Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA029644

[Submit comment/correction]

Sequence	AA029644
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA029644
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCCATCTCTCTCTTTCATCCCCTCGTCTGATCCTACTCTCGCGCCTCATC CCGACAGCGCTGATCCGATCGCGGGGAGTCCCCAACCGCCCCTCTCCTGC CCGCCACGGCCGCATTCCTCTTCCTCTTCCTCTGCCCCTGCCCCTCTGTC CACCGATTCTGGGGATTTGATCTGCTATCTGTTCCGGCCCGGTGAGGTAC CCGAATGGGGAGAAGGCCAGAGATCAAGGAAGGTTGGTTGCTCCTGTCTT GCTTTTCTTCTCTCGTAATTTCTTCAGATGTTAATGCTGTGCTAATTTTC CATATGAAGAAGATTCCTATCTAGATTACTCTTTTTTTCTTGGGTTTGGT GTAATTACTCTGGTTCGTCCCTTGAATTCAAGAAATCAATCACCCGTCTT GTTCATCTTTTCTTTTCGTTTGGGCTTTCATATGACTACCTTCTTCCTCA CGAGTTCTCAACACAGCTGAGATTAGGAATAGGCCGATTGTGATCCACCC TTTGATTAGCCTCTCTTCGGCCGGAAGCACAATGGAACTTCTTGATTGGT TTATTCTTCTCCCTGCAGTCCCGGCCGGTTGCTTGGATACCCTGAAGAAA CCCATGAATTTTCTACCTTTTCCTTCCCCAGTTTCATTTTCATCCAGAAA ATGTACATAATAATCATACTATTTCATCTATATAGCGGGGATACCAAGTG TTTTGTGTAACCCGTGCGTTTCAACAGCCTCCCTTTTAGTTTGATTCCGG GAAGGTGGAAACTAGTACACATTTCGGTTTGTGTAGATATTTGACGGTTT TTTGTTTCTTGATTGATGCATAGATCGATTTTCGAACCGTAATTTTACAC CATGTACTCGATGAATGTTACACAAAAAACAATGAGCAAATTGATCGTAA AGGTAGATATGTTTTGGACATATTAATTCTTCCATGATTAGCCCACTGCT TGTCCTCAAGAAATTCAGACGATAAAATGTATTGACACTTTTATGATTGC TTTGCTTCAATTATATGCCAAATATTTGGTGATGTGCTATATCTATAATA GCTTATCAAAGCAAATCATGTAAAAACAATAATTGAAATTCCTTCTACAC ATTTCATGATTGTGTTTTTATCAACATAGAGAGAAGTAACATGGAAGTTT TTAGATACTACTTGATTTAAGACATTCTTGCTTTGGGGTGTTAGTTACAT ATCTAACAACGGTCACTATGTTACAATAGACTCAACATAATAGCTAGGCA CACAATTACAAAAGCCGGACACCTATATCTTACAACATTCAACAGTTTGC CGTTGAAGAAAAATGTATACTAAAATAAGAATGATCGCCATACTCTCATT ATTTGACACTATATGAAATGAAAGAATAACTTGATAGGTTAGAAATGAAT TGATAAGAATATAAAAAATCTTTGTATCATGGAATGAGGTACTACTGATG TCCTGTTGTTGCTAAGTAAGGTTTTACTATTTTGGTGCACACATTCATGA GTTTGAAGTTTGATTTTATAATATTTGAGCTTTTTGAGGAATGTATCGCC TCTATTTCAACATATTGTTCCTTCCTCTAGAGAGTTTCTTTATAACAAAG TTTTAGCCCAAACTCCATTATGGTGTTAAGGAATAAAAAATTTGAGTTTT CATGGCAAGGGTGTAGTACAACTTTGAATGACATAAATGGATTATCCAGG ACATAAAGGGAAAATACTAGATTATTTGGCTTGCTAAGATATTGGATGTA CCACGAAGTATGCAGATTTTGAATGAAATAAAATGCAATGTTGAGTACCA AAGAGGCTAGAAAGATGAAAGGCATTAATCAACTAGAGAGCATGGCAATT GTACTCATATGTTTCCTACAACAAACATATCAAACTACTGCGTATGGTAA AACAGTAGATGAGCGAGAGGATGAATTGCTTCCTAACCGTAGTACCACAT GGGCAAAGTATGCATCATTTTTCAAACTATTCACCTTTCATCTAATTTAA TATTAACTTGCTCTCTACCTTAGATATTAACTAGATGTAATAACTCTACC ATCCTATTAGGAATTCTGACATAATTAGTCAATAATGCAAATGCTCCATG GTATCTCATTGATAACAAGATTAACATGGATATGCATGGCAATGTAGGTT ACCGAGCTTCACAAAAATGTTTTTTGTTCTAGTCTATCATGTGTGTTGTG TTTTTCCTAGCAAGGGTTATTTTGATCCTAGCTTCTGAACTAATACTATC CACATGGATTATTCCACAATAATTCTTCAAAAAATAAAAAGGCGAAAAAA TAAATAAAAGAATTCATAAGCAACATCAATGATTAGATGCGGACAAGCAA ATGTTATTCTTCTTCCGCTCAAGAGAGAATCAAAATAATAGTTTGCAAAT GAACTTCACGTCTTCCTCTTCTCCACTTGAACCTATTTTTGGCCATAGGT CGTTAACTTCCTCTTCTAACTCCCCCAATTCGATCTGCAAGGACAACACG GGATTTAGATCAGAGAATATGAATTTGTGCTAGTTTTCCTCTTCAAATAT GTTTTTTCTAATAGATGGAAAATTTATGAGCGAAAAATGTGCATATGAGG CACATGGTCCTATCTTTCTTTCAATGGTCGAGGTGGCAATTTGGTCTTGT TCCAAATATTTAAGCACACATTTGTGACCACCTCTTTCTAGGGGGTGCTA AATTAGGGGAATTGCTAAATTAGAGAATGTTTGTAAGGCCGTGGATTTTA TAATTGTGCGGTGGTTTGGTCTTGTTAATACGACTAATCAATCTATTTCA TGCTTGCAGCATAAAGCCAATAACTCTTTGAGGCAAAATTAGGGTTCTTC AACACCATCCAACATGTCGGTTTCTATGAAGGATTTGGATCCGGCTTTCC GCGGAGCTGGACAGAAAGAGTATCCTTTTGATTTCTTAAATATATACTTT TTATAGGATTTTCATAGCTTGAATATTTAAAATAACACAACATGTCATCA ATATTCCTATGAACATAAATACTAGCAAAAGTGATCTTGGTCTATGATCC ATGGATAGAATGATCACCACCTCTTTCTAACGACAATGTTTAGCATCAAC AGACTTATAGTGCGCTTGCCTTCATCTAGAAAATAAAGACCGCTTGCTAC AATGATATAATTTTTTGACATATTGTTTTATTGGGCAAATTAATGCTCAA ACTTAGATAAAAGCGTGTGCTGTCACCTAAATATGAACAGAGAGGAAGTA CACAACAAGTAATGCTTATTTGAATGTTTCACTATATTCCATGGAAAGAA GTATACATACCTCCCGAAGTATCCAAAAATGGCCGAACACCCTGTGAGGT CAAAATCGGAGCACATAATCCTTCAAACTATGCAAAACGATGCAAATAAT CCCCTTCACCCTATCTTAAACGGTCTTACCTGGTGGTTTTGCACACGTGG CAATAAGATGGTGCTCGTGTGCCCCTAAGAGCATTGACTTGTAATCCCGC TTCACCATGTACCCACGCGTCAGCGTAATTGAGCTGCAGGCGTACACCGT CCGCGCCAACTGCTGCGGGCCCGTGGGGAGGAGAAGGCAAGGAAGGGGGC GCAGGGGGATCTCCCCTCCGCAGAGCGTGGGGACCTCCGGCGAGGGGAGC AACAGAGCAGGACCGGCGTCGTGTGGAGCACTAACCTACGCGCGGTGGGG TTCCGTTGCGGGACCGGCTCGCGATGGAATAGATTGAGGAGGACTAGGGG CGGCGGCGGATGGATGTCGCGGACGAGTGTGTGAGCGGAGGCGGCGGCGT GCATCAGATTAAGAAGGAGGCCGACGCCGGAGACCTGTTCCTTTTGGATG ACCACCTCGACCCCCCGTGCGACAACGAGGGGGAACATGAAGCGGAGGCG ACGCGGCTGGACTGCTGGATGACGGGGAGACTCCACGTGCGCCTTCTTCT TCCTCTGTGGCGAGTAGCAGGAGGCGCCGCTGGACGAGGTCGGTCATGCG CGCATGCCGATGGACGCCCCCACGCGGGGAGGACTGCTGGGAACGGAGGA GCACGGCGAGGGGATGGATGCAGGACCAAGAGGGGAGAGCAGCGGAGCAC GGCGACCATCAACTCAGTGCTCTGCCACATGAGCAAAACCGCTCCCAAAA ACAGCTCAACATTGGGTCACGGGGTCGTTTGCCTGGTTTTGCATAGTTGA AGGGATTATGTGCACCAATTTTGATCCCATAACTACTGTTCATATGAGCG TCATATAAACGCAATACTCCTTAATTACGATGCAGCGGTTTGGAGATATG GCGTATTGAAAGTTTTAAGCCGGTTGCTGTACCAGCGTCTTCATATGGAA AATTTTACATGGGAGATTCATATATCATCTTAAAGGTAAGGACGTATTTT CTGCCTTCTTTCCAATGCACTTTATTTCTTTGGAACACTGTTGGTGCATA ATCGAGATAGATTTTTTTTTTACATTTTGAAACACAACTTAGAGACCACA ATACAGTAATCTCTTTCTTGTTACTACATCGTACAATACGAATCCTTAAT CATTTATTAGGTGCCTATGCTTCACTATGTTGAGGCTCAGTTTGTACATG GCTCGAACTCAGCTTTTCTGAGGGATGGCTTAGCTAATGCATTGTGCTTT TACTGCACCAAAAGGTTTCTCCCCTGATGTTCTTTTGTCTCTCTACAGAC AACAGCCTTGAGGAATGGTTCCTTCCGCCATGACCTCCATTATTGGCTTG GTAAAGATACTAGTCAGGTATATTCTCAAATCATTTGGCAATGCAAATCA CTTGATTTAGCAATTCTGAGACGCTATACAGGCTTTGTGTCAACTAATAA TTGTACAATGTGCTCAATATTTTTCCTGGAAGGATGAAGCTGGAACCGCA GCAATTTTAACTGTGGAGCTTGATGCTGCCCTTGGAGGGCGTGCTGTCCA GTACCGGGAAGTCCAAGGCAATGAAACTGAAAAGTTACTCTCATATTTTA GACCATGCATCATGCCACAACCAGGCGGGGTAGCTACTGGGTTCAATCAT GTAGAAGTCAATGAGCAGGAGCACGTTACCCGGTTATATGTGTGTAGAGG AAAACATGTTGTTCATGTTAAGGAAGTAAGCTATCTAAAAGACTGTCTTT TTTCTGTTTTGGGTATGTTCATTTCTTGATCGTGATGCTGTTTTTTTACA AACCAGGTTCCTTTTGCTCGTTCAACCCTTAATCACGACGACATATTTAT TTTGGATACCAAGTCCAAAATATTCCAGTTCAATGGCTCCAACTCATGCA TTCAAGAGAGAGCAAAAGCTCTTGAAGTTGTGCAGTACATCAAAGACACT TTCCATGAAGGAAAGTGTGACATTGCAGCTGTTGGTAAGTAACTTCGGTA ATGTGCCTTGAGTATTTAGAATCCCATTTACAACATCTGATAATTTGGAG TCATCTGTAGAGGATGGAAGGTTGATGGCTGATGCCGAAGCTGGTGAATT TTGGGCTACTTTTGGTGGCTTCGCTCCTCTTCCGAGGAAGACATCTTCAG AGCAGACTGGTCAAGACATGGACGCTGTGGTCAAATTATTATGGTACTTT ACTACCATTTAATATCCATAACACAATAGTGTAAAATTTCAATAGAATAA TTCGCTTTTAACATGATTTCATCCATGCCTGTGAGATAGATTAACTCTTC AAATTAGGAAACTGAGTAGCTGATTATGTGACTTCTCAGTTTTAACCAAG GAACGCTGGAGCCAATTGGTTTTGAATCCTTGGTGCATGAGTTGCTTGAG CCAAATAAATGCTACTTGTTAGATTGTGGAGCTGAAATGTATGTTTGGAT GGGCAGAGGTACTTCTTTGCAACAGAGAAAAGGTGCAAGTGAAGCTGCCG AGGTAACTTAGGAGCAACTGGATGCATTAATACATGTTCTTTCTGAAGGT TTTACTTATTTCTATCTCAGAATGAAAGAATAAATGTTTATGTACGTCCC GGTGTTAGAAAGTATACCAGCTTGGTGAAATAGCATGATAACATTCTCTA GAAATATTCTTCAAATCGAATGATCAAAGCATGCAGATATTTTACATTTT GTGCTGCTGCGTGCTTAATATCTTCTACTTCTGTACAGAAAATGCTCTTT GACGGCAGCCGAACAAAATCACATGTTATGAAAGTGATTGAGGGTTATGA AACAATAATGTTCAAGTCAAAATTTAGTGAGTGGCCAGCAACTCCTGATT TGAAATTGTCTTCTGAGGATGGGAGAGGCAAAGTTGCAGGTTACTGTCTG CCGATTTATCAGTTTCTGTGCAACAGATCGCTAAAGGGTTCACTAAATCA CACATGTTTATGTATTATTCTCTTTCTACAGCTCTCCTCAAAAGTCAAGG ATTAGACGTTAAGGGCTTGATGAAAAGTGCACCTGTAAAAGAAGAATCCG AGTCTTATATTGATTGCACTGGTCATTTACAGGTATTCTTTTCGATGCCT CTTATGGATTTGTATTGTTATGAGCATTAGTCCCTGATACTATGTATTGT GCATACACATTTTAAGGTTCTGGTCGCTAGGTATCAATGAATGCTCCCCT AACTCTAGCTTAACAAAAAGAGGAGGCTGTCAACTCTGTACTACATGCAT AGAAGTTGGTCATCTTATAACTCCCTAAACTCAACCAGGGCACCGATCTG CATTCATTTACCTTTGATGATCACCTTACAACCAATTTATCTTTTTCATA ATTACATCCATCTACTTTATCTCTGTTCATGTTTAATGGTGGTTCTATAT CCTACATCCTGACTTCAGGTATGGCGCGTGAATGGAAATAAGAAGACTCT TCTTTCATCCACCGAACAATCAAAAATTTACACCGGAGATTGCTACATTT TCCAATACACATATACTGGAGAGGACAAGGAGGAATGTCTTATTGGAACT TGGTTTGGGAAAAAGAGTATCGAGGTACTAATCAACTCCAGCTATCAGTT TGAAATTGATATACATATAAATCACTATGTGATGGACATATAGCTGATAA ATCACTAATTGATATCTAATTCGAAGTTGTTAGTAACAGTATCTGTCTCT GTTAAATGTGAGTTTGTTCACTCGAATGATCTTAATTGCTTTCAGGAGGA GAGGGCATCAGCAATTTCACAGGCTAGCAAGATGGTCCAGGCCGCAAAAT TTCAGGCTACAATGGTAACCCATTGATTTTTCATATGTCTAATTAAATTC TCACTCTAATATTTTTCTTGCTTCTGCGCAGGCTCGCCTTTATGAAGGGA AAGAACCAATTCAGTTCTTTGTCATGTTTCAGAGTCTCCAAGTGTTTAAG GTTTGCTTCTGATAGGCTGGCACTGTTGGATAATTTGAGCTGAATGTAAC ATCTATTTTTTTCTCTGGATTTTCAATGTAGGGAGGCCTTAGCTCTGGGT ACAAGAGCTTCATTGCTGAAAGTGGTCTCGATGATGATAGTTACTCAGAA GCTGGGCTCGCGTTATTCCGGATCCAAGGTTCGGGATCAGAAAACATGCA AGCAATTCAAGTTGATGCAGTAAGTTCATAACCATATTTTGTTTGCAACT AAATTCATAACTTCATATCATCTGCTTCATCTGTACCATCCTTTCACTAG GTGGCTTCCTCATTAAATTCGTCATACTGTTACATTCTACATGATGGAAA CAGCGTGTTTACATGGATTGGGAACAATACGACCTCAGTGGATCATGACT TGGTTGAGAGACAGCTAGATGCAATCAAGGTGTGAATAATATAGGAAAAT GTTAAACATTTTTGTTTTTGCAAATTTCATGCTTGGTATATTGGTGTCAT GTAACCCTTGATTAACCTCCTACAAAGGTTTGCCATATGTCTGTAACAAA TGTAGTTTCTACATTTGAGCTTGTTATTCTATTGGCACAAGATGAACTCT TGTTCTCATTGCATACCAACATTTGATGTTTTAGCCCTCACCATTGTCAT CACCCTCATCAATATCATGGTTGACTGTTGCTATGATGTTCTCTAAAATA GCTTTGACTTTCCTATGGCTAATCTTGGGTTTATATTTTAATTTGTGCTC CATTTTTTGGTTATACAGTCAGAACTGCCATCCAGGTCACAAAAAGAGGG CAGAGAAACCGACAAATTCTGGGAATTACTGGGTGGTAAATCAAAGTACT CAAACAAAAAAATAGAAAGAGAGCAGGAAAGTGACCCTCATCTTTTCTCA TGTATCTTATCCAAAGGTAATCACTAACAAAGCGTTGTATGAAGTCCTAC TCAGAATAGCTTATAATCCAACATGTACTGACACTTTTGTTTTTTTCTAT GCTACCAATATTAATGTTGGCGATTCTAGATGGCAATTTGAAGGTAAGAA AAAACAAATATGTGAAGGCTTTATACCTGAGAATGCACGTCTAATGGCAG TTTATTCCAAATACTACTCGGACAGGTCAAAGAAATACATCACTTTACTC AGGATGATCTGGTGGCAGAGGACGTTTTCGTTCTAGATTGTCACTCGTAC TTGTTTGTTTGGTTTGGGCAAGAGGTTGATGCCAAAGTGAAAACACAAGC TATGGATATCGGAGAGGTAATAGCATCAAAATTATGTATAGTTTAATTAG AAATCACATATCCTATGTCGTCTCATACTTTCCTTTTCTCAATGCTACTG TACCAGAAATTTATTGCCAGCGATTTCCTTATGGAAAATCTCTCCCGAGA AACAACGATTTTCACTGTTTCAGAAGGAAGTGAGCCTTCGTTTTTTACTA GGTTCTTCACTAACTGGGACCCTGCAAAATCATTGGTATGTTTTTCTTGC TTTTTTGGTTAGGCATTGGTTGTTATTTTGGTATGTGGATTTCATGTGTT TGTTATAAAATTAATTACAGTTCCTAATCTTTGTGATTGCACTGGTACCT AATTAGCCCTTACATAGTTTTAGGACTAAAATGCACTGCACTCACTTTTG TTTTTTGCTGCAGATGCATGGCAGTTCATACCAAAGGAGGCTTTCCATTT TAAAAGGTGGGGCAAGACCGTTGCTTGATGTAAGTCTTAACCTAATCATC CTCCGTTATACCCAGGTTTTACGTCACATATGCTAGTGCATGTTGGAGTT TTTTTTGGTTTGAAATAAGGCGTAAAAAGTGGATTGCATAATTGGAACTG GTAGTACAATTTCATTCCTGGCCATGTCTGGTGGCACTAGTATGTCTCAA GTAGTGTGCAACTCGGTGTCAATTTTATCATACTGATAAATTGCTTAAAC AAACTACTATCTGTGTTGTCAGAAACCTAAAAGGCGAACACCAGCGGTTT CAGGAAGAGCTTTAGCACAGGATAAATCCCAGCGCTCAAGAAGCATGTCC ACCAGCCCGGAGTGTCACCGTCTCCGAGGAAGATCTCCAGCCTTCGCAGC ACTAACTTCCACCTTTGAGAAACCTAGTACCAGGAATCTTTCCACCCCTC CCCCTGCCATCAAAAAGCTTTTCCCTAAATCTACCGGACCTGAAACGTCG AAGCAGACTGCTATAAGTGAACTCACCAGTTCTTTGGAGGGTCCCTTGAG AAGTGCAATACCCAAGCACCTAAGAGGTATGTGCAACACAAGTGTTTGTA GATTGACAGTTGTGCTAGAACAGGGATGAACAAACGTTCTATTGTCTTGA AAAAATCTCAAATTTTTTCGATATTTCGCAAAATTAATCGCACCCATCTG ATGCAGACAAGGCAATACAAGAGGACGCGGGCGGTGAAGATGAGGCTGAA GATGACGAGGGGCGTACGATCTACCCATACGAACGCGTCACAACCACGTC AGAGGACCCTGCGCCCGACATCGACATCACCAAGAGAGAGGTGCGCTGAG CATAAGCAACCGTTTTTCCCAGCTTCTCATTCATTCAAACTGATGTCTGA CATTTACTGCCGAATGCAGATTTACCTATCGACTGCCGAGTTCAGAGAGA AGTTTAGCATGGCAAGGGCAGCGTTCTACAGGCTTCCCAAGTGGAAGCAG AACAAGCTGAAGACTGCGCTACAGCTCTTTTAGCCCGTCTGTGTCGAATG GCAATTGGCAACTAATTTTGGGGAGTGTTCTTTTCTAGGTTCTGCTTCTT CCAGTACGTAGATATCCGAGGAGCGTTTTTTTTATACAGGTTCACGTAGG TTCTGTTGTCTGGATCAGCGTTCCTGTATTTCTTTTCTTTTATATAAGCT TGGTCGCAGAGGAGGTGCACATGATTGAAAAGTGAGTTGTAGCCTGGTGT GATGGCACCGAAGCATATGTATTATAGAGCAAACTGCCGAACCAGTGCAA TAGCCATATTCGTTTATATCAATAAAGTTTGATAATGTTTTGCCG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.