Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA043827

[Submit comment/correction]

Sequence
AA043827
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA043827
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAAGGGAAAAAAAGTTCCGTCTCCCCACGACTACCAGGTTCTAGAAGGA
GCTAGGAGCCACCCCCGTTCGATTCGCGAGAGATGGCGGAGCCCAGCACG
CAGGTGAGTGCGCGGAGCGATCCCTCCCCCTCTCCCTTGCTTCTCGGCTC
GATTTGGTGCGCGGTTCGTGCTGATTTGGTTCTGGAATTTGGGGCGTTCC
GGTTTGGGGTTGGTTTGCTTGCAGGCGAGGCCGGGACTGAGGCGGCTGGA
GTTCGTGCACGTGGCGGCGGCGCAGGCGGCGCTGTGCATCGCGGGGCTCT
ACGCGCTCGCCAGGGACCACGCCGGGCCGCTCCGCCCCGGCGTCGACGCC
GTCGACTCGGCCGTCAGGGGCGCCGCCGGCCCCGTCCTCGACCGCTTCCG
CGAGCTCCCCTTCGACCTCCTCACCTTCGTCGACCGCAAGGTACGCCGCC
GCACGACTCGCTCGAAGAAACCCCTTCCTTCTCCGCTGTAGGGTCGATCA
GTAATCAGTTGGTGCGGGTACGGCCGCCCTCGTTTCGCGCGGCGCCGCTG
CAGAGCGCTTGTCTCGCTCGCCACTCACCAGCGGAGTGGGTTGTTGCCAT
GCTGCGAACGGTAGCACATACGGGAAGGCGCTCCGGTGCGCCGCTGATCT
GTTTTAGCAGTGCATGACATCTGAGTAGTTTGGTGGCTGTGGGCTGTGTG
TGGTGGAGAATTCCCCGTGCTGGTGCGCGGAATCTGCCCGTGTCCCGCTC
TCGAGATTCCCTTTGATTCCGACGCATTGCTAGCACTGGCGGAGAGTCCG
AGGTGGTGGCGATCACATGCCGACGCTCGTTCACTCTAGGAGTTGAATTT
GAGTTTTGTTTGCTATAGTAGCATTCTAGTGACAATCGTAGTGCTACTTT
TAGTACTAAATTCCAAGCATAGTTGTCTTTACTCTTGGCGAATTCCAAGC
ATATATGGTGTCGTCTGCCTGCCGTGTTGTTGCTATTCTAACCGTCTCGC
ACGCTGACAATGGCAGGTGGACGGCGCGGTGGAGGAGCTGGACAGGCACC
TCCCGTCGCCCGTCAAGGCCGCGTCAGCCAAAGCGTACCTCGTGGCGCAG
GCCGCGCCGGAGCTGGCCAGGGAGATCGCCAACGAGGCGCTGCGGTCGGG
CGTGACTGGCGCGGCCCGCGCCGTGTACGGCAAGGTGGAGCCGGTGGCCA
AGGACGCGTACGGGAGGATCGAGCCGGCGGCCAAGGACCTGTACGTGCGC
TACGAGCCGGCGGCGGAACACCTGGCAGTCTCCGTCTGGCGCTCGCTCAA
CAGGCTGCCGCTGTTCCCGCTGTTCCCGTAGGCGGCCTCTACGGCAAGCA
CCCCAGCGGATCCGTTAGGGCTGGCGCCTTCGCCTAGCCGGCCGTCCCTC
CGTCTTGTCCAGCCATAGCAGCTTCGTCGCCAAGGTTGTCTTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGAAAATTTCTCTGTACTT
CTCCCCACTGATTCAATGCATATATTGTTGCAGATACGTGTAATACAATT
TGATAATGAAAATGGAATTATGGTAGTTAAGCACTAAAATTAGCCGAGTC
TCCATTGTTCAACAGATCGAGTGCATGTAATTGGTGTCATGGTTTGTCAT
ATAATGCCACTGTCCTTTTGTTTATAGATTGCCGAGCTATTATCCAAGCT
AGAAAATACGATGGCTGTCATTTGTGAGGTAGTCATCATTATGCTCTTAA
TTTATTTTCCAGTACATTAATACTGGATTCAGTATAATTTGTCTACTGCT
GTAACACATGTTTCTTAAGGAGGACATGATCTCATCTTCTGGCTCTTGAC
ATCATTTTGTCTGTCACTAAATTTTGTGTGGTTCTGCTAGCAATTGCTCA
AATATTCAAGCTATTAATTCTAAGTTTCAATGTGTGATATTCTTTGTTGT
GTTTCAGGGGAAGGTTAGCGTAGCTGATATGATTGCCTTTTCCCCTTCTG
AAGTAGCATCATCAAAGCATGATGGTAAGTTTGTAGCCCATGTGCAATAT
TTGGTTTCCTCTCTAAATGTACTTTTGGAAAAACTTAAAAGTAGCATCAT
CAAAGCATGATGGTACTTTTGCAATACTTGGTTTCCTCTCTAAGTCATAT
AGTTTTCATACATAAAAATTCAGCTCTACGACTCGCAGTAAGTACTTTAT
TCTTAATATCTTCATGAATTATTAATTTTATTTTGAAAATTGATGCAGCT
TGGATGCGGATCTGGCCAAAGCATGAATTATTAATTTTATTTTGAAAATT
GAGGGCTGGTCGTGGCATCCCGCAGACGATGCGGTGGTAGGTCTGGCCGA
ACCCCTACTTCCTCTACCTCGACTACGTCTCGGCTACAGCTTCCCTGCGG
TGAGTATTCTCCTTCTCTCCATGTATCTCTCTTTTGCACAGCGAGGATCA
GAGGTGTTGTGTTATGACAGCTAGATTAATACCGGTTGTGGTTTGACTGC
TTGATTTTAGATTAATATGTGAATAACAAAAAAACATTCCTGCTTAACCT
CTGTTCTATGATGAAATAAGACCCTATTTTAGATCGTGGTCTATTGGATA
TGATAACTAAAATAGGTTTATATTTGCATATTCTCTATGATAACTAAAAT
AGGTTTATATTTGCGTATTGTCTATACCAGAGAGGATTTTAAGGAGAGAC
CGCTGGTAGTGGAGTTTTGGCTCCCGAGTGTAGATAGACCTGTTAGCTGG
ACCATTGATTCATGTGTTGGGATTAACAATTCTGTCAGAAACGATATTTG
TCAAGGCAGTAGTAAATGGGGAATACAGTGTCGGCTTCGCATATGATTTT
GTTTCCATTAATTAAGTACCACTGCATTTACATTGCTGGTCCTTATTTGA
AAACATATCGATCCTATTGTATATAACTGTGTACTTGTTCTTTAAACAAA
ATATTTTCAAATAATTGATGCTGAATGTGGTGGAGCTGGTGAAGTGGGAG
GACGACAAGTGATAATTTTGCAAGATTCCATAATTGATGAATACATGACA
GGTATGTGTCTTTTTGGAGCATCAAACGGATATGTCTACCGGTGGTGCCG
TCATGTTTCTGATAAAAGGATTCTGGGTGGCCTCTAGACTGAAGCATGAT
ATTGCAATGATATGCCCGTGTCCTCTATGGTGTTGGCAGTTGGCACCGTA
GTTTCCCAGCGCTTTTGGGTTATGAGCTATGCTAGGTTTTTCTTACGTCT
CTAGATGCTCTCTTTTTCATCCTTTCTTCATTCTCTCACAAGAAAATACA
AGTGAACTTGCTTTGGTCATTTTTCAAATGAGATGCATGTGAATTATTCG
TGAATAGAACTTTTTTTATTCGTGAATGTTTCTTTGTTGCATAAAACCTA
TTTACAGAAGCTTCTATCATCTGAACATTTTGACTTATTCGCGAGACAAA
TAATTCCATTAATTATATTGTTTAAATTTGAAGTGATTGTATATACAATT
CTATCTGGAAGATGTGTGGTCTGTTTTTCTTTTGGCATGTACCAGATGAG
AAAAGTATTTGTTAACTCGAGTACCTTTCTCTTTACATGACATGACCTTA
TATTTTGCTCAGTTAAGAAACAACCAATATGCCTACAAGTAGCCCAGACA
AGAATGGATTATTTTAATTTGGAACTCATTATGTTAAATTTCTAGAAAAC
AGCGTGTATATCTTTCCCTTTTGTTCATACTCACACATCTACTTATATCC
AGGTAATTATATCTAAATATAGCAGCCGGTTGGTATTTCCTTTTATTCAT
ACTCACACAGGTGTCTTCCATCATGCATTCCTTATATATATTGCTCTCAG
ATACACATATTTTTTTCTGACGGAGTGCAAACTACTGAATATTTGCTACT
GTAGAAAACCTAAAATCATAAGTATATTCCAGAAAATAAATTTCTAACTG
TGCCCCTTCATTGCTTCATTAACTTACTTAAATTTTCTTTTCTTATTCTG
GATGTAGAAGATATATGAGATAATCCCCTACACCCTCCATGTTCCAGTAA
TGACACACATTCGCTGCTGTTGTACATGTTGTGATTTTTCATTTTTGGAT
GGAAACTATATAGTTTGTACCATGTACTACCATAAAGCAAAATGGGTTCA
TTTTTGTTTTTACTGTGTCCCCCGGTACATACAGCAGTTGTGGCTGATTC
AGGATTCATGTAGGTAAGCATTTAATGCTAACATCTAAGTGAGGAATCAG
TAAGAAATGATAGCAGAATAGTAAGAAGATGCCTACATTTGCTGCTGTGA
AATTGAACGTCATATTATTAAGCATCTACATATTTTCTTATTTGGGTATT
TAGCTAGTGGATTGTAAAAGGAATCCCCGACTACTGATCCCATTTAATGG
TAGTTTTATTCAATGGGTAGCTTTCTCCCTGATCAGAGGTGCTTTGCAAA
AATATTTTTGCCTGATAACGTAAATACTCTATGTCATATGTTACTTTAAT
ACTAGCATATTTAGAGTTCCATGTGAATATTCCTGATTTGTGTTACTTAT
CATTGAGTAATGATTATGACCAGAACAAGAGTAGTGCTACCACTTAAATT
TGGACAAATTACTTACAGTTCGTATGACACATCTGGTCAAGTGAGGCCTG
AAGGAGATGATTCCAATGGTCTGACTGAAAGTGAACAACAAATCTTGTTC
TCCTGGAGCCATCCACCTACCACCCCGGCAGCACACAGCCAATGGTCTGA
CTGAAAGTGAAAATCTGGCCTGAAGGGGATGATTCCACGCAAGCTGTCAG
CGCTCCGGTCGCGTTCCTCTTCGACGCCAAGCCCCGCATGGTCGCCCCCA
CTCCCGTGTGCCCTGTACAGCAACCGTGACTTCCATGTCATGTACGTCCT
CGACCCCGAGCTTGCCTTCGGCCACATCCCAGGTGTCCGTGTCTGCCCCA
AGCTCGGCCAACTCCCGTGGCGTCTGATGATATCCGAACAAGGTAAACAT
TCTCTTTTTCTTCTCTTCTATTTTTTTGTTAAATGAGAGTCAACTAGTTG
TATATTTTAACTCTTAACTGCATGATTGATACTACATACATGTTTGCCTG
TGTTAGTTTGTTAAGATAATCAATTAGCTAGGTGGTATCGGAACTGATAG
TGTGCTCAAATTGTTAACATGGGTATTTAGTCCAATCATAAACTTGTTCC
AGTTGGTCGAAATATCTACTTGCACGATCCTTACATTTATCTGATCAAAC
TCTTATCTGTGTATATTTGTTGCTGACCATGTTCTTGTGCTTTTGCATAT
ACAGTGCAATGTTGATATATTGCGAACTACTGAAGTTAGTCTAATAATTT
GTATGACTTGATATTAATTCTGAACAGCTTCCTCTGTTGATTAGGAGCGC
GAGCAGGAGGGCGAGGAAGGAGCTCCAGTGGTGAGACGACTTGCCTCTTG
ATCCCAACCAGGGAGCAGCTTCGGCGGCCGCGGCCGCGGCCAGCAAGGAG
GAGCTCTGGCCACAGCTCCGGCGAGCAGCAATGGTTGTGGACGAATGGTT
GTGGGCGAATGGTTGTGAACAATGACCGTAAGATATGGCTGTGAACAAAT
ATAAGATATGACTGTAAGATATGTCACTGTAAGATATGACTATAATGTGA
TTTGTAATATATTTCATGATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.