Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044163

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044163
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044163
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CGAGGACTCGTCGGCCGTGCCCAGTGCCAACAGGCAACAGCCACTCGCAC CTTGTCTTCTTCCGTCCGCCGCGGGAGAGAGGCTGACGTTACCGGCACAG ATCAAACCCGCCGAGCGAGCTCGCATCCAATTCCAATCCCAATTCTCCGG CGCGTTTTGTTTTTAAATCACATGGGAGTCGTAGCCTAAGCTTCACCGGC GACCACCCCGCGGATCCCGGAGGTCAGAGGAGGCGCGCGCGGACAACGGA GCGGGGGGCGAACTCTCCGGCATCGGCAAGCTGCGATGCCGCACGCCCGG GGCGGCGCGGTGTCCTCCTCCTCCGCCGTTCCCGCCTCCGAGGAGGACTC GCTGTGAGTGCGCTACCCTAATCCCGATCCCTTGGTCCAGTAGATGTTCT GGCTGTGCCTGTGTTCATCTGTGATCTCAATTCCGCGGCAATGGCGGCGG TATTTCGGCCAATCTCATGTCAGGTTTCATGATGTGGTCCGCGCTCCGCT GAATTCGTAGGTTTTTGGGTGTGTGTGTTATATCCTGGGGCTTTGGCATG TTCCTGCTGCATGCCCCAGCGCTAGCGCGTCGAATGCCAGAGCGGAGAAG GGAAGATGGGGAGCACGGCATCGCTAGTTTGTGCGGCGGCTAACAATTCC GCCGTCTATATTTGTGTCCTGTGTTTGATTGTTTATTAAGCGGTATGAAG TCTGTGATAATGATGCGAAAAGAAGGCATGGGGATAGTTTTCTGAATCTG CATTTCAGCCCCCATGCTACTGTTTGGTGCCTGTGCTTATGCAATTTTGT ATGAACTCAATGAAAGTGAGTATTTACGACCAAAGGTGATGCAGAAGCAT AGATAGCCAGTAAAGCTGTCTGAGCATTTTCTTGTCTCTTGCATAGTTCT TACTGCTTTAGTTTTCTGCAATCGTAATATTTCTGCAGGATGTATAATCC TTCTTTTATGTAGGTTTATCGATTTACTACATGAAGCCCCTCTATCTGGT CATCGAGAGCCTAGAAGCATAGTTAGTGGCACCTTGTACTGTATACTGTT GGTAAGGACAAGTTTCTTAGTACCAATTGCATTTATTGTTGTCATGTCTA AAATATTACCGTGTATATAAGTGTATCTTGTATAATATCCAAAAGAACAA AAACATTTTGTATTTTGGTATCCCATGGGACTACCATTTGTCAGCAATTC GTTGTTTCCCTTCCTTTGTTCACTTTATGATAATCGTGTTTTCTTATTCT CTAGGTAGGTTATGCTGCTGTTTCCGTGTCAGCTCCATGGATATTTCTCC GTCTACCACACATGATCTCTCCATTGCTTTGCAGCTCCAATGTTATCCTT TTACTTCTTACAGGTTTTCTATCAGAACAGCTGGCTCATTCTTTCTGTAC CTGAATATTTTTCGCTACTCCATTCTTTACTATTTATTGGTTCATTGTTA TCTCCCTTTGTGTGAGTTATTTACTTACTGTTCACATGAAATTCAACACA GGCATTTTTCAGCAATATTGGGTTCATCAGGTCAGGAAAGTGAGGTTGCA GGTACGGCCAATCAAAAATATACTTTAATTTGTTCACTTTCTTCATATTC CATGTAATAGAGGTGATATGTTTGATGGAGTAATCAATTTAATCGACACT TTGAAAATATTTGTATATATGCTCTCCAAATGAAGAGCCTTTTGATTCTT CTCTGCAATAGGGTTTTCAGTTATATGTATCAATACCATCAGCTTCATAT TCCATTATCATTGTGTTACTCCCTCCGACCCAAATTAGTTGACTCAAATT TATCAAGATACGGTTGAATCTAATACTAAATCATGTCTAGATACAACTGA ATCTAGACAAATCTAAGTCAACTAATTTGGGTCGGGGGGAGTATCTTTTC TTCTATAGTTACACTGTGTGTTTCACTTCGTCACTAACAAAAGTGTGCTT ACAAGCATTGTACTCAAGGTCACTAGTTTCATTATTCGGCATCTTCTTTT TATTTTACTTATGCTGCTTCTCTTTGTATTGTTTTGCATATTAACTATGT ATTTCATCTTTTGACTTGCAGGGCTATTACGATTTTAGCCAGAAACTGAA GCGTATTGCTCGACTTCCGTTTGCCACTATTGCTTATGGTGAGCAGTCCC AAACAAATTTGTTTGACTCTGTAATACCAGAATTTATCATTGTTTTATAA TTTGTAAAAGTAGAATTTGGCCACTTAGTGAACTGCTGCTTCCTTTAATG GGACCATCTTCGTGGTTCCATCTCTTGAGAGTGTGACAGTGCATATATAG CTTGTGGTTCTAATTTTTATCTTGCTAGTGCTGATCTAAAAATCTGTTAC AACAAGGATTTATGGTCTAGGAGATTCATGCATACTATGTTTCGCAGTCA AAAGGATTCACTGTTATTATGTATTTTGCTTCTGCAGGCACTGCTTTAAT GCTTTTAATCATAGTCTGGCAGCCTCTTGTACAAATTCTATCAATTTCAC TGTTGCTAAGGTACACTTTTGCCATTATACTTAACCCAAGTAAATTTGCG ACATATCTCACTAATCATGATTTTTGAACAAAACTTGAGGATAAGTGAGC TTATCTGGGATGGCAGTATGCCTTTTGGCAATGTAACATTTAACTTGAGG AAATTCAAGGAAATTAATCATGACATTATAGTACGAGGAAATTCATGGGC ATGTACTCAAGGAAAATGACGAGAATGCATGGGTGTATATGGCATGTTTT CCATTGTTTCAGTTTTCTGTTTTAAACCGATATTCTAGTGTCCTATTCTG TTGACATAAGTTCAGCTGTCAGTTGACCCAAAACCTAGTTCCTGGAATGA AGTTTTAACATGTTTATGGCTTGGGGAGCCTGTTCGCAACTTTATAATAT ACTCCCTCCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGT ATCTAGATTACTTTTAGTATGTAGGTTCATTCATGTTTGGAATGAATCTA CACACTAAAAGAAGTCTAGATACACTTTCTTCACAAACCTTAAACATCTT ATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGTATGTAATGGTAAACTGAAAAAATCCT AGGCTGATGGACGTCTCAAGTTGTAACATGATTAGAAGCCTGTTGTTTAG CTAGATAATTGTTTTATATGCTATTTCCTATGATTTCCAGTTATGATAAT CGTGCTATTACCCATCAGTAAGTTGGATTGTAGACATGAACTGAATAACC TCACAACTAGCTAACAATAGTTTAGTCCCTCTTGCTCTGGCAATCATCTC ACAATTCCAGTTGCCATAATGCAGGATCGCTATCGTGGTTGAAGCAACAT GTGCTGGATGTTTTATGAGCTTATACATATGTGAGTTAAGTTTCTATATC ACCTCTTGGTTAGCTAGAATTATGGAAACTTGTGCTCTCTTGTGCAATCT ATGATTTGCTCTGCAGGTTTATTAACATGGCACATTTTTCAATTTGCATT GAAATCTTTAATTGGCACCCATAATTAGGATTATTTCTTTCAGAATTGTG TTAACCAAGCAACGCTCTACCACTCCTTGAATGGTATTCAACATGTTTCT CATGATATTTTCAGTTCATCTACTTAATGAACTACATGTGCCATGTGTTC TTTTTCCGTAGAAATGCATGTTTCGCCCCATTAGATAGTTTAAGATGCAG TGCCTGATTGGTTCTTTTTACAGGGTACATCCACAAATACAACTCTTTGA ATGGGCGACCTGATATCTTACGGTCATTATATTCTGCACTTCAACCATCT AGCACTTTGGAAGATCGAAGGTACCAAAGTAACGTGGCACTGTAGATATG CTGAACTTTTCTCTGTTGATTGATATGTACTTATATTTTGGTATTTCAGA AGGCGTAGGTCACTCTTGTCTGTGCACATACAACATCTGTTTTCTACCAT AGTTTGCACGACTTACAGACTTAGGTGTTTAATTTTTTGACTGTCTCTAA TTGGATTCTCTAAATCATGTCTATCAGAGAGAAAAATCAAACATAGTATT AAGCTCAAATGTAGCAGCATGTGACTTCAATGAGTTAAAGCTATCAATAT ATGTTGTATAGATCACTAAACTTTATATTGCCAGTAGAATTAGACACGCT GACGCATATATTTTTTCATCAGATATTATGATGGCCGTCTTTCTGACCAG CAGATGGCATTACTTCAGTACCAAAGGGAGAATATTCATTACCTGAGTGA GGAGGTACGTAGAAAATGAATGCAGTTGTGATGCCAAATATTCAAGACCC ATCTCACTAAATCTATTCTCTTTTGTATACTCAGATACTTTGTAATAGTT GTAGAGAAGGCAATCTGTAGCAGAAGTATGCGTATTTTTAAATCTTGCCT TAGATTGATTGCAGTGATTAGTCATACTATTTTATGAAAGGAGGAATGAG CTGAACCTTTGTAATTCTTAGCTGACTTACTCGGTCAGATCAGTACTCGA CACTGAAGGATTGAATAGTCAATATACAGTTACCTTTCTGGTCAAATTAA TCATGGGCTATAATATTAAATCAGTCGTACTTTCAGAAGTTTGGTTGTTA ACAAACTTTTGTTTTCTTTTCTTGAAAGGTGCTGCGCTTACAAGAATGCC TGAGCAAATACCAGAGAACTGATGTTGGGAACACTCCTCAGGTCTGCACA ACACTGACTGCCTATGCCGCATTAGTTTTAACTGGCACTTGCACAGGTTC AGAATTAGAGAAGAAACTATGTAGCTGTTTATGAAGTGGTGGATTGACAA GAAGTTATTCCCTTTTCTAATTCTGCAGGTTGATCTTGCCCATCTTTTAG CGTCTCGTGACCAAGAACTTCGAGCACTCTCTGCTGAGGTAATAATCTGT ACTATGTTAAGACGGGCCATTCTTGACCTCGCTAGGTAGGTGCCCAAGGG CCAAGGTCAAATCACCTGTATCTGGCCTTCTTAAAAGAAATGCTTACATA AACTATTACTACTGTAAATCTTGCCCACAGAGTTGATTATTACAGTAAAT ATATCTGTATGCGAACTAGTTGCTGGCACTGCTGTGAAGAACTAGTTGCT GGCACTACCATGTGCTTATTGACTATTTGTGTTAATTCTCCTTATTTTAA CTGAAATCATATTATAATTTTAAAACCTGTAAATCTTGATACGAGAACCA TTTACTTGAATCATCCATCTTTAACACCATTAGTAAATCTTCCATCATGA AGTATCCCGTAATAACTTATTAATTGAATCTTCAGATGAATCAAGTGCAC TCTGAGCTTGACCTTGCTCGTGGCCTGATTGATGAAAAGGACTCAGAGAT CCACCGCATTCGTGTGAGCAACAATCAGGTATGCTTTAGCAAATACTAGT AGCATTCTTCTATAACATGATAATCAGGTTAGGTTTTCTCATATCTGCTT GCAAATCATTCTTATGTGATTATGAACATGCTGGATGCAGTATGTTGAAG AAAATGATAGACTCAGAGCTATTCTTGTAGAATGGAGTGCTCGAGCAGCA AAGGTACTTTGTCTAATTGAAGTGCTATTCTTTGACCTATGACATCCTAA TATTCTTCCCTCATCGTTGATTTTGGGTGTGCTCAACAGCTTGAACGGGC ACTGGAGGCAGAGCGACTGGCAAACATTGAGTTGCGGAAGAACATTGCAA AATTCCGAAGCCAACTGCAAAAGGAGCAACACACCTGATTTCCCTCTTCT TGGAATATATTCATCTAGTGGTGTGGATTAGCTGGTTTAACAACTTTTCA ACTGCTGAAGACTGCCCAGGACAACTGACCAAAGTAATCCTCCGAACCCC TGACGATTGCCAATCCAGGAGCATTGGCAGTTTCACTAAAAGCTTAAGGT AGTACATGATCAGCACGTTGCCTGATATGGATCAGAAAAAGGAAAAGCAT GTGTGTCAGCTCATGTTAATGCACAGTTTTGATGTATAAATCTGCAAACA GTTGGTTACTGGAGTATGTGGGATTTAGCATAGACTTTTTTGGATCCGGA GCCTTTCTTTTTGATGCTTCTGCAATGGCATCTTAACATGTAAAGTCTAG C

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.