Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA013480

[Submit comment/correction]

Sequence
AA013480
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013480
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTCTTCCTCCTTCCATTCCGTTTTATTCCTCTTAAACCGAGCCACCAAA
AAAAATAAAAAAAAATCGCGGAGTTCCGCCGGGAGTCGTGCGCGCTGCCC
CGATCGGAGACCGCCGCCGCTGCTCCGGCGCGCCTTCTTCATCTTCCTGG
TACGGCGGAAACATTTGGTACGTGCCAGCGGTTTCGATTGGATATCGTCT
CCGTTTCCGTTCCGATTTCTCGATCTCGATGAGAACCGAGTGATTTCTAC
TGTGGTTTTCTTCTCCGAATCCCTCTCACTCCCGCTGTGTTATTCGCAGG
TGAAGGATTGCTGGAATGGAGGGGCATAAGTTCGGCGGAACAAATTGGGG
CTCCTCGCCCTACCCTGGCTCCAACGCCAACGCCAACGAGAACCAGTTCC
TGTTTGATGCCAGGTCCGCGCCACAGCAGCTGCAGCTCTTCGGGAGCAAC
GCAGGTATGCCGATGATTACCCTGCGCTGCATAACTGCATTCTCATGTTT
TCGTCGATTCATCTTGTTGTAGAGTTCAGAGTTGAGCGTAGGTCCTGACT
TAGTAATCCGATTCATTGAATATTTTTACTATTGTGTACTCCCTATTGAT
TGTTGAGCACATACATTGTGTACTCTCTGTTGTTTGTTGGGTCAGTCGCC
GTAGTTTTGTATTTTATCTGTAGTATAAGCCATTCAGATATGTATTTTCT
CTTTATGTATACACACACCTACAAGTGAGCATGGAACTGGTTGTACCTAT
TTTCTAGGCACTCAATTTCTTCGATGAATAAAGACATTTCCCCCAGTTAG
ATGAACTTGTGACAGAATATGCAGGTTAGTCATAGTGGTGATAAATTTTG
TGAGAAAAGCTCGATTGTATGTATCATATCTCAGGTGCAAGGCTAATGAG
CTGGCTTGTTAACGATCATAGTTTTACACTCCTAGTATACTGTCAGTCTG
CACATCACATTGCCAGGTTGGAACCGATATATGTTTAATAGTGACTTTGT
TAGCAGATAGTACTAGATATTAGTATGACCCCATCAAGACTTAATGTGAT
AACTCACAAGATTTATCATTATTGGGTAGCAATGCATGAAATGCCAATAT
TAAGCCACCAATCAGGGAATGTTTGGAATTGATTCTCTTTTTGAAATACC
CTATTGTGCCTTGCACTATCGAGACATCATTTTTGCCCGATGGGTTTTGT
GGTTAAATGGTAAGAGTTGAACATGAATATGGATTATATAAAATATCCAT
TATCATAGCTCCACAACTACTTTACTAAAGCTCAAAAGGGAAAATAAATT
GGCTGTGAAACAAAAAAGGGCAAACAAAGTCATAACACGTTTATAAGAAA
AGGCCGATAAATGGCATCACACAAGGAGTATTTTACCTCTGAGGACACTA
CAAGGTTCCTCCACTCCCTTCAACTTGTTGGCACCCTCAACGGCCTTGAG
AATACCAGCAGCCTCTTGGATCTTATTCTTCATGTGTGTACAACAGGAAA
GGATCTAGATGGTGTGTGAGTGTGCATCAGCACACCAAAATTGTGGATCA
TTTTTGGGGTTTAAGTAATGATGGCTAAAAGCTCATACCTCGACCAATAT
CCAATATTGCGGGTGGAGGGCGTGTGATGTCACAATGAGAGAGAACAAGG
GCGATGGAAGCAACACACTTGAGAGGCTGACGGGTTTGAGGTATTAAAGC
GTCAGCAGTGACACTACGTCAGAGGGTCAGCTCTAGGGATTGAGGAGAGG
AGAAGTCACTGTGGAGAAAATGAGTTTTCAGGATGGGAGAGTACAGATTT
GAAATTTGGTTATGGAAATAAAACAAGCTATAATGTGTTTGTGATGAAGG
GTCTCTTCATAACGAATATAGGGATTATCAGAGCCTGTAATTTTCTTTAG
GGCTCCATTTGGGGTGTCAGGACTGTAAATGGTCTGGATAATTCACCGGA
CGATTTCGATTCAGCCCAAAATGGAGATGATCTGTAGTTCCAATTTTGTT
TGGTTAGTTGCCTGGTGAAATCAACATAAGTTGCAAATTTTGTAGCTAGT
TAACATATTAGTCACTTATTTCTTTACAAGTTCAAGGGAGTGGAGGAACC
TTGCAGTGTCCTTAGAGGTAAAATACTCCTTGTGTGATGCCATTTATCGG
CCTTTTCTTATAAACGTGTTATGACTTTGTTCTCCTTTTTTTGTTTCACA
GCCAATTTATTTTCCCTTTTGAGCTTTAGTAAAGTAGTTGTGGAGCTATG
ATAATGAGATATTTTATATAATCCATATTCATGTTCAACTCTTACCCTTT
AAGGTGTTCGTATGGATTTACTTGATGTCGATACATTCATCTAATTGAGT
TGTCTTAACGAGTACTATATGTTTCTAGCCATATGTGTTATGTCCTACTG
CCAGCAAGTCACACAGCTCAATAGCTTTGCAAGCCGTTGCACTTGTTACT
CTTGATATTCTGATGTTGTATATATCATTGTAATAGTACTGCTTCTCATT
TGTTCAAATACATCACAGGAGCCCAGAATGCATGGGATATGCTATCTGAG
GAGCAATCACAGAAACACATCAGTACTGGTTCTAGTGACCTCAACGGCAT
ACTTGGTGGAGGGATTCACTGTAAAGAAGTTACTGAGATAGGTGTGCCTT
TCTAACATCTTTCATGATGAAGGAATGAGTAGGACTTCTTGGTTAACCAG
ATAATCAACTGGACAAATTTTAGTTGGTTAATCCTTTAGCTTGGTTTCTA
TAGCTTCCTTCACGGGCATCCTGTTTTCTAGTGTTAGCCTTGTCAGTTTT
GTCTACTGTTCTGATCAATTGTAGGTGCTTAGTGAGTCTTTTCTCTACTC
TGGTTATTACCTTGTGCATGAACATCTGATGATGCCTGTCATTTTTGTCT
GTTGAGTTGTTTACATAAAATGGTTATGTTCATTGATATTATCTGTCGTG
ACTAGACTAAGCTACCAGCTTTATTCAGGTGGTGTTCCAGGAGTTGGTAA
AACTCAGCTGGGGTATGTTACACCTACTGTTGAATCAATGTAATTTCAGA
AGACAAGTGCTTTACTAAATACCAACATTTGTAGGATTCAGCTAGCAATC
AACGTACAAATCCCAGTGGATTGTGGTGGCCTTGGCGGCAAAGCAGTTTA
TATTGGTATAGTGGTGTCATGGAAAACAATTGCTATCCTGTGTTTGTTGA
GAAACTTGTAACAACATCTCTTTTCGTTGTAACAGATACAGAGGGCAGTT
TCATGGTTGAACGTGTATATCAAATTGCCGAAGGGTGTATCAGTGATATA
ATAGAGGACTTTCCATACCACCATGACAAGGCTTCATCTGGCCAAGGAAA
TCTGCAGCCTGAGCGCTTCCTGGCAGGCATCTATTACTTTCGAATATGCA
GCTACACTGAACAGATTGCGGTGATAAACCATCTGGAAAAGTTCCTCGGA
GAACATAAAGATGTAATATTCTTGAACAATTGAGTCCTCAAGTTTAATCA
CCTGAATGATGCCCATTCTTTTGTCGTAAACATCTGTTTGAGATTAAGAT
AAGTATTTTCTGGCAGTTGTATTTTTGACAGAAATTATTTTTCTGCCCTT
CCCTTCTTAATAGTACCTACCACAATTGGTTCAGTGTTGCCAGATGTTTT
TAATTTTTTTCTGCTTTACAGGTGAGAATAGTTATAATTGATAGTGTTAC
TTTCCACTTTCGACAAGATTTTGATGATCTAGCTCTGCGGACTAGAGTGC
TCAGTGGATTATCATTGAAGTTGATGAAGCTTTCAAAGACATATAACTTG
GCGGTAAGCTTTCAAAGGCATTGATGCAAACACTGTTATCAGGAGTGGAT
AATTTTGTAGACAGATGGTTGTGATTTTCTTTGAACTTTTGTTCAACATT
TGCAAGGTCTGTCGTGCTATTACACCATCTCTCCCATGGCCTTTCTGTTA
GGCATATTGGTAACTGAAGCTATTGTTCATGTTGCATAATTCTATGCTTC
CATTCTAGGTGCTGATTTAATACGATGGTAGAAACCCACCTTTGATTTTT
CTATTAAAAAACTCAGCTTATGAACAAACTAGTGAAACGTTGTGCTGATT
CAGCTGAGAAAACCATACAGTAGCTCAAATCCTTTGTAAATGGATTTTTC
TGCATGTAAATATTAGAATTTAGAAGGGACACATAACTTTTTGGGTGAAA
CTCTGCTACTGCCCCTTCGGGTATGACCTGCTTTAATACCGTAGCTATCT
CCTGCATGATTTGGCAATAGTGTATCTATTTTCTCAATCTCTGATTCCTT
GTCTGCTCTGTTTGTACTACATTCTTTTATCATGTTTCTTTTCTTTCGTA
CACTAAAAACAACAGAAAATTCAATATAAACCACTGGTAATTTGGTCAGT
TCCAGATATGAGACTCAAAGAACTCAGTTCCAAACTAAATTTTGAGCCAG
TTTCAAATGTACCACTATTGCTAGTCAAGTTGAAATAGTAGCAGGCACAT
GAAAATATATCACAGAAAATATTTATTTCTATTGTAGCAGAGAGGGTTCC
GGAGAGAAGCAGGCGCATGAAAAAAATCATTAAGGAAAAGTTACCTTCAT
CAATATGGCAAAAAATTGAGTCATCACTCAGTCAACAAACGGTAGTTTCA
TATTTGGAACTGCCACAAAATTTGAGTGGTCTATTCCAATTTGTTTTTTT
TTTAGTGGCATATCTGGATCTGACCATATTTTCAGTGGTATATATGGAAT
TTTCTGTAGAAAGAACTCAATGATGACATCTCTTAAGGTAGAGAACTAGA
GATGCCATATTCAATGAGGCTAACATACTTATTGTATTTCTTTGAGCAGG
TTGTCTTGTTGAACCAAGTAACTACTAAATTTACGGAAGGATCATTTCAG
TTAACTCTTGCTCTAGGTCATTCCCTGTCTTTACCATTATAACCCTAATT
TTACCTTTGAATCATTGTCGATGCCTATGATTTTAGTTGTTCTCCAATTA
AAACTTCTGAAACCAACAATGCTATTTTCCTATCGCAATGGTTTTCTTAT
CAACATTACATTTGCTTGCTGTACTCGTGGTTCGGAGCATAAATTTGAAT
GAGTAAGGCAGTCAATTGATGAAATTTTAAAATCTGGGTCATTTTTCTTT
GTCCTGAAATGTACATTATAGAATAGATGTTTTAGTGATAACATACAAGA
TTCAGTGCTGCTCAAGCTGTTTAGCTCACGTTGATCATAACACTGTGATG
AGTTCACTGACTCCAGTCAAACAAAGTGGCCCTAGAATGCGGCAATCAGA
CTATTTTAATCTTCAACAACAATATTTTTATGATGTTTAGATTGCCAATG
TAAAAAATATATCCATACTATTGTCAGTACATCTATAATGATGCAATTAT
TAGTTCTAAAATTTATATTTCAATATAATTGGTCACTGATAGTGCGTTCT
GAAAACAGTGTCAATGTCGTAACTTCAATGTTTTGCGACTGAAGGTAATA
ATATTGATTTACATGACATTCTTTTCTTAAAACAAAGTGATGTAAATATA
ACACATGCAACTGTATGAGGTGCGCAATTATCTGTATAGGTCTGAGTCCT
TTACCTTTGCAGCGACACTTCCTAGAGTGGTTGATTCTGCTGCTTCTTTG
GCTTTGCTCTTAAAGAGATACAAGTAGCTTGTAGCTTCTGGCCATTTCTC
AAAATCAATATTACAGTTTATGTGCTGGTGAGTTGCTAAAATGTTCCATT
CTAATGGGTAATGGCTTCCTCGTTACGTTAACGACTGCAAGTCGACAGCA
TTTCCAAAGGGTTTGGGTGCGCTTTTTCTTGCAAACTTAATTTCCCATGT
AGAATTGTTAACAGTAAAGCAATTATAATCTATGAATGTTTGGAGCATCT
GTCTGTTCAGTGTCTGGGACACCTCTATGGTTCTGCAAGAGCCTAATGTT
CCATCTTCTCTGAATATTTTATGAATCAGTTAGTCAGATTGTAGATGAAC
TTGTAATTTTTTTACAGATCTGTTGCTGGCTCAGAGACCGAACATCAATT
GATTCTGGAAATGAACGCAATGCATTGCTGTTGTGCAGGTGACAGCTGGT
CCCACTCGAGCACAAACCGACTGATTCTGTACTGGAAAGGCAATGAGCGG
TGTGCTTACCTTGATAAGTCCCCTTCGCTTCCGGTAGCTTCAACACCATA
TGCAGTGACAGGCAAAGGGGTGAGAGATGCTGTCAGTTCAAACTGCAAGC
GAGCTAGGATAATGTAGCAGCCTTGAAATGCACAGGGCTGTTTGCTTAGA
CATTAGTACCATATTTAAATAGCTTCTAGAAGAAAAGGCATTTTTATTCG
TTTGGTTGATCCAGTGATCCAAAATGCACCCAGATGCACTCCTGTTGCTT
CATCGGTATCAGGATGTAAAATGTCGCACGGCAACCGGCATATCTGCAAT
ATTGCGGTGAACGTGATCGACGAATGGGTGGTAAGGGCTGGTGGTAATGT
CGTCGTGCTAGATGTATTAAGATTAGCGAGGGAAAAAAGCAGCATAGACT
AATGGAGTCTCTGGATAGCAATGCTATATATCAACACCTTTTGCTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.