Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA020072

[Submit comment/correction]

Sequence	AA020072
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA020072
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCGCAGCTTCCAGTTCCACCGCCCGCCTTCATCTCCTTGCCACTTCTCT CAACTTCCACCGCCCGGCATGACCAAATTCCGTATACAAGCGACTCGCCA GGTTCCAACCTTCCGTCAAGTCCGTCACTGCGCCACTTTCGGTCCAAATC GGCCTAACTCAAGCCACCGCGACTCACTCCTCCCTCATCATCTATTGCTG CCGATCGAGATTCTCGCCGACACCACCACCGCCCCTGAAAGTTCCTACCG TACGCATCCTCTCTACCAGCCGCGGCAAGCGCCCGCCCAGCTCACCACTT TCTTGCTCACGTTTCCGCCCCCTGACTTCTGCAGTCGGGCCATCCTTGGT TGTGTCTGGCTTTGGTTCTACCGTTGCTGCTGTAGTGAAATTTCTGCTTT TAGCCTCTCCGTGAGTGGGTTGCCGGTGCTACCACGCGTTGAGCACATCA TCCTTGACCCAACACACTCCCAGTTTGAAGAGGTAATGTGCTACTTCAGA GAAGAGTAAGTTACAGGCTATTGTACCCACCAAGTGTTTGTGTTTATGTG CACAAAGCCTCTTGATGTTTTTTTGGTCTATTCTAATTTCTAATGGACCG CTGTACACATGTTATGACTATTTTAAAAATCAAAATGGTTATTTCTATCT TCCAAGTGAACCATCTTCATGTGGACAGTTGAATATCCACTATAAAAATG ACAAGTATAAGTTGATAATGACATTGACATATAATGGATTTATGGATTTT TTTTGTTGAATCTTTAGAGAGGACTTAAGCTTCGTGTGTTTGTACAGCCA CGTGTTTGTAAAATATGATATCTATTATGCTGCGTTTTCTAAGTATGTAA ATCATATAATACAGTGCCTTAGTGGAATCATGTACGGACAATTATCTAGG AAGGAAAAGAGGGGGAACTCAGATAATCATAAAATAAGATCCACCAAAAT ACAACGACGGACCCCGTTTCAAGATATCACAAATGCGTCTGACTCACGGA TATCATCAAATGGAAAGCAAGGTATCTCTTTAATATTTACAATCACCTAA TTCGAAATAAGATTGTTCACTGCGAACTTGGGTATCATTAACAAATCTTT TTTGTTTGTAGATCTTCTGATTAATGGGACTAAACAGAGAATGTATCCAT CTGGTGCATCCGTCCAATCAAGTACTCCTTCAGTTGGACATAAAGGTGTT ATACCAACAGATGCTTCTGAGCATATTATCGTGATCGGGAAAGATATACG AGGATGACTCAAGAACAACGTGATGCCTACCTTCAAAGGAATCGAGAATA CAAACGGAGAAGGAAAAATCGTGCTCCAGGTAGTTGTGGTGTGCAACCTG AAGTAAGCCAAGCTAATACAATTATTGATGGCTACATGCATAGAACAAAC CTTGCCAGCAGAAGCACCGAAGGTACATATCAGTTCAATTCAAGATGTTA TCTTATTTATTAACTTGAAATATATATAATTAAAAAATAACAAGATGCCA GTAGCAATGTATTTATTTTAAAGACATGCCCTCAGATAATATATATGTTT AGATTCCAGATAGCAACGTGGGTGATTATCAGTATCTTCTATTCTGATAT TTTTTCATCTGAATGCAGTTGGTATGGTTAGAAGTTTAAGTGTGTCCCCA TCTGTTAACATCCTTGAGGATGACGTGATCGGTCCAATTATTGGAAGTCA GATCGTGACCAATCCATCTGACATATCTAGATCATGTAATAAATCATCAA GTACTGCTCAAAATAAGAGAAAATCTACGTTTTAAGATAGGTGCAGCGAA TGCAAGAAAAGAAAATTATCTACCGGAGCAGGTTGTAATACTACCGTAGA GGAAACACGTGACTATGTTTGTGCATCAAAAAATATCGGACGATGTAAGA GGACAAACACATACATGGACATGATGAGCAAGTTCTTATCTAATGTGGCG TCTTGCAGTTCCGTGAAAAAGGACAGCGCTAACTTACTTGACTTTGACAG ATATGTTCCTCTACAAGTACCAGACTATGCTACCGTCAAAGAGCATGAAA GCCATGAAAGCACCATCTATGTGCCAAAAGGTCTTTTTCCTATTGAAGGT AATGAAGTTTTTAAGGTGTAAACCATCTATTTCTGTATGTACATGAAGTA CTGCATTGTATCGATCTACTTTTTTTCTCCTCTGCGTCTTTTTACTAACA CAGAAAATGATTCGTAGATGATTCTGAGCAAGCTGACGGTTTGATCGAGG ATAATTATGAAGACGATGAGAGTTGCATATTTAGTGGGCGAGGTAAACAT TAATATTTGTTCTCCATATAAGAAGAATGCAAAATACTATCATCATTCTG ACGTAGTTATTTCTTACTTTTTGATAACAATTGTCAGGTTGTGATTATTT ATCATATCGAGATATAAACCATGTAGTTTGTGAAAAACAAGTTGATCCAG GCGATCATATATATCGGAATATACCAAGTTCACATCATGTTTTGGAGCCA GTACCTAATTGTGCATATTGCAGTGCAAAACGGTTCTAGTACGAGAAACC AACATTCTGTTGTATGGGTGTCAAGATCAAATTAGTAACTCCACATGTTC CTGATGAAGTGCACAGACTATACACAAGTCAAGATCCTGATGCGAAGTAC TTTCAGGACAATATACGGTACTTCAATTCGCACTTCTCTTTTACCTCTCT TGGTGTTATCTTGGACCAATGATATTGTAGTAAGAGGTCCGGAGTTTATA CTTTCCGTGCCCAAGGTCAAATTTATCACCGAATTGACCAACTGGTTCCG GTAGAAGGTAGTCCCAAACATCTACAGTTATATTTTTATGACACAGATGC GGATTTTCAACATAGATTTCGTCATTCTCCTAACCTTGACAGAGTTCTCA TCGAGAAATGGGCGCGCATACTTGAATCTAACCCTTACGCCCAAATATTT CGAAGTCTTGGTTCAGTATCAAACCTTGATGAGTATCAAATTGAGCTCAA CACAGATATTTCACTAGATCAACGAGTATATAATGCACCTGTTGCATCAC AAGTAGCGGCAATCTGGGTAGAAGGAAATAATCCTCATGGTCACTTTGAT AGGAGTATAATGGTATGTGGTAAATCAGATGATCCACAATACATAAAGGC ATACCATGGTTGTTATGACCCACTATCGTACCCACTTCTTTTTCCAAGAG GGGAAGTTGGCTGGAACTTGAACATACCAAAAGCGAGAGCAAATGCTGCT GTTAATATTAGTATTAGAAATCAAGAAGATGAGCTCGATGAAGAAGGTAG GTTGTACCATATAATCATGTAATAGTCACTTATATTATATTTTTAAAATT TATTTGTCTAAATAAAACATTTTTTCGTTGTATAGGGCTAGAGTATAACT CTGGTTCCTCTGTTTCACCAAGGGAATATTATTGTTTTAAACTACAAGTT CGAGCTAGAGAATTTAATGTCTTACTTTTTGGAAAACGACTAACTCGACA GTACATTGTTGATATGTACATTAAGATTGAATCAATAAGATTGGCATTCT ACTTAAAGCCAGCAAACCAGAATCTTATACGAGAAGATTTGTATCAAGGA CTGGTCGATAGTGTTGTTGCTGGTGAGACACGTGCATGTATGATTGGGAA GCGCATAGTGCTCCCTCCTTCTTTCATTGGTGGTCCACGTGATATGCGTA GAAGATATCTGAATGCCATGACTTTGGTACAACGGTTTGGGAAGCCAGAT TTGTTTCTTACCATGACATGCAATCCAAGATGGGAAGAGATAATAAAAGA GCTCGCACCAGGCCAATCATCACAAGATCGGCCAGACTTGGTTGCACGAG TCTTCAAAGCAAAATTAGAAGATCTTAAGAATCTTATATTTAAAAAGAAT TTCTTTGGTGAAGTTGCTGCTCACGTCCATGTGATTGAATTTCAAAAAAG AGGACTACCTCATGCACATTTCTTAATAATTCTGAAGTCAAATTACAAAA TAAATAACCCAGATCAGTATGACCAAATTATATCAGCTGAAATTCCTGAC AAAGATAGGTATCCTGTGCTGCATGATTTGGTTATTAAACACATGATGCA TGGACCACGTGGTGTTCTCAATGCTAGAAATCCCTGCATGCAAAATGGAG AATGTAAATACCATTATCCCCGGGAGTTCTCAGAAACCACATTGCAAGGA AAAGACTCATATCCAATTTATAGACGTCAGCATGATGGTCGTCAAGTGCG CATCAGAGGATCTGTTCTGGATAATAGATGGGTTGTGCCATACAATCCAT ACCTACTTATGAGATATAATTGTCATATTAATATTGAAGTTTGCTCTAGC ATCAAGGCTGTTAAATATCTATTTAAGTATATCTATAAAGGCCATGACCG TGCCTCTTTTATTGTAGAAGCCGCAGGAGATAGAATTATTGATGAAATTC GGGAGTATAGAGATGCCAGGTTTATATCACCCCCAGAAGCATAATGGAGG ATTTATTCTTTCAATCTCAGTGAGATGTATCCTCCTGTTCTACAATTACA GGTACATTTTACAAATATGCATACTGTGCGCTATAAAGATTCAGAAAGTT TGGACAATGTTATTAATAAAGAATCATCTTCAAAGACAATGCTTACAGAG TACTTCAGAATGAACTCTATTGATAGTTATGCTAAAAATTTCACATATAA AGAGTTTCCTGAATTTTATATATGGCAAAAGAACAAGACGTGGAAACAGC GGTCGAAAAGAATTCAAATAGGTAGACTTGTGGCTGCTCACCCTGCAGAA GGGGAGCGCTACTACTTGAGAATATTGCTAAACCACGTGAGAGGGGCTAC ATCTTTTCATGATTTACGTACTGTTGAAGGTGTCATGTTCTCTACATTTA GAGAAGCTGCTGAGATAAGGGGTCGCATTGAAGCGGATGATAGTATTTCT GAATGTCTTACAGAGGCCGCAACATTTCAAATGCCTTATGCCCTTAGACG CCTTTTTTCTACAGTTTTGGCCTTCTGCGAGCTAACGAATGTTTGTGCAC TATGGGACAAACACTTAGAATCCATGTCTGATGATTTTCGTATGGCGGGC ATAAACAGTGAGGTAGCTGAGCAAATGGTGCTTAAAGATATTGGAGATCT GCTATATTCTATGGGAAAGGACATCATGAGCTTTGATCTTCCAGATTTAT TGAATAATGATGATATGAAATGCTTAGGTTGGAGGGAACTAACTGAAGAG ATATCTATCGTTGTTGATGAAGAAGATTTGAAGTTGCATGCAACGCTAAA CGATGAACAAAGGCTTGCTTTTGATGAAATATTGGACCATGTTTTATGTA AAAAGAGTAAGGTATTCTTCGTCGACGGTCCAGGAGGTACAGGAAAGACA TATCTTTATAAAGCTTTATTGGCTAAGGTGCGTTCCATGGGACTTATAGC CATCGCAACAACAACATCTGGTATTGCGGCTTCTATAATGCCTGGTGGTA GGACTGCCCATTCTAGATTTAAAATACCAATAAGTGTTCAAGATGATACT CTGTGCAACTTTAGTAAGCAGAGTGGGACATCAGAACTACTAAGAAGGGC ATCTTTAATAATTTGGGACGAAGTAGCCATGACGAAACGACAGGCTGTCG AGGCACTTGATAGATTCCTACAAGATATTACTGGTTGTAGATCACAATTT GGAGGAAAGGTAATAGTGTTTGGAGGTGATTTCAGACAAGTTCTTCCTGT AGTGAGGCGTGGCACCAGGGCACAAATTGTTAATGCTTGTCTGAAAAAAT CATATCTATGGGATGATATAAAACAAATAAAACTACAACGCAATATGAGA GCACAGTCTGATCCATGGTTCTCTGATTTTCTCCTGAGAATTGGGAATGG TACCGAAGAATCAATTGGTGAAGATTATGTACGCCTACCTAAAGAAATAG TTATAGGTTACACAGACTCAATAACCTCTGTTAGCAAATTGATCGATGAT ATCTTTCCTTCACTTGACCAGAATGGAAGATTTCCGTCCTATATAAGTGC GCGTGCCATTATTTCCACTAAAAACGAATATGTGGATGAAATAAATACAA TAATGCTTATAAAAAGATTTCCTGCAGAAGAAAAGGTCTACTACAGCTTT GATTCAGCGGTGGATGATACACAAAATCACTACCAACCTGAATTCCTGAA TTCTTTGACACCTAATGGCCTACCTCCGCATGTTCTCAAGTTAAAGATCA ATTGTCCGATGATCTTGCTTCGAAATTTAGATCCATCCAATGGATTGTGC AATGGCACAAGACTAATTATTAAAGCATTTCAAGATAACGCTATCGATGC TGAAATTATTGGAGGACAACATGCTGGAAAACGTGTATTCCTTCCAAGAA TTCCTTTATATCCGTCTGAAGATGATGTACTTCCCTTCAAATTTAAGATA AAGCAATTCCCAATCCGTCTTAGTTTTGCTATGACAATTAATAAATCTCA GGGTCAGACCATTCCAAATGTTGGCATCTACCTTCCCGAGCATGTGTTCT CTCATGGTCAACTATATGTCGCTTTGTCCAGAGGGATATCAAGGCAAACA ACAAGAATACTTGCTAAGCCAAACAAGGATGTTGACTCACTGGGAAAAAG TACCAAGAATATTGTCTATTCGGAGGCATTGATATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.