Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA042212

[Submit comment/correction]

Sequence	AA042212
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA042212
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGAAGCCCTCCTCGGCCATTGTTCTGGTGCTCGCAGCTATTGTAGCACA ATATCCCTCCCTTGCGACCGCCGCCGATCCGAAGGTCATCATCGTCGGCG CCGGCATGTCCGGTAAGAGCCTAGCTATTACACTGGACACATGCATGGAC ATGGACATTGCATACAGGTCTGCGTGCATACTTAATGCAGTACCGATCGA TCGAGTTCTTGTAGGTATCTCGGCTGGGAAGAGGCTATCGGAGGCCGGCA TCACTGACTTCGTTATCCTTGAGGCGACCCACCGCATCGGCGGGCGCATT CAGAACACCAAGTTCGCCGGCGTGAACGTGGAGATGGGGGCCAACTGGGT GGAGGGCGTGAACGGCGACGAGATGAACCCCATTTGGACCATGGCCAACG GCCCCGGAGGCCTCAACCTCACGACCTTCCGTTCCGACTTTGACCACCTT GCCAGCAACACGTACAAGCAAGAGTACGCATGAGACTTACTATACTCCAT CTATAAGTACGGAGTTATGTAAAATATATATTTTTAAATGTCTAAATATT CTGAAAACTAATTTCACATGTTCAACTAGACATTCTATGTCTGCACATAA AGTGCCAAAAAAATAACATTTTCCATGCTTGTGTAAAATTAAAAATAAAA TAAAAATAGTCTCATGAATAGCCATATTGAAGAGTTCAATATTTTATTTT TTACACATTTCATAAAAATATTCCTTTTTCCTGAAACATTATGCGCAAAA ATACAAAATGTTCACATATACATGCGATTTTTTTGGGGGGAAATTTTATA TTTTGAAATGTGATTTTAGTCAATAGGTTTATATACATATAGGAGCCAAA GTAGATTTCTGGTGTACATCTTTGTTTCCGTAAAGAATTAATCTATGTTA AGTTTGATCCGGTATATATATAAAAATATCAACTTCTATAACATTAAATT AATATTATAGGTCGGCATGAAACATACTTATTGTATGTAATTGTTATTAT AATAAGTGTTATTTTTTATACTTGATCGAACTTAGGCTGGTCATAGTGGT AGTATAGTATCATGCATATGATAGTATGATACTAGTGTATGATATTATCT TTATAGTGCATGGTATCATATGGTAGTATCATACTAGTACTATATTTAAT AATTTATAAAATCTTAATATAAAATTGTGCACAAGATTTATTTGTATGAG GATTTTCTAGTTTTACGTGCTATGATATGGTATCTATCTATGATACTCTA ACCATCTTTTTCTTTATTAATTGTTGTGTCACATCAGATTTTTGCAAATA TGACATGTATGATACTAGCTATGATACTCTTACTAGGACCAGCTTTATAG AAGCCTTAACGTTTACATGGAAAACGTACTTTTGGTAGTAGGAAAATTAG TTCTATAAAATTTGGACGACTTGAAAATCTGGTACAGTTAGGGTATCTAT TATTTACCCTAGATGTTGAATAGGCGCGATCTTATATTTATTTTCCTTTT GTTTCATCTACATATATCAGTTACTTTTCTTGAAATAACGAACCTTTGTG TATTATGTTACAAGTAAATTCTCTTGGACAATGCCTATATGTATACTTTC TTGTGTGAATCCAGCGGTGGTCTTTACGAGAAGAAATTTGTTGAGAAGAT AATCAAAAGAATGGCTGAGGTGGAAGAGAGCGGTAGCAAGCTCGCCAGTA CCTTGCACCACAGCGGCCAACAAGACATGTCCGTCATGTCCATGCAGCGC CTCACCAACCAGTACGTATGCACTCACTAATCACACCAGCTTGCGCTTTC AGTGTAACGCCTAGTGCAGTGTGCATACCTTCGAACAATTAGATCCGAGA AATTCTTTTGGGATTAAACTTGTAGTGACTATGCATTTATCACATGTACC TTGAGAAATTCTACGAGATACGACTGTTACCCAGGTTTAGAGCTAACGTG GGTAATAGCTCTATTTTTGTGTTGCAGTTTTTTATACAACTATCATATAT AATAGATTACAGTTAATGCTATATAGGGACAAGTTCTAATGCATGAACTC GAGGAATCTAATTATGGTCAAAATAAGACGTATCCTGAACCGATAGGATT TTTAGATGATGATGGCGAAGACAATTGCTTAAACTTCTCTTGATTTGAAA ACCCTGCCCTATTGGGACGACCTTGGGTCCTCGTTCATATACCAGGGTGG AGAGACGGTGGCTCACTCAGAGAGTCCCAAGAATCCAACTCCACGGCATC GATAGATTCTAAACTTACCAGATGCTAGAGAGATTCTGAGGCGATCCTCA TGCATGATGCATAGATCCGACAGTGAAACGTTAGATAATCTCTATTTAAC ATATCCTCCGTCAGCTAATCTATGTTTCTGGTCTGTCATCTAAGTTCAAT CATAGTTTTAAAATCCGGACCAATGATCGAACCGGTGAGACGACTGGTTC GCTGGTCAGACCAGCGGTTCATCCAGTTTGATAGCGACAAAAAACCGGTA TTTTTAATTAAAATTTAATCAATTTTCAGAATAAAATGACCATAAAAGGT ATATATATAGGGTATATTTCAATGTGTAATCACAAAAGATGGTGAGCGCA AGTGATTTTGGGCCTTAGTTGGTGTTATTTCTTTCTAGCAGAAGGTTGTA AGTTCGATTCCTGTTGCAACATATTTTTTTCCACTGGTTTTTTGTTGTTT GGACCGTTGCCTCTTAAAAACCAGTGAGACCGTCGGTTCAGGTTTGGTCA GACCATCGAACCGGTTCGGTTTTTAAAACTATGAGTCCAATGATCCAAAA ATTGGTGTGTATGAACCTTTCGCAAACTTGGTCGACACTAGATTTGGATG GTCGACATTTCATTTTCGAGAAAAGAAATGGACGACCTTTGTTAAATTTA AAGAAAGATGATTGAGCGATATAAGATTCCACTCAGTTGCTAGAAATATG TGTAATGGACCAGCGCTATTACTAGGAGATAATTAAGGAATAAAAAGCCA TTTATACAGGACTGGTAACTGAGAAGTCAGCTAATGGTTGATGTTCACCT TTCTATCTCTTACTTATATTTAGAGTCACTTTCGAAAGAAAAAAACTTAT ATTTAGAGCATGTGCACAGTTTAGACATGAATCTAGCAATAAAGTGTGCG GCCACGACAATAGTGAGCTAACATGGAAAAAATCACCGAGGTGGTTAGCC ATCTTAGTAGGATCCATAAACCTAGGAAAAGGTGTCTTTTCTGCTCACAG CCCTATCATACGTGTTGGGGTACTGGGAGACTGACAATGAGCCTTTTCAA CCTTTTGTTTTCTTATTATAGTTGATACTAGTACTACACTCGAGTCTAGA TTTAGAAAGGTTTTCTTAATTAGTCAATGGTTTTCTCATACACTTCACAC GTCCTTATAGTACATCTCTTCACCAAAGCTTTAATTAGACTTGTTGCATA TCTTCTCATGATACTTCCTCTTGCTAAAATATAGTACATATTAGTTTTAG CCAAAGTCACTGTCCATAAAGTTTGACTAAATATTTATAGAAACAAATCA ACATCTACCATATTAAATACATATAATGTGAAAGTATATTTTATGATAAT TTTAATAATACAGATATGATGTTGCGAATGTTGATAAATTTTATACGTAT TTGGTCAAACTTACAAATTTAAACACACTATATTGTGTCAAAAATACAAG TATATATATGTTGCAACACATGACGTAGTTATGCAATTTTTCTTCAAACT TGAAGTGTATGTCAGCAAATAAGGACCAGTCGACCACAACCGTGTTCACG AGCCAATAAGTGCATGGAGGAGAGTTTTATATAATATCCCTCCATCTTAA AATCGCAGATTTGTTTAAATTTAGATGTATATAGATACTATAGATACATC TAAATTTAGAAAAAATCACAACTTCTAATTTTAGACGGAAGGAGAACAAT TTTCCACTTTCTTTTTGAAATCGTTTAGTATTATTTCCCAATGTACATGT GATCACATCGTTACCACCTCGCCGCAAAAGAAACGGCCTTTGATTAATAA ACGCACATGCATGCCATGCATATAGTTTGTTGCAGCAGTTGAGAGTTCCC AAGCAATCATGTCTCGATCGAATGATCGATGCTACATCATGTTTCGACAT CATATGGTTGCGTCATTGCGTGTGACACATTTCTTTTGTCTGCGGGCATC CATACTGCATGTTTTGCTCGTGTTTTATTTGATTTTGCCCGTGCGTGCAA TTTGTGCGACCTGCGTACGTGTGACATGTACTGTGTTGCAGTATGCCTAC CGGTCCATCCACGCCGGTCGCCATGGTACTTGACTACTACCGGCACGACT TCGAGTTCGGGGAGCCGCCGCGCGTGACGAGCCTGCAGAACACGCAGCCG CTGCCGACGTTCAGAGACTTCGGCCACGACCTCTACTTCGTGGCTGATAA ACGCGGCTATGAGTCCGTCGTGTACCACGTCGCCAGGCAGTACCTCGAGA CCGATCTAGAGTCCGGCGCCATCGTCGACCCCAGGATCAAACTGAACACG GTGGTGCGTGAGATCGCCTACTTCCCCAGCGGCGTCGCGGTTAGGACAGA GGATGACATGGTGTATCGGGCAGACTACGTCATCGTCTCCGCTAGCCTCG GCGTCCTGCAGACGGACCTCATACAGTTCAAGCCGAAGCTGCCTTCATGG AAGACCACGCCCATATACCAGTTCGACATGGCGGTGTACACCAAGATCTT CCTCAAGTTCCACAGGAGGTTCTGGCCGGAGGGTCATGGAACCGAGTTCT TCCTCTATGCCAGCGGCAGGAGAGGGTACTACCCGGTGTGGCAGCAGCTG GAGAAGCAATACCCAGGGTCCAACGTGCTTCTGGTGACCGTTACCGACGA CGAGTCGAGGAGGATCGAGCAGCAGTCTGATAACCAGACAATGGCGGAGG CGGTGGAGGTGCTCAGGAAGATGTTCCCGGGGAAAAAGGTTCCTGAAGCG ACGGAGATACTCGTGCCCAGGTGGTGGTCCAATAGGTTCTTCAAGGGCAC CTTCTCAAACTGGCCCATTGGCGTCAGCCGCTACGAATTCGACCTCATCC GGGTACAAACATATACTCCTCTGAGATACCTCCGAATCTAAAAAATCTGA GTCCATTAATTTAGATTGGAGGTAGTATATTTTTCTTAGATTTTAATTAG CTGTCCTCTGAAATCCCTTGACAATATATGTTATTTCCATGTTTTTCTGG CATGTAATTCAGGCTCCTGTTGGGAGGGTTTACTTCACCGGTGAGCACAC GAGTGAAAAGTACAACGGCTATGTCCATGGAGCGTATCTTGCAGGTACTA GTAATTTTTTTGACCGTAACAGGTACTACTGTGGTAATTAAGAAGTTCAT CTCTCATGCTTTGCTAAGAGTTTGGTATCTTGGTTTGAACTCCGATCTGA GATATCCCATGCAACGGTGCTTTCTATTTATAATTTTTTTTAACTCGGTG CGACTGTGTTTCCTAGGCATTGACTCTGCTGACATCTTGATCAACTGTGC AAAGAAAAAGATGTGCAAGTACAATGTCCAGGGAAAGCATGACCAAAGGT AACTACTAACTAGTTCTACTGTTACCTTTAGCCCATAAGACATGTAAAAA ACATTTAACCCAAAAGGCATGTAATGAAACATTTATCCCATAAAAGTTGT GCCTAACTGTGTTGCTGCCCTGATTCACATTTTTATCCATGTTGCAGGTT AGCCACCGAGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.