Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042684

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042684
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042684
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TGCCTGCATCCCTCCCTCCTCGCAACCCCGACCCAGCTCATCATTTCCCT CTCCGGCCAACGTATTCAATCTCACATCTTCCCGACGCTTCCCAATAAAA ACTCCGCCCGTCTCGCCGCCGCACCGCCCGTCGCCTCCTCCCCACCCCCA ACATCGACAAGATCAAACACCCTTCTCTCCCCCTCCCGTCCCCCCATCAC ATTGAAACCCTAGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCAGCGGCAGCGCGCG GGCACCATCCATCCATTCCCCATGGAGGACTTCGCGCGCTCCGTGGAGGA TGGGCTCAAGCTGTCGAAGCGGCTCGTGCTTCCGGGCGGGCTTCCCCCGC CGCGGCCGCCCGCGGGGATGGAGCGGGGCCCCGACGCGGCGGCCGCGCTG CTTCTGCCCTCGGCGCCGATGGCGTACGCGGTGGTCGCCGACCCCGGCTC GGTCGACACCCCCGACGTGCCCAGCTACCAGCCCTACGTGTACGGCCGCC TCGACCCGCCCGCGCTCATCCCGCTGCAGATGAAGGAGATCGACCTGGCG GTGGACTGCGCCCTGTACGTGGCCGCCGTCACCCTGCGCGCCCGCTGGTG GCTGCACTGTATCACGCGCAGCCGCGAGTGCGACGTCAGACTCGTCCTGC CTATGGGAGAACAGGTGAGCCCGTCGGACTCTGCTTTCACCGTGTGAACA TATTGCAATTTTATTTCCTTGCCTCTGGGAGATTCAGTTAGGTGAGGGTT GACATGATTGGCGCCGAGTGTTATCGTGTCCGTTTGACTAAAGTTGGTTT ACAGTTAGGGCCCATGAATCTTTTGTTTGGTGCATCCCCTCGCGATTAGC AGTTTGCTCTGTGCACTTCAGCCGTTAGTATTGCAATTCATTTAGCATGC CCCCTTCAGTCCTTTGTCCCGTTTGTACTTTGCTGTGGGCTGTGGTGCTA GAATATGGCGGCACCATGATTTTGGGTGAATTGCATAATACGGTGTTTCT GGTAGTGCATTTGATCTCTACTTGGCTGGGGCGGCTAAAAGGATGCCCGT TAAGGGCTTCTACCTTTTGTGTCATATGCTGTGATTGTTTTTTTGCTGTG TCAAGGTGGCTGACTGCAATTGTTGGCTTGCCGATACTAAATTCTACTTA ATAGCTTTCGTCCGCAAGTTCTAGACATGTAGAAGGGATGCTTTCAGTTA TAATAGAATAGTATGTTCAACTATTACATGATCAAGTTGTCTCACTGGAA GGGATGCAAGAGCCGAACACACACTTGGGGTGTACAGGATAGGATATGTT GCATTATATCATTTGGACACTCATATCGGCATATACCGGATTTCTTGGCC TTTACTTCAGCATATATAAGTTTACTTGATGTTCATTCAGAATGTGGTAG GACATGACTTCGAAGTGGAAATTAATTTGATAGTGAAGTTATTGATCTGG GATGTGTATTGTTAAGTGCAGTTGGATTCCTGCTGTTTATCTTGCCTTGC AGAGTGGGCTGACAAGGACATAAACAAAGTAAAAAACTAACTCAAGCACC TGGACTGACATTAGATTTCTTGTTTAAAAAGTCATTTTCGTTGCTTGAAT TTAAAAAACTTGATAGGTAAAAATAACGCGGAAATTCTTTAAATTATTTT TCGTACTTGCAGGTCATCTCCTGTATAATTTAATTCCCCATTCACCGTTA AAAAATACATCAAATGAAGCATTGAGTACCTACTTTGTTTATATGGTTAT TATTTGTAATTATATTATGTGATGGTCTCAACCTAAGAACGGTTTGGCTA ATAGGGTTCAATTCTAGGCGCTGAGGTTACTATTGGAAGAAGATCATACA ATACTCACGTAATCGAAGTAGAAGACCAGACCATGGAGAATATTGGTAAA GCTGATAGTGCGGGCCTTTTGAAACCCCACATGTTTTGCTTGACAATACC ACAGGTACTTTTTATATACATATATATTTCCGCTTTTTCACTGTTATGCT TTAAATGAAGCTGTAGCTTTGCTGATGTGTTGCTGTCATATAAATCAAGG TGGAGGGCGGAGCGGATATTTCAGCCACATTTACATGGTCTCAGAAGCTA CACTATGACAATGGACGTTTTTCGGTCGACATACCTTTCCGTTTCCCATA TTTTGTCAATCCATTACCAAAAGTATTCATGAAGAAGGAGAAAATTCAGT TGACTGTGGATAGTGGATTCAGTAAAGAGGTTTTGTTGCAGGGCACAAGC CACCCTTTGAAGGTAATCACCTATAATTTGTTCCTTAGATAACATTTCTT ATCTGCATTTGAGTGCATCTATAGCCTTTCCAAATGTTTAATCTTCATAT TGATTTCAGGAAAAGGCAAGGCAGGGTGACAAATTGTCTTTCCTGCATGA AGCAATTCTTGAGAGTTGGTCGAACAAAGATTTCACCTTTTCCTACAGTG TGAGTTAATCCCTCTATGATCTTGATTAGCTGCACTAGTTCCTGGGCATT TTAATGGAAATAATTCATGATCAGAGGATGATGAACTTTCATGTGGATTT ATTGCAATTTAATGTTTCAAGTTTGCCGCTGGCTATGTGTCCTTTTGTGT CATTGTGTGTGCCTAATTTATGTGGATGTTTACAGGTTTACTCGGGCGAC TTGTCTGGTGGTATCCTCCTGCAGCCCTCAACATCACAGGATTATGATGA TAGAGATAGGTTCAGCATTTTCCTTTTACCTGGAAATGGAAATAGAAAGG TTAGCTGCTTTTCTTTGGTTTTTGTTGCACTTCCACCATTCATTTAATAT GATGAAGCATATCTTCCTTGATCGCAATGTCTGCACTTGGAAAATGTTCT ATTTAAAGGCAGGGACCTCTTGTAACCTGGTTAAGCTAATGCAACACCAC TGTTATCATATCATGATCCCACAATAATACACTATTGTTCTCTTGAAATA ATTTTATGCTGCCATTCGATTGTGTTATTTCGCATAGAGAAATGCTGATA AGAAGTGCTAGCTTGATACTTTACATCGTTGAAGTCACAAGAAACAGTGC TGCAATCTAAGTAATTTGTATCTATAAATTTTTGGTTATCAATTCAGAAC AATTTCATCTTGTTGCTACATAAAATTTGCCTTCTTGGTACTTTATTTGA TCAAAGCAATCCAATAGGTCTTCAAAAAGGCAGTTGTGTTTGTTGTTGAT ACAAGTGGAAGCATGCAAGGGAAACCTCTTGAGAATGTGAAGAGTGCAGT GTCTACAGCTCTTTCAGAACTTGCGCAAGAAGATTACTTCAACATTGTAA CATTTAATGACGAGCTCCATTCATTCTCATCCTGTTTAGAGAAAGTAAAT GAGAAAACAATAGCAGGTGCGATTGATTGGATGAACCAAAACTTTGTTGC TGAGGGTGGCACAGATATTATGCATCCTTTAAGCGAGGTATTATTATTTC GAATACGATATCAATTGGGTATGGGCATATGTTATTCATGGTATTTCTCT CTCTGTCGTCTCATATTCTCCTTTTTGTCTCACGCAAGGCAATGGCTTTA TTGTCAAGTGCTCATGATGTGCTTCCACAAATCTTTCTTATGACTGATGG ATCGGTTGATGATGAACATAACATCTGCCAAACTATGCAAAAAGAGCTCA TCAGCAGAGGATCTAAATCTCCCCGGATTTCTACTTTTGGACTAGGTAAT CTTAAGGAGCACCTTCCTGTACATTGTTATTTTAGTAACTTCATACTAAA TAAATCAGCGACAACTAATATGGATCAGAGGGAGTATCTGAATTCTAGAA CTACTCCCTCCGTCCCAAAATAGATGTCTTAAATTTGTCAAAATTTGAAT GAATCTATATACTAAATAGTGTCTAGATTCATTCGAATTTTGACAAATCT GAGACATCTATTTTGGGACGGAGGAAGTATATCCCAGTTCTTTGGTTTAA ATGGAGATTTTTTTCAAGCTTATTGGTGATCTTTCATATGCTGATATGCA TATATTTATTCCCATGTGAAAGAAAGCTTACAAACAACTTAGTGTTGTAA TTTATTAATTTCAATGTTTCATGAGTCGAACTGTTTTGTTACTACTTTTT TTCATTACTCAGTAATTGGCTGTGTTCTTGTCTAATTATTTGCAACCCTT CTCACCTGAAAATGTTAGGTGTATATTGCAACCATTATTTCTTGCGCATG CTGGCATCAATTGGCAAGGGGCATTATGATGCTGCACTTGAAACAGGTAG TGAACGAACCCCACCTCGTTTATTGAATTAGCTAACTACTCCCTCCTTTT GGAAATAAGTGACTCAGATTTGTCTAGATTCAAATTTATCTAGACGCGTT TTAGTGTGAGATACATGCGAATCTAGAAAAATCTAAGTCACTTATTTCCG TACGGAGGAAGTATATGCCATATGCCCCTTTTCTGAGCTTTGAATTGAAA ACTTTGATCTGCATGTTATGTATAGACTTATTCTGTGGCTTGCTTGAGAA TTCTAGACTTATTGGAAGTTTTGGCGATGGCCATGAGGTGTATATTATTA ATTTAGTATTTGATTAGATGATGCTATAACTTCAAAAGAAGAAAAATGCT AGATATGCGGCAAATATGAAGTATATACTGTGATCTGTTCAAATTTTTAT TGATCTGATATTCAAATTTCATCCAAGTTTGCTCAGAAGTATATCAATTC TTCTACCTAAAAAAACTATTATCTGCGGAAGTCCTGATGCAGGCCAAGTT TTTCTTTAAGGTGACACAAGTATTTCTTAGAAACCTCTTTGCTTTATAGG CTGAGAGCTACCCTACTTTTTATATTCTGTACTGTGCTCTTTGGTCGTGA TTTACTCCACTTTTGCTGTATATAACGCTGCTGTCCTTTATTCTCCTATC ATCACTGTTTCTGCTTGAACAATCTGATCATTAATTGTACGCATTAATTG GACTATAAACACATAACTTATTGAAGTCAGTTAGTAAACCTCCATGATGG TAACAATTCTTCTGATTTTTTTATCCAGGATCAGTTGAGAGCCGAATATT TAAGTGGTTCAAGAAAGCATCAAATACAATAGTGGCAAATATCTCCATAG ACGCTACAAAATATCTTGATGATTTTGAAGTGAGTCTATGCGTAGTTAAC TACATTAATTTTATCATGCACTATCGATCTAAAATTACTTTATTTTTTAG TTCCATTTTGTAGTAGGATTTTTATGATAAAAAAGCTATCCCTTCAGCAT TATTGGCTGCGGTAAATTGCATTATGCAGTTCTTGCTGGCATCACTTTCA TGTCTTATAATGTTGTAGACACTTTTATGTTGGTATCCTATTTTGACAGC TCAGTCAATTTTTTCTAGCCGTGCATAGATATGAATTAAACCATACATGC TTACCACACCTTCATAGAACTTTCTTATGCTGCTCTTTTGAGTAACAAAT TTATTTTTTTAAGATTCTTTTAAGCTGCGGCATCCTTATCATATTTGTGC AGGGTTGGATGAACGGGAGGTGGGGCAAGATCTTGCAAGTGTAGCTAGAT TTTTTTTTTAGTATTGGATGGTCCTGTTACTGATTTTTGTTTTTCTGTTC AGGTTGATTCTGAGTACATTCCAGACATTTCGGCAGAGTCTCCTCTGTGT GTATCTGGAAAGTACAAAGGCAACTTCCCTGAGACGGTTATAGTAAAGGG TAACTTGGCTGATATGACAGATATCTCGATTGAACTGAAGGTCCAGCACG TAACAGACATGCCTCCTGATAAAGTAAGATGTCCAGACTTGCTACTTTGT ACATTTGTCTTAGGAGTTGCACCTTTTCTATCCATTGGTGGACTTGCTCA GCATCTTTATTTAATTCTATGAAGATGATTTAAACCTCAGGCTAAGTGGT ATTAGATGCCTAGGACTATCCATTTTTTCCTATTATATGCTGACAAGATC TCTATTTCCTTTTGTTTATGGATCCCAGTTTTTCGTGGCACAGCAGATTG CTCTTCTCACAGCCAAGGCATGGCTTTCTTCAGACAAACAGTTGGAGAGA AAGGTAAGCTGTAGGTTAAGCCAATTGTTGCATTCCTTTTTTGTGGCTTT AAACCTCTACTTTGTGTCTAATACAATTAGAAATTGATGAGTTATTCTGG AACCAGAACTTGTTATGGTACCAAAGTTGAAGATGCACCAAAACATGAGT AGTTCCCACATTTCATACATGTAGACAAGTAAAAAGGTTGTTGAATGGTT TTGAAAGTTGCTGATATTTCAATCAAAGCAGTTATTTGTTTCTTATATAT TGCTTGTTCTGAAGAACTTTCATAAGTTGTTCATATCGAATATGTTTAAA GTCGTGGCTGTTGCTACATGCTGTCGTGGTGATCAGTTTCCATTCCGTTT CTGGATTGGAGCTGGTTCTCCTTAATCACCACCATACAGTTTTCCTGCTC GTGTTGCAAATCTTGTATTATTTGGTTTGAATCGGTTCAGTTAATAGTAT ATGGTCCCATAGTTCTTGAGTAACTCATTTTCTTCTATTTCACAGGTGGC GAGATTAAGCATACATCACAACATCCTTTCAGAGTACACAAGCATGGTTG CACTTCAAACCAAATTGGATGCACCACAAAAAGTAGGTCCCACAGATAAT ATGCCTTCTCCAGGGCACATCGTTCCTAGAGATAATTTCATTGTATATTG ATGTTTCATTTGCCAGTGTAAATCAATTCGGAACGTTACTCCTATCTAAC TAAACTTTGTGTGGACTGTACAGGGCAAGCAGAAACAAAAAGGACCAAAA GGAGCTAATGAGCCACTACGGATCCCGCTTAATGGTCTAAGACTAGGATT TGGTGACAAAGCAGCCACCAGGGAAAATCTCCTCGCAGGCTTCGGCGAGG AGAAACCGCAGGAGACGCTGAAGATATTCAAGAAGGGGGGTGGGTGCTGC GGTCGTGTCGCTGACTGCCTGTGCTGCATGTGTTGCATCAAGGTGTGCAA CAAGATGAACGACCAGTGCGCCATCATGATGGCGCAGATCTGCGCGGCAC TCTCGTGCCTTGGCTGCTGTGAGTGCTGTTCTGAGGTGTGCTGTGGAGGG TCCGAGTCGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.