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GrainGenes Sequence Report: AA049191

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Sequence
AA049191
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA049191
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGCGGCGTCCAACGGGTGGGGCGACGACGACCCGACCGACGGAGAGTG
GACCACCGTCACCCGCTCAGGGCTATCCAACCACTCCGGCCCGGCCGGGC
GCTACCCCAACAACAACACCGCACCGGCCGCTCCCCGCCGCCCCGCGCAG
GCCGCCCCGACGGCCGGTGAGGTCGCCAAGGGCTTCTCCGGGCTCGAGAT
CGAGGACGGGAGCCGGAAGCTGGACAAGTACGACATCCCGGTCGAGGTGA
GCGGCGCCGGCGCGCTCGTGCCGGCGAATGGGTTCGAGGAGGCCGGGCTC
GTGGAGGCCGTGCTCCGGAACGTGGCGCGGTGCGGGTGCGACATCCCCAC
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CGAGTCGACGTCCTGCAGATGTTCTTCTCGTCCGCGCCCGCCCAAATAGC
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TTGGTTTAGTCCTATGTTGCACTAATTTTCATCTTCATCTTCATCATGCT
TCATTCTTCATCGTGTCTCGTGCCTGGTTAGATTTGCATTGTTCCGATTT
ATGGATAACTTTATGGTTTTGCTTTGCATTCATCTCTGTACTTTATTTGT
AATCAGGTAGCTATCTATGTCTTAGCATTTTCCTTTACAATTTGACTTCC
ACATTTAAGGGTGAGTATCTTATTCGGTAGAAATTAAAACTTTGCATATC
TGCATCTTTGCTGCTGATGTAGAATAATGCAAGTTAGTAGCTCTTTTCTG
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GTATTAGTGCCAATACTTACAGGCATCGAAAAACTTTCCATTAGTTTCAA
ATGTCTAGAGCTTTTTCTATGTTCCAGTGACTAGCTTCTCTTTCCGCCCA
CATTTCTTTATTAAGCAAAGATGGTTTATGTTGCAGCTTCTCTTCATTTC
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AATTTGTTTTTGTTCGTTGGAACAGGTCTAGAGGGAAAGCTGGATTTTAT
TTATATGAGCAAAATGTTTGTCGTGCTAGTACCTACCGACTAACTTTACT
ATTTTGTGCATCATATAGTTCTGAATACTATTGTTCTTCTTTACTTCTGG
TCTTTCATTATGTCCAATGTTGATTGGGAGGTGAATGTATTTTGATCAAT
TTATATTATGTGATATGGTTTCACTGATAATAATATCACGTTCTAGATTC
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TTTTTTTATCATGGCTTCCCTTAACTTCCAAATACCTTACTAGTGCAGAA
ATTAGTTTACATGTTTGGAGTAAAAAATATAATGGGGAATTTATATGTCG
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TTTTTGCATTTCTCATCTAACATGCTCTTTATGTGCTTGCTTGTTTAGCA
GCTGCGTGATATAGAGAGAAGCGTTGACATTCTTGTTGCTGCACCTAGGC
GCCCTGTGGACATGATTGAAAGATCAAAGGTCTCTCTTGAAGCAATTAAG
TACCTGGTAATTGATGAGGCTCACAGGATGCTGGATATGGGGTCTGATCC
TCTGGTCAGAAAGATTGTTGATGGGATGGGTATGCCACAAAATTCTGTGA
GACAGATGAAGCTTTTCAGTGCAACCTTTTCACCACAAATACAGGTAATA
AATTATTTATTTACTTCCCATGCATAAAGATAAGTAGGATTAAGAATGAA
ACACCTGACTGTTTTCATGTTTCTGTTTACTGCGATAGCAGACCTTTTAA
CTCCCAACTTCCTGTAACACAATTTGCCACAAACACATTGACAAGTATAT
AGCACTTTTTGTACGAAAAAATGTGTAGTTCGTTGACATTATACCTCTCC
AGTGGATTATTGCATACTTATTAGCTTAGTATTGTCTCGTTTGAAATGAT
TTACTGATGATACACTTGATTATGTCTGCTTTGAGAACAAGCTTAAACTT
CTAGGAACAAGCTATATTCTTGTTTGAGTTACAAATTCCATCCTACCTAT
TGAGAGGGCATATCTAGCTTATGCATATGTATGCCTCTTACTCTCCTGTC
ATGTTTTATGTCTCTGCTGACAATTTAACTAGGTTTCTCTGCCTCCTGTG
CTCACTTGTTTCATTTAACTGACTAAATAAACAAATAGTTTGTTTCTATC
ATTACAGTATGAATGATGGCTGTATGTAGCTGCTCCAGATATGTGCTTCA
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CAAACTGGAATCAAAATTAAGGTGGCCTATGGGGGAACTCTAATGTTTCA
GCAGGTGTTTGTTGACAGTATGCTTTTTGGCATGATGGCTTCTCTTAGCC
TTCAAGTATCTCACTAGAGCCAAAATTAGTTTACATGTTGGAGTAGAAAT
TATTATGGGGAATTGATATGCCTAATGTATTTAATATACTGCCTCCGGTC
CATATTAGGGTTCTCAATTTTGTCTAGATACGAATGCATCTAGTCTAAAT
TTTTAACTAGATACATACGAATCTAGACAAAGTTGAGAACATTAATATGG
ACCGGAGGGAGTAGTTGATCTAGCACTCAACTGTTACATGGGTCTTTTGT
TGCTTGACCACTCAGTGTAACATTGATGGATGTTTATCTCATCTGTCTTT
TTGCATTGCTCATCTAACATGCTCTTTCTGTGCTTGGTTGTTTAGCAGCT
ACGTGATATAGGCGTTGACATTCTTGTCGCTACACCTGGGCGCCATGTGG
ACATGATTGAAAGATCAAAGGTCTCTCTTGAGGCAATTAAGTACCTGGTA
ATGGATGAGGCTGACAGGATGCTGGATATGGGGTCTGATCCTCAGGACAG
AAAGATTGTTGATGGGATGGGTATGCCACGAAATTCTGTGAGACAGACGA
TGCTTTTCAGTGCAACCTTTCTACCACAAATACAGGTAATGACTTATTTA
TTTACTTCCCATGCATCAAAATAAGTAGTATTAAGAATGGAACAACTGAC
TGTTTTCATGTTTCTGTTTACCGCAATAGCAGAATTTTAACATATTAACA
ATTAGACAGCGCATTAGCACTTGGATTTTCTGCGAAAAAATGTGTAATTC
GTTGACATGATACCTCTCCAGTGGATGATTACATAGTTATTAGCTTAGTA
CTATCTAGTTGGAAATGATTGAACTGATGATAGACTTGATTATGTCTGCT
TTGATACATTTGACTAGTAGTTGCTTTTATCCAGAGACTGGCTTCAAACT
TTTTTTCAAAGTACATATTTATCACTGTTGTGAGGGTGGGTTCAAGTACT
GATCTGATTACCCAGAAAGTTGAGTTTGACTACAACGACTATAGCCGGAT
GGCGAGGCTGCGCGCTCTCGTGCTTGTGCCCGCCAGAAAGTTTGCCACTC
AGGTATGGGGATCCCAGTTTCTCTCTCCTCCTTAGATGCTTTGTGCGGGA
TCGCTTGGACGCTGTCTTGTTTGTGGGGATGCATTGCTTTGTGTTGTCTA
GCTGAGTCGACGCCCCGTGGATATTTTTTTCATGCACGGACACCGAAATT
GCATCTGATGCCTATCCTGTGCGCGCGCCGTAGGCGTTGGCGTCGTGTAC
GTGTCCGTGTTCGTGGTTTGCCTAGACGATTGTGCCCACACAAGGGGTGG
TGTGTTCCCTTGTTCACGTCTCTCTTTACATGCATTGTGCGGGATTTGGG
GCAGGTGCACAGTGTGCTTTGTACGATGGCCAGCGGCTCGGTGCATGTTT
GGATACTTGTCCTCGGGGTTTGCATGGCTGATCTTGTGTTTGTAGTTTTT
TTTTGCCTTATTAGATGTATGCGTATTGTGCATAAGGTCTCTTAGATTAT
GTGAGTTGCCTGTAATTTTTTTGGGGTTCTTAGTTGCTTCACTGGATATA
TTTTCATAGCTGTATTAGTTTGGGTACCGTTTTGGAAAGATTTTGTCGTT
CGGTAGAACTTAGTTTCATTTCCCCCCTTCTGTTCTTTCATGTAAGTTTT
ATTTATTCATCGTAGGAGTAACAGTTAGTCTGTTATGGAGTATGTTTGTA
TGTCCATTTGTCAATTTATGTATGCTTGTACTACTGCATGTTCTATGGTT
TTGGTTTCATTACATTCTTGACGAAACTTCTTTTACTAGTTGTATGTTGT
GGAATTCTGATGGATCTTTCACCTTTTTATGCATAACTTGGTTTATTAGT
CCTATGTTGCACTAATTTTCATCTAGCACACTGGCATACTTTGGTAATTT
ATCTCAAGCATCACACTTCATTCTTCATTGTGTCTTGGTGCCTGGTTAGA
TTAGCGTTGTTTTGATTTATGGATAACTTCATGAATTTTCTTTGCCATCA
TCTGGATAACTTCCAACTTTTGGCTTGCATTCATCTCTGTACTTTATTTG
TAATCCGAAGCTATCTATGTCTTAGCATTTTCCTTTATAATTCGACTTCC
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GCATCTTTGCTTCTGATGTTGAATAATGCAAGTTAGTAGATCTTTTCTGA
TGTTAGCTGTCCTTGCTTTGAAACGTATATACACGGTTGATATGTGGTAG
TATTAGTGTCAATACTTGCAGGCCTCTAAAAACTTTCCATAAGTTTCAAA
TATCTGGAGTTTTCTCTGTGTTCCAGTTACTAGCTTCTCTTTCCACCCAG
ATTTCTTTATTAAGCAAAGATGGTTTATGTCACCACCTCTTCTTCTTATC
TGCCGGCATGTTTGCTTTCAAAATGATTTTCAGATGACAGTACTCTGCTG
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CTACCGACTCACTTCACTATTTTGTGCATCATATAGTTCTGAAGTACTAT
TGTTTTTCTTTACTTCTATTCTTCCATTCTGTCCAATGTTGATTGGGAGG
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AATATCACGTTCTAGATTCACAAGGAGGCCACCAAGATCTCTCACCAAAC
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GTAGCCCACTAGTAATTGTTTACATGTTGGAGTATAAAATATAATGTGGA
ATTTATTATGTGTCATATGGGTCTTTTGTTGCTTAACCAATCCATATAAC
ATTGATGGATGTTTATCTCATCTGTCTTTTGGCATTGCTTATCTAACATC
CTATTTCTGTGCTTGCCTGTTTAGCAGGGCATTGACATTCTTGTCGCTAC
ACCTGGGCGCCTTGTGGACATGATTGAAAGATCAAAGGTCTCTCTCGAGG
CAATTAAATACCTGGTAATGGACGAGGCTGACATGATGCTGGATATGGGG
TTTGATCCTCAGATAAGGAAGATTGTTGATGGGATGGGTATACCACGAAA
GTCTGTGAGACAGACGATGCTTTTTATTGCAACCTTTCCACCACAAATGC
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TTTCATGTTTCTGTTTACTGCAATGGAAGAATTCTAACTCCTAAGTTCCT
GTAACACACTTTGCCACAAACACATTAACAAGTAGATAGCACTTGGATTT
TGTACGAAAAAATGTGTAGTTCGTTGACATTATACCTTTCCAGTGGATGA
TTGCATACTTATTAGCTTAGTATTATCTACTCCCTCCGACCCATATTACT
TGACTCCAATTTGGATGAATCTATCACAAAAACTTGTCTAGATACATCCA
AATTGAAGTCAACTAATATGGGTCGGAGGGAGCATTTGGAAACGATTGAA
CTGATGATACACTTGATTATGTCTGCTTTGGTACATTTGGCTAATATTTG
CTTTTGTCCAGAGACTGGCTTCATACTTTGTGTCGAAGTACATATTTATC
ACTGTTGGGAGGGTGGGTTCAAATCTGATTACTACCCAGAAAGTTGAGTT
TTTCACTTATGATGAGAAAAAACCCTACCTGCTAGATCTACAGAATCGAT
CTTTAACTTCATCTGACGGCATGGTACTATTTGTTCGATCTTAAATGTGA
CGAATCGATTATTTGCAAATTTTATTTTGTGAGATTTGTTATAATGTTAG
TTTTCTTGTTGGTTTTGCCGCAGCAGCCTCTGACATTGGTTTTTGTGGAG
ACAAAACGAGATGTTGATTCGTCGAGGTATTTGCTGCTGTACAACAAAGG
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ATGTCTGAACTCTTCCGTAGTTGCCTAACTTGTTCTTTACATCAATGTAA
AACTGCAACGGCTACACATAATTTAATCAACATTTTAAGTCTGAAATATC
TTCGATGCTATCTCAACAATGCGAGCTTGAGAACAAGATTAAACTTCTAG
GAACAAGCTATATTCTTGTTTGAGTTACAAATTCCATCCTACCTATTGAG
AGGACATATCTAGCTTATGCATATGTATGCCTCTTACTCTCCTGTCATGC
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CTTGTTTCATTTAGCTGACTAAATTAACAAATAGTTTGTTTCTATCATTA
CAGTATCAATGATGGCTGTATGTAGCTGCTCCAGATATGTGCTTCACTTT
TTTTCATATTTTAGATTCACGAGGAGGAAAATAAATTTCCTCACCAGACT
GGAATCAAAGTTAAGGTCGCCTATGGAGGAACTCTAATGTTTCAGCAGGT
GTTTGTTGATTGTATGCTTTTTGGCATGATGGCTTCTCTTAGCCTTCAAG
TATCTCACTAGAGCCAAAATTAGTTTACATGTAGGGTTAGAAATTATAAT
GGGGAATTGATATGTCTAATCTATTAATATAGTTGATCTAGCACTCAACT
GTTACATGGGTCTTTTGTTGCTTGACCAATCAGTATAACATTGATGGATG
TTTATCTCATCTGTCTTTTTGCATTGCTCTAACAAGCTCTTTCTGTGCTT
GCTTGTTTAGCAGCTACGTGATATAGAGAGAGGCGTTGACATTCTTGTTG
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GAGGCAATTAAGTACCTGGTAATGGATGGGGCTGAAAGGATGCTGGATAT
GGGGTTTGATCCTCACATAAGGAAGATTGTTGATGAGATGGGTATGCCAC
GGAAGTCTGTGAGACAGACTATGCTTTTCAGTGCAACCTTTCTACCACAA
ATACAGGTATAACTTATTTATTTACTTCCCATGCATCAAAATAAGTAGTA
TTAAGAATGGAACGACTGACTGTTTTCATGTTTCTATTTACCGCAATAGC
AGAATTCTAACATATTAACAAGTAGATAGCGCATTAGCACTTGGATTTTC
TGCGAAAAAATGCGTAATTCGTTGACATGCTACCTCTCCAGTGGATGATT
GCATACTTATTAGCTTAGTACTATCTAGTTGGAAATGATTGAACTGATGA
TAGACTTGATTATGTCTGCTTTGATACATTTTACTAGTAGTTGCTTTTAT
CCAGAGACTGGCTTCAAACTTTTTGTCAAAGTACATATTTATCACTGTTG
GGAGGGTGGGTTCAAGTACCAATCTGTTTACCCGGAAAGTTGAGTTTGAC
TTCAATGACTATAGCCGCATGGTGAGGCTGTGCGCTCTCGTGCTCGGACC
CACCAGAAAGCTTGCCGCTCAGTTATGGGGATCACAGTTTCTCTCTCCTC
CTTAGATGCTTTGTGCGCGATCGCTTGGACGCCGTGTTGTTTGTGGGGAT
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TGTGCCCATACAAGGGGTGGTGTGTTCCCTTGTTCACGTCTTTTCCTTGG
GGTTTGCATGGCTGATCTTGTGTTTGTAGTTTTTTTGCCATACTAGATGT
ATGCGTATTGTTCATAAAGTCTCTTAGATTATGTGAGTTGCCTGTAATTT
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TGTACGTTTTATTTATTCATCATAGGAGTATCAATTTCTGTTATGGAGTA
TGTTTGTATGTCCATTTGTCAATTTATGTATGCTTGTACTACTGCATATT
ATATGGTTTTGGTTTCATTGCATTCTTGACGAAACTTCTTTTACTAGTTT
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AATTTATCTCAGGCATCACGCTTCATTCTTCATTGCGTCTTGGTGCCTGG
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CATCATCTGGATAACTTCCAACTTTTGGCTTGCATTCATCTCTGTAGTTT
ATTTGTAATCAGGATACACTTGATTATGTCTGCTTTGGTACATTTGGCTA
ATATTTGCTTTTGTCCAGAGACTGGCTTCATACTTTGTGTCGAAGTACAT
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AAGTTGAGTTTGTCACTTACTATGAGAAGAAACCCTACCTGCTAGATCTC
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ATCTTAAATGTGACGAATGGATTAGTTGCAAGTTTTGTTTCGTGAGATTT
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GGTTTTTGTGGAGACAAAACGAGATGCTGATTCGTTGAGGTATTGGCTGC
TGTACAACAAAGGTTTCCCTGCAACAGCGATCCATGGTGATAGAACACAA
GAGGTAAATCAATATGTCTGAACTCTTCTGTAATGGCCTAACTTGTTTAC
ATCAATGTAAAACTGCAATGGCTACACATATTTTAATCAATATTTTAGTC
TGAAATATCTGCCATGCTATGTCAGCACTGCGAGCTTAAGAACAAGGTTA
AACTTCTAAGAACAAGTTATATTATTGTTTGAGTTACAAATTCCATTCTA
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AATTGTTTCATTTAGCTCACCAAATGAACAGAGTGTTTGTTTCTATCATT
ACAATATCCATAATGACTGTATGTTGCTGTTCCAGATATGTGCTTCTCTT
TTTTTCACAAAGAGAGAAAAGCTTTGGCTTGTATAACAAATGTCAGTCTA
TTCCTAAATACAAGATGTTGTAAGAGTTCAAATTGAACTCCCATAACGTA
TTATATCAGGAACAGAGGGAGTAAAACAAATAATCAGACCATATTTAGAT
GCCATAGTGGCAGACATGTGCTGGTAGTTGATTTCCTTGTAGCCATGCAA
ATAGATTATGTGTTACGTAGTACATTAGCAGTCCTTTGACATTTTTTGAA
CTCTTGACCAGTGCATATGTTAAGAATTGTATGTCTCTTACTATATACTG
ATATTTACATGCTTGTTATCTGAAGGAGAGGGAAAGGGCATTGAGATCTT
TCAAGTCTGGCTTGACTCCTATCATGGTCGCCACTGGTGTAGCCGCGCGT
GGCCTGGATGTCCCGAGTGTCAGTCATGTGATCAACTACGACCTTCCCAA
GAGCATAGAGGATTATGTCCACGTGATTGGAAGAACTGGGAGAGCTGGAA
ATGCTGGGTGTGCCACTGCCTTTTTCAATGAACAGAACCACCCCATCTCA
AAGGGTCAGCTGGAACTGATGGCAGAGGCAAAACAGAATGTTTCTGGTTG
TCTAGAAGATTACCCAGGACCTCTAGAAATTACTTCTTCTAGACCCATAC
AGGTATTATATTTCTATGGCATCTATATCCTATAATCTGTACTGCCTCAG
TCTTAAAAAGGATGTCAATATTTCTCTCAATTCGTATGTATCTAAACACT
ATTTAGTATATGGATATATCCAAATTTGCGACATCCTTTTCGGTATGGAG
AGAGTAATATTTCTACATGGAAAATGCAGGGTTTAGTAGAAGTCATGGAT
CAGAAAATATGTCTCCAGTTTGATAGCAAATTAACTATTGAAGAAGTCGT
ATCAAAAGTATTCAACAATATTGGCATTTCATTTGATTATTGGGTCAAAA
TAAATGGCCGCCTTGCCCAGTTGGATTGTATATTATCAAGTTTGGTGCCA
GAATCAGACCATGACTTCTCATTATACATCTCACCTAGGATGCGAGGAGG
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TTATTTTAAAAGCAATTATATCTGGTTTCTTAATTTTTTATTTGGTTTCT
TAATTGTTGCTGATGCATCGCTATTTGGTTAACTAGTGTTTGCAATTTTT
TTATTCTTATTGCAGAGTTCCCATCTTAGATCACATCATAACATTTGCAG
AAAATGTTTTTGATGTGGTCTTGTTTCCAAAAGAGCTTCACTATAGAGAT
ATGACCCCGTATTTCTTGGGTCTGTCCAGTCAATCTATAGAGATATCTGT
TCTTTTAATAAACCTTGTACATAGAAAGTATCCTACTAGGTGTCCTAGCC
ATTTTACTAAAGAAGACATCTTGTACAATAGTAAAAGAAACACAGTGTCA
TTCCGTGCTGACTTTGAGTATCTTGAGTACACTGATGAATTGTACTATCA
AAATCTTCTTGACGTTGCCACCGTTTTCTCGGAAATATTCATTTACGATG
AAAATCTCCTTCTTAGCAACTCTCCTGCAATACATGTCCACAGCCCAAAT
ATCCTACCTACTCCATTACCTCATGGTTGGAGACGCCCAATGCTTTTTGA
ACTTTTGATCCATGACCTTAAACAAACTGTCTATCAGTTTGTTCCTCTGG
ACATTTCAAAAAATAAAGACTACTTTCTCAGTCATTTAGGTATTCTCTCA
GACATTGCCAGATTCGCCTTCTTGTTATCTTGTGAGCTTGATCTTAGCTA
TGATGGGAACGAGCACAATATAGAAATTTTTGTGGGGTTGAGGTCGGAAG
AACAGCAAGATGCTACAGTCCTAGAGGGTGGAGAACTACGAATGGAAGAA
GATGCCGAAGAATGGGCTGGAATGGAAGCAGATGCCGAAGAATGGGCTGG
AATGGAAGAAGATGCCGAAGAATGGGCTGAAATGGAAGATGTTGAAGAAT
GGGCTGAAAATGAAGAAGATGCGGAAGAATGGGCTGAAATTAAAGAAGAA
GAGGATAGATCTGAATCACCACCAATGCTGAATCGACATACCAGATTTGG
ATCTGATGATGAAGAAGAAGATAATGAAGCTGAAAAAGAAGAAGTTGAAG
AAGAAGCTGATGAAGAAGCTAAAGAAGCTGAAAAAGAAGTTGAAGAAGAA
GCTGAGAAAGAAGTTGAAGAAGAAGCTGAAAAAGAAGAAGCTAAAGGGAG
TGGCAAGCGCAAGCGCAAGCGTAAGCGCAAGGGAGGCAAACGAAAAAAGG
TCCGACAAGAGCAAGGACTGCCATCCAACCATATAAGAGTTGATAACTGG
TTTTTTAAAGCAGACCAAAGTGATATATTCAATTTACTTCTTGATGGACG
TTATGAATTTACAAGGCTTGGCTCGCAGTGGCGGTACTCCAGAAACTGGG
TGACGCATGGGTTTGGCTACCTTGAGACGGTAAAAATATATTCTTTATCT
TGGAAATTTATAATTTTTTATTCTTTGCACATTATGGTTCTAAGTTTTCC
TTTTTTTGTGTGTGTCCAGATGGAGGCTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.