Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008001

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008001
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008001
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGGTGGGATGCTTGTGAACCTGCTGCAGCACGTTCAGCAGCTCGCCAT TGGCGGTTCGGATGGTCGTGAGAAGGCTCAGCATAAGGCTCTGTGGGAGG TGCTTGTCCAGGCAGACTTGGTGTAGTTAGTTATTTGGAATGTTATGTAT GGTATGTAAGAACATCTAGTCTATGTTTGCTAGTTCTGGACATGGTAGGT ATGATCTTCTGGTGCACTTTGCTGTGATGAAGGTGCTCTTTTGCTTTGGA TGTTGTGAACAATCTAACGTTTTAGTTATCTATGACGGTATGAATCTGTG CTGTTAAAATGTGTGTGAAAATACCTTTTAGTTTGCACTTTTGCCATTAT GTTTGAATTTGTTATTTGAAAAATATGTAATGTTTTTTGAGAAACACATA TGAGTTTTGAAATTATTTGATTTGAATTGAAACAGAAATTAGAATTGAAA AAACGAAAAACAAATAAGAGGAAAAAATAAATAAACGTACCTGATAACCA GGCCCAGCGAGACAATCTAAGCACTGGGCCAGCTCCCGTGCCCGTGGCAG CTCAGCATCGCTGTGGGCCGGCAGTAAATCGGCCCGTTTACGCGTGCTGC CCGCGGTGCCGATGAGGGTGGGAGTTTTAGTCCCACCTCGCTAGTTGGAG GCGAGGAGGACCAGCTTATATACCCCGTTCGATGCTCACCCTCGAGCTCC TCTCAAAAAACAACTCCGATTCACCTGCTATCCTGTCCCTGTAACGGGCT GACCTCTGGGGCCACCAGGCTGTACTACTCTGGTCTAGTTCGCTTGTAAT GGGCTTGAGCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAACCTCCAGAGTGTCAAAAG TTTTTTTATGATTTTTTTTGCCAATTAATGTACTGCGTATGTCGGCCAAA ACTAGGCCTTTAGGGTCATTTTCACATTTTTTTTAGTCATACGCGCAGCG ACAAATATGAATTTTGAATAAGAAAACTTATAAATTTTGAACAAGCAAAT TTTTTAATTAAAGCTACATAATTGAACAAGCAAACTTATAAATATTGGCA TGGCATACATTTTATCTTTTGGTGTCTGTCAGCAAGGATGCCTTTAAATA CCATTTTCCATTTTAAAATTCAAAATTCAGCTATATTTTGTGAAGGAAGT ACAAAATTTATAGTTGAAACCTTTGTTTCACCAGCATGTTTAGGTAGATG GGGACATTTGGTGGGAACATAACCACTTTGGTGGTCTTTAATTTCTACCT TGTTTAATTTGTAGCACAAGTCAAAGTTTGGTCAAATATGAGAAAACATG GAAAATTTGAACTATAGCTACACATTTGGAACCTGTAATATTTTGGGAAA AATCATTTTTAGGCCCACAGGATGTGGTTTAACCATGGATCTATTGGTAG ATCAGCTAGGTTCATCCCTATGGCTACTCGGTGTTCGACGCAAAATTTGA CCAGACTTTGACCTGACAGTATAAAATCACAAAAAATCAAAAAATAGTGA AACCTTGTCCATTGGTCTTAGATTGTACCCTATTTAGAATGAAAAATATT AAACCTTGAGTTTGTGGAAGCAAAGATGAGTTTGTTGTCTCACTCTTGGT TCCAAGTGTGAGTCTCATGGGTGTGTACCCAAATTTCATAGGACATGGCC AGCTCCATGTCATACTTTCTCAGAATGGACTCAAACTTGGCAGGGAGGTG TGTCTTGGCATGGCATACATTTCATCTTTTGGTGTCTGTCAGCAAGGATG CCTTTAAATACCATTTTCCATTTTAAAATTCAAAATTCAGCTATATTTTG TGAAGGAAGTACAAAATTTATAGTTGAAACCTTTGTTTCACCAGCATGTT TAGGTAGATGGGGACATTTGGTGGGAACATAACCACTTTGGTGGTCTTTA ATTCCTATCTTGGTCAATTTTTAGCACAAGTCAAAGTTTGGTCAAATATG AGAAAACATGGAAAATTTGAACTATAGCTACACATTTGGAACCTGTAATA TTTTGGGAAAAATCATTTTTAGGCCCACAGGATGTGGTTTAACCATGGAT ATATTGGTAGATCAGCTAGGTTCATCCCTATGGCTACTCGATGTTCGACG CAAAATTTGACCAGACTTTGACCTGGCAGTATAAAATCACAAAAATTCAA AAAATAGTGAAACCTTGTCCATTGGTCTTAGATTGTACCCTATTTAGAAT GAAAAATATTAAACCTTGAGTTTGTGGAAGCAAAGATGAGTTTGTTGTCT CACTCTTGGTTCCAAGTGTGAGTCTCATGGGTGTGTACCCAAATTTCATA GGACATGGCCAGCTCCATGTCATACTTTCTCAGAATTGACTCAAACTTGG CAGGGAGGTGTGTCTTGGCATGGCATACATTTCATCTTTTGGTGTCTGTC AGCAAGGATGCCTTTAAATACCATTTTCCATTTTAAAATTCAAAATTCAG CTATATTTTGTGAAGGAAGTACAAAATTTATAGTTGAAACCTTTGTTTCA CCAGCATGTTTAGGTAGATGGGGACATTTGGTGGGAACATAACCACTTTG GCGGTCTTTAATTTCTATCTTGGTCAATTTGTAGCACAAGTCAAAGTTTG GTCAAATATGAGAAAACATGAAAAATTTGAACTATAGCTACACATTTGGA ACCTGTAATATTTTGGGAAAAATCATTTTTAGGCCCACAGGATGTGGTTT AACCATGGATCTATTGGTAGATCAGCTAGGATTATTTGGAAAAAATTATA TGGGTTTGAATCATTTTAAATGTAACTTGGAAAAAGAGAAAATACCTAAT CATAGATAAATATTAAATAACAAGAAAATTATAATTGAGTGGATTTAATA ACACAGTAAAAAATAATATGAAACCTACTTAAAAGGTTTCGTAAAGGTTT AAAATCAAATTGAGTTTTGAAATCATTTGATTTGAATTAAAACAGAAATT AGAATTGAAAAAACGAAAAACAAATAAGAGGAATAAATAAATAAACATAC CTGATAACCAGGCCCAGCGAGACAATCTAAGCACTGGGCCAGCTCCTGTG CCCGTGGCAGCGCCGCATCCTGGTGGGCCGACAGTAAATCGGCCCGTGTA CGCGTGCTGCCCGCGGTCCCGATGTGGGTGGGAGGTTTAGTCCCACCTCG CTAGTTGGAGGCGAGGAGGACCAGCTTATATACCCGGGTCGATGCTCACC CTCGAGCTCCTCTCAAAAAACAAATCCGGTTCACCTGCTATCCTGCCCTT GTAATCGGCTGACCTCTGGGGCCGCCAGGCTGTACTACTCTGGTCTAGTT CGCTTGTAATGGGCTTGAGCTAGGCCAGTGTGTGGAACCCAACCTCCAGA TTCTCAAAAAAAAATTCATGTTTTTTTTGCCAATTAATGTATACGTCGGC CTAAACTGGGCCTTTAGGATCGTTTTCACATTTTTTTATTCATACGCGCA GCGACGTGGTGGGTCAGATAGACACGACCGCGTCGTGGCTACATCGTCGC CCTACCGCCGTCTTCTCTATCCCAGTTTACAACCGTGTTTCGCGTTGACT CCTTCGAGGAGCGGCCGTCTATACGTTGCAGCGACTCGGCGGAGTGCGCC ATTCGTATAACGGCGGCGCGCGGGAGAAGTACAGTGGCAGCGCGCGGGAG AAGTACAACGGCGACCGTCTCAGGTAAGATCGCATGGATCTATGATCGCA TGCACCCTATCGCTTTGTGCCTAGATCTATGATCATGCTGCAGATCTATG ATCGCATGGTTTCGCGGTGTGCAGAGAGGGGTTGGTGGGGCCGGGGGACG TTTTGATCTGTGGCGGCGGAGGTAACATGGTAGGGTGCAGCGGTGGTGGG AATTACTAGGGTTCCAGGGGGACGTTTTGATCTGTGGCGGCGGAGGTAAC ATGATCGCAGGGTATGATCGCATGGATCATGAGCAGCTGATTGAGTTGGG AGTCAAGCCTGACGACTCTTTTGGTTTTCCAATATGACCATGACGATAAG TTAGAACGAGCATACTTATTTTTTAAATTGGCATTGTTTACACTTGTTTT TAATGTAGACTTTTGTTCCATTTTTTCTTTATGCCAACAATTTATTTTAC ATAGTATAAACACATGCATGCACTAAGTTGACAATTGTTTTTTATTGTCA TGTTGATTTTTCATGCAGCGTGATGGAACTGGATGGTGATATTGCTTGCT CTGTTGAAACATGGTGTAGACTTGTGGGCAATTTTACAAGTCAACAACGT AGCAAATTTTTGGAATCAAATATTCGAAGTATGTTACAAATTCCACCAAT TCGGATGCGAGTTGTCTTGCTGCAGTACATGTTTCAAATTTATGATCATG ACTCTAGCACTTTTGTCCTGCATAATAAAGGCAAATTTGCATTGACTGCA CAAGATGCAGAGTGCATTTATGGATTACGAAACTATGGTCTGTCTGCTAA TCGTATAATTGATGAGGAAGGTGAAGACGGAAAGTCCCGTATTTCACCAC ATTTTCTCAGCGCAACTACTGGCAACATTGTTATTGAAGATTTAATAGCT GATATTGTCATGAGCAAAGCTGCGGACGATGACTTCCTCCGCAAATCTGC CCTTGTTCTCCTTGGTACAGTTCTGGCGCCTATGACTAAGAGGATTGTAC CGAAGGATTATTGGATACTAGTGGAGGACATAGACCGTATGTCCACCATT AATTGGAGTGAGTTCACGGTAGATCATCTCATGGTATACTTCAGGCTTGT AACTAGATATAAACAAATTAGGCAGTGGCCTAAGGGAAATTTGTCTTTAA TACAGGTATTAAATCTGTTCTCAACATTATTTTTAATATGGTAGTCTTCT CATTTTATGATGCACTAACATTACACTTGGTTCACATACAGTATGTTTAT TGGGAGAAGGTCAAGCATGTAGATGATCCTTGTAGGATAAATCCAAGTTT GTCCTTGAGACCACTCATGCGTAATTGGACAGATGATACTGCTAGGATCA GGGATACAATGGACTGTGATCATGGTCGGGGTGAAGGACCTATTCTGGTA ACGATCCATGTTTCTAATATCATCTGTATATATATCATGTGGTTATGTTA ACAAACTTACGCCTCTAGTTTGATTAATAACATTGAGTTCTACTAATGTG TATGTATCAGGTTGAAGATAATATAACGTTGGAGTATAGGATTGAAATGC TAAATAAACCGGCACCTGTTCTCAAGCCAAAGGCAAGTTCGGCTAGGAAG GCTGTAGCCAGAAATTCAAACCAAAAAATTACTAAAAACGTGCAGGAGGT ACTGACGGAGTCTATGATGGAGCGAGTGATGGATCGAGTGATGGAGCGAA CAATGAATAGGATGGAGTCAAAAATGGAGAAAATCGTCAAAAAAATGATG GACTCATATGCACAGGTAATCACCATGTTATTGCATGTACTATTGGGAGT TTCTATTTTTATATTTGATAGCCTACGAGTACATTATATATTTCCATTTA ATTTTTCAGGAACTAATTGTCAAGTTGAATAAAAATGTCATTATGTACAA AAGCAAAGAAATTGAAAATGGAGATGACAACCTATCATTGAATAATGGAT CCTCTAGTACGGGAAAAGAATTTTGGTATGGGAAAGAGAGTGCAGGTGCT TATGCTGATCAGATTATTAAGGAAACTATTGATTCAATGAAACACACTGG GTTGAACGGTAATGCAACGCCCGACGATGGCGCACATAAGGATGGTTGTA AAGATGCAATAGGCAGCACACCTTCCAACCCAGAGTTAGTGCTTGATATT TCTACAAAAGCCGTGTCAGACCTTCCATCGGAAATGTACGGAATTAGCAA AAATGGGAAAGAGCTGGATGGAGCAACTGCGTTAGATGATTCCAACAACA TCGGTAGTAAGTTGGACGTTAACAATGAGCCGGAATAAGGTTTGGAGAAA CGTAAGCGCAAAATTTCTACAAAACTTGAAGGTTTCGTGGGATATGAGCC CCCCAAACGTCGTGCACTTAAGAAAGGTACTCCCTCAGGTTCAGTTTACA CGACACCTTTTATTTTTCATGCAGTTTCACTAGGAATGCTGGTTTAGGCG CATAGTCAATTACTGAATAATTGTGGCGTTTTAGCCTACTACTCCCTCCG CTCCGGATTAAAGGGCCCCTAGTGATTTTGGGGTTGTTCCGAATTGTATT GCATGGAAGGCGAGAGAAAAATTAATTAGCTAAGTTATTATCCTCCTAAA AACGCTCCTGTCCTCTTCTTTTGAACTCGAGCATGCATTGCCAGCATGCA GAGGTGGAAACTGTCGCATGCAATGTGAGAAATCAAGCGAGCATGCAACA CACTCCATTTACACGAGCATGCATTGTATGTGTACCTACTAATTACATCT GTATGTAGTTCTAACGAGTTTTTTTTAACCATTTTCATAGGATTATTTGT AAACCAAGATGATGATACACGAGTCCTGAGTGCTAAGCAAATACAAGCAG CCGTGACATTGGTTGAAAACGCATGTAAGGATGAATCGAATGGTAAAAAA GTTGTTTACCAACATGCAAATGGAATTATGTTGAATTCATTAAAGCTTAA AGATGTGTTGGACTATGAGTGGGTTAGCGATCGTGTAAGTTCTACTATGT TATGATTATTTTATATCATGCTAATACATAATAATGTTACCACTCTGATA AAATTAATTCCTCTTATGGTTACAGTTAATAGACAGTTACATTGGAGATT TGTCACTTCGTGTGGGACATGATCGGTACCTTTTCAGTGCATTAAGAACA ACGTTCCTTGTGAATAAGGGTACAACTTTGGAAGAAGCGAAAAAATCCAA GCATAACATGGACTTCACTATGTCCAAAAGTGGCTCAATTGGAAGAGTCA TGGATGAATATTTCTTGCGAAATAAGGTAATTAGAACGTACATCATTTGT ATGTTGAAAAGTGTTTTGTTGATTACATTCTTCAATTTATGTAGGTATAT TTCCCTCTAAATATAAATGACGCGCATTGGACGACAGTAGTCATGCACAT ACCGAAACAAGAATTTCAAGTTCTCGATTCTTTGTACTCTTTATCTACAA CGAAGAAAATAATTGAAACAATGGAAATTTATTCTCTTAACTTTATCATG TACTACCTTAATACTTGTGTACATTACAATAATTTTTGCATTTTTCAGAG ATATCAAATAGCGTATGACATAAAACAAACTAACATGATTACAAAATCAC AATACCCCGACGTATCAAAATGGCCTATAAAACGTTATGAATTGGCTCGG CAAAGAGATGGGTGAGTTTAGTTTACTTTTGTTTGCCTTGTATATTTCAT GTTATCCATCATGCAAAATAAAATTAGTTCTTGTGCTGTGTCCCAGAAAT TCATGTGGCTTATTTGTGTTAGAGTGTATGGAACACTGGGATGGCAATAA AATGACTAGGGAAATTTCGCAGGTTTGCATATTCTTTTAACTATCACTAC CCGACCAGCTGTACCAAAAATATTTGTACTTACTTAGATTTGTCAATGCA GTCCACAGTGAATGATAACAGAAGACTGAAGGTTGCTCAGATTGTTCTGT CCCCTTCAAACATCTGCACTGTCAGAACCAAGGTTCTTGAGGCGGCCAAA CACATGAAAACCTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.