Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040866

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040866
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040866
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTCCTCAAGTTCCTCCGCGCGCGCGAGTTCAAGGTCAAGGAGGCCAT
GCCGATGCTCAGGGTGGCGGTGCTGTGGCGCAAGAGCTTCGGCATCGACG
CGCTCCTCGGCGCTGACCTCGGCGTGCCGGAGCTGGAGAGCGTCGTCTTC
TACCGCAGCGCAGACCGCGAGGGACACCCCGTCTGCTACAACGTATTCAA
CGAGTCCCAGGACAAGGACCTCTCTGAGAAGGCCTTCGGCGACGACGAGA
AGCGGGAGCGGTTCCTCAAGTGGCGCATCCAGCTCCTCGAGCGCGGCATC
CGCGAGCAGCTCGACTTCTCGTCCAGCGGCATCTGCTCCATGGTGCAGGT
CACCGACCTCAAGAACTCGCCACCCATGCTCGGCAAGCACCGCGCAGTCA
CCCGACAGGCGCTCGCTCTGCTTCAGGACAACTACCCAGAATTCGCCGCC
AAGAAGGTGTTCATCAAGGTGCCATGGTGGTATCCCGCAGCGCACAAAAT
GATGAGTCCATTCCTCACACAACGCACCAAGAGCTACGGACGCCGAGACC
CACGGATCCGAAGGCCGATCCCGTACCCGGTGCCGCGCCAAGATCTCCGA
AAAACCCCGGTACCGGCCAAGTTCGCCATCGACCTCGAGAACGCCTACAC
GGAACGACAAGATCGCCACACGGATGGAACCCCAAGGTCTTCCCCGGGAG
CGACGAGCTCTTCTACCTGGACCCGGAGACCGCAGACGCGACAAGTACTT
CTCCCTGGAACAGATGCCCGAGAACCCAGACGCCCAGGTCATCGGCTCGA
ATACGACAAGTGCTCCTCGAGGATGCCAAGCACTTCACCCCGGATGCCGA
GACCGTTCCGTCGAACCCTGAGACCGACCCTGAACCCCGGAACCCCAAGA
CCGTCGAGACCCCTCAATGTGTGACCCTTATCCGAACCCCTATTTTCATA
AATGCTAAACATAAAACCTGTTGCATATTAAATGGTCATATTGCATGCAT
ACTAATCATGTGGTTTGGGGGCCTTATGCCGATTCACCTCTAATTAAATA
TGGGGCCCATATGCGGGCAAATCTAGTCTCATATTGGCCTCATTTAAATT
TGTGTAGCGAACCGGTAACTCATCTTGCCTTGTTAATACAACATCTAAAT
TGCGGGGGTTCTAAATAACTTGAACCATTTAATTAATTGTCGGGACCCCG
GTTCCACATAATATGACCTAATCGCATCGCATCTTTGCCATGCCATACAT
CATACATGCATCATGCCGATCTTCTGCCGTTGTATTAAATACTACATCCG
GTGTTTCTTCTAGTGTTTTGGTTCTTCACGGATAAGGCCGTTGAGTTGAT
GTGAGCTTCGCCCCGATCTTCGGTTGAACCCTTCGACAATGTTTTCAGGC
GAGCATCCCCCCCTTTTTCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTATTCCC
TCCTGTTGATCTATTGCTATCTGTGTTGCGATGCTCTAGTTCCCATACCC
GTGATATCCCTTGCAGCCCTATATTGCCTTGGACACACCCTATTACCTGT
TGTTTGGTAGCTAGTTGGACCTGCGCGTCTTAGTCGCTTGCTCAAGTGCT
GTTGCGTGTCGTCAAATGCCACAGTGTTGATGTATTCCGCATGTTGTTGT
TGGAGATGATCATAGTTTTACTTATCGTTCACTTTAAATTCCTGTTTAAC
AACTAAAATTGAATTAAGCAGAGGCATCGGTGGGTGATAGAAAATATTTG
GTTTCCGAACGCCCACTTGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTACTTGATACCT
GTTCCTTGATTTATCGCGCTATCCACATCCGGGAGGTATATGGGACCCCC
CTGAGCCAGAGCTTGATTCAGTCTTATTTCTTGGGGCCACAAACTAGTTT
GAGGTTTTATTTACGATCCTGTACTTATGCCATGCTACTTATGTATTTAC
GATTGTGCGAGGAGCACACTGTACTGTTTAGGATCGGGACACGATTCCGC
GGTGTCGACAAGCCCAGCCACACTTTCGGGTTCCCAGTCGTTCACAGCCG
TCTACCCAAACCTTGAGTCCGTCTCGGAGTCAGCTGGCTTCGTTGCGGGT
CTACTCAATGGGGTGGCCCCCTGAAATATTTCTGAATCCTGTGATTGTTC
AGTCGTGAAAGCCTCGTTGGGTTTTGAGTTGGTTTTTCCGAGGTTGATCG
AGCGTGTGTTGCTATTGGTGCACCCCGGCCGGGTAAAACTTTCTGAAAGC
CGTGTCCGCGGATATGGACGACTTGGAGCACAGTATCTCGATCATAGACA
AGCATAACTAAAGTTTATGGCTATAAATCTGACTTTATAATGACTAGTAA
TCAGCTTCACTATAATGGAATGGCTAATTAATACTGCCCACAATTGCTTG
TTTGGAGTGTCGCTTGCGACCATTGTACCTGACTAGTAAGTAATGCAACT
ACAACGGAATGGCTGAATAAAAGTACCAACAACTGCTGGGTTTTGGGTTA
TCTCATGCTAATCGTATCTGACTAGTAAGTGCTGCAACTATCACGGAATG
GTTAACTAAAAGTACCCACTGCTTACTTTATCAGGATGATTATCTAAACC
TGACTAGTAAAGTGCCGCAACTATAACTGAATAAGTAAAACTGCCAACCG
TGTGAGTTCCTCGGTTGACTTCCTCGTTTGGTATCGAGGGGGAAACACCA
GGATGGGTTTGTCTGGTGTTAGCTTCAGGTTGGATCCGGATAGATCATTC
TTACCCCTCTCTGATAACCGCTAGTTGTATCGAGTCTCTATAGGTTGTTC
AGTGCATGCTGCCGCTTCAGTCCACCATACCTATGTAGGCGAGGACCGCC
GAATTCTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTCAGTACTGACGCTCCTCTTTTT
CCTTTGCCCTTTGTCGGCACCCCCTTTTTGTTTAAGCAGGTGTTGAGATC
GACGTCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGTTATGG
ACGCCATTGGTTATTCTTCAGAGCTCTTAGCCCCATTTGCATCTTGTCCG
TAGTCGGACGCTCTATCATTTTCAAGGTGATTTGGATCTTTGTATATTAT
ATCTGTATTCTTGACTCATTGAGTCACTGCTATATATATCTGTTATGTGG
GTTCCGTCGAGGACTGTTGTGTAATGTTATTACTTCGTTTTCCACCCGCA
CGAAAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTTGGCGG
GTTTTCGCTAAAACTTGCATAGGTCCGATTTTGAGGGTGTTACAATAATC
TCATCATTTAATTACATACCATGTCATCTAAATGCTTAGTTGATAATACA
TATAGGACTATGTTACTACCCAAGTTCCTCCCACTGTGACTAAACTTAGA
GTTGGTCCCAAAGAATAACTGGTATCGAAGCTCTGGGAGGTCTACCTATG
TGGGCTCCCCGGTCGAGACGTTTAGAAAGTCACAACGCTTTGATAAGTCA
CCATCGGTCCAAGATTTCGTGTCTATGCATTGACGGAGTTGCTCGCCGCC
ACGAGACACACACAACACAGAAGCGTAGGTAGCCGGAAGGTCATCTCTGC
GGAGGCGCTCGACGAGCAGGTCGGTTGGCCCGGCCATGAGATTAGCATTG
TCCCTCATGCAAGATCCACAACTAATCTTGTTGTTGGGAGAGTGATGGAT
CACGTGGAAACATAAAATCCTATGTAAAAGTTGGTGTCGGTGGCGGTCGT
GTCGGTACAGAAACATCTATTTCTCTGGTGGTCTAGCCTCACCACCATCA
TTCCATAGTCATGTTGTATATGGAATTGAGAACTTAGGGCCCTTTTGGTC
CATAGGAATTTCATAGAAATTTTGGAGGATTCCATTACTAAGGAATTTTT
ATTTTAAAACTTGTTTTGTTTGTAGGATTTAAAACTAGGTATATGAATTT
TTTTCTATGGACTACTTTGCATGTAATCCCATAGGAAAATTCCCCTTAGA
TCCAGCCTTATGAAAAATTGCTTTGTCTCAATGACAAGTATGACATGCAC
ATATTCTTTCACGCAAAATTCTGTGCTATCTTTATGATGTAACCAAGCAG
CCACTGATAAAGATTCTTGCATTTACATTTCGTGTAGGATTTCATACAAC
ATGCCATGTCAATTCTATGGTTTTTCTATCCCTACATTTTTTTAACTCTT
GCGGACCACACAGGCCCTTATTATGGCTAGAAAAATTAGTAGGTCAGTGT
TGCCTTGCATTTTACGCCACTTTTGGCCTCTATAAATCAGACCTATATAA
TAGGATAAAATGGGAGATCTTAAATATATCACATAAGAACACAAAATTCT
TGATCGGTCTTCGTTGCGCACACGCGAGCGATTAAAGATTGTTTGACCAA
AAAGAGATTTGTACGAAAGACTTTTTTCTCTAGTAGTACAAGTCGAATCC
AAACAGTGAATTTGTCTTGCACGCGTGAGTGGACGTGTGATGTTAGGACA
CTAATTAACGCTGACTCGCTAGCCGCGTATAAACATCCATGAACTCGTAC
CCTGCAAGCTACACCAAGTTTCCCCGTTCCCCGATCTAGTCAATTCGCAG
ATAGCTTTGTAGACCCACCATGGCCGCCGTTTGCCTGTCGGACCTCCCCG
ACGACCTGCTCTGTCACATCCTCTCCTTCGCGCCATTAAAGGAGGCGGCG
TCCACAAGTGCGCTCGCGCGGCGGTGGCGCACGCTCTGGCTCTTATCGGG
CGCCATCAACTTGGACTCGCGCACGCGCTACTCTAATATCATGTGCCAGC
GCACTTATTCTCGGTGCGAAGCGCTCTATTCTAATGTCATGTGCCCGTGT
CGTACCTTTCGGCGCGACGCCAGGGCTGCGATGGTTGCATATCGCTCCTC
CGGTTTTCATGTGAAGAAAATCACATTCTACTACGACGACTGGGGCCGGG
GCGACATGCGTCGCCCACTCGATCAATTGCTCTCGAGACCGGCTGCCCGG
CACCTGGAGGAACTTTACTTCGGGAGAGGATCCTACGATGGGATGTGCAG
TTACGGCATCACCACCCTACCGGCGTTCAAGGCTCTCCGTGTGCTGCACA
TCACAAACTGCATGGACAGCCACACTGCGGAAGACATGGTGGTACGAGTC
GCCTTCCCGCGGCTCACCGAACTACGACTGTACGTATGCAACGTTTCACA
CGAGGTACTGCAGGCCATGATAGATGCCTCGCCATTGCTCACCACCCTGC
AACTGGATAGGGTGTGTTTGGATTTGTGTCATGATTCACAACACTCTCTA
TCTCTCCCCAAGGTTTCTACCCTCCTGCTACAAGATTTTGTATACGGCTA
CCGCCACAACCAAACAAACCTGCAGTTTGATGCTCCAAATCTAAGATGCT
TCATGTATAAAGGGTTTGTCAGACCACTGTCACTCAAGTCACCTGTGCCG
TATAATACACGGGTGCAATTGCACTTCAATCTGTCGAGTGTTCATGGAAA
CTCCCAAGGGAAATTTCCTTTCAGTCGGTTTAATGTGAAGAGGAGAGATG
TAGCGTGCCAGCTATTTTGGGAATTTGTAGCCAGCTTCAGCGGTGCAAAG
ATGCTGATGCTGAGCTTTGAACCACCGGACCAAATACACACGGCCATTGA
TGCTTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.