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GrainGenes Sequence Report: AA042817

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Sequence
AA042817
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA042817
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGAGAGGGTGCTCAAGGATGATGCTGTCCAGGTGAAGGGTGAGCACGC
CAGGATGGTGAGACAACTCTCTTTTCCCTTTGGTTTCATTTTTGCATTGG
ATCGGTTCGTTTGATGGTGCTTTCGCAGCTAATTAAGGGCTAGTTTGGGA
AGTGATAGATCAGGAACCTGAGCGTTTCCCCACCTAGTGGTTTGGTTTAA
TAGGATGTATTCGTATTTGTGTCATGTTGATGATTTGTTGTTGTTGCAAT
GTCTTTTGCAACTATGTGCAATTAGTTTGATTCTTTCGTGATGAGGATAT
GATGTAGTTTTGTTACTTGCTGTGTTGTATTTTGCTACTGAAGGGCATTG
TGGCATCCCGCTAAAACCACTACTAGAAAATCGCGTTGTTTTTGTGCATT
GCATCATCATGACCGCATGCTCATGTCATCATGCCACATTGCATTTGAGC
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AATAATAAAGTATTGAATTATTTTTAGGGGGGGCAGCCGAACCGGGCTGA
TCCGACCCAGTTGGCCACCCCCAGTGCAAACAGCCTGTCTAAATCCTATT
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CTCTCCCTCCCTGGCCGCTCCCTGCCAGCCCGGACCCACCCTGGGCCCGC
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CCTCTCCCCATCGTAGGCGCTCGTCGCCCCCACCGCAAGCCTCGCCCGCC
TCGCCCGGCCTCCTCTCCCTACCGCCTCGTCTCTCCCTCCGCGAGCTCCC
TCGCCCGAGCTCCTCCGCCCCGTCGCCGATGCACCCTCCCCGTCGGCCTC
CTCCTCTCCGGCCACCGCCGCGCCTCGCCCCAGACCCGCTCGCCCCAGGC
CGCGACCCCCTCCTCCTGTGGCGCCCTCTGGCCGGCGTCGGCCTCGCTCT
CTGGCCAGCGCCGCCGCCGCTCCCTGGAAGTCCCCGGCCGCCGGCTCCTC
GACCCCCTCGCACGAGTCCCCTCCGTCCGGCCCTGCCGCTCGAGCCCGCG
CTGACCCGCCGTCACCCCGAGCTTCTTCCTGCCGACCGCGGCCCCTACCT
ACCTGCTGGCAGCGTCTCGCCTTCGGCCACATCCGCATGGGTGCTCCGTC
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GTGGATGGGTTCACGCCTGACAACCGAGCCAAAACCCGTCAATGAGAGGA
ACCGAAGACTGGTCGTGTCAAACCCAGAAGCCCGATCCCGAAGCTCGATC
CCTCGTCGAACCCCGAAGATCGAACCCTGGCGCGTCAAGTTCTCCTTCCC
GGATTCAAGGACTCCGACATGGTGCGACAAGTACTTCTACCCGAGCATAA
GACCGGTGCCGCGCCAAGAACCACGACTCAGAGATGCCAGAACACCAAGT
TCGTCGAGACCCTGTGGACCCGTTCCCGGAGGCGAAGTCCGGACCCGAAG
ACCGCCAAGATCGCCACCGGTACGACAAGCACTTCGCCGCAGAACGCCAA
GTTCTTCTTCCCGAACGCCAAGACCGACCCGATACACGGACCCGACAAAA
CCTTCGAGACGACAGGATCGGCACCGACCAGGGCGGATCCGATGCGCCCC
GACGCCGCACCAAGTCCTTCTCCCCGGAACGCCAAGCTCTTCATCTTGCA
ACCGACCTTCGAAGACCGATCCCGTCGAACCCTGAACCCTGAGACCGAAC
CCTGAACCCTGTCAAACCCCGAACCCCCGGAACCTCAAGATCGTCGAGAC
CCTAATGTGTGGCCCCTTCCCGAGCCCCTATTTTATAAATTGCCAACTAT
ATAAATTGTTGCATATTAATTGAGCATGCTCGCATACATCTCATGTGGTT
TGGGGGGCATTATGCCGATTCACCTCATAATTAAATATGGGCATATGCGA
GCAAATCGAGTCTCATATTGTCCTCATTTAAATCTGTGTAGCGAACCGGT
AACTTATCTTGCCCTGTTATTACAACATTTAATTTGCAGGGTAGATAAAT
AAAATGAACCATCTAAATAATTATCGGGACCCCGGTTCCGCTTAATATTG
CCTAATCGCATCGCACCTTTGCCATGTCATGCATCATACCTGCATCATGC
TCGATCTTTTGTCGTAGTATTAAATAGTGCATCCGGTGTTTATTCTAGTG
TTTTGCTTCTTCGCGGATAAGGCCGTTGAGTTGATGTGAGCGTCGACCCG
ATCTTCGGATGAACCTTCGGCAATGTTTTCAGGCGAGCACCTCCCCCCTT
TCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTATTCCCTCCTGTTGATCTATTGC
TATCTGTGTTGTGATGCTCTAGTTTTCGTACCCGTGATATCCTTTGCAGC
CTTATATTGCCTTGGACACCTATTACCTGTTGTTTGGTAGATAGTTGGAC
CTGCGCGACGTAGTCGCTTGCTCAAGTGCTGTTGGGTGTCGTCAAGAACC
ACAGTTGTTGGAGTCTTGCCGCATGTTTAATGTTGGAGATGATCATGGCT
TTAATTATCGTTACTTTAATTATTGTTTAATAACTAAAATTGAAGTAGGT
AAATGCAGAGGCACCGGTGGGTGATAGATAATATTTGGTTTCCGACCGCC
CACTGGTGTCCCGTAGGACCCCGAGTTCTTGACACCTGTTCCGAGATCGA
GCGCGCTAACCACAGGTGGGGAGATATGGGCCCCCCATCGATTAGTACCT
GATTTCAAAGTATTGTACTGGGGGCCACAAACTAGTTTGAGGATTTATTT
ACTATCCTGTACTTATGCCATGTTTTACTGCTTTATTTAAATTGTGCGAT
GGATAGCACCTGTACTGTTTAGGATCGGGACACGATTTCGCGGTGTCGAC
AAGCCCAGTTTTGGGTTCCCAGTCGTTCACAGCCGTCTACCCAAACCCTG
AGTCCGTCTCGGAGACCGGCCGACTTCGTTGCGGGTCTACTTAGTGGGGT
GGCCCCCCATGCTTGCTTTGGGTCTGAAAACGTCATGACTTAGGCCCCGC
CGACATACCGATGGGTGTATGTTAACTGATCTGGCAAAAAGGGTCGAAGT
GCTTGTGGATACTTTGGTGCACCCCTGCAGGGTGAAATCTTTTCGAGAAG
CCGTGTCCGCGGTTATGGATGACTTGGAGCACAGTGCTTGATCATAGACA
ACTATAACTAAAGTTTACTGTTATAATTTGACCTGTATCCGATCTGACTA
GTAATCAGCTTCACTGCAACGGAATGGCTAAATAAAAGTACCAACAACTG
CTGGGTTTGGGGATATCTCATGCTATTTGTTTCTGACTAGTAAGTGTTGC
AACTACAACGGAATGGTTAACTAAAAGTGCCCACTGCTTATTTTATCAGG
ATAACCATCTACACCTGACTAGTAATTGCTGCAACGATAACTGAATAAAT
AAAACTGCCAACTGTGTGAGTTCCTCGGTTGACTTTCTCGGTTGGTATCG
AAGGGGAATACCGGGATGGGTTTGTTTGGTGTTGGATTCAGGATGGTTCC
GAATAGGTCTTTCTTACCCCTCTCTGATAGCCGCCGGTTATATCGAGTCT
CTATAGGTTGTTTAGTGCATGCTGCCGCTGCCGCTTCAGTCCACCATACC
TATGTAGGCGAGGACCGCCGAATTCTAGTCTCGCCGTGTACTGGCCTCAG
TACTGACCGCTCTCTCTTTTTCCTTTGCCCTTCGTCGGCACCCCTTTTGT
TTAAGCAGGTTTTGAGATCGACGTCGTTAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTT
GGCCTGGGCAGGGTTATGGACGCCATTGGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGC
CCCATTTGCATCTTGTCCGTAGTCGGACGCTCTATCGTTTTCAAGGTGAT
TTGGATCTTTGTATTGTATATCTGTATTCTTGACTCATGGAGTCGTGTTG
TATATATATCTGTCCTGTGGGTCCCATCGAGGACTGTTGTGTAATGTTAT
TACTTCGTTTTCCACCCGCACGCAAGTGCCTGGTGGGCACCTTTGAATCG
TTTCTATGCGGGTTTGGCGGGTTTCGCTAAAACTTGCATATGGCCGATTC
TGAGGGTGTTACAGGTAGGTTACTGATCCAGGGTAATCTGCTTTAGACCG
CATTAGTTATAAATTGCTTTGGGGGGGTCTTTGTCCAACCTCTTTGTTAG
ATCTTTTTATTTCATTCAGTTTCATCTCCTGGCATGCATCTTTTGTAGGT
GGCATCGCAATCGCGGACTCAACTAAGACCACATTGGGACCAAAAGGAAT
GGTATGTCTGTAAGATTTGCCTTTTGGATCTTCTAGTCTAGATGTTTAAA
GTAGCATACTTTAGGTTCGATCTGAGAGAGGAGAAGAGAGAGATCGGAGT
GAGACTACCTGCGCCTTGGCTCGAGGAACACGAGCCAGAGGGGATGCCTG
AGCCGGAGCTGGTGGCCATGGGGAAAGGGCGACGGCGTGGGTGTGCGGTG
GTGGCGGTGCTTCCCGTCGGCTCGCACTAACCCTAGATCGGTAGGGATAT
AGGTGGGGCGTACGGCACAGCGACTAACCTCGTGTTGCGTGCTGCCGGTA
CCCCACCTCTTTATATAGCGCGGCGACAGGGGCCCACCCACCAGATGAGG
TTGGGGCGCCCCCGATCAGGGCGCGAATAAGGGACTCCGTTCGGCTGTTG
GGCTCAAACGGGGAGAGATCTATCCAACATTCTCCCCCTTGATCTCGACT
TTACTTTTAACTTCGTACTTTACTCATTTCATCACGGATCGGTACATAGA
GCATGTTTCATCGTCTTAGCTCAATTGCCGATAGAATCAGACAGCCACTA
CATACTTTTCTATTTTGAAACAAATCCTGTTACTTTTGGGCCTCTGTAGT
CCAGGAATCATAGGCTTTCCATTAATCTCATACCGGCTATGTGTCCCTTG
AACACATTGGGTGGTAAGCCTTTCGTTAGCGGATCCGCAAGCATATCCTT
TGTCCTTATATGCTCGAGACTTATAGTTTGATCCTGGACTTTGTCCTTCA
CAACATAATACTTTATATCTATTGACTTTGTAGTATTACTCGACTTGTTG
TTGTGAGCATAGAATACTGCGGGCTCGTTGTCACAGTACATCTTTAGTGG
TCTGCTGATGCAGTCAACCACTTTCAAGTCGGGTAGGAATTTATTTAACC
ATAACGCCTGTCCCATGGCCTCATAACATGCTATAAATTCTGCATACATC
GTAGATGATGCAACTATCGACTGTTTGACGCTTCTCCACGAAATAGCACC
TCCTGCGAGAGTAAAGACATATCCTGTTGTGGACTTTCTGTCGTCTTTAT
CTCCTGCAAAATCCCCATCTGAATACCCTCTTATTTCTAGGGAATCAGAT
CTTTTACATGTTAGCATGAGGCCTCTTGAGCCTTGCACATAACGCAGAGC
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CGAGTACCCCGGTGATAAAAGCTAAGTCAGGGCGAGTGCACACTTGTGCA
TACTGTAAGCTTCCAACAGCCGAAGCATATGGTACTGACTTCATTTGATC
GATCTCATATTGGTTCTTCGGACATTGGAATTTTCCAAAACTATCGCCCT
TGACTATGGGAGCATGTGTTGCATTACTCGCATGCATATTGTATTTCTTT
AGATCTTTTCACAATATGCTTTCTGCGACAGTCCTAATACTCCATTCTTT
CTATCTCGGTGAATTTCTATGCCCAAAACATAAGAAGCTTCACCAAGGTC
TTTCATGTCAAAATTTGAAGACAAGAACTTCTTTGTTTCTAGTAGTAGAT
TGACATCACTGCTAGCAAGCAAGATGTCATCCACATACAGAATTAGGAAA
ATATATTTCCCACTTTTAAACTTTGTAAAAATGCAGTTGTCCTCAACATT
CTCTTTGAATCCAAATCTTTTAATTGTATCATTGAACTTTAAATACCACT
ACCTAGAGGCTTGCTTTAACCCATAAATGGATTTCTTTAGGCGGCATCCC
ATATGTTCCTTCCCCTCCATAAAAAAACCCTTGGGTTGTTTCATGTAAAC
ATTTTCTTCTAAATCTCCATTTAGAAATGCCGTCTTAACATCCATTTGAT
GTAACTCTAAATCAAAATGTGCAACTAGTGCCTTTATGATTCTGAAGGAA
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TTGCGTAAAGCCTTTTGCCACAAGTCTAGCTTTGTACTTTTTTACATTCC
CATTGGAGTCATACTTTGTTTTATAGACCCATTTGCATCCTACTGTTTTG
GCTCCTTTAGGAATTTCCTCTAAGTCCCAAACATTGTTGGACCTCATTGA
TTTCATTTCTCTTCCATTGCCTCCACCCACTTGGATGAGTGAGGGCTTCT
CATGGCTTCTTCATATGAGGTAGGATCGCCCTCCATATGAACTGTTTCTG
TGTTGTAGACTTTGTAAATTTCTTTGGAAATGGCTGGTTTTCGTTCTCTT
TTAGACCTTCTGAATTCATCAGACTCTTGCTCATTTCGTGCCTTAGGTTC
TGGCACATTTTCAGTATGTGGCTGTTCTGGCTCCCTTTCGTGCTCAATAG
TGGGTTCAGGTGGCTCCTGGTGGACAGGTTCCGAACCTTCTCCCATTATT
GTCACGTGTGGAGTCACAACAGGTACCGGCACCACAACCTCAGGGGTTAT
AGATGGTGGCACAACAGGTAGCGAGAAAAATGGCTCCTGAGTCATCGGAT
TAGGTGCATGCACCCTCTTCTCCTCAAGATCAATTTCCCGAGCTACCGTG
CTCCCCCTCATCAATTCGTCCTCCAAGAAGACTGCATGTCTTGTTTCTAC
AAACTTTGTGTTTCTGTCAGGACAGTAGAAACGATAACCTTTTGATTTAT
CTGGATAGACAATGAAGTGGCAAGACACTGTTTTGGGGTCTAACTTTGCA
ATGTTTGGATTGAAAACTTTTGCCTCAGCTGGGCTCCCCCAGACCCTCAA
GTGGTGCAGAGAGGGGACTCTGCGTGTCCACAATTCGTACGGTGTTTTGG
GCACCGACTTACTTGGTACTCTGTTGAGAATGTGAATGGCGGTTTTAAGC
GCCTCCATCCACAATCCCAATGGGAAGGTGGAATAGCTCATCATGTTGCG
CACCACATCCATAAGGGTACGGTTACGCCTTTCAGCTACTCCATTTTGCC
GAGGTTCGCCCGGCATAGAATACCGGGCGACTATTGCATTTTCCTGTAGG
AACCTTGCAAAAGGTCCTGGTACTTGACCATATGGAGTATGCCGACCATA
GTACTCCCCCCACGGTCAGACCAGACTATTTTAATTCTTTTATCATGCTG
ATTTTCAACTTCAGCTTTGAAAATTTTAAATTTATCGAATGCCTCAGATC
TTTCTTGAATTGGATAAATATAACCTTACCAGGAGTGATCATCCGTGAAT
GTTATGAATGAATCATAACCATCCACACTTTTCACAGTAAAAGGTCCACA
AATATCAGTGTGGATGATTTCTAGTGTTGCTATACTTCGGTTTGCACCCT
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ATGTCTGAGAACTCTAACGGAGGAAGAATGTTATTTTTAACGAGGCTTTC
TATTCTTCCCCTCGAAATATGGCCTAATCTACAGTGCCATAACTTCGATG
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GGCACGACACACTTATTAAGTTTCTATGGATGGAAGGAACAAATAAAACA
TCCTTAAGCAGAAGAGTAAAGCCATCAGCTAGCTCAACATGGAATCGTCT
AAGAAGGGGTTCTTACCTATGTCTCATGGTAGCAAGACTCTGTGTCCTTC
GACGACTGATGAGCAAAGTCGGATGAGTGTGATTCCATATGCTTCGGCAG
TCGGATCCATCATGTATTCCATGATTTGTACTAGGCCGGATGTTTCCTAT
GCTCTAGCTGTTGTGAGCAGATACCAGACTGAGCCTGGAGAAATCCACTG
GACAACGGCTAAAAATATCCTAAAGTACTTGAGAAGGACTAAGGATATGT
TTTTGGTTTATGGAGGTAAAGATGAACTCAGTGTAAAGGGTTACATGGAT
GCGAGTTATCTTACCGACTCTGATGATTCTTGTTCGCAATCCAGATATGT
GTTTGTAATAAACGGAGGAGCTGTGAGTTGGAAGAGTTCCAAGCAAGAGA
CTGTGTCTGCGTCTACAACAGAGACTGAGTACATTGCCGCCTCGGAGGCA
TCAAAGGAAGTTGTTTGGATGAGGAATTTTTTGATGGATCTTGGTGTGGT
TTAGGGCTCGTCCAATCTGTTAGAGGTGTATTGTGACAACAATGGTGATA
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ATGAGGTACCACCTGATTCGCCAGTTCGTGGATCAAGGTGATATCAAGTT
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GTACTTTGGACAAAAGATGGCAGACCTTCAAATGCTAGTGTATTTTCCTT
CAAAATTACATATTACCTTGTTTATGTTCAGGACAAAATGCTTCAATCGA
CTGGCAGAGCGCGGAGTGTCACTGTTACAAATGATGGGGCTACCATTTTG
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ATTGCTTCTTATAGCTTCTCCTAACCTCATTTGATTAGTTGGTTGTATGA
CTGTTATCCCTAATAGGAAGAAAATTTAGTCCTTAATGATTGTTAGACAT
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TTTTGGCTGGAGAACTTCTGAGGGAGGCTGAAAAGTTGGTTAACATGAAA
ATTCATCGAATGACTATTATTGCAGGTAGTCCTTATACTAAATAACATAT
ACTTCCTCAGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAAAAAATGT
ATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCATTCCAAACTTGAGTGAACCTA
GATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCACAAAGCTAAAACATCTT
ATATTTTGAAACGGAGGGAGTACTTTCTATCTCTAGGATGCTGTTTGAAA
TGTAGTTTATAATATTCATTCATATTGTTACATGATGCTGGTAAAACATT
GATTTGATATGCACTACGCTGGTCACTGGTGACAGGGTAGCACCAACTTG
GAATCAATCCAAATTCTGAAGAAACCTGGTGGATCTCTTAAGGATTCCTT
TTTGGACGAAGGGTATGTTTTTTCACAAATTATGTCGTGGGTAACTTTGT
TCTTTTTTATCCCAACTGTGTTATGTAAAGTTTACATGGAAACACTTGTA
TATCAGTTTCAAACTGACAGCTATGATCGTAATAGTGTTATCCATTAAAT
GTTCCGATTATGTTTTGTAGGTTCATTCTTGATAAGAAGATTGGCCTTGG
TCAACCAAAGCGAATTGAAAACGCTAATATTTTGGTTGCGAACACTGCTA
TGGACACAGATAAAGTTAAGATTTATGGTGCACGTGTTCGAGTGGATTCG
ATGTCTAAGGTTGCAGATATTGAAGCTGCTGAAAAACAGAAGATGAGAGA
GAAAGTTGAAAAAATCATTGGTCACGGGATCAACTGCTTTGTCAACAGGC
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TGGTGGTGACATTGCATCAACTTTTGACAACCCAGAGTCTGTTAAGCTTG
GGCACTGCAAGGTCATTGAAGAGATTATGATTGGGGAGGACAGGCTTATT
CATTTTTCTGGTGTTGCTATGGGGCAGGCTTGCACCATTGTCCTGAGAGG
AGCAAGGTATGTCTTATTTGCCTAGATCTTATCATGCAGGATATCATGGT
ATTATTTAGGCATTTAATTTTATTTGCCATTCACTGAATATAATGTTTGC
TTGTTTTCTACAGCGAGCATGTTCTTGATGAAGCTGAGAGATCGTTGCAT
GATGCCTTGTGTGTGCTTTCTCAGACAGTAAATGACACCCGTGTCTTATT
TGGTGGTGGATGGCCTGAGATGGTGATGGCCAAAGAGGTTGATGAACTTG
CAAGGAAGACCCCTGGGAAGAAATCCCATGCAATCGATGCTTTCTCGCAT
GCCTTGCAAGCCATCCCAACAATCATAGCTGACAATGCTGGTCTGGATAG
TGCCGAGCTGATCTCCCAGCTCCGAGCTGAGCACCACAAGGAGAATAGCA
CTGCTGGAATCGATGTCGTCACCGGCGGCGTAAGCTCATGGAGATACCAA
TTTTCTATGTACTCCCTTCGTTCAGAAATATAAGACGTTTTAGCATTGTG
AATCGAACGTATCTAGACGTCGTCACCGATTCGTTTCACAAAACTAAAAT
GTCTTATATTTATGAACGGTGGGAGTAATTTTTACCTGGGTTTTGGAACT
AACATGGTCTTCGTTTTCTGCAGCTCGGAGACATGCAAAAGCGAGGGATA
TGCGAGGCGTTCAAGGTGAAGCAAGCCATCATTCTGTCCGCAACTGAGGC
TGCAGAGATGATCCTCAGGGTTGATGAGATCATAACATGTGCCCCTCGCA
GGAGAGAGGATAGAATGTGATCTCACAATCTGTTTTGACGCAGGATTGTG
TATGTTCGCAAAGTTTGGCTGAGTTACTGTGGTCAACGACGTTTATAATT
TGCCTCGAGTTTTATTGCCGTTGACCGACCCCTAAGAAATTGGAGCTTGT
TGTGGAATAAGCCTATGTTCCGTAGGCTTATGTTTTAATGTCGTAGTCTT
TTGTTTTTAATTTTATCACCCTTTGTGCAGTTACCCCCAGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.