Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA023083

[Submit comment/correction]

Sequence
AA023083
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023083
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCCGCCTCTCTCTCCTCCCCTCCCACCTTCTTTCCCCTCTCCGCCCC
CGCGCCCCGCTTCTTCCCCAACTCCTCAGTCACGCCCCGAGTGAAGCCCA
AGAGCAACACCAGGAAGCCTTCTCCCTTGTCCTGCACCGCCGCCACATCC
CCGTCCCCGTCCCCTTCACTCACCACCGCCGCTGCTGCGGCCAAGGCCGG
TTCTTGGAGGGACCTATGCAGCCTCAACGCCTGGGTAGTCCGCGACTACC
ACCGTCTCGTCGCCTCCGTCAACGCACTCGAGCCACCTCTTCGGAGGCTT
TCCGACGAACAGGTGGCGTGCCGTGCGGAAACCCCTACCAGATTCTTTGG
TTTCTTCATGTGGCGGATTGGTTAATGTGTCCTTGCAGCTGAAGGGTAAG
ACGGAAGAGTTCCGCGCACGCCTGGACCGCGGGGAGACGCTCGCCGACGT
CCAGGCTGGTTGGTACTCTTGCTGTCTCTGTTTAGTGTTGCATTGCAGCG
TTCGCTTCTGAGCTTCCCTCTGATGCATTGGCATGTGTTTGCTTCTTTCA
GAAGCGTTCTCTGTGGTTAGGGAGGCAGCAAGGAGGACACTCGGCATGCG
ACACTTCGATGTTCAGGTATACCAGCCTTGATTGCTTAGGGTGGGGATAT
AATGGAAGTTTGTTTGGGGCGATTGAGCTTCGTTTAAGTGATGTCTGTGT
GTCAGATTATTGGTGGTGCTGTCCTCCATGATGGGTGCATTGCTGAGATG
AAGACTGGCGAGGGGAAGACACTAGTGTCGACCTTGGCGGCTTACCTCAA
TGCACTGACCGGGGAGGGAGTTCATGGTACTGTATGCATTTAGATTAGTT
GCAGTTTGCTGATCAAACTTATCTGAATTTAGCAGACCATTGAATCTATT
GTGCATTGTGCATGGACAAGCGCAATGCACATGTTTGTTCTTAAAGCCAC
CATATTCTCGACTGTAGTTTGCAAAAATCATATCACGTAATATAAGCATG
GTAATTATAAGATATTTCTGTTACCCTGGATTATATGCTTCTCGTTTGTG
TTTAACTATCTGAACAAAGATGGTTATTCAAGGTCTTTTTATTGTTATTA
CAATATACATATCTGAATCGCTTTTCACATTTCCATTGTTAAGCTCTAGT
CAGCCATCGATGTCCTTGACCCCACTTCTTCACATTTATAACTTATAAGC
ACTGTGATCCTCTTTCAGTGGTGACTGTAAATGATTATTTGGCGCAGCGA
GATGCTGAATGGATGGGCCGTGTTCATCGCTTTCTTGGTCTAACTGTTGG
TCTAATTCAGGTATTTTTACACTGTTCTACATAGTTCTGTCGCTGCACTT
TCTCGACCCGCTTATAGTTCTGGCTTGGAAACACCTAGTTTTGGTGTTGT
TACAGTATTTTATAGAAATATATCATTGGAGGCAAACATATAACTTCCTT
CCACTCTTTCCCTGTGACATGCATAGGCGGGTATGAAGTCTGATGAGAGG
AGAGCCAACTATATGTGTGACATTACATACACCAACAACTCGGTAAGATG
CTTAGTAGAAGAACATTTTTTAATTAGTCTTATAGTGGCTATTCATCATA
GAGAATTTTTTGTTCTTGTAACTTGGTGTGATATATGCTTATATGTCAAG
TTGTCTTCGATTCTTTGATTAGATTCTACCTCGAGTATTACCATACTTGT
TAATGGACCCTCTACCTGTTTATATCTTTGTTATGTAGTATGCACTATGT
AGTACTTTATAGTGATAGATCCATGTATATAGGTTCTCAAAGACTGCTCC
ATAATCTGCAGGAGCTTGGATTTGATTATCTCCGTGACAACTTATCGCAT
AAGAAAGAACAGCTAGTTATGCGATGGTACATATATTCGAGTCTGTCCCC
TTTCACTTTTGCAGAACTGTGGTTTCTCTATATTTGTTAATTTTCTGTGT
AATACACGATTTGATAGGCCAAGACCATTCCATTTTTCTATTGTGGATGA
AGTCGACTCGGTGCTTATAGATGAAGGAAGAAATCCATTATTAATAAGTG
GAGAGGTTTTCATGGCTAATTCTTTTGCTAACCTCGTTCCTCCTATGTCA
TGAATTTCTTGGCTCGTTAAATGTTAGATATTCACCAGATCTTATCTTAT
ATTAGGATAATAGAGAAGCAGCACGGTATCCAGTTGCTGCTAAAGTTGCA
GACCTTCTCACGGAGGGTGCTGTGAGTATTTTCGTGTTGCTTGAAACTAA
AGTTACAAAGGATCATGGTTTCGCAACATTTCTCACTTAGGATGATTATA
TTGATTTATTTCTGCAGCATTATACTGTAGAACTGAAGGGCAATAATATA
GATCTAACAGAGGATGGAGTTACTTATGCTGAGATGATTCTTGGGACCAA
TGATCTGTGGGACGAGAATGATCCATGGGCAAGGTGCCATCACTGTTTTT
TGAGAGAATCACTGTTTATTTCTTGTGTAGCTTTTTCTGTAAGGTCCCAT
CGCTGTTTATCTTTTGTAGCCTTTTGTCTGATGTGGTTATTTTGTTGCAT
GCCACTATTGGCAGTCAACTAGTCAACCCAACTTTTAATATGCGGTTCTG
TTCAAGTGTTAAAATTGCCTATATCACAATTTTCCATGGTAGTCTCAGGT
TGTATAGAAGTCAGTTGGATGCTTGTAACTTGTGCACCTCATTTCTCTGT
CTTTGCTGTACATCCAAATGGCTGTTAAGAACTTAAGATATAGTGTTGAA
TAAGGCAACTGCTCGAGAGGTACGACTAACTTACTAGCAACTTGGACTTG
TGATATGACTGACCTTAAACTTGTCAAATGCTTCAGATTTGTGATGAATG
CATTGAAGGCCAAAGAGTTCTACCGCAGGGATGTACAGTACATTGTCAGG
AGTGGAAAGGCTCTCATAATTAATGAGGTACTATCTCAAATTCGTGTTTA
GTCAATCATTTATTTACCTGACTAAGGTATGTTTTTGCATCATTCTGATC
CTGCTGGGCTGCACTAACTCAATTTAGTAACCTGAGAAGAGTATCAATGT
TTTTAATCACCTTTATGAACTCTTGTCATGCTCTACCTCATACAATAGAT
ATTCTTGATCCTATAATTGACACCGTCTATTAGTCCATTATTACAATTGC
ATATTATCAACTTAGCATATTTGGGAAGCCTGTGTTCTGGAACTATATTG
TAATGTTTTCTCCAGCTTACTGGCCGAGTTGAAGCCAAAAGAAGGTGGTC
TGATGGTATTCATCAAGCAGTAGAAGCAAAAGAAGGCCTCAAAATCCAGG
TCATCATTAACTTACCTATTGCAAATTTATACTAATGCAACTATATATAA
GATTACTTTGATTAGTTTTGTGATTGTTTGTAGAAGTGTATGATAGTTTC
TTGTGTGCAATGCTAATTGCAATTCATCAGGCAGATTCAGTAATTGTGGC
TCAGATTACATATCAATCTCTGTTTAAGCTTTATCCTAAGCTTTCTGGGA
TGACAGGTACTGCTAAGACAGAGGTACATATCTACTTGGCCACTTCCTGG
ATAATTACTTCTCTTCATATTATATATGCTTAACTGATATGATCATACTG
GTTCTGCAGGAAAAGGAATTTCTGAAGATGTTTAAGATGCCAGTTATCGA
GGTGCCCACGAATCTGCCAAATATGCGGGTGGACCTGCCTATCCAAGCTT
TTGCGGTAAGGCTCTGAAAAGTGAGATCATACCCAATTTCTTCCCTTTTT
TATGATGAGAGAATGTTTGATGGCTACTTTTACTTTTTGTAGACTCTAAG
GGGTAAATGGCAATATGTCCGGGAAGAGGTAGAGTCTATGTTTCAATTGG
GCCGTCCTGTTTTGGTTGGAACTACCAGGTATATTTTCCTTGCAACCGAA
ATCTGGTCTGTACTATATCACATACTACCAGGCTTAATATAGAGCATATT
AGGTTCAAACATCTGGATACTTCTTTGTTGACTCACTTAGTTGCTGATGT
GGCCAATCAGGGTTCTGCACACTACAACATACTCCCCCATGTCAAGATAT
AGTGCATATTAGTTTTTTCCTAAGTCAAACTGTGTAAAGTTTGACCAAGT
TTATAGGAAAAAGTATCAACATCGACATTACCATATAAATGCAATATGAG
ATTATATTTCATGATAGATCTAATGATATTGATTTATATAGACATTGATA
TTTTTTCTATAAACTTGGTAAAAGTTTTGACTTGGGACAAAACTAATATG
CACCATATTTTGACATGGAGGGAGTACTTGTTTCAATAATTGTTCCAAGT
GCTGCGAGAATATTGTCATTTATTACGGTTCCTTTGGTTAGATGCTGAGA
GAATAGATAAGCTAAACTAACATTCATGATGGCGGAACTAAGAATCTAGA
GAGCAAATAATTTATTTACTCATAAGTTTGTTCCATGGGGATATTGGTTA
GATGGAATAAACTAGGAGTATAAATTGATGTTTGCTTTAGAGAAAAATTT
AAGCGAATGAGAAGAGCAGTCTCATTAGTCAATACAATGGTGAGAGGGAG
GAGGAATTTGTTTTAAGTAAAGTAGTAGATCCTACTGTGTATATTCCCAA
ATCGACAAGGGTAAACATGATATGGAATAACAAACTCCAAGATAGACACC
TAGTAGTTAGGTTGGTTACTTTTTCATAGATTCTTTTGTGAGGGTGATAA
TTTGTGTTTCTATGTTTGAGCGTTCACGTGTTTGTCTGTAATGTGTGTGG
TTGGGAAAGGGCCCTTAGGCTTGTTTGAGGTGTCCCTGGATACAAGTATG
CAATGATACGCTAGCCAGACCAGACCACAATGTGACATCTTGTTCCTCAC
TTCGCGACGACTTGTTTTTGAGCTGTGGTGATGGAAAACTGCCGTAAAGG
AGTGCCACACCCCCCATATCTAAGAGCGATTGCAATGTCGTGTGTGAGAT
TTGTGGGGGGCATCAACGGCAGTTGAGGCTGGAGGTAATTAACCATTAGC
ACAAACTATCAAGGAGGAAACTGGTGGTAGTGAGGGAAGAAAGTGTGAGG
CAGCAGCAGGTAGGGGCGACTGTCGATCCCCCACATGCCTTCAGCTGTGT
TCCACAATGCCACTGAATGCATAGTATCGTTGTCGACTTGGAAAAGGTGG
CGACGAAAAAACAATCCTCCTTTTATTTTATCGATGCAGTGGAGATGCCA
GTAGCATGTTGGCACTGTAAGCAGCGATGGTGGAACACAGTTTCCTACCG
AGTTGCTAGTGGGGCTGTCAGCAAAGTGGCATGATTTGCTTTTGTCACCT
TATGCTACCCCCATCTTTCCCATGCGCCCTACATGTCAAGCATTCTGCCT
GTCGTTTTGTCAGTCGGCCGTTATCTTGACACTGTTGGCCTTTATCAAGG
CTAGCAACTTTGGCAGCAGAAGCCATTGTGTAATTGCGTGCTTGGGTATA
GACCCTATGTAACACCCCAGCCACCCTGGGACCGGCGATCATTACCCTGA
CAGCTCTCTAGGATTTCTAGACTGGCCCCACAGACCAAGTAGATGAGCTT
CCGGAAAAGAAGATGAGCTTACGGAAAAGAAGATGCATCTTGTTAGTATG
AGTATTCTATCAATCTTATTAAGCCCCGCGCCAGGTGTCACGCCCTAGGC
CTGATCGAGGTGTCCCTGGACCAAGTAGGGTGGGTGCACCATAGGGACAG
AGAGAAGAAATGATCTTTTAACTCAGGAACTTCGGTTTATTTTTGCTTGC
TTAGTAATGATAATGACGGACTCCTTATGAAGTGGACACTTAACGATTAT
AGATATTACCAATCACAATAATAACCTACCTAAGTTATACTCTGTTTCAA
AATCTTGGTCCAATCCATGCTTTGTCCAAAAATTAAACCAATCGTAGGTT
ATGTTATATCAACTTGGTAACGTTGGATGCATATTCAAAAGCACTTGTGA
TTGTATTTATCAGCAATATATTGTGTATGGTCAAAGTAATCCGTCAGTCA
ACATATGCCATGCATTTTGCAACAGAGAGTATATAGGATACCAAACAATG
GATCTTTATCAAAGTAATCAAACTATTTAGGAAAATATATAACTTCGCTA
GGAAAAATAACTGTCCAAGTCCTCAGATGAGGGCCATTGCTATATAGTTA
CCCCGCCCCTTGGTACCGTTCATGTGCATGACCACTCCACGTTAAGAGTA
ATTTCTGCATGTGGTATTTTCGTGGCATTTGGAATTAACAGTGTCTATAC
CTCTTGCAGTGTTGAGAGTTCAGAATACTTGTCAGATCTTCTTAAATCTC
GTAATATACCTCATAATGTACTTAATGCGAGACCAAAGGTATGCAAACTC
CTGTAGCTTAACTTATTTTTCCATGTCTAGAGCTAACCAAATTGTTCTCG
GCAGTATGCTGCAAGAGAAGCTGATATAATTGCACAAGCTGGAAGGAAAA
ATGCTATTACAATTTCAACGAACATGGCAGGCAGAGGAACAGACATCATT
TTAGGTGGTAACCCTAAGGTTAGTTTATCTATATATTTAGTATCTTCTCT
TGGTATGCGAAAACAGAAAGCTAGCAGATACCATTCTCTTCAGGTCCTGA
TTAGTTCACTTTTTTGTTCTTGGTATAAGATGCTTGCAAAAGAAATTGTA
GAAGATAATATACTTCCTTTTCTGTCGCACGATACACCAGATGTCGAAAC
TGAAGGGGAGTCCACATCCCACAAGGTGATTCATTTTGCGATTTTTCTGT
CATCCTAAAACTTCACAGGTGTTTCTCACAGTGATCTTCAATTTTTTTGG
CAGGGTCTTTCAAAGATAAAACTTGGGCCATCGTCACTAGCCTTGCTTGC
CAAAGCTGCAATCATGGGTAAGTAAGAAGTATTGAAGTATCAGTGGATGC
ATGTTCTATTACCTGTAACAAGTTTTTTTATTTGTGTGGCTCATTCATCC
ATATATTCTTGTAGCAAAATATGTTCACAAAAGTGAGAGGAATGAATGGT
CTTTTCAGAAGGCGAAAACCACTATTACGGAGTCAATTGAAATGAGTAAT
ACGATTGGGATGGAGAAACTACAAGAACGCGTGGCTGAAGTGACTGAGAT
GTACCCTCTTTGTGATGCAATAGCACTTGCTTATGTCACTGTCTTTAGGG
ACTGTGAAATTCATTGTTTTGTCGAAGGTGGCGAGGTTAAGGCATTAGGT
GGGCTTCATGTAATAGGAACTTCTTTGCACGAGTCGCGCCGAATAGATAA
CCAAGTAAGACACTCTTGATTCTGCATGGTGTACTCTGTAAGGCATAATG
CTTGGCCTTTTTTATGGGATGTGATGTGATGTGAAACTATATAAGTTTTT
AGCTACCAGGACTGTCTTTCAGAAAAAAATTCAATAAGCTGCTTAGCCCA
GGCACATAAATGTAGAATCAACTGGCATTACATTACAAACAGAACATATC
ATTCAGATGTCTTATTCTTTTAATTACGTCATACTGTAAATAAATTTAGT
TGCCATATTATCTGTGTGCTGTTTTTATCTCTTTCATAGTTTGACTAGTC
TGTCAGAGTTCTTCAAAAGCAACACATACAAACTTTGTGCTGTTGATGTG
ATGAAATGTTTACAACCAGTGGCATAATATCCGTGAGTTGTTTTTTCCGC
AGTTACGTGGTAGAGCTGGCAGACAAGGTGATCCTGGGTCCACACGGTTT
ATGGTGAGGTATGTTTGTTCTTGAACAAAAATATTTCTGTTCTACTGAAA
TTGTGTACCATCTGATGTTCCTTTTACTTACTGAATCTAAGCATCTCTAA
TTTTGGTCAACCAGCTTACAAGATGAAATGTTCCGGAAGTTTAATTTGGA
CACAGAATGGGCCGTGAGACTTATATCAAGGATAACAAATGATGAAGACA
TAGCCATTGAGAGCAATGCTGTTGTAAAACAGGTCAGATTGCATTTGTTG
ACACGCCAAACGCTAACACTTGTCTCTTTGGGATCACAGTGTATTGTCTT
GTACTCTTGTTTACATACATTACTTTTCAAAATGTAGCTTCTAGGCCTTC
AAATCAATGCAGAGAAGTATTATTTTGGCATAAGGAAAAGCCTTGTTGAG
TTTGATGAAGTCTTGGAGGTATATTATTTCTCAGTATTTATTCTTCTATA
CTATTGTGGTGTTCCCTGACTGTTATACTAAATTCCACGTATTGGATTTT
ATCTTTTGTATGATAATTTTACTGTCACCACAGATTACCGTTTATTTTAA
TGCTAGACCATGATATTTGCATCTAAATGAAAAGGTTACTGTGTTCATTG
TTCTTCCTGCTTAGTGCTGCAGTTTAATTTTCAAATACATCAGGGTTTAG
GTATTTGAGCTGGTTATAATGCAATTTATCCTTTTTCTTGAACTCTCCTT
GTTCATTGAGTATCATTCATATTTGATAGGTCCAAAGAAAGCACATATAT
AGCCTCAGGCAGGTGATATTATCAGGTGACTCTGAAAGCTGCAGCGATCA
AATTTTTCAGTAAGTTTGGCATGCACTCCTTTATCTTGATTTGAAATATT
TAATAAAAAGTGTCAAATGAAAGGTAATGACTTCTAAGGTACCACATTCT
TTTGGATCAAATCTTAGAGTAGAAAAATACATTATTGCTTATCGTGTGTG
TGGGGTAACTCCTTGTCAGAAGCAGTTATTAAGTAGTCTGATAATATGTT
ATGTTCAATTAGGTTATGCTTCATTCATGATGTGATGATGTTGAGTTTTT
AAGCGAGTTCAGGATTTATTTATCATGTCTTATACTACTCTTTTTTGAAC
ATGCATTCATTGATGCTCGCTAATGCCTTCATGGGTCATAATTTTGTTGC
TTGCATGCTCATTTTTGTCTTAACCAAAATCACTTTTCCTTGTTTGTCCG
TCAGTTTTGAGTTTCCGAAATACCCCTTCCATTTGATGCTAAGATCCTGG
ACTAGTCTAGACTAGTCCTGCTGTTTGAGTCGATCGACTCAATTTTAGCC
GGATAAGTGAGGCGCTCAGGGAGAAAATTGAGAACCCTAGCTATTCTAGA
CTTGCTACATGAAGTTCTAGATTCTAGCATTATTATGTTATATATGTAAC
TTGTGTTGAACTTATCTCATTTTTAGTTATTAAATCTCCCATCTGGTTGC
CATACATGATAGTATTTTGTACTAGCTACTGCCGAAGTACATGTCGACTA
GTCGAGCAGTAGTCTCGACTAGTCTATGAGTCGGTACCCCAACGACTCGG
CTCGACTTATCGACTCGTAATCCTTGGTTCAGTGGTAACTTTATCATTGT
CACTTGTCAGCTATTCATTCTCTCTGTATTTTTAAGATTAGATCATTTGT
CTCTGAAAGTTGTTTTCCCAATTACATGCCTTTAGTTGAAATGATATTAG
GTACATGCAAGCTGTAGTCGATGAAGTTATTTTGGGAAACATTGATCCCC
AGAAGGTACTTTTGCTTGCCCTGATTCTTTTAGTTTTTTTGTAGAATGTT
TTTTTTTTGTGTGTGTGGTATGTCAGTTGTTCTAATTACATTTCATTTCA
GCCACCAGAGACATGGAATTTGGCAAAGCTCTTGGATGAGTTTGTGAGTT
TAGGCGGAAATTTACTGACCGGTAATAAGCCTAAATTTATAGTAAATTCA
TGTTCTTGTGCAGTTAATTCTGCTGACTTTGAGATGCTGTGCAGAGACAT
TCAAGGAGACCCAAGCGGAAGACTTACAATCATCACTAGAGCAAATACTT
AGATATGGATCTCTGGAGGTCGACAATTTTGCTCTCCCAAACATGCCAGT
GGCACCTAATTCATTCAGGGGAATTCGTAAGAAAACATCTTCAATAATGA
GATGGTTTGCCATTTGTGTTGATGATACATCAAAGTAGGTGAAATTGCAT
GTATGTTTTCCTTCGACATGGAGTTACACATTCATCTAAATGCATTTATT
GTTTCTCTATGCTCCATCTACTTGATGAAAAATCCAGGAAAGGGAGATAT
ACAAACACTGTAAATCTTCTTCGGAAATATTTTGGGGATTTTCTAATAGC
TACCTACCTGGAAGTGCTGCAAGAGTCCCGTTATCATGATGCCTACATTC
GGGGAATTGAGGTTTGCTTCTCTTATGAATATGTTTATGTGGTCTTGTCA
GGTGATAAAGCCCCACCAAGACCTATGTGTTGTGTGTGGAGGTCAAGGTC
ATATTCTTTCTTGGGTTCTTTGCAAGTCATGTTGCAATCTGCACTGCATT
TACTTGGTTTTCATTTCAAGCTCCGATACATTGTATCACGTGAAGTTGTA
TCACTTGACAAACTAGCATATGAATGATCTTGAGATTGTGCCCTCACGGG
AATTCATAACGGATGGTTATTTGGCATTACTTGACAAGTCATATGTTTGG
TCATGCCCATTTATTTATCTTTTTCTCAAGTCAAAGCATATTCATTGTGT
AACCGTGCGACTCTGTTGAATTGAAGAGGGAGGTACTCCTGAAGACACTT
GATACTTTGTGGAAGGACCATTTGGTTAACATGAACAAGCTTAGTTCTGC
GGTAATTCCTGTGTTTCCCCTTAGATGTGCCAGTTTTCTGCTCCAAAATT
GCCAGTTTTTTCTGCTCTTGAGTCTCAGATTCTCTAACTTTGTTTGCTAG
GTGAATGTTCGGAGCTTTGGGCATAGGAATCCTCTCGAGGAGTACAAGAT
TGATGGGTGCCGGTTCTTCATCTCAATGTTGAGTGCCACACGCCGATTGA
CGGTGCAAGCCCTACTCCATTACTGGTCGTCTCCAATGGAATCTGAAGAG
ATCTTCGACACTGCGGATCAATAGCCGAATAACACCCAGATACTTTTGAA
GCATGGCACCTGTAGTCAGAACATGCTTCTTGTCAAGGTCTAACACAAGC
TTGACTCGGGTGGCATTACACCTTTGGTATGGATGGCCTTCCCCTGGAGT
CTTAGATATATCTAGGTCCAGCCATTAACCATTTGTTTAGTACTAGTAGA
TTACTCCAGGAATATGTTAGTAGTATAGTAGATTACGGGTGTGTTTGGTT
GAGCTGTAGATTCCTGAAAATCAGCTGCGAGAAATCTGTTGCGAAAAAGC
TGATGTGAGCTGATAACTGTGGAAAAGCTGAAAGAAGTTGTTTGGTTGGA
ACAACTGTTGACTGTAAATTCAATAGAAACTGTTTATGACGCCGCTAGGG
CAGTCGAGATTATTTACATGCTAATTAATCATATAAAGACAAATTGTACA
TTATAGACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.