Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA034403

[Submit comment/correction]

Sequence	AA034403
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA034403
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GTGGGCTTGCGTTGCGTGTCCACTAACTACAGTGCCGTCCAACGAACCAG ATCGGGTGACTCCCCCCGCCACCCAGACCAAGCTCACTCTCCTCCGTCTC CGGCCGGCCAAGGCCATGACGCGCCGCCTGCGCCGCCGTACCACCAAGGA CCACCGGCAGCACCCGATCGACTGGACCGCGCTCCCCGACGACGCCACGC TGCACGTCTTCGCGCGCCTCAGCTACCGGGACCGCGCCGCCCTCGCTGCG ACCTGCCGCCCCTGGCGCTCCCTCGCCGCCTCTCCGTGCCTCTGGGCCGC GCTCAGCCTCCGCCGACTCGACCCCGCCGCCGCGGCCTCCCTCGCGCCCC GCTGCTCCTCGCACCTCCGCCGCCTCCGCCTAGCCGGCTGCGCCGCCGCC GATGCGGCCCCCTTCCTCCGCGCCACCAACCTCCGATCCCTCCGCCTCTC CGCCTGCCGCGGCCTCACCGACGCCGCCCTCGCCGTCCTCGCCGCGCGCC ACGCCGAGCTCCGCGACCTCCACATCGGCCCCGACCCCCTCGACCGCGTC TCCAGCGACGCGCTCCACCACGTAGCTCTCTGCTGCCCGCGCCTCCGCTG CCTCCGCCTATCCGGCCTCCGCGAGGTCGCCGCCGGGGCGCTCGCCGCCC TCGCGCGCCACTGCCCGCTCCTCCACGACCTCGCCTTCCTCGACTGCCAA GCCATCGACGAGACCGCCCTCGGGGGGCTCGCCTCCCTCCGCTTCCTCTC CGTCGCCGGATGCAGCGGCGTCAAGTGGGCAACGGCCTCCGAGTCCTGGG CGCAGCTCCCCTCACTCTCCGCCATCGACGTCTCCCGTACCGACGTCTCC CCAAGCGCCGTCTCCCGCCTCATCTCGCACTCCACCACCCTCACCCTCAT ATGCGCCCTCAACTGCCCCTCCCTCGAGGACGAAGAGGCGCACAGCCCCG CCGCCTTCGCCAACTCCAAAGGCAAGCTCGTGCTCACCATCAACACCGCC ATCTCCGAATCCATCGCCCCCGCCGCATCCACCCCGTTCCCGGACACGGC TGCTGTTCCCAAAGCAACCGAGCTGTTCGATGGCGCGGCGCCCCATCTCA TGACGACATGGCTCGAATGGGTCATGTCGCAGTCCTTCCTGCGGATCGCC GAGACCAACCCGCATGGCATGAACCAGTTTTGGCTGGACCAGGGCGCCGC GCTGCTGCTTACCCTGCTCAAGAGCTCCCAGGAGGATGTGCAGGAGCGGG CAGCCACCACGCTCGCGGCATTCGCGGTTGTCGATGAGGAGAGCGCAAAT GTGGACCCTGCGAGGTCCGAGGCCGTGATGCGTGAAGGGGGCATACCCAT GCTGTTGGATCTTGCAAGGTGCTCCCGGGAGAGTGTGCAGTCTGAAGCCG CAAAGGTTTTTTGACTTCTGAAATCACCCTATAATCATTATTCAAGCTAT ATAGCTACCACTGTCAGTAATTCCTTATGCATTGTGTTTGTGTAGGCAAT CGCCAACTTATCCGTGAACCCAAAGGTCGCACAAGCAGTTGCAGATCAGG GTGGTATTGCCATACTCACTAACATGGCAAAGTCGGTTAACAAGCATGTT GCCGAAGAAGCTGCTGGGGGGCTATGGAATCTGTCAGTGGGAGAAGAACA CAAGGTTGTGACTGCTTGGTGCTGTTTCCATCTGCTTTACCCTCAACATG TTTTGTCCCGTATGATGGATGACTCATTTTAATTCCTTATCAGGTGGCTA TCGAAGTGGCTGGTGGGATAAAGACTCTGGTTGATCTTATATTTCGATGG CCCGCAGGAAGTGGAGTTCTTGTACGGACTGTCTCCAAATTCTTTACTAT ACTTGTTTTTAATGAAAAGCGTTGATCCAGTTCGGAAATAGATCTGATTT TTTTGATAACTTTCTACAGGAGCGTGCTGCTGGTGCACTTGCAAATCTGG CTGCTGATGACAAGTGTAGCTTGGAGGTTGCAATGGCCGGTGGCATCCAT GCCTTGGTTACACTTGCACGCTCCTGTAAAGTTGACGGTGTCTTAGAACA GGTAACTTGCACCTTGCTTTTAAAGCTTCTACATGTTCCATTTTTGTCAG ATAGTTTAAATGTACCGCCTAGCCCCTTTTGTAAAGCTTCCGCAGGCACT ATACGTAAATGCTCAGTCGGTTAGACACATTTGAGTCTACACCTTTGATC ATTTAGGTTTTATCTACACTGGCCAGAGATGTAAGGAGTGTAGCAATGAG TGGATGATTTAACTACTATGCAACTGCATCATGGAGTGTACTTGCATGCT TGCCCTTTTCATCTCATTGGCTGCCTCTATAATTGGTGTTTGCAAAAAGT GATAAAACATGTCTGGCCAGTCTAAATTTGGTGCATGCCTTCTTCGACTA AATTTGGGATGTGTGCTGTGTGGACAATCATTATTTTATTTATATTTGCT TAGACCAGAGAAGCAATTCCCACTGCATGTTCTGTACAAATTTCTTTTCC TGATTTAATTCAGTTTCGTGTTATCTCTTAGATAACATGAGTACCATTTG GCATGCAGGCTGCACGAGCTTTAGCTAATTTAGCTGCACATGGAGAGAAC AATAACAATAATGCTGCCGTTGGTCGGGAAGCAGGTGCTATTGAAGCTTT GGTCCAGCTAACACATTCTCCACATGAAGGCGTGAGGTAAATTTCTGCTT TAGTCAAGCGACACTGGAATGCCAAGATTTTGAACTATATGTTACAGCTT TCTTGAATCTTGCCACGAATCTGAAGTTACAGTTGGACAATCTTTTCATG CATGTAATTAGACAAGAAGCTGCTGGTGCTTTATGGAACTTGTCATTTGA TGATGGAAATCGTGAATACATTGCTGCTGCTGGTGGTGTTGAAGCTCTGG TATGTCTTGCTACATCTACAGCGAGTTAGTTATTCTTTTTCCTATACATA TACGTGATGTCTCTCATAAAGAGGGAGCCGACTTAAGGAAATATTCAATT TATTTTTCACCTGAGCTAAATTTTGAAGAGTCAAGGAGCTGTTTTAAGAG AAAAAGCATAATGCTAGTTTTGACTTTTCAAGAAATTGAGAAAAATATGT AAGAAAAAAAGCAGGAACCAATTTATTTCCGTATCTCCTCGACTTGCACC GACAGAAAACCTCACCTTGTCCAGCACCTTTTATATGCTTTCTAACAGGA CACATTTCTTTCCTTAACATAAATGACTCAATTGTTTAGGTCTCACTCTG TCAAGAATGTTTAAATGCTTCAAACGGTCTTCAGGAGAGAGCTGCAGGTG CTCTGTGGGGACTATCTGTTTCAGAAGCAAACAGGTAAATGGATAGCTGA GTTGATGTCAGTATCTTCCTTAGTAGATTCCTTATACTAGTAATTTTGTT TTGTGTGTGTGTGTGCAATATTTCTCTGTTTTGGCTTGACCTCTTGAGTC CAAGTCTTTCCTTGAAACAAAAGACACATGACATGATACTGATACATGTT TAGGTTGTATTTGGATTGAGTTCATATTTGTTGGCAATGTATTTGGAGAA AAAAATATCCAGAATATCAAGGAGTCTCGATCTATAAATAACGACAACCA TCACTTGCTTCATTCCTAGTTCCTTTTCCCTCCTGAAAACGGTTTCTTCT ATATTGAAGAACCCTAGTAAGATTTGCAGGTTGTACAAGTCTGGAGCAAG CAACTCAGATTTGAAATATTCCTTTTATGAGGTAGTCAAAGGGTTGGTTT TCATTACAGACGAAGAAGAACCCTGTGTTTGCAAGAAGTTCGTGTGAACT CGCTCATATTTCTAATCTTACATGTGGATGGTATATTCTTCACAGGGAAT GACATAGCCAGATGCTTGAACCCGTCAAAGGGTACGGGGATATGATAAGC CCACTAACACGAGAAGACCCATAAGCATTTAAAAATGATTTGGCATTTAA AATTGCCGAAAAACATTCTTCTATATAATTTTGTATACTAGTTTTTAATG AAGGGGCACCCTTTCTTGCTTGTCGGATCTTCATCCAACACATCCACACG CTCTCCACCTCTTTTAAATCCACGAAGTGGTATCCTTGTTTTCCGACCGC CAGGTCGCCATCTGACGACATGTAAGTCATCCACGTCTGCTCTCCCCCTT TTCTCTTTCTGCTCACTGCTCAGGTGGCCATTAGTTTGATGACATAGAGC AGAGTGTGGAGGTACATGTGCCCGTATGAGTTACATAGATCATGTTGTAA AAATTAGCATACAAGGTCAAACTGCATATGACAATACAGCAGATGCTACT TTTATACTGCATATATTTTGTTATATCTTCATTTCTTTCTACGGTAAATG GAATAAGGTCCTAAACTATTAAGGTGGGTAGAAATGACGTCAATACCTTA TTGTTTCTTCCCTGGGAATAATTTTGCAGGCTATAGTCAAGAATTGTTCT CAGCATAAGCTTCAGTTGTTTGCTTTGAACTCTTCCTTTTGTTCTTCCGT TTGATGTGCCAGATTCATAGCGCTTACATGATACAGTTATTAATATTTCT TTCAGCCAGGAGCGATTTTAATTATTAATCCTGATGACATCACTGCTGCT AACTTTTCTGTTGCGCTCTCAGCATTGCAATTGGAAGGGAAGGAGGTGTC CCACCTCTAATTGCGTTGGCACAGTCAGAGTTTGAAGTAAGTGTTGCTTA TCTTCAGTGCACCTGGTGTGTTTGTTTATAAAGACAATATGAACACTGAC ATGCCTCAATAAAATGACAAGCTCTATTATTTGGTGTGCTTGTCTATGCA CCATATGTATTATGCACTTTATATTCTGCGTCAATGCACTATTACTTGTA TGCTTAGTTTCTTCCTCTGTAGATAGGTCCATGTTGAGCTTCTGGGGTCA GCCTTATGATTGTGCACTTTATGCTTGTCCAGTTGTTATGTTCGAAGTTT GTGATCAAGTCTGACCTAGTTCTCTTCATCTGAACTTTGTGTAGCTGATT TCTTGATCAATATTAAGTGAAGTCAAGATTAAGTGTTCACCACTGTCATA TTTTCTTGAATCTTGAAGCCCTTAGTTGTTAAGATTGACCAATCTCTGCT GCTCGTGATTCTAAAGGCACTTTGTCATCTAGATTTCTTGTAGCCCTTAG TTGTTAAGATTGACCAATCTCTGCTGCTCGTGTAATTCTAATTTCTAAAG GCACTTTGTCATCTAGATTTGCATCCTTTGATATTGAATACCTCCTTCCT AAGCTAAGCATGCAAACCAGAAAAACTTCATTTTCTTAAGTTATGTTACT TGCTCGTTCTACAGGATGTTCATGAGACAGCAGCTGGTGCACTGTGGAAT CTTGCTTTCTATTCTTGTAATTCTCTCCGCATAGTTGAAAATGGTGGTGT ACCTGTCCTAGTGGACTTATGTTCGTCATCACATTCAAAAATGGCCCGGT TCATGGCTGCACTAACCCTTGCTTATATGTTTGATGGAAGGTATGCTGTT TATGAGTCATTTCTTCTCCATCATGTTGCTTAACTCATGAGGAAGTACCA TGATTTGGTTGTTTTCCCCATATGTATACTTGATGAATTTTATGCATGTT TTCTACATGAAGTTTCCTTGTATATTCTTGAACTGATTGCATCCTTTGTT TAATGTCTGAAAAGCAAACGACCTTAAATGCTACTCCCTCCGTTTCAAAA TATAAGATGTTTTAGCTTTGTGAAGCAAATGTATCTAGACTTTTTTTAGT ATGTAGGTTCACCCAGGTTTGGGGTGAATCTACACACTAAAAGAAGTCTA GATACATTTTCTTCACAAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGG AGTACACCCTATGGTCCTAAATATATGATGTTTTGGGTTTTGAACTCCCA AAACGTCTTATATTTAAGGAACAGAGGTAGTACATGCCAGTATAAAACTC AGTACAATTGCAAAGGTCACCAAGTTAGAAAATAGCACCATGTGACCCTC CCTCACTGGATGGTATCTTCGAATTTCTCTTTGTGATGCTAGTGAGCTAT TTTTTCTTAGTATTAATTGATACAATAAGGTTTCCACTCTCAAGATCTGC GTATAGTTATGTTGCTAGAACTTCCCTAGTATGGCTACTCAATAGTACTT CCTCTGTCCCAAAATATAAGTTCTTTTGGTAGGCTCTTATAATTTGGAAA TGAGGTCGTATATTCTTTATATCAACAAAGGATTATGAGATATTGCAGAA AAAAGGAAAAGTAAGAGCATGTACTCTGTGCTCGTTCTAATCTTGAATTG TTGACTGGCAGAATGGATGAGGTAGCACTGGTTGGGACATCCTCACAGGG TAGTTCCAAAATTGTAAATTTTGAGAGAGGAAGAAGGTTGGCGTTGAAGC ATATAGAAGCCTTCGTGTTGACATTTTCAGACCCACAAATGTTTTCTATG GCTGCTTCATCTTCTGGCGCAGCAGCCTTATCGCAGGTTGCTGAAGCACT TTGTATACCAGAAGCGGGACAGCTTAGATGCAGGTTTGACTTTCTATTTT ACTGAATAGTAATATCAATTAGACGTGATACTTGGTCTTCGGTTTATCAA CTAAAATATTAAATGAAGACAGTTTTGTCAAGATAGTTCAGCGTTGAGTT CTGGTTTACTTTCCATGCCTAATGTTGCAAAAGGATCAGTCCGATGATTT GCTTACTAAAAAACCATGCCATATTTTCTATGTTTAACATTGCAAAATGA TCAGTGCAATGATTTACTTACTATAAAACCATGCCAAATTCGGTCCTGGC AGTCTTAGATTTCATCCATAATGGGCGGATGAACCATTTCAATTTTCAAA GTTTGAAACAGTAACTAAATATATTTCTATCAAAACATGCTGAATTAGGT ACTCCCTCCGGTCCATATTATTGGCCTCAACTTTATCTAGATTCGTATGT ATCTAGTTAAGTATTTAGACTAGATGCATTTGTATCTAGACAAAGTTAAG GCCATTAATATGGACCGGAGGGAGTAGATGAAGGCAAAATGGTCTGATTA AATTATGCTCAGGATTCTCATTTCTCAGTTGGAAACTTGCTAGCTGCTCT GGCAGTGATAGCAGTCAGTAGTTAAGGTCTTGTATAACCGGCACTGCCAT TATTAGAGTTTTTAGTATTGGTCTGCAGAAAAGAAAACAGGAAGGCGAAT GGGTGCCGATGTACTGGCATGGTTTAGAAGTTCACCCAATAGTGAAAAAA CCTAGTTATTAGGCTTAACACAGCAAGCCCGCTAGACATCTCCAAATGCT GTGTTGGTACAACATGTAGCTGTTTATATAGGGACTGTTCGATCTGTTTA TCATGTGATAATGTGTTGGGCTATGCTTAATACAGCTATTATTCGATTTG TTTATCATGTGAATTCATGTTGAGCTGTTGCGATTTTGTTAATAACTCAC CATGAGTGTTATTTTTAACCTTGTGGCACGGTGTAGATATTAATTCGAAA GACACTATACTAATTTACTTTTAACTTCCTTCAGCGGAGCTGAGATTGCT AGATTTATCGACACGCTTCGGAATCCTTCATCTGTTCTTCGAGCTTGTGC AGCATTTGCTCTGCTTCAGGTTGGTTCCGTTTCATCCACTTCAGCAGCTA CCATTACTTGAGTCTCATAAGAGTCGTCGTGCTGTTGTGACTTGGCTTAC TCATGCACAAGCGGCATGCCTAAGTCTAACAAGTAATTACAAATACACTG ACTTTCTCAATTTCTTAACATTAGCGTATTCCCCTATCTGAAATTATGAA CCCATGCATATAATATGTTTATATTCTAAGGTTTTCTTGTATACTAAAAT CTACAGTGATTGCGCATGCATAGTATGTTTGGTCATGCCTATCTACCGCT CATCATATCCCCTCCCGCCAGCCAGTATTCTGTTTTTATCCATTTAGTTA GCTTCCTGATATTTGACCTGATTTGAAGCAAATGGTGAATGCCTTATTTA AACCCCCTTCATGCTTGTTTCCATGTACCCCAGATGCTTCATTTTCTGAC ACGAGTTTGTTTCAATCTTGCTGTGATACTGTATATTCTCCTGACTGGTC TCTCTAACGATGCAGTTCACTATCCCGGGCGGTCGCCATGCTGTGCACCA TGCAGACCTACTTCAGAAGGCTGGGGCATCCCGGGTCCTGCGATGGGCAG CTGCGGCGGCAACAGCTCCTATCGAAGCGAAGATCTTTGCGCGGATAGTC CTTCGGAATCTGGAGCTCCACCAAGCAGGGCCTTCAACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.