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GrainGenes Sequence Report: AA019366

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Sequence
AA019366
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019366
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTTTTTGACACACACCAAACAAACACTCCACAGCGCCCCCCGAGCCCCG
AGGTTCTTCTCCCCACCCCTCAAAACCACCAGATTCGCCGCCGCCTATTC
GACTCTCCGCCATTTTACCTCCACCGTCCAATCCTCCATCCAGTCGAACT
CCGTCGCAGCAGCAGGGACCCCGATGGCAAGTAACACTGGCGGCAGCGGG
AGCGGTGGTGGCCGTCGTTCCCGGGGGCTAGAGTTCGGGACCGTGGATCA
AGCGGAGCAGCGCGGGGCGGTCAAGAGGGCTAGGGTTTCGGCCGGTGCTT
CGCGCTCGGGTGGTATGCCATCGTGACACCCATGTGCTTGCTTTCCCTCG
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CAATCTTTTGTAAAATTAGGTAGTTGTGCATAGCTAATGTACTGAGACTG
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AGAGCATAATTGAAAGGAGTGATAGCATTATATAGTATACTCAATGTATC
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TAGCGACGACCAGACCAAAACCAAACAACTATGCTACAGGAACATCTACT
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TTTTTCTTGCACATGTGAGGTTTGAGGAATATCCTTATGATACATTTCCT
CAATATTTACCTGTTAAGTAACTCATTTTACCTCTGAATTAGTTTGCATA
CTCTCCTGAAAGCAACGCAATCAGGACTAAGACTGACTGTATTGATGCTG
GTATGACTGCAACGTAGCACTATATTGGTTCTTGAAACATCTTTTCAATG
TTGAAAACTGACCAATTGTGCTGGAAATTGACCTAATGATATTCCATAGC
TTGGACCTATGTAAGAGATTTAATTGCTTAGAAGATGGAAACAAAAATGC
ATAGGTAATAGGTTGACGCCAACATGGCTTCGAAAACATTGGATATCTTT
ATATTGCATATCTATACCAATGTAAGCGGCGCGGACATGGGATAGCCGTC
TCCCGTCTATTCCGTCCGTCGGGACTAAACAAGATTAGCGTGACTTTAGT
AAGTGGGACCCCTCAAATTGACCTGTCGATACTGCTCGGGCTGGTGTCCT
AGAGTCTGTCAGCAGCATGATTAACGCATTCATCCGCACGTCCTAGAGTA
CCTGTATGCTGGGGAGGGGTACATGCAGGAATCAGTGGCGGACCCAGGAA
AAAAATTGAGGGTGTGCATACTCCTAATTTTTTTCGCTCACTAGCATATG
TGCGATACACATATGCCAAATAAATAATATACGCAGCTAATTGAATAATG
TCCATGGCTATAATTGCATAGTTGTCATCACCAAGTTCTTCAATGATTAG
TCTAGTAGTTTGTTTTGCACAACATTCAATAATATATTGTTGTATCTTAG
GACTATTCAAGATGTAATTTCCAGGAGCATTTTTGAAAACAACCTTATTA
ACTTCATCATTTGCGGCGACCCATTTAGAAGCTTAATAAAGTTTCCATAT
TGCTTGAATCTCCACTCATCATGTCCATGGAATGCCAATCATTGAATCAA
GGATTGGCATTTCTTTTTTATCTCAAAAAAGTGCCAATCCTTGATTCAAA
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TTGATCATTCTTAGAAACCTTCACAATAACAAATATAGGGATAAATTTGA
GAGAATTTCGCATCAAGGGGGCTGAAGAAGTTGCAATCATGATTCCGAAA
AAAAGACACAATGTAACTGGCACTCTTTCTCTTCATAATCAACCTTGCCC
ATACATTTACAAAAAAGAATAGGGATAAATTTGAGGGAATTTTGCAAATA
TACAGAGGGCTATAGGCTACATCTAGCCACAACAAGCGGGCAGGGCGTCA
AGTGGTCAAGGCGCAGATTGGGGAGGATTTCGTGGGCACACTCCCTCTTC
TCTAGCTCAAATTCGTGGGAATAATTAAAGATAGGTTGGGGATTTTTACC
TGCTCCGACTGGATGTTACTATTCAATCCAGTTCGATTTGGCCGAGCAAC
GAGCAGAGCAACGGGTGAGCACCGAGCGACCGATGACGGGATGTCGGCGA
GGGCATCCAAGACTGCAGCTTGTAGGGGGAGGTGGGCGAGGGAATGTCGG
GACGGTGTGTGCGGGTGGTGCCGGTGGGAACTGAAGCTGGAGGCTGAATT
GGGGATTGATCGACAAATGAACTTCCTAGTTTGCTCACTCGGGTCATTGT
TTTCCTCGCTACATTTTTTCTTGGTTGGCTAGTAGTATTGGGCCTATATT
TTGCAGACGTGGTAGTAGTAGGTAAAAAACAATCTTTAAAATTTCTGGGT
GTGCCACGGCACACCCGGCACACCCGCTGGGTCCGCCCAGGATTAGCCGG
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CCACCAACACAAAGTGGAATCCCACAAACGGAAATAAACAGGCTTTGCTG
GCGGACGGGAGGCAGGCTTGGTGGAAGGCCTGTCCCACTTACATCGTTAT
ATACCTATTGATCAAACTGTTTTTGTGTGTGATATCTCAATGTACCTGTG
TACAACCCTTCCATATCTTTATTATATATTATACTTTAGAATTTTAGGTA
TCTTAATTTTGTACAACCTTGCTCCAGTGTGAACAGAATTATTGCTATTT
CAAAGGAACTTGATGCTCTCCCCAATTCATTATGATGTCCTTCTCTTCTC
TTTTCCTTTCTGCATGAGCATTAGCTGTCTATATTTGCATACTCCAAGCT
TCTAATCCTAGACTAACACAACTATATGTATGCTCAACAGTGAGTTCAAG
TGGAAATGATAGAGAGCGGACAATGTTCCGTTCCGTGTTGACAAGATATT
TGATGGGAATATCAATGGGTTATGTTGAACAGGAACTTCTGACTGAGGCT
GTACGCAGTGAAATAGTGCACAGGGTAGTTGAGAAGATTATTGGTCATCA
CCAAGAGCAAATTCCAGAAACTGAAAATTCGATGGAACAGTATATACGTC
AGAATCAACAGAAAATCAAGGAGTGTCTGAAGGTACATATTTTACAACTT
CTAGGTCACAGGCACATGCAGAAAATAACCATTGCTGTTGTATCTGCCTT
CTGTTACAGGGATATGTGGAAATGTTTTGGTAGGGTTCTTGGGGTTCAAG
TCTTCCTGTCATGGCTTGACGTGTTCGAGTGCAACATTAAATGAATGGTA
TTGAAATGGTAAGCTCCTTGTGAGATGTAATGCCATGACTGTGCTATAAG
CAGGGATTAGTAGATATTCATTTTTGGATATCTGCATGCTATCTGGATTT
CTGTGGTTCCGTGTCTATGTTCGGTTGGAGTTTTTGAAAATAAAGGCTGT
GGACTGTGAATTGGTGATAATGTGGCAGAACCATGGAATAATCTTGCTCA
AGCCATCAGATTTGATTAATATTCTATTACAACTTTATTAGAAATTTCTT
TGCAAAATAAGTGTTTTTTGTAAGCTCAAAGTATTCCTCTGTGAGATGAA
AACAGTTAACACCCTAAGGTATGGCAACAATGTGATTATCAACAGACTAG
ATGTTTTGGACTTGCGATGGTGGCAATTGTATAGAAGAATAAGACGTGGA
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GGACTAACGCGAGGCAGGAGAAATCCCTGCTGAGGCTGAGTAAGAATAGG
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TAGTCTGGGTCTATTATGGAGTTTGTCTCATGGTTCAGTTGGTTATGTTT
GAGTACCCAGTGCTATGAAAGCATGTCGAAATTGCATCTATGGTCCTCAA
CCTATAAGTAATCACTTGCCAAGTTCTCTTTCTGACCCCATAGTTCTCTA
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TTCCCTAATGCCAATCCTTTTTCATGTCATTGGCGTCTGTCCTTTCTATG
GTGTGCTTAGCGAACATTTCTGTATCGGCATCTACATTCCATTTTTTTTA
TAGCACACAGGAGATTTGTGTGTTTGAGGTAACAAAGTGGTATGTCTCTT
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GCTGTCGCCCATTTCCTCTCATTCTCAGTGTCGGAGACAGCTGCCACCGC
GGTGGGGCCCCTCCTCATTTGCCCTGTCTTGTTGGTTTCCCTTCCTCTCA
TTGCTCTTGTGCGATCTGTAGGGTTGGTAGGTGCAGCGTTGTTGCAGGCG
ACAATGGGTTTGAGATGGAGTGGCATTCTCGGTCATCGGGGCTACTTGGC
CGAGACCAGTTCCTAGTATTTTTTTGGTGGCACCTAGGAACTTGGCATGC
GGATGCGATCTAGCCTTCATTTGTTGGCTCTGGCGACAAGGATATTGTGG
TGTTTTCAGCACCAATCCATGCACTCCAGGTTGGAAAACTCTTGACCTCG
CCTTCATTGGTCGAATCAGTCAGCGATGATGTCTGTTCGTCCTTACCTTT
CTGAAGGTGTTTCCTCCGGTGTTACCAATGTGGTCTTCACTGGTTAGATC
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GCATTGTCTTGGAAGACGGTCATCTTCTCCACCAAGAAAATGCCCTATCT
CTAGCCTTCACAGTTTGGTCCTGGCCTCAATCCTTGGTAGCACTGTTGGT
GCTTAAACTTTCCATTCTCCGTGTTGTTACGGTTGGTTCCCCACAGAATA
TGGCGACATTTTGACAATACTTCCTCTGTTTGGGATTATAAGGTCAGAGA
GCTTTTTAAAATTGTTTGAGATTATAAGTCCTATATCATTTATTATCCCC
TCTCACCAATGCATGTCTTTTCTTTTCCTTCTGTTCTCTCATGCATGTGA
AGCTATTGGTGCATGTAGTAATTAAATTTCTTGGTCCTATCAACCAGTGG
CGGACCTAGAACAAAAATTACCGGGTGTCACTGTATCAGTCGAATATATT
TTTCATCTAGATTTAGGGGTGTCACACACTACAAATGCTCAAAACTTAGT
GAAGAAATCAATTTTTTAACGGTGTCCTGTGACCCCCGGTTGCATAACGT
GGGTACGCCCCTGCTATCAACTTGGCTCTCTGGCCTTATAATCCCAAACA
GAGGGATTATAAACCTATTTGTGCATGTAGTAATTCCATTTCTTCAATTG
TAAACCTATTTGTTCAGCTTTGGTGCCACTAGCATCATTTGGAACAAAAT
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TGTTAATACGTCGAGAAAAAGAAAAAAAGTGAAATATTCGATGAATTGCC
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GAGAAGATGACAAAAGTAAGACAACTAGACAATTTAAAGCATGAACAAAC
ACGCTAACTTTATGGGGGAAGTAAAGTGAATCCATTAGTCTTAGAAGCAT
TCCCACAGCATATACCAACAAAAAACATACGATTTTTTACTTGTTAAAAT
TGACAAGTAATTTTCTAAATGGATGCTATGGAAAGTATATGGAAGCAGAA
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ATTAATAGGGCATTTAATGAAAATATTCTGGAAAAGACAAAAATGGTAAG
TATTTGTGACGAAAACCAATCCTTGGCATGTATTAGCCTTATCTCTGCAT
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GGCTAATAGCTGGGAGTTAGTTAAGTTGACTTTATCTTAAAAGAGGAAGT
TGTGTGGTATTTGCCATTGTTTGCTGGCCTGCCAAAGGCTAGAAAAAGGT
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TGTTGGAGAACCGTTATCCTCGTTTCTTCTCTAGCCATTTCCTCCATGGG
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CTACAAGATGGGTTGATTGAACTACACTAAGTAATCACATGGTGTATACC
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TATTTTGCATCGCTAATATAGCATCGTAATTATTAGATGTTAATTTCATT
ATATCTTTTCGGCTGCATAACAAGGGAATAAGATATATTATGCCGTTTCT
AAGCTCTTAGATTGAATTCTTTCAGTAAACATAGATTCATTGGAATGATT
AATGTTGCTTCAGGTTCCACGTTGTAACCATCCTATTTCTTTTGCCGTGC
AGTACCTGCTGACCAGGAGAATAATGACGTTCGTTTTCACTTGGTGAACT
TAAAGTAGCAGGTATTTACACCTCTCGGTTATTTATTATATTATTTGGAT
GATTCACTGTATCTGCATTACTGTAGAGGTGTACCAGTCCAACCTTTTTT
ATTCTTCGGTCCCGCATTGGAAAAGTATTAATGAACGTTTAATTCTAATT
AATATTGTAGCAACTAGTAATTGTTGTTTTTACTATTCAAGAACGTTCAT
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GAGCCTGTAATGCTCCTCTCACTCTGGTCCTTGACTGGGTTGGATCCCCT
TAAAATCAACAGACTGGGTAGGAATGAGTTGGTATTGATCCAGAGTTCTC
TGGCCTGTCAAAATCAACGAAAGAGTTTTATTACTCTTGATGTATAACAT
TACAAATTAGTATGTAGAACAGCATTTCATGTTCATTCTTCTAGAATGCA
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TGTGAGATTGAGAATATTGTATGCTACAACTTCTTTTTAAAAATATAATC
TTATTTATCAATGTTTTCCTCTGGTTTGTGAAGTTATTCTGAACATAATA
GTTAGTGAGTATACTGAGGTGAGAGATCATGTCTCTGTTTCTTGTCAGCA
TACATGTGTATCATGTCTCTGTTTCTTGTCAGCAGACATGTGTCCTATTT
GAGTGTCTCTCCAGCTTGTCAAGATATTTTTTCATGTTCAGCAGTTTTTA
TCCGTTGGCAGTGGATTGTTAGGTCGTCCTTCAAGGGCAGTTCTTAATCA
TACTTACATCAAATAAGATCACCAGATCCTTGAAAGAAAAGCTACCAATG
AAGGCTTGACTAGCAAATAGCCCTTCAGTGAAGGTGAATGAACTGGCAGC
AGGTTGCCACTAATTTCCTTTATATTTTGACTGAAACAAATGCATATCGT
TTAAGTCATTTTTTGGCACATTACAGTGTGATCATACTTGCATGGGCACA
TGAATTAGTCTACTCTGGTTTGAAGACCAGATGCTTCTTATGTAGTGTTG
CCAGCATAATAATGATGATGCTGTCAGTATGGTGGCCAGGAAACCTGGTG
TTAACATTGTTCTAAGTTCTAAAAGGTACTTTTTCACTGGCATACTGGTG
GTAGTATGAGGGCTTCCACACAAAAGTACATTGGCTATTTTAGACCTCAA
ACACTAGGCTACCTGGCGGCAAGCAGTACCAGAGAATACCTAGTTACATT
GATCATGTGCCTGAGATGTATGATCATTGTCCTTTTTTTCATAAAGGAAA
ATCAGTATGATCATTGTCTGTCTCATTCAGGTTGAGGAAACTTCAGGAGC
GGCCAAGTTTTCCAAGTAACCAGTACATTGTTTTCCTCCACCATCACCTA
TTAGTGACCTATTAGTATATGACTTTCATGATGATTACTCTTGCACAATG
TTATTGCTGCCAACATGTTTTTTTCCAAGTGTATAACTGCAAAATGTATA
ATGTGTCTGGTCTCTACACAGCATTTGGAAATGCAAGGTAACTTTATCCG
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GATGAACACTTCTGTCTTGTATGTACATTTGCATGGGTGGTTTGGTTCAT
TTCGCTTATGGGTACTTATGCCTTCCTGATCTACCTGCCCCCCCCCCCCC
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TCGGGTTCTTTTGGAAGGGTGAGTAATGACCAAAAGACCATAACTTACAA
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CTATCACAAAAACTTGTCTAGATACATCCAAATTGAAGTCAACTAATATG
GGTCGGAGGGAGTATTATATATTTTGTTCTGCAGAAGTGTGGCATTGCAG
GTACCTGAAGAGCAGTATGAACGCCGTTGTTAGTGACTTGGACTTCGGAC
ATTAAATGAAGCCTATTGATCGTTGGTTAGTACTCGAGCTTGCTGCAGGC
CGCCTCCTCAGATGAGCTATGATTCATGTATGCTCCCTGGATAACATGAA
ACTGCAGGCACCTACAAACTCAGATCTATTTCACATTGCTGCTTGTGTTA
ATCTTCTCTTTGTTCTTTTTCTCAAAAAAGACCACAAAAATCCTTATACT
GAAGCTGTAGCTTGTCTTTCTTGCAGTTCATTTCTCTGGCAATAAGTGTT
AAGCAACTAGAAGCACTGACTTGGGACAAAATATTCATGCCAGGATCTGT
TTTTTCTACTCCCTCCGTCCAGAAATAAATGACTTCCATGTGTATAGATA
CATACAAATCTAGACATTGCTGAGATTCAAAAGTGATGGAGTATGTTGAA
CAAGAGGTACTCCGTACAAGAATCATTAGTTTAAGGTTGACATAGTTTGA
ATAGCAGATGTATACTCTTGTTTGTACCTTGATTTTGTCGATTTTTTTAT
GTTTGCCTTGATTATCATGAGCTACAAATGGGTCTTCTTGTCCTTATTTC
TCTGAAGTATGCGTATATTTCGGCTATTAATGAACCAAAATATTCATGCC
AGGGTCTGTTCTTTCTACTCCCTCTGAAGTATGCATGATGCCCACTCAGT
GCATTTTGATCAACATGCACTGAAAGCCCATCTGGATTCGCATGCTGTTT
GAAACCTGATAGAAGTCAATTTTATCTTCTGAAGTTTCTTTCGACTACTA
GTTTTTCTCACATATTACCTGACAAATGTTTGCGGCTTGGTGATTATCAT
CATTGTTACTTGGAGCCTTTGGATAGCGAGGAAAGATTTCACAAGCTTGT
GGAGCTGGCCATTGTTTGTCCATAGAGAGGATGTTTGTTTTTTGTCTTTG
CGTGGAAGAACCAAGAGAAAGTTGGAAATATGACCACATATGATTTTTTC
TTCTCGTTCTTTCTGTACATATATGTATCTGCCAATGAAACGACAACTGT
AATATAAATTGTGCTGTTGTTTTCATCAAAGACAGGCTCTCGCGTCAAGT
GCCCACTGTTTGCTAGCATCATCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.