAAATCTTATGAGTTGCAACTAGGTTGTAACTGAGAATTA
GCACAAATATTAGGATGACATCACCGACTTCGACATAAGAAGTTCTTAGG
CGTCTGAGATCTAGGCACTCCCTTATGTTAAATAACTATGATTTCAAAAG
ACAAACAATTTTAATTAAAAGTCCCATACGTCCTCTATATCTTTGTGTTC
CTCCAAATTTTGTGTTTATTTTCTACTAACCATCCAAAAACATCACCGTG
AAAAACCATGTAGGATAGCACAGGACATCTCATTCCTGTATTTATTCTGT
TTCTATGTTTTTTTCTGCGTCCCATATAGACTCTAATTGTCCTTGATATA
TAGATCAGCATATTGGGTCCCCAAGCTGATGAAGTTTTTCCTTGCATTTG
TAATAGCAAAAAGCTTTGCTCAAGGCCGAGCCGATGCTTCAGATAGCTGT
GAGAGAGGTGTACATGGATATCCCACTTTCGACGATCATAGTCGGTGACT
TAGGATGCTCATCAGGTGAAAACACACTCATGTTTGTCTCCAAGGTGATC
GATGTGATAGTCCACTGCTGCGACAAGCTCATTGGTGACACCGTGGAGCT
CCAATTCTTCCTCAATGATCTGCCAGCCAACGACTTTAACCGTCTATTTC
GTACACTTGGACGCTTCAAGGAATCAATTGCCGTGGATCACACTGGAGAA
ACACTCCCACCAATTTATATTGCTGGGTTGCCAGGCTCCTTCTATACCCG
GCTTTTCCCTCGTCAAAGCGTTCATCTCATTCACTCATCATACTGTCTCC
ATTGGCGCTCTCGGGTATCCAAATTGACAAGGGAGAACATTACTTTTACA
TCTTTGTAGTACTAATTAATTTTGGAGTTCAATATTAATTCATGCCACGC
ATGCAGGTTCCCATTGGATTGGAGGGAGACCAAAAGGCATGCCTAAATAT
GGAAAACATTTACATTGCAAACACTACGCCACGGTTCGTAGTGAAACTGT
ATCAAGACCAGTTTGCCAGTGACCTGTCGTTGTTCCTCAAGCTGCGATAT
GAAGAACTAGTATTTGGTGCGCAAATGGTGCTCACGTTTCTTGGGAGAAA
AAATGAAGATGTGTACAATGGAGATCTGAATCATCTTTGTGGATTACTTG
CACAGGCTGTGCTATATCTCGTGGATGAGGTGCGCATGAAATTTTCAGAC
TGCCAAATTTCACGAAAGTAATGTTTAAACATAATTTGTTTTGTTATTGT
ACCACAACAGGGCCTCATCCGGAAGGAAAAACTAACTTCATTTAATCTAC
CTATTTATGGGCCATCCGTCCATGAAGTTAGGGAAGTAGTGAATCAAACC
AAGTTGTATGAAATCAGTGACATCAAACTGTTCCAGTCGAATTGGGATCC
TTACGATGACACGGAAGGTGACGATGTGCATGACAACATACATAGTGGGA
TGAACGTCGCACAAAGCATGAGAGCGGTAATGGATCCCCTATTTACAAGC
CATTTTGGTGACTCCGTGATCGATGGGCTATTCAAGAAATACGCCCAAAA
TGTCGCCGAACACCTTAAGAGAGAGAAGACCAAATACTCAGTCATTGCCC
TGCGCCTGAAAAAAACATGATATGCACGTATGATATGCATATACGGAAAT
AATGTGTGTGTATTGCGTCCATCTTTATCCTTTTATGTGTGTCTAGTGTA
AGAACAAAGAACACGGTTTATGTGATGTAGCACGTATGATTGCTAGATGA
TATCACAAGTGTTGCTTGATGTAACTGGGAGTGTCTAATAAAATACCATG
GTTTGATCAGCGAGCCATGCATCAACCTTCCCATGTAAAGTGTCTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.