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GrainGenes Sequence Report: AA044702

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Sequence
AA044702
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA044702
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCGCGCCGGCCTCCCGCTCCGCCCCGCTCCGCCCGCCGACGGGGCACTG
CCGCGGCGGCCATCCGGACCCGAGCTGCCCCTGCCCCTGATCCTGCCCCC
TGCCGTGCACTCCGCCGCCTCCTGCTCCGCGCGCTCGCCGGCGGCACCCC
GCGCTCGCTGGCTGAATCTGCTAGAGTTGCTATACTGCTTGCTCCTATCA
AGCCCAAACAACGGTGGCCCTCGGCCCATCTCGTAACCCAGACCCAGGTT
ACAAACCGCAGAAGCTCTCCCAGACGTTTTCGTCCCCGTGCATCTCCTCC
GCGTCTGTGCGACGCTAACCTGATGGCTGTTGACAGGGAGCGCGTGCTTT
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CAGCAGCGGGGCCAGCACCCGGCAAACGCTCCAAGCCTCCAACGGCACTA
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TGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTCTTGCAGTGCGTTCGCTCGCATGG
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AGGGCTAGCAGCGCGAGGGAGAAGGCCTTTGTGATGCGTGTTGAGGAGGA
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GAGTTTGATACTGCAATTTGGTTCCTGCAGCTGCATTTATTTTCTTAATG
AAAATTATGTGCTAGTTTGCCAATATCACCTGACCGAGTGTTGTGTTATA
TTAGAATTGGACCCTCTGACATTTGGTAAGATTTACCCCAACAAAAAGGA
AGAGATGTATGATTTTCAGATTTTGAGCGGTAGCCTGTATGCTTGTAAGA
AAAATAGCCTCTGGCAGGAAGAATTTAAAATGATACCATCAAGCCATTAG
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TCATGCTGAACTGATTTTTGGAAAAATTAGTGTTCGGCTACTTGGTTATC
TTTCAATCAATTTGTAACTTCTCATTGCGGACACGTAAGAGGACAATCAT
TAGTCAACCCGATGTGTCGCATTAAATTTTATGTTTAAGCAAGAGGCAAT
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ACAGTTCATTAACCACATACTAAGCTAAGTCATCTACCATTTGCTTATTC
CTGGCAGCTTCGAAGAATCAGGGGATGAATTAGACTGCAGTGGGACATCA
TACAGTTTGATGGAGAAAAGGAGCATAGAGAAGAGCATTCTGCTTGAGCT
GGAACGCGAGCACCATCTCAAAATTCAAGTGTGTACTGGTCATTCTACTC
TGTAGTTCCTATCTAATAAGTTGTTTGTTTTCTTCACTCATGATGTTTGA
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GAAAATGTATGTACTCTCTTACTTATCATTTCTAATGCTTCTCAAAAAAA
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TCTTTGGTGAATAACACATTTAAGATACAAAGGAAGTTCTCATACTGTTC
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ACATAACAAGCTAATTGGCTAGTTATGTCCTAGTTTGTCAAAATTGCAGT
GTTTCCAATGGTGGTTTCTTTGTAAATTTATCCCATCTCTATTTACGATG
ACTCTTTGTTTGATGGTATAGGGATTTTATGGAATGGAAATTGGTGCAGT
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TGTACATATTTGCGAAAGGTGAAAGGTCGTAAAAATTGCTTTAAAGGCTT
TTTTCCCCCAAAATAATTATATGTATAAGTACTGGACATATCTCCGTTAG
ATTGATTGGATGACTAATGCCAATATGCCGCTGGTCTATTGGTCGGATAC
TCTGTTTAGTGTCTCTTCCACTATATGCAACATCCCTGATTATAATTCGT
TTAAACATGGTACTTATGTGAGCAAGGAGATTTTTTCTAAGTAAAAATTC
CAACTTTCAAGTGCGACCTGCAATAATTTGCATAATGAGTTTGCTTTCTT
GCTTACAACTCATTGAACTTTGCCATGCATAATATATAAGTAACTAAATT
TACTCTATGCTAGTATGCTTGTAGTGCAGAGTTTGTTCAAATGACGAGAG
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CTGTTCGCTTGGTAGCATATCCATCTTAGCATCCTAATGGATCTTCTTTT
GGGGCCTTTATATCTTTTCTATCAAGTGTCTTCTTTTCTTCTTCAGAATG
GCATTTGCCTGCTTGTTTTAGGATTATGTTCTGTTGAACTATCAATTTTA
TAGATGTCTGCATTGTTATTACAACACCTGATAATTATACTTCTAAAAGC
CTTACATTCTAGTTCATTCTTCAGAGTTCTTTTTTTTCCAGAAACGTTGC
TTGATTTGGTTTGTAGATAGATTGTCTTTGTGAGTCACAGACTCGCATGA
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AGATGCAGTATCATGTTATGTTATTGCTTCTTGCAGTGCAGAAGTACTCG
ATAAACATTTGTCTATGGTCCAAAGCGATCATGAACAAAAATCCCAGATT
GTGGAACGTAGAATAAGAGATGATGCGGCTGTTGAAGAAGCTAAAAGAAG
GGAGCAATCAATGAAGGAAGAAAAAATAAAGCAGGAAAGGACCAGACTAG
AAGCAGAGGTTTGTTTGCACATATTTGTCATTAAGTAGATCTTTTCCTAC
ACACATGGTTTGGTAATTTGGGGGCTTAGTCCATTTTTGTTAGGTGTGGT
GTGGGTTGGTTGGTTCCATCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTT
TTAGGTTTGTGAAGAGAATGTATCTAGACTTGTTTTAGTGTGTAGATTCA
CTCTAAACATGAGTGAACCTATATACTAAAACTAGTCTAGATACATTTGC
TTCACGAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAATATTTT
TTTTTTGCAGGTAATTTTTTGTTGGTTGCTGTTACCTTTTTCTTCCAGTT
ATGTATTCTTCTTTCCTCAAATTTTATTACCAATTGTTTGCTCAGGAAAA
TATTCTTTCCTTTACTGCTAGTCAGTTAAATGCCTGCGCAATTAACCTGA
ATCTTCATGAACGGTGATGCAGGCCAGGCAGAAGGCAGCTGCAAAATTAG
CAGCTGAAGCACAGAAAGCAGCATACGAGGCTGCTAAAAAGGAAGCTTTA
GAAAAAGAAGCTGCTAAATTGAGGGCAGAAGCAGTTTCCACATCTGGCCA
AATTTCTCAGAACAGTGTTGCACATGCAACAATCGTAAACAGTATTGAAA
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ATAGAGATTATAGGAAACTAGTTCAGCATCCATGCAAACTAGTCAACCTG
GGTGGAGATACACATTTTTGGACAAGTTATTTCTTATATTGGTTCTCAAC
TACATCGCTATGCCCCATTCTTAAATAGAAAAGTGGGCAAAGTGTTTTCC
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GGATTGCTGTTAATTAATTAATTGTCATATTTATACCAGGGATCAAAGTT
TATGCTGATAGTTCTGCATTAAAAGCGGAATCACGGAGGCGTGCATTACA
AGACCAAGTACCATCAAACATTTACCTCAGCAAGGTCTTACTTTCTCTGA
AGGATCTATCATCTATGTCTTCAATTGCAATTTAGAACAACTTGCTGCAA
CTGGTTGATTTGATAGTTCTGATATGCCATCCCTTTCTCAGTTTCCATTG
CACTACTATATGTTAGCCCCTGAACTATATGTAGTATAATGCGTACCTGT
ATGTCTGTATTTGACTGATACCATGTTATATTGTGCAGGAGTTCAGCCGA
CATGACCGACTAATTGGAAAGTCTATCAGTAAACTTATGCCAACTACTGA
CAGTGTCAAGTGAGCATACAACTTACAAACTATGTACTTAATCCTAGAGT
TCAGTTCAGATAAGGACATGTGAAATACAAGAAAACTACTATTGCACCTT
CTTCAATTTTTCAGTAATAAGAAAACATATGTTTTGGCTTCGTTCTTGGC
TCAGGTTCCAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTTTTCTGAAACACATGTAT
CTAGACGCCTTTTATTGCGTAGGTTCACTCATTTTGCTCCGAACCTACAC
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GCCGAAAGTGAAAGGATTGCTATTATAGAAAATTGTGAGGGACTGAATTG
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CCAGTTCCAGTAGCTTGCACCATTCAATTACTCAAGTTGTGGACACGTGC
TTTTAAGCATCTGTTGCTGTCAGTTTTACCAGCATGCCTGCAAGGTTATT
AGTTCTGATTTATTGTTCACTAATCCTCCTTTTCTCAATTGAGTGTGTAT
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TACTTCAATCTATCATCTGAGCTCTTATTAATCCTTACTTCCTTTCAGAG
CCAGGGCTAGTGAGCTTATTAAAGCTTTAGATGGACAAGATTGTCCTCGC
CCAATTGCTTGTCGTTTATTTGCAGACAAGGTAGCTACTTTATCTTTTTA
TTTTCTAGGGGTATACAGCATGATCATGCATGCATGGCTACTGGCAGGAT
TGGTATATAAGTATGAGTAGAGTTACACACTTACACTTGTTAATCGAAGC
TTAAGCACTTGCTTTGTGATATGTTCATTGTTAGCAAATCCTGGTTTTCT
TGTTTAGCTTATATGTACTTTCACACCTTTTGTTTTGGCGAGAAACATGG
TATTACTACTTAATTTGTTGTATTTACATGGTCTTTATATAATTATATTA
CAGTCTAGATGATGTGATTTCTGGTAGCTGCTAATGTTTGCTCTGGACAC
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ATATGCACATTTATATAACTACTAAGGCAGATAAATATGTCTTAGGGAAA
ATACAGCAGCACATCACCTGTTGTATTCAGAACCCTCCCATACTGCTACC
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CCTGGACTGATGAGTTCAGGATTTCTAGGCTATCATTCTGATTGAGCATC
TAAAAACTCTCTTTGATTGCATTATTGAATGAAATGTGTATATTAGTACC
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AACGAACAGGTTTTCGAGGCAGAAACCACCTGCTTTATAGATGTCAACCA
TACGTTATCCTGATTTCGTGTAATTAACTTCTTAGTGACTCATGGATAAA
TTCTTAAATTTCCAAGTCTTGGAATGGAATTAGCATTTTCTTCTTCTTTG
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TTCTCTCCCTCACCTCCTCCCTGGCTACCTTAGTTATGGTGATGATCCAA
TGCTCGTAACATCATCACCAAATTCTTACTGCTAGAGACAGTGCCCCTTA
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TGTATATTCTAGACCACAATCGTGAAGGTTTTTGTAGAGAACATGGATTT
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TACGTGTTACATATTAACATGCTCTGTTGTATCGCTTATGGCACACATAA
TAAAAAGAGGGCATTTTTCAATAGTATGGGCCTACACATTTATACAAGTA
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GGTTCTCTGTTGTTCCTGATTAGAATTTTTTTGGCCTTCTTATATACTAG
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GCCTTTGCTTGTGGATATGTCATGCTGCTAGTCACAAATCAGGTATCTAT
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GATTCCTATAATTTGCTATTTAGTTTGTGTTAATGCAATGCTAACATTAC
TACATAGTTGAACAAAGCTGAAAATTCTATTAACTTTCTGATAACCTAGT
TCTTTCTTACAATTCTGGTACATGTAACATATCTTTGACATTCCGGAAGG
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GCTCGAATTGTGTTGAACTGAAGTCTGAAAATAATTACTTTTTATTAATT
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ACTTGGCGCTGATAAACACAGGGCCACTGTAGATGTTCTGTCAAGGCATA
TGCTGTCAATTTGTCTGTCTAAAAGTCAATTTTGCAACCTATTTCCTATG
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AGTTATATATTCCTCTCTTAACTCATCTTTTTACTCAGTTTGATAAGTAC
TACAAAGAAAAATACAGTCAATTGTTTTGTCATGTGACACATGTGTTTGC
TCAGGTACCAGATGCAATGGATTATCTTCTGGCGGAGTTTCACAAAGTTT
GCATGTATACAGTTCCGAAGCATCTGCATGCTTTAAATGTAAGTCTGCAT
GCCACTGAACTTTCCAGCATTGATTTGCTTATCTTATTTGGGGTAGTGAA
AAGTCTAAAAATGTTTTTTTGTTGCCATTTCTTGGACTATGTGCCAAAAG
ATACAAAACATTTCAACCCTATGAACTATATATATACATATACGTTTTTT
AACTGTGAATGCACCTGGTTCTATGGCTCGAAAATATGTACTTTTCTGAA
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TACGTCAAGCTGTATGCTGCCATGATCCAGGTGTGTACAGTTCTTGTCAA
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TCCTTTTCCCTACTAATTGGCTGTTTTCCTGTTAATTGTAGTCCATTAGT
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GCGACATCCACATGGCTTAGCTGAGGGATGGAAATGGCTTGCGATGTTCC
TCAATACTCTCCCAGCCATCACAGCCACTGCTTTTGCCCTTCATGCTTTC
CTCAAGGTAGAAATCTGCACCAGGAATTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTGT
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AAGGACAAAAAACATCTGGAGGAGCCGGAAGGGCAGTACCTTGCCCAGCA
GCTGCTATCAAAAGGGTACATGTGAAGATCAACACGGCATGGAGCTATCA
CGGTGTATGGACGTCGTCGGCCAGGTCGTTATCCACGATTAGCAGCAGCG
GTTGCCAGCTGGGTGCTCCATGTGCTCAGAAAGGCAGTTAATATTTCGTC
GAGGGAGCGAGCTGCAAGGTTATATAACTATGGAGAAGCCCGGGAATTGT
CTCGAAGATGAAGACTGTTTTAGATAGTCTTGATGATGTATCGTCTTGAA
GATAATTTCAGATATCACGGGTTTCTTATATTTTTATGTGGCACATATGA
ACTTGAATATGAATTAGGATAAGTGGAGGTCATGCGATTTGTTGTATTGT
ATGATTGTACGTATGTACTGTGAGGGGCAAATCTTCTACTTACTGTATCA
GTTTGCGGCAACGTTATTCTGAATGCAATTCATCTGTGTTGACCAAGTTG
TCGTTTGTAATGTTGAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.