Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046183

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046183
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046183
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGAACCAGCGATGCCGTGCACCCTCCTCGATGCGAATCAGCTATGCA
CACCGTGGCGGTACGCGCCTTCGCGAGGGGCAGCTGGCCGAAGCGGATGA
AGAAGCGGGAGCATCGAGGACACGGTCCTGCCAAGGCGAGATGGCGACTG
CCGATAGAGATGCGCTGGCGCACACGTTGCCTCACCTGTGCGCATGACTC
GGCCTCTCTCGCGCTCAAACGGATGTGGCTAGCTACATGGTTCCTACAGG
TTTACTATGTTTTCATAAGAGGAGCACACCTAAGCTCATGCCACGATGTC
GATATTAAATCGGTGAACAGGGATATCATATTCACGTGCATACAACCCCC
CATCTTTGGTTTTGAACATATTTGAGGACGGGGAGCTAGCTAGCTAGTAT
GTATCGGCCGCATCGGTTCATCTCTGGGCTACCATTGGCAACAGGGGATC
CGAAGGCACACCGATGAACAACTCCACGGGCAGCAGATGTTGTCCACCAT
GAGGAAGAAATTGATGGGGAAAACGATGACGAGCGTGAGGATCAAGCACG
CGGGCCTCATCTCAGAGCCGGCTCCCTCGGCGCGAGGTGTGCCGTCGTGC
TCAGCCTGTTGTTGTGCACACGCGATGCGAGGAGTATATTGATTTGGACA
GAGAGGAGAAGGAAAATTGGGAAAGAAACTTTTTACAAGTGGGGTCCACA
TATCAGTGAGAGTAGCTTTCGGCCGGGATTTTTGCTTTCCGGTGCATCAA
ACAGCCACAGAGTTTGATTTAGACCGGGATCGAATACTTCAAGATACGAT
TAAGGGTCTAAACTGGCAAAACTCTACGAGTTTAGGATTTAGATAGACTT
TTTATGGCCTGTTTGGTTGGGCTTAAATCTAGCTTTTAGAGTTTGGCTTA
TAAGCCACAAAAGCACCAAAATAGGTGCTTTCGATTTTGGTTTTTGGCTT
TTAACTGAACATAGTTGTATGATGGTATAAGCTAAAATCCAAAATAAAAA
GCACCTATTTAGGTGCTTTTGTGGCTTATAAGCCAAAAATAAAAAGCCAT
AAATAAGCACAACCAAACAGCCCTTTTTGGCAGCTGGGGTGTGCACCCCG
ATCATTGCTCCTCTAGCTCGTCACTGGCGGTGCCTGCGGTGAGTGACGTA
ACGCAGCCGACTCCTCTTATCTCTTTCTCGTCTCCCCTCTGTATAAACAC
CATATCTTCTTTCTCATAAAGCCTCCCGGACCCGAGTTTTCTCCCCCTCT
CATAGGGTTTGCCCCGCCCCGTACGCAAGGTATCAGATCGCCCAACCCAC
CCTCTCTTCCTCTCTACTCTAATTTGTGTGTCCTCATTGGCATCTTTCTC
GCGAGTTCCACCTGGAATTTTCTCCATATCTGCGGTTTCTCCCATCCGTA
ATCCTTACAGCCTATTGTCCCGTGGCGTGCTCTGGTGATTCGAATTCGAA
GCCGGTGTGTTTCCGCAGTAGATATTCTGTTGGTTCCTCTCCTTTCCCCC
AATTTTTTTTTGGGATATTTTTCGCACTGCACCGATTATTTTCGTTATTG
CTCTATATACCTCATCTGTGATGCTATGGCGACCTACTTCCCTTCTGATT
GAGATTCGATTGATTATTGCCCCCTTCGTCCGGGCCGTTTTTAGTCTTCC
TAGTAGGGTCTGGGGATGACATTTTCTCATGGGATTTGATGTGCCTCGTT
ATCCTTAGTGCTTGTATAACAATAAGCTGAATTGATATCAATGGAAGAAA
CTGTGGATGCTCTTTTTTGTATGCAATGCTGCTGCTTCAGTTTTGGCTTA
GTTGAGTGTGGATGTGATAGATATCAAACTTTCTCGGCCTACAGTGTGCT
GTCTACTTGCGGCTATTCCAAAACATTGTCTATCTTAGCTGCACCCATGA
TCCATTCTGTTATCTTATTTATGCTTACCATTTTCAGCACTATATTCTCA
GGTCTTGGTAGAAGGGTGGCTTGGGGTTTCCTGTAGATATACAGACATGG
AGGGGGCTCTGGTTCAGTCAGCAATTGTTCCTACCACATATAGCAGCTGT
GCTCAGGTCCGTGGGCAGGCCAGGGCGACAGCAGTACACAGTATGAGGAC
ACAGACCATGACCCTTGGAGGCTTTCAAGGACTCCGGAGGGCAAACTTTC
TGGATACAAAATCTGTGGTTAGGCGTGATTTTGGCTCTATTGTGGCAAGT
CAGCTTGCACGTCCTACAGGAAAGGGGTCTAGGATGGTTGTCCGTGCCAT
GTTTGAGCGCTTCACAGAGAAGGCAATCAAGGTGATTATGCTTGCTCAAG
AGGAAGCGAGACGTCTAGGCCACAATTTCGTCGGAACAGAGCAGATCCTG
CTTGGACTTATTGGTGAGGGCACAGGCATTGCAGCTAAGGTTCTGAAGTC
GATGGGCATCAATCTTAAAGATGCTCGTATAGAAGTTGAGAAGATAATTG
GCCGAGGCAGTGGATTTGTGGCTGTTGAGATTCCTTTTACACCTCGCGCA
AAGCGTGTACTCGAGCTGTCGCTTGAAGAAGCTCGTCAGCTTGGTATTGA
CCTCTTATTGCCCATGTGTTATTTTTCGTGCTTTATTTGAACACTGCAAG
TTGTCTGATTCTCTTCACTGTTTCATTTGTAACTATGTTACTCTTTATGG
TGTTTTTTTTTGCAATCCTATCACTTCAACTACATTTAATATCACCATTG
ACCAAAACATGTTGTTCTCTGTCCACATGAAACTCCTCTTTGTGGTAAGG
ACATACTAAATCTGTTCAATAATAAAAGAAGTTTTGGTAGGCTAAAGTAC
CCTACCAAAACATCTTATATTGTGCAACCAGGGTAGTACTTTGGAAAAGT
CGTCAGAAATGACTAGTTCAGAATCACATACTATAGTAAAAAGGTTATGC
ATTTCAAATGGCTCGTATTTTTATAGGTTGAGACGAGATGTCAGCCTAGT
TTAAGTCATTTTAAAGCTAGGGTTGAAGCTCGCTATATGTTCTACTTTAA
TATATTGCCACGGCGTGTCCATGTCGGAGATATTTGATCATTTTCCCCAC
TTTACTCTGAAATTTGATCATTTGCCACATTGGCCACCACATGTTAGTGA
CACACGGTGTGGCAAATGATCAAATTGCAAAATAAAACGGGGCAAATCAT
CAAATCCCCCGTCCATGTCGTTGCATTTGCATGTATATGGACAGAAGATG
CGAATACAGTGAGAACCAACAATAGACATACATATGCCGTGTTATGTGCT
AGTTATCCATAATAATGTTCGAGTGGTAACTGCTAACCATGGTTCTTCAA
TGTTCAGGGCATAATTACATAGGATCTGAACACTTGCTCCTAGGCCTGCT
TCGCGAAGGTGAAGGTGTGGCTGCCCGAGTGCTAGAAAGCCTCGGTGCTG
ATCCAAACAACATCCGTACACAGGCAATCCTCTTACCTTTGCCTTCCAGT
TCAGACGTTAACTTAGTGCAAAAAAGATGGACTGTGTTGTAATTTTCTTT
TTCTTGGAGGTCCTTTCTGTAAAAATGTACCCACTGCCGTTTTAATGCAG
ACTCCAGGCCCTTCGGGTCCTTTCCTATTAAAAAAATTGCACTATGAAGG
ACATAATATGACTTTGCTACGCAGGTCATAAGAATGGTTGGTGAAAGCAC
AGAAGCTGTTGGTGCTGGTGTTGGTGGTGGAAGCAGCGGTCAGAAAATGC
CTACACTTGAGGAATATGGCACTAATTTGACAAAGCTAGCTGAAGAGGTA
ATTTTTATTTCTCATTGCTGCACTTCTTTGCTACATTAGATTTGATGTGA
ATCTGTTCTTTTTTTGCAGGGTAAACTAGATCCAGTTGTTGGCAGACAAG
CCCAAATTGAGCGTGTCACCCAAATATTAGGCAGGCGAACAAAGAACAAC
CCTTGCCTAATTGGAGAGCCAGGTGTTGGCAAAACTGCTATTGCAGAGGG
GCTTGCACAGCGTATTACCAATGGGGATGTTCCAGAAACGATTGAAGGAA
AAAAGGTAGTGTAAAAAACCATTGATTTTCTTATTGTTTTTTCTTCTGCT
GTCTGCATAAGCTGGACTGCTCAAATCATTGTGCTCGTTACCTGATAGGT
GTTCTCACGGTTCGGATGGGTGATGATACATTAATACATGTATTCCAAAT
TTCCCAGGGTATAAATCTTAGTGGATGTCCCAAGAAATTGACACTTTGTT
GTCTTGACTACTTAGGTTATTACACTTGATATGGGGCTCCTTGTTGCTGG
TACTAAATATCGTGGAGAGTTTGAAGAAAGGCTGAAGAAGCTTATGGAGG
AAATTAAGCAAAGTGATGATATTATTCTCTTCATTGATGAAGTGCACACT
TTGATTGGAGCTGGTGCAGCTGAGGGTGCGATTGATGCAGCCAACATCTT
GAAACCTGCTCTTGCAAGAGGTGAACTGCAGGTAAGAACAAAAGAAAGTT
GTAAACCCTTTTTTGTTCATCCTGCTCCCTTCTCTTGGTTTTGTATTATT
AGATTTCATAAAAAAACCGTGTCCAGTTTGCTGACCTGACATATTTATGC
ATTCAAGTTGAGTGGCGATGCTTTACCTTTTCCATTTTGGTTAATGTTTT
CTTTTGTCAGTGTATTGGTGCCACAACGCTAGATGAGTATAGAAAGCATA
TTGAGAAAGATCCAGCACTGGAAAGAAGATTTCAGCCAGTCAAGGTTCCA
GAACCAACTGTTGATGAAACCATACAAATTTTGAGAGGTCTTCGTGAGAG
ATATGAGCTTCACCATAAGCTGCAATACACGGATGATGCTCTTATTGCTG
CTGCGAAGTTGTCGTATCAGTATATCAGGTTTGCACTAGATTTCAGTCAG
CTCTTCCCTGGATCTCAACCAACTCATTGAGTAATACATATAACATTGAA
CAAAAGCTTTACATGGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAG
GTTTGTGAAGGAAATGAATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCATTCT
AAACTTGAGTGAACCTTTATACTAAAAGAAGGCTAGATACATTTCCTTCA
CAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACCGAGGGAGTAGATAGAAATAT
TCTGATGTTTTAGTTACATTTTTAAAATTTTATCATCATACAGTGATCGT
TTCCTGCCTGACAAAGCTATCGACCTGATTGATGAAGCTGGATCACGTGT
CAGGCTTAGGCATGCTCAGGTATCGGCACACAGCTAACCGTTGCCCATTT
GACTAGTGTTGCTTTCCTTTCTAAGTCTGAAAATGTGTCAGTAGCTCCCT
GATGAAGCCAAAGAATTGGACAAAGAACTCCGCCAAGTTACCAAGGATAA
GAATGAGGCAGTACGTGGCCAAGATTTTGAGAAGGTACCTGTCTTGCTAT
TATGAGTTAATGTGATGTCTTGCCAAAATGTATGCGAACAACATTTGATA
CTACTTCTGTTCCAACTAGATGTTCTTCAAAGTGCAGTCAATTTTCTCTA
TCTTGAACAACTAATATAATCTATTTAGGTTTGTTACGTACAACATTATC
ATTAGACTAGCAAAAGTGCCCGTGCGTTGCACCGGGGAAAGAAATACTCA
AATGCTCCAGCAAACCATTTGTGTTCACACTTTTCCTCGTTGTCACCATT
GTCGATGGTGGTCACGTTTCATCCCATTCATGACGAACGTATAAGCATAT
CTAAGAATATTGGAGTGCAAACCCCTCGCTGCACCAACTTGTGATGACAA
TAAAAATCCTAGAATGAACCATCGACCAGGCCAAAAGACCCGACCCCCCA
ACCCACGTAACCTACCCAAGACTCCAACCAGCCCATGGCCAGGGATCGCC
TTTCGCTAACACAAACACGAATCTTGACCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCT
CTCTCATGTTCCTGCCCGACCTCACGAGTAAGACAATGTCCCTCGGCCTG
CGCCGCTGCCCACGAAGGCCCACCGCATGATCAACAGTCAAACGTGTACG
ACGGCTCGTTGATCATCGACCCAGACGGATAAAATAGCGCTTAATCGACG
TTTATTATGTTGGACTTGCACTTGTACTTTCATGTTACATTGTATGGTTG
GAAAGTATATGTACGGTGTGTCTAAATGGAATACACCTTCCTAAAATACA
GAGAGCTATATGGTTAATTAATTGCTGCTGACATGTATTTGTGATCTAGG
AAATGTGTCGGTGCGTTGAAACGGTGGATAAAAAAATTAGTCAACTCAAA
TGTTTCCCTAATCATTTGACCTCTGTAGAATAATTTTATTTTTCTATCCA
TCAAGGTTAATCTTTTTTTTCCAAACCTAGTTTATTACTACACTTTTCTA
AAAATATAGAAAATGGATTAACAAAAGAGAAGGATGCCAGAGCATCCACG
CCTTCGTCATCCCTCTCCGCTTGCTTCTAGCTTCCTGTCCAGTGCCCCAG
CTCTGCTTGCCCAGCCTTTTTTTTAGGTGCCCTCCCTTGCTAGTCACTGT
CGAGACTATTCATGTCCTTTAATTATTGTACCAGTATGTGGGCCTACAAA
TTCAGTTTAATTACAAACTGTGCAAGCTCTCTTTTGTCCTAGGATGGAAG
CCCCCAAATCACGTTTTAGTTATAACCGTGCAAGCCCTCCTTCCCAAGCA
GCTTGTTTGTTTGATTCCTGACGCTGCTGGTTATTCCAAGCAACCTAAAA
ATTAGTAGAACTCGGTTCATGGCAGCAGTGTGGGACTATTCAAGGCCTGT
GATAATAATAATTCCATTAGAAACGCTATTTGACCGGTTCGCTTTTTGCT
CATAGCCCAAGGCCCGGGAACGCGAACAATCCAAGACGGACAGGCGATGG
ATGGAACGTGTCAGTTGGAATGGTCTTTTTTTTTTACTAATTGAAGTCGT
TGGTGGTAATTTGCTATTTGGTGGAAGGGTAAATATGTCCAAAAAATGTA
GGAACGATAAGAAACGCTCCTTCCTTTATTATTAGGTATAGATTATCCTG
AAAAATAGTTCCACAATATGCTTTGATTATGTTTATATGCATATTCATAT
AAAAAAGTTCATAGTTGCATGTTGGAGATAATGCAAAGTGGAGAAGTTCA
TTTATTTTGGAATGAGAGTAAGTACTCCCTCTGTCCAGAAATAAGTGACT
TGCATTTGTCTAAATTCACACGTATCTATACACTAAAATGTGTCTAGATA
CATGCGTATCTAGAAATCCAAGTCACTTATTTCTGGATGGAGGGAGTACT
ACTTTATGTACATGGCGAAGAAGCCTCTCCCAGACTGGACATTCTTCCCT
TTGCTATTGCAACTTCGAAGGGTCATCACTCACCAGTGTTTCCTTCTGAT
CAATTAATTCCATCACTTACCAGTATAGTTTCACAGGCTGGGGAACTAAG
AGACAAAGAAATGGAACTGAAGGCACAGATCACGGCTATCGTTGGCAAGA
GCAAGGAAATGTTTAAGGCAGAGACCGAGTCTGGTGAAGTCGGCCCTTTG
GTAACGGAGGCAGATATTCAGCACATTGTCTCCTCTTGGACTGGAATACC
TGTTGAGAAGGTCTCCTCTGACGAATCTGACCGTCTCCTGAAGATGGAGG
AAACGCTGCATCAACGTGTCATCGGCCAGGATGAGGCTGTCAAAGCTATT
AGCCGTGCAATCCGTCGAGCCCGTGTTGGCCTCAAGAACCCAAACAGACC
TATTGCCAGCTTCATATTCTCTGGACCAACAGGTGTTGGTAAATCAGAAC
TGGCCAAAACTTTGGCATCATACTACTTTGGCTCTGAGGAAGCCATGGTC
AGACTTGACATGAGTGAGTTCATGGAGAGACATACTGTCTCCAAACTAAT
TGGTTCGCCACCCGGATATGTTGGCTATACTGAGGGTGGTCAATTAACCG
AAGCAGTTCGTCGTCGCCCTTACACAGTAGTTCTCTTTGATGAGATTGAA
AAGGCACATCCAGACGTCTTCAACATGATGCTTCAAATACTTGAAGATGG
AAGATTGACTGACAGCAAGGGACGGACAGTTGATTTCAAGAATACACTAT
TGATCATGACGTCAAATGTTGGAAGCAGTGTCATTGAGAAGGGAGGCCGC
AAGATTGGATTCGATCTTGATTACAATGAGAAGGACACCAGCTATAACAG
GATCAAGAGCCTGGTGACTGAGGAGCTAAAGCAGTACTTCCGGCCCGAGT
TCTTGAACAGATTAGATGAGATGATTGTTTTCCGTCAGCTGACAAAGCTG
GAGGTGAAGGAAATAGCAGACATTATGCTGAAAGAAGTGTTTGACAGGCT
GAAGCTAAAAGAAATAGATCTTCAAGTAACTGAAAGATTCCGAGATAGGG
TGGTGGATGAAGGCTACAACCCAAGCTATGGTGCCAGGCCATTGCGGCGC
GCTATCATGAGGCTGTTGGAAGACAGCCTGGCAGAAAAGATGTTAGCTGG
TGAGGTCAAAGAAGGTGATTCCACCATCGTCGATGTTGATTCAGAAGGCA
TAGTTATAGTACTCAATGGTGGCAGCGGCGTCCGAGAGCCGCTGACGCCT
ATTTTGAGCACCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.