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GrainGenes Sequence Report: AA005562

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Sequence
AA005562
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA005562
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCAAATTTACTAGCCGCCGCAGCTCGTCGCAATCCCTTTCCGCCCAGGC
GCCCGCCGCCGCTGCCGCCGCCGTGACGCCATGACCCGCTATCTCCGGAC
GCGGGTCCTTTCTCTCTTCCTCAGCTACAGGTCATCCCATGTCCCGGCCT
CCAACCTCGTTCCCCTCCACTGCCTCCTCTCCACCACCGCATCCTTTTCC
ACCAAATCCTTCTCCGTCAAGAAATTCCTCGTCGCCGACTGCGGCCTCAC
CCCAGAGCAAGCCCTGAAGGCCTCCAAAAGGCTCTCCTACCTCACGTCCC
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AAGCACCAGATGGAGATGCTTCACCATAAGACTGAAACTGTGGTGTGCAA
GAATCTGCCCATTTTAAGGCTACACGTTTTTTTTTCCACAAGAGTGGGCT
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AGACCTGCACTAATCATGTAGAGCGTGGGGAGGCATCTGGTTCCCTGAAA
TCGTGTCATGAAGGTCCTGCTGGCAAAGGGATTGTTGAAACTTTTGTTTT
AACGCACTACTTGCCTTTTCTGAGGAGACGATCAAATCAGATTTTCGCAG
AGACCATGTCCCTGGGCTCACTGATACGTAGTATAGTGCAGACTGTGCCG
TGGAGGTGCCCCCAAGGTCAGTTTTGACATCTTAACATTGGATTTCTGTA
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TCTGATGAACCCTTGTTCAAAATTTGGATATGCATGGAGGAATTGAATTA
TTTGCCTTATTGCTCGTGTCTCACTAGTCAATAATTATATCTGCCATGCT
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AAGTGATTTGTCTCCGAGCTTTGGCTTATTTTTCTTGGCTACATTAAGCA
TAGACAATTCTGGACCAATTTTTAATCTGGTACAGTTTAGAGTTTAGAAG
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CTTATCAGGACCTGCGAAGGGTAAAAGAAAATGATGGAAGCAGTAGTATA
ATTTGGTTCGATGCTGGTAGCATGTATGCATGACATGACCAAGAGACCCA
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ACCGTTTGGAAAACTTGAAATCTTTGATGCATGGTTATATTTACCACGGC
AGCAAGCCAGCGAGTATGGACAAGGTGCTCATTGGTCTCTGGCATTGTAG
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ATCTAGAAGTAAAATGATTCCTGGTTCCTTTCAAGCTGTAAGACTCGGTT
AAGTACTCGTATAACAATCTCTACAATGTCAATATATGGATAACTGGTTG
TTCGTTTACACATGGAGCATTCAGTGGGAAATCAATAGTTTGTGCTTTCA
TTCAAGGGTTCTGTATGAAATTTCCGGATTACATGGCAGCAGTTGTTAGT
GTTGATTCTCGGTCATCAAAGATGGAAGCACAAAAATGCATCTAAAGGGA
TGATGCTGAGCATATGCAGTATGCCACTCTAGTCTCTACAAAGCCCTCTT
TTGATATTTGCTTTTGTGCCTACTCGACATAAGATTATCTCGAAGTGTAT
CGGCAGTAGATGATCAACAATAGATGAGCTAATTGACACAACTAGTCATG
AACCTCCTGCTCAACTCATGCATGTCAAACTGCAAGGAGAGCATCACCAG
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GCCATTGGTCCCCAAGATATGGGTGGATGCCATGGACACAACTAACGTTC
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CTGAATATACAGGCGATCTTCGTTCACCCTCCATCACAGTAGAGATTGGA
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ATTGTTGCCGTGGAAGTGCTTCACTGCTATGTATTTATCAGCTTGTGCTG
GTGCACCGTGCACACCACTTCAATTTCAGAACATGTGGTACTATGCCTAG
TCAGTTTTGATTTGGTATCTTTTACCTTTATGGTATAAAATATAAGATGT
TTTAGCTTTTGTGAAAGGAATGTATCTAGGCGTTTTTAGTATGCACGTTC
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GCTAAAACATCTTATATTTTAAAACAGAGGAAGTATGTGATAAATTTGCA
AGCCAATTGCCATGTGCTAAATTTGATTAAGATTTAAGAGACCCTCATTT
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TAGAGAGGTTTTGAAGCTTTAGTTTGTGTCTTAAGACTAAAATCATTGCT
TAACCTTGAACCAACACATGATACCTCTTTTATAGATATAAGACTTGAAA
GACTTGTCCCAAACATGAAAACAAACAACATTTAAACATAAACAAACTGG
AGTAGCATTGTTCTATCTTAATTTTCCTATGCATTTCTACCTCCAACTTC
CAAAATAAGATCTAATCTCTTTATTTGGACTTGATCTAGGGTTTTACAAA
GCGTTGCAGGTTGTGTTAGCACCGATTTTGACATTGAGAAGCTAGGGGAC
TACTGTTCTGCATGGTACTGCAGCACAACGGATGGGTTTATCTCATCCAT
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CCAGCGAATTTGATTCAGACTCTTGAGTTCGTTTGGATCAATAATTTGGT
TGCAGTTTGAGAGTATGAGAGATGAATGCACTTCTATTTTGGTAATTTAG
TCCTATTGTATGTGTTCATTTTTTGAGAGAAAAATCATATCTATTATAGA
AGTTCACAAGAAGTACCAGACACTCCAAATATAATAAAAATTACAATAAA
CTTCTTGGACCACCTAACGACTACTATGGTCGCCAGAGCGAGCCGCTAAT
GTGGCGCTGCAGCTATTGGTACTCAAAATATATGTGGATGCCATGGACAC
CGCTAACGTTCAGGATCCCCATGGTACTAGTTCGATGCAATGTTAACCAT
ACTGAGATGGCAAGTAAAGACATGGTGCCCCATTTCTCCCAGTTATCGAT
GCTGAAGATAATAGGTCACTCCTATACATTGGCAACCTGGCCGTAAAACC
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ATCTCTACTCTCAGAATATACAGGCGATCTTCGTTCACCCTCCATCACAG
TAGAGATTGGAACTTAAGAGTATTGAAATGGACCTAGCTGTGCTTAGTTA
TATGTTGGGCATTGTTGCCGTGGAAGTGCTTCACTGCTATGTATTTATCA
GCTTGTGCTGGTGCACCGTGCACACCACTTCAATTTCAGAACATGTGGTA
CTATGCCTAGTCAGTTTTGATTTGGTATCTTTTACCTTTATGGTATAAAA
TATAAGATGTTTTAGCTTTTATGAAAGGAATGTATCTAGGCGTTTTTAGT
ATGCACGTTCACTCTGAACTTACACACTAAAAAGCGTCTAGATACATTCG
TTTCACGAAAGCTAAAACATCTTATATTTTAAAACAGAGGAAGTATGTGA
TAAATTTGCAAGCCAATTGCCATGTGCTAAATTTGATTAAGATTTAAGAG
ACCCTCATCTATTCTATTTCTAACAGCTGGTAGGCCTAATCTCTGGTATA
GTGGTATCATTAGAGAGGTTTTGAAGCTTTAGTTTGTGTCTTAAGACTAA
AATCATTGCTTAACCTTGAACCAACACATGATACCTCTTTTATAGATATA
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AACAAACTGGAGTAGCATTGTTCTATCTTAATTTTCCTATGCATTTCTAC
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GTTTTACAAAGCGTTGCAGGTTGTGTTAGCACCGATTTTGACATTGAGGA
GCTAGGGGACTACTGTTTTGCATGGTACTGCAGCACAACGGATGGGTTTA
TCTCATCCATCATAGAGATATTCTTCTGCTAGAGATAATTTTTCTTCCTA
CCACAAGCAGCCAGCGAATTTGATTCAGACTCTTGAGTTCGTTTGGAGCA
ATAATTTGGTTGCAGTTTGAGAGTATGAGAGATGAATGCACTTCTATTTT
GGTAATTTAGTCCTATTGTATGTGTTCATTTTTTGAGAGAAAAATCATAT
CTATTATAGAAGTTCACAAGAAGTACCAGACACTCCAAATATAATAAAAA
TTACAATAAACTTCTTGGACCACCTAACGACTACTATGGTCGCCAGAGCG
AGCCGCTAATGTGGCGCTGCAGCTATTGGTACTCAAAATATGTGTGGATG
CCATGGACACCGCTAACGTGCAGGAGCCTCATGGTGCTAGTTTGATGCAG
CGTTAACCATACTGAGATGGCAAGTAAAGACATGGTGCCCCATTTCTCCC
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CCGTAAAACCATTTCCGGTGCCTTCCAAGCTTACAAAACTCTAACACATA
CAACACAATCTCTACTCTCTGAATATACGGGCGATCTTCGTTCACCATCC
ATCACAGTAGAGATTGGAACTAAGAGTTTTGAAATGGACCTAGCTATGCT
TAGTTACATGTTGGGCATTGTTGCCATGGAAGTGCTTCACTGCTATGTAT
TTATCAGCTTGTGCTGGTGCACCGTGCACACCACTTCAATTTCAGAACAT
GTGGTACCATGCCTAGTCAGTTTTGATTGGGTATCTTTGCCTTTATGGTG
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CGGCGACAGCAACCTTACTACTTACCTAAGTATTATTTTCTTGGACACCC
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TGTTAAATTTTTGAAGAAAAATATGATCATGTGTAGCTTCATGTTTGAGG
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AAAAAGACAATCTTTTACGTCGGGAAGCACGTTACTTTAGCATCAAATTT
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TTTTTGGCATTTCAAATTTTGACAAATATAAAATTCAAATAAATGGTGCA
TATGCACCCGGTTATTTCCTATGGTACTTTGATTTGGACTCTTGTTTCGT
CTGGATCGATGATTTGGTTGCAGCGCTTGAGAGTACGAGAGATGAATGCA
CTTCTATTTTGGTGATTTAGGCCATTGTATTGTATGTGTTCATGTGTACG
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TGGCGGCGACAACCCTACGACCTAAGTATTGTTTCCTCGTCTTTCACTCG
TTCATCTGTGGCTCGTTGCTCTGGTTGGTTTCTTGAACCAGAGACAGGGA
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CACTGGTTCATGATTTTGCAGGGTTAGAGCATCTCTAACCAAACCCCTAA
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CGTATCGGCTTTAGAGGAGCAAAAAATTTAGGAGTTCAGTCTCCGGGACT
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TCCGCAGCTTTCTAGCCTGTCAACCAACCCGACGACCAGCTGCTGCCTCC
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CGTCGTGTTTGGGCCGGATCCGCTCCGACGCAATCTCCATGTATTGTCTT
CCTCCTCTAACCGATGTGGAGTCTCGCCGGCTATAGGGTTGCGGTTGTCT
CTACCAAACAATGTCTCTATGGAGATTGCAGAAGTCGTTGCGGCACCGGT
GCCTGCACTAGCGCAGGCCGCACCCCTCTCTTCTCCAGTTGAGAACATGG
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AATTATAAGAGTTCCATTAAAGATGCTCTTACCAAGCGGGTTTTTGACCA
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GCTCGCGAAAATCCAAGTCGGCTCCGACGGCAATAAAATAATTGTTTAAA
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TGGCTCCCTAGTCGTCATCAGCCTCAACCCTACCACAAACCCCGCCCACA
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CGGGCGCAAACACTCAAGGCGTCCAGGTTCCTCTCCCACCTCAAGTCCCC
CTCCAACCCGGACGCCGTACTCTCCTTCCTCTCGGGCCTCGGCCTCTCCA
GCTCCGACATCGCGGCCGTCGTCGCCTCCGACCCCAAGTTCCTCTGCTCC
AAGGTGGACGAGACCCTCGCCCCCCGCGTCGCCAAGCTCCGCGACCTCGG
GCTATCCGCCTCCAGTATCGCGCGCCTCGTCCTGATCGGCGCCCACGCGC
TCCGCTCCTGCGACGTTGCCAGCAGGCTCCAGTTCTGGATCCCGTTGTTT
GGCTCCTTCGACGAGTTCATGCAGGCCGTATCAGGGGGCTCTCTGGGAGG
CGCTTCCCTCCTGAGGCGTGAGATCGACACGATTGTCAAGCCCAACCTTG
CGCTGCTTCTGCAGTGCGGGCTAACTGTTCGTGACCTCGCCAAGACCGGC
ATCAGCGGGACGTGGGCGATTGTCTGCAAGCCAGAAAAACTCAAGGAGCT
AATCGCACGCGTGGAGGAGCTCGGAGTGCAGCGCGGCTCGGGCCAGTTCA
TGTACGCTCTCGCGACAGTCTCCTGCTTGAAACCAGAGAGGCTTGCTGCA
AGGAAGGAGCTACTGAAGAAGAGCCTTGGCTGCTCTGATGAGGTGCTGCA
AATCGCGATCGTCAAGCACCCAAGCATCTTAAGAGCGTCCGAGGACAACC
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GGTGCCTCGATATATTGTCATGAAGATACTGCAGGGCAAGGGGCTTATTA
GTGCTGAGTATTGCTCAATTGCTGTTGTCAGCGAGAGGTACTTCGTCGAA
AGATTCATCGACCAGTACAAGGAGAGTGTTCCTGACCTTGCAGATGTGTA
TAATGCAGCTCGTGCAGGGGAAATACCATCTCACCTCCAACCTTGACACA
TTTCTACTTTCTAGGGATATTGAAGGTTCATATATTTTCCATGGTCACAG
CTAGCTAGTAGTGTTCGCATAGCACTGCTGTTGTTTCTTTATCCTCTCTT
GATTTAGTATTGTGACTGAAGCAGCACTGCCGCTGATTTTATTGGCCATA
CCATGACAAGTTCCATTTGCTGCACCATATGGAACAGTTGAAATCCTGAT
TTTTGTCGCCCGTTTCTTACAGTTCTGTTGGTTGATATCTATGAAGCAAT
TGAATTTGGGGAAATGAGACGCTGAATAGTGATGGTCTTGGCCAAATGCT
GCGAATCTATGTGTTGCTCGCTATGTAGCAGTGCAATTGTAAAAACTGGA
TTAAAAAAATTCTATTTTGAGATACCAAAGGTGGAGAGGGAGGGAAATGA
TTGCAATGCCCACTTTTTCTCTGATTTGGCCACCCAAAACGTGAACAGGA
GCTTCAACAGAGCTATAGGGTGTCATAGGAGCTTCTGTAATTCTGGGCCT
TCCGCCTTCATATATTGTAGCGGCATTTCCTCAAAGCTGCAGTTCTCAGC
CTCTTTAGTTGGATACATATTTCCATGAACCCCAGCCTAAGCCAGTTCCC
GGTGCCTTTCAAGCCCACACAACTTATTTACATATATTGTGATCTTTACT
CTCTGAATATATGGGCAATCTCAGTTCATCATCACTATAGTAACTGGAAC
TGAGAGGCTTGGAATGGACATATATTTATATTGGGCATTTTTGCCACTGC
ATTCCATTTATCTCAGTTACTGTGGATGCACGGCGTTTTCAATTTGCTAT
CTTGGCCTTTATTGCAGTATATTTTTCTTTTCCTCTGTCATAGACTCATA
TCCTTTCCATACCATTTCGCACCAATTGTCATGTGCTAAACTTGATAAAT
ATATGAGACCAACGGTATGTCACTCAACTTTGATTTCCTTTTGTCACAAA
AGCACGTTTTTACTGTTGGAAACATATCATCAAGAATAAGCTAGCTTTAG
TACAGAGTAGAATGTGACCTATGTTGTATTTTAAATCCCATTGTATTTTT
ACTCAGGATAGTTGAATGATTCATACTATCCAATTTGCCTTGCCTACAAC
AGCCGAAGATGCCGTTCCAAGAAGACTGCTTTCCTTATACAGTGTACAAA
CCGTGATCATACAAACACACCTCTTGTTCATGAATTTGATACTTCCTTTT
CTGCTTTGCATAACATTTTGAGTCCTGCAATACTGGAATGTGCATCGGCA
TTAAAAAGAATTCTAAGTTCTTCTGTTTGTTGATCCCAAGCACCCAAGCT
TCTTAAGAGCATATCCGAGGACAACCTGAGCAGCACGGTAATGTTCCTGA
TCACCGAGGTCGGTTTTGAGCCAGAGTACATCATGCGCAGACCGGTTTCA
GCCTGAACGGGAGGCTGATGCCCCAATATATTGTCATGAACATACTACAG
GACAAGGGGCTTCCCAGTCCTAAATTCAGCTCACTGATTTATGCGGCCAA
GAGATACTTCACTTCAAGGTTTATCGACTATTACAGGGAGAGTGTTCCTG
AGCTTGCAGATGTGTATGCAGCACAGCTCGTGCGGAGAAAATACCCTCTC
AACCCCAACCTTGACATGTCTCTTGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.