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GrainGenes Sequence Report: AA032470

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Sequence
AA032470
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA032470
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCCAGCCGGCGGACTCTCTGTCCCGAGTCCCGACGGCGAGAGCCAGAAG
AGAACCAGCCAGCAGCCAGACAAATCCGCGCCGCACCGCCTCGTCGTCTT
CGCCCCCGCCGTACCCCTACCCCCCTCGCGATCCCCGAAACCCTAATCCC
TCGCCGCCTCAATCCGACCCCTTCCCCCGCCTCCACTTATCCCCCTCGGA
TCCAGGTGAGCCCTCAGACTTGTCCCCATTCAGCCGAATTCCGATCCGGA
ACGGCTCCGACCAGAATAATTTGGGCGTTGTTTCGTTCGGGGCTTTGTCT
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CGTGGTTTCTGATCCAGGGCGCGGCGCTGGGCAATGGTTTTCGAGTGATA
AGCTTGAGCTGTTTTGGGAGGCCTCGGATCGGTTTTGAGGAGGTTTTAGA
TGGGCTCGGACCGGGAACACGGCGGCTCAGGGGCCGTGGTGGCGACGAAA
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GTGCTTTTTAGTTCTGAGAAGCTCCCTGTGGCTAAGATTACTGAAAGAGA
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GAAGAATAAGGGAGATACGCTGAGCAGGAGTAGCTCACAGCCTGACTCCA
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CAAAGATCAAGGAGCAGGCCTCAAGTTTGGGTGACAAGAGGAAGCCGGTA
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GTCTGGTTCCCGGGAGGTTATAAGGCTGCAAGGGAAAAGTGGCCTTTTGA
AGATTCTGCCGAACAAGTCCAAGGTCGACGGGGAAACCAGTGATAGCAGT
ACTCAGCCAAAGAAGTCCAAGGTGGTTGAGGTCGGGGATGGAAAAATTCC
AACGAAGAGTGGTGTTTTAAAGCTTCTTCCAAAGAACAGTATGATGGCCA
GAGAAAACAGTGACGGAAAGCTTCTTTCCAAGAACATTAAGGTTGAGAGG
GAGACCACTGATGGCATGATTCTGACGAAGACCAGTAAGGTGGGTAGGGA
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GGTTATAGACAAGATAAGGATAAAAGCAGTGATCTCACTGAGTCTCAGAA
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TCACATTAAGGAGAAGCGATCCTAGTGTGGTGGGTGTTTCTTCAGGCCAT
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AAGTCTGCAAGAAGAAAAAACTAAATTAAGTGAACACAAAAATGAGAAAA
AGAGATTGCTTGAGCATAAAGGTTCACCACTGAATTTATCCAAGAAAGCA
AAATCGGAGGTCACTGATCTGCAAGGTGCATCTGATTCGGCTCTCAAGAA
GCATGGCATGAAGAAGCCAAGGGGGGGACCTCGTAATGCACTTAAGCAGA
AACTCAGGGATCAGATAAAAGGCATACTCTTAGATAATGGATGGACAATT
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TAATATGCAAGGCATTGGTGACTATATCCCTTATAAAGGGAAGAGGACGG
TTTTATCCTGGATGATAGATCAGGGGGTTGTTTCAGAAGATGCGAAGGTC
AGATATATGAATAAAAAAGGAACACAGGCAAAGCTAGATGGTAGAATTAC
CAGGGATGGTATTTACTGCGGATGCTGTTCCAAGATCCTCACATCTGCAA
AGTTTGAACTTCATGCTGGTTCAAAAGAGCAGCAGCCTTATGCAAACATC
TTCCTAGAAGATGGTGGAGTTCCATTGTTGCAATGCTTAGTTGATGCATG
GGATAAGCAAGCACGATCTGAAAAGAAGGGATTTTACAAGATAGATCCTG
CTGAGGATCCTGATGATGACACATGTGGTATTTGTGGTGATGGTGGCGAC
TTGCTCTGCTGTGATCACTGTACTTCAACTTTTCATGTGGCTTGCTTGGG
AATTGAGGTGAGCATTCAAGTATATCATGTGTGTGGGCACTCTTATGTTA
TCTTTCTATAAAATATAGAGAAGACATATTTGGATTTTCAATTATCTGAA
AACTTGGGGTAGGATAGTATGAGAAAAATTCTACTTATGGCCTTCCACTT
GATTTGAGCCCGCAGCTTTTTGGGCACTCTATGCTTATATATTTATTTTT
TCGAATTGTCGCTGCAGATGCCTTCTGAAGATTGGTATTGTCGTAGCTGT
ATATGCAAGTTCTGTGGCTCTGCTGAAGAAATGACATCATCTTTTGCTGA
GTTGCTTTCTTGCTTGCAATGTTCAAGAAAATGTAAGGCTCATGACATGC
ACCTGGAACCCTCCCAACACACGTGTACAGTTGCATGCACACACAGAAAA
GCTTATGCTTCCGGACATTTCTTACACATTGTTGTTTTTGTAGATCACCA
GGTTTGCGTACCAGGAACTGAGAGGGACTCAGTTTGTACCACGTCTGGTG
CCTCGATGGATTGCTTTTGCAGCCCAGGATGTAGAAAGGTACGGAATATT
ACATGAGTTTCTGTTTCTCGTTTTTTTGGGTGAGGATGATATTTGGTGTT
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CCCTAGCGACATCTCCCAGCCTTCCATTACAGTTCACAGGATTCAGTGGT
TCACAGCTTTTTTTGTAGTAAAAGGGAGCATTGCATTCAGCCCTCCTGAT
TTCCATTAAAGAAATAAATTTAGTTATGCTACTGGTTCTAGGTTGAGGCT
TGTCCAAACCAAACCAATTTCATACACTGAAAGAGCAACTCTATGATTCG
ATACTTCTTAGCTTACACAATTTTTTGTTGCTGTGTTTTGGCATCTAATG
CTGTGTAATTTGCCCAAGTCAAAGCTTACTTATGTCTTGTATCATAGTAT
ATAGAAGGAGAAGCAAAATCTTCAATCACTTGTATTCACCTGTTGTCATT
TCATAGCCGCTCATAATACCTTTCCGTTTTTCTTCTTCTGGGGCAACTAA
AAGACGACCACTTTAGGCTAGCTCTATATGACGGGAATATGCCACATTAA
ATCTCCGAGGTGCTGGAATGTTTACATGTTGACCTGATTGTGTGTCCATT
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TTTTGGCTATCTTGCTGGAACATATATATGTGAACCTGGTAGATGTATGC
CCACTAATCCAGTGAAAAATCTACAACCATCCTATAGTTTTTGCCGGTTG
ACATACCTATGATCTGTACTGTATTCAGAATATGTCGTTATGGTTCTACA
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TTTTAGATCTACTTGCCATTTTCTATTTTCCTGGCTAGCATATAGACATG
TTCCCTGTAATTGTTATCATTAACTGGTCAATGTTGCTTTGTTCTAGCAT
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TATTCTATTCTTTGAAATAACACAGATTTATAAACGACTAAAAAAGCTTC
TTGGGTTGAAGAATGATACCGAGGCTGGATTTTCCTGGAGTCTGGTTCGC
TGTTTTGCTGACAGTGATGCTGCATCCCTGAAAAAGAAAGCAGATTTGGT
GCATTGCAACTCAAAGACAGCTGTTGCTTTCTCTATTATGGATGAGTGTT
TTCTGCCACGTATTGATGAGAGAAGTGGGATTAATATAGTTCACAACGTC
GTATATAACTGTGGGTAAGTATGCCTTTCTGCTCTAGTTCATCATGAGAG
AAAAGATAAATGATTTATTTTAATGATGCAAGTTCCTCGCTGTATATGTG
ATTTTCCAGAACTAGCTACACTTAGTATGGAATTCGTATACACTCAGCAG
CTTGAATATTGTTTTTTAGCCTTTCAGTGTTAGTCCAAGTCAATAATCAC
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TTATGTGCAGTAGGATTATATATTTTTTAGAGCATGCTATGACATTCCTC
AGGCCGTTGTTTATCCTTAAATATGCTATGGCAGGTCGGATTTCAACCGT
TTAAATTTTAGTGGCTTCTATACTTTTATTCTGGAGCGTGGGGATGAAGT
TATATCTGCGGCAACTGTCAGGTAAACTTGATATGCATATATTGTTACAT
GCTGGATTAATAGGTTTTTGCGGTTTTATATGAGTCTCAGCCGTCAGCCA
CCTGCTTTTCACGCTCTTTTATTCTGTCATGATTATTTAACTTTTTTTTT
TCCTGCAACACATATCCTGAGATTTGTGTTTAGGATGAGCAGTTCATCAT
CCATTATTATTGAAGTTTGGATTGTAATTAGACTTGTAATTTTCCAAGAA
GGGACATATTTGTTTGTAGGTCATGCAGAGGCACTGAGACCAATTTCTAC
TCATGATGGCATGATACAAGAATTTTTTCACGACCTACACACTTGGCGTT
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GGCACGAGAGGCATGCATCGGCGCAAAGGGATGTGCCATCGACTACTCAA
TGCAATTGAATCGGTAATTTGGTTCGACATTTGTTTCTGATCTTTGTTGC
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ATGTCTACCCCTGTTACACACTAGTGATATTACCGTATACTTCTTCCTGG
AATTGTTTAAACATCAGCAGTATGTTTTCTGGATTGATTTGTTCATCTAA
TCGTGGGCCCAGCATGTATTTGTGTTTTACTTTGAATTTGCGAGATCTTT
CATCTCTTCCCTAGGATGCCTGCTATGTGCTGAATTGATTGACATGTTGA
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GACACAACTGTAACATACCGTTACTACTCGGAACCAGAAACCCCAGTTTA
TTTCCGAGTTTATGCTATTTTAAGCTACACAGAGTTGTTTTGAACCTTCA
CTCTGAAGGAAAAACAAGAAAGATAAGGGAATGTGACTAGGGTTAGGCTG
CTAGCTCCTTGCTGTTAATGGAAAGTGGAAATTTCTCCTAGAAAGGTTCT
GAAACCTGGTTGTAGTTGTGCATCCTTCTGTTTGTTAGTAATGTTTGCAT
TGTTTCTTAATGCTGAACTTGTAAAATGGAGCTAGGCATTGTTGGACAGA
CCCAGTGCTAGAGGTGCAATGCCAGGGTGGGGTCTGGGGAAGGATTATAG
AGGCAAGCCTTATCCCCTGCAAAGTGCAATGCAGAGAGGCTGCGTCGAAC
CCAGGACCTCTTGGCACAAGTGGGGAGTACTTCACCACTGTGCCATTGTT
GAATTGCGTAAATTTATCTTACTTTTGATGAGAGTCGGGAGGTATTTAGA
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CTGGCTTTTGATACTTATTGGTTGCTTACCAAGCCAAGTTTTAAGTTCTG
TTTTTATCGAATCTGCAAGTTCTTTTCTGGGTAACTGGATATACCTGTGT
TTGCATTGTTTTGTTTTCATATGAACTTGTAACATGTTTTGGGGTATATT
CTTCTGTAGACCCTTTGCTCTCTCAATGTTCGAAGGCTCGTAATACCTGC
CATACCAGAGTTGCAGAATACCTGGTCTACAGTTTTTGGTTTTAAGCCTG
TTGGACCTATGAAGAAACAAAAACTCAAGTCTTTTAATCTCTTGATTATC
CATGGTACTGGTCTTCTGGAGAAGCGCTTGCTGCTAACAGGTCAAGTGAA
TCAACCAACCACTGCTGGGACAGGTCAAAATCCTAACTACTGTGTGAATA
CTTTCCCTTATACTACTGTTGAGAGTATTGCAATTATGTTGTTTTATGTT
CCAACAATGCTCCCTATTCATGCAGTCAATGTTGTTGAATGTGATAAGAC
GTCTGCTCAAATGTTTGGTGAAGCAAGTGGTTCCGTAACACCTGTTCATG
CTTCTCGAGAATGTGCTGTGGGTGATAATATTGGAACTAAGGACCATGAT
AGTTCTCGTGCTTTAGTTCAGAGCTCTTCAGGCTTGGCGTCTAACCTTCC
TCCTGTCCCCGAAGAAAAACCTCAAGAAAGGAGTTCTCCAGTTCACGTAG
CTGATGTTAATTTGCGTACAAGTGAAGATGACATACCTTGCAAGGCTGAA
GCTGACAATCAGGAAGAAGTGAGATATGCAGAAACAGATGTAACATCAGT
TGCTGATAACATTGTTACCGGAGGGAAGCCTGAAGATAAATCTGGCTCCA
GTTATGCAGATTCATGTGCTATTCCAGTGACAGTGGATCCAGGTCAATGT
TCATCTGATGAGCTTGGGAAAGGTGAAAGTTGCCCACCTACTGAACTTTA
TGATGATGATGTTCTCTTGAGAGACAAAACTGAATCAAATCACAACTCCC
AATCCATCTCTGTCCACTTCGATACTCAAGAAGATATGAAGTCATGTGTA
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TAACCATGACTTGAAAACTATTGTTGCTGATGGTGACACTCAAAGTTCAC
TAGAAGTTAAAGGTTCGGAAGTTACTGTAGATGAAAGATCAATAGATGGC
TATACAACTAAAGATCAAGCATATGTTGATGGTGTAACTAGCAATGCTGT
TGCTACTACTGAAGAATGCAGTTGTTCTGCAGTTGATCTTGTAGTATCAA
CAGAGAGATCATTGGATGAAACAAAGTCTATTGGAGGTGATCAGAGTGAA
GTGAAGGTTGCAACCATTGAAGTGGGTGCCATATCTGAGACCTCTAATAA
AGCAGGAGTAACAGTTTCAGCGCTTGAAAGATCAAATGACATATATGGTG
AAGATACCGCAAAGCCTAGTCTAAGTTGTGGGGAGGGTCAACTTCATGGA
GAGGATGGAATATACAAGAATAGCTTGGAAGATGTCCTAGCTTCTAGAGA
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TCTAGAGAGATGATTTCACGGTCACACATACTCGGTTTTCTAACTTGCAT
TATATATTTCGATGTTTGTTACCTAGAATAATGAATATAAGTGCATCCTG
GTATCGAGAATTCCCATTCTTTTGTTGTGAGATAAAATCTTCACAACTTT
TCGCCTTGTAGTTGTACATGATTCAGGACCAGGACAAAATTTGTTCAGAA
AATTAATAGGGATGAGATGGGGAGAAGTGGTACTCCCTCCGATCCATAAT
AAGTGTCTCTCATCTAGTATAAAGTTTGTACTAGCTTAATACAAAATGAA
CGACACTTATTATGGATCGGAGGGAGTACTTAAAATGAAAGATAAAGTTT
CAACAACTTCTTTTAGACGTTCAAGGAGAAACATAACACCTACTGAAGTG
AAGATACTGCTTCAATAACTCAATTATATTTGGGACCACCTTTTGTGCAG
CTGTATCTGCCTTCATTGTCATGCTTGCTTCACTGATAACTTCATCGTTT
TACTTGAATAGGTAGGATCAGGGCTATAGAAGATGCCACATTTCTGGAAG
TTTTTGGGTTCTGGGAGATCTTTCATTAGGATAGTCAGTCAAGTTGCTGG
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GATGACTGGTTCTTGAAAGAACTGTTGGCGATATCCTTAGGCTTGGATGA
ATGTGAACCCTTTTGGTAAGATGATGGAACTTATTAGCACATCAAGCCCT
TGGGTCTTCTGTCATTTTGACTTGATTCTAATTTAAGAATAGATATCTCA
TTCTGTAGTTTAATTCCAATCCTTCTATGCTCATTACTCCTCGTGTCCTC
CAATGTTTTTGCATTGACAGTGTGAGCAATGTGTGGCAACATCTATACAC
CCAACTACCCAAATAGCTAGTTCGTCGATGTTTCAGGATTTTGGTTGCTT
CTTCGAGGATGAAGCGTGGTTTCTTTTTGAGTAGGCACCTAGTTCGCATC
AGAGTTACACCCCAACCGGGTCACTCTTTTTTTGCTGTGTATGTACATGC
TCTGAATTTTCTCATCTTTCATAATCCCTATCATGCAGCTCAAGAGTTCG
CCCTGAAAGATTGGTCAATAGGGTATGCTATAGACATGTAAACCCTTTGC
TTTACCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.