Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA040092

[Submit comment/correction]

Sequence	AA040092
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA040092
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGCCGCTCCACGACGCGCCGTCCAAGCGGGTCACCAGCTCCCGCCACTC CACGGCCGCCGTGGGCCAGCCCCCGGGCCAGCGCCCGTCGCGCTCCATGT CCGTCGCGCCGTCCTTCTCCGGGGCCACCTTCGCACGGAAGCCGCCCGAG CCGCTACGCCGGGCCGTCGCCGACTGCCTCTCGCCGCCCGCGCCGCACAC CCACGGGCCCGCCGCCGCAGCCGCGTTCGCCGCCACCGAGGCCTCCCGCA CCCTCCGGGTCAGTCCCCCCTCCCTCCCTCCACGCGATCCCCCTCTACAA CTCTACAGACGACTTGCTTGCAGTGCCCCGACCCAGTAGAGCTCCAAATC ACGTCGATTTGATCTGCTATGCGAGTTGCGAATGGTTAGACTTGGTAATG CTACTAGTGTTGCATTTCTGAACCCTCAATCACAGAGCAACCAGCAAACC ACTATCTGGTTCAGCTGCCTTCTTGTATGCTGCGTAATAATGCATTGAAT GACACACAGAATCTGGCGCCTATACTATAAACTGACGAGTGTTCTGACTT GCTTCAGTGACACCAAGAAATGATTCCATGTCCACCAATGCCGTCACCAC GTGGCTTATCACGATCTGCCACCCGCTAAGCGGGTTGAGAATGGCTAGAT TGGGTAATGGCGCTCCACGACTGCTTGCTGTTCTGAACCCCCAATTGCAG AGTAACCGGCAACTTATACGGTTATATGCCACGCAGTACGTAATACGTTG CATGATGCATTGAATGATCCACAGAATTTGGCGCCGGTAGTATTAATTGA AGCGTGTTCCGACCTACTTCAGTGACACCGAGAAGAGATTCTTGTGTCCG CGATTTATCGTGAGATTACCTGATCACGTTCTGCTATGTATCGTTCCGTG ATTAATGGAGTAACACGTGTCACTGAAGACCACCGTTCGAAGTAAAAAGG CGTTACCTCTGTATTTTTGCAGACCATAGATAATGAACATGTTGGCTAGG TCTGTTTACAAGGACGCCTATATGACATATAATGAAGGTGCTGGAAGAAA GGAATATTACATTTGTGCATATTATTTATAGAGTCTCATTCCAAATTACG TGCACATCATCTAATGTGAAGTTTTTGGAAAGTAAAGGTATAGAAAATTG TCAAATCCTTTTGACTGTTGACATTTGGTTGCTCAGTATGTTAATTGTTT GGTATAGCCGTCATGGTTCATCACTGCCGAGCATATTTAGCTTCCCTGCT TTCTCTGTTACTGCTGTTTGTGTTGTTAGTGTTGCGCTATTGGTAGCAAA AAGAGTTTTGTAATGCCGCCAGATTCTTTTACTTTTGTTATAATCTCAAC TCAACTCGTTCATATATGTATATGTCATTTCTTAATGCGGTGATCATACA TGGCAGGATTATATAGCCAACCCTTCAACCATCGATATGGCTTACAATGT CCTTATTGACCATGCGCTTGCAGAAAGAGATCGCAGGTATGCTTTTAGCT TTCACATTCCCAATCCTTTTCTGGCTATTTTCCCCAGTCCGCATCAGAAG GGGTAAATAACTTCTGACTGTTCAGCATAATGTGCTTATGTATCTAACTC CCGTGTTCTTATTGACGAACCTATCTAGATCCAGTGTCATAAGCTCCATC TTATTCGCTTGTTTCTATACGACATATAATAATTAATCAAGTAGGAATGA GGATCTGGAATACGTGAAATTATTGACAATTTCCTTGGTGCATCTTGATC TCTTGAGCTGTGTTTTCGACTGTGCCCCTTAGAATCAAATTTTATGATTT CTCATCCTTTTCCTAACGTGGACAATCTTTTCAACCAGCCCAGCAGTTGT CCCAAGATGCGTGGCATTGTTAAAGAGATATCTTATCCGGTAAGCTGAGT TTCACTTGTCAGATCTCATGCTTATTCTTGAAATTTACTTGCACTCACAC TAATACACTATACAACTTTGTATTGTAAGGTATATTCCAAAGGTGCAAAC ACTGCGCCAAATCGATATCTTTTGTGCAAATACAATAGCAAAGTACGATC CGGTGGCAAGTCACAGGGCATCATCATTTGGCCAGAACTTTGGATCATCA GCAGCTTTGCCAAATTCCTCTCTTGTTGCCCCACCAATATCGAACTTTGC TTCAGCATCGCTTGTGAAGTCTTTAAACTATGTCCGCTCATTAGTCGCGA GGCATATTCCAAAGTTGTCATTCCAACCAATTCCTCAATCTATTGCATCA ACCTCTACAAAACAGTCACTTCCTTCACTTTCATCATTTTTGAATAGGTC TTTAATTCCTCACTTGAATCCAGAAGTTGTTACCAATAGAGAACATCTTG AATCAAAGGAAATCCATACTCCACCTGATTTAATATCGTTAGCAAGTGAA AAGGTTGATGGGGGAGAGCAGGGATATGATATCAAGTATATATCCTTCGA CATTCTAAATTGGCGATGGCATGTATACAGTGAACGACAAGCATCAATTT CTGCCAAAGATAGGTATTTCTCTTGTGTTCATTGTTTACTCTCAGTTTGC TTTGGTCGACCTGGATGTTTTGCCAGTAGAAAGCCTAAATGTGTGCTGCA CCTCTTTTTTTCTTTTTTTTGACATGCTGGAGCATCCCAGTACTTCTGGC TGGAATGGAATTAGAAAGTACGATACTAATAGTCTTGCAAACACTGAATG CCTTTTTTTTCCTTTCTCACCAGCAGTGATTTTGCGGGCTTTCAAGATTT TCATACACAGGGTTTTCTTGAAGTTGGTGCTGCAGCTCTTCTAGTAGGGG ATATGGAGGCAAAGATCAATGATCAACAATGGAAATATTCTGTTACACAT GAATTTCCTGATATTGATTTGTTGCAACCGTCAACTTCTACAGCTAGCAC TTTTGCGTCATCACAGGGTCATCTGAAAGCAATAACTGCCTCAAAGCGCA TGAAATCGGGCCCAAGCCAAGTTTGGTAAGCTCATTTTTTCTTTGGGTTA TCATGCCTATGAGTGCTACATTGTGGTGAAACCAAATTCTTCGTTTGATG CATCATCTTAGTATTTCTTGTGAAGCACATTCTCCTTCTCTTCCCTGCCT TATTTCATTTACAGTTTCGCTGATAAACAGTTTTCTGCATCTGTGCTGAC GTTTGCCATTTGATTATGAACAAACTTGTTATTTATTTCTAGATCTTTTT TGTTAATATTATTGATATTAATTGGTCAAAAGGGTCTCACGTGTGGAAAC ATGTACATTTTGTGTAGGATGAACATACCTGCAAACACATTCCAGCCTCG AGCACGTCCCCTTTTTCAATATAGACACTACAGGTATCCCCTTGTTTCAT TTATGTACTTTGCTTATGATCTAGCATTATATTTTGTACAAGAACGTTAT AGATGTAAAGTCAGTGTTGCATCACTGTAATTGAAATATGGTAAGTTGAT TGTGGCTGGATAATTTTCTATTACGGTATCAAAACAAGATGAAAATAGCT AGAAATGTAATTTGATAGGATTCTGACTAAAGCCATGCAGAGATTCCATT GGGAGGTAACTATATTTGCCTCGATGTTAAACATTTTCCTATTTAAAGTA TATCATACATTAATGCTACTCTAGTCCTGTATAAACCATATGGCTAAATA ATACCGTGATTCAGTTCGAATTTCGCATGTCTTTTGAATATGTTGCATCA TGCCTAATGATGTGCTCACTTGCGTCTATTGTTCTTTTGGTACCCTCTTT CAATAGTGAGCAGCAACCCTTACGATTGAATCCTGCTGAAATTTCGGAAG TCATAGCTGAAGTTTGCTCAGAAACAACTTCAAGTCAGTCAAATGCTGCA TCAAGATTGACCACCCAGAGTCGGCAACCTTCATCAGATGTGGCATTCAG TGTCCTCATTAAACTTGTCATTGACATGTATATAATCTTAAAACCTTTTC ATTCTTTTTTACCTCCAGTTCATACATTGTGTTTGCAAATCATTTTTTAG TTTTTCTACTGCTGGTTCCGTTATTGGTGGTATGGGTGCAGCATGACTCT TTGTACTTCTATACATGTTATTACTGCTGATATCAGGCCTGAACAACCTT TTAATTAACTGACAGTATATTTCTTTACTAATGGCTGATTTCAAGTGCAA AACATATGCTTTAATGCCAAATATTTAGTACATTACTATCTTTGTGATCT GACCTGCCACATTCTCATTGTTGATCCGAATTGTTTATTGTTCTGCTACT TTTTTTTTCCTTTTATAACAATGTCTCTTTTACTTGGGTTGTCAGCAAGC TGTACGCTTTGATGTATGTATACTTAAGTTCCATGTTTGGCGTATTTCTG TTATCAATTAGTAGTTCGAGTAATGAGCTAAGCAGCATGAGGGTGTGTTC ATAAAAGAACAGTGGTTGCAAGATATGAGCAAATATTTGTTAAAGAATAT AGAACTACACTTATTTAGGTTTGGTGCTAATTGCTAAAGCTTACCTTTGA AACCATAGAACTGCACTTGCTTAGATTTTTGATGATTTTGTTTATTTTCT TTGGTCCAGGTATATGATGGACTCTGAGGCTGCTGCTCCTCTGACACTTT ATATGCTCGAGGTGTTGTACTCTGCTCAGCTGTACCCAAACAGAACATGT GAACTAAATCTAACATTTCTTTACGTGTCAGGGCATGCTAAGTTCTCAAA AGTCACCTGCCAGAACAAAGGCTTTTGATCTGATTCTAAACCTTGGGATT CATGCACACCTGCTGGAGCCTATGATAGTTGAAGATCCACCACTTGTTGA AAAAAGTGAAACTGCGAGTAACTCTTATTTGAACAATGAGTATGTACCAA GTATGGAGGAACAGAAGGCAGCAGAACCTGAAGAAGAGCAGAGAATTAGT CCTGCTATTGATCAGTTTGAGTCGTGGCTTCTGAAAATACTATTTGAAGT TCTCCTTCTCCTAGTTCAGGTGGTTATTACATTTAGAATATTGAACTTGA TATGCATTTTGATAGTTATATGGACCCTCCTCTTAAGCCTAAGGGAAGGT CTGTGCATTATATTCATTTATGTGGACGGGCAAGCATGTTCACACTACAA CATGTACGTAAACTGCTGCATTTTATGCTTGGCCGATACACATGATAGCT TTATTTGTTATTTTTGGTCTTGTAGATGGAGGAGCGGCAGGAGATCGTGT GGGCGTCAGCTTTGAGTTGTCTATTTTATTTTGTCTGCGATGGAGGAAAA ATCATCAGGAGCAGACTTGGAGGTTTGGACATAAGGGTAATGAAACACAT CTTTGTTCATTTATTCATTCTTTGAGTCGTGCTCTGGACCCTATCTGCAA CATTTGTCAATCCTGACTTGCCTTTGGATTATGTAATAGTGTTGAAGACT TCACTTCAAATATAGGAGCTGTAGTTGAAACTGTACTCCTTTATGTCCCA TTAATGCTAAACATATATGAGTTGAGCATGTGGTATGAATTTCTACTTAC TAGGCATGGTGTGCACAAATTTCTGCTTACTAGGCAAGATGTGCATAATT TTTTTATTCATCGCTAATGGAAAATAAAATTAACCAATAGCAGTGCTACT GAAATGATTTAAACCTACATGTTTGAGTATATCGCTATTGGTGTTAAAGT GTTTCTATTGTACGCGTGAAGAATGCTACTCCAGCGCAGGATTTTTCTTT CGTAGCGGTCTGTGCAATGCACTTGGACTACTTTTTTGTATGTAGTCACA CATTTTTCTTATGTATTTGACATTTGAGCCTGTTTGATCTTCATCTGGCA TAGGCTTCTAAAAATGTATCATATAGTCTGTTTGCTTATAGCAATTTCTG TAAAGTGAGCTACTTCTTGCTGACAAAGAAGGGTCTGAGAACCACTTATG CATATTTTAATCCTGAACAGGTTGTTAAAACTCTTCTTGAGATCAGTGTG GAACACTCATGGGCAAAAGTAGTGCACAGCAAGCTCATCTGCATGCTGAC AAATATGCTGTACCAAGTACCAGATGGAACTCAGAGTGGCCCAGTTGATA CACAATTTGTTCCCGAGCGGATAGATCTTCTTGGTGGAGTTGACTATATC TGTCTCGAGGTTAGTGCTACTCTTATGTTTGTTGATGGCTGTTGACAACT GAGCTTTCTATCTATTTGACTGCAATATATTATAATCGTTGTATCTAATT TTGCAAACACCACAAGGATTATGAATCACTTGCTCAGTCGGTAAGTAGAC CCACTGGTGGATCACTGTCATTCTGTAGATTGTTTCCATCTGTAGTTAAT CTTGCCTATTTCATTCTGGTACTGGCTGGAATATTTCATTCCGGTCAATA AAATTCGATATCAAAGACTAATTTTCATGTTGTGTCAAAAAAATTGTTAA TATAGTCTGGAATATACACGGGATCAGCTAGTCAGTACCAAGTGGTGAAT GGTGACTGCAACAATATGTGAATTTTCTTTCCTTGTAGGTTCACACTGAA TTCCAGTTCAGCATATTGTGCCACCCATTATTCTGAGCTCCCAGAACCTC AGACAATGGGATTTTTTTTCGCAGAATACAGTTCTTTCTGCATCTAGTAT CCCACATGTGGATGGTAGGGTGAGTAACCTAGAAAAACTAGATAGGTGTT GCGTTCTTTTCTAGTGGACAAAGTTTATTCAATCATAACATCAACAAAAT GTGTGCCGATGGTCACTACTGTCTCAAACCTATGAATTCTTAATTTCTTA TGATAATAGATGATCCTTAAATCTTACCATGAAATGCTAATCCATTTCAG TATCCATTTCTGCTAATGATGATGGTATTTTTTCTTAACTTAATCAATAG GCTTCAGATATGCTATTTTGTTATACCTAAGTGTTAGTATATGCAGTGAA TTTATCTGTATCACCTTTTCATTGACAGTATTCACGGGCCAATTCGAAGG AAGAGAAGCGGGATTTGTTTTTTGTTCTTTTTGACTACGTAGTGCATCAA ATAAATGGAACATGCTTGGCTGGTGGCCTTTCCACATATACTTATGATGA TGCTCAGCCCCTCGCTTCCCTTCTTGCATCTGCTGATGCTCCAGAGGCCT TCTATATATCCGTGAAGCATGGTGTTGAAGGTGTTGGGGACATGCTTACA AAGGCTATATCTGCGGCATTAACACAGTCAGCAGAATATGAGCAATTACA TGTGGTAATGTGGTCTTCCCCAATCAGGATAACTATCTATTTTTTATGAA GCTAGTAGCAGACAGTGTTTTTACGTCAGAGTAGACAGTATTAAGAGACA AATTAGTAACTAGTACAACTGTAGAGCCTTGGTTGAATTGGTCTTTTTAT GTCACAAAAATAGAATGCATGTAAAACATCATGTCCCAATTTGCATGTAG TAAGTTGTATCAACAACATTGAGGGCTCCTGTAATCAAATATATAGTGTA TATCATGTGATGGTTCATACACGTGCACACAAATAGCCAGCAGTCATCAC CAAAAATCCCCATTTACTTTAATTAACCAATAGATCATGCAATATGGTCA TATTTGTGTTTCTCATGTTCTGTTTGACTTTGTTTCATGATAAACACTGC AGTATATGTGAAGATTCTCTTTTATAAAGCTGCACAGAATTCTGAATTTT ATTTTTGAAATACCATTTACTGTATTTGTTTTGATGAAATTTTCATTATT TGTAGCTTCTGGACAAGGTTATCAGGAAACTTGATGGAACTGTCAGCACA TTTTCAAGGATTGACAGCGAGTTTGCTTATATGATCGAAGTAACAAAATC CTTCAAGTGTTTCAGCAGCATTAAAGATGGATCTGAAGATGGTGATGTTG CATGTAGAGCAAGGCTTTGCTGGGCTACTTTGCACTCACTTCTTCACTCG CAAATTTCATCATACAGGCACCATGGATATATTTGGTTAGTTGAGTTGCT CCTCTCGGAAGTCAGTGAAGAAACAGATGGCTCTGTTTGGTCTAAAATCC AAAAGCTCCAAGAGGAAATTAAAGATGCCGGAAGCCAAGACATGTCATGT TCAGAAGTTTCACTGCCCGTTTGTTTGCTATGTGGGCTTCTGAAATCAAA ACACAACTACATTAGATGGGGATTTCTATATGTTTTAGAGAAGTTTCTGA TGCGCTGCAAATTGCTATTGGATGACAGTGACATGCAAGGGCACTCAGTT TCTTATCGTAGCAGAAACCGTCTGGACAAAGCTTTTGCGGTTATAGATAT TATGAGTACTGCTTTGTTACTCGTGGTTCAAAATAACGAGACAGATCATA TCAACATCTTAAAGGTGATTTTCTTTCACCTAAGTCCAGGTGTTTGGCCT TTGCACTGCACTAGCACTATTTGTGAATGTTAAGAGTTGCTTTCTTAAAA AATAATAGTGCCTTCTTTGGTGTCCTCCTGATACACAACGACCAAATGTG TTTGAGAAAGAAGTTCCAAATTAGTAGTTTCTGTTGTCTGGCTCGTACTT TGTTTCTGTTGTGAACCTGTTATTAACTGGACAGCTTCTCTTTGTTTTCT ATGGAAGACAGTCATTGAAAGCATTGGAACTGCCTGGTTCTAAAGCTTCT TCAGTCTTAGCAATTAGGATTAGTGTGTTTATGCCAATATTCTTGCATGC AAGAACTTCATAGAAACTGAGCATCACATTTTCAATTTTTGATTCCTACC TGACTCCCCTGATTAAAGAATTAGCATTCTCTACATTCAGTTAACTGCAA TAGTTAGTTGATCTACAACTAGTTTAATTGCTAAGTTAGTCGATCATCTC TTGGCCCCCCTGTTTAGTGACATGTCTAAATCAACAACTATCAGTATTCT TGAGTTTTATGATTTTATCCTCTCTAATTGGAACTTTCCTCGTACAGATG TGTGACATGTTGTTTTCACAATTATGTCTGAGGCTTCCGTCCACAAATGT GATGCAAATGGGTGGACTTCAATCCCTCGGTCAACTTTTTGGCTGTACAA CTAAGAACATCGAGAGCCATTTGGAGACCCTTGGATCACACCCAACTGTA GGAACAAAGAAATTTTGCAGGAACGAGACGTTGCAAGATACAAGTATGAA TCAATCAACTCAATCCACTTTGCTCTGTGAAACATCAATGGCAGCACTAC TTCTGAAAGGTCTTGCGATAGCTCCGATGCAGCTTGTAGCCCGTGTACCA ACTTCACTATTATTCTGGCCATTGATGCAACTTGAAGGCGCTGCCAGTGA TGATATTGCACTTGGTATTGCTGTCGGTAGCACAGGAAGAGGCAATATTC CTGGTGCTACATCAGATATTAGGGCAGCGCTTCTTTTGCTTTTGATTGGT AAATGCACAGCTGATCAAGAAGCACTTACGGAAGTAGAAGGCAACGAGTT CTTCAGGTAATCTTTTGTAAGCTGCACATTTTTCGTTTACAGTGTGGTGC ATAGCTAATGCTCGATGTTTGTCCCTTCTCCACTCGACACCAATAGGGGG CTTCTGGACGATACAGACTCAAGGGTAGCATATTATTCCGCTGCTTTTCT CTTGAAGGTATGCTTGTTGCAGTCGTTGATTTTACTTGCTTATAGTTCCA TTGTACTTGGCCCTAATTAAATTTGGTATTGCAGAGGATGATGACAGAGG AGCCAGAGATCTACCAAAGGATGCTTCAAAGTCTCATTTCAAAAGCTCAA CAGGTTGACACTCTTTTCCTATCTCATCTTGTCTGGGTTAAGTTTGAATA TTACAGGAATATTGTTCGCATGCACCTATTATCTAGACTAGTTCCTGCTG TCATATTCATGCAGTTTGTCTGACAATAAATTGAGTTTCATGCATGTGTT CTGTGTCTAAATAGAACTGGCACTGACATTTCATTTTTATGCTGTCTCCA CAGTGTAACAATGAGAAACTTCTGGAGAATCCATACCTTCAAATGCGAGG AATATTGCAGTTGTCAAATGATCTAGGAGTTCAATAACCACTCTGGTTTG ACATTTAGATGTACAAAGCTTTCAATGAGAATTGATACCATCGATCATGT TTATTGCAGAAGAATTTGTATCTGAATTCCTCTGCTCTAACTATGAAAAG GTGCGTGCTGTTAAATTCCCCCCCTGTCTGTTCTCCCTTTTTACTTTATA CTCTGATGAGGATGCTAATGCCTTTTGGCAATTTTGCAGGTGTTTTGAGT GGATAATGTAAATTACCCCTTCCGACTGGATGCATGAACATGCTTCCGAA TTTCTTTATTCTTTATTAGATCTGAATCATTGGATCAATATCCATCTGGG GCTCACTGTCATTTGCAAGATAGAGTTTTAAGATCATCTAGTTTCCTATC ATCGTGGCTATTTCAGAGAAGTGACGACTGAGTTAGGATTGAGGTGGTGT TCATAAGGGTGACAGCTGCAATTTTCTGACGCAGCATTGAGATCGAGCCG GCGCAACTCTTTTTTTGTGAGGCATGCTCGGTCCAATAACGGTAGTCTGT ATGTGTGTTTGCTTTACCTGCCTATCCGTTGTAAGTAACGAAGGTATAGA TGTTTGTACTGCTAGTGTAGTTGCTATCTGGAAGTAGAGTGAATTTCCTC ACAATTCTTCTTGATTCATAGGTCTGTACTGGGCTAAGTGTAAATG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.