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GrainGenes Sequence Report: AA033448

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Sequence
AA033448
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033448
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGATCGTGTCAACAAAACAGGTGACTCTGAAGATCAACGGTTCTTTGAA
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TATAGGTTTGGTTTTACAGTAGAGAAGGTTACTCCTGATTATTTTGAAGT
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TCTTTTCAAAGCATGGATAAGCATGTACAACTTCAATATTTACATTAAGG
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ATTTAAGTTGGATCGTGCGGCATAGAACGCGTACCTCTTCGCGGTAAGTG
ATCTAATCGCAGCGCTTGGATCTGCATCCTACGGCTGCTAGCATGCTTGC
CTAGGATCGGCGGCGCTGGCGGTGGCTTGCGGCGGCGCACGGTTAGGCAG
CAACGCTACGACGATTTCAGGAAGCGGAGAGGGGGAGAAAGTTGCTCACC
AGAATCGCGATGAAGAGGGAATGCTCAACGTGTGCTTGTCGTGGTAAGGG
GCGCTCTGGTACAGCTGTAATTGCTCGCTGGAGTGGAGGATGGCGTCGGG
TGCTTCAGGTGGTCGTCGTGGATGGCATTGTGGATCACTCCAAGGCGAAA
GGATGGCATGGTTAGATGCGCGGGACTAAGACAAAGCTCCTCGTGTGAAT
GAGAAGGCGTAGGGCGGTCAGTACTTACCGGGAAGTTCGACGGAGACGAA
ACAGACGGCGGCGCTGTCGGAGTTTGTCCTAGTCGACTCTCTGGGGCGCC
CGCGGTCGAACGAAAAGCACCGGGAGGATTGTCTGAGAGTGGGGAGTCTG
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AATAAGTTCGTCGGAGACGGCGGTGGTGCAGACGAGATTGGCGACAGCCT
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GGCTTTAAAGCGCATGGTCAAGGCGAGGTAAAGGCGCGGCGTTATGGCGA
ATTGAACGCGCGGAATCACAGCAGGTAACGGTGGTCGAGGGAGGAAGAAG
GGGTCGCGTGGGTGGGAGAGAAGAACAGGAGCGGTGGGGTCTACCTGTCA
GTGGAAAAAGAAACGAGGAGGAGGCCCACTAGTTGGTGCGAATCGTTTTC
TTTCGGGGTGAGGGTGAGGTGGGTTGCAAGTGGGCTGTTGGGCTGGGGCA
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TTCAAATATATTCAAACCACACTCAAACTTTGTAATATTGAAATTAGTTC
TGTTCAGCAACATGAACCAAAATCCAAAATAATATTTTAAATCTTTTAGG
TTCCTTTTATTAATTAAATAAAATGGTCCATGGTTTATTAATAAAACAAG
GTTTGGTTTATTTAATAAAATCTACATTTGAATTCCAAATGCTTTCAAAC
CCAATCAGTAGGTTTTATTTGGAAATAAAGAATATTTGGAAGACTTGTTT
AAAATAAAATAATCTTTTATTTTAGGGTCCATTAATAATTAAATAAAATG
GGCCTTAGTTATTAAATCAAATAGAGTTTGATTCTATTAATAAAAAATCC
TTATTTGAAACCTAAAATATTTTCAAAACCAAATCAGTAGGCTTTAATTA
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AAATCCTTATTATTTTATTTAAATAAACTTTTGCTAATTTTATAAAATGT
TTTAATTCCAAAGCTTGGTCAAGGTTTAATTTGGCTTTATAAAATAATCC
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ATGGGCCAAGGTTGAGTTTCTCCATAGGCTTGTTCAACTTGTTTTTCATC
CTTTCTGGACAGTTGCTTGCATAATGTCCTGGATTCTTGCAGTTGAAACA
ATGAATGTCCTTGAGTTCTTTGCGTTGTTCTTGTGGACAAGTGGCTACAT
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TTCTTCTTGTTCTCTGGGCATCCACTGGAGTAGTGTCCCATTTCCTTACA
TTTACGACATTGTGCACACTCATGTCTTGCTTTTGTTTCTTAAATTTCTT
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CTTTGGTAGACTTGGATCCTTCTTGTTTCCTTTGTTCCACCATGGAGTAG
ATTGGGCATTGGATAGGGACATGGTCATTTCCTTCACAAAGGTAACAAGT
ATCTTGAGAGGTAGGACATTGTCCAACAGAATGATCTTCTCCACAGTTGG
GGCATTGACCTTCATGCTCTTTGGATGTGTGATCCTTGTCTCCACAAATA
GTGCAAGCTGGGGCTCCATCCAGAATAACATTCTTGTCAGCCTTGTTATC
ATAAACTTCTTTGGGATAATTTTCTTCCATGCTGATCATTTGATTGGTCA
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TCCTTATCACAATTGTTGGTTATGAACTGAGCTGTCAGTTGGTTCAGCTG
GTGTTGGGTTGCTATGAGCTCCTTCATGCTGTCAGCTTGGTTGGTGTTGG
TGTCATCAACTTTGGAGTCTTTTGGAGTAGTCATCTGTTTGGGTTGAAGG
GAGGTTAGAATAGGCAAGATATTTCTTAAGGAATTATTTCTATTCACACC
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TGGTTCCTTCTTATTTTGCATTCCCTTAGTCTCTAAATCTTGAGTAAGAC
TCTCCTTATCTCAATTGTTGTCTTTGGTGGCATCCATGTTGGAAGTCCTT
GGTGATTATGCTGAAGATGTTGAAGTCATTAGAGTTGAAGATGTTGAAGC
CATTAGAGTTGAAAAAGTTGAAGAAGTTCTTTGCACATGGTGTAGTCTTT
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TTTTGGATCAAAATATAACTCCTATTTTTCTAAGGGTTTTTGTCCAATCC
TTGGTTAACAAATCCTACAGGCAACACAATGCTCTGATACCATCTGTAGA
GGTCTCAACCTAATAAGGTAGATCCCTCCTGTGTTTTATAATGCTAGTCC
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GGTCATAACATAACTTTACAACCAGGAATAACATAAGTTTATTACATCAA
ACATAGCTCATTTGGCTATTACATTACATTGCAGCGAAATAATAATAATC
ATGGAGTCCTTCATCTTTAAAATGCCACAGGCAGATGTTGGTTGTAGGCT
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TCACTACTTTGTATATTATGAGTGGATCTTATCATTACATGCATATTTGG
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TTCAAAGTGGTTTTGGTCCTTGTCAAATCCTTTTTCCAAGTTCCTTGAAC
TCCTTGGTAGAAACACAAGTGTTCAAGCCCTTGTCAAAAATCTCTTGAGC
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TTTAGTTGCTCAGTATTGTCCATAACCGGGGACACGACTAAGTACTTAGA
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CTTCTTGTTGCCACCAGTGGCCTACTGGATTAGTGCTCACCAAGATGGAG
TTCCGGCAGACTGAGAGTGTGACGAAGTCTTTCCAAAAGGTCCTCCCATA
CATCATTGCTAGCTTGCCTTCAGCCCCCATGAAGCATTCCAGATCCCCAT
GTCCGGTAACTAAAGACAATGTATGGGTCTTCCTAATGTAGTTGACTAAG
CCAGAGCCATAATAGCATGTGGTTGCACACGAAAGCCACAATTGGAGAAA
CATGTTCAATCTCTAAGTTTCCTAGGTGGTTTTCATTTGGAGCACAACAC
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ATAAAGTGTCCACCACCTAGGTGGTTCATTGAATCCTTGTTTTATTATGT
AAAACACAGGTCCTTTTCTCAACCTTTGTAAAATCTCAACATGTATCTCT
TTTCAAAGCATGGCTAAGCATGTACAACTTCAATATTTACATTAAGGAGT
GTATAGGGAATCCTATTAGGATTTAGCATAGCATAAGTATAAAACATTTT
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GTATGATAGTGTAACTTGCCTTTTTGGAAGAGAATGGTGGTTCACTCCTT
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TTCTGCAAATTCAAACAAGCTAACAGATACTATTTGTCAAACTAAGGCCA
TGGTTGGCTAGGGCTTGTTCTCCTGAATCCAATGACATAAAATTTGTAAT
TTTTGGACGTATGGTTTGAAAGTTACAGGGGTTTGAAAATTGAATCTCAA
TCAGGTTTCAAATCTGTTTTAAACAAAACAGGTGACACGCGACGCACTCT
GGTTGGACGGTACCGGTTCGGTTGGATCGTGTGCTGCGGAGCGTTGGATT
TAAGTTGGATCGTGCGGCACAGAACACGTACCTCTTCGCGGTAAGTGATC
TAATCGCAGCGCTTGGATCTGCATCCTACGGCTGCTAGCATGCTTGCCTA
GGATCGGCGGCGCTGGCGGTGGCTTGCGGCGGCGCACGGTCAGGCAACAA
CGCTACGGCGATTTCAGGAAGCGGAGAGGGGGAGAAAGGTGCTCACCAGA
ATCGCGATGAAGAGGGAATGCTCAACGTGTGCTTGTCGTGGTAAGGGGCG
CTCTGGTACAGCTGTAATTGCTCGCCGGAGTGGAGGATGGCGTCGGGTGC
TTCAGGTGGTCGTCGTGGATGGCATTGTGGATCACTCCAAGGCGAAAGGA
TGGCATGGTTAGATGCGCGGGACTAAGACAAAGCTCCTCGTGTGAATGAG
AAGGCGTAGGGCGGTCAGTACTTACCGGGAAGTTCGACGGAGACGAAACA
GACGGCGGCGCTGTCGGAGTTTGTCCTAGTCGACTCTCTGGGGCGCCCGC
GGTCGAACGAAAAGCACCGGGAGGATTGTCTGAGAGTGGGGAGTCTGCTA
GTGTGCTCGGGGAGGTTCGGGGTGGTGTCGTGTCGCCGGAATCGGGGAAT
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GAACGCGCGGAATCACAGCAGGTAACGGTGGTCGAGGGAGGAAGAAGGGG
TCGCATGGGTGGGAGAGAAGAACAGGAGCGGTGGGGTCTACCTGTCAGTG
GAAAAAGAAACGAGGAGGAGGCCCACTAGTCAGTTGCTCCGCGGGTTAAC
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GTGGGCTGTTGGGCTGGGGCAGCTGGGCCAGATCCAATTCATATTTTTTT
CTGTTTCTGAATCTTTTTCCTTTTTCTAATTTCTGAATTCTGTTTTGAAA
TTTCTATCAAACAAACATGGTTCAAATCTATTCAAACCACACTCAAACTT
TGTAATATTGAAATTAGTTCTGTTCAGCAACATGAACCAAAATCCAAAAT
AATATTTTAAATCTTTTAGGTTCCTTTTATTAATTAAATAAAATGGTCCA
TGGTTTATTAATAAAACAAGGTTTGGTTTATTTAATAAAATCTACATTTG
AATTCCAAATGCTTTCAAAACCCAATCAGTAGGTTTTATTTGGAAATAAA
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AAATAATTTAATAAGTTTTGATATTTTAATTAAAATGATAAATCCTTTTA
TTTAAATAAAGTTGGATATTAAATCCTTATTATTTTATTTAAATAAACTT
TTGCTAATTTTATAAAATGTTTTAATTCCAAAGCTTGGTCAAGGTTTAAT
TTGGCTTTATAAAATAATCCTTATTTGTAAGACATCTATTTCATTTGAAA
ACAAATCTTTTCATTTAATTGTTTCAAACCAAATGTTTTATTTTTCCTTT
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TCAAACAAAATTTTATTTTATTCTTTTATTTTCACATTACAAGATTTGGA
AAAATCTTGGGATGTGACATATGGTAATTATTTGAACAACCTTTGTTCTC
ATAATACCTGATTTAAATAACAATTATTAAAACAAATCTTGAAGTCAAGC
TTTGATGTCAACGAGAAATACAAACAACGATTTGTTTGTTGTCGATGAAC
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TGCATCGTTCCGTATGAAATTTCATACCAACCAATTTGGTATCCAATACC
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CATATATATACCTAAATTGGATATTTCCAATCTTTTCTTTTCTGCCAAAT
ATATTTTTATAGATTCTCTTTCAGCATTTCCTTTTTCTTTTAAAAGAATC
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TATATTCAAATAATAATACCTTTGGACTTGCACTTTGAAGTAGATCACCA
TCATCAAATGATCGGCGTTCTTTCAGAATCCATTCTTTAGTAATCTTTTA
GTATAGGTAACACTTTACATACATCTTCTATTCATCCTTATCATGACAAC
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TTACTTTCCAAAACCCTTTTGGATGATTATGTTTAGCATCTCCAACCTTT
GTAAATTCTCATCCAATATGAGAACGTATATTATACTCTATCATATTGCA
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TGAAACAATTATTTCAGCTCCTAGATAAACTTGATATTAAAACAATCAAG
AATCATAGAGGCAAACATGATACTTAAGATACTAACAATGGAATTGTTAC
TCTCGATTTAATACCAATTATTAAATTTCACGGAGTAAATAGAGTATTGC
TGAAAGTTTGCAATAGGACTTTAAACTTTAGATTGACACTCAACACAATA
CGATACCAGTTCGTAAAGTATATATCCAGTAATTTATAGTTCTATTATCT
CAATTACAACTATGCATAAGGTGGTGAACGAATGCCAATGACTACAATAA
ATTATGCAAATTCACTTTGATTTAATTTATGATAAATTGAGTTCTACTAA
TCCAAATTAGAAATGAACTCCCACTCAAAAACGACATCCCTCGTGCCTTT
TTTGGTGATTACATGAACCAAATCCACTACACCAAGTCCGATCATCACGT
AAGTCGGTGTAGCTTCAAAGGCGAGCATCCATATGGTCATCATATCAAAA
ACATATGAATCGTGCTTAACCTTTCGGTCCGTGTTCCGAGGCCATGTCTG
TACATGCCAGGCTCGACATGTAAGAACCTTAGTATTCGCGTGTGTAACTG
TCTTACACCCGAGATATGCTCGTGGATTCAAGTACACCCAATCATCACGT
GATGCCTTGAAGCAACAAAACATTGTCGGTGCATACTTAAGGAAGAACAC
ATTCTTATCTTGATATTTAAATGAGGGATCATCTTATTATGCTAATAAAA
CGCTAAAATAGCAATATAAGATGCAATCAAACATATCATGTTAATAAGTG
AAATGATATGGTTCCCGCATATGATCTCCATCATGTGCACCGTGGTATGA
TCTCTATCATACCTTTATGTGTAAGGCCAAGGTCTATGGAACTTACACGC
TATGTGTGTTGTAAGAGTATCATCTCATACTTCTACTTGCAATATCACCA
TATCATAACACTAGCCCAGCAACAATCTAAACTAGACGCCTCTAATTTGT
CCATTGCAAGTTTTACGTGGCTTAGGGCTTTCGAAGATAGAACCGTTCTT
ACCTACGAACATGAACCACAACGAGGATAACCAAATTGTTTACAACTCGT
TGCAAATTAGATATTGACTATAGTAGGAGAGACAGACACCCGCTAGCCAC
TTATGCAAAACTAGTTGCATGTCAAGCGTGGAACAGGTCTCATGTGCGAG
GACATGTAAAGTTTGTCCGGGCCGCTTCATCCCACTATGCCACCAATATC
CAAAGTACAACTAAGAAGCAATAAAATGATCATCATCGCCCACATACTCA
TATGTGTACTACCCGTGCAAAGCATCTACGCATAGATCCGGCTCTGATAC
CACTGTAGGGTTCGCAGCATAGAAAACAAAAATTTTCCTACGATGGGAAC
ATCTAAGTACCAAGATCTATCTACTAGATAGAAGCAACGGGTGGATATAC
ATCCATAGAATACATACCCTCGAAGACCGAATAGCGTTAACGAGGTTGTA
CTCGTGGATGATGTAGACGAACGCTTGCCGATCTCAAGATCGTGATGAAG
CTCATCTGGTCCAGCACGATCAAGTCTAGCACCTCAAAGGAGTGGTGCAT
CCGTGATCGCACACACGTACGGGTACCCCGACAACCTCCGCGCCCTCGCT
CCAGCGAAGCAGCGGAAGCAACAAATCCTTCCAGAAAAAGCCACCGGGAA
CATGTATCTCGCTGATCCTAGACCATGGGGAAATTTTAAAGGGGGGAGAG
AGATCCTTCGCGAGGAGGTGTGAGAGACAAGTGAGAGGAGGGGGTCCTTT
TATAGGGGAGGGGGGAAGCCCAAGGGGGCATGGCCGCCGGCCATGGAGGG
TGCCCCCACCTCTCCCTCATTCATGTGGTGGAAGCCCCACTCACATAAAA
ACCTCTCCACTCACAATTCCACTCACATGCATTAATTTTCCACCAAAATT
AATGCAAGCTCTCATTTAAATAAAACTATTTTATTTATTTATTCAGAATT
TTGTTAATTACTTTAATTAACAAACATTCACATAAAACCCCTTGCTAGTA
TTCATTTCACATGCAGAACCAGTTTCAGCAATTTCAACCGAAATAGTTCC
GGTGTCTAGTGAAATAAATTCCTGCGCTTTCCTTTTCTTTTTCTGGCATA
TCATTTGCGCCGAATGGTGTCGGCATCCCTTAAGTGTGTCACCCTACGGT
TCGCGAATAATGCGGACATGATCGAGACCCTTCTCCGATCAATAATCAGT
AGCGGGACCTGGAGATCCATATTGACTCCCACACATTCAACGATGACTTC
TGTGATCGTGTGAACCTTTTACGCTAGTATCTTAATCCCTTTGTTTCACG
ATATATTACATGTCCGAGATTCGATCATAGGTATCTCCATACCTAGTTTG
ATCTCGTTACCGACATGCACTCTTTTCTCGTTCCCGTGATATAACATTCT
AGTGATCAAATCACTTGCTTGCAAGCTAATCAATGTGATATCACCGAGAG
GGCCCAGAGCATATCTATCCGTCATAGGGATGAACAAATTCCACCCTTGA
TCCATGGGTCTCAACATAATACTTTAGTAGTTCTGAAGCCATCTTTATAA
TCACCCAGTTACAGTGTGACGTTTGATGTCATCGAGAAACTCTTCTGGTG
TTAGTGATTGACATGATCTCATGGTCTAAGGATTAGGATCACTTCGTAAG
TTGTTATAGAAATATAAACTCAATCACTTTGATCGTAATGCTATACTTCA
GATGAATGTTCATCACATCATTACACTAATGTTGTGACCTCGTTATTAAC
AATATCCAATGTCCATGATCAGGAAACTTTGATCATCATGTTAATCAACG
AGCTAGTTTATAAGAGAGGCATAACTAGAAACTTCCTTTTTATTTATTAA
ACACACATGTATTAACGTTTCCGTATTGATACAATTATAGCATGTAAAAT
AAACATTTATCATAAACAAGGAATACGATAATAACCACTTTATTATTGCC
TCTCGGGCATATTCCCTTCAAGAAGCTTGGCTGGGCAATGTAGCATCGGC
CTCGAATGGAGCGCTTATTGAAAAGCAGTGGTCATCGCTATGGTGGACGC
AGGTTCCGTCCAAGGTGAAGGTTTTCCTTTGGAGACTAGCCAAACAATCA
ATACCAACCAATGACGCAAGCAATCATCGAGGCATGACTGGCAATGACAT
GTGTCAGATGTGTGGGGCGCCGGACTCCTGGAAACACACTTTGATCGAAT
GCACGATGTCTCGTTGCGTTTGGTCATTGGTCGACGAGGAGGTCACGACA
AATATGATCGGATGCGAGGAAGGAGATACTTGGAAGTGGCTTGCAGTCAT
GACCGAGACACTGAAGCATGAGGACCAGACTATGGTCTTTGTGACCCTAT
GGACGATCTGGCATGCCCGAAGAAAAGCTTTACATGAGCAGATTTACCAA
AATCCGCTCTCCGTTCATCATTTTGTAGAAAACTTCATTGCTGATCTTAA
GAAGTGGGAGTGTAGGCGAATGGGAAGAAGACCACACCGACGTATGAGAG
TACGAAGATATGGACTCTACCTAGTGTAGGTGTCGTCAAGATCAATGTCG
ACGCAACCGTGAGCAAAAACATGGGCCATGGTTCGGTGGCAGTTGCCAGG
GATGAGCACGTCAAATTCAGGGGAGCGTCTACAAGGGTCTTCCAGGGAAA
GACGGATGTGGAAACGCTTGAAGCTGTGGCTGTCCGAGAAGAGGTGGATT
TGGCTATGGACATCGATGCTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.