Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA014254

[Submit comment/correction]

Sequence	AA014254
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA014254
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TTAAGATCTGAGATCTGCGCTCTGGACTCTCAAGTCCACTATCAGCGCTC CCCCTTCCTTTGACAGCTTGAGAAATCATACGCCGTGCTACGGTGGAAAT CACTTCAAGCTCGCCGTGACTACATAACTGGGATTCGTCAGGTAATTACC AGAAGTTCCTCGAAACAACCATTCTTCTTTGTATCTAATTTCGCTCCACC GTACCGTCCAAATACATCCTTTGCTCCATCTTGTTTTTCTTTTGCTGCGA GTGGTGGCCGGTGAGGGAGGTGGATCTGGCTGCTGCGGTGTGTGCGGCTT GGGAGGGTGGCGCTCCACCGTCCTTACATATAAGCCTTTGTTATAGTCTG CAGCTGCAATCCTTTTCCCTTCACAATTACCATGAATCTCATCCTTAAAT TTTGTTCGCGACTGGATTCTTGATGCTTAAAATTGATATAGAGTAGCGAG CGCACCTTTGGTGCAGACGCATAATAGGCATGAGGCTTTACTTGGTTGCT AGCTGTTTTAACCATTTTATTCGTTCGAGCTGTGTGCATTGATTCCCACG GACTATCACCTAACTTGATACTATCGTGTCTTCTTTTCAACTTGCAAGGA TAAAGGATGTGAAGAAAAATAATATTGTCGTGTGCAAAAGAATCGTCTTT GTTATTAACAATCCTGAATAGGTGAATATTGATTGTCTTCTATAATTTTC TATACTGCATAATTCATAAAGGAACTGGGTTTGACATCTATTTTCAACTC GTCATGATCAGGCATATATATACCAAAGGATCCTGCACTTGGAGATGATC TGAATATTGTGATAATAAAAGGGCAATTGATGGGTGCATTCAAGACAGCA CAAACATCCAGAACATGTTTTGATCAATAAGGTACTTATAGTTCTTGATG ATGCCAGTAGACATCTTTCATTTGATGGTACACCTAGTTTATATAGTTGT GAGAAGAGTTATTGTAAGCTGTTGTAATGGAAAATCAGACTTTACTGTAG ACCATAACCTAATGTCCTTGCATTTTGAACTCTGATTTTGAATGAGTAAA GTTACTCCCACCAACAATTCAATTAAACGTTAATCACATCCTCTTAATGT ACCACAATGCCTATTTTGTTTGTTGTCTAAAGCAAGCCCTGCACTTGAAC AGTATATATATGTTACCTTCCAAACAGTCGAACATTGTGTTCCACAAAAT TATATCCTTTCCTGCAGTCTTCTATGCTCCTTAAACGTGGAGAGTTGTCC CAGGTGTGCACAGAGGAAATACAATATTGTCTTTCTAAGTTGAAAGCTCA GGTCAACTGATACTAATCTGAAGTACTCCTGAGTGGCTTCAGTGGGTGGC ACAGGTATGTTTATATGGTTTACTCTTTGTCTTTTTGTCTTCAAATCATG ATATTTACTTAGTGAATTTTAATTTTATGGTTTTTGTAAGCACTATGGTC ATAAGACTACATAATAGTTATTTAAGCACATAACATATTTACAAACATTA TTGTCATACTTTGAATTTGCAGCTATAGTAGTTTAGTATACAATTACCTT GAGTCTTTTATCCTTAATTTCTTTCAGGTTTAGTCATCAGCATTTGGGAA ATCTCTATAAAAAATTCATCCAATTTTTTTCTGTTTTACAGGAATATGAC CCTATCAACCATGGCAGTGAGCGCTTCCATGGGTGTGATAAACTCCCTCC TTGGGAAGCTTACTACCCTGATGGGGGAAAAATATCGAAAGCTCAAAGGC GTGCGGAATAAGGTGGCGTCCCTTCATGAAGAGTTCAGTAGCATGAATGC TCTTCTTGTGAAGCTTGTAGGAATGGATGAGCTTGATGTTCAGGCTAAGG CGTGGAGAGACCAAGTGAGGGACATGTCGTATGATATTGAAGACTGCATC GATGACTTCATGCATGACCTTGAAGTAAAAGGTGCAACTACTGGGTTTCT CAAGAAGAGTGCTGAACGCCTTAAAAAGCTTAAGGTGCGTCATCAAATTG CCAACAAGATCAAGGGGATTGAGGCTCGTGTACGTGAAGTGCATGAGCGG CGCATAAGATACAAGCTTGATGAGTACAACCCTACGTCCAGTATTGTCCA TATTGATCCACGGGCACTCGCCATTTTTGCGGATGCGGCTGGTCTTATGG GTATTGATACCCCCAGAGATGAGCTTGTTGAGTTGTTGATGCATCCAGAT CAAGAGCTGAAGGTGGTTTCTATTGTGGGATTTGGAGGTCTCGGAAAGAC CACCCTTGCCAGTGAAGTGCGCCGCAAGATTGAAGGGCAGTTCACTTGTC ATGCATTTGTATCGGTATCTCTAAAGCCTGATCTACCAAGGCTTCTCCAG AATTTATTATTGAAGCTTACTGGACAACAGTCCTCTGAAAGTAGCATTTT GGAGGATTTGATTCAAAATATCAGAGAGTATTTATTGAACAAGAGGTATT TTTATTATGTTTGTTTTATTGTAGCAATGTACACTTTATGCATTTTTACC AATATATCTTAGCAAGTAATTGTGATTTAATGCACTATAAAAGTATTTTA AACAAATCATTTTCAAATTACCATTTCCAGCGCAACCATACTAACAAATG ATGAAGTGCTGAGTACACGGAAGCGAAAGTTATTACATGTACTGCAAAAC GACTTCTACTACCTGTATTTATATCTAATGACAGACGATTCAAAGGCCAT TTGTTGTGTACAATATAACTTACGTAAATCTAATTAACTGTATGTGTTAT CATGGTGTTTGGTGTTGACATGTACACGTAGAATTTATGGTTTAGGTAAT GGGACTATAATTTTTCAAAGTTTATAAAATCTCACAATTAACTAACCTTT ATGTGTTCTCAATGCGATATGATTTTTAGGTACTTTATTATAATTGATGA TTTATGGGACACATCAGCATGGGATATTATTAAATGTGCTTTTCCAGAAA ACAATAATGGCAGTAGAGTGCTAACAACTACAAGGATTTATTCTGTTGCT GCTGCTTGTTGTTCTAGAAGCAGAGGATGTGTTTACAAGATGAAAGCTCT TACGAACAATGATTCAAGAAGATTGTTTTTTAGCAGAATATTTGGTTCAG AAGATTCCTGCCCTACTGAATTAGAAGATATTTCAATAGATATACTAAAA AAATGTGGTGGTATCCCACTTGCTATTATTAGTATGTCAAGTCTTCTAGC CGATCAGCCAAAGACAAAATTTGAGTATGTAAGGAAGTCTCTCGGATGCA TGTTTGATGGGAATCCTACTCTTGATCAGATGAGACAAATTTTGGAGCTT AGCTTCAGAGACCTTCCTAACCATCTGAAGACATGTTTGTTGTATCTTGG TATATATCAGGAAGACCATGAGATATACAAGTCTAATTTGTTGAGGCAAT GGATAGCAGAGGGTTTCGTGTGTGCAATTCCTAGGATAGATGCAGAGGAT GTTGCAAAAAGCTACTTCAATGAGCTTATTAATAGGAGCATGATCCAGCC TATGTATACTGACATTAATGGAAAGTTGTTGAGCTGCAGAGTACATGATA TAATGCTAGATGTCATCAGATCCAAGATTGAAGAAGAAAATTTTATTTCT GTGCTAAATGACCCGGAAGTTGTGTTAGGGATGCACAGAAATATCCGGAG AGCTTCACTCCAATGCTCCGGTAAAGAGTGCACAGTGACATCAGCAATGG TCAATGGGTCATTATCAAAAGTCCGGTCAGTCTATGTTTTTGGAGGCTTT TCTTGCCAATCTCTGACGATGCTGAAATATGTCCGAGTTCTATATCTTGA GATCGGCATAAAAGATGTGGTAGATCTCACTGGTATATCTAGGTTGTTTC TGTTGAGATACTTAAAGGTGGTTGGTTGTCGGAGGGTTGAGCTACCTAGC CGAATTGGTAAGCTACAACAATTGGAGACACTTGATCTAAGAAAATCCGC CTCCAAGCTTCCATCTGACATTGCTAGTTTGCCTCTGCTGCTGCATCTTA TTGTTCACAAGGATACAGTTATTCCTGACGGCATTGGCAGATTGAGACAT GTGCGAACTATAGGGGTTTTCGATTTGCGGAAGAACTCAGTGGAGAATAT CGAAGGCTTAGGCGAGATGTCCAGCCTAAGAGATTTTGAGTTCCAATGGT CGGGAGAGGACTTGGTTGAAGGGGCGAGACGTATGGACGTCTTGCGCTCT TCTCTCGAAAGGATCGGCGACAGCCTCATGACCCTTAGGATGTATTATCG TGGTGGGATTTTGGATGGCTGGAGCACATTTTCCTCTCCACCTATCCATC TTCAAGAGATGGGGATGCTGGGTTGCGTGTTCTTGACGATCCCCAACTGG TTTGGTCAACTCCACGACCTTCAAACCTTGGAGTTCAGGGTCAGGGGGGC AGGGTTGAAGGATGATGGTGTAGCTATACTTGCAGGGCTGCCATCACTTG TCTGTCTTTGGTTATACACAGAAGAACCTGTAGAAGAAAGGGTGAACATC CCTGGCAGCGGCATGGCATTCCGAGCTCTCAAAGTGTTTGATTTCTGGTG TAATCATAATGTGTTGCTGACCTTCGAAGCAGGTGCTATGCCTATGCTCA AGAAGCTTAAATTTAATTTAGAACCGAGTGGTTGCGAGAGTGGTGGGTCT GTGGAGTGTCCAGTAGATGGCATTGAGCACTTGCCAGCTGGCCTCAGTGA AGTCAAGTTATGGATCTCTGGTGAAAGAAAAAGAAAAGAGGCCGTGAAGT CTTCATTGAAGATCGCATTTGAGGAGCATCATCCTGGTGCTGCCTTGTCT ATCTTTGGTTAGACTTAGAAGAACCTGTAGAAGAAAGGGTTCACATCCCT GGCAGCGGCATGGCATTCCGAGCTCTCAAAGTGTTTAGTTTCTGGTGTCA TCATAACGTGTTGCTGACCTTCGAAGCAGGTGCTATGCCTATGCTCAAGA GGCTTTATTTAATTTTAGAACTGAGTGGTTGCGAGAGTGATGGGTCTGCG GAGTGTCCAGTAGATGGCGTGGAGCACTTGCCAGCTGGCCTCAGAGAAGT CAAGTTATGGATCGATTGTGAAAGAAAAAGAAAAGAGGCCGTGAAGTCTT CGTTGAAGATCGCATTTGAGGAGCATCATCCTGGTGCTGCCTTGGATATC TACTGATTCTCGTCTCAACTGACACTTCCTGGGGCATGTAAACCATGCAC TCTTACCTGTTTGTTTGAACCATTTATTGATTACTACTCCAGCATGGAAC CCTCCTAAGTTTGTCTGTAAACCTTTTGGACCTCCTGTATTTAATTCAAC CATGGATGTTGTCTGCTTATCTGTTATGTATTGCAATCGTGCACTCTGCC G

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.