Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA033212

[Submit comment/correction]

Sequence	AA033212
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA033212
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CAGCACTCGGGCACTCGGCTAGCCAAACCGTCGCCGCTGCTCGACTCGTC GCCCTCGCGCCGTGATGATGGCCATGGCGCTACTCGGCGGCGCCGTGGAG ACCGTCGCCGCCGTGAACCCTCGTCCAGACTCCGCCGCGGGAGCCGCTGT GATGGGCGTCTTCAAGTACAACTTCGGTGCGCCTTTCTCGCCTCCCTCTT CCCACCCCCCATCCGATTCGAGGGTTACTTCTGGGTGCTTGGTTTTGGGG ATCTAAAGCTCAGTGCTCGTGTTTATGTGCCTTGCAGCGGCGCAGTTCCT TTCGAGGGTCATCCCCTTCTTGTATAATGGCTGGTTCGTGCGGCAGCTCA GCGCCGACGACTGCGCGGTGCGGATCTAACCTGCTCCTTTCTCCCATCTG AGTTCAGTGCAGTGTGCAATTGATATGGCCATTTCATTGCTTGATGTGGA ATTGACTGAATTTGGGGTGGTGGGTTCGGCGTGGAGCTTAGCATTAGTGT ACATTCAATGTGATTTTTATCTTTTCTTTACTACTATGGTTAAGTCGTGT CATCAGTTAATGCGTGCAGTTTTGATTTTTTTGCGATGCTAGTATGCTTG GAACTGGAACTCTGGAAGTTGAAAAGCTGGTGGTCTGTCCTAAAGTAGAG GCGTGGAGTGAAGTTCTAATTCTAATAGCAGCCTTGTTTGACTTTTGGCG AATTTTGTGATAATTAACGGCACTCTAACATTGTCATTTGAGCTGCAGCA AATTATGTCATCTAGTTGATCACATACTGTAATACTACTTCCCCTCCAGA AAATAAGGTGTATACATTTTCTGAAAAATCAAAGGGTTTCAATTTCGACC AAGTTTATACCAAAAACCATTTTTATTAGAATACAATGTAGATACAGTAT GGAAATATATTTCATAATGTATCTTGAAACGGAGGTAGTAATCAAAGTGG GTGCTTTCAATTATTCGAGTCATCCATGTATTTACATTGTACTGCCTCTT TGCTATTGTTCGTTCCTTGTATTTTTTTACAAGCTAGAATTTGCGCCGAT CTTTTCATTTTGATGAACTTTGAATACACATATATTTTTTAAGCATTGAT CCTTCATTGTTTGTGTCACAAGCTCACTATAGTTTACTAAATGGTGATTT TGCTTAATCAGATGTACCTTACATAGGGCTACCGTACTTGGTGACTAAGG TCTTAAGGCAAAAATGCTATGGGGATTTCCGTATCTTCTCCACTTGCAAC TGGGTATGAATGATTCAGTAAACATGAGCGACAGAATAACTTGATCACAT CACTGTGCTCAACAATTGATCCCTCTATGCAGGGTTTGAAAAACCAGCGG TTATCACTCGGTAGTCGGTAAACCACAACCTTTTTTTTTGCGAAAACGCA AATCCTTTGCGTTTCGATTCATTGATAGAAAAAGAAGTTTGTACAAATAT ATACAAAGCTCAGAAGAGCTAGCAACCCATACAACTCACCCCACTAGACC TATGGGATCGCGGGGATCAAGGCGTGGAGGCCTTTCACGCCGGCAGTCCC CCAAGATCGCGCGTCGGTCTGAATGGTGGTGAGAAGACGACCCAAGTCAG GCGACACATGGTCAAACATGACCGCATTGTGCTGCTTCCAGATCCACCAT GCCGTCAACATGATCAGCGAAGATGTCCCCTTGCGCATGGCACGGGGGGC GGACAGCACAGCGTGTTGCCACTAGTCCACGAAGTCGTCTTCTCCATCCG GAGGTAGGATCGTGGATCGTGTCCAGGATAGAACCTCATGCCATAGCGCC CGGGAGAAGGGGCAGCCAACCAGGAGATGAGACATCGTCTCCTCGGTCTG GTCGCACAGGGGGCAGTTTTGCGGGTGCGCGAGTCCTCTTCGTGCGAGCC GCTCAGCCGTCCAACAGCGGTCTTGGCAGGCGAGCCAAATGAAGAATTTA ACCCGCGGGGGTGCCCAGGTGTGGCAATTAAGCTTCCAAGATCTCGAGCT AATCGATCCCTGGAATAGGAACTCGTAGCAAGACTTGGCGGAGTACTGCG TGTTCGACGTGTCAGGCGACTCTGCGAGCTCGACTCTACGCACCCGGATC CATAGCTGGACATACTGCCAGAGGGCAAGCGGGCTCAGTGCGCCTCTGAT GTCAGCTATCCAGCGGCGCTCCACAAGCGCCTCTCTCACCGTGCGGCGCT TCCTAGCGCGGCTGGGTATCAGCGCAAAAAAATCCGGCGCTATCTCTCCA ATGGTCTTCCCGTCTAACCATCGATCCATCCAAAAGAGAGCCGTGGCCCC ATCGCCTATCACCATCGTGGTAGAGGCGTCGAACACCTGCAGCTCCGCCT TGGAGAAGTGCATGTCTAGACCTCTCCAAGGTCGCAACGGATCCGTACGC ATCCTCCAAATCCAGCGCGTCCGAAGGCTGATCGTCATGCGGGAGAGGTC GGGGACCCCAAGGCCGCCAAGGCATTTGGGTCTGCAGACCTTGTCCCAGT TCACGTGGCAGTGGCCTCCTTTGGCTTCCGCTCTCCCGGCCCACAGGAAG CCCCGGACAATCCGTTGGATTTGTTTGAGCGTCTTCTTGTTGAGTCCCAA CACAATGATGTGGTGGAGGGGGATCGCCATGAGAACCGACTTGACCAGGG TAAGGCGTCCAGCCTTCGCCATCATCGCCGCCTTCCAGGTGGGCAAGCGG TTCGCAATGTTGTCGACCAGCGGCTGAAGCGCCGCCGCTGACAAACGCCG CAGAGAGAGAGGGATCCCTAGGTATTTTACAGGGAAGGGTGCCACCTGGC ACTCCATTGTCCCTGCTGCCAGCTGAATCATCTCATCGGTGCAGGCAATG GGTGAGAACGAGCACTTGGTGAAGTTGGTATGTAGCCCTGATGCCTCCCC AAAGATATCCAACAGCGCGCGCACGGCGTGCAGCTCAGGTTCATCGGGAT GGCAGAAAATCAGCACGTCATCCGCGTAGAGTGAGACAGTCGTCACCAAC TCTCGGGAGGCTACACGCTTCAGCACTCCGAACTCAAGGGCTCTATGCAG CAGCTTGTTCAGCGTGTTGATAAACAACACGAACAACATTGGCGACAGAG GGTCCCCCTGTCTCAGGCCCCTCCTATGCTATATGGGAGGGCCTGGCTCG CCATTGAGCATCACCTGGGTGCTCGCAGTCGACAGAAGGATGGCCACCAG CTCACGGAATCTGGGACCAAACCCAGCCTTCTGCAGGACCTCGAACAACA GCGCCCAGGAGACGGAGTCAAAGGCCTTGGCTATGTCTAGCTTCAGCATG ACTCGCGGTTCCCCCAGTCTGTGCAGCAAGCGTGCTGTCTGCTGAACCAA CATGAAGTTATCATGAATGCAGCGCTTCTTAATGAAGGCGCATTGGTTCA GATCCACCATGGCCCCAAGCCCCAGGCGAGCCTTGATGCCAACACCTTCG CCCCCAGCTTGGCAAAGATGTGGATCAGGCTAATCGGCCGGTAATCACCC AATGTAGCCGCATCCGCATGTTTGGGCAGCAGTACTACCAAGGCCTGATT GAGACCTTGGAACCCGCGCCCATTCATGGAGTACAGCTTGTCGAAGGCGG CCATGAAGTCCGCCTTGACCACCCCCCAGCATTTCTGCAGGAATTCGGCG GTGAAGCCGTCCGGGCCTGGCGCCTTACCATATGGCAGCCGGGAGATAAC CTCCCATACCTCCTCCTCCGAGAAGGGGGCCTCAAGGCTCGATAGGTCCT CCTGGATGATCCCGAGGAAATCCGCAACCTGACTGGGTACTGCCTGTTGG TACACAATATTTGTTCATTCAGCCCCCCACCCCCACCCCACCCACTGAAG CCCTCTTTTAATATTTTTTCCTTATACCAATAGGAATACTGCTGCATGTG GTTTATGACCCTTGTGTCGAATATGAATGAAATATGCAAAGTTCATAAAT AAAAATAAAAGAAGAAAAATGACTGGTCTTAACTTTTTTTCCGAGAAAGT GGAACTGGGAACCCTGCATGTTTTTGCCAAAGAAAAGGTTTTGCTGCATC TACGCATACAGATGTTTCTCATTTTTAACGCTGTCTAATATGTTTGTTAT TTATTTGCAGGCATACGCACTGCAGCTTCCTCTTTTCATCAATTGCGTCT TATTTTTAAGCCGAGAAGGGTTTCGGCGTGCTTGTCTGCGTAATAGTTCT GGGAGGTATTACAAATATACGATAACTTTTGAGGCTCATCTGTGTTATGT GATTAATCAGCACCACTGCAGCATTTATATACAGTACATAGCATGTATTT ATTTGAAGGTTTCTCTTTGTCAATATGAGCCACATAAGATAGATACTGCA AATTGCAAAGTTTTACGAATGCTCCTTCCACAGTTTCTTGTCATAATGCA CTATAATTCAGATGTACAGAGTATTACATGACAAGAAGCATGGTGTTCAT TTGTTACACGAAAAACTCAACCTCTAGTGGCGCTTGAGCATGTTTTTTTC TGGCTAGAGAACAATAATAAACAGAGGAAAACAACTTGACCATTTGGCAG GATGATTCAGGAGGGATAGAAGGAATAAAGGGTAAAGATAGTGAGAGAAA ATGCGCCCTCTAGGAGATGCGGTATATTTCTCTTCAAGTTAATAGAGAAA AGAAGAATAAGATTAAGTTTGATGCTATTTTTAAATACAATGTTGGACTG TGGCACCACGACTACACACCGAGGGCCACATAGGACACCTCCTAAAGTGG TCCATGTGTTTAGTGGTGGTATGCTTGTCATATGTTGTAAGTTGAAGGTG TGCAGAGCTAGCATGTAATACTTGTGGATCTAAATGGATAACTTCAGGTT AACTCTTTTAGGAGAAGTGAGGACATAAGCCCAAGCGAGCTGCTACATGT GAGCACAGCCACACCTAGGGGCTGAGCGCTCGAGAATTATGTATATACCA TCATTTTCTGAAGCAATAATGCTCGGTATCATGCTTCTCATAGCTATTTT CACCAACTTGAGGATGGTACATGTGAAAAGTTTTTTGTGATGATGTGTGC CATTCCTCACCGTGTTCACATTTTGTATGTTTGTGAAAATTTGTTGTTTA ATTCATGTTGAAATTTGTATCTGAGGATTTTTCTCCGATCTTGTAATATT TTTCTTTATACATGCTTTGTTGCAGTATACTTCTTAACTGATGACTTAAT ACCTATATTACAGCGGTGATGTGTTAAGTGATGAAGAGATACTAAAGGTA GCTTGGATGATCATCCCATTTGGCTTGTTAGTTACTTTTACTGGCAGTCT ATTTGTGTTCAGGGTAAAGAAACTGAAGTTTTCTGACCCTTATGCGAAAG CTACATTAATCATTGGTAAGTGTTCCATTAACCAAAATTTAGTAGCAAGT ATATTGGTCCTGAGCACGACAAGTGATATTTCATTAAGGATAACTCTCCA GAGTGAATTGGTCAGTTAGTTGATTCAGTTTAGTTGAGTGCCAAAATAAC CAGCCACGTTAAATCGTTAGAGGCACTGCCAGATTATCTCTTAGAAAAGT CAAACTATTTAACGCTGAACTCTTGCATAAGCCCACTTTTCAAATTTGAG CTATAATACCATTTGAATTGCAAAACTTTGAACTACTGAGACTACAGTTT CATTCTTGCATGGTCTGACAAGTAGTTTTTGGTGACATGACGTGTCTGCA CATGCTGCCATGTCACCAAATTTGATTTTATCCGTTTCCACCATTTATTT ATTTGGCGGATCTTTTATATACAAAACGATTGTAATGGCGAGTTTCTTCT TAACGTGTTTGTTAATGGCGGTGGCATGGCAGACATTCCATGTCACTCAG AACCACTTGTGAAACCATCTGAGGGGGGTTGTCTCGACAGTTCAAGGTTG CAACTCAAATGGTTTTTGAGTTCAGGGTTGAAGATTGTTTCCTTTTTATC TTAGATTTAAATGCTCAACACCTAGCTCGATCTATAACTTGGAAACAAAC ATTTTATGCTATTATGCAGCTATCCAGAGCATCTGAAATAAATAACCCTA CAGTCCTTTTGAGATGGTTCGCTAAGAAATTAAATGTATTGATTTTCTTG TTTGTTGGATAGGATCCAGACATGCTCAATCACGGGCTGACTCTATTGTT TACATGTTATTACTCCTAAACTATTGCCTTCTCATTTCTTATTCTGTCTC TCCCCTCATATTGTGGGCTAATGTATTTATTTGGTCCAAAATGGCAGGAT TTGCTTGTATCTTGGAGCTACTGGCAGAACCTTTGTATATACTTTCCCAA ACGAAGAAATACTACATAATAAGAGTATATACCGAACCTGCAGCTACTCT GCTACGTTGTCTAACAACTTATATCTTCATAAAAGGACACATTAAAATGG TAATGTCTCATTAGCCTTTGCTTCATCTTATTACCGATGGCATAAATGCA TAAGCTCATAATATTTCATTGTTTATTCTACTCCCTCCGACCCATATTAC TTGACTTGGATTTTTCAAAATTTGGATGAACCTATATACTAAATAGTGTC TAGATTCATCCAAATCTAGACAAATTTGAGTCAACTAATATGGGTCGGAG GGAGTACTTGAAAGGGTTAATAACCATTCCGAAAATTATGTAACCATTTG GTGCAACCATCTATATGGCTATACATCCAAATTTAGTGACAAATTAATAA TCCATAACATTCCAATATCCAATTCATATTGTATACTGTATTCTTTTGGT TTGTGTACCAAGGATAACATTTATGTATATCCTCCATTTCCTCTCTTTTC TTTAAACCAAGAGCTCCGTTAAGTGTTAATAGAAGGTTTGAACTTTTGTA TCTCTATAGTTGGTTAAGAAATACAACTGCCCTAATTAGTAATTTCTTTT TGCAACACATGCCTTCGTCACTCTGTTCCCCTCTTTTGTACACATCCATT TTAATTTCATCTGAGAAAATAGAGAGCTTTGCATAAAAAGCGATATAATT TTTGCCGTGTTACATATCCAATTGATAATATTCTCTGCGGCACTTTTGTT CACACATTAATTCATGCTTTCCGACGTCATTATTTTTCTATTGCATCTGT TGATCAGTACAGTACTACAATAGTGATATTGTTTTTGCAGGAGAAGTTGG TCATATTTGCTCTGTCTCAGGTTGTCTATGCAGCCTGCATTTTCATTGGA TATTGGGCATATTTTCTTTTATTTGCTAATATCAGAGCTTCTGATCTCCT TCCATTTAGGTTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTC TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTATTATTGTATCATTAGGTTTGATTGATC ACAAGTTAGTTATATTTCCTTATTGATGCCAAACACGCACATTGTCAGGT TATCAACCGTGATGGTCTATGATAAACAGTTATTGCACATGTGCATATTG TTTACAGGCCAGACTTTCAGGAAATTGATTCTCCAAGAAGGCGAAAAATT TGTTCTTGTTTGGTTTGATACACCATACAACCAGGCTGCATATGGTCTTG TGGATAAATTAGGCAAGTATGCCAAACAGACTCAAGTGCTTTTCTTTACT AGATAAATGTGAGTTCGTGAGATGCGGTTTACCATGCCTCCCACCTTGCT AGAATATCTCCAACAAAAAAAATTTAACGGACTAAAAATATGATGAAGCT ATTTTCAAAATAATAACTTAACAACCTTCCAGAAGAATCCCTAATGACCT TGTATTTATTTGAAGGGAGTCTGGTTGTTAGAATAGTTTGCTAAACAGAC TCAAGTGCTTTTCTTTACTAGATAAATGTGAGTTCTTGAGATGCGGTTTA CCATGCCTCCTACCTCTAGAACATCTCCAACAAAAAAATTGAACGAACTA AAAATATGATGAAGCTATTCAAAATAATAACTAACAACCTTCCAGAAGAA TCCCTAATGACCTTGTATTTATTTGCAGGGAGTCTGGTTGTTAGAATAGT TTTCCTACCATTTGAGGAGAGTTCTTATGCTACATTCACCCAATTGGCAT CAGGTTGCTCTTTTGCATGAATTTGAAGTTTCATTTTACTATGACAGCTA AGATTGAATTGCTTATCATCCATGCATCTGCATCATTTTAGTCTTCTGAT CTGGAGAATTCTAAGTTTTGCCTATTGAGCATCTCTCGAATTGGTTAATC AATCGAAGTTCTCCTATGTTATGCTGGTATCTGTAAAAAATACTCGTGAA ATATGTTTTTCCATTTGAATTCATTTGGCCATCTGAATTGACAATGTTCT TCTGAAGTTACTGCTTTATGGATAGGCTGTTGGTCTTCGATATTACTGCA TACTTTCCCCATGTTTGCTATGTTGTTTGCTCAATATTTAAGTTACTCAT GACCAGTCTGACAAGTACCATGAGTTAACTTATTATTATTGCTAAGACAA GTTGCTTCCAGTTCAACAAAACTAGATTATCTTTTGGCATATTCCTTGTA TCCTAGATTATAATGTTTGCCACAATTCCAGTTTATATGCCACTGCTGCC CAGTTAGAATTTAGGTATGGCTATTCCTATCAAGCTATCTGAACGTATAA TTTTTGACATATTTTCGGTTTGTGTGCTGCTGTTCAATAACCTGTCTTTA CCATTATAGCTGGCCAATATTATATTCTAAGCAAGATTATTAAAACAAAA TGTTTTGTGCATTATATTTGGATTTATATTTCTCTGAAAGAGCTAACGAT GGATCTTCACCAACAGGGCAATCTCCTCAGAATATATCCAATCTGGAAAG TTCTTTGCTCGGAGCTCTTAAGCTGATTATGCTGATAGGTGCGCTATCCA ATGCTGAATGCTGTAATGTTTATATCAGTCTGTTTATCTACTCCGAGTCC TCATACTGAATAAGAAGCAAGCACTTAAAGCACATGCAATCTTTGTAGTA AACATAGTTTAGTTGCTGTCAACTTTGATTTCCTGTTTTCCTTGGATATT AAATACGTCAACAGCCCTGGAATATGATCATCGTCTAACTATGCAGGTCT CGTGGTCATTTCTTTTGGTCCAAGTTATTCATACACCCTTTTGAATCTAC TATATGGAGGAAGATATAGTGATGGTGAAGCTACAGCTGTTCTTCGTTAC TATTGTGTTTACATAATCTGCTTAGCAATGAATGGTTTGTACTTTTATGC AGCAGCTCTGCATATTATCATTCTACAACCTTTTACTGTAGTTTTCTTAG TAACATTAAAGAATATTTGATTGCTGAATAGTAGCTCTGGGCAGGAACCT GTCAAATCCAAATTGGGTAATTAAATATGAGAATTTGAAACTAGCTTTTG CGAACCCAGAATTTGGAACACTGGGCAGGACAACCCTGGTTTTGCCATTT TTGCTTTTTGATTTGTCTTCAGTTATGAACTTATGTTGCATAGCACAATA ATCATATCCAACTTGACAACAAGCAGTTATAATTTCTTCCCAGTCATGTA ATTAGCAATTAGGTTCATGCGTTCAGCCAACTTATGACTTGACCTCTCTA CACAACATTACAGCTGAAAAAGAACTTCAATTGAATGAAAAGCCAACTAT ACTATGCATTGTCTCAACATAGTTTTGACATTTCTGGATTAATTTACTGT ATGAACAAGGAACATGCTTCTAGTGGTGCTGATTGTTAGATATACTAAGT CTATGTAGTATTTTGATTAAAAGTGCTTATTAACTAAGTTCTGCATAAAT GACTTGTATCACTTTTTGATAATTTTCAGGCACGTCAGAAGCTTTCCTTC ATTCTGTTGCAAATGAGAACCAGCTCAAGCAGTCAAACGATATGTTGCTC CTATTCTCAGCAATTTATATTGTTCTGAATGTGTTCTTTATTAAGTCTGC CGGAGCTGTCGGGTTGATTGCTGCAAATTCTGTCAGTATCCTTTGGTCAA TAACTCTACTATCCTTGTTTTCTTGAAATTAATATTTTTCTGGAAGAACT TCTTTTGAGTCTTTGACTGTGTAAAGATATGCTACTGCGAATCACATACT CTGCAGTATTCATCAAAGACTATTTTAAGGTAAAGTTTCGGTTATATTCT ACATTGAGATTCTCTTTAAGGATTATATTTATAACAAAAAAACCTGATGA CAAATTTTACAGGGCTCATTCTCTTTCCGCCGCTGCTTGCCAGCAGGCTG GGGCGTTCTGCTCATTTCTGGTGTGACCACAGCTTTCTCAGAGAGGATGT TTCTGAATAGAAATAGGTTCAAGAAGACCCTTCCTGTTCACATGGCGATA GGTGTCATGTGCCTGGTCCTCTCGTTGACTGAGATGTAAGCACTGCATCA CTACACAAGGATACTCCTCTTTGTTTAAATATTATTAGTCATCCTGACTC AGCTTGTTTCTTGAACAGATACCGTGGTGAAAAGCAGTTCTTGTTGAGCA TTGTCAAATCGTTCAAGGGCAACGACAAACATGCTTGATTTCTATAGCAT TCGGGAATTGGACCACCTTCTGTGAGTGTATGTAGCCCTGATATGTAACA CTGCCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.