Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA022914

[Submit comment/correction]

Sequence
AA022914
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022914
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CACCCGCTCCCTTCCCCGACGATTCCTGTTCGGCCCCAACCTTTTCCGCC
GCCTCCTTCTCCCGCCGCCTCCCTCCCCCGTCACCGGCCGCCGTCCTCTC
TTCCCCGCCGCCTCCCTCCCCCGCTGACTCCATTCTGGGCGTCCCCTCCG
AATCGTCGGGGGCCCGACCTAGGAGGAGTGGGCCTCGTCCCCGTCGCCAT
CCACAGACCGGAGCTCCATCAGCCGCCGCCTCGACGTACTACCTTCTTTG
GCGTCCCCGTCACCTACTCCGGCGCGCCCAAGCCTAGCTCCAACTCCTGC
GGTTGTTCTCCGAACGCAGTTGCGAATCCAGCGGCAAGGTGAGGAATTTT
TGCCCTTTTTTTTTTGAGTTTTTCTGACCTGATGATGAACATGGCCTCGA
ATTAGTGATTCGAAGTGAGATGAAAACATGGACTCAAATAAATGTTTTAG
GTAGTAATCTGTTAGTTGAGCTGCTTACATTGTCTGTGAATATTGTCTTC
ATGTGAATACTCTATTGCTAGCAAATACTGTCTTGCTGGTGCTGTTTTGC
AACCAAACCTTGCTAGTAATCTGTTTTGCTAGTGCCGATTAGAAATATGC
TTTGCTAGTAATCTGTGAGCTGATTGAGATATGTTGATTTAATTACTTAG
ATGGATCAAGAAAATAAGGCTGTTTGCTGCTGTTTGTGTCAAATATTGTG
GCTGTTTGGTGCTGTTTTTATAGTGTTGCTGCTGTTTGTGTCAAGTATGG
TGGCTGTTTTGTGATGTTTTTATAGTGCTGTTTTTTCAGATGAGCTCAAG
CCATGGCAGTGATGAAGGTGCGAGTGACGATGGCATTGAGTCCTCACTTA
TGGAGGCAAGAAGACGTCATCGACGACAGAATACCCAAATAGAGTATCAT
GTTCTTTCACATTGTGAGAAGCATCTTGAGAAAAAACCAAGGCTGCAACC
AAGGTACACTGGACAACAATGGGTATTTGATAGCTTGGGCAACTCGAAGG
ATTGTTATGACATGTTTAGAATGCATAGGCCATGTTTTGATTCTTTGCAT
GACACTTTGGTTCAAAACTATGGTCTAGAGGGGTCATCCAACATGTGTTC
TGAGGAGGCACTTGGAATGTTTCTGTGGACTCTTGGAAGCCCACAATCAC
TGTCTTAAGTTCATAACCGATTCAAAAGATCCAAGGAGACAATCAATAGA
AAGTTTGCCGAGGTGTTCTATTGTGTGAATCAGTTAGCGGGAGATATCAT
CAAGCCTGTTGATCCACTCTTCCCAATATTTATTCAGATCATTTACATTT
TGTTTTCTTTCATTATACATGATCTTTACATGTAACTCGTTCTAACCGCA
CCTTCTTTTCCACGTTTTAGTTCATTTCAGCGTCATGTTAGTCATGTACT
AGCAAATGATGAAGTCACTGCATTACTAAAAGAAAAGAGAAAATGGGAGA
TGCCTGCAGTGGGCATTCCAAAATCCAAATGGGTTGGAACAGGTGAAAAA
ATCCAGGTACTTTATGGATTTACATCATGATGAGTTATTGATTAATTCAC
ATGTTAACTTGGGTATTGTGAATCTTATGCCCTCTAAGTACTTCGGAAGT
CATGTTTTATGTGATAGTATAATTCCATCTTACGCCCTTGGTATTGTTAT
AGGTATTTGAACTCCTTGAAATGTGGGTGACTGAACTTTTGAGCCCTTGA
TAGCGTTATAGGTATTTGTTCTTTAATAGAAAGATACCAGTATGGCAGTA
TGTTTATTCCGAGTCCCAAGGTTTCATGTTTATCACGTATTTAGATCACC
TTATGACCTATATTCATTTTGTAACCTATTTGGGAGGAGTTACTATGGTG
CATTCATCCTTATGACATCCATCCACATGTTTTCTGATTACTTACAGTAA
TCTTCAAATGGTATGTGAAGTGTGCTTCTTCAAAGGGCAAGACGTGCAGA
AACATTAGTTTCTGCTCCTCTGTGCTTGGGTACTTGATCTGTTGGATTAG
TTATCAAACTACTCAATTGCTCAGCTAAAAAAAAACTACTCAAATGCTTG
GCGCCGAGTTATTCAACTTCTTCATTATTACCGCGGGGATGCTTTTCTGT
ATAATAAATAGTTCAAGAGATTCTCATTGCTTTGTTCTTTCAGGGAGCTC
CTGATGATCCTTTTGTTGATGTCAAAGGAAAGCTAAGGGACCACTGGCAA
AACACCCTCTCTGATAACTTGGATTCTAGATTGAGGTTCTTCTCACTTTG
TGAGTACTCATTGTTGATTATCTTTCTTTTAGTGCCTAGTTTCACAAATG
CTGATAACCTGGATTCTAGATTGAGGTTCTTCTCACTTTGTGAGTACTCA
TTGTTGATTATCTTTCTTTTAGTGCCTAGTTTCACAAATGACATGATTCA
GTAGGACATTAAAGCTATCAGTTACTCAATAGTGCTGCTTTTGAGGAATA
TAATAGAGCTATTTTTTCTAGAATTAGCAAAGGTCTCTATTGCTAACTAA
TTTTGCAGCACAACCCAGCAGTAGAAATTGGCCATAAATTTAGATGGATC
AGGATTTAGACCTCTAAATTCCACATGATCAAATATTTCTTTTGCATGCT
TATGTGTGGCTACCTGGTAACTCTAAACTTCTCTCGAAAGCGAAGTAAGA
CTGTATTTGTTTACCGAAGAAGCCAACAGGAGCTTCTACCCATTCTATAA
GTAGGGAAAAGTAGAAATTCTAAGGCCCTTTAAGGCTCTCAAGCTGATTC
AGATGTGGACTTCTCATTTATTATGGTGTCTCCACTTGATCTGAAGAGCA
GAAACTATCTGTCATATGCCTGTCTTAGTAATTTTGGTATATAGAGACAA
AAAGTACCTTTTCTGGTTCCCCTAGCCTATAGATTCTGTTGTGCACGTCT
GTTTCAGATCTATATTCTTGCTATTTTGAATAAATAATTGTCACCAATAT
GGTTTTAGCACACAAAGTTACGTGCTCCATTCTTTCCTCATAATTAAGTA
AATTTAAGATAAATATGGCTTTCCATGTCATGTTTCCTGGTTAAAATGAT
GTATGGTGGCTCTCTCTGTCACTTATAGTAAGTGTAATTCTAATCCTAAT
TGTTTATTACAGGTAATAGCTATCGTGACATAATGCATTGTAATAAGAAG
CCATTTTACCTTAAGGGTTGTAAGGTGGATTCCAGTACTATGGATGCATA
TATTATGCATGCTGTAAGTTTCAAAATCCCTCTTTGATAACATTATTATT
GTACACCCTCCGTCCCAAAAATGATGTCGCAGATTTGTCTACATTTGCAT
GTATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATAATGTGAATCTAGAAAAATTTG
CAACATCTTTTTTGGGACAGAGGGAGTACCTGTTATGGTGCTCACTAATG
TTGTGCAATGTAATGGCAGTTGAATCATGTTCATAGAACAAGACATGTTG
TCATTAAAAATGACGCAAAGCTTAGGAATGATGCTAACACAGATATTCTG
GATGACAACTCATACCGTGATCAGGGTTTTACACGTCCAAAGGTATTGTC
ACATAGTCAAAACATTTGAGCAAACAATATCTTACTTGACAACATTATCT
TGCATAAATGCATATGGTGCTACAGATAGTTGCTTGAATGTTAGTTGCAC
CATCGAATCACGTAAATACTATTATTTTTTGTTAAAGAGTAAATGTTACA
TGCCAGTATAGATTTCTAACTTGCTGTCACTTCATTTATACAAGTATTTT
TGTTGTATATTTATCTGTTGAACTTATTGCTCTTTTTTGGTATTATTATC
ATGGCCCCAGGTTCTTTTCTTGTTACCTCTCAAAAGTATTGCACGGCATG
TAGTGAAGAGATTAATCCAATTATCTCCACTGACACAAAAGGTACACCTT
TACTTCTGCGGTTGCTCTTACAGGCAAAATTTATATATCAGGCTCATTTA
AATCTGCAGAGCATTATGTATATAATTTGTGATTGCTGTTTCAGCAATTA
TTTTTCTATGGTGCTAAGAGATAGAGAATTCTTTCATTTATAGGATACTG
CCATGGGACTATTCAAAAAAGAGTTTGATGATTCAGATGATGAAGAGGAG
ACTGAAAATAGTTCAAAACCCGCAGATTTTAACCTTCTTTTTGCTGGGGA
TGTTGAAGATCACTTTCTTTTTGGGATAAAATATACAAAGTAAGTGTGCT
AGATCGTGGTTGTGGAGACAAGTGCGTCCACAGCCCATCTCGTACTCTCC
ACGTTTTTTTTTTCAACAGCTTAATTTACAACGTCAAATACATACTCCCT
CTATCTGGAAATAAACGACTTGCATTTGTCTAGATTGGCATGTATCTATC
TATACACTAAAACGTGTTTAGATACATACAAATCTAGTCAAATCCAAATC
ACTTATTTTCGGACGGAGGGAGTATAATATGTATAATATGAAAGTATATT
TCATGATGGTTCTAATAATATACTCCCTCCGTCCCATAATACAGGATGTT
ATTCCAACCAATATAGGAGCATCTTGTGGAACGTTGCAAGATCTTTTGTG
TGTTGAGATTAGTCTTTGATATTCTGCATTACGAGATCTTATGCCTTTAG
CAAATATATGTCCTTAAATTCATTATTGCTAGCACAGTGATATTTTGGTA
TTTTCTTAGGACTTTATGTTCACATGCTGACATGCACAAGGATTCTTAAA
AGTTGATGTTTTAACCAATCCTTTTGCAGGAAATCTGTTAAGCTATACAG
TAACTTCTATGCTTCTGATATCATAGTGGCATCTCCTTTAGCGCTTAAAC
TTGTAAGTACTCTTCACCAAAGGTTTTCTTAGCAGACTCAACTAATCATG
ATCACTCATGCATCCAGCAGCTATATATTGTTACCGTTCTGCGGACACCT
CATAGTTTACTGTCCTAATTAGCACTGCACAATATAAAAACACACTCCCT
CTATTCCTTTTTATCAGCTGCATTTGTTTTTAGGTAAATTCTGAATTAGG
TGTATTTTCTTTTTTGTCCCAGTTGATGCCGATTCTATCCCTCTTGAATT
GGAATGATCTCTGATTAGCCACCGATTTACTTTATACTACTCTAATCAAC
GGTGTAACTAGGGGTATTTTCGTCCCAAATTATCCTCAAATCAATCCCTT
TGGTCACCTTGCATGAAAAATACACCTAATAAAATGGAACAGAGGGAGAA
TAGAACAGCTAGAAAATACTATCCTACTTTTGCACAAACACCTGATGGGT
TCAGTCCCTTGAGGTCCCAACGGTGTGAGGTACATGTCAACATGCTGTTG
GATTTGCCGATCCACTGAGTAGGTGCTACTCCATTGTACGAGATAAAACA
GGATCTGTTTTGTTATTATTTGATCATTAGGCACCAGTTTCATTTGTAAT
AGAAACTAGATCTCGTTGTGCCCTCACATTACTTTGCTTCCAAATCCTTA
TCATCTCTGAGTTGTTACTCTGATTAAATGTGCACAGTCTTCCTGAAGTA
TCAGTATTCTCTACCTTATTATGTCTGTCTGATATCAGAAAATAGATGGA
GGTGAAGATATCAAGAAGAAGGGACATGCAAAGGAAAATGATTCTGATTT
CCTGTCATCGATTGAAGTTAGTTCCGCTCAAATTCATATACAATTTTCCA
ATTACTACTATCAAATAGTACTATATACTATTTCATTTATGTAAACAATT
ATTATATGTAAATCTTCTATGGTCGCATGGAAACAATGATTAAATATCTT
ATTGGTTGTCGAGATTTCATCCTGAAAATTACAAGTATTTTTCCATCATT
TTTTGGGGGAAACAAAAATTCCAAACTGGACATCTGTAAGACCCTTTGTA
TAGTTGAAGTTATGATAAGTTAACTAATGCTTCCACAAAGGAACACACAC
AGTTCTGTTGTTCTTATTTTCGACGAGGTCTAAACTATCAGTATATTTGT
TCTGTGCAGATAGTGGTGGTTGATCATGCAGATGTGATATCTATGCAGGT
TAACCTCCAACTCTAATACTTTGCTGTACTTTTTTGTGGATGCCTGCTGG
TACAAATGACTCTGTTATCTATGAATGTAGAATTGGTCACATCTCCATGC
TGTTCTTGAACAACTAAATCAGTTGCCATCAAAAGAACATGTAGCCAATG
TGATGCGGATTAGGCCATGGTAATTCTCTTTTGATATTTATTTATGCCAT
GTTCTAAGGCCGTACTATCTGTAAGTCGTCAACATATTGTATTGTGAATA
GCAAAACATGGAATTTGTTCTTGATTTTGATGTTTATGAGGTCAATTATA
TGCTTTTTACGTTTTCATTTATTTTCCTAAGGTACCTGGATCAGCATGCA
CGTTACTATCGGCAAACAATAATCCTAAGCTCGTATCTTACACCAGGTAT
GGAATTTCACCTGGAACTGTGACCATCATTTTGACTCATATTTTTCTAGT
CTTCAGCTTATACCATCCAATTGGGTCCCAAAATATAAGGCGCCCTTAAA
TTTCGCCGGTCAACAATATATAACTTTGACTGTGATTTGTACAATATATT
CATAAAATTTGTATAAGTATATGAAATGAAAGAGTTCTGCAAGACTAATG
CAACGATACGATTTATACATCCTGAAACCATATCATTTTCTACATATTAG
TGGTCAAAGTTGTGCATCAAAGACCGTGCGAAAAAAGCGTGTCTTATATT
TTGGGACGGAGGGAGTACTAGTTCTTGTTTTAGTCATGATCAGCATTTAT
TTACTTAATCACTATTTTTTTACTAGTTGCCTATTTGTTCACTGGAGTTA
TGCCTGGTACTTTAATATTTAAATTGCTCGCATTAGTTGTTGTGCATGTG
CACCATCATACTTTGGCTGCTAATATATTCACCTTCTACATTTACATCTG
TAATCTGCTTGTTTATTTATTAACATATTTATGTTTCAATTCTTTGCCTG
CTGTGCAGAAATGAATGCTTTATTCAGCCGATCATGCTTAAATTATGAGG
GAAAGGTATGCAGCATGCTGGAAGTCACTAATTGATCCATTTGCGGTGCT
GGGCTCTTGTTTCTAACATGCTGGAACTCACTCAACTTTTTTTAGGTTAA
GCTGGTGACTGAGTTTACAGGTGTTTTTCCCAAAATACAGTTTGACATAC
GGCAGGTCAGTTAATTCCTTGTGTATCTTCATGCTCCGTCGAATCTTTAC
AAATTTGCTTTGCGGATATGTCCGTCCGAACAAAACTTTGATGTCAGGGA
TCCCAGGTTCCTTAGATTCTGTTGCAAATTTTGGATGGACACACTCAACA
GACTTGTATCTTCGTGCTAATAGTACTTATTAAATGACATGTTTGTCATT
GTCCAATCACTACACAGGTGTATGAACGGTTTGATGCATCTTCTGTTGGT
GAATCCGATGATGCCCGCTTTGATTATTTCTGCACAACGGTGAGTCATTT
TGTGCTTGTATTGCATCTTGATAATGCATTATGGAATTTAGCACACTCAG
CTCATTTTCAAAACTATTACTCGTCTTTACAGTACATAATTTATGTGGCA
ACTATATGTAAACAATTATACAAGGATATAACCAACCTTAATTCTTATCT
GGACTTGGTGCAATGCCCGACTAATATGTCCTTGAATCTAGCTACTACGT
ACATGCTATCGGGTTGACTACATATTGTCAAAAATGTTGTGTTGAATTGT
AATGTTATTGAATTTTGAAAATCTTGTAAGATTAATTGGTCTTTATATTA
CGATATATATACATGTTTTCTGTTTGATGCAATATCTGACTAGATGTTTA
TACAAGAGGATGTATGTATTTGAGTTGCTCTGTGCTCGCTTCATATTTGT
GACCAATACTATCCACATTAATATTTATATCTGGCAATGACTCTGAGATA
AAAATGGGATTTAAATACCGAACAAGCAATATCCTTCCGCATCCGCTTTG
ATTTCACCCAGATTCACAGGGTAACAAAATCCAACCCATTCACCCAAAGT
GCTCTGTCACTACCAAAAACTTGGACATGGGAATTCCATAATGTGACAAT
TGTATGAAAGAGTGCGCACCTACTCTGTAATTTAACAAGCTCGGACAGAA
GAAGCTGGGGCATGTGGTAGTACACAGAAGTACTATGCCCACATGTGACT
CACATAAGTTCTTTCAGTGTTAGGTGCTGCGTAAAACTGGGGAGTCATAC
TTTTTTTTTTGAGGGAAGGGAGTCATACAGTTTTTGTTTGGCACCTTTAG
TCTTGACTCTTGATTGTTAGAAATATGGAATAGTACTAAAATAAGTTGTG
GTCCCAATATATGTATATTCTATTATTGACTGTGTGATTTATTATTACAG
GTATACCCAAAGATTCAGGCGTCAGATGAGGTATTGTTCTTCCATACTCC
TGATATCTCCAATGTTGCCGTGTTCACTTGAATTTGGTACTTCTCGAAGT
TGGTAGGTGTATTAGTTTGAATTATCATCCTGTAGGAGTCGACACTGGTA
ACTAAAATGTTGATGGGTGGAAGAGTTCAAGAAAACCATGGGTTGCATCT
GATAGCACACGATATTTTGGATTTATGCAACTAAACATATTATTTTGAAG
CAGTGGAATGTACACTTCGTCACCACATGGAGTTCACTTGATGTTATTAT
TACCAAGGAAAGTTCTACAACAGTATTTGTTAGAAATGTATCAGAACTTT
GAACGTTTTGCAATAAATTTTGTTTGTAGATGTGCTAGACATGTCTGGAA
ATGATTTAGTGTTAGAGCAAAATGTACATTATCTGACAATTCCTCATCTG
GATTCCATAATGATTCGTCGGTTGCTATTTTTGAATATAGTAGTTTGGAG
ATATCATATGCAAGTTTTATCGAATTGTTTAATGCAATATGCAGGGTGGA
GTGTTGCTGTTTGTTAGTTCCTATTATGAATATATTAGGATGAGCAATTT
CTTGAAATCTCAGGACGCGTCGTTCTGTAGAATTGGAGAGTAAGTGCACC
TTCCTTTGTCTGCTAACTTAATTTTTTTGTTCAACTGAACTGCTTCTGCT
CCCATTCTTCGTTTTTATTGAGCGTCTGTTTTTGGTACTATGCATATAGT
AACTATATATGTGCTCATATATTAGGGCTACGTCACAACCGGATATATCT
CGGGCAAGACTCTGGTTTTTTGAGGGCCAGAAGAAGATCTTGCTATATAG
CGAGAGATCTCACTTCTTCCACAGATACAAGGTCATAACGTCTAAAAGGC
CCTCTAGGACTTGTTATGATGTGCTCTTCCTGTGGTTTCGCAAGCATGCA
TTTGATTGTCTGTTTGTTTAATGTTTAAACTCTTACCATTAAATATGCAG
ATCAGAGGAGGCCATCATTTGATTGTCTACTCATTGCCAGGGAGAAAAGA
TTTCTATCCAGAGGTATTGACTACATTGCTGTTGTATGCATTATGCATTA
TGCATTATGCACTATGTATGAAGTTGTCGTGTTAAAAAGTCTAAAATGAT
CTCCTTGGACCATGTGGTTTCCTTTTCTTTCAGCTTGTAAATATGCTTGG
CGAATCAGAAAATCCGAAGTGCAATGTACTTTTTTCTCCTCTGGATATTC
TTAAGGTGAGAAATGTACAGCTATTACTAAAGCAAAAATCTGATCTGGTC
CATTGTAAAGCATTTTGGACCGTGTCATGTAGATTGTGTTAGATCATATT
GCATAGTTCATCTTATTAAGTTTCATGCACCAACCTGTAAAATCAAAAGT
CTGAAATAATGGAGAATGTTGGGCAATCCACATATACTTCAAACACATCC
ATCATTTATACCGTGACAAAATTATTTGAGATTGTACTCATAGCTGTACT
GTCGTGCTAAATACAGTTTAATTGTATTCAAGCAATTCACAAGTGAATTC
TCCACCAGCATTTTTGTTGACCGGGCTATCTTGCAAATTTGTAGTTGGAA
CGAATTGTTGGAACATCTTCTGCACGGAGGCTGGTTTCTTCTGACAAGAG
CATGTTTGTGTTCTGCTAACGAATGTATGAGCGTTTGATGGCCTACAACT
TTGAAACATGAGTTGAGATTGTATTGCTGGCTAGGCAGCTCACTGCGCGC
TAATCAGAAATTCATTTTGTAGGCCGGTTGAAAGTTTTTTTTGTATCTGA
AATCCTTCTAGTGAATTATATATTGGTTTAGTGCTGTCATATTTGGTTGT
TCGTGATTAATGCTCTGTGGCAGCGCTCATTGATTTTGGGGAAATCTTGT
ACTGACCATATTTTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.