Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA041640

[Submit comment/correction]

Sequence
AA041640
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041640
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCTGGACATCGGAGCACCGGAGCGCCGCCGAACGCGACGCCTTGTCCAA
ATCCTAGTTCAGTCACAGTCAGGATACAGGACTCCCGACGTGTCGCACGG
CTGCCACGGCACCGTACCGAGAGACGGAGAGGGGCGCCGCATCCGATCCC
TCCCCACCAAGGTCCGTCAGCGTGCAGTAATTTCCCACGGCGCGGCGTCT
CACTCTTCCTTCCCCGCGCACGCTGCCCTGCCACCACTGCGCCCCGCTAT
TTATACCACCGCACCACCGCCGCGCCGTACACAGACCGCCTCGCCACCGC
CGCTCGACTCCACCCCAGCCAGCCATGGCCGCCGCCGCAGGCCGGTTTCT
CCCCTTGCTCCTGCTGCTCCTGTTACTCCTCGTCGGCGTGTCCGCCTCCA
GCGTGACGTACGACCACCGCTCCCTCATCATCGACGGCCGCCGCCGCCTC
CTCATCTCCGCCTCCATCCACTACCCGCGCAGCGTCCCCGCGGTACGTAC
GCTGCTCTACCACTCCCCTTCTCACCCAGCAGTGGCTGCATTTAAGTCAC
TCCGGTCGCTTCCCGTGCTCGCAGATGTGGCCCAAGCTGGTGGCCGAGGC
CAAGGAAGGCGGCGCCGACTGCATCGAGACCTACGTCTTCTGGAACGGCC
ACGAGACCGCCCCCGGCCAGGTCCGCCCGCGCCCTTCAGTTTTCTTTACT
GCATTTAGCCCGTTCGTCGCGGGCGGGGGGCGTATTTTGAAAATTTTGAC
TGGTGCTGCAGTACTACTTCGAGGACCGCTTCGATCTGGTGCAGTTCGCG
ACGGTCGTCAAGGACGCCGGACTCTACCTGATGCTGCGCATCGGCCCCTT
CGTCGCCGCCGAGTGGAACTTCGGGTCCGTCCTCCGCTTTCTCGCGTTTC
ACTGACCCTGTCTGGGATGTGTAATTCTGCATGTTTATTGGCATTCTGTT
TCTCTCTGTGTGTCTGAATTTCAGGGGCGTGCCTGTGTGGCTGCATTACA
TACCTGGGACGGTCTTCCGGACCAACAACGAGCCGTTCAAGGTGGCTGCG
GCTTCTGAATTCTGCAGTGCTTTGTGGTAAACTTACTGGTCTGGGTCATA
CATAATCCGAGCGTTATTATTTTTGGATGCAGTCTCACATGAAGAGCTTC
ACCACCAAGATCGTGGACATGATGAAGAAAGAGCGGTTTTTCGCTTCGCA
GGGAGGGCACATCATCCTAGCCCAGGTCGTGATTTCAGCCAACTTTGAGG
CCGATTTTTTTGGTCACAGCTGACATACAGGGTTGCATCATCTGAAGCTA
AAAATTTGTGCATTCCAGGTTGAAAATGAGTATGGAGATTATGAACAAGG
GTATGGAGCTGGTGGCAAGGCGTATGCGATGTGGGCAGCTAGTATGGCTC
TGGCTCAGAACATTGGCGTCCCTTGGATCATGTGCCAGCAGTACGATGCT
CCTGAACATGTGGTCAGTTTCTGGCTTCTGATACTATCTTTTAGACTTTT
TGTACATCAGTTAGAAATGGATTGCCTCGTCAAACATACTACGCAAATTG
CAATATATGGCATCATATTTATTTGGATAGACTAGCACGACTGATTTTTT
TTCTTTGCTAGCAATGTGTTTGCTGAATGATTGCTTGCTCCTGAAATTAC
ATGTTCAAATTCGAGAGCCGTTCAAATAGGGGACAGCATGAACATCAGAT
AGTTGGTAGTTGTAAAAGGAACTTGGTTATGTGATGAACAGCATCCTGGT
ATCTATACATGCATGAGCTTGGTAGTTGAGACATAATAATATGTGATAAA
GTTCTTAGCAAATGCAGTATGAGATCTTTTTTGGCAGATCTATTTATTGT
TGTGTTGACATTTGCAGATAAACACTTGTAATAAATTCTATTGCGACCAA
TTCAAGCCGAATTCGCCAACCAAGCCAAAAATTTGGACAGAGAATTGGCC
AGGATGGTAATGCATTTGGCACACTTGACACTTCCATTAGCAGCCGATTA
AAATTTACAGTTACTTATCCTGCTATTGATCATAACACAGTATGGAGCAA
ATGCTGGATTTCATTTTCCTTATCTCCCTTATTTCCAAAAGCGGAAGGGA
ATAATCTCTTGCATCCTGTTTATTTCTATATTTTGTGTAGGTTCCAGACT
TTTGGTGAAAGTAATCCCCACAGACCCCCTGAGGATGTTGCATTTTCTGT
TGCACGTTTTTTCGGGAAAGGTGGCAGCGTTCAGAATTACTATGTGGTAT
TACCTTGTACACAGTTTGCATTCTAACTTGATTCTTAAAAAAATAATCAT
AGTCCAACTTCACAAAGGATCACACGTCTCATATTCTAATTTGACAAAGA
CACTGATATTTATCTGGTCAAGCACATGAAATCATATTCAGTTGGTAGCG
TTATGTATGATGATTTCATCCTACTGAAAATTGACCAAGTCTATTGTCCT
TTTGAAGTACCATGGTGGAACAAACTTTGATCGTACTGCTGGAGGACCGT
TCATTACAACTAGCTATGACTATGATGCACCAATTGATGAATATGGTTGG
GCTCTAATGGTCTTGGATCCATCAGTAATATTATGCCTGGAACCATCTTG
ACATTGTTCATTGATCTGGATTTTCAGGCCTTAGGCGACTTCCAAAATGG
GCACATCTGAGGGAGCTTCACAAATCTATAAAATTATGCGAACATAGTCT
GCTTTATGGAAACTCAACGTTACTTTCTCTTGGATCTCAACAAGAGGTAA
GCTTTATTGTCTTCCGCTGGGATATAAATGATCGAACGCTGTAAGATCTC
CAGTTATTTATGACATACTCACCTCCACAAGCTTGGGCTCCTTTTAGTCC
AAACGATAAGCGAAATCCATCTGTCTTGTAAATAGAACCTTATGCTTACA
TGATACATACTGCTTTATAAATGTAGAGCGCACATATTGACTACATCTGT
CAACCTATCTGTGTTAAACTCACCATTCTCCTTATGTTTATCCCCCTTTA
GATTAATTTTATCCTCTACTATCTTATACAACGAAAGTATCAACTTTTGC
TTGCAGGCTGATGTTTACACTGATCACTCAGGAGGATGTGTTGCGTTCCT
AGCTAACATTGATTCAGAAAAGGACAAAGTTGTCACTTTCAGGAACAGAC
AATATGATCTTCCTGCTTGGTCAGTTAGCATCCTACCTGACTGCAAGAAT
GTAGTTTTCAACACTGCAAAGGTATTCCATTTTCCATTTAGTGGTTTTGA
GAATTAAATGTCATTGAAATGGATGGATAACATACTTCTCAGAATATGGA
ACAGAAAATAGCAGTAGAATTTAAAAGGAGAAAGTATATAGGGGACATCA
GATTATTCAATGCTTAGCTGAGAAACACAAGATTTAGCACACCACTTATT
CTTATAACTTTGGTTCTCTATTATTAATCATCTTTAGGTTCGATCTCAAA
CTTTGATGGTGGACATGGTTCCGGAAACTTTGCAAGCATCAAAACCTGAT
CATTGGAGCGTTTTCACGGAGAGAATTGGGATTTGGGATAAAAATGATTT
CGTACAAAATGGATTTGTAGACCATATTAATACAACAAAGGACTCTACTG
ATTACCTGTGGCATACAACAAGGTTGGTTTACTACGGGCTGTTTCATGTG
TGCTTATTAAGTATGTCGGTAAGCCTGGTATCAACCAAAGAGGAGAGGTC
TTAGTATTATTTATGTTCCACTATAATTTCTCTGCACCATTCTATCCACT
TCCAATTCTCAATGTGGCCCATTCTTTTAATGAAATTTGCAGTTTTAATG
TGGACAGAAGTTATCCTGCTGGGAGCCATCCAGTTCTTAGTATTGACTCC
AAAGGCCATGGTGTTCATGCTTTCCTGAATAATGTGCTCATAGGTCTATT
CTTTACTCTACTTTATGCTGAGAAACCATATAAAGTATTATCTTTGAGTA
TGCGTTTGCTGGGATGTTTCTCCATTTCTAGTTCAGCCTATTTGGATCTT
TCGACTTCCAAGTATCAACATTTTCTGCATGGTCAAAATATATCCTTAAG
AAGTGAACGTTTGTTTGCACTAGCGCCATTATGACAATTTTCCGAAGGGT
TGTTGAATTGCACATTGTTGGCAGTGACTTTCACCCTTAGATGCTAGTTG
TTTGCAATTTGCATTTCTCTTCAGTTTGAGTTGCTTTGTCATTACACTAT
CATACATCTCTTCCTCAGGTAGTGCATATGGTAATGGCTCAGAATCAAGT
TTCAGTGTGCATATGCCCATCAACTTGAAGACTGGGAAGAATGAAATTGC
ACTACTGAGTATGACTGTTGGATTGAAAGTAAGTGTCTACCTGTACAAAC
GGTTTAACGTTGCATTATATGTATGCTGTTCTTTACACGTCCATGCTGTT
TTATGTGTATACATATGCCAGTTTACACACTTCAGTGAAGAAACTTTTGT
TAAGGTCACTTCATGTTAAAACTGTTTATCTGATCGGACCTTTATGCACT
TTATAAGAGTGCAGGGCCCTACTATGAATGGGTAGGAGCTGGCCTTACAA
GCGTGAAAATCTCTGGAATGAAAAATGGAACCATAGACTTGTCTTCAAAT
AATTGGTCATACAAGGTACTGTCGTCGAGATTCTTTATATGAAATTTCAA
TTGAGAACCCAATATGGAAGTACATCGTATTACCTCTGTTCCAGAATATA
AGATGTTTTGGTAGGCTAAGGCTATTTTAGCCTACCAAGACTTCTTACAT
TTCGAAACGGAGGTAGTATTTCTTAGCACCTATTTGTTTCGACTTTACTG
ATTTTTTTTCTAGAATTTGAGATAATCCAGATAGGTGTTTATCTGTGCTT
CTGTTATGTATTTGTTGGTAGATTGGGTTGGAAGGTGAACATTACAGTTT
GTTTAAGCCCGATCAGGGGAATAACCAAAAGTGGAGGTCACAATCTGAGC
CACCAAAAGATCAGCCTTTAACATGGTACAAGGTAACATTTTACTATCTT
TATTCTCCATGAATTATTCACATCCTATTATGTGTACTAATCCAGCATAC
TTCTAGGTAAATGTTGATGTTCCACAAGGAGATGACCCGGTTGGGATAGA
CATGCAGTCTATGGGGAAAGGCCTAGTTTGGTTGAATGGAAATGCCATAG
GGAGGTACTGGCCGAGGACCAGTTCTAGTGATGAGAGGTGCACTCCCAGC
TGTGACTACAGAGGACAATTTTCTCCAAACAAGTGCAGGATTGGATGTGG
GAAGCCAACCCAAAGATGGTAATGTAACTGACATTAGGAACAGCTCACCA
TCCTAATTATGTTCTGTTCATTATTCTCACATTATTTCTGTTTTACTTCT
AAAATAAACAAGGTACCACGTCCCAAGGTCATGGTTTCACCCATCAGGGA
ACACACTTGTGGTCTTTGAGGAGCATGGTGGGGATCCCACGAAGATTACA
TTCTCGAGAAGAGTTGTGACAAGTGTCTGCTCCTCTGTGTCAGAGAACTA
CCCTTCCATAGACCTGGAGTCTTGGGATAAAAGTATCTCAGATGATGTCC
GAGTTGCAGCAAAAGTACAGCTGTCTTGCGCTAAGGACAAAAAGATTTCC
ACAATCAAGTTCGCAAGCTTTGGAGACCCCAGTGGAACCTGTAGATCCTA
CCAACAGGGAAGCTGCCACCATCCAAGCTCTCTATCTGTTGTCGAGAAGG
TAACATTTACAATTTCCTGATGTAAAAATTGAACAGGATACTAATCTTAG
AGACTGGGAACCATCAAATCTGACTTTTTAGGGGTGTCAATGCATGTAGG
TTTGGATCAGTGCACATGTAATTAGTCTTAAAATTTGATGACTGCCAGTT
CTGACTTCAAGACTGCAGTTGTGGTACAACTAGAATCAGATTAGACAGTA
GGAGGTTTCAATTTTCCATTTCGAAGCTACCATATGGGTTTCATCCGGGT
TGCCTAATAACTATTTCTGTATTCTAGCCCTTCCTGTATCTAAAAAAGGA
GATCTATAGATTTAGTCTACCATATCAACTTTGTATAGTATTTTCCTAAC
CAGTCCATTATTCTCTGCAGGCCTGTCTGAACACCAATAGTTGTACAGTT
TCATTGTCAAAGGAGGGATTCGGAAAAGATATATGCCCTGGCATCACAAA
AACACTTGCCATTGAAGCAGACTGTTCTTAGTAAGTTCTGCCCAGATAAG
AGTCCCACACCACAAATCTGCTCGTCAAAAATCAAATTCGGAAAGCTGTA
GTGCTGGCTGCATTTACGTGATGTAACCTTGAAGTGGAGGTCTACCTAGA
TTTTGGTTCATATTTCTTGTGAGCATGATGTTAGCCTTTGTTTCATCGAG
TTTTCCTGACACGTCTCTGGTAGTACTACTGACAAGTGACAAGTCAGGAT
ACTGACCATATGGGGCTCATTATACCTAATGTAGCTATGAGTTTAAAACC
ATGAGCAAACTACCACAAATCATATTGGACAATGCATCATGAACGTTCTG
CATCAACAGTGTTGGGATGCTGATGTACCGTGAGGACTCTCTTAATTAAT
TATGGCCAGTTCCGTCAAGTTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.