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GrainGenes Sequence Report: AA028400

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Sequence
AA028400
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA028400
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGGAGGATCAATGAGGGGATAAAGAAGAAAGCTTTCACGATTCAGGTGGA
AGATGGAAAGCCTGGGAAGGATGGCCGGCGGGCGGTTGGGCCGGTATTCA
GGAACATACTGGCCAAGGATGGGTACCCCCCGCTCGACCCTGACATGAGA
ACCTCATGGGATGTTTTCAGGTAAAACACATGAAACAACAAAATGTTCAT
TTCTTTCTGTCCTTATACTACTTCCTTCGATCTATATTACTTGTTGTTGA
AATGGATATATCTAGCACTAAAATATATCTAGATAAATCCATTTATATGA
CAAGTAATATGCATCAGAGGGAGTATTACTATGAGAAAATAATGTGCGAC
GTCTGTTCCATGCCAGACGATTTCATCTTGTTGTCCCATACTAGGCGATG
TGTCATTTATTTTACTTCGACAAGGGTTAAAAAGAGCACTAGTCTGCTTT
TTGTTGTTCCAAGATGGTATTGAGGAGAACCTCATTTCTGATGTACCAAA
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TGTACCCCTTTATAATAATAAAGGGCATGATAGTCTAATTATACTTTTAT
AAAATAATATAAATAAAGGTCTGTGTGTTAGAACGAGTACGGAATGTACG
CCCCCCATATTCGGATAATCTACATATTTTACTTCACATCATATTGTACG
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CGCTCTCTTTGTTTAGGACTTAAAGCAGCGGGATCTCGGAGGCCTATTAT
CCCGGTTAGCGGTGCACGCCGTAAGACGAAATGGGGAAGATCTAGGTAGC
ACCGTGCTCTGAAACTGGAGGCGCAAAGGGATATGCGACGGTGTGTCTGA
GTGGAGGCGTGACCTCTGTGTCTGAAAGGAGGCGCGACCTCTCTCTCTTA
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CGGAAGTTGAAACGAACAGGTGGCAGCCAACCGAACAAACTCCACTCAGT
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TTTCAACTTATGTACAACTATTCATATACCATTCATGCGTAGAAAAATAA
ATCTCGGCTCGGCGAGACTCTCGCAACCCAAGGCGTGGCGTGGCAAGTTG
AGTGAGGAGGAGCGCGCGTGGATATGTCTTCTCTTCTCAAGCTCTTACAA
GTGATGGAAGAGATCTCCTTATAAGCTGGTCCAACTTCCACTTAACTAGC
AATGTGGAACTAAACTTTTTTCCGAGTTCTTGCCTTGCATGAATGTGCCA
AATGGGCCTTTAGGGTTTCAAAAATTTATTGGCATATAATAAATGGATTG
GGCCTATTTAGGAAAAAAATTCAACAATCCCCCACCAGATCCCAGAGGCA
TATAAAGTTTGCTTTTGGTTCCAAAACATTGTGTATATACCGGTACTACA
GTGGAGACTATTAAGTTGAACTTTTATCTATAGTTTTATGTTATGCTAGG
CTACAACTTGTACAGTGGACTATGCCTTGAACTATAAGTTTGCTGTGAAC
CTAGCTTCACACAAAGTCTTGACCGATACTAGGCGACCGTGGGACTTCCC
CGCAGGTGAAGTTTATGCGTCATACTCCATGGCCTTTCATGAGTTTATTA
GAGAGCACCATACTCTCATAGACTGGAACATTTAACAGTCAGACTCATAT
AGGTTTGTGCTTCAAAAGATGTTCTATAGGACAACATCACTGCTTAAGAT
AAGCCACTTAGAACACATTAAGATAATAAATCAACCTGTCGTGCAGAATA
GGAAAGTATTTCATCTTTATAGAGTGGTGTTTATTAAAGTAGAGATACTT
TCCTCTCAGCTAACCAATAGCTTGTCTCCCAATTCTAATTCACAGGATCT
CTGATCACATATAGTGGTTTACCACTGTGGAAAACTCATATTGTGGGTCT
CATACCCATCTTCTTATATGAATTTTCTATCACGTTGCGTGATAGACCCT
TTGTGAAGGGATATGCCAAGTTTTTAGATGTTTGGATATAATCCATTGCA
ATAACTCCAGAGTTTCTTATTTTTCTGACAGATTTCAGTATGCTCTTTAC
ATGTCTTCTTCACATAGTGAGATTGAAGCAACATAATCCCACCATCATCA
TCTCTCAATAGCTTGATGTTCATGATAACATCAGTTACTCCCAGATCCTT
CATATCAAAAGAATGAGATAAGAAATCCTTAACCCCCTTAATTGCGTTAA
GGTTGGTTCTGAAAATCAGTATGTCATCAATATACAAATAAAGTATGACA
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ACAAAGTCTGCAGCAGTTAAAGTTCTTTCAAACTTTTAATGTCACTGCTT
AGGGGCTTGTTTTAGGCCATATAAAGACTTCAACAACTTTCACACCTTTT
CTTCTTCACCATTTACCACAAAGCCATATGGCTGATCCATGTAAATTTTC
TCATACAACTCTCCATTTAAAAAAGTTGTCTTAATGTCCATTTGATATAC
GAGAAGACCATGAGAGGCAGCCAATGAGAGTAGTACTCTAATGGTGATCA
ATATGGCAACATGTGAGTAAGTGTCAAGATAAACTCTAGATAAAACATGA
ATATAATAATAGAAATTAAACTAATCATGTGAATTAGCGGATAGAAATTA
AGGCGAATATTCAAGAGGATTGCAAGGCATACAACTTGAGATAATATTAG
AGCAAGGTCTACAACAAACCAAAAGGAACGACATACTATCTGACTGAGAT
AGACAAGATTAAGGAAGAGGATGTACATCACAACAGAGGAACTGCCAGGG
TTGGTGTTGGCACCGTTGTTAGCCATGTCGTCGAGGAAGAGGTTCTTGAT
GTCGGGGAAGAAGTTGTCGTTAGGAAAGACATCGGCGATATCGCTATTCG
CTATCCGTGAAGGAGTCCATGATGAAGCCAGTAGTCGCGCCAATAGCGCT
CCCCAAAAACTTTATCGCCCTTCTCCCGTACAGGATTTTAAGCAGCGGGG
TCTCAGAGGCCTACTATCCCGACTAGCGGTGCACGCCGTAAGACGGGATA
GGGAAGATCTAGGTATCGCAGTGCTCTGGAATTAGAGGCGCAAAGGGATG
TGCGGCAGTGTGTCTGAGAGGAGGTGCGACCTCTCTCTCTTATATGCATG
GACGGAAGACAGACAGGCTGCGCAGGAGATAAAACGAAGAGGCGGAAGTT
GAGCGGCAGCCAACCGGACAGCCTTCACTCAGTTCGTATTCATTTTCACT
TAGCTCGTATTAAAAATCCTTGGCGAGATTTCTGCAACCTGTGGCGCGCG
CGTAGCGTGGCGAGCGAGGAGGATGAGCGTGCGTGTATATGTCTTCTCTT
CCCAAGCTCGTGCAAGTGGTGAAAGGGCTCTCCTTATAAGCTGGTCCAAC
TTGCACTCAACCAGCAATGTGGTACTAAACTTTTTTTCCAGCTCTTGCCT
TATATGAATAGACCAAATGAACCTTACAATTTCAAAAATTTATTGACATA
TAATAAAATGGTCTGGACTGGACTTATGTAGGCAAAAACTTACATGATCC
AACAGAGTCAGTATGTGGGATTTCCTATCAATTGATTAGGGGAAAATACC
ATTCTACCCTTTTAAATTTGGGGGAGGAGATATTCAGAAAAAAACTCATC
TTCTTCGACGAGTTTAACGGTACCCGGAAATGAATGTGGGTCATTCATTT
CCTCAAATCTAAAGGCTGTTCTTAGTTGGTACTCCAACATCAATATGATG
GAGTGCCATCTCAAAAAACCTTGGGAGTACTTTGAGTTTAGGGGTAAAAA
GGTAATCATATAGAGGATGTTTTATAGGGATGCACGAATAATTCTTTCCT
CACACCCAGTATCAGCTGCCCGCACTCAAACAACGAAGAGTTGGCTACGA
CTTGATCGAAGATTTATCAGATCGAATTTTTTATATGGGATTAGATTAGA
CCGAGTGGGAAAAGAGCCATCAGATCATTATTGAAGGCCTAGACGATTTG
ACTGCTACTCTAGCCTCCGCTTACGGAGTATCAAAGCACCCTGAAAGTCC
TTTATTCATATATAAAGGACAGGCATGTGATACTCCTCATCAAAAAACGG
ACGTGCACAAGTCATGTTTTGTTTCCGCTCAATGTTTACCCAGAAGAAGC
TGTGCGCTGAACCACTAGTGTTGAATGTTTACTCTAAAGCTCTTTTCGAC
CCTCCTTTTTTTTCTCAAACTTCTCTTCTTTAGAACTTTTTTGAAAGGTT
AGTTGTTGGATCCAAGAACAACATGACTATCTAGTTAATTATTTAGACTA
GATATTGTATCTAGACAAAGTTTAGTATATTAATATGCACCGAAGGGGGT
ATCATGTTATTAGCATTAATCTTCAAATAGTTCAAGAGTCGCAGCTTAGC
TAGCTCCTTCATAAAAACCTGCAAAGAGAAAAGATAAGGCATAAGATAGT
TGAGATTTAATCTAGTGTTGTTATTCAACATGTCATGCATGATAAACCAT
TTATTCTCTAGATTAAATGTATGGATAATGTTAGAGCATCTCTAACCCAT
CCACAAAAACCGGTAGAGGCGGCCGAAGCCGCACCTAATCGAAACACTAA
AACTGGTTAGAGGACTAAATATGCTAGACCTTCCCCAAAAATCTCCCACT
CCTATTATATTTTTGCTCAGCTGCCAAAGGAATGACTAAAATTTCCCCTC
TACTTTACTCATGCTGAGACGCCAAAGCTCCCACACAATCTCGCCGCCAG
TTGTCGCCGGCGCCACATTCTCCGTTCCCCTAGTCAGGAGGTCACTGGAG
CTCGGTTCCGCAGCCCCGGCGGACTCTCCCGCCGACAAGACACCACCAGA
ATCGACCTTGCGGCGCCTCCGATTTCGAAGAACCGGTTGGGCACCATCGG
CGTGGTGTGGACGGCGAGAGTAGCTGCCAAGACCACCAACAAGTCACCAG
CGACGGTGAGGAAGGTGGGATGGCCACAATTTGCGTCGGTGTTGAGCGGC
CCATGGGCGCGGAAGCTGAAGGATGCCATGATAGCTCATTTGGAGGCGGC
GGAGGAGAAGACGAATAGGAATGCCGTGGCATCCTCCACACCCAAGCCAT
CGACCATGACGGCTAATCGCAAGGATAAGCCGTTAGGGGCATCCTCAATG
CCCAAGCTGTCTGCATCCTCCTCGGCAATCTTCACAACTCGAGGCGTCGA
CCGTGAGGTGATCGATGAAATGCCCAAGACTCAAGCGTTGCGACCAAGCT
GATTGTCGCCGAATTCATGTCACAGCTTGATTCTTCACACAATCATGGGC
TCAACGACTGCAACTTTAGCGGCGACGAAGAGGTGGGAAATGAAGAAGTG
GCCAATGAAGAGTATGTGGCCGATAAAGAGGAGGCCACCGAGGATGTCAA
TGAGGAAGTCGTGACCGAGGTGGAGGCGCCAACACAAACCAAATCCATGG
GAAGGAAGGGCAAGAGGTCCGCAAACTATATCAAAGAGGAAGATGCAGTG
TTGTGCCATCCTTGGAGGAATGTCTCGCTTGATGCATCGGTTAGCGCAGA
TAAATCGAAGGAGAAGTTTTGGGGGAGAATTGAGGAACACTACCACAAGA
CGGTCACCATTCAATCATACCAAACCCAAGGCTCACCTGATCATCGTTAG
GGAACAATATTTGAGCATTGCAACTGATGGGCCGGGACCATTGACTACGT
GAACACTGCACCACCGAGTGGGGTGCCAATGACCGAGTATGTCCCTCTCC
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GCTTTGCACCATTACTACAAGGCAACACCAAAGAGGGCTAGGATTAGCCA
AACCATTGATGTCGATGAAGATGAGGATTAAGAACAAAATAAGAGGCCAG
AGGGTGCCAAGATAGCAAAAGAGAATAATAAGAGGGGAGATGTTGGCGCC
TACAAAGAAGAGTTCCATGCTATCATTTACACGAAGAAAGCACGGTTGGC
CGAACACGAAGAGGACAAGGAGGCTAGGTGGAATGAGCTCAAAGAATTTG
AGGAGGAGAAGTGGTGGTCCAAGTTGGCGGTGGGTCAAAGAAGGATTTCA
CTAGAAGAAGAAATAATATCGAAGGGAGAAGAAGATAGAAGAGCAATGGC
TTGCACTTGAGGTAGAGAAGTTGGCTAAGGAGAAAGAGGATGCCGACCAC
GCCATCATGTTTATGACCCCAAGCACCTTGGATGATAAAGCTATGGAATA
TTGGAGAGATTGCTTGTGCGAAGATCTTGGCCTGAGAGAGTGGTGGTGGT
GGTGATGTTGGTGGTGGCCGAGATGGTGGCGGCGTAGATGTTATGCTTTA
GGATAAAACTTGATCGATGTGATTTTTTTGGATAATACTTATGCATGTTT
GAATTATGTGTATTTGATATGGTTGATGGAGGTTCCAACATGATGCTAAA
CAAATTTATTCCTTTATTGGGGATCGGGGATCGGTTTCGGGGGCCACAGT
TTAGAGGGAAAAAAATATGCTCATGTATTATAGGGAGGCGTTTAGTCCTC
TGAGTTTTTTGGGATGGTTTAGAGATGCTCTTAGATTCATCTCTTTAACA
ACAAAATGGAAAACCAGCTGCATACAACATATCATAGTAGAAAAAAATCT
TTCATATCTCAGAATCTTTGATTTGATCTTGTTTTTTCTTATATCCTTGC
AGAACAGCGGCATGCAAGTATCCAAACAATCAAATGCTTGGATGGCGTCC
ACTTAAAGATGGAGTAGTTAGTCCTAAGCACAATGAAGCTTATGTATCTT
CTACATGTCTATTTTCTATTAGTTGGTTCTTCATGGGAACCTTCTCCATT
TTCATCTTCTAGCCAGGGCCCTTTTTATGGAAATCATACATGGAGGTCTA
TGAGGAGGTCCTGCAAACTGGCTCTGCACTGCAACATTTGGGGGTACAAC
TGGTAAGAACGAAAACTTATGCTAACTTTTTCTCTCCAGCTATATAAAAT
AGACCTGTTCAATAACTTTAATATTTCTAATTTCAAGAGAGCTTGTGAAA
TTCACATTTGGTAAAGAAAATGATGGTCCTATGCTTGATATATGACAGGG
CTCCACAGTTGGTATTTATGGAGCAAACTGCCCACAATGGGTGGTGGCAA
TGCAGGTAACCACCGGAAACCATCTAAATGATAATATCCTTAGACCAATA
AAAAATTGATAGTCACACAATTAACTTTGCAGGCTTGCAATGGTTACAAC
CTAGTATGTGTCCCACTGTATGACACTTTAGGTAAGCAGAAAAATTATAA
GGATCATCAGAAAATTTTCAGAATAACAAACATTTGAAACACGATATTGG
ATTTTGATCAGGAAAAATATACTATGTACCTATTGAAATTAGTAATTGTT
CCATGAGATTGCAGGTGCAGGAGCTGTTGATTACATTATTGGCCATGCTG
AGATTGATGTTGTCTTCATACAAGATAAGAAAATAAAAGAAGTAAATCAA
ATTTATTAGCATAATCCATTTTAAATCTTGTCTGAATTTGGATGTGATAG
TATTTCTTATTTCTAGATACTGTCCCCAAATTGCAAATCTGCGAAAAGGC
TAAAAGGTAAGTATTGTAAAGTTATTAGGTACAATCAAGTAGTCGGTATT
TTTATTCTCTAAAATTAAAATGGTTGCAGCATTGGTGGCATTCACTTCGG
CAAATAACGAACAAATAAAAGATGTCGAGCGGATTGGGATGAAAGTTTAC
TCCTGGAATGATTTCTTAAAAGTGGTGGGTAAAGACAATTTGAAATGTTC
ATTTACCATTCACACAGAAAATGGTCATAGCAATTTTGATAACATGTACA
TGTTGATCAAACCATCAGTTATGGAATTGTATTTCAGGGAAAGGACAAAC
AAGCTCAACCTTGTCCTCCACGACCAAATGATACATGCACCATCATGTAC
ACAAGTGGAACAAGTGGGCAACCCAAAGGTGTTATGCTGAGCCATGAGAG
CCATGGAAGCTTTGTAAAAGGAGTAGACCTCTTCATGGACCAGTTTGATG
ATAAGGTGACTCCTTTCTATCAAATAAAATGTTATGAATAAGGCTAATTC
TGATTGAATCGATGGTCATGTTTAAGAATAATCCAAGGAAATTCGCATGT
ATTGGGCATACAGATGTCAACAGAAGATGTGTTTCTTTCTTTTCTCCCAC
TTGCTCACATTATGGACCGCATGATCGAAGAGTATTTCTTTCACAAAGGA
GCCTCCGTTGGATATTACCATGGAGTAAGAAAATCAACATACCAGGCTTC
CATTTTTAATCATATTGTTGAACTGTGATCATTCTTTGTTTAATACGACC
ACAATATTTTATTTTATCAGGATTTGAATGCGTTGGGAGATGATATCATG
GAGTTAAAGCCAACCGTGCTAGCTGGGGTGCCTAGAGTATATGAAAAAAA
TTATGAAGGTGGTAAAATTGAAATATTGATAGTAAATAAGTATCCATATC
TTCTAACTCAGACAACTTATTATTATATATTGACTTTAGGTATTTTAAAG
GCCTTGGCAGATCTCAAACCCATCAGGAGAGTGATGTTCCATGCACTGTA
TAACCGGTAAGTCGCTTACCATCATGAATAATGTCATGCCGCAACCAAAT
CATGTCAGCTCACCATAGATTTTGCAATTCAGCAAATTAGCAAGCATGAA
AGCAGGCTACACACACAAAACTGCTTCACCTGTTTCAGACATGCTGGCTT
TTCGCAAGGTATTGTGTTCATAACTAAGAACGAAAATCTAGAGATAAATT
AGTTTCATCAAAATAGTGAAGAACAGTACAAACTTGTACCCGCAAGTCAT
GAGTTCTATATCTGATTTTATTGTTTCATTTGCTTTCTCTAGGTCAAGGC
AAGGTTGGGCGGTCGTATTCGCCTACTTATCTCAGGTGGTGCACCATTAA
GTACTGAAATAGAAGAGTTCTTGAGAGTGACCAGCTGTGCACACTTTGTG
CAAGGCTATGGTAATGCATGTAGACCTTTTCCATTATTGTTCAAGTTTCC
TCTTGGAGACTGCTATCATCACAAAATTTAACTACTCTGTAGCATCAACA
AAGAGTTGACAAGGCAAACAAATCATACATATAACATACCACCAAACTCG
GTGTCTAAAATTTCCGTTCAAGAATAAGTTCAAGTTCTATTTTTTTCGAA
ATGGGGAGCGTAGCCCCGGCCTCTGCATCAATCGATGCACACAACCAACC
TTTTATTGCATAGTTCTTAAGAACTATTCGGAACTAGAATTAATTGACAT
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GGCTCCATGTTAACCTTGCTATGTCCTACCCCATAAGTATTTTCATTTCA
GATCTACACTAATTTTAGGAGTATTTCAAGCCAACTTATTGTGTTAAGCT
ATTTAAGTGTACTACACAATATTGTTTGCAACAAGGAAAAGTATGCTGGA
ATCTATTTTCCTATTTTACGAATATAATAACAAGCCACATAAATTTCTTT
CTATGTATGAAGTTCCAATAGTGTATTGTTTAGTTATCAGTCTCTCTGCC
AATTAAAAGGGGCCGGTGTAAGTTACATTTTGTTGAGTTTTTTCAGGTTT
AACAGAAACACTGGGAGCTACCACAAGCTGTTACCCGGATGACATGTCCC
TCGTTGGAACTGTCGGTGTTGCCGGCACCTACACTGAACTGTGTTTGGAA
GAAGTACCTGAGATGGGTTATGATCCACTCGGTGTTCCTTCTCAGGGTGA
AATCCTTATCCGAGGGAACAATGTCTTCACTGGGTACTACAAAAATTCTG
AGCTCACAAATGAAGTCATGGTTGATGGATGGTTTCACACAGGTGAAGAA
TCACATTTTAACTAAAACAGGGGATCAAGGTAAAGTTTCACATATCATGT
TCTGACATACTATTGTTTTTCAGGAGACATTGGAGAGATGACCACAGATG
GAATCCTGAAGGTAATTGACCGAAAGAAGAACATATTCAAGTTGTCACAT
GGGGAGTATGTCGCTGTTGAGTATCTGGAGAAAGTATATGCCTTCCTTCA
AATTATTGAAGATGTAAGGAAAATTCCAGTGAATCATAATCTTATATTAA
GAAAATGAATAGCCCTGCATTCAACTAATACGGTATTTTTTAGATTTGGG
TGTACGGGGACAGCTACAGATCAATGTTAGTTGCAGTAGTTAATCCACAT
GAAGAAAACACCATGAAGTGGGCAGAGTCAAGTGGATACAAAGGTTCTTT
CGATGAAATATGCAAATTGGAAAGATTTGAAGAATATATCCTTAAACATC
TCGCAACGGCTGCACTGAAGAACCAGGTAAGGTCATTTATTAACTTCCTA
GTTGCTGAAAATACCACATGGTTAATCATGTCACCCATCAAATTATCCTG
ACATGTTTTCACTGCATGTGCCATTAGAATATTATAGTATGAAACTTGAA
AGTTTCTGTATAGTATAGACTCCTTGATTTTTACTCGACACTACATCTCT
AAGCGTCGTATATGGTAACCCTCTTTTTGCTCAGCTAAGGGGTTTCGAGC
ACGTCAAGGGTTTAGTGTTGGATCCTGTACCTTTTGACATCCAAAGAAAT
TTGGTCACTGCAACAATGAAGAAGAGAAGAAACTCCATGCTAAAATATTA
CCAGGTAATAACTTTTGAACTGCTGAAGTGTAATATTTGTTGTTGTTTCT
AGTTGGTAGGTTGAGAGACAGTGTATGAGCATTTGGTACAATCGAATCAA
GAAAATTTCGGAATATTATGTACAAAATCACTATCGATCAATGAAGATCT
AACTCGTAGCATATTAAAGTGGACCTAGCTAGTGAAGCCTAATGTCCTAC
GTCTGACTCCTATTGTCTTCATATACTATCTTTTCCCGTAATTGTCCTCT
GTTTCTTCATCTGAGTATTTAAATTCCTTCTCCTTCATGTGCAGCCTCAG
ATTGACAAAGTATACAAAAAATTGGAGGATCAGAGGGCTGCCAACAAACA
C

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.