Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA002201

[Submit comment/correction]

Sequence
AA002201
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA002201
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGCGGATGGACGGACCTCCCAAGCGATCTCCTTGGCCGCATCTTGCAAC
TCCTCTAGCTCCCGGCCGCTCTTGCTATTGTAGCCGTCTGCACTTCATGG
TGCTCAGCCGCAGTGGCTGCCGGTGTCCCTCACGTACGCACACCTTGGCT
CATATCCTGGCAACATAGAAGGTATCAAAGCATTGAATTCCGGAATCTCC
TCAGCACCCAGAAGACGAACAAGGTTAGTTTACCCGATGATCGGCCACAA
CTCGACTGGTGTGGAGCCTCACATGGTTGGCTCGCTGCGTCAGATGAATC
CTCCAACCTTGTGCTCTACCACCCCTTCACCTTCAGGACGATGCCTCTCC
CGCCTATTACTGATTTGGAGTGTGTTAAGGGAGTCTATGACACTGACGGA
AGAATTGTGGGCTATCGTTATGGAAAAGATCATCAGCATGAGCCTAGAGA
GCTGGTGTACAAACACTCTCGCACATGGTTCTACCAAAAGGTGGTGTTGT
CATGCGATCCATCACGGTGGTGACTGTTAGATGTATATATCTGTATATTG
TATTTCCTCCATATGTTAGGGGGCTTCCTGCATATTTGTCCTTGTACCTG
TACTATATATTGTGTCCTTTGGTCCCCAGAGAAATACAAGTTGCATATTC
TTGACATGGTACCAGAGCTAGGTTAGCCTTCTCCTACTTGCAACTTCGTC
GCTCTAGCCGCCACCGTCCCTGTCGCTGACGGCCTTGCCGTCGTCGCCGC
CGTCGTTCGCCGCCTGTCCACGTCCAGTTTCTGGCCGTCTGCCGTCGTCG
CCTGTTCCGTCTCGCAACCCAGATCTGATCGGTCTTCAGATAGATCTCGA
TCTGGTCTTCTCGCCGGGATCGATCTGCCTCTCCTGACGTGCCGATCTGC
CTCGCCCGCCCATCGATCTGCATCTGCCTGGCCCGCCCCTCCTGACGCTC
CTGCCTCCTGACGACCACGTCCACGTGGGAGTTCCTCCAGGCGCTGCTAC
CTCACGCGTTGGTTGACCTCCATGCGCCTGCCCACCTGGCCTCCACCTCC
TGCCCCACCGGGTCCCACCTGCCCCCGCCGGGTCCTGCCTGCCCTCTGCC
GCTGCAGCAGCTGTCTGCCTCACCCGCCGCGCGACAGCAGCGCCCGCGCC
TGCACGCTCACCCGCAGCAGCGCCTGCGCCTGCATCGCCGGGCCCGCCAG
TCCCTGCCTCCCGCCGCGTTCCGCCTGGCCCGCTGCAGGCGGAATCTGGT
CCCACCCTCGTCGGACTTCGTCTGTTTGCGTCAGGATCGATCAAATCTAG
ATTGATCTATGTCAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGTCTTCTTCAT
CGGGTTATGTTGCGATTCCTCGCTGCCCGGTGATCTTCGATGGCGCGAAT
TATCCTGATTTCGCTGCCTTTATGCGCGTTCACATGCGCGGTCTCCGTCT
TTGGGGTGTGCTCTCCGGTGAGGTCTCCTGTCCGCCGTGCCCCCTGCTCC
TGTGGCTCCTCTTCCGCCGACGTCGATTGTTCTCGGTGTTGATGCTTCTC
AGGAGGCCAAGGATGCTGCTCAGAGTGCTGATAATAGTGTTGTTGTTGCT
TATGACCTGAAGTTCAAGCAGTACTCTTCTGATCTCGAGGCCTATCGACA
CGCTCTGACCGCTTACACTCAGTGGGTTGATGAGGACGCTCGTGTTGCTG
CTGTTCTCACCTCCAGTGTTCTGCCCCAGTATGTTGCTGAGTTCATGAGT
ATCCCTACTGTTGCCGTTCAGTGGGCTCATCTTCGTCAGCGCTATCAGCC
GTCTGGGGATGCTCTTTACTTGTCCGTGGTTCGCTAGGAGCATGCTCTTC
AGCAGGGTGATTCTACTATTGATGAGTTCTATACTCAGAGTGCTGCTATC
TAGCGTCAGCTTGATTCTCTTTGTACTGCTGTTTGTGGCACATGCTCGTG
TTGCCAGATTGTGCGCTCGGATTTGGAGTTTCACCGCATCTATGAGTTTC
TATGTCGGCTTCGCCAGGAGTTTGAGCCCCGACGTGCTCAGCTGAATGCT
CGTGGTCATGTTTCGCTCTCTAAGGTGTTGACTGAGCTTCGGGCTGAGGA
GACTCGTCTCCGTGGTGCTGGTCTTCTTGCGGCTCCATATGTGCTTGCTA
CTCGTGGTCCTCCTATGTCGTTTGTTCCCTCGACTCAGCCGCGGTCCTCT
GTGCCGCCGCCGATACTATCCACTCCTCCAGGTCAGGGTCAGAGTCAGCA
CCAGCAGTTTCAGGGTCAGAGTCAGCCCCAGCAGTTTCAGGGTACCAGCA
GTTTCAGGGCCAGAGTCAGCACCAGCAGGCTCGTGGTCAGAGTCGCCGTG
GTTCTCTTTGTCACTGCTCTTACTGTAACAAGGATGGCCACACTTGGGCC
ACCTGTTATACACGGGATCCCAGTCTACGTCAGCAGCACCAGACTCGTGG
GCAGTCGGCTCCTTCTAGATATTCAGTAGTTGCTCTCTCCGACCAGGACA
TTATCAGGAGTCTTCGCGGTCTGCTTGCTGCTATAGGCTCTTCTTCGACA
GGCACTGCTGGTTCTGTGACTGATTCTTCAGGCCCTGTGCGACCACCATC
TTCTACATATTCAGGTACGTCCCCATGGTATCTAGATTCTGGAGCTTCTT
TTCATATGACCTCTGAGTCTTCTTTTCTGTCCGCTCTTCGTTCTCTCCCT
TCTCCTGTCCGTGTTTTCACAGTTGATGATACCTCTCTCCCTGTTTCTAG
TCGGGGCACCCTCTCTACTTTTTCCTTTTCTGTTCCTGATATTTCTCATG
TTCCTCTTCTTAAGATGAATCTGTTCTCTGCTAGCCAGCTTACTGACTCT
GGTTGTCGCGTCATTCTTTATGTTGATTCTTGTGTTGTCCAGGACCGTCG
CACGCAGGCCCTGGTTGGAGCTGGCCCTCGCAGCCGTGACTCTTCAGGAC
TTTGGGAGTTAGACTGGCTTCGTGTTCCTTCTGCTGCCACTTCATCTTCC
AGTTCTTCTCCGGTCGTCGCCTCTGCTACCAGCTCCTTTCAGCAGTGGCA
TCATCGTCTTGGTCACCTTTGTGACTCTCGCCTGTCGTTATTAGTTCATC
GTGGCCTTCTGGGGTCTGTCTCAGGAGATGGGTCTTTACATTGTCAAGGC
TGTAGGTTGGGTAAACAGATTCAGCTTCCCTATCCTACTAGCGCGTCTGT
ATCTTAGCGACCTTTTGATTTAGTTCATTCAGATGTTTGGGGTCCGGCTC
CCTTCGCTTCGAAAGGGGGCCATCGCTACTATATTTTATTCATCGATGAT
TTTTCTCGGTACACTTGGTTGTATTTTATGCGCTCTCGTAGTGAGGTTCT
CTCCATATATCAGCATTTTGCGGCCATGGTTCGTACTCAATATTCTACCC
CCATTCGTGTGTTTCGTGCTGATTCTGCTGGTGAGTATATCTCCCAGATG
TTGCGAGGTATCCTTGCTGAGCAGGGCACTCTTGCTCAGTTCTCCTGTCC
TGGCGCCCACGCCTAGAATGGCGTTGCTGAGCGTAAGCATCGTCATCTTC
TTGAGACCACTCGTGCCATGATGATTGCTTCTTCTCTTCCGCCGCATTTC
TGGGCTGAGGTTGTTGCTACGTCCGCTTACCTCATCAACATTCAGCCTTC
TGCTGCTCTGCAGGGTGGTATCCCTCTTGAGCGCCTATCTGGACAGTCTC
CCGACTACTCCATGCTTCGCTTGTTTGGTTGTGTTTGTTATGTTCTTCTT
GCTCCTCGCGAACGCACCAAACTGACTGCTCAGCCTGTTGAGTGTGTATT
TCTTGGATACAGTAATGAGCATAAGGGCTATCGCTGTTGGGACCCCGTTG
GTCGTCGGATGTGTATCTCTCGTGATGTTACTTTTGATGAGATGCGCCCT
TTCTATCCTCGTCCCACCGCTGGTACCTACCCGATGGAAGATATCTCTTT
TCTTATCTTTCCTGACACACCTCCTTCTACTCCCGTTGTGCCTTCTTCAG
GATCTCCTACCCCTGATGTCTCTTTTTCTACACCGTCCTCCTCCGCTCCG
TCTAGTTCTCCTCGTTCTCCGGAGTCTTCCTCTGCTATTCCTTCTTCTTC
ATCGTCGTCTCCTGAGTCGTCTTCTTCTGATGAGCTTCCCTCTACTCGTC
CTGTTCGTCAGCGTCGTGCCCCCAACCGTTACTCTCCTAGTCAGTATGGT
CTTTCTGTTGTCTCCGAGCCGACTTCTTATCGGGATGCTGAGCATCATCC
TGAATGGCAGCTGGCCATGGCTGAGGAGATTGCTGCGCTTGAGCGCACTG
GCACCTGGGATATTGTCTCTCCCCTCCCGGTGTTCGTCCTATCACGTGTA
AGTGGGTCTATAAGATTAAGACCCGCTCTGATGGATCTCTTGAGCGCTAT
AAAGCGCGTCTTGTAGCTCGTGGTTTTCAGCAGGAGCATGGTCGTGACTA
TGATGAGACCTTTGATCCTGTGGCTCATATGACCACTGTGTGTACTCTTC
TTGCTGTTGCTTCTGTTCGTCACTGGTCTGTGTCTCAGCTTGATGTTCAG
AACGCCTTTCTCAATGGTGAGTTGAGTGAGGAGGTTTATATGCAGCCTCC
TCCTGGGTATTCTGTTCCCGAGGGGATGGTTTGTCGTCTTCGACGGTCTC
TTTATGGCCTCAAACAGGCCCCTCGTGCCTGGTTTGAGCGCTTTACTTCT
GTAGTGACTGCTGCTGGTTTCTTCCCTAATGCTCATGATCCAGCGCTATT
TGTTCACACTTCTCCTCGTGGACGCACTCTTCTTCTTCTCTATGTTGATG
ATATGATCATTACTGGTGATGATCCTGAGTATATCGCCTTTGTTAAGGCT
CGTCTTCGTGATCAGTTTCTTATGACTGATCTTGGTCCTCTTCGATACTT
TCTATTGAGGTTTCCTCCACTTCTGATGGCTTTTACATCTCTCAGGAAAA
GTATATTCAGGATCTCCTTGCTCGTGCTGCTCTTGGGGATGAGCGCACTG
TTGAGACCCCTATGGAGCTTAATGTTAAGCTTCAACCTACTGATGGTGAT
CCTCTTTCTGTTCCGACGCGTTATCGTCATCTTGTTGGGAGTCTAGTTTA
TCTTGCTGTCACTTGTCCTGCCATCTCTTATCCTGTTCATATTCTGAGTC
AGTTTGTTTCTGCTCCTACCACTGTTCACTATAGTCATCTTCTCCGTGTT
CTTCGTTATCTTCGTGGTACGATCACTCGTTGCCTTTTCTTTCCTCGTTC
CAGCTCCCTCTAGCTCGAGTGCTATTCGGATGCTACGTGGGCGAGTGATC
CTTCGGATCGTCGTTCACTTTCTTCTTACTGTGTGTTTCTTGGTGGTTCG
CTCATTGCTTGGAAGACGAAAAAACAGACAGCGGTTTCCCGTTCGTGTGT
TGAGACTGAGTTGCGTGCTATGGCCTTGTTGACTGTTAAGGTGACCTGGT
TACGGTGGTTACTTGCGGATTTTGGGGTCTCTATTACCACACCCACTCTG
GTTTTGTCTGACAGTACAAGTGCTATTAGTGTTGCATGTGATCCGGTCAA
GCATGAGCTTACCAAGCATATTGGTGTTGATGCTTTCTATACACGTGCTC
AGGTGCAGGCTCAGGTTGTTGCGCTTCAGTATGTGTCTTCAGATTTACAG
TTGGCGGATTTCTTTACGAAGGCACAGACAAGAACGCAGCATGATTTCTT
ACTCTCCAAACTCAGTGTTGTGGATCCACCATGAGTTTGAGGGGGGGGGG
TGTTAGATGTATATATCTGTATATTGTATTTCCCCCATATGTTAGGGGGC
TTCCTGCATATTTGCCCTGTACCTGTACTATATATTGTGGCCTTTGGCCC
CCAGAGGAATACAAGTTGCATATTCTTGACAGTGACTACACTGCTGTGAT
CATCCACTATGACGCCAACTGGATTTCTTTTACAAGGGCAAAAGAGGGAT
GCTGGCGACTTGCCGGAGCTTTGGGTGACGGGAGCGATGACCGTTATGCC
GATTGTGTCTATCATGATGGCAGATTCTACACGGTGACCTTACGCGGGGT
GCTTGAGGCGTGGGACCTTTGTGGCCCCCAAGAACCAAGCAAAGAGGTGA
TCATTGCCGACGGGGACAAGAGACGAAGGAGGGTCCTTACTAGGTTTCTA
GTGTCTACGCCTTGCGGCCGCCTCCTGCATATAAGAACCCTTCGACGCAT
TCATCATCCCATGGAAATCAAGGTGCAGGTGCTTGAAGTCGATCTAGAAG
AGCGCAAGCTGGTCAGCCTGAGTTCTTCGACGGCCTTCCAGGAGCACGTG
GTGTTTGTCGGGTTAAATCATTCGGCATGTTTGCCCACTCAGGAATTTCC
AGAACTCAAACCCAACCGTGTCTACTTCACCCAACCTCGGCTGGTACACC
ATGACAATTTTGGCCTTCCGGGTTGGAGATGTGCAGGGATTTACAACTTA
GAAAATCAGAAATTTGAGTATGTTTTCTCCAGCTTTGGACCTGACTATAG
AGAACCGTGGCCTACTGAAATGTGGTATATTCCGGGTGTTTAGAAGATTA
GACATCTCGTCGGATTGAGATGAATGGTTGCGGTCAAGTTACGGGTCGGG
TAATGTTAAGCTGAATTGGCTGAGATGGATTATCGCTTGATGGTATAGTG
GGCAAATCTTAGGACTCAAGTTGTGGTACGGCTTCCTTTAACTTTTCTTT
TCTCAATGATGACCTGCTTTTTCGCTCTAGTGTTATTTTATTTGTTGTTT
GATTGCACAGACTTGTACTCGGCCTATTTTAGTTATTGAACTATTTGGCT
ATGCGTGGTTTTGTTATCTCTTAAGAATTATTTGGTTATGTGTGGTTTTG
TTATCTCTTAAGGTTAATCGTATTGGCAGTCAGCTGGCACATGAGCTTGT
ACTTTAGGGAAGTCTGTCGAATGTGAAGTGTTAGTTGGGTCTGCTCCTCC
CTGTGTGGTTGCGACAGCCTAACGTGATTGTAATCCGGATATTCCGTAAT
TTTTACTATGCGTGGAAGTTCAAAAGAAAGTTCTTTGGATATCTGTATTT
TACTGAATTGTGTGGTAAGGTACGGTATGGCTTCCCTTGTCCGTCTATAT
GGCTTCTCATATGAAAATTGCACTATTGTCCAATCAATATACAAACATGA
GATGATGAACCATAAAGGGTTGTAGATAGTATCTAAAAAAAGAACTTCCC
GTAACAAATTAACCCAACACTAATGAAGAAAGGACATACAGTACAAAACA
TCATCTTTGTGCCTAAACGTGACATGGAATACTGCCAGCCAGTTCTTTGT
ATCTCCGAAAGAGCTCGAAATTTCAGGTTTGTTACAATATCAGTTTGCGG
CCCAAACAAATTGCTACTGGTACATTGATCTGTTTTCCATTGTACTTATG
CTAGGGGAGGTAATACGGGAGCACATATAGTTGATAGAAATCAGTGCCAG
TCTGTTGAAGAATCACCGTGACAGGTAATTACAACAGTAAACATTTTTTT
TGGGTGAATGAAGATAATCGATTTGGTATTCAGCTTCACTTTCCCAATTG
CTTGGTTTAGATTTGAGAATGTGGGGATAAATCATGACATAGCCCTACTT
TACAATTTTATGACCATAGTAAGTTTGATACACGCGCAAATATTTGAGAT
GTTCAGGGCTGGAGTTGTTGACAGTAAACAGTTAGAGCTGACTTCAAGTT
TTTTTTTGCCTGTGAGGTTCTATGTTTTATGAGCATAATTTTTTTTTGTC
TGATCAGAGCCGTCATAGTTGTAGCTAGATATAAAGGAAGAGTGGCAGTG
CAATGGCTATTCGATATTGCTGGAGTAATTTATGAATTTGATTAGATATT
TTTGTACAATTTTGAATTTGAATCTTTGATGCAGGCCATGTTTCTGATTT
GGCTGATGATGTTGGTCAGTATGTTGGATGCAGTTTTCCTCCTTTTAATG
TCTTGTTGACATATTAGCTTTCTTCTATAAGCTAGCTGGAGTGCCATTTC
ATTGATAAAATAATGCATTTCTCCACAACGTGTCATGCTTATATCTTATC
TTGTCAACCATTGCTCAACCAAGTTTTTGTTTTTCAAGTTTAGCTTCTTC
TGCTACTGGTGTGATAGTTGCACATCTATGCGTTCAGGCAGCATGTGACT
TTCCAGTAGAACTAAATAACTACTCTTATGCCCTTTGGTGGCTTAGAATG
ATCATAATACTATTTATTAACACTGCAGTTCACTCCGAATGGTCTCTTCT
TTAGAAGGCTTTACTCAGCCAAGTGTTAATGTTCCATTATTAGATATGTT
TTTTTTTTCATTAAACCCAGGATATTTCCTCTATGTGGCAACCTGTTACT
ATTGAGTTTCAGTTAGTAGTAATCAAGGAGTCAGTTTCTTTGATGATGCA
CAATGTTCTTGATTATCATGTATTTTGTATGTAACTAGCAACTATAGTGT
TTTCTTTGTTTACTCATCGATTCCGAAGGAGGCAAGTCTGCAGAGTAGCT
TTTTTAGCTGAATATTGTCATTAACAGTTTGTTCTTATGATGACAAAACT
CCATCATACACCAGATTTAATGTTATCACTATTTCTTTATGTTCAATCTA
GAACCAAGTAAATGTTGGTGTTGGGAATAATTTAGTACATGATGATTAGA
TGGACACTAGCTTAGACTTAATTGTGGTCCTAGCCTAAATTATTTTAGTA
CAGGATCAGATGGATCAACCTCTTGCTCTACACCATTTAGTCTTTTATAT
AAGTGACCAAATTCCTCCGCTTCAGTGTACAAGCTGATAAGATCATGATA
GAATCAAATTTATAAATGAAGTACACAATTAGTCATTTTGAGTTTGCTCT
GGAGTTCTTTTTAACTGTACCCTTTTTATGTTAATTTCCTTTTTCTTTTT
TCATTTCTATTTATTTTGGTTGAAGGATGGTACTTTCTTAATAATAGGTT
TCTTCTAGGTCTCTACTTTTTCCTGACAGATCGTAGCCGTTTGCCTTCCA
TTCAGCATGGTTGTGTGTGCTTTTATGGATATTTCCAGTTTCATAACCTT
TGTTTGTTGGTTGTACTTGTAACTATTCTAACTAAATTTTAGAATTTGCT
TTAGGATGCTGAAATATTCTTCCACACAAATTCTGACAGTTGAACTCTCC
TAGTTCAGTTCCTCAAACCTCATATGACATATTTCTGAACTTCAGACTGT
GTTTGTGTCCGTCTTTTCTATGATCTTGGAGCTATCAAAGATTTATTTTG
TGCTACAGATATTTTATAGTAGTATTCTTAATGGTAATGCATCATCCTGT
TTTGCCTATATAGAGTTCAACTTGAGGAAAAACATTTTTTATGTTTATTC
CAGTGATCTTTCTCATTGCTCGGTGCCCTGCATTCATATTTGTTGTATAT
AGAGCTCTACAGTTTGTATGTCTATTAAACTCCTAAAAGCAATTTTTGCC
TTGCAGATACTTCATGGTCTTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.