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GrainGenes Sequence Report: AA040293

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Sequence
AA040293
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040293
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGAAAAAAAGGAGTGAAGGAGCACGCAACTTGGCTTGGGTCGTCAC
GACACCAGACTACTGCCACCGCAGAGAGACCACCACACCGAGGACGAGGA
GCGCGAGAGGAAGGGAGGCGACGGACGGACGGAGACCACGACCGCCAGAT
TTTGTTCACACCACACCGATCGACCCATCTCCCCTCCCCCACCCCCGCGT
CGTCCTCCTCGTCGCCGTCGTTTATTTATCGCCTCCACCTCCGCCTCTCC
CACCGGCCCTGTCCCCGCGCCGACGCCGCAGCCTCGCTCCCCTCCCCGTC
TCCGCGACTCCCCTCCGTCCCCGCGCAGGCGCCCGCCGCGACGACCCGGC
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TTCCTTCCCTCCATAGCTTCGTCCGCCGGGCTCGCCGCTCGTTCCAACCC
ACCGATCCCCGCCAGTTACTTGCCCGGCCTAGGCAGCGCTCTTGTTCCGT
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CACTCAGCACCGAAAAAACACTGCAGCATCAGTCGCCGGGAACCTGCTCC
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GGCGCTCCTTTAAAATTTGATTCTCTGCTTGTTGTGCTTAACTGCTTGCT
GGCTGTGTAGATCTTCTTGGTTGTCAAGCTTTCTTCACATTCCCTTGGCA
ACCATGAGACGATCACAATTATCACATGATGCTGCTGCTACTGCCTTGCT
TCCGCTGCTGGGACATGTGGCAGATTTGGGGCTGGGCGAGACGGATGTCG
CACCTACTGTCATTTAAGTGCCCGCTTTATTCCTGGGGCTTGTGGTACTC
TGCTGATGTTAACTGCAGCATTGCGTTGGTTGCTAAGTACTGCACTAAGG
AGCAGGGGAACTTACAGGCTGCTCCTTTAAAATTTGATCGTCTGCTTGTT
GTGCTTAATTCGGTGCCTGTCAGCTCGCTCGCTCGCTGGTTTTTTAGATC
TTCTTGAATGTCAAGCTTTCTTCACACTTCCTTGACAACCATGTTTGCGC
TGCACAATCCATCGGGATTCGCTCTTTAACTGTTTTCTGCTGAATTTCGC
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CTTGCTTGGCGATATTTGTGTTTTGTTGATCGTCAAGAGTTCCATACAGC
TCAGCCTCCTGTTTTGTGCTGTCTATATCTGCTTGGAGAGCGCGGTCTAA
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GTTAGTCGGTTCTTATTTCTTATCTTATGCATCTTCCTTTCCAAACCACA
TTCAGGAGAACGCTTGCAGTTGTTTCTGGCGCACTACTTGCTGGTGGAAC
TTTAGCTTATGCGCATTCAAGTCGACGGACGAAACGTCAGGAAAAAGAGT
CTTTTACAGATGCAAATGGACATGCCAGGAGTAAAGACAGCACTAGTCAA
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AATCTCTCCAGTCTGCCCGTTTCATTTCTTTGACATGTCGATAGTGCTTT
TCTGAGTACCAGAATTTGTATGGTCCGTAGGTGCCATTTAAAGGATTTCC
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TGAGAAGCTGTATCGTAGTTCAGTCATGATGGAACTATCTGTATAAAGTG
ATACTGTGTCCATGCTTGTCCAACAACATGTAGAACCTTTTTAACCAATG
AACTTTCTGCAGGTGTTGCGTACAGCCATCGGTCACAGATTAGCAAAAGT
TCAAGGATATTTGTTCAAATCCACGTTTCTTCGGCGTGTTCCGACCTTCA
CACGGCTGATTATTGAAAATCTTCTATTATGCTTCCTTCAGTCCACGATA
TATCAGACCTCAAAGTATTTGACAGGGTCCTTAGGCTTGCGCTTCAAGAA
AATTTTGACAGATCTCGTCCATGCTGATTACTTTGAGGTATATTGGTTAT
AAAGTTGAAATATCCTTACTATTTGTACCTTCACATGTTTATTTTACTTC
TTCAAGTCCCAGTTATGTACTGCAAGTTCTCCCTACCCAGATTAGCTGAT
AGCTCAAATTGGTAGACTGTGTGGAGAATTATTGGTGAATCATGAGATCA
TAGACTTGCAACCAGCAACTAGTGCTACACATATGGCAGCTGAAAGGAGA
CAACTATTTCTATGGGCCGTGATACCTGATCATGCAAAATAATGTAGTGC
TGAAGTATTCTGTCGTTATCTAACTCAACTCACTTAGTCACTCGCTTCTT
TTGCTGCAATTCACAGAAAGAAGTGACTTAGGCATCGTATGTCTCGGCTG
TTCATTACCAGTTCTTCTAGAGATTATCATGTCGAATTCAGATAACTTCA
TTAGTTGATAGTTTGGTCAGTTGCCGGATTTTTCCTGCTTTGAACTACAT
ATCTGCTGTAACTTATTGATTTTACTACTTTATTTCCAGAATATGGTTTA
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TTGCTAGTGATATTCCTAAGTTCTGTTCAGGACTAAGTGAACTTGTACAG
GATGATCTGATTGCAGTTGCTGATGGGTTAATATACATCTGGCGCATCTG
CTCTTATGCAAGTCCGAAATATGTTCTCTGGATTCTGGTAAAATAACTAT
TTACATGGCTGTTACCCTTGTTGATTTGTAGTACGACGTGGGAATTCTTA
TGGTTAAAGAAAAATGCTCCTCTATTCTGATGACACTATGCTGCCTTAAT
GTTTGTGTATACTGTAATATTATGAAACTAGCCTGCTCTTTAATTAGATA
CAATGTTAATAAGTAATTGCTTCCAGGCATACGTACTTGGTGCTGGTGGT
GTCATTAGAAAATTTTCTCCGTCTTTTGGGAAGTTGAAAGGCATGGAACA
ACAACTAGAAGGGGAATATCGGCAGGTTCATTCACGATTGAGAACTCATG
CTGAGAGCGTGGCATTTTACGGTGGTGAAAATAGAGAAGAATCACACATT
ATGCAGCGGTTCCAGGCTCTCGTGCGGCACTTGAATATTGTTCTTCATGA
GAACTGGTGGTTTGGCATGATTCAAGATTTTCTTCTCAAGTATCTTGGTG
CCACTGTGGGAGTCATCTTGATTGTGGAACCTTTCTTTGCCGGAGATCTT
AAACCCGATTCATCTACTTTAGGAAGGGCAGAGATGTTGAGCAACCTTCG
GTATCACACAAGTGTGATAATATCATTATTTCAGTCTCTCGGCACCCTTT
CTACCAGTTCAAGACGTTTAAATCTTCTTAGGTAAATATACACCATCCCT
TGTGAAATGCTTGAGTGACCTATATTTCAAGTAGACATTCAATTAAATAT
ATTATTCTTTGTCAAGTTTGTAGCTGTAAATTGCTGTAGTTCCATAGTTG
TTGGTGATATGATGTTTCCATGTACATGCTGTTCATGACTTCTACTGACT
GTTTGCTCACAATACTATATAATTCTTGTGATATCATTTAACACATGTTT
CCTTCTTTAACTTTTATTTACCCTTGAGTTCATATTTGTTTATTGAATGG
AGTTATCTATTCATCCGTGATGCTTCATCAATAAGAATCTCTCTGCTACT
TTGCGCTCCAGAATTTCTCTCTAAGACCCTCTTAAGTATTTTGCTGGAAT
TAAATCTAAAAGTATAAACTTCTGGCTTTTAAGAATTACATTGGTAATAT
GTGTTTATGCTTCTCAACAGTGATGCAACTTTAGATTGTGTGTTCTGTTC
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AGTTTGGAACCTTTTTCTATATGTATTTTATGCTGATAAACTCTCCGCTC
CGATTGACAGTGGCTATGCAGACCGCATCCATGAGTTACTGGATGTTTCA
CGTGAGCTATCTGGGGTTCGCGACAGATCGATGAATCAAAATTCTTCCGC
CAAAAATTATATTAGTGAGGCAAACTATATAGAATTTTCAGGTGTTAAGG
TAAGTATGATGGTGGAAGTAATATTCTTATTGTTATGTCAGTTTGATACC
AAGATATAAATAAATGTTTGTTACAGGTGGTGACACCCTCTGGGAATGTC
TTGGTTGACGATTTAACTCTTCGGGTGGAGTCGGGTTCTAATCTTTTGAT
CACTGGTAACCTCTCTAACTATCTATCCAATATTTGCTCCCACAAATCTG
GTCCTGAATCATGGCTATAATGGGATCTTAATCTATTTACGTGTCTTTGT
GTTATTTCAGGCCCCAACGGTAGTGGAAAAAGCTCTCTTTTCCGTGTTCT
TGGTGGCCTGTGGCCGCTTGTATCTGGCCACATTGTCAAACCTGGTGTTG
GTTCTAATCTTAACAAGGAAATCTTCTATGTCCCCCAGCGACCGTATACA
GCCGTTGGAACACTTCGCGACCAGCTAATCTATCCACTTACAGAAGATCA
GGAAACTGAACCACTTAGCTATGGTGGTATGGTGGATCTTCTAAAGAATG
TAATCATACCTAAACCAATACGCTGTCCTCTTCAACTATACCTGTTCATT
TTGTTTGTGTGCTTTCTTTCTCCTGAATAAGTAATTAATTAACTTTTCTG
GAGATTCTTACTGTTGTCTTTTCCTTTTTCAGGTTGACTTAGAATATTTG
CTAGAACGATACCCTCTCGACAATGAAGTTAACTGGGGTGATGAATTGTC
TCTTGGTGAGCAACAAAGATTGGGAATGGCCAGATTGTTCTACCATAAGC
CCAAGTTTGCCATCCTGGATGAGTGTACTAGTGCTGTAACAACTGATATG
GAAGAACGATTCTGCCAAAGGGTTCGAGCAATGGGCACGTCATGCATAAC
AATATCTCATCGTCCAGCATTAGTTGCATTTCACGATGTTGTTTTGTCCT
TGGATGGTGAAGGGGGATGGACAGTTCAAGATAACAGGTTATATTCATGA
GATTTTGCTTTCCTTTTTGTCCTTTAGACATTCTGTTTTTAAAAAGCTGA
ATGTTCTGTGATCCTCTTGTTTTTGTAGGAATGGGTCCTTCCTTCCTACT
GAATCGGAGGTTGATGTATTGAAGTCATCAGAAACTGACCGAAAATCTGA
TGCACTTGCTGTTCAAAGGGCTTTTAGTACCAACACAAAGGTACTTATTA
TTTCATATTGCCTGTTCTGCTGTTGTTGGTATTAGATGTGTCACTCTTTA
ACACATTTCATTTACCAGGGAAATTCTTTATCAGGTCCCAAGGAGCATTC
TTATTCAACACAGGTCATAGCTACTTCCCCTAATATGGAAATAGAATCCA
CAGAACAACCGCATATGATTCAACAATTACAGTGCTCACCTAGACCTTTG
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TATTTGATTAATGGTCTTTATTATATATATTTAACTCTAATGATATTCTT
CAATACTTTGTCAGGTTCCTAAAATAATTGATAAGCAAGGGGGGCAATTG
CTTGCAGTTGCAGTACTTGTGCTCTCTCGGACTTGGATATCAGATCGTAT
AGCTTCACTAAATGGTTGGTTCTCTGTGTGTCTTCCGTTACTAGAATAAC
TGGAACAGCCAGTGTACCATTTGTTTACATGTTGCACATCTTGGCAGGTA
CTAGTGTTAAGTATGTCCTGGAGCAGGACAAGGCTGCCTTCATTCGGTTG
ATTGGGATCAGTGTAATGCAAAGTGCTGCTAATGCAATTGTGGCACCATC
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TGATGGTGCAGTGCTTGTCACAATATGTATTTAACCATTTTTTACATTGG
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CCATCTACTTGCATATTATTTGAAAAGAAATGCTTTTTACAAGGTAAATT
GCCTCAACAGATGTTCAATTTACAATTCATTTCTTTCCAATTTGTATCAG
TTGTTGCTAGTATTACTCTGGCATGATGTTATTTCTGTTTGCATAAAAGC
TGAGTATTTTGATATTTTCTCCCAGGTATTTAACATGACAGGCATGGACA
TTGATGCAGACCAAAGAATAACACGTGATGTGGAGAAATTGACCAACGAT
CTTGCTGGCTTAGTTACTGGAATGGTGAAACCACTGGTTGACATTATTTG
GTTAGTTCTTCGTGGCCTAATGTGTTCTTTAGGTGTACTTCTGTTAATCA
GTTTTTCATAATAAAGCTAATGCTACTCGCCAGGTTTACATGGAGAATGA
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CTAGGGCTTGGTTTTCTAAGAGCCGTTTCCCCTGACTTCGGTGATCTTTC
AAACCAAGAACAAGAACTTGAAGGTTCTTTCAGGTTAGTCACATAATTTG
TTGGATATTTGCGAATTTGGCTTTCTTATAACATGATTAACTTCCAGTAT
TGACCTTGTAACATCTGTACAAGGTTCATGCACTCAAGACTGCGAACACA
TGCTGAGTCAATTGCATTCTTTGGCGGTGGATCAAGGGAACGAGCTGTGA
GTTATTCATGCTCAAGCTTTATGCACTTTATGTACTCCCTCCGATCCAAA
TTAATTGACTTGGATTTGTCTAAATTCGGATGTATCTAGTATTAAAACAA
GTCTACATACATCTGAATCTAGACAAATCTAAGTCAATTAATTTGAACCG
GAGGGAGTATTCTGATTCTTGTAAAGATTATGGTTCTTTTTTCTATTTGT
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TGAATGATCCATATGTAGTTAAATCACAAATATCTTCTGATTTTTTTTTT
AATAAAACAGAAGTCTGTAGCTTCATCTGCACATCTAGCATCTGTTAGTA
TAAGTATATGCCCTCACTTTGTGATTATTTTCTTAAAATCAGATGGTTGA
AGCTAAATTCAACACTCTGCTTAACCACTCGAAGATTCTTCTGAGGAAAA
GATGGCTTTATGGTATTTTTGATGATTTCGTGACGAAGCAGCTGCCTCAC
AATGTGACATGGGGACTGAGTATGTTATATGCATTGGAACACAAAGGGGA
CCGAGCTTTGACTTCAACTCAAGGTTGATAAATCTTGAAATGGATCCATT
TTCCAGTCTATATTATTTGCATATAGAATTTTACGATATGTTCTCCTTTT
GAAATTACAGGAGAGTTAGCACACGCACTACGGTTCTTGGCATCTGTAGT
GTCACAAAGCTTCATAGCTTTTGGTGATATTCTCGAGTTGCACAAGAAAT
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TAGTGAGATGAAAGTCAATGATCTATTTAGTACCAACTTGTTGTACACCC
ACAACAATGTCTGAGTCAGAAGGCTATGCCATTCTCCTATTTTGGTCAAC
CATTGTGAAATCTGCCACAAGCCCTTGCACTGAAATTATGAACACTAACT
TCCCATATGATAAATTTTGTCTGAGCATGTTCAGTCTAGCATCAAAAGAG
TTAATCTTATATTTGCAAGCTTTGTCCAACTATGTGAAGTCGTTAGTGTA
TATTTAGATACAACAAATTCGTGATTGAGGAAAAATTAAAATTCACTGTA
TACCTATAATTTCTCGACACTGAAAAACTGTCAGTTTTTCTAGCATTGCT
GGCTATTCGATATACTTCACTGCAACATTTCTGTTTGTTTAAAACAAATA
ACTTGCCCCAACTGGCTAAGAAGTACCACCATTACTGATTGTAGAAACTT
TTGTACTCAAGTGATTACCCATATCATATTCTTGACCGTCTTGACAAGAG
CTGGAAATTTGTTCATCTAATTTATCAGCTGCTGAATTATTATGCTCATA
TTCAGTTGATGAAGTTAAAAAGGTTAAAGCTTTAGCTTGTGGAATCTTGA
TGCTATGAATTGCACCTGAATATAATACTTTTGTTTTTCTAGATGCTGTC
ATGCCTTCAAATGTTCTTAGTGTGGCGTCCGAAGAAATTATTTCCTTCCG
TGATGTCGATATTGTGACCCCATCGCAAAAGCTATTGGCTAGCCAATTGT
CTTGTGACGTGTCTCAAGGAAAAAGCCTTCTTGTCACTGGTATGTCATCT
GACAACTGCTTGACCTTGTATTCAGCACCATGTAAACAATGCTTTTCTAA
TATCTGTGATGATGTCTTCTGAAGGTCCAAACGGCAGTGGAAAGAGTTCC
ATTTTTAGGGTGCTCCAAGGTTTGTGGCCTGTAGCTTCTGGAAGACTTAC
CGTGCCGTCTGAAGGGATATTCCATGTTCCTCAGCGTCCATATACTTGTC
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GGAACATACGTTTGTAAACCTCCTCAACTAAATTTCAAGGATGCATCAAA
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GTGATAGGTCTACTGCTTCCGGGTCGCTGGATGACCACCTGAGGACTATT
CTAGAGAATGTTCGCTTGGTCTATCTTCTCGAGAGAGAAGGTTGGGATGC
TACTCCCAATTGGGAAGATATTTTGTCGTTGGGAGAGCAGCAGAGGCTTG
GCATGGTCAGTGGTTAATACATACAGTTTGTTTCGACCTAATCTATGTAC
CTTGCTTTGAACTGAACTGTGTATTAACTGGGAATAACTTATTTCTTGCC
AGGCTCGTTTGTTCTTCCAATGTCCTAAATTTGGTATCCTTGACGAGTGC
ACCAAGTACGTGTCGTACGACAATATATATATTTTACTTTCAGTTTGTTT
ATCAATTGATGTGCTTAAAAACATATACTCACTGCAGTGCCACAAGTGTC
GATGTGGAGGAGCATTTGTACAGGCTAGCAACCGACATGGGTATAACTGT
GGTCACTTCCTCACAAGTAAGTACTCTATTCATCAATTTATCTCGAGCCT
CTGAAAGTTGAGACAGCAACAACAGCTCTGGGAATTGGAGCCGATTTCTG
TGTCCAACTTGATTTTGGTTCTAGTTCCCTACTTCTGGCCCTTCTAGTTT
GTGTCTTTCTTAATGTGAAGTATATTGCTGAAGCATTGTCTCATTTATTT
GTTTTATTACAGAGGCCTGCTCTGATACCCTTCCATTCACTGGAACTGAA
ACTCATTGACGGCGAAGGGAAGTGGGAGCTATGTGCAATCAACCAGTAGT
TGGTCGCTGCCGATCGCTTTTAGTCACTCTCGGTTGTATACTAACTTACA
GTACAAATAGTCAACAGCTGCTGCCTATGAAAGCCAGGGCGGCAGCATCC
AATTGGAGATAGAGCAGAACAATATACGGAGGTTGTAGAAGGGAAATGTT
CTTCTTTTCAGCAGGATAGCATGGGTAGTACATAGTATTGTTGTTCTCAT
ACAGAATACACACAATGAGATGACTTCGCCACCGAAATCGAGCTGTGGCG
TGTAGCAATTATTTATTTTGTATAAACACGGGCACGAAGCATGCCCTTGT
AAAGGGTGACTAATAGAAATCCATCTTCCTGATGCCTTTGCCTTTGCCTG
GTTTTGTTCCATGCTTCCGAGTGAGCTGAATGTGAAACTCTTTCTGTCGC
TCCAACTTGTCGACTTGCTGCATTGACTTTGGATGTGCCGAGTTTATGCT
GAACGGTTTCGCAGTTCATATTTTGAGTTGAGGTCTGCTACATTTGGACG
ATGAGTACAGTTCAGTAAGAATGATGGAATGAATACGGACTGGGAGCCAC
TTGCTTTTGTTGTGCTAATAGTATTTTTCTTTTCCCGTTGTTTAGTGAAC
GATCGTACACACGCAGGAGCTCATTTTACACTGACAGAAAGTGTGTTAAA
AACCTGACATTTTTCCGTAAGCTCTAGAGCTAAGAGGAGACTTGCTGGGA
GAGGAGGACGAGGAGGCCCTGCGGGCCGACGAGGATCTCGCTGAGGAAGC
TGACGAGGCCGAACCAGACGACGGGGGTGACGTCGACGCCGCCCAGCGGC
GGGATCACCTTCCTGGTGGCGGCGAGGATGGGCTCCGTGGGCGCGTACGC
CACCACGTACGGGAACTTGGTCACCGGCAGCCTCGGGTACCACGACATGA
CGATCCGCGCGATGAACAGGAACCCAAACGCCGACAGCGCCGGCCCCGCC
AGCCCGATCACCACCTTCGCCGTCGCCGGGTCCAGGTCCCCCAGCACCAG
CATCGCCGCCGACCCGTGGTGCAGCTGGGCCTGGGCGGCGTGGCACGGCA
GGGCGGCGGTGTTGCTGCTCATGGCGGCCATGCCCGCGGCCAGTAGGTGC
TGGCCGTGAGTTCCTCTGGTCTGCTTGCTCGGTGCGCCCTCGCTGCTTCC
CCCTTCCGTCCGCCGAGTCTCGAGGTCCTGCTCGACAGGGCACACTGTGA
GACTGATTGATGGAGCTAGCTGAATCCTCTGACAAGGATTTCGAAGTAGA
GGGAGTAATAAACAATCAACCAACCTTGCCGCGGCCGCCGGCGCCGGCAA
CGATGCACCACCTCGTGGACGACCCTCCCCTCGCCGGAGAGAACAGTGAC
GAAGGCTTCGGCGCCACGAGCATGGAGGCTTCCATGAGTGCGAGAGAAGG
AAGAAAAACAGAGGAGAGCGAAAGAGGCAGCGTCTCGTGGCCTCCTTTGC
TCGCGTTCGGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.