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GrainGenes Sequence Report: AA051084

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Sequence
AA051084
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA051084
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATAAGTACGATAAGAACGTACCAAGTGATTATGATGGTCTGTTCCA
AAAGGCTGCTGATGCCAACGGGGTCTCTTATGACCTTTTACGTAAAGTCG
CTTGGACAGAATCACGATTTGTGCCTACAGCAAAATCTAAGACTGGACCA
TTAGGCATGATGCAATTTACCAAGGCAACCGCTAAGGCCCTCGGTCTGCG
AGTTACCGATGGTCTAGACGACGACCGACTGAACCCTGAGTTAGCTATTA
ATGCTGCCGCTAAGCAACTTGCAGGTCTGGTAGGGAAGTTTGATGGCGAT
GAACTCAAAGCTGCCCTTGCGTACAACCAAGGCGAGGGACGCTTGGGTAA
TCCACAACTTGAGGCGTACTCTAAGGGAGACTTCGCATCAATCTCTGAGG
AGGGACGTAACTACATGCGTAACCTTCTGGATGTTGCTAAGTCACCTATG
GCTGGACAGTTGGAAACTTTTGGTGGCATAACCCCAAAGGGTAAAGGCAT
TCCGGCTGAGGTAGGATTGGCTGGAATTGGTCACAAGCAGAAAGTAACAC
AGGAACTTCCTGAGTCCACAAGTTTTGACGTTAAGGGTATCGAACAGGAG
GCTACGGCGAAACCATTCGCCAAGGACTTTTGGGAGACCCACGGAGAAAC
ACTTGACGAGTACAACAGTCGTTCAACCTTCTTCGGATTCAAAATGCTGC
CGAAGCTGAACTCTCCAACTCAGTCGCTGGGATGGCTTTCCGTGCTGGTC
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ACCTCGATGACCTCATTAAATTGGCTAACGAGAACTTTGAGAATGACTCC
CGCGCTGCCGAGGCTGGCCTAGGTGCCAAACTGAGTGCTGGTATTATTGG
TGCTGGTGTGGACCCGCTTAGCTATGTTCCTATGGTCGGTGTCACTGGTA
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TGTCTGCAATCAGTGACGCTGTAGCTGCTGGACTGAAACGCAGTAAACCA
GAAGCTGAGTTCGACAATGAGTTCATCGGTCCTATGATGCGATTGGAAGC
CCGTGAGACAGCACGAAACGCCAACTCTGCGGACCTCTCTCGGATGAACA
CTGAGAACATGAAGTTTGAAGGTGAACATAATGGTGTCCCTTATGAGGAC
TTACCAACAGAGAGAGGTGCCGTGGTGTTACATGATGGCTCCGTTCTAAG
TGCAAGCAACCCAATCAACCCTAAGACTCTAAAAGAGTTCTCCGAGGTTG
ACCCTGAGAAGGCTGCGCGAGGAATCAAACTGGCTGGGTTCACCGAGATT
GGCTTGAAGACCTTGGGGTCTGACGATGCTGACATCCGTAGAGTGGCTAT
CGACCTCGTTCGCTCTCCTACTGGTATGCAGTCTGGTGCCTCAGGTAAGT
TCGGTGCAACAGCTTCTGACATCCATGAGAGACTTCATGGTACTGACCAG
CGTACTTATAATGACTTGTACAAAGCAATGTCTGACGCTATGAAAGACCC
TGAGTTCTCTACTGGCGGCGCTAAGATGTCCCGTGAAGAAACTCGATACA
CTATCTACCGTAGAGCGGCACTAGCTATTGAGCGTCCAGAACTACAGAAG
GCACTCACTCCGTCTGAGAGAATCGTTATGGACATCATTAAGCGTCACTT
TGACACCAAGCGTGAACTTATGGAAAACCCAGCAATATTCGGTAACACAA
AGGCTGTGAGTATCTTCCCTGAGAGTCGCCACAAAGGTACTTACGTTCCT
CACGTATATGACCGTCATGCCAAGGCGCTGATGATTCAACGCTACGGTGC
CGAAGGTTTGCAGGAAGGGATTGCCCGCTCATGGATGAACAGCTACGTCT
CCAGACCTGAGGTCAAGGCCAGAGTCGATGAGATGCTTAAGGAATTACAC
GGGGTGAAGGAAGTAACACCAGAGATGGTAGAGAAGTACGCTATGGATAA
GGCTTATGGTATCTCCCACTCAGACCAGTTCACCAACAGTTCCATAATAG
AAGAGAACATTGAGGGCTTAGTAGGTATCGAGAATAACTCATTCCTTGAG
GCACGTAACTTGTTTGATTCGGACCTATCCATCACTATGCCAGACGGACA
GCAATTCTCAGTGAATGACCTAAGGGACTTCGATATGTTCCGCATCATGC
CAGCGTATGACCGCCGTGTCAATGGTGACATCGCCATCATGGGGTCTACT
GGTAAAACCACTAAGGAACTTAAGGATGAGATTTTGGCTCTCAAAGCGAA
AGCTGAGGGAGACGGTAAGAAGACTGGCGAGGTACATGCTTTAATGGATA
CCGTTAAGATTCTTACTGGTCGTGCTAGACGCAATCAGGACACTGTGTGG
GAAACCTCACTGCGTGCCATCAATGACCTAGGGTTCTTCGCTAAGAACGC
CTACATGGGTGCTCAGAACATTACGGAGATTGCTGGGATGATTGTCACTG
GTAACGTTCGTGCTCTAGGGCATGGTATCCCAATTCTGCGTGATACACTC
TACAAGTCTAAACCAGTTTCAGCTAAGGAACTCAAGGAACTCCATGCGTC
TCTGTTCGGGAAGGAGGTGGACCAGTTGATTCGGCCTAAACGTGCTGACA
TTGTGCAGCGCCTAAGGGAAGCAACTGATACCGGACCTGCCGTGGCGAAC
ATCGTAGGGACCTTGAAGTATTCAACACAGGAACTGGCTGCTCGCTCTCC
GTGGACTAAGCTACTGAACGGAACCACTAACTACCTTCTGGATGCTGCGC
GTCAAGGTATGCTTGGGGATGTTATTAGTGCCACCCTAACAGGTAAGACT
ACCCGCTGGGAGAAAGAAGGCTTCCTTCGTGGTGCCTCCGTAACTCCTGA
GCAGATGGCTGGCATCAAGTCTCTCATCAAGGAACATATGGTACGCGGTG
AGGACGGGAAGTTTACCGTTAAGGACAAGCAAGCGTTCTCTATGGACCCA
CGGGCTATGGACTTATGGAGACTGGCTGACAAGGTAGCTGATGAGGCAAT
GCTGCGTCCACATAAGGTGTCCTTACAGGATTCCCATGCGTTCGGAGCAC
TAGGTAAGATGGTTATGCAGTTTAAGTCTTTCACTATCAAGTCCCTTAAC
TCTAAGTTCCTGCGAACCTTCTATGATGGATACAAGAACAACCGAGCGAT
TGACGCTGCGCTGAGCATCATCACCTCTATGGGTCTCGCTGGTGGTTTCT
ATGCTATGGCTGCACACGTCAAAGCATACGCTCTGCCTAAGGAGAAACGT
AAGGAGTACTTGGAGCGTGCACTGGACCCAACCATGATTGCCCACGCTGC
GTTATCTCGTAGTTCTCAATTGGGTGCTCCTTTGGCTATGGTTGACCTAG
TTGGTGGTGTTTTAGGGTTCGAGTCCTCCAAGATGGCTCGCTCTACGATT
CTACCTAAGGACACCGTGAAGGAACGTGACCCAAACAAACCGTACACCTC
TAGAGAGGTAATGGGCGCTATGGGTTCAAACCTTCTGGAACAGATGCCTT
CGGCTGGCTTTGTGGCTAACGTAGGGGCTACCTTAATGAATGCTGCTGGC
GTGGTCAACTCACCTAATAAAGCAACCGAGCAGGACTTCATGACTGGTCT
TATGAACTCCACAAAAGAGTTAGTACCGAACGACCCATTGACTCAACAGC
TTGTGTTGAAGATTTATGAGGCGAACGGTGTTAACTTGAGGGAGCGTAGG
AAATAATACGACTCACTATAGGGAGAGGCGAAATAATCTTCTCCCTGTAG
TCTCTTAGATTTACTTTAAGGAGGTCAAATGGCTAACGTAATTAAAACCG
TTTTGACTTACCAGTTAGATGGCTCCAATCGTGATTTTAATATCCCGTTT
GAGTATCTAGCCCGTAAGTTCGTAGTGGTAACTCTTATTGGTGTAGACCG
AAAGGTCCTTACGATTAATACAGACTATCGCTTTGCTACACGTACTACTA
TCTCTCTGACAAAGGCTTGGGGTCCAGCCGATGGCTACACGACCATCGAG
TTACGTCGAGTAACCTCCACTACCGACCGATTGGTTGACTTTACGGATGG
TTCAATCCTCCGCGCGTATGACCTTAACGTCGCTCAGATTCAAACGATGC
ACGTAGCGGAAGAGGCCCGTGACCTCACTACGGATACTATCGGTGTCAAT
AACGATGGTCACTTGGATGCTCGTGGTCGTCGAATTGTGAACCTAGCGAA
CGCCGTGGATGACCGCGATGCTGTTCCGTTTGGTCAACTAAAGACCATGA
ACCAGAACTCATGGCAAGCACGTAATGAAGCCTTACAGTTCCGTAATGAG
GCTGAGACTTTCAGAAACCAAGCGGAGGGCTTTAAGAACGAGTCCAGTAC
CAACGCTACGAACACAAAGCAGTGGCGCGATGAGACCAAGGGTTTCCGAG
ACGAAGCCAAGCGGTTCAAGAATACGGCTGGTCAATACGCTACATCTGCT
GGGAACTCTGCTTCCGCTGCGCATCAATCTGAGGTAAACGCTGAGAACTC
TGCCACAGCATCCGCTAACTCTGCTCATTTGGCAGAACAGCAAGCAGACC
GTGCGGAACGTGAGGCAGACAAGCTGGAAAATTACAATGGATTGGCTGGT
GCAATTGATAAGGTAGATGGAACCAATGTGTACTGGAAAGGAAATATTCA
CGCTAACGGGCGCCTTTACATGACCACAAACGGTTTTGACTGTGGCCAGT
ATCAACAGTTCTTTGGTGGTGTCACTAATCGTTACTCTGTCATGGAGTGG
GGAGATGAGAACGGATGGCTGATGTATGTTCAACGTAGAGAGTGGACAAC
AGCGATAGGCGGTAACATCCAGTTAGTAGTAAACGGACAGATCATCACCC
AAGGTGGAGCCATGACCGGTCAGCTAAAATTGCAGAATGGGCATGTTCTT
CAATTAGAGTCCGCATCCGACAAGGCGCACTATATTCTATCTAAAGATGG
TAACAGGAATAACTGGTACATTGGTAGAGGGTCAGATAACAACAATGACT
GTACCTTCCACTCCTATGTACATGGTACGACCTTAACACTCAAGCAGGAC
TATGCAGTAGTTAACAAACACTTCCACGTAGGTCAGGCCGTTGTGGCCAC
TGATGGTAATATTCAAGGTACTAAGTGGGGAGGTAAATGGCTGGATGCTT
ACCTACGTGACAGCTTCGTTGCGAAGTCCAAGGCGTGGACTCAGGTGTGG
TCTGGTAGTGCTGGCGGTGGGGTAAGTGTGACTGTTTCACAGGATCTCCG
CTTCCGCAATATCTGGATTAAGTGTGCCAACAACTCTTGGAACTTCTTCC
GTACTGGCCCCGATGGAATCTACTTCATAGCCTCTGATGGTGGATGGTTA
CGATTCCAAATACACTCCAACGGTCTCGGATTCAAGAATATTGCAGACAG
TCGTTCAGTACCTAATGCAATCATGGTGGAGAACGAGTAATTGGTAAATC
ACAAGGAAAGACGTGTAGTCCACGGATGGACTCTCAAGGAGGTACAAGGT
GCTATCATTAGACTTTAACAACGAATTGATTAAGGCTGCTCCAATTGTTG
GGACGGGTGTAGCAGATGTTAGTGCTCGACTGTTCTTTGGGTTAAGCCTT
AACGAATGGTTCTACGTTGCTGCTATCGCCTACACAGTGGTTCAGATTGG
TGCCAAGGTAGTCGATAAGATGATTGACTGGAAGAAAGCCAATAAGGAGT
GATATGTATGGAAAAGGATAAGAGCCTTATTACATTCTTAGAGATGTTGG
ACACTGCGATGGCTCAGCGTATGCTTGCGGACCTTTCGGACCATGAGCGT
CGCTCTCCGCAACTCTATAATGCTATTAACAAACTGTTAGACCGCCACAA
GTTCCAGATTGGTAAGTTGCAGCCGGATGTTCACATCTTAGGTGGCCTTG
CTGGTGCTCTTGAAGAGTACAAAGAGAAAGTCGGTGATAACGGTCTTACG
GATGATGATATTTACACATTACAGTGATATACTCAAGGCCACTACAGATA
GTGGTCTTTATGGATGTCATTGTCTATACGAGATGCTCCTACGTGAAATC
TAAAGTTAACGGGAGGCATTATGCTAGAATTTTTACGTAAGCTAATCCCT
TGGGTTCTCGCTGGGATGCTATTCGGGTTAGGATGGCATCTAGGGTCAGA
CTCAATGGACGCTAAATGGAAACAGGAGGTACACAATGAGTACGTTAAGA
GAGTTGAGGCTGCGAAGAGCACTCAAAGAGCAATCGATGCGGTATCTGCT
AAGTATCAAGAAGACCTTGCCGCGCTGGAAGGGAGCACTGATAGGATTAT
TTCTGATTTGCGTAGCGACAATAAGCGGTTGCGCGTCAGAGTCAAAACTA
CCGGAACCTCCGATGGTCAGTGTGGATTCGAGCCTGATGGTCGAGCCGAA
CTTGACGACCGAGATGCTAAACGTATTCTCGCAGTGACCCAGAAGGGTGA
CGCATGGATTCGTGCGTTACAGGATACTATTCGTGAACTGCAACGTAAGT
AGGAAATCAAGTAAGGAGGCAATGTGTCTACTCAATCCAATCGTAATGCG
CTCGTAGTGGCGCAACTGAAAGGAGACTTCGTGGCGTTCCTATTCGTCTT
ATGGAAGGCGCTAAACCTACCGGTGCCCACTAAGTGTCAGATTGACATGG
CTAAGGTGCTGGCGAATGGAGACAACAAGAAGTTCATCTTACAGGCTTTC
CGTGGTATCGGTAAGTCGTTCATCACATGTGCGTTCGTTGTGTGGTCCTT
ATGGAGAGACCCTCAGTTGAAGATACTTATCGTATCAGCCTCTAAGGAGC
GTGCAGACGCTAACTCCATCTTTATTAAGAACATCATTGACCTGCTGCCA
TTCCTATCTGAGTTAAAGCCAAGACCGGACAGCGTGACTCGGTAATCAGC
TTTGATGTAGGCCCAGCCAATCCTGACCACTCTCCTAGTGTGAAATCAGT
AGGTATCACTGGTCAGTTAACTGGTAGCCGTGCTGACATTATCATTGCGG
ATGACGTTGAGATTCCGTCTAACAGCGCAACTATGGGTGCCCGTGAGAAG
CTATGGACTCTGGTTCAGGAGTTCGCTGCGTTACTTAAACCGCTGCCTTC
CTCTCGCGTTATCTACCTTGGTACACCTCAGACAGAGATGACTCTCTATA
AGGAACTTGAGGATAACCGTGGGTACACAACCATTATCTGGCCTGCTCTG
TACCCAAGGACACGTGAAGAGAACCTCTATTACTCACAGCGTCTTGCTCC
TATGTTACGCGCTGAGTACGATGAGAACCTGAGGCACTTGCTGGGACTCC
AACAGACCCAGTGCGCTTTGACCGTGATGACCTGCGCGAGCGTGAGTTGG
AATACGGTAAGGCTGGCTTTACGCTACAGTTCATGCTTAACCCTAACCTT
AGTGATGCCGAGAAGTACCCGCTGAGGCTTCGTGACGCTATCGTAGCGGC
CTTAGACTTAGAGAAGGCCCCAATGCATTACCAGTGGCTTCCGAACCGTC
AGAACATCATTGAGGACCTTCCTAACGTTGGCCTTAAGGTGATGACCTGC
ATACGTACCACGATTGTTCCAACAACTCAGGTCAGTACCAACAGAAGATT
CTGGTCATTGACCCTAGTGGTCGCGGTAAGGACGAAACAGGTTACGCTGT
GCTGTACACACTGAACGGTTACATCTACCTTATGGAAGCTGGAGGTTTCC
GTGATGGCTACTCCGATAAGACCCTTGAGTTACTCGCTAAGAAGGCAAAG
CAATGGGGAGTCCAGACGGTTGTCTACGAGAGTAACTTCGGTGACGGTAT
GTTCGGTAAGGTATTCAGTCCTATCCTTCTTAAACACCACAACTGTGCGA
TGGAAGAGATTCGTGCCCGTGGTATGAAAGAGATGCGTATTTGCGATACC
CTTGAGCCAGTCATGCAGACTCACCGCCTTGTAATTCGTGATGAGGTCAT
TAGGGCCGACTACCAGTCCGCTCGTGACGTAGACGGTAAGCATGACGTTA
AGTACTCGTTGTTCTACCAGATGACCCGTATCACTCGTGAGAAAGGCGCT
CTGGCTCATGATGACCGATTGGATGCCCTTGCGTTAGGCATTGAGTATCT
CCGTGAGTCCATGCAGTTGGATTCCGTTAAGGTCGAGGGTGAAGTACTTG
CTGACTTCCTTGAGGAACACATGATGCGTCCTACGGTTGCTGCTACGCAT
ATCATTGAGATGTCTGTGGGAGGAGTTGATGTGTACTCTGAGGACGATGA
GGGTTACGGTACGTCTTTCATTGAGTGGTGATTTATGCATTAGGACTGCA
TAGGGATGCACTATAGACCACGGATGGTCAGTTCTTTAAGTTACTGAAAA
GACACGATAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGGAGGGACGAAAGGT
TACTATATAGATACTGAATGAATACTTATAGAGTGCATAAAGTATGCATA
ATGGTGTACCTAGAGTGACCTCTAAGAATGGTGATTATATTGTATTAGTA
TCACCTTAACTTAAGGACCAACATAAAGGGAGGAGACTCATGTTCCGCTT
ATTGTTGAACCTACTGCGGCATAGAGTCACCTACCGATTTCTTGTGGTAC
TTTGTGCTGCCCTTGGGTACGCATCTCTTACTGGAGACCTCAGTTCACTG
GAGTCTGTCGTTGCTCTATACTCACTTGTAGCGATTAGGGTCTTCCTGAC
CGACTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.