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GrainGenes Sequence Report: AA002909

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Sequence
AA002909
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002909
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TAGGAGCCCCCACTGCTGATTTTTGCTGCAATTTGGTGATGCCATGTTAT
CTGTCACGTCATTATCTAATAGCTTAAGCCTGAACAACAGGGAGCCATGT
GACACCACTTGCCGAGCGATGTCTCTGCGTACGGTCGCTGGTCTTGGGCC
CTTGTTGGTTCTGCCGCTGCGTGTGGGCCAGGAGGGGTGTGTTTCGTGTC
TCCGCAGCTGGCGTGGGCAGGCGGTGGTCAAAGATCACTTTGCTTGCACG
CGTTTCTCCGCCGCTTGATCTCGCCCTCCCACATCCCGTCCCTGCTCCCG
CTCCCCAAGCCGGCCTCACAGCGTCTGCACTCATCCCCACCTATGCCTCC
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GTTAACGACCGCACCATCGAACCAGGTATGGTTCTCCTAGCACCCGCTCT
GCAAATTCCTAGAACACTGCAATCTTTCTAAATACTCACTCCAATCCAAA
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ACTAGATACATCCGAATTTAGACAAATCTCAGTTATTAATTTGGATCGGA
GGGAGTATACTTTTCATCAAGATTTATCATTTGTCAATAGCATGAAGTAG
GTCGTGCTAATGTAGTATATTAGAGTTTAGATTAGTTCAAAATTGATTTT
GCACTAGACTACAAAATAATGAAATCGTGCTGAGTTTTTTGTTTGGAGAA
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ATAGATAATCAACCGGGGTCGCACAAAAATGGTATATGTAGCTGACCGTT
ATATTTCATCTTCTTTTGTGCTCATCTGAAGGTGTTCTTTGGTGTGATTT
AGTTGTTGCTGAGTTTTTTCTTATATCAAAGTCATATTCCATGAATGATC
TGCATATTAAATTAATGAAGAACATGAAACACCTAGAATTGGTCCTTGTG
ACACCAGTTGTTGTTGTGTTTCCAAAACTGCAAATCCTGAAATACCTGGT
TTACCACTCCCATGTTCTCGCTGTCGGCCCTCGGTCCAATGCTACGCTCA
CCGTCCATATGGCTTCAGCAATCGCAGCCTTGCCATGGAGGGTGTGGGCA
GCGCGCTATGATGTCGACCCATGATCTCCATGTCTTAGGCGGCTTTTGTT
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ACAGATTTATTTCCGTATGATATGACTACACTGGCAAGACGAGTGAACTG
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GGCTAATTTGCGGGTGGAGAAACATGGGGGTCATGGTGACGGACGATTTT
CAAGTCGACCATTATATCACATTTCTCCATCCTAGGTTTGCTCTTTCATT
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CTTCCCGAACGATGAGCTGAGGCCTCGAACATGACTCCTACTCCCCCTGC
CCTGCTCTCTACTGGTATCTATCTATAACCAGATCCTTACCATATAATTT
TCGTTCCAGTTTTGTTTCGATTTGCTTTCTTTTCCAATCTCCGGTCCTTC
TCTGATGATGATCCAAATATACTATCCTTCTGAAATTCTCGGTGTGGAAG
AACTGGAGACCTAAACTTAGGAGACACGCCTCGGTTTAGTGTTTGATTCC
TTTTCTTTATTTTTTTTGTTTCCACAAATCCGATGTTGGTGTTAAAAGGA
TCCCGGTGATGGCTTCTTCTGTTAAAGTAGTGGCATGATTCATATGTTGA
TGAGATCTATATCATCACCGGACTTGAAGCACCACCGGCAGGCCCATATT
TTCATAAAAACATTCCACTTCTTTTTCGGTCTGTTCTTCTGGACTAGATT
TTATTCAGCAACATGTTCCTCCTGATGACTAGACAGAATTTATGTTTCAG
CCTTGTTTGGAAAATATATCAATCTGTTGATACCTTAGTGCAATCTTTCT
GAGGGTGCTCTTGGGATATTATTTCTTTTTTCTGGTCTATATATTGTAGT
GATCTAATCTTGGTTGTTGTCCGATGATGATCAAACTAAATACTTATGTT
CTTGCCGGGACAAGTTTTCCGGCAGTATTTTCCTATATGTGCCGATCTTG
CAAAGGCAAGTAATCCGGCAGCCAAGATGGCCAGGGAGAAGTTACCCCCA
TCTTCCTGTGGCAGCCAAAAGTGCTGGATCAATCAGCTTGCAGTACTCTA
GATGATATCCTATATGCTGTGAGTTCTTTTTGAAAATCAGATCCATAAGC
TGTTTTCTTGCGTAACCACATGCCTCCACAACCGCTACCGATGGCATAAC
TTTGGACGGTTCAATTGAACGCATGCTAGGAGCCTAGCTAGCTTGATTTC
CAGATGATTGATTTTGCACATATGCATGTCTACGTGCCCATGATTGATTT
TGTCCTTCTGGTGCATATGTTTTGTACTCAGCCTCCTCAAGCAAGTTGTT
TTCTATGAAGCCCTACTAGCTGTTTGCCCTTAACTTCTATGATTTAATTA
AGGGGTGTGATGCATGTGCTAAACCATATACTCCCTCTGTTCCTCTTTAC
TCTGCGCCTAAGCTTTTTAGAGTTTTTTCATATTAGTCTGCGCGCTGACG
CCGTTTCCCGGAAATAGCCCCCCTCTGGCGCTGCATGCAGAGCTGAGTTG
ATATGGACCACATATCCCACGCAAAAGTAGGGGCAAAACAGTGAGAAAGG
AAAGCAAACAAGCATGCAGGAGCTCTCCTTGGTATGCGTGCTATGCCTAA
TGTGCAGTGTAAAACGGAACAGAGGGAGTAGTTTTTAGATAAGTAACCTC
ATTATAGAGACATATTAAGTATGCTCATTAAGACATTTATTTGGTAAACT
TTCAGGCATCTCAGTTATCTTAATTTACACCCCCTGTGAAATATTATTAT
ATTTAATAGTTTGCATCAAAGAAAATATTTGCTATGCTATTGTATTTGAA
GCATCCAATTTCTCTTGACATCAATTGGAATTTGCATCACCCAAATTATT
ATGTCTGTTTTAGTCTCAGGGGAAACTTGGTTGAGCTGATTATGGCACTT
TTATTATTGTAGGTATCTTATGGGCCACGCAAGCAAGTAGAAGAGAGCAA
GGAACTCAACGAATACAAATTCAGTAAAATAAGACATCATAGGGCTACAC
GATGTGAGTTAACAAGTTCAAATCCATCTATTCATCCACCCCACAATAGC
TTCGGTTCTTTTAGTTTGTTTCCATATGAATATATGATGGCAAATAACCT
TAAACGGAAAGGCTAGCTGGATTGGTGAAAGTGATTTATGTTGCCTTGCA
CTTTTATACATGGATGTGAGCATCTTTATCCTGCTTTGAGTTATCTGCTC
ACAATGGATGGTGTGTTTGCTTAATTGCTCAAGTTATGGCCGTATGTGCA
TTTACTAGGTTCAAGGAACTAGCACAAAATTAAATGCTCAGAGTTGGACT
TCTAATACCTTCTTTTTACTAATTATGTCACCTAAAATGGCTTATTCGAA
TTTAGCAATCCTTATTTTCAATAGTTGTCTGAAAAATCCTGTCGTATTAG
TTTCTACATTTGGTGTGCATCTAACGGTTTGTGTTTGATGGACAGTTTAA
AAGGTATGTGCAAATGTGGTAAATTTTGTAATTATGTGATATGATAACCC
TAACTCAGCTTCATAATCTCAAAGATTGAAACAGAGGTATGTGAACCATA
TTATTTTGCTTAAAGAGTGCATTTATATCTTTTCCACTTCACTTCCCTGA
ATATGTGCTCTACTAAATAGTACGCGTGTTCAGCTCTTCCATGATTAATT
ATCAAATGGAAGAGATGTGAGAGGAGTACCTAGCTCTACTTACTCGGCAC
TCACTCATGCTAGCGTATGTTTGGTATTACAATGTGTAACAAGTACTCTT
CATAATTTCAATGTGTAACAAGTACTGTTCATAATTTCCAGATATTGTGT
AGTGGCTTCATTAGGTTACTCATCTTTTGGCAATTTCATATGAATCTCAC
AATACATGGATTTCTCAATATATTAATTTCCTGGATTACCTCAGTCAGTA
TTAATTTGGCCTATTGCAAAAAATGTCTCAATAGCATTTTCTTAGAATTT
GGCCTTTTGTTAATTCAGTGACTATATCAAAGAGAATTGGCGACAAGTAA
TATATTAAAAGTCAAGTAAGCCATGATTCCCAGTGAATTAATATAGTAAA
AGTCAAGTAAGCCATGATTCCCAGTGAATTAATATATTGAGACATTTTCT
TTTCATGTCTCAATATATTAACTCCCTGGATTACCTCAGTCAAGTAACAT
TTTCTAGGAACATACTTTATCTCCTATGCAGATCTTCCTACTGCCTCGAG
GCACTCTCTTGGGCTCTTCTTGGAGGATAGTTTTGATGGGCTAGCATCAT
GAATGAATGGTAGAGGCGTATTTGGGTGTTTTCTTCTTAGAATCTATGTT
TATTTTTCACATACTACGTACGGTAAGTACACATCATTCTGATATTTGTT
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TGACTTTCAATTTGGCCTTTTGTTCATGTAAGTATGGAGTTAGGCTTGTG
ACATGTATCAAACATCAAAATACCTTTATAACTAGACATGTAAATGTTCA
AACTTGATTTTTTTGAAGCTTAAATCTTAATTCGTTTCTTTTCTAGATGT
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TGTATTTGGTGACTTACAACAATGTGGGCTACTCAAAATCTTTCTTCCAG
TTAGTAAACTTTGGTGGGAAAGACCAATTTTATTATTTCCTTGTGATATG
CTTCTTTATTAGACCCTTATTTTGACCACCTTTCTATGATAACTTCATTT
GCTGCAGAGTGTAAGATGTGGCTCGTGTGCACTACAGAATTTTCTACCTG
TCTATTATGTACTGGTGTGTTCTTTTTTGTGAAAAGTCTATTACATTATG
TTTCGTTAGTTTTGTGTATGGAATCTCATAATCCTACACGACACGTTTTT
CTAGGATCTTCCCCTTTACATGCTTTCATGGTTAGATTTTGAACTAGAAA
TTATTATTATTTTGTTGAGGAATTTCTCTAAATTGTATGCCTGGCTTAGC
AGGCTAGCTGCGTCTCCTCTTAGCCTAACTGCTACCCTCTTTGCCCTTGT
TTTGTGTCCCCGATTGCTTTTTGCACTGCCTTGTGAGCCTGGTTAAGTAT
TGTGAGCATGCGAGTTGCTGTAGAGGATTGAAGCAGAAAGCTCACAAACA
AAGTTATAACAGTATACCATGGATTGAAAAAAAAACTTTACAAATAGAGC
TATAACAAAATGCCACGCCAATACTCCTCTCAGGCCACAACAGCAACGAC
ATACACATTTGACCACAGTATTCAAGCGTCGGTGGTGTGAACCAGTGCAA
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AAAATTACAAGCATTATGACAGACAAAAACAGCTGAGAGCCACCATGTCA
ATCACATAGTGCCAAAACGCATTTTGGCGGCGAGGCGAAGCTCGCATATC
CATCTAGTTCTTATTATTTCTGGATTTTTTGGAACATCATCTCCTCCACG
GTACCCATTCATCTGTCCTTCCATGATGATCGTTATCATCTCCATGGCGC
TCTTCTTCTCCCCCATTACTGTTCCTCCCCTTCATGTCCTCCATGGTCCG
GCTCCTGCTCCATTTGTGCACCTAATTAATTGATCTGAATTAGCAAACAC
CAAAATCGTACGGTGTGGTTGTTCGATGCGATATATTAATCCCTTTCTGT
TTGATAATGCAGAATTCCTGTACATACTGCATATATAATTTTTAGTATGA
CTATACTGACAAAGCTTTCAATATATTGCCATCTCAACATGTCATACTCG
GGATCATAAAATAAAAAGGGCATGCCTTAGTTATCTGTTATAACCATGCC
ATTTATATCATTGCCTTCAAAGGATTACAAATTTGAATGATACATCTTTA
GTTCCTAGAGGAAAACACTCTCACCTCCTCACTGCAGATAAATGTGTAAA
TCGGGCTCTAGCTTTATAAGCTACCAGATTTCCTTACATCATTTCGCTGG
TACCGCTGGATTATATTTGTCAGTTATATCCATATTTTGCTATAGTATAG
CTCATTTTTTACAATGAATTTATAAATATTGTTGACATGTGCAGAGATTT
TGATCATTGTGTTGCATCTTCTACTTGCTGAGTTGCATACATCCAAATTA
CCTCCATTCTATTGTATTATATCTTTGAGTTACTAGGGGTTTTAGTGCCA
TATATATCATTGAACAAGAGTTGTGGTAATATGCATTCTATGTTGCAGAC
TTTTCCCTTTTGATGTATGACAATCCAAAGAAATTCCAGACTTTACAATG
ATTGGCATATGTGGATGCCCATCCTTCAAAATATTTTGATTGCATGGCAA
CTGTTCATCCATCCATCTCATAATTAGCGGTGTTGCTATTCATGTGTGCA
TCCGGTCTTGGAAAGAGAGGAATCACTCCTCAGTTAGACCATTTGAAGCC
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CATAAATCAAGTGTTGTCCATTGTTGTAAACCCTACGATAAGCATGACCA
CCTGATGCTAGCTAATTAATAGTCATATATGAGTTTGAAAGACTAAAATA
CATCTCATAATTTTATGCTCTGGGACCTCAAGAAATCCTGCAATGCTTTA
GTCACTCCTCGGTTAAACCATTTGAAGCCCACAAATCAAGTGTTGTCCAT
TGTTATAAACCCTACGATAAGTATGACCACCTCCTGCTAGCTAATTACTA
GTCATATATGAGTCTGAAATACTGAAGCTACGCATTTGTGAGGTATTCGA
TCTATCAATTGAATGATGTTTTGTGCTATCCGATTATGCATGATTCTCAT
TTACCTATTAGTTTACCAGTAAGGCATTGTGTATTGTGGCAAGCAAAGTG
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CAATTTTAACAAGTTAATTGAATGATTACAAATACACATAAAATAATGTA
TTTCATATAAAAGTCAAAAACACAAATAATTAAATAGCTAAGAATGTATT
TATAGAACTAGAAATGAACTAAAATAAATTTCACCAAAAATACAATATGG
AAGAGAAAACAAAATAACAAAAATAAATTAAAAACTGAAAAGAAATAAGA
AAAGAGAGAACACATCAACCAGTAATAGGACATAACTAACATAGCAAAGT
TGTACGTAAAGTGTTTCCATAATTTGTTCATAACCTGCAAATCAAAATTG
ATATCGTTGTTATGACTAATTGTGTGGGTACATACACATCGCTTGTCATT
AAATCTTTTTGTCTTGTATAATTAACAATGATCAAATGACATCTAAGTGT
GCCATATGAATCAAATCAAGTGGCATATCGTGTGTGCATGGTGCATAGAA
AAGCAAGGAATGCAAATATTATAATTAACGAGCTCATGAGACCCACTATG
TGTTTTGCAAGGCACCATCAAGGTGGATTATATATGTAGATATCCAACAC
TTAAGTGTATGCATACTATCTTTCTTGTTGTTGTTGGAGACGATAACCAT
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TGTGCTTGTTTGCTCACGAAGTTTTTTATTGTCCAAAGAAACAACTTTAA
TGACTTTTAATATCTATGCCCACGTCTATTTAGATAGAGAATGTTTTGTT
GCAATTAACTAGTTTATTATCCTGATATGTATGTGCAAGTGCCTACGTGG
ATATGTGTCATCCAGTTTCATCTTTGGGATGCGTGTAGATCGACATGAGC
AAAACTATCCAAATATTGTTATGCAACAGCTAAACAGATGTTGTTAGTTA
GTGGTGCAGTAAACAAACAACAAAGAGAAGTCACAAGTACCACCAATCAC
ATCGCAGAAACTAGAAAGTATTATAAGAAATTCAAGCAACATAGTTACTT
AACGTGTCATATCAGGCAAGGGTGGTAGACAAAAGCTTTACATCCTTCTT
TGAGAAGTTTGGAGTTGTATGTGAAAAAAGGAACATTTAAGAAAGTGTGC
AAGAAATATTTTCTAAATAAATACATATAGGGTTATTAGAGACAACAGAG
ACTTATAGTTTGTTTATGCTTGCAATTATCAATCTAAGTTCCGAGAGTCT
ATTACACCAATTCGACATTTCTGTTCAGTACAAATGACCATGTCATCACT
TAATTATCTTAACAAACTCTATCTTTACATAAACTTTACGCCACTTTTCT
TGGCTATAAAATCCCAACACATCCTGCACCATTTCCATAAACCAAGCTTC
TCCAATCTCTTCAACCATGGCAATTACTAGTTTTCCATCAGTTTTATTTT
ACTTTTGCCTTTTCCTCTTTGTCCATGGATCCATGGCTCAACTATTTGGC
CAGAGCAATCCTTGGCAAAGCTTTCGCCAAGGAGGCGTTAGGGGATGCAG
ATTTGATCGGTTACAGGCATTTGAACCACTTCGGCAAGAGAGGTCAGAAG
CAGGCTTCACTGAGTACTATGAGGAGCAAAATGAGCAATTCCGTTGTGCT
GGCCTATCTGTCATCCGTCGTGTTATCGAGCCTCAAGGCCTCTTGTTACC
TCGATATCACAACACTCCCGGCTTAGTCTACATCCTTCAAGGTTTGTGTA
TAAATTGAATAGGGTGGTTACATCCTAAGAGTATATACTTAGGAATTGTA
TGTGCAAAATATAATGTTAAAAACTGTCCATAGTTCTTAATATCTAACTA
AAATTTGTTTCTTGTAGGTAGTGGCTTTGCAGGTCTAACATTTCCTGGAT
GCCCAGAAACCTTCCAACAACAATTTGGACAATTTGATCAATCATAATTT
TCCCAGGATCAAAGCCAAGGGCATAAGTTCAGAGACGAGCACCAAAAAGT
TCATCAAATTAGACAAGGAGATGTTGTCGCGCTACCAGCTGGGGTTGCAC
ATTGGTTCTACAATCATGGTCAAGTGCCTGTTGTAGCGCTCTATGTTTTT
GATATAAACAGCAATGCCAATCAACTTGAACCCAGACAAAAGGTAAATAA
GGATACCTAAACCAACTCCTAAGATTGTTAATTTTTTCGGATAATCTACT
AGGTTCGGTTTAGTTCATGAAGTGAAATGTTGTTTGATAATTTTTAACTT
GTTCAAAAATTTTAGGAATTTCTGTTGGCTGGCGGCAGTAGGGCACTACA
ACAATACGTGAGTCAAAACATATTCCGAGGGTTCAATTTCCAGTTGCTTG
GCGAGGCCCTTGGTATAAGTGAACATACCTCACAAAGACTTTCAAATCAA
AATGAACAAAGAGGTGATATAATCCGTGTGAATCGTGCCCTTCAATTTCT
ACAACCAATTGTGACGCAACAACAAGAACAAGAGCCCTACTCTCAGGTTG
GTCAATCTCAGGTAGGGCAATCCCAGACATGGAAACCTCAGGGATGGCAA
TCAACTTTTGGCCATTTGAATGGTTTGGAGGAGAATTTGTGTGATACTAA
GCCAACACAGAACATTGAAAATCCCAGTCGTGCTGACACATACAACCCAC
GTGCTGGTAGGATAACGCATCTCAACAGTCTAAAGTTCCCTATCCTTAAC
ACCGTGCAAATGAGTGCTACAAGAGTGAACCTCTATCAGGTACTTATGAT
GTTACATTTTAAAACATTCTTATTAGTATATCTTATAAAATTCAAAATAG
AAGTCTGATATTTTGTTCTTTACTGACTCATTGTGATTAATTGCAGAATG
CTATTCTTTCACCATTCTGGAACATTAATGCTCACAGTGTGATGTACACA
ATCCAAGGTCATGTGTTGGTTCAGGTTGTTAATAATCATGGTCAGAATGT
GTTCGATGGCATTCTTCGTCCGGGACAACTATTAATCATACCACAAAAAT
ATGTTGTTATAAAGAAGGCAAAACGTGAAGGATGCCAATACATTTCATTC
AAGACCAATGCAAACTCTATGGTTAGTCACATTGCAGGAAAGACCTCAAT
CCTTTGTGCCCTTCCTGTTGATGTCATTGCCAATGCATATCGCATTACCA
GGCAAGAGGCCCAAAACCTCAAGCACAATAGAGGAGAGGAGTTTGGCGCA
TTTGCTCCTAAATTTTCTCAAATTAGGTTCCAGAGTTATCCTCAAGATGG
AACCGGGTTGTCTTCCATTGATAAGGCATAAACATGATTGAGCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.