Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA041438

[Submit comment/correction]

Sequence	AA041438
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA041438
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAAAACCGCTACGCGCCGACGCGCTTGCGCCTGAGCTGTAGTACGCCTAG TCGCCTCCCGTGCCCGTGCCGCCGCTATGAATGTTCCGCCGCACCTCCAG CTGCCACCAAGATTTTACTCCTCCTCCTCCTCCTTGCGGCAGTGAAGGCC AGAAGGCGACCGTTTGTTGCCCCGTTGTCGTCCAGCTACTCCCAACCACC CGCCTGCCCGCACGCGAGGCAGCCGCCGGCGACACACCGCGAGCGACCGG ATCGAGGCGCGCCCGGCGATCGCCCCTCCGCCCTCCTCCCACAGGCGGGC GGATCCGCTGGTGGCAGGTACCTCTGTCGTTTCCCTCGTCAGGGTCCGCT CGTCGGTTCAATTTGCGTTTGGGCGTGATCTGGGTTGTCTGGAAACGTGT GATTTCTTAGAAAAAAGTTTCATCTTTCGCAGGGTGTGGATTCAGTCGGC CGGCCCTCCTGGTTTTGGAGTTCGGGAGAGGGAAAGAAGGATTCTTGCCC CGCGTTCTTTGCCGGATTTTTTGACCCAGCAAGTTGCTGTTTTGAAAAAG TCCCAATCCCAACCTGGATTTGATTTGGTCAGAGTAGACTCTGACGCGAG GGGAATCTTTTGCTGTTTCTTGATCTCAACTCGGTCCAAGGGGCTCCAAT TGGCTACGCCAACGTGAGGCAGGCCAGGGTGCTCCCATCCCCTGCTGCGA ACAGCTGCCCATCGCTATAGTCCAAGTCGAGGAAGAGGGTTCAGTTCTTG GAGTCATCGTAACAAGGAGGATAACCAGATAGTTCGAGAGTTTGAGTTCC AGTTCTGTTGTCTGAGGACATTTGGATCAAAGAGTTCGGCCTTTTGGGAG GGGAAGGAAGAGCCATGGGGGTGATGTCGCGACGGGTGCTGCCTGCGTGC AGCAGCCTCTGCTACCTCTGCCCCTCGCTGCGGGCGCGATCCCGTCAGCC CGTCAAGAGGTACAAGAAGATCATCGCGGAAATCTACCAGCTGCCAGCGG TATGGCCCTTCCTGCCTGTTACCTTTCGAATTTTCTAACCTGCTGTCTAT CATGTTAGTTGTAGTCCTGCGTAATGGCTGTGTTGTGTTCAAATGTTTGG GAGTTTGCTAACTGAACTTATGATGCTGACTTAGGATGGAGAACCAAATG ACAGAAGGATCGGGAAACTCTGCGATTATGTATCGAGAAATCCAACACGC ATACCAAAGGTAACACATTCTGCCTCCTCCCTGTTTTTAGGACCACCGTC TAATAATTCCCGCTGGCATTGCAAAAGACTGGAATCAAGTCAGTGGAAGA AATTGAATTATGTATCGCGAAGCATATATTCTTGTTACGGTCTAAGTAGT CTCCAGCTCTTACCTCTATGTTGACGAGTGATCATCACTTTGCTTTTCCT GTGACGGGCATTGTTCTTGCAAACTGTTGGTAGATCTGCTGTTACTTCTA CAGTGATCACCACACTGGAATGAGCTTAGCTAATTGCTTTTTTGGGATTT AATTGGCGTACTCAAAGAAGCGAATGAATCAACTTTATAACCTTGGTAAA ACCAGAATTTAATTTTACTTCCTCTTTTCGGACAGATCACAGAGTATCTT GAGCAGAGATGCTATAAAGAACTGAGACATGAGAATTTTACCTTGGCCAA AGTTGTTCCATGCATCTATAGAAAACTTCTTCGATCATGCAAGGAGCATA CGTAAGTGCAAATGTTGTTTATCCAGTGATGCACTCGTGACCAATCTTGG CTAATTGACTGATTGGATTGTTCTTGTTTCAGGCCATTGCTGGCAACAAG CACATTGTGTATTGTTCGCACTCTTCTTGATCAGAAATCGAACGATGATT TGCAGGTCTTGGGTTGTCTATTGCTTGTCGACTTTCTCAGTGGACAGGTT GTTGACGTGGCATATAACTACTTACACTTTATTTATTGTTTTGGTACTTG CTATCTGCTTAATTTCTGAATTCTAATTGGTTGTTCATATAGGTTGACAG CACACATATGTTTAGTCTAGAAGGCCTCATACCAAAACTATGCAGAATTG GTCAAGAACAAAGGGAAGATGACAAAGGGCTCCGTCTTAGATCGGCTGCA CTCCAAGCTCTTGCTTCTATGGTATGACAACCTATTACTTAATTGCTCTG ATGAAAAGGGCAAGACAGTTGTACGTTAACCAGCCATTTTAAGGGCTTTT TTTTTTCATACCAGGAATAATGCTGTAGAACAAATGAACCAGTTACCAAT TTCATTTGTTATACATTTTCACATGCTTCATACATGTAAACTTTTGTATG TTGACTGCATACAGCTTCAAAGCCTCTGGATAGACAATTATTATATTGAG GCTTTAAACCCATATTTTACTTTAAGTGGGACAATAAATACATTTTTTGT GCATCCTGCTCATATCATGTCATGCTATGTTCTGCCATAGTGCTGTATTT TTTTTAAATGTTAAAGTTAAAAAAATGTAAGTTTCGTCGTTGCTTTTTCT GCATTACCGATTCCTTGCAAGTAATATCATAGGAGTAGCAGTGATTAAGT TGGGAAACATTACCGATTCCTTGCAAGTAATATCATAGGAGAAGTTTCGT CGTTGCTTTTTCTGCCAGACTGACTGTTTGACCACTTGTAATCAGGTCGA ATACATGGGTGACTACTCCCATATTTCAATGGAACTCGATGAAGTAAGTC CTTTCAAGTTTAATTTCATGCATACCGGATACTTTCTGCGGAATACTATT TCCTGTATGAGTTTCAGTACAAATAGATCATTGCATACAGGGAAGAGATA TAGTATAACCAAAGTTCAGCAAATTCTGACATACTAGGTCTACCTACTTA ATACAGGAATAGTAAACTAAATTTAATTGAAAGTGGACCAGAAACAACAA CTCATGAAGCAAAATGTTAGCAGAGATGTTTCAGCTCAAATAGCATCTCA AACTGGGGATCTGATTAATTTGCCATTCATTCTCGAACCCAGGTTGTCTC AGTGATAATAAGCTGTTATGAGGCTAACCACACTCTCTCAATAAAAGAGG TTGTCAGACTTCAAGATGACGATGATTTGGCAATGTTGGCAGTATCTGGG CAAAATAGTGCCAAAGTGGCATCTGATACAATGTGAGATCTTCTGCTCAC ACAATAACCCCAGTTATAAACAACAGTTCACCTTTTTATCCTATTAATGG CTTAATGTGTTTACAGGGCTGCATCTGAGAACCCAGCGCACTGGGCAAGG GTTTGCTTGCGTAACATGGCCGATATCGCGAAGGAGGCAACAACAGTACG GCGTATTCTTGATCCTCTTTTTCGCCTTTTTGATAGCCACAATTACTGGT CTCCTGAAAGTGGGATTGCCCTTTCTGTTCTACAAGAAATGCAAACACTG ATGGACAAATCAGGTGCAGCAATTTCCACCCATGTAATTTCTTCTCTTGT TTTTTCCCTTTCAGCGTTGCTTTAAGTTGGAAATATTACGGTAGACTAAT TTAGTACCCTGTTAAATCTTGTTTTATACTTGCAGGGCAAAATGGCCATT TACTGCTATCTTTCACCATAAAGCACATTGATCATAAAAGTGTTGCCAAG ATGCCCATCAAACAAATCAGCATTGTAAACGTTGCTTGTCGTCTTGCAAA GCATGCAAAGTCACAGGCATCAGTGACAATAGCAAGTGCAATCAGCGACT TAATAAAACACTTGCGAAAATGTATGTACTGTGCTATTGAAGCAGCAAAT GCTAGCGCTGATGTTGATAAGTGGAACAGTGAACTTTATGTGGCCTTGGA GGAGTGCCTGGTGCAATTGACAGAGAAGGTTGTTGTAATCTTTTGGCAAT TTATTACAATAACTATTTCTGGTTTCCGCATAGAAATGTTTAAGAAAAGT TTTTGTTGTGTTGATTAGGTCGGGGATGTTGGGCCTATTCTTGACATGAT CAGTGTAATGCTTGAGAATCTCTCGTACACTGCCACCATCGCCAGGGCGG CAGTGTCATCTGTTTACCGCACAGCACAAATAGCAGCTTCTGTTTACAAA TTATCGTACAATCAGAAAGTAAGTTTTTATATTTTTACTACCATGGAGAA ATAATTTAGCAGTACTCTATAGAACATTAGTATTAATTGGCATTTCCTTT TGTATCTCAGGCATTTCCTGAAGCTTTGTACCATCAGCTTCTGTTAGCAA TGATGCACCCAGACCATAAGACAAGGATTGGCTCACACCGAGTTTTATCC ACCATTGTTGCACCTTCGCTATTATGCCCGTGGTCAGCAATATGTTTTCC GGTCCCATTGAAGGTCAATGGTTCACAGAGTGTGCGATTGTTGGCCCTGT CAGCTTTCTCTTCTGAGATCAAGGAGTTCTTGCAGCAAAATGAGAAATCA GAAGCTGTGGTAAGTGCTGAGAATGGATATGCACACAGAGAACCAAACGC AAGTCAGTCTTCTGGGAGCCCATCCTTCAACGAGAATAGTCTTGCCGCTT TTAGTGATGAAGTATGAAGTCCAGCTAGTATTCTTAGTTCTTAATCTTTT GACTTTTGACCGTCAACTGATACTAACTGATACAATATCTTACTTGCCTT GCATCTGAGCAGAATTTAAAGTTTATGAAGTTGAACAGCGGCCAACTTGT TCTTCTTCTTTCATCTATATGGAGTCAAGCATCTCTGGAAGATAACTCAC CTTCAAATTTTGAAACAATGTGCCATACCTACAACATTGCTTTATTGTGT TCGAAGGCAAAAGTAAGTCAAGCTTTACGCAGTCATTTTTGCTACTCAAT AGGGAAGAAAACCATATACTACCTCCGCTGCATAATGTAAGCCTTTCTAG CAGTTCAAATTGAACTGCTAAAAAGGCTTACATTTTGGAATTGAGGTAGT AGTAAATAGGGAAATTTGTTCCTATCACCCGGGGACTATACCACCTCTTG GACCCATTGTCAGTCTGTTTTCAAAGTCACATATTTTAATCATTTTCATT GTAGCACATCCTTATTTCACACGGTAATTAAGTCAATTGTACAGTGCCTC ATGCATATAATTTGGATTCTATAGATGAATTGGTCCATTGCAGAGAGTAC AATGATGCATAGTGTAGACTGTAGAGACATAAGATTATGAAGAGCTTGAA ATGATATTAGATAGATGTAACTTGGATCTCTAAGTTATCAGTGATTGGCA TTTTAACCAGTATCATGTACTCCATTTGGGTTGAAAGCATTAAACCCTTT TCTTAGATTCTCAGGATAGTGAACCCGAGATACCATCTTGTGTACTGTTT AAGTGACCAGTTAATTTTGATGACAGACCTCCAGTCACGTGGCACTAGTT CGATGTTTCCAGTTGGCATTCTCTCTCAGGAGGTTGTCTCTGAACCAAGA TAGTAAGTTCCTGGAACATTGCCTCTCAAATGATGTTGTAAAAGCTGATA TTGAGATTCACCGAATAGATGTCCGTTTTTAAATGATTATCTATTAAAAT CTGAACGAAAATGCTCTCCATATGCGACACCAGTATAGCAGTTGAATTCA TGGCTTGATTTAATCTTTTATTTTTGTGTGTAAGTGAAGATGTTGTGCAG CCATCCCGGAGAAGATGTTTGTATACGATGGCATCGGCAATGCTTATCTT TTCGGCAAAAGTTGCTGATATTCCTCAGATTACCCATCTTGTCAAAGCGG CAGTGCCAGCGAAAATGGTTTGTTGATATCCATCATGTGACTATTTAATT TGGATTGTCCGGCTCTATGTAATTAGTATGATAACAGTAACGTGCTTTAT TAATTTTGCAGGCTGACCCTCATCTTTGCCTGATCGATGACTGCCGACTC ATTATGACTTCTGCACAATCTTATGGTTCCGAGGAAGATGAATGTGATGC ACAAGTTTTTCTTTCAGCTGTGGATAAGGACGATACACAGTTAAAAGATA TTGTGATATCTCACTTCAAGAGGAAATTTGAAAATTTACCAGAGGTGTAG ATTCAGACTTACTTGATCAGATTATCTCTGTGACTTAGCTAGCTGTACAG AATCTAGAAAACTGACATTAGAGTATATTCACTTGAAATTGCAGAAGTTT GACGGGATAGAAGAACAGCTTCTTCAAGAGTTCACCCTGGATGATTCATT TCCTCTTGGTGCCCCGCTATTCATGGAGACGCCACACTCTTGTTTAATGT ACGCAGAGAAGGATGATCACTGTTTCGATGAGGTATCCTTCAGAATTACT TGATTTTGTGCTATGCATGACTCGCCGGTGATGTTATTTCCTAACCTTTT GGCTACTTGTCTTGTGCTTTCAGGAAGTTATTCCTTGTGAGATGGATGAT GATGATGACATCGTTTTTGAACACAGCGGGTCTCAGTCCGACAGGAAAAC ATCAGGATCTATGGGTTCATCCGATGTTCTAAACGTGAATCAACTGATGG AATCTGTACGTATCATCTCTACAGCAAATGGCACCTGAAAAACCCTCGTC TGTCTTACAAAATGCGCAGTTTCCTCATCTGTTTGTACTTGAACTACTTG CTCCCAGGTTCACGAGACAGCAAGGCAAGTTGCTAACGTTCCAGTGTCCA TGAATCCTGTATCGTATGACCAAATGAAGAGCCAGTGTGAATCCCTCGTG ATGGAAAAGCAGCAGAAGATGTCTGTTCTCTTGAGCTTCAAGCACTCGAG GACCAATTCACGTAGCTCAACCGGGGATAATGGACCGGAAACAAATGAGG CATGTGTACTCCTATCAGATGTTCTTAACCTTGAGCTTTCTAAATCCAGG CATCTTGTCAGGCTCTTAACCTTGATATCTCATAAATGCTGACATCTCGT CCCATCTTGCAGTCATCTGCTCGATCTGAGCCTGAGCTGCAATTGACAAA GAAGGACTACATGCGGCGCAGCGACTCAATATCCAGCGACGATCGGTCCT TCAGGTTGCCTCCTGCAAGCCCATATGACAAGTTCTTGAAGGCGGCTGGA CGGTAGATCGTCGCAATGGCACACTGGTTCTCAAAACTGTATACAGGAGT GGTTGCAAATTATATGTCTTCCGAGTTAATTTGTTGTTTCATTTTTTTTT CCGGCTTCTGTTCTTTGAGTGTACAAATTTTCGACAAGGTGTACAAATTT CTGTTACTGCTGTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.