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GrainGenes Sequence Report: AA013077

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Sequence
AA013077
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013077
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCCCTGGCCAGTTCGACGACCCATATCCGAGGCGACCCATCCATCATC
GGGTTAGACAGGCTCGGACGGACGGACGGACGGACCGCAACCGCGAAGGG
AAGCGACCGAGTCCCGTCCCGGCGCGCGCGTGCGGCCGGATCGGGCTCCG
AAGCCCCCGACCCCACGCCACCCCCCCACCCCCCCTCGCTCCCCGGCGGG
GGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCGCGATCCCCTTCCGCCGCCGCTCCTTCC
CGGCCTCTTCTTCCACAGGTACGTCGTCCTCCTTCCCCCTCCACTCCCTA
GATTTGTCGGTTTCCTTTATCCTTTGCGTACGGATAAGACTGGATCGCCG
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GTCTGCTGTTTGCTCACCAGGTAATCCTTGTTGGGGGTCCGCATGCGTGG
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CACTGCTAGACATTATCCTACTTAGTTACATATGGCTACCTGCTGTTATC
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AGTCGCATCCCCAGGAGCTTAATGCCTTGCTGAAGAAGGTATGCTACCGA
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TCAGTATGCTGTGCTGTTTAAGATGTGATGATGTATGGGCATGAAGGAAT
GCATATATTTTTTAGCTGATTCTGCTTGTTCTTGTTTGATAAGACACAAA
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CTCATATGAACTTATCTATCGATGTATGTTCAAAATATTTATAGTTATGT
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ATTATTACATTTAAGGAATAATAACTACATCCTTACATATGCTACAACTT
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GTATGCACTACGCAAAGTAATGGTGGCTAAACTTTACTCTCTTATGTGCA
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CTGCGACATCTGAGCTTGCTTTTGGAAGGTGAATATTCAAAGTCTTTAGT
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TTGTTCGTTATGGCTACTTGAAATTTCTCCTATTTTCTTATTTTAGTTTA
TAACATTGAGCAAGAACAATTGACATTGAATGCAAAAATAGCTCTTCTCC
AGCACTTCATATGAGGATGTCCAGTACTTTACTCACTCTCTTTAAGATAC
AATTCTCCATGGACAATGAATAGATTTGGCAATGTAATCTAGGGTAACTA
GTAGTCATGTATGCCTAAATTGCTCACTGAGCTAGAAAAAGTAAATCTCA
GCTCAGAAGTTTCTTGACTTGGTCTGTATCAAGATACACCAAGAACTTAT
TTTAAAGGGTTAAACTGTCAGTCCCTTTTTGATTTTTGTCTGTTCTGGTG
TTATCCCAACATGTGAAATTGCTTATTTTTTTTTTTTGCATTTTTTATTG
CTAGGAATACGATGTTGCTAATGATAATGGCAAGAATCCAGCAGACCGTT
TAGCTCGCCAAAAGCAAAATCTTCGGCGGCGTTTAGGTATGGATTTTTTC
CCTTACTGTAGTAAACCACAATCTATTTTCAAGAGTTAGTTAATGTTCCA
TCTTATTTCTTCGGGAAAACGTGAAGGACCTTCGTGTTTCATTTCATTGG
ATAGGTCAGAGTTACCATAATATGGATTGTAGTGACATTGTAGCTTTTAA
GATGGGTATCAAGCCTTTTGGCAATATCAGTTCTGTGATGCTTGTTCTTG
TGTTCGCTACATTTGAATTCCCGCTCATCAGTTCAAATTCATATCTTGGT
GATCACTAAAAGCTTATTAGCTAATATTCCAACCAATTATATTGTACTGC
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TTAAAAGGTACTAAATTATTAGTTGCTTGTTCATCTTCTTTTGCTTAATA
TATGTGACTCAAAGTACAATCTGTTATCATACATGATCTTGTGTGCTAGT
TTCATAATGTCTACTTATTGTTTTGGGACATTTACATATTGTTTTCTTAT
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TATCAAAGATGAGGATCTTCTTGCCCAAAAGAATTATTGGGGTGCAAATG
TCCAGAACAATGGATTTTATTCATTTAATACTGGTCAGAATATTCAGCAC
TTGGTTGCCTCCATGGTTCCTAGGTATCCGAAACATTCTAATTTTCGACC
TAAGCGATTAAGTGCAAGGGAACGCAATATGCTGAAGCGGAAAGCAAAGA
GCAACGCAAAAGATCATACAAAGTCTGTACCAGAGGATGACGAGGTTGTG
CTAAAAAATTCTACATCATCCAATGGAGCTTCTTCTGACCAAGTTGGTGC
ATATAACGTACGACCATTCAACCACATATTCTAAGATATACTGGATTTAC
TTTCATGATATAGTTATCTTATATTATATTCCTCGTTCCTGAAATAATCT
GAAGCCTTAGCAAATTTGTTGTCTGCTAGTTTTGTCTAATATTTCAAAGC
TTAAAACAGAGAATTCTGTTTCTTATCATTAAGTTGCAGCATAGTGTAGC
ATTCCTACATATATGGGAAGGTGCAAGTTGCTAATACACTTGCTCTTGCC
TGAGCTTGTCTGCGCTCATCGCACACACAAGTTTGCTCATTGCTGCTGCA
TTGTCTGGCAATTTACACATTACTCTTGCAGTAGAATTCTCCAAGGCGGA
TGGCCTTGTCTTCAGACCATGATGATTTGATAATTTCATTTCCCTAATTT
CAGGATGCTTCTGACACAGTTGCAGATGAAGACAATATGGAGCGCAGTGA
CAGTGGGAGATGGCCTTTTCAGCAATTTGTGGATCAGCTTATTCTTGATA
TGTTCGATCCTAGTAAGTTCATCTCCCAACTCCCATATTTGTCTCCTTTT
GTCTTGCTTATAACCATTAACTGAGTGTCTCCTTTTAGTTTGGGAAGTTC
GCCATGGCACCATTATGGCTTTGAGGGAAATTTTGACACATCAAGGTTCT
TGTGCTGGAGTATATTTCCCTGATCTGAGCTCACCTCTTGCTGATCTGGA
TGATAAAACCGATTCTGACTGCCTGAAAAGGCCGAATGGTATTGATCTTA
ACGAAGACATAGATGTCGAACAGCTTGAACCAGTTCTGAAGAGACATAAG
AAAGATGAGTCAGATCCTTCTGAGGTTATGCTTGAACCAGTTGTGGAGGG
ACATACAAAAGACGAGAAGCCAAATCCTTCTGAGCTTATGGATCTTGACT
TGACTAAGGAGCTGGTCAATGCTGACGATTCCAAAGCAGAGGCAGATGTG
AGCAATGTGCTCACTATGTCAAGCGGTGAACCTAATTCTGCTCATGTGAA
GGTTGAACCAGAGTTGCAGCTTGATAATTCAACTGATCCCTCTAAAGTGG
ATACATGCTGTACATCACTCCACAGTGTACTCAACTCGGCATCAAATCCA
AGTTCTATTACACATGCTCCTGAAAATTCAAAATATGTGAAACTGATGAA
ATTGGCCAAGTACTCATGTATGAAGAATTGGGAGTTTCTTCAAGATTGTG
CAATTCGTTTCCTTTGTGTACTTTCGTTGGACCGGTATGCATTTCTAGAC
TTCCAAGATAGGCATACATATATTTCCTTTCATTGGTTATTACCCTTATT
TCTGTATACTTTGCTTGCAGCTTTGGTGATTATGTATCTGATCAAGTGGT
TGCCCCTGTCCGTGAAACTTGCGCTCAAGCTCTTGGTGCTGTTCTGAAGT
ACATGCATCCTTCTTTAGTGTGCCATACACTAAATATCTTATTGCAAATG
CAGGTATGTGTTGCAGTTATCTGTGCCATGATCATCTAGTTCTAAAACAA
TACATTCACTTTTGTCATCACCATCATCTCTTTGTCTCTCTTTTATTTGT
TTTTTCAGCGCAGGCAAGAGTGGGAAGTTCGTCACGGCAGCCTCCTTGGA
ATCAAATACTTGGTTGCGGTTCGCAAGGTGATTGCTAATCGAACAACTGA
TAACCTAATATGATAATTTAGTTCCATATTGCAATGTTATGGGATTGGTG
ACACCTTGGGTTTTGTTCAACTCATGTCAATCTAGGTTCTCCAGTGTGCA
TTGTTACTGGCGTGTTTATTAATACTGATGTATGAATTTGATCCTGATCT
GTGTACAGAATTGATAATATTGCTTTCTGCCTCACCAGGAAATGCTTAAA
GATCTGTTCGAGTATGTCCTTCATGCCTGTAAGGCTGGTCTGGAGGATCC
AGATGATGATGTCCGTGCTGTAGCTGCAGAAGCCCTGATCCCTGCTGCTG
CTTCTTTAGTCAGACTAAATGATCAAATGCTGCATTCAGTTGTGATGTTG
TTATGGGATATATTGCTTGACCTTGATGACCTAAGCCCATCTACAAGCAG
GTAGTACTTCAATCTTGCGTTGTATAGTGTACATGCATTAGCCTAAAGTT
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CTGAAACTAAACCAGGCACCATTACAATTAATCTTGCTGTCTATGTTATT
TATTGCTGGTTTCTGTTTTACTCATAAATTTCTCTTCTATTTCAGTGTAA
TGAATTTGTTAGCTGAGATATACTCGCAACCAGAGATGGTTCCGAAGATG
CTTGGCATGGCAGCCTTAGGAGAAAGAGAATTTGATCTAAACAAAGCTAC
TCAGACTGTTGAGCAAGAAGACATGCTGGCATATATTGAGAACCCTTATG
TTTTAGCCACACTGACACCCCGTCTGTGGCCTTTTATGAGGCACAGTATT
ACTTCAGTCCGGCGTTCTGCTATACGAACATTGGTAAGAACTACTTGGAA
TTTAGTACCCACTTTGGTCTTTTGTGCTGATGTATCAGGTATTCACTAGA
CTTTTTGAACTGAGTTATGCAAAATTAGCAGAATCATTATTGTTCAGTCA
GAAACCTCTACAACCATGTGGTGCAACTTTGTTTACTAAAGGTCACACCA
GATTTTAGAATTGATTTATAGATATTAGCAGAGTCTTCACCGTTGAATCA
CATGTCTCTACACCTGACGTAGCTCAGCAGTTCTGAACCATCTGACTAAT
CTATTTTTCAACTTCGTTTACTAAAGAAACAACCTTCTGGAGATATTTTT
CCAAGTCACAGTTACTCAGTAATGCAAATTTGCCATAATGTATAATGATT
TTGTAGTACAAGCCCACATCTAACATTTGCATCAGTTACATCTGGCTAAT
GTTTTAGGAAACTTTGTTTAGTAAAAAATGACCTTCCTTGAGATCTTTTT
CCAGTCTCAAGCATGGAATGATGATACAATTTCACCGCCATTATGTATAG
ATATTTTTAGTGTGAGTCCACATCTATCATTATGCCTTCCTAGTTAACTG
TGAAGTTCCAACTGTTTGCAGGAGAGGCTTCTTGAGGTTGGCAACACTGG
GAGTTCAGCTGGAAACACCCCATCTAAATTGTGGCCTACATCCATAGTAG
GTGACTCACTGCAGGTTGTCTTCCAGAATATACTTTTGGAGTCAAATGAC
GAGATTCTTCAATCTTCTGAAAGGGCTTGGAAACTTCTAATTCAGGTTGC
TGATGTTCCGGACTTCTGGACATTCTGTAAAAGAAAGTTTAATGATCTTG
TCTATCATAGGATGATATTAACAAACAAAACTGTCTTCATTATTGCAGTG
CCCTGAGAAGGACCTTGAGTGTGCTGCAATGTCATATTTTAGTAATTGGG
TGCAACTTGCTACAACTCCATATGGCTCAACATTGGATTCCACAAAAATG
TTTCTGCCAGTTGCCCTTCCCCGAGGAAGTCGTTCAAGAGCTGCTGCAAA
GATAAGTTCTGCAAGGCTAGAACATGAAAGTTCAAGAATGATATCTTTTG
GTTCTACAGGAGAAAATACTTCACATGAGAAGCATTTTGATGTTTCGTCG
AATGTTCCAAAGATAATCGTGGGGGCTGATTCTGACAAATCTGTTACTCA
TACACGGGTGCTAACAGCAATGGCCCTTGGTCTTTTCGCCTCAAAGTTGC
CAGTTGGCTCGTGGCAAGTTGTTCTTAGTCCACTTGTGAATGATGTCATG
TCTCTCTCAGGAGTCCAGAGACAGGTTTGTAATGGCCCCATTACATTAGT
TTGTTAATATCTTCACTCCTGAACTATTCACATTGTACTAATTTGTTTCG
TTTTTCTAGGTTGCTTCTATGGTTATTGTTTCTTGGTTTAAAGATCTCAG
AGGAAGAGATCTCGCTGGAGTGGGCGCATTGCTAGCTTTCTTCTCCTCTG
TGAAAGAGTATCTGTTGGACTTACTGTCTTGCTCTGATCCTGCATTTCCA
ACAAAGGGCTCTGTGGTTCCCTATTCTGAACTTGCAAGAACCTACACAAA
GATGCGCAATGAAGCCACTAATTTGTACCGCTCAGTTGATTCTTGTGCTA
TATTCAAAGATTATGCTAGCAGCTTAAATTTTAATGCTGACACGCTGAGC
GTCGATGATGCTATTAATTTTGCTTCAAAGCTGGTGTTACCCACTGAGTT
TGATCTTCCTTCGGACAGTGAGAAAATTGTCCTGAATAACATAGAGTCAG
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TGTATTTTTTCCCAAGTATTGTCTCTTTTTATTTGTGTCAGCATGATAAA
ATTCTGTGTTACATCATTCTATTCATGGAATTTCTGATTTTCTTAATTGG
TCCATGGTAATATCTTCACATATGTTTCATCTTTTGATACAATTCTGCAG
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CATTTCTGTTCTTGCAATTTAGCATATAAATTTGGATGATTCCATGTTGT
GCAGGAGGAGCTACTTCAAGACAAAGCTGCAGATGCACTTGCCGAGCTCA
TTTTTAGTTGTGTTGGTCGGAAGCCTGGTCCCAATGACAAGCTAACAAAG
AATCTCTGCACCTTAGCATGCACTGACATTTACGAGACACCTCAAGCTGC
AGTTATCAATTCAATGCAGGTTATCGAGGACCAAAATCTGTTGTCAATCG
GGAAGCGTTTTAGCAATCACAAATCTAGGGGTCATTCTAATTCTGGTGCT
GAAGAAAGAACAAAAACAGAAGGTTTCATTAGCCGTCGTGGATCTGAGTT
GGCTTTAAAGCATCTCTCTGAGAAATTTGGATCATCATTATTTGAAAAAC
TCCCGAAGTTATGGGATTGCCTTACTGAATTTCTTAAACCTGTTGAGATC
GAAGATGACATTCAGAAAGACGATCCAAGTATTGCACAACTAGGCAGATC
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CCATTAGGACCTACTTTTGGATTCAGTGTTATCGTTGCTGCTTTACACAA
GACAGCTATATTCTCTAGGCTTAAATCGTCATGTCACATGCCCATATATT
TCTAATGGTGTGTTTGATTCTTGCAGGTTGTTCGCTCAGTTACTCCTCAT
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TGGGTGTGTACGCCATCCTCATGTGGCTGTTAGGTTAGCGGCTGCCAGGT
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ATAGAAAATGCCATTCCAATGCTGTCAGATTCATCTTCTGTGTGTGCAAG
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CTCCTTGACAACTCCCAGATTGATGATTACAAGCTCAACATTCAGCTTAG
CGTTGAGTTGCGAAGGTCTGTAACTATCATTAAAGTTCCTTTGTCAGAAT
GCTGCTTCATGATAGTATACTTTATTTAAAGTTTCATGCATTAAAAATCA
TCATACCCATTGAATCTGTAGTTCGCTTCATATGTTGAAATATGCTGTGC
TGTATATTGCCTCTCCGCAGGTTTACAATATTTGTTGTGATTTTTTATTG
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ATTCCTGAGACGGTTTAAGTTGCATGGAATTTTATGTGATGACATGGGGC
TTGGCAAGACACTCCAGGCATCTGCTATTGTAGCAAGTGATATTGCTGAG
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TTCTACATTAGTAGCCCACTGGGAGTACGAAATGGAGAAATACATAGACA
GCTCTATCATGAAACCTCTTCAGTATGTTGGTTCATCACCAGACAGGATC
ATGCTCCGTAGCCAATTTGATAAGTTCAATGTTATCATTACATCATATGA
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GTGTTTTGGATGAAGGGCACATCATCAAAAACTCAAGATCTAAAATAACA
TCTGCTGTGAAACAGTTGAAAGCACAACACCGTCTTATCTTGAGTGGAAC
TCCTATCCAGGTAAAGCTTTAGCTGCTCTCTGTTTCTGTTCACCTACAGA
GCTACTACTGTTTTGTTGTGTTCTTTTTGGAAATTTACTGCTATTTAATT
AAATTATTTCTTTATGTTGACACATTCTACTGAACTGCAGAACAATGTAT
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GTGCCCCTTTTCAAGAACATATTTTTGAGTTTCAACTTTCATAATTCAGT
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TAGTCCAGGAAGGATAAACCTGGAAGAGGAAAACATACAAAAGGAAACAC
CTCTTAATTACATTACACTTACAGACCAAAGAAATTTCTTAAAGTAAATC
TAGGGTATGTTTGGTTCTGTTGGTTGCCCCACCAAATGTTTTGCTAGCCA
AAATTTTGGTTGACCTGTTGGTTGCCCATGAGTTAGCCAAAACTACAAGA
AAAGTGAACTAGATTGGCCAAAGAGGCATTAGCATGCATGGGCATTAGTG
TGCCAAATGATTGGCAAGCATCCAACAAAGACCAACAATTTGGCCAAGAC
CGAAAAATTGCCATGGTGAGTTTTGGCCACAACCCAAACATACCCCTATT
GAATACAACCAGTTGACAATAAGTGCTTTTCTGAATACAAAATCTTTAGT
ACTCTTGTCCAGAGTACACATATGCCATTATGGAAGCTATCTTTATTCTG
GCAAGTATTTTATTGCTGCAATCTGACCAAAATATTGATATGTGCAGTTC
CAAGCTACATATGGGAAACCACTGATAGCAGCTAAAGATTCAAAATGTTC
AGCAAAGGATTCTGAAGCTGGCATTCTTGCAATGGAGGCACTTCATAAAC
AGGTTTTGTATCTTCTCTTAGATTTTAAACAATATGTTATGACTTTTGTC
AATGAATAAACAAACCTTGCTATACCAGGTCATGCCATTTCTACTCAGAA
GAACCAAGGATGAAGTCTTATCAGATCTTCCAGAGAAGATCATCCAGGAT
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TAACTCCAATGCAAAAGAAGAGATCTCAACCATTGTAAAAGCAAATGAAT
CAGAGCAATCTACCTCTCAACCAAAGGCAACTCGTCACGTGTTTCAGGTG
CTACAATTTAACTACTCTTATCTTGTTTCTTCATTTCATAACATCAATTT
TAGTACTGGCCTCTAAATGGATACACTTTTGCATGCAGGCATTACAATAC
CTATTAAAACTATGCAGCCATCCTTTACTTGTAACTGGGGAGAGCCCGCC
TGATTATCTTGTGGATCATTTAAAAGAAATAGGTGTGGGAGCCGGTGGTG
AGCTGCATGAGCTGCACCACTCTCCTAAGCTTGTTGCTCTTCAAGAGATA
CTTCACGAGTGTGGTATAGGCTTAGAAATATCAAGTCCTGATGCTTCCGC
AGCTGTTGGGCAACACAGAGTTTTGATTTTTGCTCAACATAAGGTATTGG
GTCGAGTCTGTTATGCCTTGCTATACAGTGGCAGCGCTAGGAATTTTCCT
CTTGGTATTCATTTTAATAATTTTGTACTCCCTCCGATCCGAGATTTAGT
ACAAACTTTGCACTAAAACAGTACTAAATCACGGACACTTATTATGGATC
GGAGGGAATATTTATTTTGCTAAATCCATCGTTATTTTGCCAAAAAATTA
ACTGTTTTGCCAAAATATTCGGTATTCACTTGAATACCAAAGAATACCCC
TAGCGCCGCCCCTGTTGCTATATCTTTGCTTCTGCTCTTACTTCATCCTT
TGTTCTTATCTCAACTATTTCTGTAGGCTTTTCTTGATATTATCGAGAAG
GACCTGTTTCAGTCCCATATGAGAAGGTGAGTTTATGGCATTTTCCTACT
TATATTATTTGTTGTTTACTGGCATTTCATATTTCTGCAGCATTTGTAGT
CAGCAACAGTTAACGCGCATTATTAGTCCCTCTACTAGCTAGTCATCTGA
TTCGGAAAAATTTGATAATGCTGCAGTGTGACATATTTGCGGCTTGACGG
CTCTGTTCAAACAGAGAAGAGATTTGAGATTGTTAAATCGTTCAATTCAG
ATCCAACCATCGATGTGCTTCTATTAACGACTCATGGTAGGTTCAGAAAA
AAACACTATATGAACTGGAGTTTTATTCCTTTGTATGCTAGAAAGGCTTT
GCTGAGATACTTTTTTTCGTTGCAGTTGGTGGTCTGGGCTTGAACTTGAC
ATCTGCTGACACCTTGGTCTTCATGGAACATGATTGGAACCCAATGAAGG
ATCTCCAGGTTGGTCTTTTGCATCTTGTCGCAGCGACAATGTGTTCTATC
TGCATTAGATTACCTACTATATGCTATTTGTCCCACTGCAAGTTATTTTT
CTGCTCTTGGGTCTTTCTGATTAGGGTATATGTTTCTGCTCTTATACAGG
CAATGGACAGAGCACATCGCCTGGGTCAAAAGAAAGTCGTGAATGTGCAC
CGTCTCATCATGCGTGGCACTCTGGAAGAGAAAGTGATGAGTCTCCAGCG
GTTCAAGGTGTCGGTTGCGAATGCGGTCATAAACGCCGAGAACGCTAGCC
TGAAGACCATGAACACTGACCAGCTGCTTGATCTGTTCACTTCAACCCCT
GCTTCCAGAAAGGTAGGTTTCTTAGACTTATTGGAATGATATCTTGCTGA
TAATATCCACCTGTTTCTCATCCAAATATGATCTCATCTCTCTCCAAAAT
GGCATGGCAGGCATCTGTGCTCCCAAGCAGCTCGAGTGGCGAGGATAGTA
AAGACTCCCAGGGGAAACCTGGTAAGAAGGGCCTGAAGTCGATCCTGAAC
GGGCTGGATGAGCTGTGGGACCAGTCGCAGTACGCGGACGAGTATGACAT
GAAGCAGTTCCTGGCGAAGCTCGACAGGTGAATGGCTGCCGCTAGTGTAC
AGTGTAAAGTAAAAAAAGATTGGGACGCGTGATCCAGGTTCACAGGTTTT
GCTGGCAACCTCGGAGATCTTTTTTTTGTTTTGTTTTACATAGTAGGGGA
AGAAAAGGAATGGAGAAGATCGCAAGATCGATCTAGAGCAGCGTGTTTGA
GGCTAACTTACTTATAGGTGCTTGAGATGGCGCTCTCAGTTTTCTTTTCG
TTTTTGTTAGGAGGATCGGAGGGGTTATTATTTAGATGGATGCCTGGCCG
TGGCCGTGGCCGTAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.