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GrainGenes Sequence Report: AA008941

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Sequence
AA008941
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008941
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCGCGGCCAAAGGCGGCAGGAGCACGTTCACGGTGGTGGCCACCACTGC
CACAACATCTACATCTCCATCCCTCACGAGAGATTCCTATTGGCCAAGAT
TAACTGCAAGACCCAAGCAACCGACACGGCAATTCTCCCAGAACCCAATC
AAGCCCAGGTATGGTGCTGGCTCCAAGGTATACAATACGACGAGCCTACC
TCAGTCAAGTTCGATCTCGGCCGGCTCAATCCTCTGCCTCGATCTCGGCC
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CTATTGTACACCTTGTGTTCAACATATACACCTGATAAAATTGGAATGAT
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ATTGGGGTCTGGGATGGAGCCATGGAGGTGGAAGGTACTGCGGCCTCGCC
CTTCCTCTGCCACAGGCGCACCGCCACCATCCACACCGCACGCACACGAC
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CTATCGTCCCCTTCAAACCGTAGGTTGCGGCGGCCGCCACCCGCTTTCTT
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CTTCAGAGTTTGTTTGTTATACACAGTCTGACAGTCACACATACTGACAC
AAAATTATGCATGTACGACCTGGATTTGCTAAATCTGAATATGCTTTGTA
TGAACTAGATAACTGAAACAATAACAGTGAGCTGACAAATTATTATGGAA
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GTTGATTGGTTGAGTTTTATTATTTGTGTTTTTCCCCCTCTTGTCTTGCT
AATGTTCCTTCATATATGCCTTTATGGTGTGTAATCTGCAGTTCTTTTTC
TGTTCTTTTGCAGATATTCTGCTCAAGTGTGTCATATCGGATCTTGAATA
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TCACGATTCATGTAGATACACTGATTTTCTGCTGATTAGGTAAGATTATT
TATGAGCTTCTCATTATTTGCTATAGTTCACAATTGTGTTTATGCTCTCA
AAGACATTCTTTTAGTGTATAAATACTTGCATTCGATAATCCAGGGCTCA
GTTGATTAACATATGTAAGTGTACAACAATCCGTTTTCCAACAACCATAT
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AGGTAATGGTCAGCCATGCATACACCCACGGTTCACATTGTTAAAGTAGC
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CCTTTACTGTTATTATTGTCATTTACCCGAACCATGATCGTCAATTAAAC
TTTGCAAGCGAATGTGAAGAAAGTGTAGATTTACAATCTTGGGAGGTGTT
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TAAGAGTCATTAAGCATGTGATCCAACCAGTTGTGGCCATTATTTTTGTA
TAGTTTGTCTGTCCAATTCATGCCCATGGTACATACTGGTTTTTTTCACT
ACTCCACCTGAATTTTCAATGGTGATGCGTAGGCATATATGCATGAATGT
AGCTATGGTGCTTCATACAGAAAGTTGTAGTAGTAATATTTCTGTGGTTT
TTCTTCTGGCTGGAGTAATGCATGTTATGTGGACATGAAAGATTCAGTCG
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TTGTCACTTTTTTGCTATGGTATTTCAAGCAAACTCCAGATCAGTTACTG
CACTTTTAAGAAAGAGAAGTTCATTTATGTATGGGGTTCATCTCTTCCTT
ATTCATTCTTATAAGTAACTAGGTTGCTCTTTTAGTCTGATCATGAGTAT
GCTTCAACTTAATAAACTAGCATAACATTATTTCGTAACGATTACATGCG
TGCGTGTTTCAATTATGACTAATGTTTTTTGTTGTTGAGGGATGGAGTAC
TTTGACGATAAAGTAGCACACGAAACGGCTGCTTATGGTGCTAATTAGCA
CGGGTACGACTAATACGGCCAAAGACTGCACCAGATGATGTAATCGTTGT
GGTGTCCAGCGGGTCCGTTGAGCCGATATAATGGAACCGCAGTTTTCCAA
GTCAAAAAAAGTACTTTGATGCCACTGGAGGAGGACATGTACGATTTTAC
ATGTGCCGGTCTGGTGACTTTGTGTTTGCCCACGTAGGTATGAATTAATT
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ACGATAGGATCTTTCTAGGAACAACTACTATCCTTCTGTTATTTTCTTTA
GAATGATCAAAGACATTGTTTTGTTTGTGTGAAACCAAATATTTGATAGT
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CCTACATTTAAGGATTCCTTATTATCTTTCTTGGTTGGGTTTTCTACTGA
TCACTATCATCTGCTTAGGGTGTGTTTGTTAGCCTGGGTGAGTCCAGAAT
TCCCATCTCATCCCATACAAGCTGACCTTAGCTAAGTTGAGCTGAGATTT
TCATATGTGTTTGGCAGCCTGTGTCTGTTGAGATATGATGAATAGAGATG
TTGTTTGGTGGGCTGTGTCTGTTGAGATATGATGAAAAGAGATGTTGTTT
GGTGGGCTGAGTCTGTTTAGCCATGCTGAACTCAGACTTTGTTTGGTAGA
GTGCACGTGAGTAAGATGTGATTGCCATGACTTGGTGCGATGACCACACA
AATATTTTCAAATTTCATCCATTACGTCATAAATTCGAAACACAAGCAAG
TATATAGCACGAAATTACCCCAAAATGATATATTACCAAGGATCACTTGA
GCACATAATTCAGCATGTCTACAACACCAAAAGCTAACATAGAAAATACG
TCCAAATTACCAAGTCTGCATCATATAATATAGTAGGCATTACAAAATAT
ATAGATTTTCATGTTGCATCAACTGACAAAAACTCAAACTAGATCCAGAT
TTTTGGCTATGATACGCTTGAATGAGGCTTCACGAACATCCGCTTCCATT
TTCATGAAATTAAGGCCTTTACCCTTATGCTCCGTCAAATAATCCAAAAC
AGCCAACCGTTCATCCATGTCGAAATTGGTAAGGTCCATAACCGTTTTGC
ACAAATCAGGGTGTGTTTCGGTATGGCAAGTGTTATTGATAGCACCAGCC
ACATCACGCAATGCATCAGACATGTTGTTTACCTGAACTGCATCTTCGTC
ACTCAAAACTCGCTTCCTATTTTTATTATTTGTTGAGCCAGAAGGTGAAG
GAGTAGTTGCTCCGAGGCCTTGAACTCCAAAGTTGATGGGGATTTCACCT
TGCACAAAACCTTCACCATTGGTTTCTCCACCCTCCAAATCAATAGGTTT
TTCTAGAGTTTCAACTTCAATGGGTTTCCCCAAAGGCTCATTAGATCCCA
TTGCGAACTTTCCTGTGGCTAGCTTATTGGCAAAGCAAGCTTCCATGTAT
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CTATAGATATCATGAACAAAAATATATTTTAGCACTATAACAACATGTTT
CCAACAGATTTTAGTAATGAAACAATGGGTTCTTGGACAAACCTGGGTAT
GCCCCAAGTAATGTTGGTCTTCTAAAACAATCATCTTTTGATTATCATCC
CAAAGTGCCCCGCTTAGAAGTCTCAGTTTCTCGATTCTTTGATACCTGAT
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CGATGAGTTTGGTCAAAGCTTTTGCTGCTTGTCCAATATGGATCTCTTTG
AATCCTTTGTCGGTCTTGACACCTTTTGCTGCAATCTCGGCGAGACATCG
CATCATGCATGCTGACATCATAAGGGTCCAAGTCATAACCTTCGGAGCCT
TCTTTTTTGTAGCACCTACATCCGGAACTTCGTTCTCAATTTCAGCCATC
TACAAAAAAAAGCAGCACCAACATGAGTAATTACAGCAATAAAAATACAA
GTTCCAGCAAAAGAAAAGTAGTTCCAGCACTAATAGAGACATTTCAGCAC
CAAAATGAGTAATTTCAGCAATAAATATAGACATTCCAGCACCATATTGA
TATATTCCAGCAACAAAATACAAGTTCCAGCAAAAGAAAAGTAGTTCTAG
CACTAATAGAGACATTTTAGCACCAAAATGAGTAATTTCAGCAACAAATA
TAGACATTCCAGTCCCATATTGATATATTCCAGCAACAAAATACAAGTTC
CAGCAAAAGAAAAGTAGTTCCAGCACTAATAGAGACATTTCAGCACCAAA
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TTCCAGCAACAAAATACAAGTTCCAGCAAAAGAAAAGTAGTTCCAGCACT
AATAGAGACATTTCAGCACCAAAATGAGTAATTCCAGCAACAAATATAGA
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TACACATTTCAGCACCATATTGATATATTACAGCACCAAAATGCAAGTTC
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GATGCATCAAATGTGTGCTGTGCCCCCCTATTCGCCCACATCGCTTGGGC
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TCATCCTCCCCAAATTGAAGGATCCAATTATGGAGAACGGCACAAGCTAT
TACTACTTTTACTTGGGTCTTGTAAGGATGGAATGGCTTATTGTAACAAA
CTTCCACCGATTCTTATATGCGGCAAAAGCTCATTCAACTGTTATCCTTA
GAGAAGAGTGTCTCAAGTTGAACAATTCTTTGTAATTTTCAGGATGATTC
CCTGCACCATACTCCTTCAAGTGATACCTTGTCCTACGGTATGGTGGACG
GAAACCCGGTCTCACGGCATACCCAGCGTCAACAAGATAGAATTTTCCTA
CGAAATTCCAACTATTAGGTACATCAAAAACTATTGAAAAATATGTGGCT
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TCATAAATATGTAAGTATGAGTGGAGGGAGGACGAGATGAATATATAGAT
TTTTCCGAATAAAAGTAGATTACCTTGAAGTAAGGATTGAAGCGGTTGTT
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GTGGCCAACTACCAGGAGAAACATGGCTACTTGTTCCTCAATGGAAGTAT
TAATACTATCTTTCAATAATTCTCTCTCTCTAAACAAATTGCACAAGCGA
AAAAAGGGAGCTCTTTTCATTCTAAGCTGATTTGAGCAATTTGATTCGGT
AGAATGATAGATAAATCTCAAGTTTGATTCCCTAGCTATATCCATATCAA
TCCTACGACCTAATAACATCGGAGTTTGGTTTCTAGCTCTCCTTGAGATA
AAAATCATGTAAGCTCCCAATGCAGCTGCAAGGCCGGCTGCTTGCACGAT
TAGTTGACGTCGTTTTTTGGTCACATCATCCATCTAAAGAGACAAAAAAA
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GGTGCAGATGCCTCTCGTGCGTGCAGGCGTGCAGATCGGTCCGGCGTGCT
GGCTGGTCGTCCTGGTCCGGCGGGGTGGCGGTGGTACTCCTGGTCCGGCG
GGGCAGCTGGCCGTCGGAGCTTGGCGGGTCGGAGCTAGGTGGGGCGGCGG
TGGTCGTTCTGGTTCGGCGTGATGGCTGGCCGTCCTGGTCCGGCGGGGTG
GCGGTGATAGTCCTGGTCCGGCGGGGGAGCTGGCCGTCGAAGCTAGGCGG
GGCGACGGTGGTCGATCTGGTCCGTCGGGGTAGCTGGTCGCCGGTCTGGG
AGGAGTGGCGGTGGTCGTTCTGGGAGGAGTGGCGGTGGGGAGGAGCAGGG
GGAGAAAGGGAGGAGTGGCGGCTGGGGAGGAGCAGGGGGAGAAAGGCAGG
AGCGGCGGCTGGGGAGGAGCTTGGCGGCGGTGGATGCGAATGGAAGAGTG
GCGGCTGGGGAGGGATTTGGGAACGGGTCGCGAGGGAGAGGGAGTTGCCC
TACCGCAGGGCCAAGCGGGAGTTTTTTCGGGGACGCGCGGGGCACAATTT
TTCGGGTCAACTCGGCCAGGCTCACATGCGAACCTCGTTTTTTGCTTCTC
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GCTATTATATATCTTTCTAAGCATTTCATCAACAAAGAAAATTCTAAGAT
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TTGCAAGTGCGAATGGATATACGTGATTTTTTGCTTCGGACAATTTGTTT
TCTGAGATTTTGCTCCATTTGTGAAAAGCAAATTAGTGTTATTAACATTT
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TCTTGCTGACCATTCCAGGAAGAAAGTGTATTAGAGGCTGCATCTCATAA
GATTCACATTCATTGTTTATTGTGGTTTTCAACATCAAAGATTTTATCTC
TTATATAATAACAATGTTTGGTTAAAAAATATTAAATGTAGAAATTAGGC
ATGTTCATAATATAGCTGGTATTTTCAGAAACAGAGAACATAAAGCTTAA
CATGATGTAGATAAGGTCATAAGGTGTTCTCTTAGTATTTCCCATTACTT
CAAGTTTAATGGCTCAGAAATGATGATATATACCTGCTTTATATAACAGT
GAGTCATGTTTGTGTAGATATTTGAAATTATTAGCTGCTTGATGTGCTTT
TGTTCCTAGATAGATATGTCCATTCTTTCACTGTTTGTTCCACAAATTTT
GTTGTGATGGTCAATTGTAGCATTAATTTTTATTTCATTTTCTTGTCACC
ACTGCAGGGAAGAGGATACCAATATAACAGTACAATGGATGGAACTATTG
AATATCAGTAATGCCAATCGTGGCACTGCATTACAAAAGAATTGTCTCAA
GGTGTGCCACTTATGACCCGTGTAGGGCATTCCGTCGGATGTTGCTTTGC
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CTTAGAAGTTCTATCTCATTTGATTGTGATCATACTTAGAGCTCCAATAG
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GGTATTACACCATGTGTTATGTCAGCAAGTTGTGTTATATGAGGCATGGT
CCAATCAATCAGGTTTAGTTTTGCATGAGTTCGATATTAGTTGATCCATT
ACATTTTCTAACTGTTTGTATTCTTGTGTTCGATGTGACTACTGATGATT
GATGGCTATGTATAAAATTATTTATTTATCTGAGTAATGAAGTTTTTGTT
CAGTATTCCTATTACCATGCTTGAAGCCCATGAATAAGCGTTACAATCTA
TCCTTTATCTTATTCATTTATGTTGAGAATGGTATTTGCATGAAAGTTTA
TGTTCATGCACCAACTACATAGCATGGTGGAAATAAAACTACTCGAGGAG
ATGAAAGAGTGATACTGATGTGATTCCGTACACTATGGTCATGCTATGTG
TCCTTCTGGTACTCGATGGTTGGGGAAGCAGAAAAAAGAGGCCAACAACA
AGAAGTACTGCCTATGTTTAGGCTTTTAGCATTTGCGCCGGTAATTTTGG
TCTCTTGTAGCCATGGGTATCTTCATTGCATTTTTCCTTATTGTTCGGTG
TGCATTTTTTTAATCTTTACTAAGAGTGTTTTGAATTTTAGGCCAGATGT
CTACAAGTGTGAATCTCATTCATAGTTGCACTCTTTGTTTATCAGGAATT
ATTACATGTATTACTGATCAATCGTGCCACAATTGCTTTTAGGTGGATTT
GATTTAGATACATCAACTATGGTTAGGCTATTTATGGTGCTATTGCCTAT
TTGAAGCCACACCTGAACAAATAGTGATAAAATGGTGTTCCATCTCATTC
GTGTTATAGAACCAAATGCTGGCAATGTACTTGATATGGAGAAGTATTCT
TGGACTCAACAATTTCCAAAGGTTAATCTCTCTGTTTCCGGTTCTGAAGG
AACAAAGTGAAGGTTTGTTGTCCGTGAGATTAAGAAGGATCATTTGAAGT
TTGGGTAGAAGGTCCAGCCACCTATCATTGATGTAAGTAGTAGAAACTAT
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TGCTTCTGGAGCATAGGTATAAATCACAAACTATGTACTGTATGTTAAGT
TCTATAGTTTTGTTTCCTTGGTGAATAATAATCCATGTGATAATTTCTTC
AGAGGACAGAAATCACTGTCCATACCGCGGACAAAGAATTAACTAAAGAA
CTTCCCTTGGGGTAAATTTCACAGAAAAATGTTTCAAGCAGTCTGTACCT
CAACTTTAAAAACTTCATCATCCAAAACTATAAGAAATTCTGCTTCTAAG
TAGGTATTTTGTTGACAACTTAAATTTTTGGTAGTCTCTATGTATAATAT
ATAGCTATATGTATTCGTAACTAAGCTATGATATAGTTGAACTGCCAAGA
GCGGTTTCTTAAATATCTACTTACTATTGCATCGATTCAATGATGCAAAA
TCTCGAGCAACAGGTTGAAATTAGTTCAAGGCAGAGGAGTGAATTTACAT
GGCTTAAGCTTTATTTAACAATTGACACTATTAATTTTCTTAGGTGGTGA
TTTTCTAGGTCTTAACTATTCTTTGCCATTCTCCACTGTGTTATCAGGAA
ACTATTCTGTCATTCTCTACTGTGTTGTTCGGAAACTATTCTTTGTTCCT
TTCTTACAATGTTGGTGTAGAGTTGGTGTTCGGAGGCTGTTGTTTCTCAC
GTAACACTTGAATCATTGGAAGAGCCGTCGAATAGGTAGAGCGCTAAATG
CCATAAGTGGTGCATTTTCTACTTATTGCTCATCATCTATTTTTTTGAAG
GTGCTTGTCATTTTTTCCGATAGACAGTCGATTCTGATTCTTGGCGAGTA
ACTTATCTTGGTGGCAAACCTACATTGATTTTTTGCTCTCTATGTCGTTC
AGTGTAGGGACATGTGTGGATTCATGTATTTTGTATTTTTTTGGGTTCAC
AATATGATTCATACACTCAGTCTGTAAAGACTATTTTAGTTGAGATCAAT
TGTTCAATCTTTATTTAGTATACCATCCTTGATAATTTTCTGTTGTTCCC
GTTGTCCATATAGTACAAATAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.