Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA046720

[Submit comment/correction]

Sequence
AA046720
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA046720
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTAGGGTTTGCGGCGGAGGGAGTGCGGGTTCGACCCGTCTCCGCCGCAGT
TGCCCCTATTAGGACGGCCTAAGTACAGATACTGATCGATGCGCGACTCG
ATCCAGGGTGCTGTTAGTCATGCTCTTATGTCACTAGATTGCTCTTCACG
AAACGGTAAAGTAACAGGGGATGATTTTGGTCGACATTAAACAGGTCCAG
GGATTTCAGAGTCTGACGCATCTCCGCCCCATCCCGGCCCGTACCGGAAT
AGTTCGCTGCGTCTTCAGTTAGTTGTGCCACCGCCGCCGCCGCCGCCGCC
CAAAGCTCGCTGCCCCGTAGCCGTCCCCAATTCTCTGCGCAGCCTCCGCC
GGACACAGGTAGTCTCCTCCTTTCTTCCTTCCTCCCACCCTCTTACCTCC
CTCCCCCTGTCCCGCCCCCCCTGCGTTCTTCTTTGTTCCTTTTGTCGTAG
GTAGAGCTGAGTTCGTAGATCGATTCTGGTCAAGCGACCTACTAGTTCAT
TGATTTCCTGGTCTTTGCCACTCTCTTGCCAGTTTTCATAGATCGGAAAA
AGTAAGGGCCGTGGCGCTAGTATCCACATTGCTAAATTAATCTTGCTGTT
CTCGGTAGCAAAAAATGCAGTATATAGATCTGACATGGTTCATAAATTGT
TCAGTTTTTCTGATCGGTCATTTCAATCTATTGCTGACAAAGATATAGCA
TATATGGTTGGTACAACTTCCTTGCTTGAAATAGTATCCATGCCCGTTGT
TTAAAGCTTGTGCATGCTCAGGACTTACCAGGTAGCAACCCACCGGTGCT
TTTACTCATGTATTTTTTGCTATGATTCCTGCATGCATGCCTAGGGACGT
TGTAATGAGCTGGACAAAAATTATTTGCTTTCACTTGCAGCATCACTGAA
TAGGTTTAGTGATAGTTTCTGAATATGCAGAACTTGATGCTCATGTATAT
CATGTTTACTATTGATGCTTCAAGGCCATATAATTAGCTCCTAAATAATT
AAACTACTGAAGCAAGCCAAATCAGTTCTGGTTGTGAAGCTAATTAATGA
TTAATAGGACGAATATGTGATCAGTTCTAGCTGTTGAAAAATCCATTGGT
TGCAGGTTAACTGATTTTATTGAATTTGTCTTGATTGATGTATGGGCTCG
AAGCAATAGAAGAAGGAAATCCCTATCCTCTGGTTGCCTTTCCACGTCGA
AGACATCCTGGTGGTGATGGCGGTGGCTGCAGCAAGGTCTGGATCCCGGC
GCCTGTTCTCCATCTCGGCCATTGTGCCACGGAAGCTGCCAAACCCTCCC
CTGAAGGCTGAGTCCTTCCCCAACCTCTTGGTCCCTGGTACAATTATTTC
TTCCCCTTCCCCTTTCCTGTCATCCCTTCCTTCCTGTAACCACTGTCAGG
CGTTGCTCACTTATACAGATTTAGGTCCTAGTAGCATGGTAGTAGTCTTG
CGGGATTAAATCTTGCCCAAATCGACTAGAGTCAGGTAGCTCTGGATTTG
GCTGGGAGGTTCTTTAGTGAGGGCTTAATTATAAACTGGCGTCTCGGACA
TTAGAAAACTTTTTGTTGGCATGTTCACAAAGTTGGTATTTTGGGTTGCA
CTAAGTCAGTCCTCACAGGATACCATGCGCTGTTCCAGCGTTGCTTATTC
AAGCCCTGCATTCTTGGTCGATTATTTCCTTTTCTATTCAATTTAAAAAA
TATATAATTGTTTGAAAACACATATAGAACATACAGAGGAGTTTTTGCAA
ATCATGTCATGAATTATGTCAAGTAACCCGGGCATATACATGTTCTGACA
TTGTTCATGTGATGTGAACTAATCACATTACTTGTTCTTAAAACAACTAG
CAGGGAGAGTTATAGAAGGTTATCAAGTGTACCACCACAGGAAACGAACT
TCGCTGTGGATCCCTGAATAACTAAGTATGAAGCATATGACGATATCATG
CAATTTATCTTTTCGAGAGAGGTACAAGTGGTTAAAATAATTCATACATT
TCTTAGATAACATAAAGATGGGCCTGTACATGGACCGAAGCTTTTTTTGC
CAATTCAGTCTTACACCAGAATGCGTCCTGACACACTTTACTGGTCTTCT
GTTTATATGTGACCAAGCCAATACCACGGCATTATGATATTGAATGATCA
TCCATCTCTTGAAATCATAATAATTCTGCATGATACATCAACCTGTCCTC
TCATGGAATGGAAGCTGACTGCTCCTCTGGAGATCCTATTGTGCAACTCT
CTTGAGCTGAGGCTACAAGTTGAAACTGAAAGACCAGTTGAATGAATGAT
GGACTAGCAGAACTGCAACCAACTAGCAATCTTCTCCCTCTGCACTTTCT
CTCTAGGCAGCTTTATTCCATCTTTTGTTTCGTCTGCTTCTCGGGGTCAA
TTTTAATTTCATTTGACATACCATCACCAATAGCGGAGGTGATGATTGAG
TAAGCATCAGAAACTATATCAATGGTTTTGCCTACTAGAAAGTACCAAAT
AGGTGAACATTTCACCAGGAGATTGTTAAACTCAGCCCAATTATAATCTT
GACTTGGCTCTTGCTTGCTCTATATGTACAAACAAGAAACTTTATGAAAA
TAATGGAACCGAAAAACACTTTTCGAAGTATACCAATTTAAAAGAGTCAG
TACAGTTTTTGAGAAAACGCAAAGAGGTGTTTGTGTTTCATTTCATTGCA
AAGATAGAGTTTTGATACAAGCCTACTAAGAGGGAACCACTGCTAGAACT
AGTGACGATTACAGATTTAGTGTACATCCCAAGTGGTTGGGACTACTACC
CTAAGCCCTTTCGCCCCCGCCTGCATCCACGCTGACGCCTCTTCCTTGAT
CTTGCTCATCAGGTTCTGGATATATGGTTGGCTGCGCTCGAATACGCAGC
CGTTGCGTTGCTTCCAGATCAGCCATGGGACAAGCAGGGTTGCTGATGCT
AGCCCCTTGCGTATGGGTTTGGGGGTGATCTGGTCCGCCTTGGTCCACCA
ATCAAAAAGGGTGGCTTCGTCAGATGGAGGCGGGCAGGTCATGCGCAGCC
AGGAGAGGGTCTCATGCCAGATTTTCCTAGAAGAAGGGGCAGCTGATCAT
CAGGTGGTGCATGGTCTTGGGGGCCTGATCACATAGCACGCACCAAGGAT
GGTGCTGCAGGTGTCGCCTCTCAAGCCTGTCCGCGGTCCAGCAGCGGTCT
AAGTTGGCAAGCCAATGGAAAAACTTAACACGATTATGTGTCCAGCTCTT
CCAGATTAGCTTCCAAGCCGCACACCTCTTGGAGCCTTGGAAGGAGGCTA
GATATGCGGATTTGGCGGTGTATTGACCATCACTTGTCCATTTCCAGATC
AGTCTATCTGCCTCATCGGACAGGGTTGTGGGCGTGATCAGCTGCCATAG
CTGTAGGTATTGCCCAACCTCCTGTATGCCGATCACTCCTCGGATGTCTT
GGGCCCATTGGTTGGCGTGTAGCCCATCTGCCCCTGTTCTCGACGTGCAC
CGATGCTTGGGGATGCAGTCATAGAGCTGTGGCGCGATCTCGCAAATGGA
TCTTCCCTGCAGCCATCGATCCTCCCAGAATTTGGCGGTTCGGCCGTCTC
CCAGGCTCATGTAGGTAGAGGCAAAGAATAGTTCGCGCTCTTCTTTACTG
AACTGCAGGTCCAGACCATTCCAGGCCCTGGTGCTGTCTGTTGTATCCAG
CCACTGCCACCTGAGCCAAAGCGCCATGCCTGTGAGTACCAGGTCTTGTA
TGCCGAGACCTCCATGAGATTTGGGTCTGCAGGCACTGCGCCAATTGACG
TGGCAACTTCCACCATTGGCCGATGCCCTGCCCTCCCACAGGAATCCTCG
TTCAATCCTCTCCATGGCTTTGATTGTTTTCTTTGAGGGTGCCAGGACTA
AAATCTGATGTATGGGGATTGCAGCCAGCACTGATTTGACGAGGGCAAGC
CTTCCTGGCTTTTGCATCAATCGTGACTTCCAGGTGGGCAACCGGCCTGC
CATTTTATCAACTAGGGGCTGCAGCTGTTCCGTGGTGGGTCTGCGCAGCG
TTAGTGGTATCCCCAGGTAGGTGATAGGAAACTCAACTATGGCACAGCCC
AAGGATTGCAGTAGCGGTGCCGCAGCCTCGGCATCAGCCCTGATTAGCGT
GGCGGAACTCTTGGCGAAGTTGACATTGAGCCCTGAGGCATGTCCAAACA
GTCGCAGGATTCCCTTCACAGCCTCGATGTCGTCCATGGTCAAGTGGCAG
TAAAGGATCACATCATCCGCGTATAGCGAGATCGATGGGATCGCACGCCT
GGGGTGTAGTTGCTGTAGGATGCCTCTGTCTATCGCGTGCCTGATCAGCC
TGCCAAGAACGTCGACCGCTAGTACAAATAGTTGTGGTGATAGCGGGTCT
CCTTGGCGTAAGCCGCGCCGGTGCCAGATGATTGGGGTCCCCAGGTTCTC
CATTTAGCAGCACCTTCGTGCTCGCTGAGGAGAAGAGTATGGCTAGCCAA
TCAAGGAACTTGTCGCTGATGCCGTAGCGACGCAGCACCTCGAATAGGAA
GGGCCAGGACAGTGAGTCGAAGGCTCTCGCCATGTTTAGCTTGAGAAGGA
CGCGGGGTTCCCCCAGTTGGTGTAGTAGTCGCGCGGACTGTTAGACCAGC
ACAAAGTTATCATGCAGACTGCAGCCCGAGATGAACGCATTCGGAATCGG
GCTGACGAGTTGTATCAGCTTCAGCGCAAGTCGTAATGGGATCATCTTGG
TGAAGATCTTGGCGATGAGGTGTATAAGGCTAATCGGCCTGTAGTCATTC
AGCTGGATCGCATCGGCACACTTTGGCAGCAAGGCCAAGAGCGCTTGATT
GAGCTTGCAGAAACCCCGGCCTCGTAGCTCATAGAGCTGTTGGAACACCG
ACACAAAATCATGTTTGATCGTGTTCCAGCAAGCTCGTAGGAACTCAGCT
GTGATACCGTCGGGGCCTGGTGCTTTGCGTGGAGGAAGCTGCTTCACCGT
GTTCCAAATCTCCTCGGCTCCAAAAGGTGTCTCCAGGTCATCCAGATTGT
TGGCCGGTTCAATGAGCTGCTCAAGATGGAGCGTGAAGTCACGCTCAGAG
TCGATTCCAAGTAGCCCGTCGTAGTGGTGGAATGCGGTTTCGGCCAAGTC
TTGTTGCTCTGTAACAACCCAGCCGTCGACCGTCAGGCTTGCGATCCTGT
TCTTCTGGCGCTTATACGTGCACTGGCGATGGAAGAAAGAGGTGTTTGCG
TCTCCGTCCCTGAGCACCGCGATACAGGCTTGTTGCCGCGCTATGGTGTG
CTCAAGGGAGGCAAGGCCCAGACAGGAAACCTTAATCTGTTTGCACAACC
ACTCTTCGCCCACGGTCAGTGGCCTGTCTTCTTGCGCCTTGTCAAACCGG
GATAGCAGTTCGCGGGACAGCGCCATCTCGTGCCTGACGTTTCCCACCGC
CTTTGCGCTACAGCTTATAAGTTTACGGGCCATGGTAAGTACCATTAAAG
TTATGGCAGTTACACTGTTGTGGCGCTGTGATTCAACTTATCACAAGTTA
TAACTAAATTATTGATTGTTATTGATCTTGTTGTACATATTCTTGTTCGA
TCAACAAAAGGAGGGAGTATAGTTTCCCTTTCCAAGTTTCAGAAAAGAAA
AGTTCCCCTTTCCCTATCTACCGTCTTCTGTTACGGTTAGAAGTTTATAT
GTTTTGCCCCTTTTGGGTTGTTTCCTTTCATGTTAACCTTCTAGTGTACA
CAACATCTAGATTCTCATATTATTTAGCAATGATGTATAGGGTTAAGCAA
GCAGACAACACTTGGTGGACTTAGGGAAGCTTTTCCAAAGTCTGGTGAAG
TTGGGCATGGTATGTTTTTCTTATAATTTGGAAATTGTTATTCTTCGCAT
GCTTCTGTTTGTACAGGATTTCTTCTGATATAATTGCAGACTAAAGTATA
GCAAGAAGCAGAACACAATAATTTTTGTCTCGAGTTCATATAATGTACTC
CCTCCAATCCAAAATAAGTGTTGCTGATTTAGTACAAAGTTAAATCAGCG
ACACTTATTTTGGATCGGATGGAGTATTATTCATTCTACCAGAAGAACTA
TTGAACAAGTATATCTTCTAGCCAGGATTTTCTTGTTTTCTGCTAACACC
CCTTAGCTTGTACTACCTCCGTTCCATAATATAAGCCTTTTTAGAAGGTT
GTTTTAGCTTGCTAAAAAGGCTTATATTGTGGAACAGAGGTAGTACTAAT
TAAGCGACATTTATTTTGGATCGGAGGGAGTACTATCATTCTACAAGAAT
AACTATAAACTATTTAACAAGTACATCTTCTAGTCAGGATTTTCTTGTTT
TCTGCTAGCACCCCTTAGCTATAAATAATTTACGATATAATGGATTATTT
GACTATTATATGTGTCTATGCATAATGTATACCTTAAACGAGTGGAATCT
TTTTTTTAGGAAATTTGAATCTTTTCAATTTTACCAGAAGAATCATTAAG
AATAGCTTCCTTATACTTGTTTAATGAATCTTCGTTGGAAATATTTGATG
GTTGCAGTACAAGTATAACTTAATCTTCCATTCATTAAACCTGCTAGAAT
GAAATGGTTAGAATTGCAAAGGCACAATTTCTCAAAATGAAAACTTTAGA
GGAAAGTAAAAAGCATTTTCTGTTTGCCTTCTCCAGTGAACTAATGATAG
ATTGATACCAGCATATGATTACTTTGCCTATTCTGTCCTTCAGTTAAGTT
GGGTCAGTCCATGTTAATTGCTGTTTATTTTGATTCTAAAGGTGTTAAAA
TAACGTAAATTTCCGTGTACTGTGTTGTTAAATCTGAACTAAAAGTTCTT
TTCAGTATTGTGCATCCTATGGACCTTGTTTAATGCTGATGCAGTTCTCT
TTTGACAAACCTTCCAGCATCATCTTCAAAAAGTTCAAGGTGGTATATGA
TCAATTCAAACCATTCAGGTTCTCTTACAGTGCGTAAAGAATGCCGCAAA
GTACTTCCTTCTTCAATAAGGCCATCTGCATCTTACTCCACACAAGCTTC
AGAAAACAAACCAAATCAGGTTTGCTAGTCTATTTTATGACTTAATTATT
CTAATTATTCAATATTGGTTTCTTCCATATTTTCTTCCATGTGGTGACTC
TTGGTATAATTTTGAGCAGTTGACAATGTTGTCCATTTTCTTTGAATATG
CTACTATGATTTTTCCATTTTGAGCAGTTAACCATGTCACATTTTGACCA
TTTGCAGCAGTGACAATGATAACTCTTGCATACGTCCATGGGCTTTACTA
TGTTTCTTTTTTGTTTTCATAATTCTAATTCTGTTGGGATCAGTGCATCA
GGAAGCGGCTGCATCGCTGTTGATAAGTATAGGCATTTCAGAATAGATTG
TTAGAGGTTAATCAACTGCTATCGGAATGCATATACTGAAAAGATTCTCT
TTGTTTGTCATGCTAGTGTAGCTAATGCTAGGTGCTTTACTGACTTTTTG
TTCATTATCTTGAGGTGGTGATATCCTCCACTAAGCTCTTCATTTACCTA
CACCAGATTTCTTGAGGAGGCATGGGTATTGATCTGATAGGACAAACTAA
TTCTGTTACTTATAGACTATAATTTATCGGAAAGTCTACTCTTGTCTGTT
CTCTTATTGTTATCCATTTTGACAACATTTTGCTGTAGAAGAGTTGATTA
TTGTGTATTTACTCTCCATCAACACTGTTAATTACCTGGCACCTTCATTT
TCTGCTTTTGAGGCCCACTGTTCATGCATATCTTCGTCTAAAATGTAATT
TATTTGTAAACTATATTTTTATAGTTTTATTAGTTGTTTCTGTTTCCTAT
TTCATGGATACATTCTTTTTACGGTGCATGTCATGCTGGGTCACTTTTTA
CTGCTTATAGAAGATTTGCCCTTTTTATCCTCAGGAGAGAACAGACTTGA
CAACAACTGAAGATCCCTTTGATTCCCCTACATATAATATACCTGAGAAG
CCAGTGACATTTGTTGAAGGGGCCTCTTACACTGTTGTAATACTCGCTGG
GCTTGGAGTTGCTGCGGTGGCTGGATATGCTGTTTTCAAAGAGCTTATAT
TTGAACCAAAAGAGTATGTCGTTTGCATTCTATTAATTTGAATTTAAGGA
TGCCAAACAACACAATTTGTAAGAAATATGGTAAATCATACGAGCATGTT
TAGTTTATAGCTACACATTGGCCAAACTTTTTGGCACAAGTGTGGCAGCT
GTTTGTTTCACTGCCACAGTTGTGTAAGAGGCCCCCACCTGTCATAGGCC
CACACAAGTGTGTCGTGCCACACCTCCTTAGTAGCCTGCCCCACCTGTTG
CAGGCCCATACTTCCGCCCAATCTTGTCACAGTTATGGTGGCCAATTTCT
TGGCCACACTTTTTATGGCTTGCCACTACTTAGTAGAGAAGACATACACT
AGCTACTGTATTTTAGAAAACTCCTACAAGCTATCTTCCAAGAGCATCTA
AATTTTTGGGAATATGTCTAAGCACTAAGAAATGCCACATCAGGCAGCCG
CTAAATTGGCTTTGTCTCTTCCGGTTTTATCATCTGTCCTCCTTGATTTT
GTACTTTTGTGCCACTCCCCATCACTTAGTTGATAGAAGTTTTGTATGTT
TAAACACCTAGATCTCTTTTCTACATGGCATGGTTGTTCTTCTATCCTTA
TGGCTAAATACCCCTATGTGGTTTACGACTTCCATTTTTCTGGAAAATTC
TTGTGGTACCCCTGTGCAATCTGTATGGGAGATTTTTAATGTTGCTACAA
TCGTACAGGTACAAGATATTTGGGAAAGCTCTAGCAAGAGTTCAGAGTGA
TAGTCAGGTTTGTGGGTGTTAGTGTTATTTCGATTTTTTGCCTGGCACAT
TATTATTCCTCTCTTAGTATACTTCATATTTGCGTAATTTTCAGGTTACG
GCCAAAATTGGTTACCCTATAACTGGTTATGGTATGGAATCCAGAAACCG
TGCAGCTCGGCAGCGCATTCAAAACAGGGTTTGGACAGACGAGGACGGTG
TTGAACATGTGGAGGTAGCATAAATTCCTGTCCCTACGATTTAGTGATGT
GTGTTCTTTAACTATGCTGCTTACTGGTGCATCAAGATTACGGTAGCTAA
GTTAATGAAAAACGTACAAGTTCACCATGAGGAGCTGCTGTCTGTACTCT
TTAATGATGTGCTTCTTTAACTATGCTGCTTACTTGTGCATCAAGATTAC
GATAGCTAAGTCAATGAAAAACTACAAGTTAACCGCGAGGAGTTGCAACA
GATAGCGTGACACTTCCTGTCTGACAGTTTGTTAGCAGCATTATGGCAAT
GAGACAACGACTTGCAAACGTGGGAGAAAAGCTAAGAGGATTTTTTACTA
GGGAGTCCAAAGTCATGATCAACAGTAATACTTTGCAAGTATAGAGAGTT
TTAATACGTAATGGACCTTTGGCAAGTTTATATGCTTTCAGATGATGCTT
TTGCTAGTTGCGAAAGGGGCACTAGGATGGCATGTGATATGAGTTTATGC
GTTTTCCTTTACGTAGTCGTGTGGCAGCTCTTTGAACTTGGTTGATCAGT
TGAAATTCACATGCATCATTTCAGGTGGGATTTCATATCCGCGGGCCACA
TGGAGCTGGAAAGGTGTTTGCTGAGATGTTTAAAGATAACTCTGACAGGA
CATGGAAGTTCACATTTCTTCTTGTCGAGATTACGTCACCACGTCATTCA
CAGATGATGTTGGAATCTTACATCCCAGCATAAGGATGCAAGAGGCAAAA
CCAGCTAGCGGGGACACATCCATGCGATACTTTTTTTTACATCCTATCTC
ATGTTTAATACTGGTCCTCAGATTAAAAAAAGTTCTGAATTTTGATCTTC
CTATAAGCATAGGCAGGAGGAAGATAAACTATCAGAGCCGCTGATCATCT
CTTGCATCTTATATATAGTGTACCGCAAAAGGACCGTAATGTTAGGATTG
TTTAGCTGAAGGCCGTGTAAGCTCATGTAGGCAGCTCATTTCCCCTAATG
TTCCTCAAACCTGGTGCGGAGAACAAGTGATCCTTCATCTGAGTTTTTTG
TCTCATTTTTTCAGGTCAGATGGTTTACCGCTGTCTATGGATTTTCATCC
AAACCTCTGATGATATCCAAATAGCTATAACATGCATTTTGTAATAACAT
TTTAAAATTCTTTCAAACCCGAGGATCCATGGCATGCACGTGAAGTGATC
TAGCTGACTCTTTATTTGATCTCTTTACGAAAAATGTCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.