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GrainGenes Sequence Report: AA002235

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Sequence
AA002235
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002235
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTGGATAGCAGTGGTTCAAGTATGATGGAAGAAGATGACGAGTACTT
GGACAATGAGGCCGAGTCCTCTCACCACCATGGATCAGATTCCGAGTCCT
CTGACCACCATGGATCAGATTCTCACGTAGATGTGCACGTCCATCCTGAT
GATGCATCAGACGAAAATGTGAGTGGCCTTAATTTTATGTGGTGTACTAG
TAATTGCAATGAAGACAACAAAATAAAATTATGTTCATTTTCATTTGTGT
TGTGTAGATTGAGTTAGAAGTTGCTAATGAGGAGAACGATTCTGAGGTAT
TGGACAGTGAGTACGTGAATAAGGTATGTGCATTATTGTAGGTATATATG
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GAGTATGAGAGAGGCTATTAGTGGTCTAGTAATTAGACACACCAATTAGA
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AGCTCTAAACCGAAACGGCTCTAAACCGGAGGTAGAAGATAGGAACTTGT
GTGTGCTAGGAGGGGAGCCCTGCCCCTCCTTATATAGATGGGAGGGGCCG
GCGGCCAAGGGGAGGGGAGTCCCTCCCCAAGTCGGCTTGGTGGTGCGCCG
GCCAAGGGAGGAACCCTCCCCCAATTCGGCCTCCACCAATCCTCCTTCTC
CTCTTTCCGAAAACTGGCAGTTTGACTTTTCAAACTAGCCGTTTGACTTT
TCAAACTAGGATTTGAATTAACCCTTTATTTCGGACAGCGATGACACTTA
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TGAATCTTATTCTCTGGACTATTCCGGATCACCTCGTGATATCCCGGATC
CCATACGAGACTCCTAACAACATTAGGTCTCTTTCTCATAATACCATAAC
TACTCAAACAACGTCGAATCCTTAAGTGTGTCTCCCTACGGTTCGTGAAT
TATGCGGACATGATCGAGACACTTCTCCGAACAATAACCAATAGAGGAAT
CTGGAAATTCATATGGCTCCCACATATTTCTACGATTACTTTGCGATCAA
ATGAACCACTTACATACGATACCAATTTCCCTTTGTCTCACGATAGTTTA
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GTTACTGATAAGTACTCTTTTCTCGTTCCCGTGATATGTGATCCCTTGTG
AGCCAGTCACATGCTTGCAAGCTAATTGGATGACATTTCACCGAGAGGGC
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GTGATATGCATGATCTCATGGTCGAAGGAATTAGGTTACTATGTATCAGA
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GTTGTTAATAACATCTCTATGTTCATGATCAGGAAACCATGATCATATAT
TAACCAACAAGCTAGTTTAACAAGAGGCTTTACTAGGGACTCTTTTATGT
TTACAAATCACACAAGTATTAATGTTTCCTGTTAATACAATTATAGCATG
GTATGTAAACATTTATCATAAGTGTGAAGATATGATAATAACCACTTTAT
TATTGCCTCTTGGGCATATCTCCAACAGTCTCCCACTTGCACTAGAGTCA
ATAATCTAGTTTCAAACCTTTGTGTATTCAACACCTATGGCTTTCCGGTG
TTGTATGTACACGATTGCTAGTGGTCAACTGATCTCCGGATCTGACACTT
CCAGGTCCGTGTGTAATTGCATGTCTTTGCGTCTCTACGCATCACTCATT
CTCTAATGAGATGGCTTTGTATAAATTTGGTCTTTCGGTGTGACCTTTAG
TTCTTTGGGGTTAAAACATGTTGATAATATTGTCGCACAATATATCTTCA
TAGTATTATCCCTCTGTGAACTACACCTAGTTTGATAACAAACTACTTGA
CACAAATGCCCTCTTTTGCTGCTATAATAGCAGTCATATACTTAGCCTTT
TGTTGTAGTATCTGTCACAATGTCTTAACTTTGGAACTCATCCAAATCCA
TTATGGAACTCATTTTCCATTATATTGTGCCACCCTTAGTTTAGATTGAG
ATAAACTTAATTTGCACTTTGTGACAAAACTAGTATCAATGTAGTACTTC
TACAATGAACTAACCATCTATTTGTCACTTCTACAAATAATATACTCTTA
GTTCTTCCAAAAGATCATAAGAATATCCTTACTATTGTCCAATGATCATC
TTACGAATCATTCTGGTATATGCTCACAACATTTAGAGCATAGGACATAT
CTGGATTTGTACATATCACAGTATGATTGATATAAATACTCTTTGTGATT
TCATGCATCAAGTATCAATCTATACTTGATTATTTGTTTCACTTTACCAA
ATGTCAATACACTTGAATATATCATCAACATTGAACTTATTCAATCCTTT
CTGTGCGACAAGAACCTCTCTTGTAGTTTCTATATTGAACTCATTCAATA
TCTTGTCTATGTACTTCTGGCACAACCATATTAGCGTCTATTGATGCTAA
ATATTTGGGTTTTGCCTAAGTCTTTCATCGAGATGAAATTCTTATCTTGT
GTTAATAAAAAGATACATCACTTCCAATCAACAATATGTCTCCTACATGA
TGTATTAGAAATATGTCTTAGCGCTCCCACTTAATTTCTTGCAAATGCAA
GCATCTTCATTGTCTCTGATGAATTTAAACTCTTTTAACAATTTCATCAT
TGTGAAGATTCCAACTCCGCGATGCTCACTTCAACCATTGAAGTTTGCAT
ATGCTTTTAGCATCCTTTGATTTAACAAAACCCTATGGACCGTGTCATGC
ACATGTCCTAGGTAACAATTCTATTAGAAGAACTTGTTTTGTTTATTCAA
CTACCATACAACAAAATTATATGTAGTGGTTGCTACATTTATCCGTCTAG
ACTAAATATCGCTATGAAAGATCAAATCTTGTCATAGTCAACCCTTTGAA
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CATCCATGTCTATTTATTTACAGATCCAAACACAACCGTAAGGTCTTACA
CCTTTCTCGAGGGTCCTTCAAGTTCAAAACTTGATCTCTCGTGTATGGAA
CTATCACGGATTTTATGGCTTCAAGCCATTTTACGGAGTCAGGGCCCATC
ATCGCTTCTTTGCATGTAGTCAGTTCATTATTCTCAAATAATGATTCAAC
CCTCAAATCTTGGTATTTGATTGTTTACCCAACCTACTTGTTTCAATAGG
AACTTAGATCTCTGTGACCACAACCTTTGAGGCACGTGAGCCATGAGCAT
TTGTTGCTGCCTCCGGAACACTTTTCGGCGCTGCGCAACTTTGCACATAT
AGCTAAGGTTCTTTTAACCTTATCAAAGTTCTATTGTCCTCCCACTTAAC
TTTTCACGAAAAATTCCTTCTCAAAGAAACTTGACGTTCTAAGCGACAAA
CACTTTTGTCTCCGGTGTTATGGAGGAATACTTAACAAAGACAGGTTCAT
CCGACTTTGGTTGCAAACATCTTTCTTATGTATAGCATACCAATGTTTAA
GAAAGGACTACTTGGGTTTTATCCCAAACCATAACTTTATATGGTGTCAT
TTCAACGGATTACGATCAAGCTCTTTTCAGTGGGAAAAACGGTAGTCTCT
AAAGCTTTTAATCTTTAAAATATAATGGCAGTTTTATGAATTATACCTTT
TGATCTTACCATGTCAAACAAGGTTTAATTACATATCTCGAATGCTCCAT
ACTCTTATGGTGTTTCGGGAAATGCAAATCCACGGAACGATTCCTTAAAT
CTTAGGTATTATGCTAAACTCTGTAACTCAAATATCTTCCTTTATGATCT
TTATCATAAACTGTTTATATTCTTGTTACAATGATTTTGAACTTCATCTT
GAAAGTCTTTGAACTTTTCAAATGTTTCATACTTCATCCTTATTAAGTAA
ATATTCATATATTCACTCAAATTTTCGGAGAAAGCATATGAAGTTGAAAT
CCATCGCTTTTGACTACACATGATGGACTTTGTACAACAATATGTACAAT
TTCCAATAAGCTAGTCTTTCGTTCCCTTTTGGCCTATGAACGAAGTTTCA
ATTATCTCTAGGAAAGTTTCACAAGTGTCATTTGATCAAAAATCAAAAGA
CTCTAAAATTCCATCCATATGGAGTTTCTTCATGTTTTCTTTCCAATATA
ATTTAAACGGCGATGTCACTTCCTAAGTGATCTTTCAATCAATTTATCTT
TCGACATCTTTAGCACTAGTTTTATGGATGTGATGTTTCCAACGAGATTT
GCGAATCCATCTTTTATGGATTACGGCAATTATTTGAACAACCCTTTTGT
TCTCATAATACCTGATAAAACAAATCTTTGAAGACAAGCTTTGATGTTTA
ACGAGCAACATGATAACCCTTTATTTGTTCTCGATGAACATCATCACATA
TTCTTTTGCTAGTTACTTAGGCCATTGTAGTTCATGAATTGTGTTGTTTC
GTATGACGATTCACACCAACAAATTCAGTATCAAATACTTGAGAACCACA
TTGTTTAATAAGCAAAGAATATAGCCATAACATGTATATCATCTATATAC
TTAAGCTGAACAATTCTAGTCTTTTCCTTTCTGCCATATACTTATGAGAT
TTTCTTTAAATATTTCCTTTTCTGTTTGAAAGAATCTACCAACATCAATA
GTGGAGTCATACATATGACATATAGTCCAAAGCGTGTATAGTTAAATACC
AATGTCTTTGGATTTGCACTTTGAAGTAGATCACCATCATCAAATGTTTG
GTGTTCTTTCAAATTCCTTTCTTTAGTAATCTCTTGGTGTAGTAAACATT
TTACCTACATCAAATATTCACCCTTATCATGGAATCGTCCATGATCAAGC
TACTTTTAGCTTATAACGATGAATTATGAGTATAATGTTGCTATCCAAAA
ACCTTTTGGAGGATTAGGACAACAAGTGTTTCCACCCTTTTGCAAATTCT
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TAACCAAAACTTCGTTTCAGATATCGCAATATCTTCCACACATCATGGTT
TCTGAAACAACTCTTTCAGATCCTAGATAACCTTGATATTAAGACAATCC
TTTGAATATCAAGAATCATGGAGACAAACATGATACTTATATACTAACAT
TGGAATTGTTACTCTTGTTTTAATACCAATTATTAAACTTCATGGAGTAA
CCGGAACTTACTGAAAGTTTGCAATAGGACTTTTAAACTTTAGATTAACA
CTTCAAAACAATACGATACCAGTTCGTAAAGTAACTAACCAGAATTCTAT
AGTTCTATCATCTCAATTATAACTAAGCGCAAGGTGGTAAACGGATGCCA
ATGACTACAACAACTATGCAAATTCACTTTGATTAAATTGAGTTCTAATT
AATAATTAAATTAATCTAGGTGAACTCCCACTCAAAACAATATCCCTCAC
ATTTTTTAGTGATCACACGAACCAAATCCACCACATCAAAACCGATCATC
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CTCCTATATGACTCATGCTTTACCTTTCGGTGATCCGTGTTCCTGAGACC
ATGTCTGTACATGCTAGGCTCGTCAAGATCAAACCTTAGCTTCCGCATGA
GCAAATCTGGCTTGCCCACGTTGTATACACTTGCGGAATCTAACACACCC
GATCATCACGTGGTACTTCGAAACAACAAGTTTTAGCAACGGTGCTAACT
AAGGGTGAACACTTTATGACTTGAAATTCATGTGCATGAGGGATCATCAT
CTTATAATGCTACCGTCGTCTACTAAGCAATACAAGATGCATAAAGGATT
AACATCACATGCAATTCATAATATGTGATATGATATGGCCTTTCTTCTTT
GTGCTTCCGATCTCCATCTTCTAGCACGAACATGATCTCCATCATCACCG
GCATTGCATCAAGGTCAATGACGCTGCTCCATGGTTGTCGTCCACCGGCT
TCAACTATTACAACTATTTTGAATAGACACGCGGGTCTTAACAGAAATTA
AAGACAACCATATGGCTCCTGCCGGTTGCCGACTTACAATAAGGAACATT
GCATACATCATATATAATCACAATCATGGCCATATCACATCACTGCACAC
CCCTGCAAAACAAAGTTAGACGCCTCTACTTTCTTTGCATATTTTACGTG
GTTTGGGGCTTTCAATAAGTGTCGTTCTAACTTACGAACAAGAACCACAA
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GCTAGGAGAAACAGGCACCCGCAAAGCCACTTATGCAATACAAGTTGCAT
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GCCGCTTCATCCCAACATACCGCAAGATGCAAAGTACACAAGAAGCAATC
GACAATAAAAGCATCAACGCCCACAATGACCATTGTGTTCTACTCGTGCA
ACAGATCTACATATAGACACGACTCTGATACCACTGTAGGGGTTCGTAGC
ATGGAAAACAAAAATTTTCTATCGCATACAAACAAACAAGCCAAGATCTA
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TTCCGATCTCAAGATCGCGTAGACGATCCTTCCGGCGCCACGTTCCGGCA
GCGCTCCCGCAGTCGGTCACACGTTCGGTACTCGACGAAGACCTTCCTCT
CCCTTGTTCCAGCAGGCAGCGGAGGTTGTAGCACTCTCCTCGCGATTCCG
GCAGCACAACGGCGTGGTACCGGAAGTAGAGGGAGATCCCGCAGGGCTTC
GCCTTAAGCCGGTGCGAGTATGGTGGAGTATGAGAGAGGCTATTAGTGGT
CTAGTAATTAGACACACCAATTAGAAGGCTCTAAACCAATTAGAAGGCTC
TAAACCGAAGGCTAAAGCAATTAGAAGCTCTAAACCGAAACGGCTCTAAA
CCGGAGGTAGAAGATAGGAACTTGTGTGTGCTAGGAGGGGAGCCCTGCCC
CTCCTTATATAGATGGGAGGGGCCGGCGGCCAAGGGGAGGGGAGTCCCTC
CCCAAGTCGGCTTGGTGGTGCGCCGGCCAAGGGAGGAACCCTCCCCCAAT
TTGGCCTCCACCAATCCTCCTTCTCCTCTTTCCGAAAACTAGCAGTTTGA
CTTTTCAAACTAGCCGTTTGACTTTTCAAACTAGGATTTGAATTAACCCT
TTATTTCGGACAGCGATGACACTTAGTACATGATGCAATCATACCAACTT
TGATACAACACATTCATGTACCCCCCCCGGAGTGCCGGACATTCCGGAAC
CTTCTAGAACATTCCCGATGAAAACACCGGAATCATTTCCGAACTCCGAA
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TCATGATATCCCGGATCCCATCTGAGACTCAGAACAACATTAGGTCGCTT
TCTCATAATACCATAACTACTCAAACAACGTCGAATCCTTAAGTGTGTCT
CCCTACGGTTCGTGAATTATGCGGACATGATCGAGACACTTCTCCGAACA
ATAACCAATAGAGGAATCTGGAAATTCATATGGCTCCCACATATTTCTAC
GATTACTTTGCGATCGAATGAACGACTTACATACGATACCAATTTCCCTT
TGTCTCACGATAGTTTACTTATCCGAGGTTATGATCGTCGGTATCTCTGC
ATACCTAGTTCAACCTCGTTACTGATAAGTACTCTTTTCTCGTTCCCATG
ATATGTGATCCCTTGTGAGCCAGTCACATGCTTGCAAGCTAATTGGATGA
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GCATCCATCTGGCAAAGGTGATATGCATGATCTCATGGTCGAAGGAATTA
GGTTACTATGTATCAGAAAGCATATAGCAATTGAACTATTTAAAATGACT
TGATATTTATGCTACGCTTATCTATAGGAGTATGTCCATCACATCATTCT
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TAGGGACTCTTTTATGTTTACAAATCACACAAGTATTAATGTTTCCTGTT
AATACAATTATAGCATGGTATGTAAACATTTATCATAAGTGTGAAGATAT
GATAATAACCACTTTATTATTGCCTCTTGGGCATATCTCCAACAGGTATA
AGGAAAACAAAAAGGCATCGCATGATATACGTAAGAGGCAGTTCGTATGC
TCCAGGGAAGAGAAACGTAGTAGCAAATACTTGCCTTTGGAAGGCGGAAA
ATACAAGCCGAGAGCAGAATCTCGTTGTGGATGCACAGCGCAACTGGTCG
TGAAGCTAGATAAATCTAAAGGTGTTTGGTGTGTTGAGAAGTTTGATGAC
AAGCACAATCATATTTTAGCTAGACCTGATGAGGTGCCTTTTTTTTGGTC
TCATAGAAAGATCAAAGATTTCCAAAGAGCAGAGATATTAGCAATGGCAG
CTAGTGGGATTAGAAAGCATATGATCATGAGTTCTTTCATCAGCAAGTAC
GGTAGATACAATCAAGTTGGATTCACGAGGAAGGATTTGTATAACATGTG
TGCCAGAGAGAAAAGGAAGCTACTTTCAAGCGGCGATGCGGCCACGGCCA
TCGGCATTATGCAAAGCAGGAAGGAAAAGGACCCTGACTTTTTTTATGGT
CATCATCTTGACGATAAGGGACGTTTGAAATGTCTCTTCTGGTGTGATTC
TCAGTCACGTCAGGACTACCAATATTATGGTGACGTTTTGGTGTTTGACA
GCACCTACAAGATGAATCGATACGGTATGCCTTTTGTTCCGTTTGTCGGC
CTGAACAATCACCGGAAGACTACCGTATTCGGATGTTCCATCATATCAAA
CGAGACCGAGGATACTTATGCTTGGCTCCTGAAAACATTTTTGAAAGCAA
TGTGTCAGAAGAGGCCACGGTCTATAATCACGGATGCGGATGCTGCGATG
ATGAGAGCGATACGAAGTGTATTACCAGACGTGTGGCACCGTATTTGTAC
ATGGCACATTGAAAAGAACATGTGCAAGCACCTAAGTTCCAAATCATTGC
CAGAGTTTCGGTCTCTATTATATTACTCCACCACGAAGGCCAAGTTTGAG
GAAGGATGGCACGCATATGTGAGAAAATGGTAGACAGATAAGACAAAACC
GTGGGTAAATAGAATGTACAAGAAGAAGCACCTATGGGCGGCTGCTTACC
TCGCAGATGGATTTTGGCTAGGGATGAAAAGCAACCAGCGTAGTGAAAGT
CTCAACTCGTCCCTTCATCTTCACCTCGATTATGGGATGACGCTTGTGGA
TTTAATTGTGCACTATGAGAATGCCATTGTACGTATCCGGAAAACAGAGG
CGCGAGATGACTGCACGGCTTCACAGACTATGCCTGTGATTGTTACCAAA
TGGCAGCAAATTGAGTTAGCAATGGCCAGCACATTCGCCCCAGCTAATTT
TTATATCTTGCAGGATGATCTTCGTAAGATTGAAGGCATGACGACTGTAG
AAAAAAGTGTGGGAATAGAAGATTCTAAGGTATCTTGTGGCATGGTCAAA
TAACCGACGCCATAATTTTTCTGTGGACTATACACCAAACAATCCAGCAC
AAAGTATAGATTGCAATTGCCGGAGGATGGTACGTAGAGGAATTCCTTGC
AAGCATATTCTGTTTGTGTTGACGGAGCTGAAATTGGTTGAACTACCAAG
GTGTATTGTTCTTGCACGATTCTCAAAAAATGCCAAAAGTGGGTTACCTT
TGAGGCGCACGAGCGATCTGTTTGGCTGGGGATTTGCTGGGGCAGAGGAG
CGGAGTCGGTATTCCGAGCTCAGTGTGATGTCGTCTGAAGCATTACATGT
AGCCTGCAATAATCCTGAGTTGTACAAACAAATAAAGACCTTGTACCAGG
AAGTTATATCGAAAAAAGTGGCGTACGATGCAGGAGTACGTGGTCCAAGA
AATTCCACTAATACTGATGGAGGACCTTCTGCAAGTGCAACTACTCCAAT
AGGTGATCCTGCTAAAGTCAACACAAAAGGTGCTCCGAAGGGAAAGAATA
AAGGGAAGAGCAATGTTGTGAGTAAAAACGATAGACCACTCGGGTATGAT
GAGAAAAAGCGGTTAAAGTTGTTTTAGCGTTTGAAAAACGCCTGGACACA
ACAAAAATAGTGTGAAATGCAAACTCCATCACAGGTAACCATTATATTTA
ATTTTGGCATTAATTATTGTAATATAGTTATTTATGATTTTTGTGTTTGT
AATCTGCAGGTATCTTACAAAAATGTTAGTTCGACGTGAGCAGCAGTAAC
AAAGTATACTGACGAGAGGGAGCTCATCATCATGATTATCCAGAAGTGAA
AAAGATCATAAACAGTAGTTGAGATTTTTATCTTGTTTATGAGAACGTTG
TTTGGTTATCTTGATTGGTTGTAATGCTTGATTAGGGACATAATAGTGAC
ATGTGGGTATTATGTTTATTTATCTTTATTGGTTATCATGAAATTAAGCT
GGATTAATGTTGCAATCCGTTTTGAAGAAAACAATGGCTATGTATGAATG
GTTGTTGCTAAAGTTTCCAAAAAAAACAATGATGATAACTTGATGTGTAA
ATTTGTCGTGGCAGAAAAACTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.