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GrainGenes Sequence Report: AA025741

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Sequence
AA025741
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA025741
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCTCAAGACCGCGCTCGTCCACATGTACTCCAGCTGGACCTCTGCAGCTG
CGGCTTGATGGACATTGCCCACGCCGTGCTCTGCTCCACGCCTGAAACCG
ATGTTGTGCTCTGGACCGCCATGATTGCTGGCTACTCACAGACCAGAGAC
CTTCAGGCCACTCTGCGGATGTTTCTTCACATGGAACTCGCCGCGGTACA
GCCCAGTGCCTTCACCTTCGCAGGGATCATCACCGCCTGCTCTTCCTCTG
CCCCAGCCACCCAGGCGTTCCAAACTCCAAACTGGACGGCAGCTCCATGC
CCGCGTGTTCAAGTTTGCTCTGGAGCAGGACATCTCTGTCTGCAATGCGC
TCGTCGACTTCTGCAGCAAGTCCTCCACCCGTTTACTCAACTTGCTCCAC
GCGTTCGATGCCACCGACATGCCAAATGTGGTGTCCTGGACCGCCTTGAT
AGCTGGACTTGCACACCATGGCAGAGATGGGGACGCGTTTGCGGCGTTCA
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CCATGCTTACGTGCTCAAGACCAGCTCTGAGTCTTTGGATGTGGCTGTTG
GGAACTTGCTGGTTGATCGGTATTCCAGGTTTGGAAGAACGGATGACGCG
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TGAGATGAACGGATGTCAACGAAGCCTATTCAGGAGGAGGTCCGTATCGA
CGGCGTCAGTCTCGCCTGCTTCCTTTCTGCTGCTGCAAGTTTGCCATCCA
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AGCCATGTCTCAGTTTCTAACAGCCTTATCAACATGTACAGCAAGCACAA
GTGTTTGGAGGATGCTAAGAGTGTTTTCCAGTCAATTAGAGAGCCAGGTG
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CTCTTTGCCTGGATATCTTACTCACACAAAAAGGTAAAAAATCTGGAATA
TGGAGTTAATGTTGAGTTTTGAATAAAATATCTAAACTGAATATGGCATG
AGGATTGGAAGTGTTTGAACTCTCCTGCAGAGTGCAGACTTACCTCTTAG
TGTAGTATACAGAATTACAGATTCTGGGATATGGACCCCTCTTAAAGAAA
AACCTAGTCATATATTATAAAATTGTACATCAGCTTGTACACAAGAATAC
ATCGGCAGAACTTCTAAGGGACACTTCTATTTAATGATGCTAAGAAAATA
TTAGGATGTGGATGTGGCAGTACAATTGCTGATTACTACTTATAGCAATA
TCCTGTGGTTACATTTGTCCCTACGCTAACAACCATTTTCTTTAAGAGTG
AAATGATGTCCATTTCTGTTTCACAGGAGCAATACTAGGATTGGCCTGGG
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TTCTTATAGGCCCTTTGCTGATCCTTCACTCGGTGATGTTAACCGGTAAT
TGATTACAACCACACAACTTCTTTGCGAATTGCTATTCTTTTGAATGTGT
AGTTTTCTGCGGTATTAGTTCCTTACACGAACCACTTGAATATGTTATAC
AAAACACTGAGCACCATAGTCAATCCTTGTGCCACAAATGACCACAAGCG
GATGTAATATGCAAGAAGATAGACGACAAACGGTTCCATGCAGAATTTGT
AAAGCTTCATGATGGGCCGAACTAATGCTTCAGGATTCTGTAGAAATGCT
GCACGTGTATTTCCATGCTTAGCTGGATTTTAGTAGCACTAGGTTATATA
CTAAATATTTGATTTTGTGAAGCACATACCTTCAGCTTCTTTTGGAAGTG
TGTCGAACAATATGGCAACGAATTGAAGTATTTCCTGCAAAAAATGGAAT
ATTATATGGAAAGCAAATAGCTAGAGGTTTGGTAATCAGACTAATATAGT
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TTTACCTCCAAATTAAAATTATCTAGAGTCCAAACCCTCATTTCCAAATA
AAACCGTAAGAAATATAACCACCATTATAGTTGTAATATCTTTCCGGACA
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GCTGAACACATGTAGATACTGCAGCCTTTGGTAAATGGGATGATCTTACC
GTTCCACTCTGCGAAAAAATGATATCACTATCATGCACCAGAATGCCTGT
CACTTATAATTCGAATTTCATGCTGCAGGATCTTACCGAGGTGCCACATT
ACAGCAATAGTGGGTTCTACTCCTTGACAAACCTCATCAATAGCAAATTT
AACATTCTTCCTCATAGCTGCCATAAGCCTTGTGAAATAGGTATGGGTAT
TCTGCATGCAGCAATTTTTTTGTGAACTCCTGAGTATAGGAACTTGATTT
TAAACTAACAGCTCGATGGTAAAAAAAGTATGCAGAGGACTGAACCATGA
GATATTAGAGCAGAACAAGAAAATGAGGTGCGAGTAATTAAAACCTTGAC
GTCCAGCGGTTTATAATATGAAGTGTGCTCGACGACGCAATCAGGGCCAA
GCAGCTTCTTGAGCCGCGTGATGTCCTTGTCATTGATGGAGGAGTAGAAC
TCCTGGATCACATCTGTCAGGGGTGAAGACGGCAATGTATTACCTCCGCC
GTAAGCATTGTCAAGTCCCCCGGTTGATTTTGGCCCTAGTACTGCTTGTT
TGGGCTTTGGCATAAATGGCTGCCTCGTTCCCCAGCTGGCGCTTATCTGC
CGGTGTCGGGATGGCGTGTGCTGTTTGAGGCTGAAAGAGGGGGACTGGAA
GGAGATGAGCGTGAGGGCAGAATTCATGGTGTTTGAATGCAGGAAGACTG
TGAGGCGTAGAGGAACGAGGTGTGATATAGGGATGGTGGGCATTTTTGGT
TGCTTGGTAGTTAGAGAATGGATCTGAGTACAGAGGGGGTGGCTTCCTGG
CATGGAATTGGATAAAATTTGCGTGCTGCATTGCTAAAGCATAAGGATTC
GTTACAACATGAAGTATGGAATCGCTTCCTACATAATTTACAAAGCCTGG
GCAGGCAAGAATCTGTTAAAAAGCTATTGCTTTGTTTTACTTTTGCTATG
TTTTACATTGGGTTCCCCAGAGAGTAGCAGGCAGGCAGAGGTCGTCTTTG
TTTTACTTCTGCTATGCTTTTCCTTTTCCTTGGAAGAATCCTAAGACTGT
CTTCTTGGAGGGCGGCTTGTACTTGCTCGACTTCCCGGCAGCCTTCTTTG
CGGCAGCAGCAAGAGGAGGAGCAGCACCAGCAGCAGGAGCAGATTCAGGA
AGAGGAGGACGAGGGAACATGTCTTGCTCCCTGACCCCCTTCTCCGTGGC
CGTCGTCTCCTCCAACCCACTTGGCGCTGCCCACGGGCCACGGCTCATCC
GCCTCTTCTTCTGAGAATACTCACTGCATGGACGCCAGTTTAATCTGCCA
TACTTGGGGGCGCCGCAGGTGGTAAACTGGTAATTGGTCCAGTGCCTGCT
CCTGCTGCTTCTTCTCCGTCGTACCAGTTGACGGGACATGGTCGTATGCA
GGATCCGTATCCAATTGCTTGCCTTTTCCTGTTGCTGCCGCTGCCACCTG
TTTGGTGATGCTCTCCACTTTGAACGACTCCCCCTCGTCATCGTAGCCTT
GGTACGGTAGCGCCACCACCTGCTGCTGCTACACCTTCATTGGCTCAGGC
AGTGAGATGTCGTCGTCAGAGGAGTTGCTGATGAGCTTGACGTCCAGCGG
CACCATCTCACGAGGCTTAACAAAGTCACGATGATCATCAGTCTTGGCCT
CCAATATAGCTACTGCCTCTGCTTCCGCCAGAGCTTCCTGTTGCGCTGCT
TTTTTCCTCTTCTTTGTTGTTGGCAGAGACAGAGGCATAGGCATTGGCAC
CTGCTGTAGAGGAGGAGGATGAAGACAAAGAGGACGAGGATCTGCTCTTG
CCGCTGGCCTCGGGGACGGTGACCAGCTGTCCCTGCATCTTCTCGGTTAC
AAAGTAGGGTCTGAAGCGAGACAGGCTGAAGTCGCTGGCGTGAGGCGCGC
CCACAGTGAAGCTCTCGTGCCGTTGTCTCTGCAATGGATAAGGATTCTTG
TCAGACCAGTCATCATTGAGTGTTTTCTGCAGTATGTTCATAGTTCTAGA
CTTCAATAGAAACATAAAAGCTCTACGTAGTACTGTAACCTATATTATTT
GCTTCCTCAAAGCTCTATTTGCTCCCTAGATGTGTTTGCTACCCTACTAC
ATGTTGGGTAGTTCCTTGCTGCTCTTGTAGAAATTGTTATAACCTTCTCT
AGGGCAACTCCCATATCGTTTATATAACATAAACTGTAGCAGGGAGCTGA
TGTTACATGGACAACTTACTGAATTATATGGAATTCCATTGTTGAACTTT
CATTCTCAAGGTGATTGAACCTGGTGCTCGATCTGGTGACTTGTGTACCC
GGCGTGAAGACGCTCGATGGTTGGTAGTTGCAAGTAACTGTCTTTCAAGG
TAAACTGCTTTGCTTTGCTGTATGTTCACATTCTGGGTATTGCTATACGT
TATTCGTCTGCTGATTTATGAGAGTTATTTTGTATCATCGGCTTATTTCA
TATTGCTATTTCACTGTTGTAGCGCATATTTTTCCTCTATTTTCTATGGA
TATTGCCTGTCATGGAATACAAGAAATAAGACAGTAGCGACAAGAGTTCA
CATTTTGCTTTAAAGTTAATCTGGTTGGCAACTGCAGGCATACTTACTCG
AAAGTTTGCCCATCAATGTACATTGAGAATGTGTCTGAACTTGCATTTTA
TGATATCACCACTGAAGATCCTGATTTCCATTTATACAAGGTGAGAAGCA
GAAATATTGTTCAGCACCATCTTGATCACATATCATTACTATTGAAATAA
TGATACGTTATTCTTGTATTTGTTTCAATTGACCCTTAGGATTGGCCGAA
GCAGGGTTAATTTCTAGCAAGCTATCAAGATCCGATATGAACATCTCTGA
AAATGTTCAGAACAGCCATTACTTTTTCTCCCTGGAGAGGTAATCATCTC
TTCCATGCATCCACTTGACTCTCTGTGTGCTGTATGTATACGTGTGTTTG
TTGTGTCCAACTACTAATCAGCTTCACTCGTTGCAGACTTGCAGTCCCTT
GCCACGTCAAGATCTTGTAAGTTGGAAGATGGCTTTGGATAAAAGGCAAT
TACCTGAAGTTGACAAAAATGTAAGAAAGGAAGTTCCTATTATTCTTGAT
TGTTGTTTTGAAACCATCTGGTTAAGCTGATATATGTCCTCTCTGTGTGA
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CAGCTGCATGGCCCGTTTTGGCAGCTGACTTGGGTGCTGAAGACCAGAGC
ATTACCGCTCTTGCATTTGGTAGGATTTGATTTATATACTTTTTTCCTCC
TTTTTTGGCTCCTTGATGATCACTAAAACTCTATTCTTAAAGTTTTACCA
AGACTTTTCCAGCCAAACAAACCTGTGACAAAAGGACAAGCTGCCCTAGC
ACTTTCAACTGGTGACTATGCTTTTTTTTAGATGAAAGGGTTTCCCCCCG
ATTTCATTAATAGAAACCACAGACTACAAAGTTCTGGTCTCAACACCACA
AAGAACTGGTGACTCTGCTGAAGTGGTTATGGAGGAGCTTGCTCGTATTG
AAGCAGAGAAAATAGCTGAAGCAGCTTTGAACGCACATGGTGCATTGGTC
GCTCATGTTGAGAAAGAAATCAATGCAAGTTTCGAAAGGAAGCTTACAAG
GGAAAGAGAGAAGATAGAGCGCATTGAGGAACTGGCTGAAGAAACTAGGG
TCGAATTGGACAAGCTGAGAACAGAAAGAGTGGAATAAAAGAATGCTCTG
ACTAGGGTCAGAGCTGCTGTCGAATCTGAAATAGAAGTTCTTCCAAAGTT
GAGGTCTGAGGCAGAGGAGCAACTGCAGAATGTGCTGAGCAAGAAGGTCG
AGATCTTCTTTGTGAAGAATAGGATCGAGAAACTTGAGAAGGAAATAGAG
AATGAAGACCATGCTGCCGTGCAACTTCAGTATGAGCTTTGTCTATGGCC
AGGTATGAATTTGTGATACCCTGAGAAGCCTCTGTATTAAATTTGCTTGT
CAATTCCCTGAACCCAGTGAGGATCACTCAGAAGTTCCTTCCAGCACTGG
ATAGCGAGACATAAACCATGCATTTTCCCTTTTCCTGAAATCATCAACTA
GATACTGGCTAGTTGCAGCAGCTGTTTTTTTTTTAAAGGTTTGCAATCGG
CTTCTCCGTTCAAGTTGAGACTCAACTGATAATTTGACAAATTATATTCT
CCGTGACACGGAAAATGATGTTATTTTGTCTAGACGAGCACATATATAGT
TGTCTTCGGGCGCCGGGCGGTGAGCCATCGAAATCAACCGGCGTGCACAC
GCAAACATACAATCATATAGGACGATCAACATGTACACGCACTCTGTGTT
TCCTCTTGTTGGATCGCCATATAAGTATATGTGCGCGGTCCAGTTGGTAG
ATTTGTTCTTCATAAACGATTCAGTTGGTACTACGTCTCTTCCTTCTGCT
CCACCCTCTTGCCCGTTAATGACCCAGGTACATATCCAGTCATAGATTAA
TTAGCTTTCCAAAATTGCCCCGAAATAGATTAGCTGGCAAATCTGGCATG
CATGCATGTAATTAATTGCTCGATTAACTCCTTATTTATTTGCAGCTATA
TAGGTGTGTCACTCCCTTGCTATGCGTGCGTTAAATATACAATCCCCCTA
TCGTTGCGCTGATTTTCTATCCATTGGTAGGGCGATATTGTGCTTCTGCT
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GGGCTCTTCTGGCTCTTGTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCGGC
AGCTGCGTGCAGGCGGCGGACGAAGAGACAAACGGCGCCGGCAGGAGGAG
GAGCCGGCGACGTTCTACGGTGGCAGCATCCAACATCATGGTGCCTATCA
CCTTCCTCAACTCCTCCGTCGAGAAGGGAGCCGGTATGTAATTATGCATG
GACTCGTTTCTTCTTGTGCCATCGATCCCCTCCTTATATTTTTGCTGTGC
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TTGCTACCTAGCGAGGGCACATCGGCTCAAATAAACATTTCGGAATATAT
TCTCTTTAAATTAGAGTAGTACTCCACATAGAATGGAAAAGATTTCAGTT
TCCTTACCTAGGTTTAAAATAACCTTAACAAGTGTAATTTTTCGTGGTAG
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AGGGGTTCCCTTTCTTTGGGCAGCCGTACTAAATAGCTGAAATCACCGTC
AAATGTCTCGCCGATGGGTTGACCATTGCCCCAATCAGTCCGTACTAAAT
TTTGCAACCCTGTCTACCAATTTGGTCATGGACTAAATAGCTGAATCTTA
GTGCCTTGATGAATGTATCTTACAGCTGCAACCGGCGTGGAGTTGTTTTG
GAATTCACAGCCGCGCGAGTGACCATGAGACCATGCTATATATGTCTAGG
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CTAGTAACTATTGCAGTGTGCATGGATGGGACGCCGGCGGCTTATCACCT
AGACCCGGGCTCCGGAGCAGGGAACGGCAGCTGGATCGTCAACCTGGAGG
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TGATAATTAATTAAGTGATGCTGAACACAGTACAGTGGCTGCCTGACGTC
GTCGGTGTGGGTGCAGGGAGGCGGGTGGTGCAACAACGCGAGGACGTGCA
AGTTCCGGACAAGGAGCCACCACGGGTCGTCCGACTTGATGGAGCGGCGG
ATCGCCTTCACCGGCATCATGAGCGCAAGCCCGGCCGACAATCCTGGTCG
GTACATACTCAGCTGCTATTATTTGTTCCACATTCATATTTCATCGTTTC
TTCCTACTCGCTCCTAGTATCTCGTACGTACGTGTGCATGCAGACTTCTA
CAACTGGAACCGGGTCAAGATTCGGTACTGCGACAGCGCCTCTTTCGCCG
GCGATACCTTCGACAAGGGTACGGGCCTCTACTTCCGGGGCCAGCGGATT
TGGGAGGAAGCCATCCACCACTTGCTCTCCATCGGGATGGCCTCGGCCGA
TCAGGTGCTTCTCACCGGCTGCTCCGCGGGGGGGCTAGCAGCCATACTGC
ACTGCGACCAGTTCAGTGCCTTCTTCGCTGATCGCCGGCGGAGCACCACC
ACCGTCAAATGTCTCGCCGACGCCGGCCTTTTCCTCGACGCGTACGCCCG
CCGCTTACCTACGTACTCTAATTAGATATATACTAGCTAGGTGCTCGATC
GCCACACCGTACCATATCATCATCATCATCGTCACGGACTCGCCCCCGGC
CTGCCTGCAGCGTGGATATCTCCGGAGGACGCAGCCTGAGATCCTACTAC
GCTGATATCGTCTACATGCAGGGAGTGGCTCAGAACCTTCCGCCGGCGTG
CACCCATCATCTCGACGCCACCTCGGTGCGTATGTACCTGCTAGCTACGT
ACTATTCCGTATATATCGGAATGCTTGCAAGAGACCGACCTCATTCGTGG
CTGCTATTAATTCTGTCTCGACAAGTAATCCTTGGTTTGCGTGCAGTGCT
TCTTCCCACAGAACATCATCGACGGCATCAAGACCCCCATCTTCCTGCTT
AACGCTGCCTATGACGTCTGGCAGGTAAAAACCATTGCACGCACCAATTA
ATGTCCATATAGTAGGTCATTAATTGTAACGTTGGAGTTTTGGACTGCTC
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AACAAAGCAGACCCCAACGGCTCCTGGAGAGCCTGCAAGTTCAACCGCTC
AGCTTGCGACGCATCTCAGTTGAAGTTCCTGCAAGGTAAAAATATACACA
TCAAACGTACTAGCCAAGATCGGGACAACTGACCACTAATAACCAATTTT
ATGCCATGCACGTACGTGCACGTCCGATCCGTAGATTTCAGGGAGCAGAT
GGTGGCGTCTGTTAAAGGCTTCTCCCGCTCCAGGACCAACGGGCTCTTCA
TAAACTCGTGTTTCTCCCACTGCCAGTCCGAACTGCCGGCTACCTGGAAT
GGCTCCCCTGCCATTCACAACAAGGTACAAGCAGAACAAATGTCTCCTAC
ACTACACGGCACATTCTCTGTACATTCTTCCTTGGTTCATGCATGATGTA
TATAAACTGCTGTGTTGTTGTTGTTGCAACTATATATAGGGGATCGCCAA
ATCTGTAGGTGACTGGTACTTTGGCCGAGCCCAAGTGAAGGCGATCGATT
GCCCCTACCCTTGCGACAAAACATGCCGTCACATCATATGAGAAGAAGAT
ACTGCAAGCCACGGCCGCCTCGAACGCATGGACTGGCTGTTGTGTAATCA
GAATTTAGAACCCGTGGAAAAGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.