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GrainGenes Sequence Report: AA015967

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Sequence
AA015967
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015967
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAACTTCGCAATCTCTCTGCACAGACCTGACCAGATCCGACCTGTTGT
TCGTCCCGTTCGAGTCAGCCTCTCGCTCCGTCCCCTGTCATCAGCAGAAG
CGATCGACTCGACTCCGGCAAATCCACCACTGAAACCTCCGCAAACCCTC
GGCACGCACGCACGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCATGCGTCCAT
CTCACGACCGCCGCCCTTACCGTCCACCGGACCGGGATTCCCCGCCTCCC
CATCGTTACCACCACCAGCAGCATCACCGCCAGCCACCCCTGCACGCCCG
TCAGTACGCGGTGATCCTCCTCCGCGCGAGTCCCACCTCCTCCACCCCGT
CCGCCACGGAGATCGACGCCCTCGTCGCCGGCCTCCAATCGCCGCCCCCC
GACAGCCTCTCCGTCTGCTCCTCCGGCCGCCAGGGCGCTCGCCTCCTCTT
CCGCTCCCTCCTTGCCGCCGCGGAAGCCGCCTGCGAGGTCTGGTCGCTCC
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AGCTCGCAGTCTCTATCCAATCGGTGAAACACCGCCTACGCTGCCACAAT
AGACTCGGCGACTTCGATCAGCTCAATCTCCAGAAGAAAACACTGGAGGC
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CGTGACTTGTCAAGCGACTTGTCTACCAATCGCAACTTCGATGTCGACAA
CTTGGAGCGACTCGACTAGTTGAGGTTGTCGGTCAACAAGTTGAGTAGTC
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TGCCTGGGAACAAAAGGCCCCCGTGTGAGTGAAAACCCTAACCCCCCACA
GATCGTTATTTCCCCCCACTGAGCCGCCTCTCTCCTGGCCACCCTCCCCT
TGCGCCGCCTTTCAACTTGTTAATATACTACTATCAGTAGACTAGTTGCT
TAGTATTTTTTAGTAGTCTCCTTGTCGCCACCCCAACGACAAGTTGCGAC
TTGTCGACTCGTAATCCTTTGCTGTAACTGAAGTGAGTTGTGCTTTTTCA
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TAAATAGCAGGGATTACTACAGAAATATGTACGAATTAGGGAGGTTTTCC
AGAAAAGCTGCGGCGTCAGCTGACCCCACAGCTAACAAGCAGCTCCGCCA
CTGATAATGCTTATAAGTAAAAGGTTATTATATTAGGTGCATTTTTACTT
CACGAGGCGCCAATTTTTGTATTGGTAGTTTGTTTAATACTCAGTAATCA
GCATTGGGCTTTACCACAGTTTTCCGTGTATTTAGTTTCACTTGTTCATT
TGAATTTGTAGAGCATGACACGCTGACGCAAACATCATGGTTTAATCTGT
ATGATGTTTGTTCTCTGCAGGTTATGATCTTAATTGGGGAAACTGGTTCT
GGGAAAAGCACACAGCTAGTCCAGTTTCTTGCCGACTCAGGTCTTGCTGC
AAATGGCTCAATTGTCTGCACACAACCTCGAAAAGTTGCTGCTTTATCGC
TGGCACATAGAGTAGATGAAGAAAGCAAGGGCTGCTATAAGGACAATTTC
GTGGCATCATATTCAAGCTTTTTAAATTCCCAAGACTTTAGTTCTAAGAT
CATATTCTGCACAGATAGTTGCCTTTTACATCACTACATGAATGATACAG
ACCTGAATGGCATTTCGTATATCATTATTGATGAAGCCCATGAAAGAAGC
TTGAACACTGATCTTCTCTTGGCTTCGATCAAGAAGGAGCTGTTTGATAG
GTTGGATTTGCGACTCATTATAATGTCTGCCACTGCTGATGCTAATAGAC
TTTCTGAATATTTTTACGGCTGTCAAACTTTCAATGTGAAAGGGAGAAAT
TTTCCTGTTGAAATTAAATATGTGCCAAATGTATCAGCAGAGGCTTCTTT
CAATACTGGGCTAAATTCTCCAGGTGGTGCTTGTGCCACTGCTTCTTATG
TCGATGATGTTATAAGACAGGTAAGCATCATTCACAAGAGTGAAGACGAG
GGTGCCATCCTTGCTTTCTTGACATCTCAACTGGAAGTTGAATGGGCTTG
TGAAAAATTCAGCGACGCAAGTGCTGTGGTGCTTCCTATGCATGGAAAGC
TTTCCCCTGTAGAACAGAGTCATGTTTTCAAAAGCTTTCCTGGAAAGAGA
AAAATTATCTTCTGTACAAATATAGCTGAAACATCACTGACTATAAAAGA
AGTGAAGTATGTTGTTGATTCTGGTCTGGTCAAGGAGAGCAGATTTGTGC
CTAGCAGCGGTCTCAATGTTCTGAAAGTAAATTGGATTTCCCAAAGTTCA
GCTAATCAACGCGCTGGCCGGGCAGGTCGAACGGGAGCAGGAAAGTGTTA
TAGGCTTTACTCCGAATGCGACTATAGCATGATGGAAGTGCATCAAGAAC
CTGAAATCCGAAAAGTTCATCTTGGCACTGCTGTTCTGAGAATACTTGCT
TTGGGTGTTAAAGATGCACAAAAATTCGAGTTTGTTGATGCCCCAAATCC
AGAAGCTATCAATATGGCTGTGAAGAACCTTGAACAATTGGGTGCTATCA
AATGTAAAAGTAATTGCTTTGAGCTGACTGATATTGGACACTACTTGGTC
AAATTGGGAATTGAGCCAAGGCTTGGAAAAATTATGCTTGATTGCTTTGG
TTTTGGTTTGAGGAAGGAAGGTGTGGTTTTAGCTGCGGTTATGGCAAATT
CTAGCAGCATATTTTGTAGAGTGGGCACGGATGAGGAGAAACATAAAGCT
GACCTTCAGAAGGTCCGATTGTGTCACCAAGATGGAGATCTGTTCACTCT
ACTCGCTGTTTATAAGAAATGGGAGGATGGACATGAAAACCGGAATACGT
GGTGCTGGCAGAACAGCATCAACGCCAAGACCATGAGGAGGTGCCAGGAA
ACTATATCAGAACTTGAAAAGTGCCTTAAGCATGAGCTGAACATTATTGT
CCCAAGTTATTGGTGTTGGAATCCTGAGGCTCCCACTGTGCATGATAAGT
TGCTGAAGAGAATTATCCTGTCATCTCTTGCAGGTAATCTTGCTATGTTT
TTAGGACATGAAAGGTCTGGTTACCAGGTGATTTCGACAGATCAGGTTGT
GAACCTTCATCCCTCATGCTCATTGCTCAATTATGGCATCAAGCCAGAGT
GGGTGGTGTTTTCAGAAATCTTGTCAGTCCCAAATCAATACTTGGTATGC
GTCACTGCTGTTGATCATGATGCCTTGTGTACAATTCACCCAATGTCTTT
CATTCAGCAATTGGAGAAACATAAATTGCAGATAAAGGTGATTAGTGGTC
TTGGTAATAACTTGCTGGGAAAATTTTATGGGAAATATGGCCAAAATCAG
CAGAAGATCATCTCGCGTCTCAAGGAAGAATGCAGGGATGACCGATTAAG
TGTTGAAATTAACTTCAAAAATAATGAAGTTGTGTTGTTTGCTACAGAAC
AGCACATGGAAAAGGTCTTTTGCATTGTTAACCGTGCTTTGGAATGTGAA
GGTAAGATGATGCAGAATGAGTGCCTTGAGAGAAGTTTATTTCCCGAGAG
GTCTGGCAGTTCTCCTATTGCACTATTTGGCCCAGGTGCTGAAATCAAGC
ATTTGGAACTTGAGAAGAGATATCTGGCAGTAGAGGTTCTACATCAAAAT
GCCCATGACATCAATGACAAGGAGCTCATTTGTCTGGTGGACAGTCTTGT
CTCCGGTGTTGTTAATTTTTATAAATTTGCCAGAAATTTCCGCATAACCT
CAGATGAAACTAAATGGGGTAAATTTACATTCCTCAAACCTGAAAATGCT
GAAGATGCTGTCTCAAAATTGAACGGAATAGAGTTTCATGGTTCCTCCCT
AAAAGTAGTTCCTGTATATTCTTCCGATAATCAAGGATTACCATTTCCTG
CAGTAAGAGCTAAATTATGCTGGCCACGTAAGCAAAGCAGGGGCCTTGCA
GTTGTAACATGTGCCAGCGGGGAAGCTCAATCTGTTGCAAATGACTGCTT
TGCTCTAGGAATTGATGGAAGGTATGTCAATTGTAGGGTTAGTACGAAGG
AGGAGAACTGTGTCTTTGTTGAAAGAATTCCATTGCATGTCACAGAGGCA
GAACTGTATGAGGCTTTTCGTAGCACAACAACAAGGAGAATCCTTAATAT
CCGTTTACTCAGGGTCAAGGAAGCCAGCATAGCTAACCCTTCTGTTTCTG
TATGTGAGGAAGCACTGATTAGGGAAATTTCTTCATTCATGCCAAACAAG
AGTTTTCCTGGACCAAATTTCCGTGTTGAGGTGTTCCCTCCAGAGGAAAA
TGATTCAATGATGAGAGCAACTTTATCTTTTGATGGAAGTCTTCATCGAG
AAGCTGCAAGAGCATTGGACCATCTTGAAGGAAGTATTCTTCCTTGTTGT
CAACCTTGGCAAATCATACAGTGCAAGCATGTATTTCATAGCACTCTGTC
CTGCCCGATACGTGTTTACAATGTTATCAGCCTGGAAGTTACTTCTCTCC
TTGAGAGCTTCCGAAGCCAAAAAGGTGTGCATGAACTCCTCATTCCCTGG
AAGCTTCTTTTTTTCATTGTTCTGTTGGTTGAATCATCTTCCGATTGCTT
TTTTTTGGTCACTTGGTTTAGTTTATATGAGCTAGCCAGACTTTTTGAGC
TATCTTTCCTGTGAAACTCATCCAGGATGCCTACCTCCCTCGGAAGCAAC
TTATTGCTGCTGGCTTTGCTGTGTTCTTTTTGTGAAACTCCAAAAAATCT
ATATTAGCTGATAAAAGTGGTTTGAGATAGGATCCTGCACAGGAGTTTCT
CAATTACATTTTTTCAAATCTTCACTTGCTCCAGGGAGAAAACCATAATG
ATTTATGGTTCATATAAATTTTAGTAAGAGAATATGAGTACTTATATAGC
TCACCTTCTATTTTATCTCAACTTCTTCATGAGAAGCATAAAATCATGAA
GCCATCTATTCTAATATCAATTGGAGGTTAAGCATTGAATTAAGGGTTAA
TTGGATTTATGCCACTACAACTTTCACCACTTGGAGAAATGCCATTACAA
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GCCATTTTCATAGCTTAAGAACATAATGGTTCCAAAAATTCTTGTATTAT
AGTGTGTATTTAAACATGGACTATACTACCTCTGCCAAATTTGGGCCAGC
GCTTTTCGGTCAACCGGATGGCAAAAGTTCAAATTAGGCCGAAAACTTGA
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GGGGCAACGGGCAGCGTGGAACACCAAATTGACGACAGGGTGGCGACAAC
AGCGCCCTTCTCCAGCAGCGCCAGTGTCCAGCCCTGCCAGCATCCAGTTG
CGTCCAGCCCACCCACCTGCAGCCACAATTGGTCTCGCTCGCCTGTAGCC
CCTTCCAGCTTGGCTCGTCTCCAGACTCCAGTCGCCGCATCACGCGAGTA
GGGTTTCAGGCTTCCAGCAGCTGCGTCGTTCCAGGAGAGACTCTAGCCGA
GGGCGCCTCCAGAGATGCTGGGTTGCTCGAGGGCCTCTAGTCGTCTCATC
ATGAGTTTGCCTCCGGCCGGCGTCCGCCACCGCCGCAATGCTTGGGTTCT
TGTACACGTGTGAGTTCTATTGGGGATTTGTGGTGCGGTTCAAGCGTTGG
TCGGGATAGGCCTAGTAGTCGTGAGTTTTTTCGTCTTTTTACATAAATCG
TATGAACGTATAACAGTATAAGCATACATATGGGATTATAATAGGTTGTA
TAGGGCTTGGTATTGGAGAAAATGGCATAGATGGTGGTATGATGAAGTTG
GAGTGGCATATTTCCAAGTCTTGTTTTTGTAATGGCATTTCTCCAAGTGG
TGAAAGTTACAATGGCATAGATCCAATTAACCCTTGAATTAATGGGGTGT
TACTTTGTTGATGTTTCTCAAAACAAGCAAACTAACTAGGTTCCCCATTT
ATCTACTCCCTCCGATCCAAATTAATTGACTCAGATTTGTCTAGATACGA
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TATTATGGGTCGGAGGAAGTAGAAGAATGTGTGTAGCATAAAATGTTTAT
ATCTGCCGCTGAGTTTGAAGTTTAAATTTCTCTACTTCATGCAGGTGTGT
CCTACAATTTTGAGAAGACTGAGAATGGTATTTTTCGAGTAAAGCTCACT
GCAAATGCCACAAAAACAATATCAGATTTGAGAAGGCCGCTTGAGATTTT
GATGAAAGGGAAAACCATAAACCACCCAGATCTGACACTAAGTGCCATTC
ATATGCTCTTGTCCCGTGATGGTGTAGCACATTTGAACTCAATCGAACAA
GAGACTGGTACTTACATTCTGTATGACAGGCAAAGTCTAAATATGAAAGT
CTTTGGACAGCAGGATCAGATGGCTGAAGCAGAGGAGAAATTGGTTCATG
TACTTCGGCAGCTCCTTGAGAAGAGGCCTCTTGAAATTTTTCTTCGTGGG
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TGATCTGGAAGGATTAAAGAAAGAGATGCCCACAGTAAAGGTTGACTTGC
ATAAACACCGCCATCTACTTAAAGTTTGGGGCAGTAAAGAGGACAAAAGA
AGGGTGGAAGGGATGATCTCCGAGTTAATAATCTCTGTTAAAAACAATGC
TCTGGTTCAACTTCCGTCAGAGAATGTTGGAGGTAGGAAAGAAGATAAAA
AAAGGGTGGATGACACTGAGCTGTTAAATGATACATGCCCTATTTGCTTG
TGTGAGACTGAAGATCCTTTTAAGCTTGAAACGTGTATGCATGTGTTTTG
TCGTGCTTGCTTGGTGGATCAGTGTGAATCTGCCATGAAATCGCATGATG
GGTTCCCTCTTTGTTGCCTCAAAGCTGGGTGCAAGAAGCCCTTCCTCATT
ATTGATCTGAAGCACCTTGTGTCAAAAGAGAAGATGGATGACCTATTTAG
AGCTTCCTTGAGGGCATTTGTTGCATCCAGGGCAGGAATGTACCATTTCT
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GAGGCCAAACCTTTTGTCTGTGGGGCTTGCTATGTGGAGATCTGCACCAA
GTGCCATCTTGAGTATCATCCTTTCATATCCTGTGAGGCTTACAAAGAAT
ACAAGGAAGACCCAGACGCCACACTGCTTGAATGGCGTAAAGGGAAGGAG
AATGTGAAGAGCTGCCCGTCCTGTCGATACACTATTGAGAAAGCTGAAGG
CTGCAACCATGTTGAGTGCAGATGTGGCAGCCATATTTGCTGGGCATGCT
TGGCGAACTTCAGGAGCAGCGAGGAGTGTTATGGCCATCTCAGGTCTGTG
CACCAATCGTTTGTGGACATTGTATAGAATGTAGATGTAGATGTACATGC
TGGCAAAATACTTTATGCTGAAGCATGCAGTAATCAAGCTGTGAAGGCAC
TGCAATTATAAAACCTTAAACTTTGCAAGAAGGGGTGCATCCTGTCGAAT
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ATTGCTTCTGCAAATTTCTTTATTTTTGCTGCCATCGTGGTATGTATGGA
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GGATTTGGCTAGATTTAGATGAATCTAGACACTATTTAGTATGTACTCCC
TCCGTTTAGAAATATAAGTTGTTTTAGGTTTGTGAAAGAGATGTATCTAG
ACATCTTTTAATGTATAGGTTCAAATGAATCTAAACACTAAAAGGTGTCT
AGATACATCTCATTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTCAAAACGGAGG
GAGTAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATCCACGTCAACTAATATGGGTCG
GAGGGAATACGAAAATTTTGGCAAATCGCCCATCACAACTTGCCACAGTG
GCCTGTACATCATCATCCCACACTATAGCCTCATGGGCATTACAAGATTT
TCCTATCAAGGCTAGTTCATGAGCCACTTTGTTTGTGCTGCGTCTACATA
TACGCACTTCACTTCTAGAAAACCATGAGTACAATTGGATCTTCAGGTCA
TCAATTGACGCTGCCAGCTGGGAATAGTCCTCTTGACCACGCCAGTTCAT
TGCCATGGCCAGAAGTTTCAAAAACTACTCGTATAGCACCCCCATGCAGT
GCAACATTGACAGCTTGTTCCAATGCATGGAATTCTGCAGCAAAAACATC
ACGGATAGTTTGCATTTGGTTATTCTGCTTGCATATTAAAACATACTACA
TTGGAGCACATAATTTGAAGGAAACATTGGACACTGAAAAGGGCATACCC
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GTGACATATGATTCATATATTGTTGACCAAATTTATGGTCAAACTATTTT
TTTGAAGTACGTATTAGCCCTATAATCCGAAATGGAGGGTGTACTGAAAG
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AAGAAGCTGATTCGGACTCAGGACCTCTAGGACACAAGTGGAGATACCCT
ACCACTGCGCCAGGCCTGCCCTTCAAAAAAAAGAAAACATAGTTGTCTCG
AAATACTTGTAAATGCTTAGCATTTTTTATAATTTTGTGGCATAGGACTC
GTATTTTATTAGTTAAATTCATGGTCAAAACTCAGTTTATAATTTACCAA
AGCATATGGATTGTAAGGAACCCGAGCTTAGACCAGGCTTTTGATTTACC
ACAGCATATGTACTGCAATTACATCCAATAATTTTTTTTAGCTATGTGGA
CTATGCTTGACTTTTAAATTAACAAAGTAGACTTCTTTTTTATTAATCGT
TATTAAGCGAGGCCAGTAGAACTATAATGTGATTATGCAGGCATAGGAAG
CAGGTGTTGTGGTCTTTGCTCTTATTCTCATTTTCATCTATATGTTCTTC
CTAATAATCTTACTACTGTTTGAATAGTTACATGTATGAAAATCCCATCT
ATTTATTTTGATAGTAGTAAATTCGATAGTTATATACTTTCTCAATATAT
ATATAGTTATATACTTCCTCCGTCCCAAATAACTTGTCGCAGATTTTTCT
AGATTTGCATGTAGTATCTATTACAATAAAATATGTCTATATATGATTTG
GGATGGAGGAAGTATATATATATATATGATTGAGGTCAAGAAATGAAGAA
ACAGTTAGGAAATATGTTAGCTTGTAGGATGAAGTATTATAGTTAGCGAT
ATGATTGCGTCAGGAAATAAAGAAACGGGTAGTAAATATGTTAGCTTGTA
TGATTAGCTCTTTTGGCCTCCAATAAAGTTTTTTTTAGCTATGTGGACTA
TGCTTGACTTCTAAATTAATGAAGTAGACTTCTTTTTTATTAATTGTTAA
GCGAGGCCAGTAGAACTATAATGTGTTGTGGTCTTTGCTCTTAGCCTCAT
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AGGATGAAGTATTATAGTTAGCGATATGATTGTGTCTCGAAATGGAGAAA
CATGTACTCCCTCCGTCCTAAAAAGGATGTCATAAAGTTTTTTAAATTTG
AATGTATCCTTTTTCAGACGGAGGGAGTAGGAAATATGTTAGCTTGCACG
ATTAGCTTTTTTGGCTTTTTAATTTTGTTAGCTTGTAGAATTAGCTTGTG
GTGTATGAATTGAATTTTTGTTCATCTGAATTTTCACCGTTCTTTCATCT
AAAAATTTACTTTCAGAAACCTTTTTTTTAGCACAGAATATGCAAATAAG
CGTTTGTACATTTTTTTTTCAAGACCAGTGATCCAGCGGTGATGTGATGG
CAACACAAGGAACCTGCACTCTGCAACTGCTATCGCTTCAGCCTTGATAG
TCAGAAGTCCTTTGTATCAACACAAGGAACCTGCACTCTGCAACTGCAAT
CGCTTCGGCCTTGATAGTCAGAAGTCCTTGGTAAATCATGTTGTTCCACT
CACGTCAAATTGATCAGACACTACCGCGGAATTAAAATATTTGCTCTTAT
TTTCAGTGCCTTGATTTGTGGAGAGGTGCCACTGGCACAAGCTGGGAACA
GGAGCAGTGCCGTACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.