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GrainGenes Sequence Report: AA000590

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Sequence
AA000590
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000590
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGTGGGCTGCAACTGATGTTTTAATTCTGTGTTTTGTGCAACAATG
TCACCAAACATTGGTGCTATGTGCAATTTTCTCATGAGGGAGACTTTGCT
GAAATAGTTGATACCTGATGTAATTATCGTGGAATAGCTGGTACTCCCTC
CGTTTCAAAATACATTTCTCCCTCCGTCTCAAAATATATGTCGTATTTTC
TTTCTAAACTTGAATGTATCTAGTACCGAATAATGTTTGTTTAGATACAT
CCAAATTTAGATAATTTTTTGGCATCTATTTTGAGACGAATATCTAGATC
TTTTAAGTAATGTCACTGAGGGAGTATGTTTTAGCTTTTTCTTTAAAGAC
ATATATCTAGATCTTTTAAGTTTGTAGGTTTATTTATTTTGCTCCGAATC
TATACACTAAAATATGGCTATATGTGTTTCAGAAAAAAACAGAAACAACT
TATAATTTGAAACAAAGTTAGGATCTATTATTGTGAACTATATGATTGTT
GATGTTTCCGGACGCATAGTGCGGTTCTGTTCCGTACGAGCGAAAATAAA
CCTGAAAACTACATTTTGTGTGGCCGGTAAATGCGTTTTCCGGACCGCGA
CTTTACTATGACTATGTTTGGTTCCGATTCGTAAGCCAGATTCACTACCG
AGCAGCTATAATCTATATCTATATCTATATCTAAACCTACCAATACAAAA
AGCCTCAGAAGGGGGCAGATCCAACAAATCGTAACCATTCACGGTACATC
TAACGGTCGCAGATCCTTTCATCCCTAGCGCTAAAACATGACCGGACGGA
CAACTTACTATAGCTAATCTAAAAACTGTCTCGCTAATCACGTTTCTAAG
TAAATCACACAAACACCACGCACGCCCTACTCCGCCGCCTCCGCCCTGCG
CCTCGCCGTGTTCCAGGCCGCCGCCGCCTCCCAGCGCCTCGCCCTCGCCG
TGTTCCAGGCCGCCGCCGCCTCCCAGCTCCTCGCCCTCGCCGAGTTCCAG
GCCGCCGCCTCCCAGCGCCTAGCCGTGCTCCAGAGCGCCGCCGCCTCCCT
GCGCCTTGCCCTCGCCGTGTTCCAGGCCGCTGATGCCCTGCGCTCGCCCT
CGCCGTTTGCAGGCTGCCGCCGCCGTTCGATCCGCCCGCCGTCGCCTCCC
TGCGCCTTGCCCTCGCCGTTTTCAGGCTGTTGCCTTCTCGCGTCTCGCAG
TTTTCCAGGCCGTCGCCCTGTGCCTCGCCCTCGCCGTGTTCCACGCTGCC
GGCTCCCCACACCTCGCCGTGTTCCAGGCCGCCGTCGCCCTGCGCCTCGC
TCTCAACGTTTTCCAGACCGTCGCCGCCGCCTGTGCCACACCAAGTTTCA
ACATCACTGCGGTACTCCTATTCTTGTCATCCCTGTCGAGATATTCCTGT
AGGTCGTCATCTTTTTTTGATTGTTCAGTACGCATCTTTTTTTGATTGTT
CAGTACGCATTGAAGTAAAATGACATTGATGGGCATGTCTCTGTTTATTA
TATAGTGATGAAGTTGGTGTCCGGGAGTTGCTTGGAACATATGGTCTGAT
CAGTACATGTCTTCTTAAAATATTTTAGAGAACATGTGATTTATCATGTA
TGCATGGGTGCTTTTCTGATTGTTTCAGGCCATAGTTTGTATAATCGTAT
CTAATAATCCACGGTTCATAACATGTTGGTAAATTAATTTGAAGACACCG
TGTAACCAAGATCAGTTCAAAATTGTATCCGCATTTATGTTTGTATATAA
AGTCTGATATTAATAAGAAGGGGAAGTCCACACATGTTCTCAGCCAGCTC
CTTTTTCTAGATACACATGGACTAACATGGCCTTCAAGTGGTACTAATTA
GACCGATCCCATGAAACAATCAGAAAATGAATATATTAATATGCTCTGTC
TGCATATTCACACAGTTTCTTTCTATATGCGTGTTCTACTTATGTAATAG
TTCTTTCGGTCTTTATTGTACACGGAATTGATGCGGTACATCAATTTGAA
GGTATCTGACTGTTAAATGTACAAGATGACATAAACAATGAGGCATATTC
TAAACCTAAAATCTGAAGCTATTTTGAATTATCTTACTGTTATAGTTATA
TGCTTTTTTCAAATTATAAAATGTGATAACTACCAACTGATTGTTACATT
GGAGATTTGAAATATTCTTTAATGCCAGTTATTTTTTCATGAAATAGGAA
GCAGGAATACACATGTCATCTTCCAAACGCACTCCATTCCAGGACATAAC
CAATAGGAAAAACTTAGGTGATTAACAACTGTCATTGGTCAGGTCAGTTA
TTACTTTCTGAACGTATATTAAACTATGTCGTGTATGCAGATCCTAAAGA
GGCCAAGAGGCAGAGGGACAGAGAGTACTATGCAAAAAATAAAGATGAGA
TTTTGAAACGACGGCGCCAAGCACGAGAACTTAAGAAACAAGCGAGTCCA
ACGACCCCTGTGAATGAGGACAACGCAGAATGTCATACACCAACTGCTAC
ACTAACAGGACTCACCCAACTACAATTCAGAACACCTTCAAGAGGTCATG
TATTTTGAACTCTCATGTTTTATAAATGCATATATATGAATTAAATACTA
AATTTTAATATGCAAAGACTTTGTAGTTATCGCTCCAGTTGTTCCAGAAA
CCGGTGCATCTCCAATTCCTCAACAAGAATCATCACAATTCTATGCAAAT
GGTTCACTCAACCATATAGAAGGTAGGGTAAGTGGTCAGAGTTGGTATGC
TCGATTGTCTGATGAGAAAAGAGCAGAGTACATACAGAGGCAGCGTACAG
CCCGTCAACAAAAGAAAGCTGCAAGTCAGAGTGGTATTAGTCGTGCAGAA
GTGTCTCTCCCACAATGTACCCCGTTTAGCAACGGAACCATGTCACAGGC
CAATGGTACATAAACCTCGACTGAGTCTATTTCGAATAACGGTATAGGGC
CTAACTGTTTCATGTATGCTTGCATGGGTATGTGCAGATGCAAGCCCAGA
GGTTATGACATGCAAGCCTCGAGAAGATACACCAGGTAATAACCTCGAAC
ATTATTCTCAATACTTTACCACGTATCGATTTTCATGACCTGCCAGGGCC
AATCTATGTGCTTCACATTTTCTACTTTAGGTTTTGCAGAGATTGGATAT
GCACATTCCTGTATGACCAATGTTGAAGAAGATGATACTGATTGGCTACA
TAGTAATCTGACTTGCATTCCTCATGTGAGATCTGTTCAAGGTCTACAAA
ACATGTCCCCATATGTTGGGGGCCATGGGCAAAAGAGTTACGTTGACAAA
ATTGGATATTCTGAGAAGAAAAGACAACGTGATAATTCTGAGAATAAAAG
AAAACGTGAAAGGGAACGGTACTCATCTATGACAGATGCACAAAAGGACG
CATGCTTGCACAATAACCGTGATTATAAGAAATTGGTCCGCGACCACAGT
TCACCCTTGATCACCTCACGTTGCACACCTGACATGCAAACAAAGCCATC
CAAAATTTACCCAACAGGTATTGTTAGCCCTCGGTATATGTTCTATATTA
ATATTCATAACATTAGTACTTTCCGCGTTAAATTACTATGTTTGATATTG
GTTATTCAACTACTATCTGTGCTATTTCATGCACATCCAGTTTACACAAA
CAGTGATGACGAATCTGATCATGCACGCATATTTGAACCATTTGAAAAAG
ATGCTGGATTACAAGGTAAAATAGATAGTGTAGTCATATTTCCATAAATC
CTTTATATATACGAATGTGAGTATCCAATAATTTAAGGACATTAAACCTT
TTTCACATAGGTAATATCGACACCATCCAAGAGGAACAAACAATACCCGA
GGATGACGAGGAGAGCAGGATTTTTAGTGGCCAAGGTAACTTATACAACT
AAGTAAATTTTAGTGTTGTAGTCCGACCTTGAATTTGGTGCATCTGTTTT
ATTTCTACTCATCTTGGTAGGCGATGTGTTTGATTCGTATCGAGTGACAA
ATGATGTTGCTCCGAGTAACCAGAACGATGATCCTTATGATTATGTGTAC
CACAATCTACCAACCAAGCATCATGTTTTGAAGCCAGTAAAAGACTGCAT
TTATTGTGGAGCAATGAGGCTCCAATATGAGGGGCCCGCATTTTGTTGCA
AAAAGGGAATGGTCAAGATTGTTACCCCTGAAGTTCCTCAGGAGCTGCGC
CGATTGTTCACAAGTCAGGTTGATGAGGATGCAAAATACTTTAGAAAGCA
CATACGCTATTTCAATACTCACTTCTCCTTCACAAGCCTTGGAGTCACCC
TTGATAAGAATGTCAGCAATGCAGCAAAAACCGGTGTGTATACATTTCGT
GCACAAGGAGCATTGTATTATAAGATGGACGATCTGGTGCCTGGTGGTCA
AGGACCTAGACATCTCCAACTTTACATCTATGATACAGACGAAACCTTGG
AACATAGAGTGAAGCGTTCTCCAGACCTTGATATAAATATCATACGGGTG
ATTCTTAAGATTCTAGAGAACAATCCCTATGTTCAAACTTTTAAGAGCAT
TGGCTCTGTTCCAAATCTGGAGGAGTATCGTATTTCACTGAATACAGATA
TAAGACTTGACCAACGAAGGTACAATGCCCCCACAACTTCCCAGGTGGCA
GCGATGTGGGTTGAAGGGAGCGACCCACAGAACACTTTTGATAGGCAAGT
TGTTGTGTATGGCAAAGGGGACCGCCCTATATTTATGAGAGCATACTATG
GATGCTATGATCCTTTGGCATATCCATTGTTCTTCCCGGGCGGGGAGACG
GGATGGAACCGTTGGATGCCATATCATAGACCACTTTCCGCCGTTCAAGA
AAACAACGAGAATGCCAATGAGGGTGAAGATATCCAAGTTCAAGATCATA
CTTCACGTGTACATGTGGAACAAAACACATGTGTGCATGTGGAACAAAAC
ACATATGAGGTAGCAGGTAATTGTCCAGATGCTTCTAATGTGCTCCACGT
TTTTATTTAGTCCATTATTACTAGATATCAGATATTAAACATTCTGTAAC
CATGGTACAGATGATGATGATGACCAGGAGGATGATGAAGTTGGATCTTC
CAGACAATTTGTCAGTGCAAGGGAGTACTATTGTTTCAAGATACAAGTCA
GGAAAAAACTTTTTAACATTATATTATTTGGTGCTCGCGCGTTCCAGCAA
TGGGCTGTCGACATGTACATCAAGATGGAGACTATGAGACTTGATTTCTT
CTCCAAGCCTAAGAATCAGAAGCTCATTCGTGCTGATCTCTACCAGGTAT
CATTGTGCTCTCCATTGATTAAAAATTTCATGTTATATCTCACATGCATC
GCTTAATCTTTCAATAAAAATTATTTTCATTTACTAGAGAAAGATGTTTG
ATTAATTCGTTTCATAGGGTGTTGTTGATGTCATTGATGCTGGCGAGACA
CGGGGTTCTCAGGTTGGTAAGAGAATCGTGCTACCACGGACTTTTCCTGG
AGGTGATCGAGACATGCAGCGAAGATTTCTTGACGCGATGGCGATAGTAC
AACGCTTTGGGAAGCCTGATTACTTCATCACGATGACTTGCAACCCTCAC
TGGGAGGAGATTACATCTAGACTTGAACCCGGGCAGACACCACAAGACCG
TCCAGACCTTGTGGCTAGAGTATATAGGGCCAAATTGCGAAGTATGAAAG
AGCTCTTGATTCAGAAAAGGTACTTTGGTGAGGTAGCTGCATATGTCCAT
GTTACCGAGTTTCAAAAGAGGGGACTTCCACATGAGCACATGCTTCTGAT
CATGCGCTCAGATAGCAATCTAACAAACCCAGACGAATACGACAAGGTGA
TATCAGCAGAAATCCCGGACAAGGATAGGTACCCTATATTGCATGCTCTG
GTGATCAAGCATATGCTACACGGACCATGTGGTACTCTCAAGAAAAATTG
TCCTTGCATGATAGATGGTGAATGTCGATTTCGCTATCCTCGACAGTTTT
GTGATGCCACACAACAAGGAAAGGACTCATATCCTATCTATAGGAGGAGG
GCTGATGGTCGTCAAGTGAAGGTCAGAGGAGCAGAGCTGGATAATAGATG
GGTTGTCCCATACAACCCTGGTCTTCTTATGTTGTACAATTGTCACATCA
ATGTTGAAGCTTGCTCTAGCATTAAGGCAGTTAAGTATTTATTCAAGTAC
ATATATAAAGGACATGATCGTGCTTCATTCTCAGTCGATCCAACATCAGA
TAATGATGGCGGAGTAATCAATGAGATTAAACAGTACAGGGATGCTAGGT
TTGTGGGACCACAAGAGTCTATCTATAGGATTTGCGCTTTTCCAATGTAC
AATGTCTCTCCTGCTGTTCTCCAACTTCAGCTTCATTTGGAAAATATGCA
GACTATCGCTTTCAAAGAGGGCGATCATCTAGAGGATGTCGTCAATCGAC
CCTCTTCTTCCAGTACCATGCTCACCGAATTTTTCAAGATGAACCAGGCA
GATCCTTATGCTAGGAACTTCTTATACAAAGAGTTCCCGGAATTTTATAG
GTGGATTAAGGGTAAGAATAGTAAGTGGCAGAGAAGAAAACTAAGGGGGA
GGGGGCAGGTTGGAAGAATTGTGTATGCGCATCCCGCTGAAGGTGAGAGG
TACTTTTTGAGAGTGCTTATGGATCATGTCAGAGGTGCAACATCATATGA
AGATTTGAGAACTGTGCATGGCAAGGCTTGCTCTACTTTTAGAGAATCGT
GTGAGAAAAGAGGTCTCATAGAGGCCGACAAGTCCCTTGATGATTGCCTG
ACTGAGGCTGCTACTTTCCAGATGCCATATGCTCTAAGAAGGCTTTTCGC
AACTATTCTGGTGTTTTGCGAGGCGACGAACATCCGATCATTATGGGAGA
AGCACCTTGAGGCGATGTCTGAGGACTATCGTCGTAACCAATCCAACCAG
GCCGCACTTGAGCAGATGGTCCTGCGAGACATTAGGGATCTGGTGCATTC
GATGGGGAAGGATATTAAAAGTTATGGCCTTCCGGATTTGGATCCTGTTG
ACGATGAGTGTTCGAACGGTTACTCAAGAGAGGTTCGAGAGGAGTTGTCA
GTCATATTTGACAAAGACGATGAAAATTTGTTTACATCTCTTAACAAAGA
GCAGCGCGCTGGTTTTGATGAAATCCTCTCTCACGTCATCGACAATAGGA
GCCAGATTTTCTTTGTTGATGGTCCGGGTGGCACGGGGAAGACGTATCTG
TATAAGGCACTCCTTGCTAAGGTCCGTTCCCTAGGAAAAATAGCTATTGC
GACGGCGACATCTGGTATAGCAGCATCGATCATGCCTGGTGGACGCACCG
CTCACTCTAGGTTCAAAATTCCGATTAGGCTCACGGAGAGCAGCATGTGC
AATTTCACCAAGCAAAGCGGTACTGCACAATTGCTTCGTAGGGCATCATT
GATAATCTGGGACGAAGTTGCCATGACAAAACGTCAAACGGTTGAGACAC
TTGATAGGTCCCTACAAGACATCGTGGGGTGTGAGTTGCATTTTGGTGGG
AAGGTTGTGGTATTCGGAGGAGATTTTAGGCAGGTCCTTCCCGTGGTGAT
GCGTGGGACAAGAGCGCAAATCACTGATGCTACACTGCAGAGATCTTATT
TATGGGAGAAGATTAGGAAGATACGCCTCAAGCGTAATATGAGGGCACAA
ACCGACCAGGGGTTCTCCAGTTACCTCCTAAGAATTGGCAATGGAACAGA
AGAGACGATTGGTGGCGATTATGTGCGTCTTCGAGATGATATTGTTATTC
CTTACTCTCCCACCGATCAACCAGTGAACAAGCTTATTGAAGAAGTCTTC
CCATCCCTTCATGAGAACGCCGCATCTGGATCCTATATGAGCGCACGTGC
CATTCTTTCAACCAAGAATGAACATGTGGACAATCTGAATACTAAAATGA
TTGAAAGGTTTCCTGGCCAAGAAAAGATATATTATAGCTTTGACTCTGTT
GAGGATGATGCCCGCAATAACTACCCAATTGACTATCTAAACTCCATCAC
TCCAAATGGCTTGCCTCCGCATGTTTTGAAACTCAAAGTAAATTGTCCCG
TCATCCTTCTCCGAAATCTTGATCCTCACAACGGGTTGTGTAATGGAACA
AGGTTGATGATTAGAGCATTCCAGCATAATGCAATCGACACCGAGATTGT
TGGTGGACAACATGCTAGAAGTAGAGTGTTCATACCAAGGATCCCTTTGT
CACCCTCAGAGGATATTTCACTTCCTTTCAAGTTCAAGAGAAAGCAATTC
CCAGTCCGGTTGAGTTTTGCAATGACCATCAACAAAGCCCAGGGGCAAAC
CATTCCAACTGTTGGTATTTACCTCCCTGAGCCTGTATTCTCGCATGGCC
AACTTTATGTTGCACTATCAAGGGGCGTATCAAGGCAGACCACTCGGATT
TTGGCCAAGCCAAATGAAGAAATAGATCCCACGGGAAAAAGCACAAAAAA
CATTGTGTACATGGATGTCTTGGAGGGATGAAACAGGTTTGTTCTTCCTT
CAGGACTACCTTTTCGTATTATTTAATATTCTTACTGCATATATTGCTCA
TCTCCTTTCTCTTTTTCTGATTTTCGTATGTTCTTTTTATGCAGCATCAT
CAGCGGTTATGTTACCCGGTTCTGAGATAGAAGATTTTCCAAAATTTATT
TTGAAGATCTGTACATTTTTTACAACCTATAAGAACTCCGGCTTGTCTTG
TTTTTTCTGTTATATCCCCATAAATATAGTTAACAAGAGACTATAAATAT
GAAACGTGTGTGTATACATTTCACTCATTAGCTTTATAGTTTTTGGCTTT
ACACTTCCTCAATGCAAATATTTAAATACTTTACATGACTATCAACCGGC
AAGGTACTCATTCATGGCATTTCTAAGGTATTTTTTAAAATATCTATAGA
TAAGTGTCTTCTATTTCTAATCATGCATTAATTTCCCACAACAGAGGCAG
TTTCTTGAACAGTAGCGGCGGCGGTGCCAAAAACCTCCAGCTGGATGAAC
TCTGTCTAGGATTTAACCTGTGCCTGTGCATATCTTTGCGTCAGGTATAA
AAAACTTCTCCAACTACTCTATCAATGGTAGATATATCAGGAGGACAACC
AGGAGGTAACAAAACCGCCATGCGATGGCAAACTCCAACTATTTTCGACA
TTACCATGTTATAATTTTCACAATCTGCTCTATTCCAGGTATGTCTCACA
CTCAAAGTTTAGGAAGATGAAAGATGGCAAACTCTAATATGAGATATACT
GGTATGCTTTCTATCGACTTACTTTTCTGTTACATCCCTACAATGTTATT
TCTCACGGTGTGCTTTAGATCATTTGCCTTTTCTTGTTCATTGCATTTGC
AAGCTAGAGTCAGCCATCCAATTTTTATATGCATATACATGTTCTACTAT
TTTGCTTCAAAACAACTGCTTAGCGGAGGAGGGTAATTTACATTGTACGT
GAGGACAAAAATGCATAAAGGACTTAGGTGAACATTGCATTGAGCTATGG
GATAATATTCTCTGCATGTTTAGGCATAATGGAAATATGTTTTAACTGGC
TTATTACTTTTATCACCTATTCAGCTTCAGGTGAAGTGATTGCATGGTTT
AATATCATGCCTTTTTTTTCAGTTTGGAGAACTTACTTTCGAAGTGACGG
CACAAAAACTGCCTATATTAATGCTACAGTTGGACTGGTTTTCAGGCAAC
TCCCAGACATGCTCCATGTTGTACGTGTTCTGGCCGCCAGACAAGTAACC
GTACTTTGATTGATGAAGTATCCTATCCATTCGGTGTATGGTTTTCTCCC
CCTCTCTCTCTCTCATTTTGAATCCTTAGACTCCATGCCTCTACAAAGCT
ACTTTTTTCTGAGACATGTCATATCCATTCTTTGCATACACATGTTTTTA
TGGCCTACTTGAGATATATATAGAAGATGAAAAGAGAAATTGGTTGTAGA
GATACAAAATACGGAAAAAGGAGATTAGAGGCAGCTTGATTACTATCATA
TGGACGTGATGTTATTTAACATTTCTATAGTGTAAGCAATGTTATGTAAT
AACAAATATAAAAGTAAGAAACTCAATGGTTAGTTCGTTTTCTTTCTGTG
GGAGAAAAATCCATAAGCATTAGATGTATACATCAAAACTGAAGTAATTA
ACTAGCCATGATTATTATATTGTTTTTTAATAATAAAAAACAATGCTATG
TTACGGAATCCATTAATAGATGAGGGAAGGAGAGTAATCAAAGGGATTAA
GGTCCTTCAATTACAGGAGGTAATAATATTTATGTGTTACAATCAGCCCG
GAAACCTAGCCACAGGAGGAGGAAACTCTTTACCCGTCCAGTTGACTACT
GCTTTATATACCCACCAAGACCCAGCGTCCTTCCACACGTCGCCTAGAAC
AATCCCTTCCTCGCCGTGGGTCGCCGCTGCGCTATTTCTACCCAAGGCCA
CTGCTATCTCTCTCTACTGGTACTATCGCGGTGTAGAGTGCTAGCGCCTC
TCTTTTATCCCAGGTACACTATGCACTGTTATACATAGACAAGTCTCATT
TTCTTTATCGATCAAAGTTAGTCTCATTTTCTTCCGAATTACAATATACC
CAGCCTGATGTTGTTTCTCTCTTTCTAAGAAACACAAGTCTGAATAATAA
GTGCATACATGATTAAGTTTGGATGGATTACTTTACCATGTTGATATAGT
AGACGTATATACATATATCTCATACAATTTTGTCTGATGTAGTTTGTAGC
CATAGATCTATATTTAGTTCAATAGAAATAACGCGTTAGTTCATTGCCAA
AAATATATTGAATTCAAAATGTCCTTATGTTTTCTCTTTACATGAACAGA
TATGGCTGATGTACTCAATTTCCCAAATGGTTCAACCACTGGTATGATTA
CAGTCAAGACCGAAGTCCGACCAAGTTCTTCCGGAACTTCCTCGGTGAAA
TACATGTTCAACTATCTGATACGTAGTACACCTGTGAGTTCTAGCGTGGA
GGTGATATATGATCCGTACTCGCGAGAGAGAGTTAATAAAATAGACCAAG
TTGATTAGACACGCAAGTCCAGAATAATAAATAATAAGTTAAGCGGTCTG
CTCAGCCTGTAATCCGGTTGTTATTAGGTCAATTTATTTTTTGTGTTGTA
TCAACCCTCATTTATTTTGTATCAACCCTCACTGATTGCTTGATTTATTT
GTATTGGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.