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GrainGenes Sequence Report: AA021905

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Sequence
AA021905
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021905
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAGAAACTCGCGAGGCCGATAAGGCTACACGTGCTTCTTCCACCCATCGC
TCTCGCCGCGTCCCCCTCCCCTCTCCTCCTCGCTGTGTCGCCGCGCGCGG
AGGGGCGTAATCGCCTTCGCCTTCTTCCCCACCTCTTTCGCCCCAACCTA
ACCCTTTCTCTCCCTTCGTCTCGAGCCCCAACTCCAGCCCCCAATCTCTC
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CAAAACCTTACTTCGGAACATATGAGCTATGAGCTATCCTCTTGAATTTA
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AAGGCACACTGTTTTTCTCCCTCATTGATATTAAATATCTTAAGAGAATA
CATTTTGTTTGCCTTGCAGGGGCAAGATGCTACAGTGCATAACTTATTCG
AGAGGAGCTACATGCCCATGCTTTATGTGCCTTGTACACATCGGGCCTTG
AGTGTTAGATCTTTTGCCTTGCCAGTTGCTTTGAAGGAAATTCCGTTGGT
CAAGAGCACGTCATTAGTATTGACTAGGTAGCTCTCCTCATGTTATTATT
TAGATGACACTAATATGGATTATTCAATTTCTTCCTGTAAAATGTCATCT
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GTGTATGCACCATGGGTAGATTGGTACCTTGCAGTATATTTGTGTGTAGA
AGTTAAGATAATGATCGGACGCCTTAACATGTGATAGCATCTTTATATTG
TCTAAAAAAAGCTAGCAGCAACATATTAATTACACCAACATATTAGCTGA
TGTAGTTTGGTTACTTAGTCTTAAATGGAACTTCTATGATTGATGATGGT
CTTGTGTGGGCTTGCATAGCCAATTCAGTAGACTTATGTATTAGCTTTTT
TTTTTCAATCTTGAAGTCATGTTTATACCATTCTATGCAATTTAAGTCGG
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AAAAGATCAAAGTATATTCTATAATGTAACCTTGCAGCATGGAGGCAACT
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CTTTTGTTATTTGTGCCCTTTGCCCTTTGCTCATAAATTGTCCTGCAGGG
GTTTGGATCCAGTCGTGTTGCCTTCAGCAGCAAGCCAAGCTGTTAAAACA
CGACTTTTGACTTTTGTGAGATCATTATCGACCGTCCTAGCTACTGCATA
TATTATGACAAGGTGCAAATGCTACAATTTCGATAAAAATCCCCAATGCC
TGTTTGCCAGTCATATCTATATGATTCAGTTATGCAAGTTGCTTATGAGT
AATGATGGCATTGTTTTTGTTGATGAAAAAACACACACCGAATTTTGGAA
TTAGGCCATTGACAATCTCTGATTCTAGCTTAACATCAATTTTATCAACC
ATTCTTGAAAGTGGATAATCCTAGACTGGCTAACTAAATTTTTTGAACCC
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ATCTGATTGCGTTTTACCTAGTTGAGTTTATATTGAATTCCATTCTATAC
TTTAGCTGATGTTTTGGGGTCTGTCTGTACAAAAGGGGAAGCAACCCAAT
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TGATTGGGATTCACTAACTTACTGAAGGTAACGAGAGAGCTATAGTAAGT
TTTTTTAGCGGAAAATAGCTATAATAAGTCACCAGCCTTCTTGATTCCAT
CCCTCCCCCACCCGCACAACACCTATATCTATCTAATTTATGTTAAGTTT
AACATGCACCTGTTTTAATTGTTTCAAGTACCTGTTCCAGTAATATTAAT
AATTGTCTTAGTGAGTTGACTGCCTTACTACTCTAGGGGTTTCCAGTATT
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ACTACTAAGTAAGAAGAAGAATAGTTACTCAGAGAGATAATTTAGATATG
TGTTCTTCATAAAACCTGAACCTAAGGCCTTTCTGTGGATCATGTGCTTG
GCTTGAGAGTAGGAACAAGCTCCACATGAGGAGTCGGATGGAGGAGCGGA
GAGGAAAATTGGCTGGGGACAAAAATCAAAGAAATGCCAGTCACTATTAC
TACCCATTCGTGTGGACTCCCTTACAAAATAATGCCGCTTTCCACGGAAA
CTCCTGCCATTGGTCTGATGTCCGTGGGCTTGTGGTCAACCTGCCATGTG
AACTCTCCAGTCTCGCTAACATACTTAAATCATGGTCTGGGATTAAAGTT
CGGGTTTTTTAGAGAACGTGCAAACAAGCGTGTGTACATGTTCTAATCGA
GTTCAGGAATTGGGATTTGTTTGACTGGCTTGGACAATTTTAAATAGCTA
CAGAATTTTGATCTTTGAATATTCAACAACGAAGTTCCCTATAGCGCCGT
ACTGCCGTAGAAAGAGGTGCTGGGAAAAATTATTGAGATGTTCTGTTTAG
TTGATCGTCCTTGTTTTTATGGTCAGTTGGTTTCCTTTGTGTGCAGTTTT
TATCCATTACTTCTACTAATACAATTTATCTTCTCTTAGTTTGATTCAGC
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GTAAGAATAATGTCCTATATCATAGTGATTACATTATTAGAGTACCTACT
GTAGTTCATCGGCTGGGTTTTGGTTTCAGTGATATAGCATATGATGCATT
GGTTCTGAAGTAAATAAGGGAGATATGATGAATATTGAAGGGAAAGTAGA
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GTGTATAGCAAGCTGTTGAAGAAAGTTTTTTCGTGCTTTTCTTTGTAGCG
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TCTTGGTTTGGTCTTTTATTTTTGATGATAAATTTTCTTTGTAGCGGTTC
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GTACTAAATTTGGATTTGATCTTATTAGGTCATCTGTTCTATTATTAAGA
TATTCTTCTGGTATTTAAATTTGCGATGTACTTATAACATATAAGTTTTT
ATTTGCGGGTACTTATAACATATAAGTTGTCCCTCAGTTTTTCCCATGTT
GTAGCATTACTTACGCAATCTGTTTTTGACAGATGGGGCTGGATTTTACC
ATGAGAGCTGTTTATACTGGTATTTGGATTGCTTCTGTTTCGCTCTTTAT
GGAGTTGCTGGGTTTCAATACCCAGAAGTGGATAACTGCTGGAGGTTTTG
GGACAGTATTGCTTACGCTTGCTGGTCGTGAGGTACTGCACTTCTTTTAT
TGATAATATTGTTGTTATGCTGTAGGACTGATAGCTATGGTGATTCATTG
CAGATTTTTACTAACTTCCTCTCAAGTGTTATGATCAATGCCACCCGCCC
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CTGGTATTGTTGAGGTCAGTATTGGTATGCTTTATTTGAACTTGAACTAT
CTATCATTTGTTGCAGAATTGCAGCTTTATTTGTCCCATTTGTAGACTAA
AACAGCAGCGATCTAGCTATGAAGTTAATTTTCCTGTAACCCTGAATCAT
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TTGCTATAAGCCACATGGATGCTGGAAAAATTGGTGTAAGAACTTTGAAT
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TACTAGTCTGAGTTAGTCGTTATGAAGGGTTGTGTGGTGAGAGCATCTCC
AAGAGGTGCCCAAAAAATGCTGCACGCTAAAATAGTTTTACAGCGCCACT
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AATACGGCGTGCAGCCTGCAGCAGTTTACCAGACGCACTGAGCACGACAA
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GCATCCGATTTGAGCATCGTCCGCCCCGTGCGCGCGGGGAAAACTTCTCG
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TTGCCTACGGCGCCCCAAAACGATGGTTTTTAGCGCGGGGGGGCATTTTT
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GTTCGGCACAAATTTAAACTTCTGTTTGTTTCCTTGAGTTTAGAACTTGT
GCAAAAATTTGCATCCTTCAGTATCTTAGGTTTCTATCATTTTGCTGTGC
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ACACGAACACACACATAGGACCACGTCGGCATACAACAAAGTCATTTAAG
ACCAAAGCTATGCCTAGGAGGAAAAAAGAAAAAACCCGAAGCGATCAACG
AAATGCAGCAACGACCATATCGGCACCAACATATCATGACAACACAAGAA
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TGAGCGCCGCTGTCACCAGACCCAACCAATGAAGGCCAGATCATGGGTTT
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TAATGTTGTCGCCTCCACTTTCTGCAATCCCAGCAGGTACGTACACGTAC
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ATAGCCATTGATGAGGGGGAAGGTTACGAGCACCCGCCAAAATACCTAAT
TCGGTATGCTCCGGCAGTCTCGCAACATCCTCCCACGCCGATGGAGGATC
TGTATTAGACAACAACACCATGAGTCACACCACTCTCTCCGTTGCCTTCG
CCTGTGACAGCCAGCAAATCACCGACCGACCATCATACCAAGGTTTCCGG
TAGGTCGGGTGATACCTCACTGGCTATTCTCGATGCCGCCTCTGCTTCAT
AGCCTTCACCACTGCCTCAAGTTGCGGCACAACACACATCGCCTGACAGC
ACCACGCAGAAGACACCGGGCGAGGGAGGCATCCCACAGCCGCAGATCTG
GAACACAACGACCTCATCCCATGACGACGAGGAAGCGAGGTGCCAGATCC
TGGGCGAACAGAATAGATCGACCTCATCTTGCAGCTTTAGTAGGCAATGC
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GATCACCGCTGCAAGATGCAACTTTAGAAGAACTTTTTCCTTCGAGGCGT
TTGCCACGGCATGCTGGAATATTTAGAAGCATGGGAATGCTCTAGTTTTT
GATAATGTAACTTCCTTCTTTCTTATAGAATGAAGGATGATCTGAAAACC
TCTCTCGTTGCCTGGCTAGACACTATACTTTCTTTGGGCTACGCCCTGGG
CTAAGCCCTTTTGTATATTCTTTTGCCCCTCTTGTACATTTTGTTCCTCT
TAATAAATTTTACCGTCGGGGCCTCCCCTACAGTTTTTAGCTCAAAAAAA
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TTTTCTGGCGGCGTCAGGGGCCTTCGGAGTCACTAGGAGCATGGTTTTGT
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AAACCGCCCACAATTCTTGTGGCCAAGAAACCAAGATTGAAATGGTACCA
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AGGCATCTTTCTCTACTTATCTTCGATGTAGATATACACGAAACATGATC
TAATAGTGTGAACCTTGGTGCGCCACTATAGTATGTTATAAAATACACCA
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AAATGGCCATGTAGTTTTTGTACGAGTTAGAAATCAGGGTGACACACACC
ATGATTATCTCATAATACTTCTACTCAGTTTTGGCAATGAGATAGAAATC
AGGGAAACATGCACCATGATCATCTCACAAAATTTCCACCTAGTTTTGGT
AATGGGATAGAAATAGGAGAAACATGCAGCATGATTATCTGGCAATATTG
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GGGAAGTTGCCATTTGACATGAAGGCAAAGCAAATTAGCCTGAAAACAGT
AAATTAAGAGACCATCAAGTGCATGGACACACTATATGGAGCGAATAACA
TGTCTCGGGCGTATGAATCCTAAGCCTTGAATTAGAAATATTAGATTGCA
TGTTTGCAGGAAATTTGTGCATTTCCTTGACTATGATTCTGAAGGAGTCT
TAAAATCATCCTATTACTGCCTGGTGCATTTATCATTGTTCAGATATTTT
CTTGCATGTCACAGGGGAAAGTACAGAAGAGTTCTTTCTTTTTCTTTATG
GAATGATATATGACAGGAGAAAAGCCAAATTCTTCATCAGGATTTTAGAT
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TGATGTTCCAAATTGCAACAGGAAACAGTTATGTTGGATCTTCTTACAAT
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TATAGTCGTGTACGTGCCCGTCCAATCCTGATCGATACTTCTGCAAGGCT
CAGTGATGACAAGAAACCTCGACCAGCATCACGCGAAGATCAGAAAGTCA
AGGCAAGTGTATCAGTAGAGACCAAGCCAGCTTCAGGTGATGGGCCTGAT
GGCTCTAGCTTAAGCAACCCTGAGAAGCAGGAAGAGAAAAAGATGGTACC
AGAAGATATTCGGATGAAGAATAGCAAGAACGATCATGTGAAATCAACAA
TACCATCCCCGATAACTCCATGGGCAGAAAGTACTGATCCTGTAGCTTCC
AAGCCTGGTAAAGGGAAGGCTCAAGGATCAGAGGCTACAGAACGCCAAGG
AGATAGTTCAGTCCCGGGGACTAATCCAAAGAAGGAGTCAAGGCCTGCCT
TTGAAGATAACATTGTTCTTGGTGTTGCTCTTGAGGGCTCTAAGAGGACA
CTCCCAATTGATGAAGGAATGAACCCTCATCTATCGCTATCTGAACCTGA
GCAAGACACTGTCGAGGCTGCTTCATCGCCTAAGAAAGGTCAAAGCTACT
CACTCTCAGGTCAAGAGAAGGGTGACCAGAGGAATCCTGACAGGTGATCC
ATGTCATTTCTTTACCAGTGAATGATATTTGTCACCAAGCCAACCTTTTT
TGTGTGCTTGTGGCCTTGTGCAAATGCAATCTGTCATGCAGCTCTGTTTG
TTACGTTGAAGGCATAAAACGCCACTGATACTTGTTCTGTCCGGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.