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GrainGenes Sequence Report: AA001229

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Sequence
AA001229
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA001229
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATTCCCATCCGCCAAGAGGGCAAAGCAACTCTGCATATGGGATGTT
TCAAGGTTTCGACTTCTCGCCAAGGTTTCATGTCTAGGAGGCAGCGGGAT
GGGCTCATTTTGTTGTGGTGTCACGCGGCGTTACGTTTTCTTTGCAAGGA
AATAAAACTTACAATGCCATCTTCTACTTTATGGCCCAACAAGGCCCACC
AAGGAAACCCTAGTTTCTGAATATATTTAAACCGGCCATCGGGGTTCTCT
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TTACTCGATTAGTCGCTGCTTCGCGCGCTGCGTCGTGGCCGGATTCAGTT
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GTTGCCCCCGTGGCAAGGCGCCGCCAATGTTCAAGTACCCATTGTGTTAG
GGTAGTGTCTACCGCTATGAACCTATGAGCTCGTGCTGCTTGTACCAGCC
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CCATTGCAAAGAAGAAGAACGTTTCTTCTTTACCTCCAAACTTGATGAGC
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AATCCGAATCATTCCTTCTTCTTTAACTTAGGCACACACCAAATAAACCT
TGCAGGCCTAACAAAGAATGCATGATACTTTGTTTCTAAGGACACTCCAG
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TCAGGGACTATCACAAAAGCTAATGTTCGATGCTATCTACAACCCATTCC
CTTGTTCAATAAATACAAGTCGCTATGTAAGTCGATAAAAGACACACACA
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CAGCTGTCAGGCCCATCATAACACACATATCCCGTCAGTCACTGTTTCAT
GGGTACAAGTGAATACAAAATGAAGAATACAAATAACTGAAAGATGACAA
TCTTGTACCACCCAGCTAGAGAAACACCAGGATGATGATGGTGAAACTGT
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CTGCGACGTCAACAACTGAAGGGAAGGGTAGCACCTGGATCCAGCTATGG
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TAGCGTCCGAATTGATGGACACCACATTCACAGGTGCTAACTCAACTACA
GGTGCGAATAACTTTTCTTGGCTTTTATCTCTAGATGCTAGATGCTTCTT
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TAAATGCGGAGTCAAATGTTGTGCCACAAATGCAACAGCAACAGAAGTCA
TTTGACAATAATCAAGGTTGTTATCCAATGCAACACCTTGGTGGCCTTGC
TGTTTCTACAGTACATCCAAACACGTTGGATAAGTCCTCCTCTTATGGTT
CGTCAGATGCAAAAATGAATGGTGGAATGGGCATGAACAGGTCGAATATG
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CGCCACTGAAGACACCAAGTACGTCTGCTTTCCTTTTATAGATGAAAACC
CTCTACTATACCATTCTTTTTGATGATTTGCGCTTCGATACATAGGAAAC
TAATCGGTACTGACCATACTGAAACTTCGTTGCTTCAAGTTCTGCAAAAG
GAATATGGCCTTCGAATCTAATTCTTGATTTATCCATCTCGATTACATGA
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TTTATAGGGAGCAGAAGTAAATTATATGTTTCCTTTTGTTCAATTTAAAT
AGAAGACACGCTACATGTTGTACAAGAAGATATATCCTTGTCACCATAAT
TTTGGTGGCGTTAAATCTAAGAATGCAAGCACAGCTTTATTGTAGCAAAC
CTTGCTTTTACATGTTACTACCTTGTTCTTACATGGTATTTTAGGACATA
GTGTTCAAGTGTCGTCGAGTCGTCGAGTCAGTGGCATGCAAAGTACTCCC
TCCGTCTAGAAATAACTGACTTGGGTTCGTCTAGATTCAAATGTATCTAT
ACCTAAAATGCGTCTAGATACATTTGAATCTAGACAAAACCAAGTCAATT
ATTTCTAGACGGAGGGTTTGGCTTTCTAAAACGTTGACCAACGGGGGAAG
GATCCCTCCCTTGGCTATACGTTGTTAGATAGATGAGACCTCTCCAGCTG
TGGATTAATACACTTTAGATAATACCCTGTTTAATTCGGTCGCACCTGTG
ACTCAAACCCGGGTGGGCGAGCTCACCACTGTGAGGTCAAGCCACCAGAT
AATCCATCCTCTGTATAAGGATTAGTGTTGAAGCATGCAAATGCAAAGTA
ATAGTGAATGAAGGCTCTTCTCTTAGTAAAAGTCATTTTTTGTCCTCCCT
TTGTTCTGTAGAGATTTATGTCCTCACAAAGTATATTTCTTCTGCCAATA
GTATAAGTATCATAATTAATAATACTTGTGATATTTGTATTTTTGAAATT
ACCCATATAGCAAAGTTATACTTATTTTGACGAATTATATTGATAATACA
TTCAAATAACATATTGTTGTATACTAGAAATAAATAAATCATTGTCAATG
AATGTCTTAAATTGTTATGATCTTACTCTGATTATAATAGTTGATGGTAA
ATTTAGTCTTGTCTATATTTGTAGGTGTGTAAAATTTAAGAGACTTGTAA
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TACTAATCGTTTGAGGCGGTATTGCTTATTTTGATAATATACTTCATATG
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TTATGTTGGATCTGATTTATTCGAATAGCAAAGTAATAGTTGCTAGAGGC
GTTTGGCACTGCAAAACTTTTCTTCTACAGCATATGGCTGTTTCTAGAAT
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TTGGGTGTGCGGTGACTTCAGTTGACTCTAAGTTGTCAAATCACCCAACA
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GCGGTGGTTACTGATGTTAAACCATGCAGAATGCTGTGAAGCTCCTACAG
GAAGTTGTAAATCTCAGTATTGTGTTCGTGTACAGGAGATTGTGAAGCAT
CTTAGACGCTGTCAAACAGAAAATTGTTCATATCGGTACTGCATGCAGTC
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TTTGCAGCAAGGTAAAGACAAGATTGCAGCGCTCTTCTGAACAGGCACAC
AAGAACAGTCCGGATGACCATAGATTAATTACTAAGCGCAGTATGGTTCA
AAGAATTACGAAGGATGCACTTGATGATAAAATGGATATCGACCTTGTCA
TAGATGAAACCAGAGATGAGCAACCATTGGCACCGAAACGTTTAAAGTTG
CATCATGTGTCTTCCAATGCATCAAAGAATGGAAATGGAATCCCTCCCGT
CTCTGCTCAAGAACCAAAACCAGTGTTGCAGGAGCAAAAAAACAACATGC
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TAACATGATTCCTCATGTTAAGGAAGAAAATGTATTGGCTGACAAAGATA
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GTTACAGTGTCTAAATCAGGGAAACCAAAGATAAAAGGTGTTTCACTCTT
GGAATTGTTCACTCCAGAACAAATTAAAGAGCACACCGACAGTCTAAAGT
TATGGGTTGGTCAGGTATGCTTCTTGAACTTGAAAAAAATCTACAGTATT
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GAGTGGCAAATGAATTAAGAAAACCCAAATGGATATGGTCAAATTTCTTC
TCCATTGTTTTCCTATGTTAAATATGTTAACATTTTGAAGTAACTCTCTT
ATTGGTTAATTGTGTATCTAGCAAAATGTTACTCCCTTCGACCCATATTA
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GGGAGTACAAAAATTTAGATTAATTCTGTATATAGACCTTTGCGTTTTAT
TGCATTGAAAAGATAGAGTTAGTGTTCACAATCCTCCCAAGAGGCAACTC
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ATCAGAATTCCAAAGGCTAAGAAAGGCGACTATGTCTTCGAATTATTATC
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TTTTGGATGGGGCAGTTTCAAAAAAAAAATGTAGAAAACATTATTAAATG
TGAATACATGAACTTGTCGATTTTGAGTGGGATTTCCCACTGCTCAGTGA
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TGCACGCATATGAAATATCAAAAAAAAGGAAAGACAAAGTACCAATGTCC
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GTATGCATTTACTTTGGGCAAATTGCAAGTTTGTTAGAATTTCTTCTTCT
TGTAAGCATGACATGTTTTATAAACATGATTCAATATCCTTTTACTTCAT
AATTTCAGCTCAGTAAACATATGGATCAATAGTTTCAGTGGTTAATAATG
TTGATATTTTTTTGTTCTGCAGTAACCAGCTGATTTCTGCTGCTTTCTGT
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CGATATATTGTTCTCCCTGTGGTGCTCGGATAAAACGAAATGCACCATAC
TACACTGCTCCTTCAACTGAGACCTGTCACAATTTTTGTCATTTCTGTTA
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AGCATTTAAATTTTCCTTTTGGTAGTCCGTGAATTATATTTACACTCTTT
TCTTGCATACTAACTTATTCTAATTGATTGGCCCTACAGTGGGTTATGTG
TGACAAATGTGAACGCTGGCAGCATCAGATTTGTGCCCTTTTCAATGCCA
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TGGGAGATAGAGCATGGTTTGCGTGTGCCTTTGCCGCAAAGTGCTGTTCT
TGGCGCTAAGGATCTGCCAAAGACTGTGCTTAGCGATCATATAGAAGGAC
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GGGAAAAGCTTTGACGAGGTTAGTGCTAGTTCGGAACTCACCAACGTAAA
TTATACTTGAGTTGTGCGTATGTGTGCACCCTTGTTTATCTAGCTGATCT
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TGTCTGCTAATAAAGGAGTCAGAAAAGTAAGTTTGCATAGCAACCATGAC
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TACAGTATATACCACTATTATATTCACCAATCTATCCACCTTTCCCAGTT
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ACTTGTTAGGTTTCTGGAGCAGACGGACTTGTGGTCAGAGTTGTTTCATC
GGTGGACAAAAAGTTGGAAGTTAAACCACGGTTTTATGAGATTTTTAAAG
AAGACAAGTATCCAGCAGAATTCCCTTACAAATCCAAGGTAAGAGAACAC
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CAATTCAAGTTACTGTTTTTCTGAGATGAAAGCTTTGTTAAGTCATCCTC
TGTAATATTGCCAAATATTCGGCAGGCTATTCTCTTATTTCAGAAAATAG
AAGGTGTTGAAGTATGCCTATTTGGCATGTATGTTCAAGAATATGGTGCA
GATTGTGCAGACCCAAACCAACGTCGGGTTTATCTGTCATACCTTGATTC
TGTCAAATTCTTTAGACCTGAAGTAAAAACAGTGTCTGGGGAGGCCTTGA
GGACATATGTCTATCATGAAATTCTGGTAATTCACCACACCTAGTGAGAC
TTTTCGTAATTTTTAGAAAGTCTAGTATGCAAGCAAGGTTACTGGTTTCC
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GCTGTCAGTGTAATATTTGTTATACGCATGCAGATAGGTTATCTTGAGTA
TTGTAAGCAGCGCGGATTCACTAGCTGTTACATATGGGCTTGCCCACCTT
TGAAGGGTGAAGATTACATTCTATATTGCCATCCAGAGATTCAGAAGACA
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CTTCGAAAAGCTACCAAGGAGCGTATTGTTGTTGAGACGACAAATCTCTA
TGATCACTTTTTTGTCACTACTAAAGAATGCAAGGCTAAAGTTACGGCAG
CTCGCTTGCCATATTTCGATGGAGATTATTGGCCAGGAACTGCAGAAGAT
ATGATCAACCAATTTTTCGTAGAAGAAGGTGATAGAAAGTTGCAGAAGAA
GGGGAAAGTAAAGAAGACTATCACAAAGAGAGCTCTTAGAGCTGCTGGCC
AGACTGATCTATGTGGGAATGCTTCAAAGGATGCTATGTTGATGCAAAAG
GTTTAGTTTCATATAGTGATCTACTTTTCTATGTCCCAAATTTGTATCAG
TTGTGTCACATGTTATTCTTAGTCTCCAAGTTGATGATGTGCAGCTCGGA
GAAACCATTTACCCAATGAAGGAAGATTTCATCATGGTCCATTTGCAGCA
TTCTTGCAGTCACTGCTCTACTCTTATGGTAGCTGGAAAACGCTGGGTCT
GCCACCAATGCAAAAGTTTTTATATTTGTGACAGGTAAGTGACTTCTATT
CATCTCATGTGTTAGTTTCCTGTGATAGACCCAATATATGATACATCTGT
TTGAGAGATGTGCATGACTATGGACGAGTGTTTCTATACATGCCGCAACT
TGAGAGCATCAGCAACTACGCCACAATGAACGAGTGTTTCTTTTCAGAAA
AGACAATAATATCTTTGTGATGATATGAAAGTAAATGTGATCCTGGTGAC
ATGGAACTATTGTTCCATAGTCTTTACACAACTTCATAAGTGGATGAACT
GCTCTAAGATCTTACAGCTAGTCTAATACTAGATGTTAATCTGTTACCCT
TGCTTCTGCAACATGATGAGTTTCTTGCTGCAGTTGTTATGATGCGGAGC
GACAGCTTGAAGGAAAGGAGAGGCACCCGAGTAATAGTAGAGACTCACAT
GTGCTCCACCCAGTAAGTTCTGGATAACTTCTCATAATCTAGTTTTTAAC
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ATTTTATTTCTTAGGTCGACATTGTTGGGGTGCCCGAAGATACAAAGGAT
AGTGACGATATCATAGAGTGTGAGTTTTTCGACACCCGACAGGCATTCCT
CAGTCTTTGTCAAGGAAATCGCTATCAACATGACACACTTCGCCGCGCAA
AGCATTCCTCAATGATGATGTTATACCACCTTCATAATCCAACTGCACCG
GCTTTTGTTATCTCGTGTAATATCTGCAAACTCGATATTGAAACTGGTCA
AGGGTGGCGATGTGAAGAATGTACAGACTTTGATGTATGCGGTGCATGTT
ACGAAAAAGACGGAGGTGCCAATCACCGTCACAAGTTAACAAACCATCCA
TCATCTGCAGACCGTAACGCTCAAAGTACAGAAGCTCGCCAGATGCGTGT
TCAGCAGGTGATTTATACTCTGAACCATAAATGTCAGAAAACGTATTCCA
ACGTATACATTATTTTATGCTGCTGTTTTAGTTTGTTGAGTGAACACTCG
ATGCCTCTTTACTTGCGCACTGTTAAGTCTAATGCCAATACTTGTCCACT
TATTTTGTTGAAAACCATATCTGTCCACTTATTGTTGTGTATACCATATA
TTATCCTTTCTGCATAACTGAAGGTGCAGAGGTTGTGGTTTATACTTTAG
TCTCTGAGATAGGTTATATCTAAGAACTTTGTGCTATCTGCTTTCTAGAT
TAGCCCATGAAAGGAATGAGTCTTAAACTAACTGATGATGTTTCTTTCGT
GGCTGTGCAGGCACGGGAAATGCTTGCCCTTTTGGTCCATGCGCAGGCAT
GCCGTGACGCTACTTGCGAGCATGGTAATTGCCGAAGAATCAAGGGAGTC
TTCGGCCACGCGAGAAAGTGCACAAAACGGGCATCCGGAGGCTGCAAAGT
GTGTCTGAAGATGTGGGCTCTGCTTCACTTCCATGCCCGCGCTTGCAAAG
AATCACAATGCACCGTACCAAGATGCAGGTTACAGCACCCCCCCCCCCCC
TTCCGCGCCGCCCACATCGTTAAGAACACGAATAGATAATTTATCGGGTT
TGCTTGATGATTGCAGGGATCTGAAAGACATCATAAGGAGATCGCAGCAG
CAGGCCGAAACCAGGAGGAGGGCTGCCGTGAACGAGATGATGAGGGAAAG
AGCCGCACAAGCTGCTAGGCCTAGGAGGTAGTGTATTGAGGCAGGCAATA
CTGGTATACTTTTACAAGAAAAAGATAGCAAGTACATATGTACACCGCAG
CTCTTCTCGAGCCCGCCCCCAAAAGACAAAGTTCTGGATGGGCAAGATGA
GAGGATAGATACAGCTCAGCGGAAGATCATCAGTTGTTATACTGGAGGCG
GAGATATCTTGGTCAAAGTCGCTTGATTGATGATCCGATGATTTTGCCGA
GGACTTATACTGTATTGTTAGTGTTGCTGTTGTTATGTAGCCTTGCTCAT
GTACAATAGGGTTTTGGACGGCTTGCCTCCTATACAATGCGCGGAATTGC
CCGCGCATAGTTGTCTGTCATGAGAGGGAAAAAAGAGTCATAGTTGGTGT
TTTTTTTTGGTCTTAGCCTGTGAGGGCTGTAGGAAAGAAACGGAACATCT
GGATATGATGGTTACATGGATGATGATATCAGTCATTTCATTTGTTCTTT
CCAGTCCCCACATTTTTGCAGTGTCTGTGTGGGACGGATGTGAATTTATA
CAAAGATATATACCAGAGCATGACTGACTTGGGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.