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GrainGenes Sequence Report: AA035951

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Sequence
AA035951
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA035951
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTGAAGACGTGGTGTGGGAGGATTAACTGTTCGGAATTTTGGAACACAG
CTCGCGAGCCATTCAAACCGAGCTTCGATCCCACTTTTGAGTTTTCAATC
TGAAGGAAGCCAAGGCTGGCTCGGCTCGAAATTCCTCGAGGCTCAAGGAG
CCAGCTTGGCTCGGCTCTATTCCACAGTCAGCGATCCCTCCGCTGTTCAC
GGGAAGAATTTGGCGAGCGAAAGCCACGAGTCAGGGAGGGATTAACGGAG
ATGGATGGCAGTTTCTGTTGCTGGGGACAGCCACTGGTCCGTTCCATGGC
CGCCGCGCTTTTCCTCCCCACGAATCCAAACCCGACGGCTAACCCCACCT
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AAGAACACACTTTCTTGTTTTATTGTTATGTTATTTCAGTACCATCCAGA
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CATATGAGGTATATTCTGGTCTCTGCTCTCTGGTCTCTGCTGAAGTGTGC
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TACTCTTAGTAATAAGTAACCCAATTTTTAACAGCATGCTTTGGTTTGTG
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TTGTAGATTCTTTCAGACAAAGAGAAAAGATCTATGTATGATCGATTTGG
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GGGTACTTATTTATTCAAAACCCAAGAGATAGTTTTGCTTTTCAATCACT
CTTTTCTTATTTAGGAATATAAATTTATTTTATACTGGTAGATGTTGTTT
TCTACTGCTAATTAGCTCTCCAACATTGTGCCAGCAATTGTTCGGTAAAT
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TGTGTGTGTGTGCATTATTAGGAGTTAATAGGGATAATGATATGTATTTA
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AAGATGCAATTTAATGAACAAAAAAAAAAGCAATAGCATGTGAACTTGCA
AATGGCTATATGTTCTGTGCATCTTGCATCCAAACTAACACTCAGCTTTA
CATAGAAGGTCTTGATTGAAAAACAGTTTAGGTGACGGGATCTTCGGCCT
TTTGGTTTCTTTTGCAGGTTGATCCATATGAACTCTTCAATGCATTCTTC
GGTAGTGCCGACAAGTTTTTTGGGGGCATGGGTGCAGGGAGATTTCATTA
CAGTTCAAATGTCAACGACAACAGGGGACTTGATATTCGGTAAACAATTT
TGGTCTCACATTAAAGCAGTGAAAATTAATTTTTCGATAGCTGTTTACAC
CCTTTTTTCTGTATAGCTATGATCTTCTCCTTCCTTTTGAAGAATCGATC
CTTGGAGGCAAACGGGAGATCAGTATTTTTCGTCATGAATCGTGTGGCAC
TTGCCATGGATCTGGAGCTAAATCTGGTAATAGCATAACAGAATGTACAC
AATGCAGAGGTCAAGGCAGGTCGATGAAATCTCAGAGGACACCTTTTGGT
ATAGTATCTCAGGTGATCTAGACATTCTTTTGGAACTTTGTGTTTTCAGT
CATTCTTGTGTTTATCCACCTCTGCAGTTAATCTGAACATGACATTTATC
TTTTCATGGATACTGAATTACCGAGTTTAATAACCCTTACCATTTTATTA
ATACAGTCTTATTGAGTTTTTACTATTCATTTTGGGAAATTGTATTCTCA
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TTTTGCCCACATGTGTGATATGGTTAGAATGGAATAACAATAATAGGCAG
GCATTGAATTATAAAAGGGCATCATTCCTCTTAGAGAGGCGAAGTTCGTA
AGAAGGCAGTTACGCAACATTTTCTCAATATTGAATGAATTTTGCCCACA
TGTGTGATATGGTTAGCATGGAATAACAAGAATAGTCAGGCATTGAATTA
TAAAAGGGCATCATTCCTCTTAGAAAGGCGAAGTCAGTAAGAATGACTGG
AGGCACTTCCTCCATGGATGGTACATGGCAGGCATCTGCCGGAACTAGAG
GCGAGCACTTTTCAATCAATTGTGAGAGGCATTCGCTTTTAACGGGATGC
ACCTTATCAGGACCTTATCGGGAGGTTTAATCGAGCTGAAAATGCAAATA
AAATGGGTTGTGGACGCCTTGAGGCGCTGGAGTTATCTGGCGCCCAGCCT
GTAAAGCAAACTAAGAGCGGGGAAGGAACTAGGGCGGGCATAAGCTCACC
AATTAGGATGCGGGATTGACGCATCTTTTTTTCAAATGATCAGGGCTTTT
CCTTTGGGGCTGGGAGGGTAGGGACGGGATACAAAACTGCCACGAAAGCG
ATAATAAGCCTAAAAGCGATTCTTACACAAGATACAATGACAGGAAGGGA
GTTCGACCAGGAATGGAACCGGAGAATCTGAAATTGGCTCTCGACCCAGG
CCTTGCTTTGCTTACCTCTCCCACGGACCATTTAGTAGCGCATCGCGAAG
GTGGCCCAGTCTCTTTCCCTTCTCGACTAGACGAAGGAGATATTCATTCC
ATTCAGGCAGGTGAGGAAGGGCGGCATCGGCTTGACCCCATGTTCTCTCT
TGGTCGGGTCGGAGGCTAAGTTTCTCATTAGCAAATTCGGAAATGAAAGA
AGGCTACTGAAAGAACAAGCAACAGATTTCTCAAAACTATTCCTTTTTTA
GATTCTATTGCTTTTCTAAAGCATTTCTTTAGAACAATATTATTGCTTCT
CAAGATGTATGTCTGCTGGCTACTCCTAATCTACTACTTGAAAAAACAAA
AGGTGAAGCCCTCCTCTTCTATTTCGGGCAGTAGCTCAGCCCGTTCTGGG
CCTTCCTTTACTGAATCTATTAGTAGTGGAACTTTTCGACATATGCCTTT
ATTTAGGCATTGGTTGTAAGCATCCCCTTCTCTCTTCAGTGAGCGAAGTC
ATTTCCTCAAGAGAGTTCTTTGCCCGAAAAAAGTGAATCTTGATCTTTAT
TCTTGATAGTTTGTGATCTTTACCTCTTATTTTGGATAGGCAGAAATGCT
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GGGGCTTCATTGCCGTGGCCATCCGTCTCTGCTTTGTCGTCTGATAAGAT
CACCCATATATATATAAACAGAAAAGGAAGAACCTTGATGCTAAACCAGA
TCGAACAAGGGATCTTCTTGGACATAAAATTTGGTGCTTTCGATCCCTAG
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GTTCTCGCTTCTCCTTGTTCCTGCTCCTAACTCCTCCCCGGGTAGTTCCC
AAAAATCTTTCGGCGGAGAAAAGGAGGTGACTAGTCGCTTCTGGCAAAGC
AGTGAGTTCATGAGCAAGTGAATGAACGAGCATCGAGTGAAGTGCAAAAG
TCGTAAGTAAGGCTCGCCATGTTCCTAAAAGGAGTGACCATCTTTTCTTC
CCTTCTATTGACATGGAGTTGGAAGCGGTTGGTCAAGGTAAGTTTTATTG
GCACTTCTGGTTAGGTCTATGTTGCCGCAATATTGTTCTATGGAAGCGGG
TGGGCTGCTTTTTAGAAGTTCGGCCCGGTTATCAAAAAGAAGAAGGGAGG
GGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGACAGATAGAGCAGATGGTCCAACTAT
AGAACTTCTTTTTCAGTACTTCCATGGTCGTGCCCCGTGGCACGCAACAC
CTGTATTATTGAAATGGTTCGTTAGTAGAGATGTTCCCACTGGTGCCTCT
TCTTCCAATGGTACTATAATTTTGTGTGTGTGTGTCTAGCTGTTATATCC
TACAAAATGAAGTGAGTTGGTCGGAAGCTAGACTCCAATAGCATTGATGC
TCAAATAACCCCGCTGCTGCAGGAAAGCAACTTGATACTACTACGATCCA
GATCCAACAAGAAGTAACATTGCACTATTACTCAATCCAGTTGGAAGAAG
AAGCTTATATATCCCAATCCACCGGGTCTAAGTCCCCTTCCAATCATGTA
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TCTTGTTAACTACCTTGAGCGAGGACGGGTTATATGTTAACGCCGCGCCA
GGGGCCACGAATGTACAATTTTCCTTATTATGTTGATGCTCGAAACGGTC
ATGGCAGGTGTGTGATAACCATCACCATCTATTAGAAAGTTGAAGATGTA
TTTCATCGAGGAAGCTTGGGAAGAACTTGAGCCATCTTTGGTCTTGAGTT
TCTTTGGGTAGGTAGCTGAACAATGTCGCCATTGTTGGGTGACTTGTGAG
CATCCCTCCTAAGAAGTACAACACCTTTTACCGCATTACGCTAAGACAAA
TCATTTTGAATAAGTTGAGGCACACCTACAATGTGGAAAATTTAGACATC
TATTCATCAAATGGGCAAGTGGTTTTAAAAATAGTATAGGTAACTTCAAG
CACGTCAAACTGATGACACCAAGCACGATGACCGACAACTCCTCTTGAAC
CTCTCTTGAGTGATCGCTGAAAAAAACATTATCAACGGGATCCAAATCCG
GGATGCCATAACATTAATAACCTTCCCCATCAAATGCACCATATCCCTAA
TGTCTCCAAGGACCATCCGTTCAATTGCAACTTGGTTGGAGTGACTACAA
TGGTAGTCCTAGGACAATAACTCGAGGTGCTTCTCCCACATGATTGGATG
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TTGTTTGGTTGGGCTTAAATCTAGCTTTTGAATTTTGGCTTATAAACAAC
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GGCTTATAAACAACAAAAACAACTAAATATGTGTTTTTGACTTTTAACCG
GAACTGGACATAGTTGTATGATAGTATAAGCCAAAAGCCAAAATCAAAAG
CACCCATTTAAGTGCTTTTGTAACTTTAAGCCAAAAACTAAAAGCCACAA
ATAAGTCAAACCAAACAGCCCCTTACAGCACATGACATATGGAAAGTAGC
AACCTCGGTCAAGCAGTCATCAAGGAACTTGTTGATCTCTATGAAACCTC
TTTGCTCACACGCATCTTGAAAGGTTGAACTAGACATGCACATTTTTCAA
CCTTCTTATGGAGTTGCATCTCACATGATTCATGAGCACTCTCAGGAAGT
ACCTCTCACATTTAGCAGGATGTGCATACACAACCAACTTGCCTCCACCC
CTTGATATTCTTCTTGGCCACATCTTCTTATCCTTAATCCACTAGTATAA
TTTTGGGAACTCTTTGTACAAGAAATTCCGCACATAAAGATCCATTTTGT
TCATCTTAAAGTATTCAGTGAGCATGGTACTGGAAGAAGCGGCTAATTGA
CGATATCCTCTAAACTATCGTCCTCTTTGAATGCAAAACATTATGCATAT
TTTCCAATGAAGTCAAAGTTGAAGACAACAGGAGAGACACCATACATTGG
ACAAACGCAAATCTTGTAGACGGACTCTGGTGGCGATATGTACTGAGCAT
CCTTGTATTGTTTAATCTCATTGATTACTCTACCATCATTATCTTCTTAC
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TGGATGCTAGGTACGCATCTCTAAATGGAGTCTAGCTAGGGATTTGCGCT
TTTCCAATGTATGATGTCTCTCCCGCTATTCTCCAACTTCATCTTCATTT
ATAAAATATGCATACTGACGCATTCAAAGAGGGCGATAGTTTAAAGGATG
TCATCAGTCGGCCTCTTTTTCTAGGACCATGCTCACCAAATATTTCAAGA
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AAATTACTTGTTCTATCTAGGTTCAGTGAACCTGCGACAATTTGGATCAG
AGGGAGTACAAAGAGTTCCTGGAACTCTACCCGTGGATTTAGTCGTAAGA
AGATGTAAGATGTGACAGAGAAGAAAATTAAGGAGGTGGGGGGCAAGTTG
GAAGAATTGTGTATGCACATCTTGCTGAAGGTGAGAGGTACTTCCTTAGA
GTGCTTATGGATCATGTGACACGTGCAACTCCATATGAGGATTAAAAAGT
GTGCATGACAAGCTGGGTTCAACCTTCCAAGAAGCATGTGAGCAAAGAGC
TCTCAAAGAGACCGACAAGTCCTTTGATGACTGCTTGACTGCGGATGCTA
CTTTATAGATGCCATGTGCTCTAAAAATGTTTTTCACAACTATTTTGATA
TTTTGCAAGGCAACCAACATCCGATCACTATCGGAGAAGCACCTCAAAGT
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TATCCGAAGTTATGGCCTCTCGGATTTGGATCATATTGATGATGGTTGTT
TTAGTGATAACTCATCGGTGCTTGGTGTGTCATTAGTTTGACATGTTTTA
AGTTGACTATAGTATTATTGTTAGTATTTCACCATTCTTGATGAATAGAT
TACTAAATTTTTCACGTCGTCAACAGATTTAAAATGATGTCTTCCTATGA
TGCGGTAAAATGTGTTGTACTTCATAGAAGGGATGCTCACAAGCTGCCCA
ACAAGGACAACATTGTTCAACTACCTGTCCGAAGATACTCAAGACCAAAG
ATGACCCAAGTTCTTCCCAACCTTTCTCCATGAAACACATCTTTAACATT
TTGATAGATAGCGATGTTTATCATGCACTTGTCATTTGTTCCGGGCATCA
AAAAAAGAAGGGGGATAGTACACACGTGGCCCCGGGCGCGGCAGTGATAT
ATAACTCGTCCTCGCTCCTAACTTTTTGATAGATGGCGATGTTTATCACG
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GTGGGCCGTGGCCCCTAGCACGGCAGTGATATATAACTTGTCCTCGCTGG
AGCGAGTTAACAAGATGGTCCAACTTGATTAGACATGCAGTTCCGGAATA
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TACTCCTTCCATTCGGAAATAAGTGTCACCCATTGTATCTAGACAAATCT
GTGACTCTTATTTCCGAACCGAGGAAGTAATATTAATATCGCTTGATTGA
TTTTTATTGGAGCGAACCTTATGATGCTACTGCACCGTGTTTGTACCATA
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CTTTCGCTGTTACATTCTGCAGATATCTTCTTGCTTAAATTGTGATGGCA
GTGGTAAGATAATTACTGAACATTGCACAAGGTGCTATGGTTCAGGCAAA
GTCAAAGTTGAACGAAGTATAGAAGTAGACATACCTGGAGGTATCGAGGA
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AAGCACTGGGCAACTAATGCATAATCACGTAAATTAATGAACCCTGTGTA
GTTTTCTGCATGTTTTGTTTGAACTTGTAAATTTGTCAAAGCTATGCTTA
AGCCGCCCATACTGAAATTTCTACCCATTGACAAGGTGCTCAGAATTATT
AATTTGCAAAGTTTAAGTAGAGTAATACAGCCCGGATGAAAACTCACATT
TCAGCTCAGTTGATTAGGATCCACTTACTGCAAATAATAATTATTATTAT
TGTTATCCATTCTATTTTATCATGCAGGGGTGTTAGTGGTGACTTGTATA
TATTTGTTCGTGTTAAAGAAAGGGAAGGCATCTACAGAGACGGTCTCAGT
TTGTACTCGGATGTCACGATTGATTACACTGAGGCAATTTTAGGAACTAC
AGTAAAGGTGAGCTGTCAAAACTCAACAGCTCCAAACTGTTTCTGACGCA
TAATCTTTGTCCCCAAGTATTTTTTAAACAAGAATCTTTGTTGTCAAGTT
AGATTACACAAAACTTACACGTGCTTTTATAAACTAAAGTACATCCTTTT
GTTAATCCCATCACGCTGTAACCATTCTTGTTTTGTGCTACAAAGACTCC
CACTTAAGCTTTACCGAGAAAGCTTCCTATTTCAGGTTGAGACAATAGAG
GGATGGAGGGATCTTTATATTCCTCCTGGAATTCAGCCTGGGGAGAAGTT
GAAATTTGCGCAATTCGGAGCTCCTGACATTAAGAGGCCTAACCATAGAG
GAGATCACAACTTTGTTATAAAGGTGAAGATCCCGAAGAATCTCAGGTGT
GAGTTGCCAGTGTTTTCTAACAGCATGTGAGCTACCGAAGAATGTTGTGT
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TTTCCAAGAGTGAACCAAATTGGACATGCTTTTTTTTATATCAAATTGGA
CATGCTTGATTGCAGGCTCAGCAGGCAACAGCAATCGTATGGCATAGTTC
TTGTATAGTTATATTTCATGTGACCTGCCCTATCTTCCCTTTGCTGTTTT
CTCTATTGGCAACTGTAAAGCTGCTGCTACTCATAGTTTTTGTGTTAACA
CCATATTCTTGACTTTGACACGTTACTTTTCCAATATGTTAATTTATGCA
GTGACCAGGCACGTTCACTAGTTGAAGATCTTGCTGCACTAAATGGAACT
CAGGATATTTCAGTTTCTGGTGATGGTACGTCTTCCCTTTTCTGCATTTG
CATGGGTACATTATTCCTGAGAATTTTTGCTGCCTAAGCTTTTGGCTTAA
TCAGAAACTATAGACCAAGGAAACTTGAGAAAGACAAGCCATCATTCTTC
GGCAAGGAAGAAAATATCATTTTGGGGGTCTGTCAGGAATCTCTTCAGGT
ACATGTAATATCTTATTAACTTTTGTCGCAATAAAATGCAACAATGGATC
TCTTGTACTGATACATCAATAGTACTGCCTTTACATTTACATTAAAGTAT
CAAGCCAACTCATGCTTCTTCTGATGCATAGCCAAAAGGACAGAAACTTA
GTTTTTTTTTTACTTCAGATCCTCTAAATCTGTAGAACTCCAATTCACTT
ATGTTAATAAGTCCATTCATACCATGCTAGGGCTGATGATGGGGATCAGA
GATTTGCTTCAATCAGTGCACACTCTGTTATTCCACGGTGGACTTCTCAA
CGAGGAATTCATCCGGCTGCCCGTTTGTTAGAAGGCTGCTTCATGATCAC
AGCACTCATATTCGTGATGAGCAGAATGGTTAAATTCAGGATTTGCCCGA
AGCAGTATGAGCCCGCAACTGAAGCTAAACAAGCTGAAGATGGGAGTGTG
AAGTTCTTTAGTGCTGTTCGTTGGACATTAATGGTGTAATAGATTGGAAG
GTTGCACAATCTGTTTATCGGACAGATCGCTGATCATACTTTTTGCACCC
GCTAGCTTTGTTATATTGTAGAGGAAAGCCGTGAAGAAGCAGCAACCAGA
GTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.