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GrainGenes Sequence Report: AA000657

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Sequence
AA000657
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA000657
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCAAAGGCCCTATCTATAAACTCGGCGCTTCTCCTCTTCTCCTGCTCCT
TCTATACTGGTTGGACGATCGATTCCGTCCGGCGCCGCCGATTCATTCCT
CCCCCAGCCCCCGCTCCCGCTCCCCTCCCTCCCTTCCGCCGCCCGCCTTG
TTGCGCGAAGCACCGCTCCCCCCACCGGCGCGGTCCAGGCGCATCATCGG
CAATGGCCTCGGCGGCGACGGCGCTGTGGCAGCCGCAGGAGGAGGGGCTC
CGCGAGATATGCGCGCTCCTGGAGGCGCACATCTCCCCCAACTCCGACAA
GGCCCGCATCTGGCAGCAGCTCCAGCACTACGGCCAGTTCCCCGACTTCA
ACAACTACCTCGTCTTCCTCCTCGCCCGCGGAGAGGTAACCGCCCTCGAC
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TTTATGCATTGCCTGTTTGGTTTCAACCACTGCGGCGATGGTTCTGCCAT
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GTTGCTTAATATATAGTATTAGTGAGGTCTGACTTATGATGGACTCAGAC
AGCACCAAATACATGCTAAAATGTTATTTGTAGGTACAGATTAGAATTGA
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GGGAAATGTCAAGAATTGTATCATGTTGTAATTGTGATTTGAAGTATCTT
GAAGAAATAATAACACATATGTTCTTACTTTCTCCATCTGGAAATTACAC
TGACGCCGAACAGTTAATTTAATCATATCATATTTTTCACCAGCTGGCAT
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TTTCTGTTTGGGTTTCATATCTAGCCTACACCAACTTGATTGGGACAAAA
GGCTTGGTTGTTGTTGTTGTTGTATGGTCTTGCTGACATATGGGTTACTC
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ACTGTTGAAAAACAATCTGCCAACGGCATTTGTTCCTATGCCTCCGGCAT
CTCAGCAATACATAAAAACTGAGCTTCTGCCATGTATAGGGGCGACTAAT
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TGTGTAGGTGCTTTGCGCACTGGTTGCTTGTGTTACTTCCTTGCTTTGAA
AAAATCTGGATTTTTTTTACATGGATATCAGTGTATGATGCAAACCTGTA
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ACAGATTAGACATAGTTTGGCCAAATATGCAGATTAACCCTTTGTCAAAC
AGTGTACATCTAGAAAAAAGAATGGACTTCTTCAAAGCATCTACCTTTGA
TTTTTTGGTGCACTTATAACGTATAAGAAGAAACTTATGGTTGTTTCTCC
AATTGCATGTCTCCATCTAGGGAAGTCCCACTAGCAATGTCAGGAGTAAA
TATTCTAATATGAATCATATGTATTAACTTTGTGAACTCAACTTGTGTGC
TTAGAAGCTTGCATTTTCTTTTGATGTCAGATATGTGAAGATGTTCCTGA
AGAGCTTGATGTTGATGTACCTGGTTTGTCTGAACGACCAATCAATGTAT
TCATGCCACGGATGCTGCAGGTTTGTGTTCCATCTATACTCATCCTCTAT
TAAACTAGAGGGTGTGCACCTTCACTTGCACATCCTGTAAATGATGAACT
TTCTTTATTTGTTCAGTGAAACAGCTGTATATACATATTTCACCAAGCAT
GCCTCTGGGGTGCACATGCTTCGACAGTCCAGTTTAACATGTCTAAATGG
TTTTGCCCTAACACAGTCAATTCAATTGTTTTTTCAGCTTTTCCAGTCCC
CACATGCAAGTCTTAGGAAACTAGCACTGGGCTGTATCAACCAGTATATT
GTGGTGATGCCATCGGTATGTGTCTCTCCTTCCTGTCCATCTTATGTACT
CCCTCCGTCCCTAAATAGATGTCTTAGATTTGTCAAAATTTAGATGAATC
TAGACACTATTTAGTATATAGATTCATCCAAATTTTGACAAATCTAAGAC
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ATCTGCAGGCGCTGTATATGTCCATGGATCAGTACCTGCATGGCTTATTC
AGCCTTGTGAAGGATCCTTCAGCAGATGTCCGGAAACTGGTATTTCACTT
CAATAAATTACAGTTTAAGATGCGCATATGCGCTACTTCTCTGTAATCTT
GTGTAGATAAATGCTTCAAATATTATAAATGCAATTACTCCATAACTTAG
TAGATTCAACTTATGTCACAGAGTTCAATATGTGGCTGACTTGTCCGGAA
GTGCTTATAATATAGTTGCTGTTCTGCATAATTTAGCAGTTCAATTGCAT
ATTTTATCTTTATATAGTCCTCCCTGTTTATTTGATAGGTTTGCTCGGCC
TGGGTTCAGCTCATTCAAGTGCGACCATCGATTTTGGAGGTAATTTATCA
TGTTCGTTGATGCCCATTTAGATTCCATTTGCTGTCACTGAGTATATAGT
AAGATAACTCAGTTCCTTATGCTCAAATATTGTGCGCAATCTGACATTGA
ATAGCAAAACTGCAGCCACATTTGAAAAATGTCACTGAATTGATCCTGCA
AGCGAATAAAGATTCGGATGATGAAGTTGCTCTGGAGGCTTGTGAATTCT
GGTATGCATGTGAACATCATAATTTCAAACTTTGTACTATCATATTTTTA
CATCTGATTCTGTTCCTTGTGACAACCTTTTGTGTACTGCCATTTGTATC
TATTCTCACAGTTTAGTTTTATATCCTTCGAATTCAAAGGAAACTATTAT
TGGCTGATGAGTGATGACGTTTCTAACTGATTGTGTTGAATGATTTGTCA
GGGGACTAACTATTTGTCAACCTTTCAGGTCGGCATACTGTGATGTTTGC
ATGCCTCCTGAAGGATTGCGGGAATTCTTGCCACGCTTAATACCAGTATA
TAAGTTGCCTTATCTAAGTTAATTCCAACAAGTCTTGGGCCTGGTTACAA
TTTTGACATGTTTCTTTTCTGTATTTATTTCATAGACTTTGGTATCGAAC
ATGGTCTATACTGACGACGATGAATCACTTGTTGATGCTGAGGTGTGGTA
AATTTCTTTTTATCCTGCATGTTTTAGCTCCTAGTCATTGTGTGATAGTG
GCATGCTCTGATAAGTATTATATGTTTTCAGGAAGACGAATCCTTTCCAG
ACAGAGACCAGGTTCGTCACTTATGTAATTATATGTTTTGAGTGATAGCG
GCTAGATTAAATCGTTGGCTTTATCCTTGTCTTATCATATACTCCCACTG
TTCACAATTATAAGATGTTTTAGCTTTTTTCTGAAATGTGTGTAGGATCA
CTCATTTTGGTCCATATATAGTCCACATTGAAATGTCTAAAACATCTTAT
AAATTATAATTGTGAACGGGGGGAGTATTATTTTGGATAAGGTTTGTGTT
TTGTCGGTATAATGCTGCATAATGGATTAAACATAGTCCTGTAATGTTGA
ACTCTGGAAGGCATGGAAGTTAATCATTTTTCGTAGTATATTTACAATAG
CATTTTAAGAACAATGCAATGCTTGTTTAGCAAGCATGTTGTAATGGATT
AGCCATAGTCCTGTAATGTTGAACTCTGGAAGTCATGGAAGTTAGTCATT
TTTTGTACTATATTTACAAATAGCATTTTAAGAACACCACAATGCTTGTT
TAGCAAGCATGTTGTACTTTGCCTTGCAATAAGATTATATTAACAGTCCT
AAAAAGAAATGGAGAGTGGCAGTAAGTTTACAGTTAGTAAGCTGTACATG
TTTATCTCTTCAGCCCCTTTTTGTTGCTTGGAATAAGATCTAGATGATTG
TGTGACAGGATTTGAAGCCCCGTTTCCATGCCTCTCGATTACATGGATCT
GAAACTGGTGAAGATGATGTGAGTTTAGGAACATTATCTTCTTAAACAAT
GGAATGACTTTTTGCCTACTTACTAAGTTAAATCTGCAAAAACTTACTAG
CAATATGGACAGGATGATGATGATGATGCTATAAATGTTTGGAATTTGCG
GAAATGTAGCGCTGCTGGGTTGGATGTCCTTTCGAATGTTTTTGGTGATG
ACATCCTTCCTACTTTAATGCCTTTGATTGAGGTAACTGGAAGATTCCAT
AATCCCTCCCCTGGTATTATTGGCTATTGGCCCCATATGTGTCCAAGGAC
CTTGTTATATTTGGTGCTTGGTACAGTATTTTTTGCTGCACTTGTAACTA
ACCTTCAATATGTTGGATAACTATGAATCAAATATTGTAATTTTGCAGCA
AAATTTGGCTCGGATAGATGATGATTCCTGGAAGGAGCGGGAAGCTGCTG
TTTTAACTATTGGTGCTATAGCAGAGGGATGCATTACTGGCTTATATCCA
CACCTTCCACAGGTAATTCCAATAACCAATCAACAATGTATTCATAGTCC
CATTGGACAATTGCAGTAAGAACACATGGCATGCGTCAAATTTTATTGAG
AAAAGCATCTCGGATGATCTTCCTGAAATTAGTTTTCAGAAGTACTTCAA
CTAGCCTGAATATCTGCTTCTCTCATGAACCATCTATAACATAGGCATGA
AATTTCTCTCAATATGTTTTAACATTTCGAAAGGAGGGAACACTGTTGAT
TCAGTCATTAGTTCCATACATGATAACAGATCAAAATTTCAGTTGCTTTA
ATAGTTACCTCACATTTTTAATGATATATTTATCTGTGAAATTTTGGACT
ATTGTGACTTGTGAGTTGCAATTCTAGTACAGTATTAACTTTCCTGTCCT
CCACTAACTACCTATGTTTGTTGCAGTATGATGTATCTTCTCTGAGATTT
CCTGTTCAATTGCAGATTGTTGCCTTCCTAATCCCTCTTCTTGATGATAA
GTTTCCTCTTATACGGAGTATTACTTGTTGGACCCTCTCCCGATATAGCA
AGTTCATTGTTCAGGTAACAGAATTATCATATGTGTTGATGCTACCTTAT
CTGCTTGGAAGAGTTCCTTTCCTTCGAAGGGTTTTTAGTTTTCTATGTAG
CAACCAATGTATTTAAACATATATTGTTGGGTTGTAGCAATATATGAATG
GTGTGTTGCATGGTTAAGCATGTGATGGTGGATTGATCATTTTGATGCAT
ACCCAGACATGCATGTACTTTCAATATTTCTAGCGGCTTCAGATGTTTTA
CGGATGTGTACTTTTCCTTGTTTATGTGTGCTCAATTTGTACATCCGTGA
CCGTTTATTCCTTATGACACTCTTATTTTTGCTGGCGCAGAGCCTGGGCC
ATCCAAATGGTCAGGAACAATTTGATAAGATCCTCATCGGTTTGCTTAGA
AGGATATTGGATACTAACAAAAAAGTGCAGGAGGCTGCTTGTTCTGCATT
TGCAACGGTTGAAGAGGTTATTTTAACTATTTTTGAATTGTTTTCCTACA
CTGATCTTTGTCGATAATTAATCAGTACACGATTTTTGTTTTTCAGGAGG
CTGCAGAAGAACTAGTACCACGACTGGAAGTCATTTTGCAGCACCTCATG
TGTGCATATGGAAAATATCAGGTTCATCAGATTCTTAACATTCATAGTTT
GCAGTCAATTAACAGGTATCGCCTAAGGTTTTTTTAGTCCTAATATTATG
TTTTGCTTCTGAGCAGAGGCGAAACCTTAGGATCTTGTATGATGCTCTTG
GTACTCTTGCTGATGCTGTTGGAGCAGAGCTAAACCAGGTTCAACATTTA
TTACATTCCTCTCTTGCTTGTTTTTCGAATATTATAAGTATTGTCCTTGA
GGGTTTCCTCATTCAGTTTTTCAGCGTGTTAGTCCCTTATCAAGATTGCT
AATTCCTTTTAAGATGTCATGCAGGCAAAATATCTAGATATATTTATGCC
ACCATTAATCGCGAAATGGCAACAACTTCCCAACTCTGACAAAGATCTAT
TTCCTCTGCTTGAATGCTTTACATCTATCGCACAGGTACTGTTATTTTAC
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GTCTGTAGTACCCATGTTAGAATACTTTTTTTGTTATCTCAGTTATGAAC
TTCGCATGTATACAGAATCATGTGAAATTTGATCTTCGTTTGGTGTATGC
ACATGAACTTTTTTTCTCAGGCACTGGGACCAGGATTTTCTCAGTTTGCC
GAGCCAGTCTTTCTGAGATGCATCAGTCTTATCCAGTCCCAGCAGTTAGC
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TAAGTATCCGCTGTGATTTGTACATCAAGTCTAACCACACAGTCCCATAT
TCACATGCTCTAGTTGCTATCACAAGCAATTCTTTTGTCTTGATTGATTG
AGGCCTATGTTTGTTTTGCCGTTTTTGGACCGGTATCTAATTACACCGTA
ACCTGATGACGTTAAAACTGTTTGGTTCGATCAGACTGTAATCAGGTACC
GTGTAATCGAAATACACCGAAGCTTTAATCTGATTCCGCCCCCACCCCAC
CTGAAAAGAACCGTTACCTGAGCGATGTTCTAGCGATCGTTCCACCCCTG
ATCCCATCCGCCTTCGATCTCTTGCAGCGTGAGCGCTGATGCCGGTGGAG
CCCCCTAAATCCTCTAGTTAACGAGCAGCGTCCCCGCACGAGGGACATCG
GTGCGCTGGGAGTAGCCGCAATGGCCACCGATCCCCACTATATTCAGATC
CAGCGTTGTTCTCTGTACCTTGATTCCGTTACTATTACCACATCTAACCA
AACAAAACATGGAAAATACCCATTACGTTACCGGTCCCACCATGACTCGA
TTCCGTTACCGTTTACATTAACTTAATCCAACCAAACATGTTCTAAATGC
TTGGCATGTTTTCTTTTTCATTTCTGGAAGAGAAATTAAGACATCAAGTT
GACTCTCTCCAACTTACACTATTCTTGTTTTAGTACAAATTAGTGGAAAC
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TAAGTTTGGTTCAAGTCTAAGCATTTAGAAGTACTTCTCATGTTGTAGCA
TGGTTTCTCGTACTCTGATCTGTAAGTACCCTGGATTACGCCAACTAAAA
AGCTAATCTATCTGGCAGTTTGACATCAACGTCTGCTGGAGTATGATATA
GTGTTCAATTACATCAGAGACAAGATTGTGCTGTTGTGTTGCTTGAGGGA
TCTCTCCTTTCTACATGCAGGTTGATCCTGCTGCAGCGGGTGCGTTATAC
GATAAGGAATTCATTGTCTGTTCATTGGACTTGTTATCTGGACTTACGGA
AGGACTTGGTGCCGGAATCGAAAGCCTGGTTAGTTCAACTCTAATGTCTA
ATGATATTCCCCTTCCCTGCCCTTAAATTCTCAATGACCTTAATAAGGTG
CTTGCTTCTGTGGCAACTTATGGTGGAAGCATTGTTTTGTTTAGACCATG
TAGTACTGGTTCTTCATAATATGCTAAAATATGCACTTGTGAGTAAGGTT
CATATACCCCTTACATAGTACAGATGAAAGATTGCTAGTAAATCTTCGGA
AGTTATATTAACGCCAACTATGTGTTAATCTAATGATATACTTGTGAGCT
TTACAAGACTACCGTTAATACTGAATGTTTTTGTTTTGTTGATTAGATAC
TGATTTATAGGTTTATTATATTAGGAACATTCCATATTTTGTAAGCCATC
TTTATTTTTGGTTTAGGTTGCGCAAAGCAATTTGAGAGATCTACTTCTGC
AATGCTGCATGGATGAATCAGCGGATGTTCGACAAAGTGCTCTGGCCCTT
CTTGGGGACATTTCTAGGGTTGGTTGCAGAGCTCCTAAACTGATAATTGT
TATCGCTATGACAATTTTGAGCCTATAACACCTTTTCATATTTAGGTCTG
CCCTATACATCTGCATCCACGCCTTCAAGAATTCCTTAATGTTGCAGCAA
AGCAATTGGTAAGTGTATATATTCTTTCTAGCCCAGTATTATCTTATCTT
CATTTGATTCTCACAATATTTTTTTGATCTAGACCCCACAATCTGTGAAG
GATGCTGTGTCAGTTGCTAATAATGCTTGTTGGGCCATTGGAGAATTAGC
AATAAAGGTTTGTGCCACTTTGTCAATTCTAGGTTATATTGTATAGCAGA
GCACTGGAGGTGCTTCCTTCTTGGCTAGTCTATTGTGGCATCTCACTGAA
CGATTTCAATGGAAGAAACAGAGACACGAGAGAGACAGTAGGTTTTGCCT
TTCTTTCCTTTTATTCAACACAACCTGCGATCGTGTCTGGTACCACGATC
CCACTTATCGAGCACGCCATCCCACGCTCAGGAGACCGAGATTACAGGGC
ATGATCGAGTCCATGACTTATCTAAACGACCCTAGGAAATAGCTGAACCC
TAACTGAATTTAATTTTGAAAAAGACACTGCTTAACTGAAACTGAACCTG
ACACCTTATTTGCTAGACACAACCAGATTAACCGACATCTATTACTACTG
CATATGCCTTACCTAGTTTGTCAGATTATACCTTTGTTTGCTCTATACTT
GTAGCACCGATCGTTTGACATGTATTGCCACTTGCCTCGTAGCAACTTCA
AAACCTTATTTATATGATTTATAGGCAGGATCTCGGTTTCATGCCTTAAA
GTCAAACATACTAGTGTTAATTATTATTGTAAAATGTCTTGTATGTCTGA
CCGACTATTCCTTTACAGATCGGCAAAGAAGTTTCACCTGTGGTGATCAG
TGTTGTTTCATGCTTGGTTCCTATTCTAACAACCCCAGAGGTGATTGCTT
TTTGTTCCGTCATGTTCTCTAGTCGAGTGAGCTTTTCAGCTAAGTGTCTT
GTGTGTTGTGCCATTTAACAGAGCTCGAATAAGTCACTTACTGAAAATAG
TGCAATCACCCTTGGAAGGCTTTCCTGGGTCTGTCCAGACATTGTGGCCC
CTCATATGGAACATTTCATGCAAGCCTGGTGCAATGCCCTGTGCATGTGA
GCATTCTTTTTTTCCTGGAGCTTTTATGCTATAGCCAAATGGTCAAGAAA
GATTTTATTTTGTAGCTTTCTTGGAAAGATATGAGATATGGCGGATGTTT
TTTTCTTTATGCTTCTTGTACCATTTTTGTTTTGTTTTTGCATGCTTCTT
GTAGCTAATGATCTTTCTTGTGCAGGATAAGAGATGATTTTGAGAAAGAA
GATGCGTTCCATGGTCTATGCGCAATGGTAAACCAGTAGCTATTTATTTG
ACACTAGCTGTTACATTCTTCATTGACGTGAATGGTGTACTTACAATGAA
TACTCTTGTGTGTGCACTACTAGGTGGCAGCAAACCCTACAGGGGCTGTG
AGCTCACTATCTTACGTATGCCAGGCCTGTGCGAGTTGGAATGTAAGATG
CCGTTTCTATCAGATTTGCACCTGACAGTAGTATGGCATATGAGCTCACT
TGATTTTGATTTGTGTACAGGAGATAAAAAGTGAAGGTCTACACAACGAA
GTGTCCCAGATTTTGAAAGGCTACAAGCAGGTAAAAACAACAGTCTTCTC
ATCGTTGTTGTTCTAGTTGTGTGTGCTATATGCAAGAAGCGATTGACATA
AATTATTTCACCTAGATGCTTGGAGGTGCTGGTTGGCAGCAGTGTATGTC
CACCCTCGAACCAGCAGTGGTGCAGAGATTAGCAAAATACGGGGTCTGAT
GAAGCCAGGAGATCTGTGTTACTGTTCTCATTATACCACCAGAGTCAAAC
CGCAGAAAGGAGGAAATGTTACTTGTGGGGCATGTGATTGGGCAAAGTCG
GTCAGGTGTCCAGCGTGTAGCACATTGTGTGATTTTATATGATGCGCTTG
ATTCTTCATGGGTTGGTTCTTGGTTTGTGTTGTATACTATGGTTATATAG
TCCACACGCAGGGCTGCTCAAAGCATGTCACAAATGAGTTGAGTGAATTA
TGATGAGAGAAATTATTTTTGTTTCGAGTCGAAAAAAGGCGGTGCTTGCC
TTGTTGGTTATAGGGACTCGGGGTCAGGTTTGGCTGGTTTTCAGTGGGCT
TGGTTTTGTTGGCAGTGGACTCGGGGTCGGGTTGCTCCATCCACAAGGTA
ACACACTATTTACAGTCATACTTATGCATTTATACAAGTAATATTATGGT
GTGGATAGCAAGTTTGGCACTAATACAATATGCCACATTGGTAAAAAATT
AGGTTCTAAAGTCATGTATGTTATGTACCTTCAGTTATGGATTTTTCCTT
GCATAAATCTGAATTCATAACGCTAAGGTGATTCCTGTGCTTATGAAAGG
CTAAGTTGACTCGTAGTCCCTGAAAGCCCTTGGCAAATAATCCTGGCATT
ATGCATGTCAATATGCGTGAATGGATCGTCCTCTGATGTACATATGTTCA
GCAGGTTTCGGTCGTCTTCTAAGGAAAAGTGTATCAGGTTTCACATCTTG
GCAGCTGTATTGTCTCTACTAATTGGATGTCCTTTGCGAAGGCTGATATA
AGATTGAAGGTGTTAATCCAAAAGCACTAAATATTGCAGCAGTAGCAGGA
TTCAATAATGTCAAACAGTTCCCTTGGGGTGTCTTCTTTCTAGCTGATGT
GAAATTTGAGAAATAAACTGGCGGGGCATTGGTACCGAAGTATATTAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.